Gambarkan struktur amlodipine dan tunjukkan sifat-sifat fisikokimia molekul tersebut?
2. Soal esai
Anda sebagai seorang peneliti ingin menemukan obat antihipertensi baru. Jelaskan
langkah apa yang selanjutnya anda tempuh?
1. Membayangkan menjadi seorang seorang peneliti baru yang ingin menemukan
obat antihipertensi baru
2. Dilakukan penelusuran pustaka bagaimana patofisiologi penyakit tersebut
3. Dicatat semua reseptor, enzim dan protein yang terlibat dalam perkembangan
penyakit hipertensi tersebut beserta peran masing masing reseptor, enzim dan
proteinnya
4. Dipilih salah satu dari eseptor, enzim dan protein sebagai target kerja obat
5. Masuk ke website [Link]. Dilakukan pencarian struktur 3D reseptor, enzim
atau protein yang telah dipilih dalam database Protein Data Bank (PDB)
6. Pada kolom search dimasukkan kata kunci yang ingin dicari
7. Setelah muncul seluruh data, pada kolom Refinements, dipilih lagi beberapa
kriteria, contohnya yaitu : Pada Kolom Scientific Nama of Source Organism dipilih
Homo Sapiens, Pada Expetimental Method dipilih X-Ray Diffraction, pada Polymer
Entity Type dipilih Protein, pada Refinement Resolution dipilih dibawah 2A.
8. Didonwload reseptor, enzim atau protein dalam format PDB file
3. Soal esai
Download protein dengan ID PDB 2V0Z, kemudian berikan informasi berikut: a). Nama
protein; b). Nama ligan alami; c). Resolusi protein; d). Jumlah asam amino pada protein
a. Nama protein: Crystal Structure of Renin with Inhibitor 10
b. nama ligan alami: C41 dan NAG (Aliskiren)
c. resolusi protein: 2.20 A
d. jumlah asam amino dan protein: 326
4. Soal esai
Lakukan analisis terhadap proteinyang telah didownload dan tentukan: a). Jumlah ikatan
hidrogen; b). Jumlah jembatan garam. c). Rigiditas protein tersebut
a. 89 ikatan hidrogen
b. 6 jembatan garam
c. ada 2 warna yaitu merah dan biru dengan warna merah sebagai dominan, ini
menunjukkan struktur bersifat rigid