LA TRADUCTION
OBJECTIFS
Traduction
• Définir les termes : traduction, codon et
anticodon, polyribosome, signal-peptide
• Montrer le mécanisme de la traduction d’un
messager, en distinguant les étapes d’initiation,
d’élongation et de terminaison.
• Montrer les mécanismes de la régulation de la
traduction.
• Enumérer et décrire les principales
modifications post-traductionnelles
Définitions
Alphabet de 4 lettres Alphabet de 20 lettres
(A, U, G, C) (20 acides aminés)
de l'ARN messager des protéines
Le code génétique est la clé qui permet de passer
d'un langage à l'autre.
Lecture d’un RNAm par des ribosomes qui
synthétisent des protéines (L’expression du génome)
Les partenaires de la traduction
1. Les ribosomes (ARNr + Protéines)
Procaryote (70 S)
ARNr 23S
50S ARNr 5S
34 protéines
30S ARNr 16S
21 protéines
Eucaryote (80 S)
ARNr 28S
ARNr 5S,
60S ARNr 5,8S
49 protéines
40S ARNr 18S
33 protéines
•Catalyse l’établissement des liaisons peptidiques
•Assure l’alignement de l’ARNm et le choix de
"cadre de lecture" = séquence unique de 3 lettres
Point de départ de lecture
Assure la traduction correcte du code génétique
Cadre de lecture d’un ARNm
ARNm AUGCA UGCAUGC
Message lu dans
le cadre de lecture 1 AUG|CAU|GCA|UGC
Message lu dans
A | U G C | A U G | C A U |G C
le cadre de lecture 2
Message lu dans
AU|GCA|UGC|AUG|C
le cadre de lecture 3
Code génétique = codons non chevauchant de 3 lettres
Code génétique
Le code génétique est le même pour tous les
êtres vivants (Universel)
La séquence codante = suite de codons qui
permet d’incorporer spécifiquement un AA
au cours de la synthèse d’une protéine.
Chaque AA peut être codé par plusieurs codons
qui diffèrent en général par leur 3 ème nucléotide
↔ code génétique est dégénéré
Ex. Glycine à 4 codons: GGU, GGC, GGA, et GGG
Le code génétique comporte 64 codons mais seuls
61 spécifient les 20 acides aminés qui participent à la
synthèse des protéines
3 codons UAA, UGA, UAG = codons de terminaison
1 codon AUG assigné à la Méthionine est le codon
qui initie la synthèse protéique
Les codons de terminaison ne sont reconnus par
aucune molécule d’ARNt mais par des protéines
spécifiques de la libération du peptide néo-synthétisé
Code génétique courant
1ère position 2ème position 3ème position
Extrémité 5’ U C A G Extrémité 3’
Phé Sér Tyr Cys U
Phé Sér Tyr Cys C
U
Leu Sér STOP STOP A
Leu Sér STOP Trp G
Leu Pro His Arg U
Leu Pro His Arg C
C
Leu Pro Gln Arg A
Leu Pro Gln Arg G
Ile Thr Asn Sér U
Ile Thr Asn Sér C
A
Ile Thr Lys Arg A
Mét Thr Lys Arg G
Val Ala Asp Gly U
Val Ala Asp Gly C
G
Val Ala Glu Gly A
Val Ala Glu Gly G
2. Les ARN de transfert (ARNt)
ARNt = dictionnaire de la traduction
Lien chimique entre la structure du codon, reconnu par
l’anticodon, et l’AA spécifique porté par le tRNA
Codon, anticodon
3 nucléotides de la séquence d’un AN porteur de
l’information génétique permettant l’incorporation
d’un AA dans la séquence primaire d’une protéine
3 nucléotides du mRNA = codon
3 nucléotides du tRNA = anticodon
Au cours de la traduction l’anticodon et le codon se
lient de manière antiparallèle, et l’AA porté par le
tRNA est incorporé à la protéine en cours de synthèse
3. Les aminoacyl-ARNt
Précurseur activé qui précède l’initiation de la
polymérisation des acides aminés
Assure l’assortiment d’un acide aminé déterminé
à un couple codon-anticodon
La clé du transfert de l’information génétique de l’acide
nucléique à la protéine est la capacité de l’aminoacyl-
ARNt synthétase :
• d’activer l’AA pour son transfert à la chaîne peptidique
naissante
• de lier ces AA et les assortir aux ARNt adéquat
Mécanisme général de la traduction
Transcription
Cytosol
Traduction
Noyau
Protéines en cours de synthèse
de NH2 vers COO-
Le RNAm est "lu" par groupe de 3 nucléotides grâce
à un RNAt qui porte l’AA correspondant
La "lecture" du mRNA se fait de 5’ vers 3’ et la
synthèse de la protéine se fait en même temps de
l’extrémité NH2 terminale vers l’extrémité COOH
terminale.
Réactions de maturation de protéine
→ protéine "mature" prête
Devenir des protéines:
•Libérés dans le cytoplasme
•Conduits dans les membranes ou les
organites
•Excrétés à travers les membranes vers
l’extérieur de la cellule
Les étapes de la traduction
Initiation (cyclique)
Dissociation du ribosome 70S → 30S + 50S
Fixation de la sous-unité 30S à l’ARNm
30S + 50S → 70S actif (Elongation → Terminaison)
Dissociation 70S actif → 30S + 50S
Réassociation 30S + 50S = 70S inactif
(ribosome inactif)
Facteurs d’initiation chez l’E. Coli
Facteurs
d’initiation Fonctions
•Se fixe à la sous unité 30S
eIF-1
•Renforce l’activité de IF-2 et IF-3
•Fixe GTP
eIF-2 •Entraine Mét-ARNT au complexe
d’initiation 30S
•Se fixe à la sous unité 30S
•Empêche la sous unité 30S de
eIF-3 se combiner à la sous unité 50S
•Facilite la liaison de l’ARNm
•Concourt à placer le Mét-ARNt au site P
GDP
70S
50S
IF2
IF3
30S
IF1
IF2
P P P
GTP
P P P
P P P 5’
MétARNt
Pi
Complexe
d’initiation ARNm
70S
3’
Complexe
50S d’initiation 30S
Remarques
L’interaction entre ARNm et ARNr 16S permet
de sélectionner le codon d’initiation correcte
Transfert correcte de l’information dépend de la
fixation sur le cadre de lecture (codon) du Mét-ARNt
Le positionnement ARNm par rapport au Mét-RNAt
détermine le cadre de lecture de la traduction du
messager
Décalage du Altération de la
cadre de lecture séquence de protéines
Codon de la Méthionine est le AUG
Autres codons reconnus par Mét ARNT:
GUG, UUG, CUG
Elongation (microcycle en 3 étapes)
Etape1. Mise en place de l’ aminoacyl-ARNt dans
le ribosome
Étape 2. Formation de la liaison peptidique
Étape 3. Coulissage du ribosome d’un codon par
rapport à l’ARNm
Au niveau d’un ribosome:
Un site actif pour l’établissement de liaison peptidique
Deux sites qui fixent les substrats de la réaction:
-Site peptidyle (site P) qui maintient la chaîne
polypeptidique naissante (encore lié à l’ARNt
de l’AA ajouté en dernier)
-Site accepteur (site A) qui fixe l’aminoacyl à
l’ARNt chargé d’AA pour la position suivante
de la chaîne en croissance
- Déplacement du ribosome vers le 3' de l'ARNm,
- Les AA tRNA se logent dans le site A (aminoacyl)
du ribosome en respectant la séquence de l'ARNm
(code génétique).
- Le peptide fixé sur le tRNA (site P) se détache
et se fixe sur l’AA qui est lié au tRNA (site A)
5’
Chaîne peptidique Aminoacyl
naissante ARNt GTP
ARNm
Mét
site P occupé EFTu
Peptidyl ARNt 3’ Complexe
5’ i t eAA uépé 3’
Se cp ternaire
Sit incoccu
I no
5’
ARNm
3’
5’ 3’
5’
3’
pé
i n te A
cu
Pi
oc
Si
3’
Terminaison
Dislocation du ribosome au niveau du codon terminateur
(UAA, UAG ou UGA) (pas de tRNA correspondant)
Les facteurs de terminaison RF (release factor) imitent
la structure 3d d'un tRNA permettant le décrochage
du peptide lié au tRNA (site P) donnant ainsi la protéine.
Polyribosome
Traduction de l’RNAm par les polyribosomes
(les uns après les autres)
Le premier AA constitue l’extrémité NH2 terminale
Le dernier AA incorporé constitue l’extrémité
COOH terminale
Les sous-particules du ribosome se séparent et
libèrent la protéine synthétisée à l’extrémité 3’ (à
l’arrivé au codon de terminaison)
40 S
mRNA 60 S
Terminaison
Initiation Ribosomes 3’
5’
Protéines en cours
de synthèse Protéines
Les polyribosomes présentent un aspect différent
selon la régulation des différentes étapes de
la traduction.
Plus l’initiation est active plus les ribosomes
sont nombreux sur le messager
Si l’élongation est lente, la lecture de la séquence
codante par les ribosomes est lente
Une activation brutale de la terminaison dissocie
tous les ribosomes du messager
Nombreux antibiotiques sont capables d’interférer avec
chacune des étapes de la synthèse des protéines
Modifications post-traductionnelles
Protéine mature = forme chimique définitive que
la protéine montrera au moment où elle remplira
sa fonction dans l’organisme.