AND-ul mitocondrial și rolul
său în trasarea istoriei
omului.
A elaborat:
La disciplina: Țaran Elena , gr.43 B
,,Evoluționismul ”
Profesor: S.
Grigorcea
• ADN - ul mitocondrial ( mtDNA sau mDNA ) este ADN - ul localizat în
mitocondrii , celulare organite in cadrul eucariote celule care transformă
energia chimică din alimente într - o formă care celulele pot folosi,
adenozin trifosfat (ATP). ADN-ul mitocondrial este doar o mică parte din
ADN-ul dintr-o celulă eucariotă; cea mai mare parte a ADN-ului se găsește
în nucleul celular și, în plante și alge, și în plastide, cum ar fi cloroplastele .
• ADN-ul mitocondrial uman a fost prima parte semnificativă a genomului
uman care a fost secvențiat. Această secvențiere a dezvăluit că ADNmt
uman include 16.569 perechi de baze și codifică 13 proteine .
• Deoarece ADNmt animal evoluează mai repede decât markerii genetici
nucleari, acesta reprezintă un pilon al filogeneticii și al biologiei evoluției.
Permite, de asemenea, o examinare a legăturii dintre populații și astfel a
devenit importantă în antropologie și biogeografie .
Origine
• ADN-ul nuclear și mitocondrial se crede că au o origine evolutivă separată , ADNmt
derivând din genomurile circulare ale bacteriilor care au fost înghițite de strămoșii timpurii
ai celulelor eucariote de astăzi. Această teorie se numește teoria endosimbiotică . În celulele
organismelor existente, marea majoritate a proteinelor prezente în mitocondrie (numărând
aproximativ 1500 de tipuri diferite la mamifere ) sunt codificate de ADN-ul nuclear , dar
genele pentru unele, dacă nu chiar pentru majoritatea dintre ele, se crede că inițial au fost de
origine bacteriană, fiind transferate de atunci în nucleul eucariot în timpul evoluției .
• Motivele pentru care mitocondriile au păstrat unele gene sunt dezbătute. Existența în unele
specii de organite derivate din mitocondriile lipsite de genom sugerează că este posibilă
pierderea completă a genelor, iar transferul genelor mitocondriale către nucleu are mai
multe avantaje. Dificultatea de a direcționa produsele proteice hidrofobe produse de la
distanță către mitocondrie este o ipoteză a motivului pentru care unele gene sunt reținute în
ADNmt; colocalizarea pentru reglarea redox este un alt lucru, citând dorința controlului
localizat asupra mașinilor mitocondriale. Analiza recentă a unei game largi de genomi
mtDNA sugerează că ambele aceste caracteristici pot dicta retenția genelor mitocondriale.
Replicare ADN mitocondrial
• ADN-ul mitocondrial este replicat de complexul ADN polimerază gamma care este
compus dintr-o ADN polimerază catalitică de 140 kDa codificată de gena POLG și două
subunități accesorii de 55 kDa codificate de gena POLG2 . Mașinile replisome sunt
formate din ADN polimerază, TWINKLE și proteine SSB mitocondriale . TWINKLE
este o helicază , care desfășoară scurte întinderi de dsDNA în direcția 5 'până la 3'. Toate
aceste polipeptide sunt codificate în genomul nuclear. În timpul embriogenezei ,
replicarea ADNmt este strict reglată în jos de la ovocitul fertilizat prin embrionul de
preimplantare. Reducerea rezultată a numărului de copii per celulă de ADNmt joacă un
rol în blocajul mitocondrial, exploatând variabilitatea de la celulă la celulă pentru a
ameliora moștenirea mutațiilor dăunătoare. Potrivit lui Justin St. John si colegii, „La
blastocist etapă, debutul replicare ADNmt este specific celulele trophectodermului . In
contrast, celulele din masa de celule interioare restricționează replicarea ADNmt până
când primesc semnale pentru a diferenția la tipuri specifice de celule. "
Moștenirea mitocondrială ADN mitocondrial
• În majoritatea organismelor multicelulare , ADNmt este moștenit de la
mamă (moștenit matern). Mecanismele pentru aceasta includ diluarea
simplă (un ovul conține în medie 200.000 mtADN molecule, în timp ce
un spermă uman sănătos a fost raportat că conține în medie 5 molecule),
degradarea spermatozoizilor mtDNA în tractul genital masculin și în
ovulul fertilizat; și, cel puțin în câteva organisme, eșecul ADNmt
spermatozoizilor de a intra în ovul. Oricare ar fi mecanismul, acest
model unic ( moștenire uniparentală ) a moștenirii ADNmt se găsește la
majoritatea animalelor, la majoritatea plantelor și, de asemenea, la
ciuperci. În cazuri excepționale, bebelușii umani moștenesc uneori
ADNmt atât de la tați, cât și de la mame, rezultând heteroplasmă
ADNmt .
Moștenirea feminina
• În reproducerea sexuală , mitocondriile sunt în mod normal moștenite exclusiv de la mamă;
mitocondriile din spermatozoizii de mamifere sunt de obicei distruse de celula ovulă după fertilizare. De
asemenea, mitocondriile se află numai în coada spermei, care este utilizată pentru propulsarea celulelor
spermatozoide și uneori coada se pierde în timpul fertilizării. În 1999 s-a raportat că mitocondriile
spermei paterne (care conțin ADNmt) sunt marcate cu ubiquitină pentru a le selecta pentru distrugerea
ulterioară în interiorul embrionului . Unele tehnici de fertilizare in vitro , în special injectarea unui
spermă într-un ovocit , pot interfera cu acest lucru. Faptul că ADN-ul mitocondrial este moștenit matern
permite cercetătorilor genealogici să urmărească descendența maternă mult înapoi în timp. ( ADN-ul
cromozomial Y , moștenit patern, este utilizat într-un mod analog pentru a determina istoricul
patrilineal .) Acest lucru se realizează de obicei pe ADN-ul mitocondrial uman prin secvențierea
regiunilor de control hipervariabile (HVR1 sau HVR2) și, uneori, molecula completă a mitocondrialului
ADN, ca test genealogic al ADN-ului . HVR1, de exemplu, este format din aproximativ 440 de perechi
de baze. Aceste 440 de perechi de baze sunt comparate cu aceleași regiuni ale altor indivizi (fie persoane
specifice, fie subiecți dintr-o bază de date) pentru a determina descendența maternă. Cel mai adesea,
comparația se face cu secvența de referință Cambridge revizuită . Vilà și colab. au publicat studii care
urmăresc descendența matrilineală a câinilor domestici de la lupi. Conceptul de Eva mitocondrială se
bazează pe același tip de analiză, încercând să descopere originea umanității urmărind descendența
înapoi în timp.
Blocajul mitocondrial ADN mitocondrial
• Este de așteptat ca entitățile supuse moștenirii uniparentale și cu puțină sau nici o
recombinare să fie supuse clichetului lui Muller , acumularea de mutații dăunătoare
până la pierderea funcționalității. Populațiile animale de mitocondrie evită acest lucru
printr-un proces de dezvoltare cunoscut sub numele de gâtul de sticlă al ADNmt .
Gâtul de sticlă exploatează procesele aleatorii din celulă pentru a crește variabilitatea
de la celulă la celulă a încărcăturii mutante pe măsură ce se dezvoltă un organism: o
singură celulă de ou cu o anumită proporție de ADNmt mutant produce astfel un
embrion în care diferite celule au sarcini mutante diferite. Selecția la nivel de celulă
poate acționa apoi pentru a îndepărta acele celule cu mtDNA mai mutant, ducând la o
stabilizare sau reducere a încărcăturii mutante între generații. Mecanismul care stă la
baza blocajului este dezbătut, cu o recentă metastudie matematică și experimentală
care oferă dovezi pentru o combinație de partiționare aleatorie a ADNmt la diviziunile
celulare și a fluctuației aleatorii a moleculelor ADNmt în interiorul celulei.
Moștenirea masculină
• Moștenirea ADN-ului mitocondrial masculin a fost descoperită la puii Plymouth Rock .
Dovezile susțin cazuri rare de moștenire mitocondrială masculină și la unele mamifere.
Mai exact, există apariții documentate pentru șoareci, unde mitocondriile moștenite de
bărbați au fost ulterior respinse. De asemenea, a fost găsit la oi și la bovine clonate.
Cazuri rare de moștenire mitocondrială masculină au fost documentate la om. Deși multe
dintre aceste cazuri implică embrioni clonați sau respingerea ulterioară a mitocondriilor
paterne, altele documentează moștenirea in vivo și persistența în condiții de laborator.
Moștenirea dublu uniparentală a ADNmt este observată la moluștele bivalve. La aceste
specii, femelele au un singur tip de ADNmt (F), în timp ce masculii au ADNmt de tip F
în celulele lor somatice, dar tipul de ADNmt (care poate fi până la 30% divergent) în
celulele germinale . Mitocondriile moștenite paternal au fost raportate suplimentar la
unele insecte, cum ar fi muștele fructelor , albinele și cicadele periodice .
Susceptibil
• Conceptul că ADNmt este deosebit de susceptibil la speciile reactive de oxigen
generate de lanțul respirator datorită proximității sale rămâne controversat. ADNmt
nu acumulează mai multe daune de bază oxidative decât ADN-ul nuclear. S-a
raportat că cel puțin unele tipuri de deteriorare a ADN-ului oxidativ sunt reparate
mai eficient în mitocondrii decât în nucleu. ADNmt este ambalat cu proteine care par
a fi la fel de protectoare ca proteinele cromatinei nucleare. Mai mult, mitocondriile
au dezvoltat un mecanism unic care menține integritatea ADNmt prin degradarea
genomilor excesiv deteriorați, urmată de replicarea ADNtmt intact / reparat. Acest
mecanism nu este prezent în nucleu și este activat de mai multe copii ale ADNmt
prezente în mitocondrii. Rezultatul mutației în ADNmt poate fi o modificare a
instrucțiunilor de codificare pentru unele proteine, care poate avea un efect asupra
metabolismului și / sau stării de sănătate a organismului.
Utilizare în criminalistică
• Spre deosebire de ADN-ul nuclear, care este moștenit de la
ambii părinți și în care genele sunt rearanjate în procesul de
recombinare , nu există de obicei nicio modificare a ADNmt de
la părinte la descendenți. Deși și ADNmt se recombină, face
acest lucru cu copii ale lui în cadrul aceleiași mitocondriuni.
Din acest motiv și pentru că rata de mutație a ADNmt animal
este mai mare decât cea a ADN nuclear, ADNmt este un
instrument puternic pentru urmărirea strămoșilor prin femele
( matrilineage ) și a fost folosit în acest rol pentru a urmări
strămoșii multor specii de sute de generații.
• Rata rapidă de mutație (la animale) face ca ADNmt să fie util pentru evaluarea
relațiilor genetice ale indivizilor sau grupurilor dintr-o specie și, de asemenea, pentru
identificarea și cuantificarea filogeniei (relații evolutive; vezi filogenetica ) între
diferite specii. Pentru a face acest lucru, biologii determină și apoi compară
secvențele ADNmt de la diferiți indivizi sau specii. Datele din comparații sunt
utilizate pentru a construi o rețea de relații între secvențe, care oferă o estimare a
relațiilor dintre indivizii sau speciile din care au fost luați ADNmt. ADNmt poate fi
utilizat pentru a estima relația dintre ambele specii strâns înrudite și specii înrudite la
distanță. Datorită ratei mari de mutație a ADNmt la animale, pozițiile 3 ale codonilor
se schimbă relativ rapid și oferă astfel informații despre distanțele genetice dintre
indivizi sau specii strâns legate. Pe de altă parte, rata de substituție a proteinelor mt
este foarte scăzută, astfel modificările aminoacizilor se acumulează încet (cu
modificări lente corespunzătoare la pozițiile 1 și 2 codoni) și astfel oferă informații
despre distanțele genetice ale speciilor înrudite la distanță. Modele statistice care
tratează ratele de substituție între pozițiile codonilor separat, pot fi astfel utilizate
pentru a estima simultan filogenii care conțin atât specii înrudite cât și îndepărtate.
• ADN-ul mitocondrial a fost admis în dovezi pentru prima dată într-o sală de
judecată a Statelor Unite în 1996, în timpul statului Tennessee împotriva lui
Paul Ware . În dosarul din 1998 al SUA, Commonwealth of Pennsylvania v.
Patricia Lynne Rorrer, ADN-ul mitocondrial a fost admis pentru prima dată
în dovezi în statul Pennsylvania. Cazul a fost prezentat în episodul 55 din
sezonul 5 al adevăratei serii dramatice criminale Forensic Files (sezonul 5) .
ADN-ul mitocondrial a fost admis pentru prima dată în probe în California ,
Statele Unite, în urmărirea cu succes a lui David Westerfield pentru răpirea
și uciderea din 2002 a Danielle van Dam, în vârstă de 7 ani, în San Diego : a
fost utilizat atât pentru identificarea oamenilor, cât și pentru câini. Acesta a
fost primul proces din SUA care a admis ADN-ul canin. Rămășițele regelui
Richard al III-lea , care a murit în 1485, au fost identificate prin compararea
ADN mt cu cea a doi descendenți matrilineali ai surorii sale care erau în
viață în 2013, la 527 de ani după ce a murit.
Utilizare în biologia evolutivă și biologia sistematică.
• ADNmt este conservat în organismul eucariot având în vedere rolul critic al
mitocondriilor în respirația celulară . Cu toate acestea, datorită reparării mai
puțin eficiente a ADN-ului (în comparație cu ADN-ul nuclear), acesta are o rată
de mutație relativ mare (dar lentă în comparație cu alte regiuni de ADN, cum ar
fi microsateliții ), ceea ce îl face util pentru studierea relațiilor evolutive -
filogenia - a organismelor. Biologii pot determina și apoi compara secvențe de
ADNmt între diferite specii și pot folosi comparațiile pentru a construi un
arbore evolutiv pentru speciile examinate. De exemplu, în timp ce majoritatea
genelor nucleare sunt aproape identice între oameni și cimpanzei , genomurile
lor mitocondriale sunt diferite de 9,8%. Genomul mitocondrial uman și gorilă
este diferit de 11,8%, ceea ce arată că suntem mai strâns legați de cimpanzei
decât gorilele.
Folosirea ADN-ului mitocondrial pentru stabilirea celui mai
vechi grup de oameni (africanii). Eva mitocondrială.
• Studierea ADN-ului, din pricina recombinării genetice (formarea cromozomilor himerici, în urma ruperii unor
cromozom, nu permite citirea istoriei scrise în genomul uman.
• Mitocondria dispune de propriul genom, fiind singura structură celulară cu genom, cu excepţia nucleului celulei. De
ce? Pentru că mitocondria este ce a mai rămas dintr-o bacterie antică înghiţită de unul dintre strămoşii noştri
unicelulari.
• Genomul mitocondrial există în unic exemplar (nu în dublu exemplar, ca cel din nucleu), deci nu se poate recombina
• În 1987 cercetătoarea Rebecca Cann şi colegii acesteia au publicat primul studiu privind diversitatea mitocondrială la
om. Principala descoperire este menţionată în studiu cu următoarele cuvinte:
• "Toate aceste ADN-uri mitocondriale provin de la o singură femeie, despre care se crede că a trăit acum circa
200 de mii de ani, probabil în Africa".
• Accepţiunea actuală este că, în fapt, Eva mitocondrială a trăit cu mai puţin de 150 de mii de ani în urmă.
• În studiu, Cann se întreabă cum sunt legate între ele secvenţele de ADN mitocondrial (ADNmt). Rezultatele au arătat
că divergenţa cea mai mare dintre secvenţele de ADNmt există în rândul populaţiilor africane, ceea ce sugera
că africanii trecuseră de mai mult timp prin procesul de divergenţă. Cu alte cuvinte africanii reprezintă cel mai
vechi grup de pe planetă, iar Africa este locul apariţiei speciei noastre.
• E important de notat că provenienţa întregii diversităţi de azi a populaţiei umane dintr-un singur strămoş (Eva
mitocondrială) nu înseamnă că acest strămoş reprezenta singura persoană existentă la momentul respectiv, ci că
liniile de descendenţă ale contemporanilor s-au stins.