PENGGUNAAN APLIKASI ARGUSLAB
Aplikasi argus lab adalah aplikasi kimia yang digunakan untuk membantu penelitian
permodelan molukul, umumnya merupakan gambar 2 dimensi. Diagram data dari buku
catatan untuk koneksi tabel yang disimpan secara elektronik dimana satu sama lain saling
mendefinisikan jenis atom. Kemudian struktur dua dimensi diubah menjadi tiga dimensi
untuk mempelajari sifat kimia, namun struktur molekul lebih akurat diubah menjadi tiga
dimensi yang respresentasi tersedia di cabridge [Link] kristalografi data basa (sekitar 50.000
struktur).
Program ArgusLab memberikan kepada siswa dan profesional kedokteran, atau
orang-orang yang tertarik, kemungkinan untuk menggambar struktur molekul dalam 3D.
Dengan perangkat lunak ini, anda akan memiliki representasi grafis dalam tiga dimensi
struktur sederhana dan kompleks, konfigurasi protein, rantai asam amino atau heliks asam
amino. ArgusLab menggunakan sistem pohon untuk mengatur semua elemen untuk
menambah struktur apapun untuk kemudian menampilkan data ini sebagai gambar,sehingga
dimungkinkan untuk menganalisisnya secara visual. Jika tidak fasih dalam ilmu molekuler
maka tidak terlalu banyak belajar dari tools ini tetapi jika sebaliknya, maka aplikasi
ArgusLab ini perangkat gratis untuk penelitian.
Langkah-Langkah Menggambar Struktur Molekul HF dan Etanol dengan ArgusLab
1. Membuka Program ArgusLab
Program ArgusLab dapat dijalankan melalui icon di desktop komputer ataupun start
menu. Pada icon desktop, program ArgusLab dapat dijalan dengan melakukan double
click pada icon.
Melalui start menu, program dapat dijalankan dengan membuka start menu → All
Program → [Link] → ArgusLab 4.0.1.
2. Setelah program dijalankan, ArgusLab akan memberikan tampilan seperti ditunjukkan
Gambar 1.
Gambar 1 Tampilan ArgusLab, saat program dijalankan.
3. Menggambar struktur sederhana HF dan Etanol
1. Klik File pada Menu→New untuk membuka halaman baru
2. Klik Create New Molecule pada structure toolbar dan aktifkan tombol hidrogen
(H) pada atoms toolbar, pada panel sebelah kiri.
3. Klik satu kali pada workspace. Kemudian aktifkan tombol flour (F) pada atoms
toolbar, klik kiri atom H pada workspace dan tahan tarik kekanan untuk
mendapatkan struktur H F
4. Klik Automatic Bonds Are OFF pada general toolbar untuk menambahkan ikatan
5. Klik Label→All Atoms pada menu untuk memberikan nama atom
6. Klik Clean Structure pada general toolbar untuk mendapatkan bentuk struktur sama
sesuai yang diinginkan
7. Klik Geometry Optimization untuk memperoleh struktur molekul yang optimal dan
juga untuk mengetahui nilai energy
8. Klik tombol ctrl+ tekan bagian tengah atom H dan F, kemudian klik Distance pada
general toolbar untuk mendapatkan jarak antar atom.
9. Untuk menggambar Etanol (C2H5OH), aktifkan tombol karbon (C) pada atoms
toolbar, pada panel sebelah kiri.
10. Klik kiri mouse satu kali pada workspace, klik kiri lagi pada sebelah atom kanan C
11. Kemudian aktifkan tombol oksigen (O) pada atoms toolbar, pada panel sebelah kiri.
12. Klik kiri mouse satu kali pada workspace, klik kiri lagi pada sebelah atom kanan C
Untuk mendapatkan struktur C C O
[Link] Add Hidrogens pada general toolbar untuk menambahkan atom hidrogen
sehingga diperoleh struktur molekul C2H5OH
14. Klik Label→All Atoms pada menu untuk memberikan nama atom
[Link] Clean Structure pada general toolbar untuk mendapatkan bentuk struktur sama
sesuai yang diinginkan
16. Klik Geometry Optimization untuk memperoleh struktur molekul yang optimal dan
juga untuk mengetahui besarnya energy.
17. Klik tombol ctrl+ pilih 2 atom tekan bagian tengah (bebas), kemudian klik Distance
pada general toolbar untuk mendapatkan jarak antar atom.
18. Klik tombol ctrl+ pilih 3 atom tekan bagian tengah (bebas), kemudian klik Angle
pada general toolbar untuk mendapatkan sudut yang terbentuk oleh atom.
19. Klik View Latest Calculation Results pada general toolbar untuk mengcopy Final
Geometry dari hasil yang telah didapatkan
20. Klik Save pada general toolbar untuk untuk menyimpan hasil