BG1 : Définition, Classification et
Nomenclature des bactéries
Prof. Saïdou MAMADOU
Dr Abdourahamane YACOUBA
2025-2026
Objectifs du cours
• Définir une bactérie
• Citer 10 principales différences entre une bactérie et une
cellule eucaryote, une bactérie et un virus
• Définir une espèce bactérienne
• Décrire la classification des bactéries
• Ecrire les noms de 5 espèces bactériennes suivant la
nomenclature internationale
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Définition
Bactéries = micro-organismes unicellulaires,
procaryotes, de morphologie variable, de petite
taille, caractérisées par:
• Un seul chromosome
• Une absence de membrane nucléaire
• Une multiplication par clivage longitudinal/scissiparité
• Une absence d’organites intra-cellulaires (Mitochondries, Golgi)
• Une activité métabolique propre
Historique
Antony Van Leeuwenhoek (1632-1723), drapier
hollandais, découvre et décrit entre 1674 et 1687 le
monde microbien, « les animalcules ».
Instrument de Leeuwenhoek
Mais les travaux de Leeuwenhoek ne sont
véritablement reconnus qu'à partir du milieu du
XIXe siècle à la suite des travaux de Louis
PASTEUR (1864) et de Robert KOCH (1876)
L. PASTEUR Robert KOCH
En 1866, Ernest HAECKEL crée le terme de protistes pour
désigner, les êtres unicellulaires et les êtres pluricellulaires sans
tissus différenciés. Les protistes sont classés en deux catégories :
Protiste sup (eucaryotes)et inferieurs (Procaryotes)
En 1878, SEDILLOT crée le terme de microbes parmi lesquels on
distinguera ensuite les bactéries proprement dites et les virus.
Arbre universel de la vie
(selon Carl WOESE 1990, modifié)
Eucaryotes
CPR
Candidat phyla radiation
LUCA
(Last Universal Common Ancestor)
Archaea ou archées
Bactéries (Archeabactéries)
Arbre universel
de la vie
Castelle et al. Lancet 2018
Taille de la bactérie
Différences Bactéries – Eucaryotes
Caractéristiques Bactéries Eucaryotes
Taille de la cellule 0,3 à 2,5 2 à 20
Membrane nucléaire Absente Présente
Nombre de chromosomes 1 (sauf Brucella=2) >1
Multiplication Clivage Mitose / Méïose
longitudinal/scissiparité
Position de l’ADN Nucléoïde plasmides Noyau /certains organites
Recombinaisons Processus variables Fusion gamètes Méïose
génétiques
Mitochondries /R E/Golgi Absents Présents en général
Ribosomes 70 S 80 S / 70 S
Stérols membranaires Absents (sauf mycoplasmes) Présents souvent
Enveloppes cellulaires Hétéropolymères Polysaccharide (cellulose) chez les
glucidopeptidiques plantes
Phagocytose, Pinocytose Absents Présents souvent
Mouvement cellulaire
Cils et flagelles -Pas de Cils Agencement des cils et flagelles
-Flagelles constitués d’hélices associant plusieurs constituants
protéiques
Principales différences Bactérie-Virus
Caractéristiques Bactérie Virus
Unité de structure Cellule Particule
Acide nucléique ADN et ARN ADN ou bien ARN
Activité métabolique Présente Aucune
propre
Multiplication Croissance et Production de virions à
division binaire partir de l’acide nucléique
viral et par détournement
obligatoire du
métabolisme de la cellule-
hôte.
Classification / Taxonomie
Taxonomie (Taxinomie): Du Grec Taxis = arrangement et nomos = loi
▪ La taxonomie établis des groupes taxonomiques qui
sont des ensembles d’organismes vivants apparentés
sur des critères (selon leur similitude et leur parenté
évolutive) et distincts des autres groupes.
▪ Elle permet de regrouper les organismes vivants en
taxons (ou taxa) selon leur similitude et leur parenté
évolutive.
▪ Au sens large du terme, la taxonomie regroupe : la
classification, la nomenclature et l’identification
bactérienne
Classification / Taxonomie
Niveaux taxonomiques :
• Domaine → Phylum → Classe → Ordre → Famille→
Genre → Espèce → sous-espèce.
• Des subdivisions de l’espèce sont proposées :
o Biovars ou biotypes : sur la base de caractères biochimiques
o Sérovars ou sérotypes : sur la base de caractères antigéniques
o Pathovars ou pathotypes : sur la base de facteurs de pathogénicités
o Phagovars ou lysotype : sur la base de la sensibilité aux phages
Classification / Taxonomie
L’unité de base de la classification = l’espèce
❑ Définition d’une espèce :
Actuellement, la définition est basée exclusivement sur l’analyse de
caractères génomiques (16S, génome complet), et excluent tout
caractère phénotypique.
• Sur la base de l’ARNr 16S: le seuil d’identité est fixé à < 98.7%
• Sur la base de l’hybridation ADN/ADN (dDDH): < 70%
Classification / Taxonomie
L’unité de base de la classification = l’espèce
❑ Définition d’une espèce :
• L’espèce bactérienne regroupe l’ensemble des souches considérées
comme suffisamment proches de la souche type de l’espèce pour y
être assimilées.
• La souche type de l’espèce ayant été au préalable clairement définie
par les caractères génomiques et déposée comme souche de
référence.
• La souche type est symbolisée par T
Ex: Acinetobacter ihumii strain-P8049T
Classification / Taxonomie
Ex: Escherichia coli
Domaine Bacteria
Phylum Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Enterobacterales
Famille Enterobacteriaceae
Genre Escherichia
Espèce Escherichia coli
Sérovars Escherichia coli O157 : H7
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Classification / Taxonomie
Ex: Enterobacter cloacae
Domaine Bacteria
Phylum Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Enterobacterales
Famille Enterobacteriaceae
Genre Enterobacter
Espèce Enterobacter cloacae
Sous espèces Enterobacter cloacae subsp. cloacae
Enterobacter cloacae subsp. dissolvens
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Classification / Taxonomie
Ex: Streptocoques
Domaine: Bactérie
Phylum: Bacillota
Classe: Bacilli
Ordre: Lactobacillales
Famille: Streptococcaceae
Genre: Streptococcus
Espèces: 238 espèces connues à ce jour (Mai 2025)
Streptococcus pneumoniae
Streptococcus pyogenes
Streptococcus agalactiae
Streptococcus bovis
Streptococcus mutans
Streptococcus oralis, sanguis, intermedius
…..
Sous Espèces: 37 Sous espèces connues à ce jour (Mai 2025) 16
Nomenclature des bactéries
❑ Définition: C’est discipline qui établit les règles d'un
langage international permettant de désigner par un même
nom, des bactéries identiques dans n’importe quelle région
du monde
❑ La nomenclature des bactéries est binomiale
❑ Elle est réglementée par le Code International de la
Nomenclature Bactérienne
Nomenclature des bactéries
❑ Dénomination d’une espece par binôme latin Genre +
espèce. le premier terme est le nom de genre
❑ Genre
• Le genre est toujours en italique ou souligné (à défaut).
• 1ère lettre du genre en majuscule
• Après sa première citation dans le texte, le nom du genre
est abrégé à sa première lettre suivie d’un point
Ex: Neisseria gonorrhoeae ou N. gonorrhoeae
Escherichia coli ou E. coli
Nomenclature des bactéries
❑ Dénomination d’une espèce par binôme latin Genre +
espèce.
❑ Espèce
• écrite en Italique (ou souligné dans les livres et manuscrits).
• Sa première lettre en minuscule.
Ex: Escherichia coli
Nomenclature des bactéries
❑ Dénomination d’une espèce par binôme latin Genre +
espèce.
❑ Sous espèce
Les noms des sous-espèces sont formés d'une combinaison
ternaire commençant par le nom d’espèce suivi par
l'abréviation « subsp. » et d’un troisième terme propre à la
sous-espèce
Ex: Pseudomonas chlororaphis [Link]
Nomenclature des bactéries
Exception:
Pour Salmonelles: il existe une multitude de sérovars pour la
sous-espèce Salmonella enterica enterica, il est convenu de
les dénommer par le binôme Genre + Sérovars.
Ex:
• Salmonella Typhi
au lieu de
• Salmonella enterica subsp. enterica serovars Typhi
Nomenclature des bactéries
❑ Dénomination d’une espèce par binôme latin Genre +
espèce.
❑ Famille
• se termine par « –aceae ».
• Toujours en italique
Ex : Enterobacteriaceae; Streptococcaceae; Staphylococcaceae
❑Ordre
• se termine par « ales »
• Ex : Enterobacterales; Lactobacillales
Identification des bactéries
❑ Définition
L’identification consiste à placer un individu dans un taxon
connu. La souche inconnue est comparée à des espèces déjà
décrites (souches Types) et le nom de l’espèce la plus
similaire est proposé.
❑ Détermination du genre et de l’espèce d’un bactérie
nouvellement découverte
• Elle est basée sur la taxonomie polyphasique. Cette
approche inclut les caractères :
o phénotypiques,
o phylogénétiques et
o génotypiques
Conclusion
• La Taxonomie bactérienne fournie une « banque de
données » sur les bactéries et permet la description de
groupes d'organismes distincts et reconnaissables.
• Elle est indispensable pour identifier une nouvelle
bactérie et donne accès à la phylogénie bactérienne.
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