Utilisation d’ArcGIS Pro pour
estimer les zones sujettes au
paludisme
Jeff Oppong | Mai 18, 2021 | Logiciel SIG
Le paludisme est une maladie mortelle causée par des parasites qui sont
transmis à l’homme par les piqûres de moustiques des moustiques
anophèles femelles infectés. Le paludisme est plus fréquent dans les climats
tropicaux et subtropicaux, où les parasites prospèrent.
Selon l’Organisation mondiale de la Santé (OMS), le nombre estimé de décès
dus au paludisme s’élevait à 409000 personnes en 2019, et la Région
africaine de l’OMS représentait une part disproportionnellement élevée du
fardeau mondial du paludisme (qui représentait 94 % des cas et des décès
dus au paludisme).
Ce didacticiel contribue à la lutte contre le paludisme en utilisant la science
des données spatiales et les techniques de télédétection (ArcGIS Pro) pour
estimer les zones sujettes au paludisme à l’aide d’ArcGIS Pro. De nombreux
facteurs influent sur la prévalence du paludisme dans une Région. Toutefois,
pour les besoins de ce didacticiel, les facteurs suivants sont pris en
compte ; Indice de végétation par différence normalisée (NDVI),utilisation
des terres, pente et distance à la rivière. La figure 1 montre un résumé de la
méthodologie utilisée dans ce didacticiel.
Figure 1 : Flux de la méthode employée pour estimer les zones sujettes au
paludisme
Estimation de NDVI à partir de l’imagerie Landsat 7
L’indice de végétation par différence normalisée (NDVI) peut être téléchargé
gratuitement à partir du site Web de l’United States Geological Survey
(USGS). NDVI peut également être calculé à partir de l’imagerie Landsat 7 à
l’aide de la calculatrice raster ou de la boîte à outils Landsat après avoir
effectué une correction de ligne sur l’imagerie. Afin de corriger les erreurs
de ligne de balayage, cette vidéo peut être utile
([Link]
La boîte à outils Landsat peut être téléchargée ici
([Link]
view).
Après correction de la ligne de balayage, le calcul de NDVI peut être
effectué à partir de la boîte à outils Landsat ou de la calculatrice raster.
Pour calculer NDVI à l’aide de la boîte à outils Landsat, les étapes suivantes
peuvent être suivies ;
1. Sélectionnez « NDVI » dans la « Boîte à outils Landsat », qui se trouve
dans le cadre de l’Arctoolbox.
2. Définissez « bande rouge » sur bande 3 exempte d’erreurs de ligne de
balayage.
3. Définissez « Bande IR proche » sur bande 4 exempte d’erreurs de ligne
de balayage.
4. Définissez « Raster en sortie » comme nom en sortie et emplacement
souhaités du raster à enregistrer.
Figure 2 : interface graphique NDVI dans ArcGIS Pro.
Pour calculer NDVI à l’aide de la calculatrice raster, les étapes suivantes
peuvent être suivies ;
1. Rechercher « calculatrice raster » dans la barre de recherche de
géotraitement
2. Entrez les éléments suivants comme indiqué dans la figure ci-dessous
dans la barre de calcul de la calculatrice raster.
Figure 3 : Calcul de NDVI à l’aide de la calculatrice raster dans ArcGIS Pro.
3. Cliquez sur « Exécuter ».
Préparation des données sur la « distance à la rivière »
Afin d’estimer une distance définie à la rivière en tant que zone sensible à la
reproduction des moustiques, et donc sensible au paludisme, les données
hydrologiques ou fluviales seront extraites du modèle numérique
altimétriques (MNT) par les étapes suivantes:
Figure 4 : Interface graphique d’accumulation de flux dans ArcGIS Pro.
1. Sélectionnez l’icône « Ajouter des données » pour importer des
données DEM sur le canevas de la carte.
2. Saisissez et recherchez « fill » dans la barre de recherche de la boîte à
outils de géotraitement.
3. Dans la boîte de dialogue « remplissage », définissez « raster en
entrée » comme MNT et « Raster en sortie » comme nom et
emplacement souhaités du fichier à enregistrer.
4. Cliquez sur « Exécuter ».
5. Saisissez et recherchez « direction de flux » dans la barre de recherche
de la boîte à outils de géotraitement.
6. Définissez « Input Surface Raster (ISR) » comme les résultats de « fill »
et « Output Surface Raster (OSR) » comme nom et emplacement
souhaités. Cliquez sur « Exécuter ».
7. Tapez et recherchez « accumulation de flux ».
8. Définissez « Raster en entrée » comme les résultats de « direction de
flux » et définissez « Raster en sortie ».
9. Cliquez sur « Exécuter ».
10. Tapez et recherchez « calculatrice raster » et entrez la formule
comme indiqué ci-dessous dans la barre de calcul de la fenêtre. Cliquez
sur « Exécuter ».
11. Tapez et recherchez « ordre de flux ». Définissez « raster en
entrée » comme résultats de la calculatrice raster et définissez « raster
de direction de flux en sortie » comme raster résultant de la direction
de flux. Définissez « Raster en sortie » et « Exécuter ».
12. Tapez et recherchez « stream to feature ». Définissez « Raster en
entrée » comme raster d’ordre de flux résultant. Définissez « Raster de
direction de flux en entrée », puis cliquez sur « Exécuter ».
Figure 5 : interface graphique « Diffuser dans une entité » dans ArcGIS Pro.
Préparation des données de pente
La pente est estimée à partir des données du MNT en suivant les étapes
décrites ci-dessous :
1. Saisissez et recherchez « pente » dans la barre de recherche de la
boîte à outils de géotraitement. La pente doit être sélectionnée dans
l’onglet boîte à outils Spatial Analyst.
2. Définissez « raster en entrée » comme fichier MNT et « raster en sortie
» comme nom et emplacement souhaités des données raster à
enregistrer.
3. Définissez « mesure de sortie » sur degré.
Cliquez sur « Exécuter »
Préparation des données Landsat
Les données sur l’utilisation des sols seront téléchargées à partir du site
Web de WaterItech.
1. Ouvrez [Link], puis sélectionnez Données dans le menu de
l’onglet.
2. Faites défiler jusqu’à Landcover map (Carte à couverture terrestre),
puis cliquez pour télécharger. Le fichier téléchargé est archivé et peut
être extrait dans un dossier.
3. Ensuite, la carte peut être importée sur le canevas de carte d’ArcGIS
Pro à l’aide de l’option « Ajouter des données ».
4. Pour les besoins de ce tutoriel, le système de référence spatiale
WGS1984 UTM Zone 30N sera utilisé pour tous les ensembles de
données puisque l’étude se concentre sur une section au Ghana.
5. La carte de la couverture terrestre sera projetée de WGS 1984 à WGS
1984 Zone 30N. Saisissez et recherchez « Project Raster » dans la
barre de recherche de la boîte à outils de géotraitement.
6. Définissez « input raster » comme carte Landcover téléchargée et «
Output coordinate system » comme WGS1984 UTM Zone 30N.
7. Cliquez sur « Exécuter ».
Figure 6 : Interface graphique du raster de projet dans ArcGIS Pro.
« Reclassement » et analyse de superposition pondérée
« Reclassifier » sera utilisé pour normaliser les données en fonction d’un
ensemble de classes définies. L’analyse de superposition pondérée
permettra également d’accorder des préférences aux facteurs individuels en
fonction de leur niveau d’importance. Les étapes suivantes seront prises
pour effectuer la « reclassification » :
1. Saisissez et recherchez « reclassifier » dans la barre de recherche de la
boîte à outils de géotraitement. L’outil « reclassification » doit être
sélectionné dans la boîte à outils Spatial Analyst.
2. Définissez « raster en entrée » comme résultats de la carte Land
Cover.
Fi
gure 7 : « Reclasser » l’utilisation du sol dans ArcGIS Pro.
3. Sélectionnez « classer » et définissez le nombre de classes sur 5.
4. Cliquez sur « Exécuter ».
5. Répétez les étapes pour les résultats de la pente, de la distance_rivers
euclidienne et de la NDVI.
Figure 8 : Reclassement dans ArcGIS Pro.
Les étapes suivantes seront suivies pour effectuer une analyse de
superposition pondérée sur les facteurs :
1. Saisissez et recherchez « superposition pondérée » dans la barre de
recherche de la boîte à outils de géotraitement.
2. Dans le menu déroulant de l’onglet rasters, sélectionnez toutes les
images reclassées des facteurs distance par rapport aux rivières,
couverture terrestre, pente et NDVI.
3. Les pourcentages suivants doivent être attribués aux facteurs, comme
le montre la figure ci-dessous.
Figure 9 : Superposition pondérée dans ArcGIS Pro.
4. Click “Run.”
Figure 10 : Carte du risque de paludisme de la région d’Upper Ashanti au
Ghana