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Cours de Virologie : Structure et Classification

Ce document présente les principaux points d'un cours de virologie. Il définit ce qu'est un virus, décrit leur structure et leur classification, et explique les conditions nécessaires à leur multiplication ainsi que les étapes de leur cycle de réplication intracellulaire.

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Cours de Virologie : Structure et Classification

Ce document présente les principaux points d'un cours de virologie. Il définit ce qu'est un virus, décrit leur structure et leur classification, et explique les conditions nécessaires à leur multiplication ainsi que les étapes de leur cycle de réplication intracellulaire.

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COURS DE VIROLOGIE

2022

Structure, classification et cycle de


multiplication des virus

El kochri.S
Pharmacien-Biologiste au Laboratoire de
Virologie de l’Hopital d’Instruction
Mohammed V-Rabat
Objectifs du cours
• Définir un virus.
• Citer les particularités des virus dans le monde du vivant
(bactéries, parasites).
• Décrire la structure générale d’un virus.
• Citer les critères de classification des virus.
• Préciser les conditions nécessaires à la multiplication des
virus.
• Expliquer les étapes de la multiplication virale dans la
cellule.
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Virus dans l’histoire de l’homme
Historique
• La contagion: Aristote, Fracastor
• La théorie des germes: Pasteur
• Le terme de virus (du latin poison,
toxine): tous les germes infectieux
• Agents invisibles et incultivables,
la filtration:
virus ultrafiltrants / virus filtrants /
virus
Virus dans l’histoire de l’homme
Vaccination contre la rage 1885
Virus dans l’histoire de l’homme
La découverte des virus
• 1892 Mosaïque du tabac
• 1898 Fièvre aphteuse
• 1901 « Etres de raison » Roux
• 1902 Fièvre jaune
• 1911 Sarcome de Rous
• 1915 Bactériophage
• Toujours d’actualité : SARS
VIRUS, grippe, Ebola
Virus dans l’histoire de l’homme
Particularités des virus dans le monde des vivants
Vie et virus
Les caractéristiques de la vie sont :
- la respiration
- la réactivité à des stimulis
- le mouvement
- la croissance
- la reproduction
- l'adaptabilité

Les bactéries et les parasites répondent à ces


critères mais les virus ne les possèdent pas tous !
Particularités des virus dans le monde des vivants
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Définitions

• Qu’est-ce qu’un virus ?

« Les virus sont les virus »


André Lwoff
Définitions

• Définition d’André LWOFF 1957


Virus Vs autre organisme

 parasite intracellulaire obligatoire,

 Génome= un seul type AN (ADN ou ARN)

 une reproduction par réplication du génome

 Incapable de croître et de se diviser


Définitions

Définition simplifiée

• Un virus est un agent pathogène ultramicroscopique

• Bien plus petit qu’une bactérie

• Non cultivable
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Structure des virus
Les virus sont composés de deux éléments constants :

 un acide nucléique appelé génome


 une structure protéique entourant et protégeant le
génome, appelée capside

L'association : génome + capside = nucléocapside

 Une troisième structure, entourant la capside,


appelée enveloppe est présente chez certains virus.
Structure des virus
A - le génome 1ER CRITERE DE CLASSIFICATION

Est porteur de l’information génétique et caractérisé par:

• Sa nature : ARN ou ADN

• Sa taille (longueur, la masse moléculaire, le nombre de paires de base et la


capacité approximative de codage et sa composition en bases, notamment
le %GC)

• Sa structure : monocaténaire, bicaténaire, ou bien avec des fragments


subgénomiques.

• Sa topologie elle peut être linéaire ou circulaire


Structure des virus
A - le génome 1ER CRITERE DE CLASSIFICATION
Structure des virus
1- les génomes à ADN
Les ADN des virus , sont le plus souvent bicaténaires et linéaires, présentent pour la plupart structure tridimensionnelle classique
en double hélice
PM : 1 à 180 x106 dalton
Structure des virus
2- les génomes à ARN
La variabilité des ARN viraux est sensiblement moins grande que celle des ADN.
Les ARN viraux sont généralement monocaténaires et linéaires.
PM :2 à 15 X106 dalton
Structure des virus
B – la capside 2éme CRITERE DE CLASSIFICATION

La capside, est une coque de nature protéique qui entoure le


génome;

• elle est capable d'assurer sa protection et sa survie dans le


milieu extérieur

• Elle est composée de plusieurs monomères (unités


• structurales de base) appelés capsomères.
Structure des virus

• L’ensemble acide nucléique (génome)-capside est appelé


nucléocapside (core pour les rétrovirus)
Structure des virus
B – la capside 2éme CRITERE DE CLASSIFICATION
elle peut être soit:

1-les virus à symétrie 2- les virus icosaèdrique à 3 - les virus à symétrie


hélicoïdale symétrie cubique complexe

Un seul type de capsomère Structure géométrique Un certain nombre de virus


s'emboîte pour former un 12 sommets, 20 faces ne paraissent pas répondre
volume (la capside) selon et 30 arêtes. aux types de description
une symétrie en hélice. précédente.
Structure des virus
C – l’enveloppe 3éme CRITERE DE CLASSIFICATION

Une structure périphérique facultative


• structure lipido-gluco-protéique enveloppe sensible aux
actions physico-chimiques
• Les virus acquièrent leur enveloppe par bourgeonnement à
travers la membrane nucléaire (Herpesviridae), à travers la
membrane du réticulum endoplasmique (Bunyaviridae) ou
enfin à travers la membrane cytoplasmique
(Orthomyxoviridae)
• Rôle: Protection (nucléase, résistance); Antigénicité (induction
Ac neutralisants; Infectiosité (interaction/recepteur); Activité
enzymatique
Structure des virus
C – l’enveloppe 3éme CRITERE DE CLASSIFICATION
C – l’enveloppe 3éme CRITERE DE CLASSIFICATION
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Taxonomie virale

Depuis 1966, ICTV a défini une nomenclature des virus et


proposé une classification à vocation universelle; Et depuis juillet
1999 OF(S/F)G s’écrivent en italique avec 1ère lettre en majuscule
Classification virale
A- critères de classification des virus

actuellement: Basée sur l'ensemble des données biochimiques et


morphologiques, proposée en 1962 par Lwoff, Horne, et Tournier appelée
système L.H.T. a été adoptée par tous les virologistes
Principaux virus à ADN ayant un pouvoir pathogène chez
l’homme
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
1. la multiplication d’un être vivant
Se reproduire processus à la fois très complexe,
très précis et très organisé faisant intervenir
quatre conditions:
• Support de travail: information génétique,
contenue dans le génome
• Matière première: petites molécules, acides
aminées, acides gras, sels minéraux…..
• Source d’énergie d’ATP nécessaire à toute
édification Système enzymatique: nécessaire aux
grand voie de synthèse biologique
Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
2. Chez les virus
• un virus est incapable de se multiplier par lui même,
par définition c’est un parasite intracellulaire obligatoire,
En dehors d'une cellule, la particule virale ou virion
existe sous une forme statique

• Pour se multiplier un virus n’a que son génome .


• il n’ a pas de système enzymatique de production
d'énergie de Lippmann ni de synthèse protéique;
• Dans la cellule, le virus détourne la machinerie cellulaire
à son profit pour sa multiplication;
Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus

3. Conditions de la multiplications virale


• Parasiter une cellule
• trouver des sources de matière première,
• Trouver des sources d’énergie,
• Trouver des enzymes.
Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
la multiplication intracellulaire virale
1- Cycle de multiplication
• La vie des virus est cyclique avec une succession
d’étapes intracellulaires et extracellulaires.

• La durée d’un cycle viral dépend de la taille et de


lacomplexité du virus : 4h à 8h poliovirus à plus
de 40h Herpesviridae
la multiplication intracellulaire virale
1- Cycle de multiplication (Etude sur culture
cellulaire)

•La phase d’éclipse : absence de virions détectés


([Link] extracel)
- disparition des virus inoculés
- dégradation de la particule virale, exposition du génome
viral à la machinerie cellulaire

La phase de latence : absence de virions (extracel.)


comprend le délai de libération des virions
la multiplication intracellulaire virale
2- Etapes du cycle de multiplication virales
un cycle de multiplication comprend les mêmes
étapes regroupés en 3 périodes:
la multiplication intracellulaire virale
2-1 Etapes initiales
2-1-1 Attachement :
• Interactions protéine virale-
récepteur cellulaire
• C’est le 1er facteur
conditionnant le tropisme d’1
virus pour une cellule, un
tissu, un organe ou un hôte
particulier (permissivité).
• Récepteurs cellulaires
spécifiques ou non spécifique
• Récepteurs présents sur
certains types de cellules
• Notion de co-récepteurs
• Attachement en plusieurs
étapes
Exemples de récepteurs de virus
la multiplication intracellulaire virale
2-1 Etapes initiales

2-1-2 Pénétration :
Trois mécanismes:
• Endocytose
• La fusion des
membranes
• Transfert du matériel
viral à travers la
membrane cellulaire
la multiplication intracellulaire virale
2-1 Etapes initiales
2-1-3 Décapsidation:
• Dégradation de la capside
• Libération du génome
viral dans le cytoplasme
cellulaire
• Étape nécessaire pour
que le génome puisse:

o Fonctionner (détourner la
machinerie enzymatique)

o Livrer son information


génétique
la multiplication intracellulaire virale
2-2 Expression et réplication du génome viral

Le génome viral libéré prend la direction des synthèses, dans la


cellule.
• Il se substitue en totalité ou en partie au génome cellulaire qui
jusqu’alors organisait les synthèses cellulaires.
•Le génome cellulaire faisait en sorte que la cellule produise des
sécrétions, exocrines ou endocrines, et éventuellement des
éléments pour faire une deuxième cellule.

Désormais, la cellule va produire des virus.


• Plus précisément
o des copies du génome viral, (réplication)
o des répliques de protéines virales,
o protéines de capside
o glycoprotéines de péplos pour les virus enveloppé
la multiplication intracellulaire virale
2-2 Expression et réplication du génome viral

Le mécanisme de cette réplication virale varie selon que le génome


est à ARN ou à ADN.

Mais dans tous les cas, c’est par des ARN messagers viraux que les
génomes viraux transmettent leur information, donnent leurs ordres
à la machinerie cellulaire.
la multiplication intracellulaire virale
2-3 Etapes tardives : Maturation, assemblage, libération

2-3-1 Maturation
• Maturation des protéines virales après traduction:

-protéolyse--> protéines fonctionnelles (réplicases, protéines de


structure)

-glycosylation dans appareil de Golgi

• Migration aux sites de réplication, d’assemblage, surface


cellulaire
la multiplication intracellulaire virale
2-3 Etapes tardives : Maturation, assemblage, libération

2-3-2 Assemblage
Les protéines de structure s’auto-assemblent en capsomères puis
en nucléocapside par intégration du génome répliqué

• Assemblage a lieu au niveau du:


- noyau (virus à ADN: Adénovirus, Herpès)
-cytoplasme (virus à ARN:Picornavirus; ADN pox)

---> anomalies morphologiques de la cellule: inclusions contenant


des virions
la multiplication intracellulaire virale
2-3 Etapes tardives : Maturation, assemblage, libération

2-3-3 Libération
• Virus enveloppés:
---> libération par bourgeonnement
• Ces virus acquièrent leur enveloppe par bourgeonnement à partir
de la mb cellulaire
la multiplication intracellulaire virale
2-3 Etapes tardives : Maturation, assemblage, libération

2-3-3 Libération
• Virus enveloppés:
---> libération par bourgeonnement
• Ces virus acquièrent leur enveloppe par bourgeonnement à partir
de la mb cellulaire
la multiplication intracellulaire virale
2-3 Etapes tardives : Maturation, assemblage, libération

2-3-3 Libération
• Virus nus:

---> libération par lyse

o Après accumulation des virions en quantité importante,

o il y a rupture de la cellule hôte

o Libération des particules virales complètes et matures

o Trouver une nouvelle cellule hôte pour perpétuer le cycle


Plan du cours
I. Introduction
II. Définitions
III. Structure des virus
IV. Taxonomie et classification virale
V. Conditions nécessaires à la multiplication d’un virus
VI. Multiplication intracellulaire des virus
VII. Conséquences de la multiplication virale sur la cellule
infectée
VIII. conclusion
Conséquences de la multiplication virale pour la cellule
infectée

• Mort de la cellule

• Tolérance de l’infection

• Transformation cellulaire maligne


Transformation cellulaire
Mort de la cellule Tolérance de l’infection maligne

Infection lytique Infection tempérée • la cellule se multiplie de


façon anarchique
Structure et fonction • le génome viral et le
génome cellulaire se • la cellule infectée
cellulaire gravement
perturbée par l’ partagent le potentiel acquérant des caractères
accumulation du de synthèse cellulaire généralement attribués
matériel viral la • Virus et cellule coexiste aux cellules cancéreuses.
selon un compromis (perte de l’inhibition de
cellule meurt soit
par: acceptable. contact)
o Nécrose • Modus vivendi • Ex: HPV, Hépatite virale
o Apoptose B et C

Tout le problème est de


savoir si ces cellules
peuvent être
remplacées par
d’autres cellules au
sein de l’organisme.
Conclusion
• La structure virale est particulière et simple par
rapport aux autres cellules procaryotes et
eucaryotes , mais la classification des virus reste
difficile et incomplète.
• Toutes les étapes de la multiplication virale sont
importantes pour :
– Comprendre la biologie du virus
– Définir de nouveaux antiviraux et comprendre
leur mode d’action

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