Institut Supérieur des
Professions Infirmières et
Techniques de Santé Ouarzazate
Semestre: S1
Option: Technicien de Laboratoire
Cours de Microbiologie, Parasitologie et
Mycologie
Année Universitaire 2024- Par Dr. Loubna Ait
2025 Dra
Sommaire
Définition d’un virus
Morphologie et structure d’un virus
Réplication virale
Classification des virus et de pathologies virales
Exemple de virus
Introduction
Virologie ?
Virologie: La virologie est le domaine de la microbiologie qui
étudie les virus.
Virus?
Virus: un microorganisme, une entité biologique incapable de se
reproduire de façon autonome, nécessitant une cellule hôte, dont
il utilise les constituants pour se multiplier
Généralités
Quelques généralités
Les virus sont présents absolument partout dans tous les biotopes et dans toutes les
conditions extrêmes
Il n’y a pas une espèce qui puisse échapper à une infection par un virus: les virus sont
ubiquitaires.
Les virus sont très diversifiés, ce sont les entités les plus abondantes sur cette terre
Ils ne se multiplient que sur un hôte.
Caractères généraux des virus
Les plus petits (20-400 nm) et les plus primitifs (Bactéries : 0.5-10 μm)
Les virus n'ont ni paroi ni organisation cellulaire.
Parasites intra-cellulaires obligatoires : dépendent de la cellule hôte
→ énergie (ATP), nucléotides, acides aminés, lipides, machinerie cellulaire (ribosomes)
Mode de multiplication complexe: désassemblage, réplication et réassemblage au sein de
la cellule hôte (bactéries par scissiparité)
Plus difficile de concevoir des antiviraux
efficaces et atoxiques que des antibiotiques
car les virus utilisant les systèmes cellulaires
de l'hôte
Taille des Virus
Poxvirus
Taille des Virus
Taille des Virus
Exemple de virus
Exemple de bactéries
Structure de la particule
virale
Virion: en dehors des cellules hôtes, les virus survivent comme des particules
virales. Il contient
- Le génome viral emballé dans une structure de protéine, capside
- Plusieurs virus ont aussi une composante lipidique à la surface de virion:
enveloppe
Génome viral
Capside
Enveloppe
Structure de la particule virale
Structure de la particule virale
Les structures virales au tour de l’acide nucléique ont pour fonction de protéger
le génome et de permettre au virus de se fixer sur un récepteur cellulaire.
Structure de la particule virale
1- Génomes Viraux ARN ou d'ADN
Nature: ADN ou ARN
Eucaryotes et Procaryotes
Structure: Monocaténaire ou bicaténaire Virus à ADN double brin
Topologie: Linéaire ou circulaire (dsDNA)
ADN ARN
ADN ADN ARN ARN
double brin simple brin double brin Simple brin
Les virus dsDNA codent leurs gènes de la même façon que les animaux, plantes,
bactéries et autres organismes cellulaires
Les autres types de génomes sont uniques pour les virus
ADN : Acide désoxyribonucléotidique ARN : Acide ribonucléotidique
Structure de la particule virale
1- Génomes Viraux
Génomes à ADN Génomes à ARN
Parvoviruses
Linéaire Tobacco mosaic virus
Poxviruses Reoviruses
ou
Phage φ X174 Hepatitis delta virus
Circulaire
Pas de virus connus avec des
Baculoviruses génomes dsRNA circulaires
Structure de la particule virale
1- Génomes Viraux Hepatitis B virus 3.2 kbp
Phage λ 48.5 kbp
Taille des génomes des virus
Mimivirus 1200 kbp
Escherichia coli 4700 kbp
- Génomes à ADN : 5 kb à 280 kb Human 3 000 000 kbp
- Génomes à ARN : 3 kb à 20 Kb
Une seule molécule d’acide nucléique
Herpesviridae
Segmenté
Deux ou plusieurs molécule d’ac nucléique (segments)
Influenza A virus.
Structure de la particule virale
2- Protéines
Nombre des types protéiques:
• 1 type de protéine : tobacco mosaic virus
• Plus de 100 types : Paramecium bursaria Chlorella virus 1
Nomenclature des protéines virales
• Virus protein: VP1, VP2, VP3, …
• Non-Structural Protein: NSP1, NSP2, NSP3, ...
• G (glycoprotéine), P (phosphoprotéine), F (fusion), P (polymérase)
RT (reverse transcriptase)
Rôles:
• Protection de génome viral
• Attachement de virion à la cellule hôte
• Fusion de l’enveloppe du virion avec la membrane de la cellule hôte
• Enzymes : protéase, reverse transcriptase
• Amorces pour replication des acides nucléiques
Structure de la particule virale
3- Capside
Coque protéique rigide qui entoure le génome viral
Formée de sous-unités: capsomères
Nucléocapside = génome + capsomères
Rôle majeur dans:
o La protection du génome → génomes viraux dépourvus de leurs capsides
sont plus susceptibles pour l’inactivation
o La reconnaissance et l’attachement au cellule hôte
Structure de la particule virale
3- Capside
Symétrie icosaédrique
Symétrie hélicoïdale Symétries complexes
Structure de la particule virale
3- Capside
Les virus à symétrie hélicoïdale
- Capside en forme de bâtonnets cylindriques creux à l‘intérieur
- Elle est formée de protomères identiques et individualisés
- Elle entoure la molécule d’ARN enroulée en hélice à la manière d’un
ressort
- Plusieurs molécules de la même protéine sont arrangées
autour de l’hélice
Structure de la particule virale
3- Capside
Les virus à symétrie icosaédrique
- Capside constituée de capsomères associées pour former une figure géométrique
en forme d’icosaèdre
- La plupart possèdent 20 facettes : icosaédriques (eicosa= vingt et hedron= côté)
- Elle contient l’acide nucléique pelotonné ou enroulé sur lui même
Chaque face est un triangle équilatérale
Structure de la particule virale
3- Capside Les virus à symétrie complexe
- Association de structures hélicoïdales et cubiques
- Ou structures mal identifiées
- Les grands bactériophages de la série T paires présentent
une symétrie mixtes
Tête
Symétrie cubique
Core interne
connecteur
Symétrie hélicoïdale
Fibres
queue
Structure de la particule virale
4- Enveloppe viral
Influenza A virus
Structure de la particule virale
4- Enveloppe viral
Virus nus Virus enveloppé
Rotavirus, Picornaviridae, Adenoviridaé Myxoviridae, Retroviridaé, Herpesviridaé
Virus nus: Capables de survivre plus longtemps dans un milieu inanimé que ceux
qui possèdent une enveloppe lipidique
Virus enveloppés : La perte de l'enveloppe lipidique s'accompagne de la perte du
pouvoir infectieux → peuvent être inactivés par l'éther ou par des détergents
Multiplication des Virus
Réplication des virus: Cycle viral
Le but d'un virus est de se reproduire
Le processus de multiplication d'un virus comporte sept étapes:
1. Attachement du virion à la cellule hôte
2. Entrée dans la cellule
3. Transcription des gènes viraux aux ARNm
4. Traduction des ARNm aux protéines virales
5. Réplication du génome viral
6. Assemblage des protéines et des génomes dans des virions
7. Sortie des virions des cellules hôtes
Virion
Réplication des virus: Cycle viral
Réplication des virus: Cycle viral
Réplication des virus: Cycle viral
Réplication des virus: Cycle viral
2. Entrée dans la cellule
Mode de pénétration des virus:
Virus nus
Soit à travers un pore formé dans la membrane plasmique
Soit par endocytose (la majorité) : processus utilisé par la cellule pour capture
des nutriments, défense contre des agents pathogènes
récepteur
Membrane
plasmique
Attachement Attachement endocytose
réversible irréversible
Attachement et entrée d’un virus nus
Réplication des virus: Cycle viral
2. Entrée dans la cellule
Virus enveloppé
deux processus :
1- Soit par endocytose suivie par fusion de l’enveloppe du virion avec la
membrane de l’endosome
Attachement
Endocytose
Réplication des virus: Cycle viral
2. Entrée dans la cellule
Virus enveloppé
2- Soit par fusion de l’enveloppe du virion avec la membrane
cytoplasmique
Attachement Fusion
Chaque virus enveloppé a une glycoprotéine spécialisée responsable de la
fusion membranaire (exp. VIH-1 : gp41)
Réplication des virus: Cycle viral
Réplication des virus: Cycle viral
Les virus matures s’accumulent dans le noyau
ou le cytoplasme de la cellule infectée puis sont
libérés par lyse cellulaire
Multiplication des Phages
Etapes du cycle Entrée dans la
viral cellule
Bactériophages
Sites d’attachement des virus : fibres de la queue du phage T4 (E. coli)
Se lient spécifiquement aux récepteurs:
- soit sur la surface de la paroi bactérienne (porines),
- ou sur la surface de pili, flagelles ou capsules
L’infection d’une cellule par une phage implique l’entrée
dans la cellule du génome viral et probablement
certaines protéines associées,
la capside et les molécules associées restent à la
surface de la cellules
Etapes du cycle viral
Fixation du virus à des
récepteurs
complémentaires
Injection de l’acide
nucléique dans la
bactérie
Phase d’éclipse (prise en charge
du métabolisme cellulaire par
l’acide nucléique viral)
Etapes du cycle
viral
Synthèse et assemblage des
capsomères en capside et
insertion de l’acide nucléique
dans la capside
Libération des bactériophages
lors de la lyse cellulaire
Cycles des phages
Bacteriophage lysis of the host cell. From
Brown JC (2003) Virology. In Encyclopedia of Life Sciences. With permission from John
Wiley & Sons, Inc.
Classification des virus
1. Nature du matériel génétique: ADN ou ARN
2. Capside avec ou sans enveloppe: virus nus ou enveloppés
3. Symétrie de la capside (icosaédrique ou hélicoïdale)
4. Site d’assemblage
5. Critères épidémiologiques
42
Classification des virus
Classification des virus
Classification des virus
Critères épidémiologiques
1. Virus entériques: se multiplient dans le tractus gastro-intestinal. Ex.:
entérovirus (sous groupe des Picornaviridae), Adénovirus, Hépatite A.
2. Virus respiratoires: se multiplient dans le tractus respiratoire et restent
localisés dans cet endroit. Ex.: Orthomyxovirus, Paramyxovirus,
Coronavirus, Rhinovirus.
3. Virus dermotropes
Variole, rougeole, rubéole, varicelle et zona
4. Virus neurotropes
Rage, encéphalite et polyomyélite 45
Classification des virus
Classification de Baltimore
lauréat d’un prix Nobel, David Baltimore.
Basée sur le type et la transcription du génome
Classification par la structure du génome
Les virus sont classés en 7 groupes par l’ICTV (comité international de
taxonomie)
1: ADN double brin (ex: papillomavirus, herpesvirus, mimivirus, variole,
bactériophage lambda)
2: ADN simple brin (bactériophage M13, geminivirus des plantes)
3: ARN double brin (reovirus)
4: ARN simple brin positif (poliovirus, chikungunya, virus mosaïque tabac,
hepatite C)
5: ARN simple brin négatif (grippe, ebola)
6: Rétrovirus à ARN (HIV)
7: Rétrovirus à ADN (hépatite B)
Classification de Baltimore
+
+
Les différents types d’infections virales
1- Infection aigüe
L'infection aigüe se caractérise par une destruction massive des cellules
de l'hôte infectée suivie d'une disparition totale du virus dans l'organisme.
Elle peut être localisée ou généralisée (exp: grippe et polio).
2- Infection persistante latente
L'infection latente est une sorte de combat permanent entre le système
immunitaire de l'organisme infecté et le virus.
Le virus se manifeste de manière intermédiaire dans un site de latence où
il est situé (ex.: les virus de la famille Herpès)
Ce type d'infection peut se révéler dangereuse pour un sujet immuno-
déprimé car le virus peut dans ce cas devenir virulent.
Les différents types d’infections virales
3- Infection persistante chronique
Le virus ne se situe pas cette fois-ci dans un site de latence mais en
permanence dans l'organisme où il détruit petit à petit ces cibles: le
virus est relativement détectable en permanence dans l'organisme.
Les virus comme le VIH ou les virus de la famille des hépatites
(hépatite B , C..) mène ce type d'infection.
4- Infection transformante (papillomavirus humains)
Stimulation de la prolifération cellulaire par un oncogène virale
Insertion d'un promoteur
Induction non spécifique d'une prolifération cellulaire dans des
cellules quiescentes (épithélium).
Exemple de virus
Coronavirus
Poxviridae