Introduction virologie
Dr. Mamoudou KODIO
Introduction
• Le but de ce cours , et de donner aux futurs
Médecins que vous serez, quelle que soit votre
mode d’activité, les notions de virologie
essentielles à la pratique courante de la médecine,
– diagnostic,
– traitement curatif et
– prévention.
• Sont examinés les principaux virus ou familles de
virus pathogènes pour l’homme.
• L’étude de leur structure et de leur réplication est
centrée sur les éléments importants pour la
transmission de l’infection et pour la
compréhension des tests diagnostiques, et sur les
cibles de la chimiothérapie.
Introduction
• L’étude du trajet de l’infection dans l’organisme
(notion de porte d’entrée, d’organe-cible) explique
le déroulement des signes cliniques, les possibilités
d’intervention immunologiques dans les infections
à incubation longue.
• Lors de l’étude des différents virus pathogènes
pour l’homme, l’accent est mis sur les formes
fréquentes (éventuellement bénignes) et les formes
graves, sur les problèmes de santé publique, dans
le Monde Sont expliquées les grandes lignes du
calendrier vaccinal, remis à jour annuellement
par la Direction Générale de la Santé.
Introduction
• Les objectifs d’enseignement sont
classés en trois catégories.
• 1. Objectifs d’enseignement de
virologie générale. Ils concernent d’une
part la structure des virus, leur
multiplication, leurs relations avec
l’hôte au niveau de la cellule, de
l’organisme, des populations. Ils
concernent d’autre part les
conséquences générales de ces
éléments de virologie fondamentale
pour le diagnostic, le traitement, et la
Introduction
• 1. Connaître la définition des virus, des
viroïdes et des ATNC, et les critères de
classification des virus .
• 2. Connaître les étapes du cycle de
réplication des virus, et expliquer les
possibilités qu’elles offrent de
chimiothérapie antivirale selon les
différents types de cycle de
réplication .
• 3. Connaître les différences entre virus
nus et virus à enveloppé en termes
de résistance aux conditions physico-
Introduction
• 4. Connaître les mécanismes des
variations génétiques des virus et
leurs conséquences sur
l’épidémiologie, le traitement et la
prévention des infections virales .
• 5. Connaître les différents modes
d’interaction virus-cellule hôte :
infection lytique, infection
tempérée, transformation .
• 6. Connaître les différents modes
d’oncogenèse virale, et les expliquer à
l’aide d’exemples .
Introduction
• 7. Connaître et expliquer à l’aide
d’exemples les différents modes de
diffusion des virus dans l’organisme,
la distinction entre porte d’entrée et
organe-cible, infection virale localisée
et infection virale généralisée.
• 8. Connaître les moyens de défense
spécifiques et non spécifiques de
l’organisme contre les infections virales
et les mécanismes d’échappement
des virus à ces moyens de défense.
Introduction
• 9. Connaître les différents modes
évolutifs des infections virales :
infections aiguës, infections latentes,
infections chroniques (C).
• 10. Connaître le rôle des virus dans les
phénomènes immunopathologiques.
• 11. Connaître les règles générales du
diagnostic virologique au laboratoire
: indications, principe des différentes
techniques, interprétation des
résultats .
• 12. Connaître les règles pratiques des
Introduction
• 13. Connaître les différentes classes
d’antiviraux, leur mode d’action et
leurs limites.
• 14. Connaître les examens
virologiques à mettre en œuvre par
le clinicien pour le suivi d’un
traitement et la caractérisation des
mutants résistants.
• 15. Connaître les différents types de
vaccins antiviraux, vaccins
inactivés, vaccins atténués,
vaccins de génie génétique, leurs
Introduction
• 16. Connaître les bases virologiques
du calendrier vaccinal pour la
population générale et pour les
personnes exposées à des risques
particuliers, professionnels et
touristiques notamment
• 17. Connaître les principes de
l’épidémiologie et de l’écologie
virales, les méthodes d’étude de la
traçabilité virale et les moyens
virologiques de contrôle des épidémies.
• 18. Connaître les principes de la
Structure des virus, cycle
viral, physiopathologie des
infections virales
Introduction
Qu’est-ce qu’un virus ?
• C’est un agent infectieux très simple,
défini par une structure se résumant à
deux ou trois éléments, selon les virus.
• Les virus sont donc totalement
différents des bactéries ou des
parasites, qui sont des cellules, ce que
ne sont pas les virus. « Les virus sont
les virus » André Lwoff
Introduction
Genome
• Un virus comporte toujours un génome
qui est de l’ADN ou de l’ARN, de sorte
que dans la classification des virus on
distingue en premier lieu virus à ADN et
virus à ARN.
• Ce génome peut-être monocaténaire (à
simple brin) ou bicaténaire (à double
brin).
• D’une façon générale, la réplication du
génome des virus à ARN est beaucoup
moins fidèle que, celle du génome des
virus à ADN (les ARN polymérases
Génome
• Ainsi, les virus à ARN sont
particulièrement sujets aux variations
génétiques (HIV, virus de l’hépatite C,
par exemple), contrairement aux virus à
ADN.
• La taille du génome - et donc les
capacités de codage - diffère
considérablement parmi les virus à ADN
(3 à 300 kpb), alors qu’elle est
comprise entre 10 et 20 kb pour la
plupart des virus à ARN.
• La capacité somme toute réduite de
Capside
• Le génome est emballé dans une
structure protéique appelée CAPSIDE,
d’un mot grec, capsa, signifiant boîte.
• La capside protège le génome. Elle a
une conformation géométrique qui,
selon les virus est, soit tubulaire, soit
polyédrique. On appelle nucléocapside
la structure compacte formée par
l’assemblage de la capside autour du
génome.
• Il faut retenir que les capsides,
tubulaires comme polyédriques, 1) sont
faites de protéines virales
Nucléocapside tubulaire ou hélicoïdale
• C’est un tube enroulé en peloton (pour
ce qui concerne les virus humains ou
animaux, ce peloton
• est lui-même enveloppé dans un 3e
élément appelé péplos).
Nucléocapside polyédrique
• Ce n’est pas n’importe quel polyèdre
mais un ICOSAÈDRE : polyèdre à 20
faces qui sont des triangles
équilatéraux, et 12 sommets.
• Vu sous un certain angle, l’icosaèdre
présente un contour hexagonal.
Nucléocapside tubulaire ou hélicoïdale
• L’icosaèdre est utilisé en architecture
(coupole du Palais des Sports) et le
ballon de football à 12 pièces noires et
20 pièces blanches a pour structure de
base un icosaèdre.
• Le dé icosaédrique est, par ses 20
faces, un instrument de docimologie
utilisé volontiers par vos enseignants,
confrontés à la correction d’un nombre
excessif de copies.
Nucléocapside tubulaire ou hélicoïdale
• C’est un tube enroulé en peloton (pour
ce qui concerne les virus humains ou
animaux, ce peloton
• est lui-même enveloppé dans un 3e
élément appelé péplos).
Nucléocapside polyédrique
• Un exemple de virus icosaédrique très
simple : les poliovirus
Enveloppe ou péplos
• D’un mot grec signifiant manteau, c’est
l’élément le plus externe de certains
virus. La présence ou l’absence
d’enveloppe règle en grande partie le
mode de transmission des maladies.
• Tous les virus humains et animaux à
capside tubulaire ont un péplos, mais
certains virus à capside icosaédrique en
sont également pourvus (Herpesviridae,
Togaviridae, Flaviviridae).