GUIDE PRATIQUE

À L’USAGE DES
DOCTORANTES ET
DES DOCTORANTS
Table des matières
1. Concevoir sa démarche
scientifique de manière ouverte
Utiliser des ressources librement
accessibles .................................................................. p. 6
Prévoir la gestion des données ..................................... p. 8
Travailler de manière reproductible :
pour soi, pour les autres ............................................... p. 11

2. Diffuser sa recherche
Diffuser ses publications en accès ouvert .................... p. 16
Rendre sa thèse librement accessible .......................... p. 21
Ouvrir les données de recherche .................................. p. 25

3. Préparer l'après-thèse,
rejoindre le mouvement
Des politiques publiques enracinées ............................ p. 30
Évaluer la recherche autrement ................................... p. 32

Agir dès maintenant ...................................................... p. 34

Aller plus loin ................................................................. p. 35
Glossaire ...................................................................... p. 36
Sources ....................................................................... p. 38

Légende
Le texte souligné renvoie au glossaire.
▼ signale des outils donnés en exemple.

Version numérique disponible sur le site [Link]

Préambule La science ouverte est née des nouvelles opportunités offertes
par la révolution numérique en matière de partage et de
diffusion des contenus scientifiques. Elle consiste d’abord
à rendre accessibles à tous les résultats de la recherche, en levant les barrières
techniques ou financières qui entravent l’accès aux publications scientifiques.
Elle consiste aussi à ouvrir la boîte noire du chercheur en partageant autant que
possible les données et les méthodes sous-jacentes aux publications.
Le choix de la science ouverte revient d’abord à affirmer qu’une recherche
majoritairement financée sur fonds publics doit restituer le plus largement
possible ses résultats au public. L'ouverture est une condition nécessaire de
la reproductibilité des résultats scientifiques, le gage d’une recherche mieux
documentée et plus étayée, le partage renforce le caractère cumulatif de la
science et favorise ses avancées. Une science ouverte et transparente contribue
également à accroître la crédibilité de la recherche dans la société, un enjeu dont
la crise sanitaire nous a rappelé toute l’importance. Elle est porteuse enfin d’un
profond mouvement de démocratisation des savoirs au bénéfice des organisations,
des entreprises, des citoyens, et particulièrement des étudiants, pour lesquels la
facilité d’accès à la connaissance est une condition de la réussite.
Les politiques de science ouverte sont désormais portées au plus haut niveau.
Elles le sont par l'Union européenne, qui demande l’ouverture des publications
et des données des recherches qu’elle finance, et, depuis 2021, définit la science
ouverte comme un critère d’excellence scientifique. Elles le sont aussi, à l’échelle
de la planète, par le G7 et l’UNESCO. En France, la ministre de l’Enseignement
supérieur, de la Recherche et de l’Innovation Frédérique Vidal a renforcé son
engagement en lançant en juillet 2021 le deuxième Plan national pour la science
ouverte.
En définitive, ce sont bien les chercheurs qui, à travers leurs engagements et leurs
pratiques, incarnent et font vivre la science ouverte. Au moment où vous vous
engagez dans la préparation de votre doctorat, dernière étape de votre parcours
de formation et première étape de votre vie professionnelle, profitez donc de ce
guide pour engager le dialogue au sein de votre équipe de recherche.
Le Passeport pour la science ouverte est un guide conçu pour vous accompagner
à chaque étape de votre parcours quelle que soit votre discipline de recherche,
depuis l’élaboration de votre démarche scientifique jusqu’à la diffusion de ses
résultats. Il vous propose une série de bonnes pratiques et d’outils directement
activables et il s’adresse à l’ensemble des champs disciplinaires.
Nous souhaitons qu’il vous donne l’envie et les moyens de concrétiser les
ambitions de la science ouverte, en partageant avec le plus grand nombre
les résultats et les données des recherches que vous allez conduire.

Anne-Sophie Barthez Claire Giry

Directrice générale de l’enseignement Directrice générale
supérieur et de l’insertion professionnelle de la recherche et de l’innovation
4
 1

Concevoir
sa démarche
scientifique
de manière
ouverte
5
Utiliser des ressources librement accessibles

Vous débutez votre thèse. Vous avez besoin d’accéder aux publications,
aux communications et aux données déjà produites dans votre domaine.
Votre course d’obstacles est sur le point de commencer…

Accéder, réutiliser
Le mouvement de la science
ouverte vise à faciliter l’accès
et à encourager la réutilisation
des contenus scientifiques.
On parle couramment :
• Des ressources
en accès ouvert : grâce à
leur auteur et/ou à leur
éditeur, on peut accéder
librement à ces ressources sans
paiement par le chercheur ou
l'institution.
• Des ressources libres :
non seulement en accès ouvert,
elles sont aussi réutilisables,
en fonction de la licence de diffusion. Par exemple, les licences Creative
Commons permettent d'autoriser la réutilisation, en respectant les conditions
fixées par l'auteur. Pour en savoir plus, rendez-vous sur ▼[Link].

BON À SAVOIR

Le fait qu’une ressource soit en accès ouvert ne constitue pas une

garantie de qualité. Comme toute ressource documentaire, elle doit
faire l’objet d’une évaluation critique avant d’être utilisée.

6
Où chercher des ressources ?

Plateformes de revues Archives ouvertes : institutionnelles

en accès ouvert : les revues ou thématiques, les productions
en accès ouvert présentent scientifiques y sont déposées par
des modèles économiques et les chercheurs eux-mêmes pour une
éditoriaux diversifiés. consultation libre. Explorez ▼HAL,
▼OpenEdition Journals met à l’archive pluridisciplinaire de la
disposition 450 publications dans recherche française.
le domaine des sciences humaines
et sociales.
▼Persée numérise et diffuse des
collections complètes de revues
de manière rétrospective.

Bases de thèses ou
de travaux académiques :
ces bases agrègent les collections
de thèses numériques des
universités et centres de
Plateformes de prépublications recherche. Rendez-vous sur
ou documents de travail : ▼Dart-Europe ou sur ▼Open
la mise à disposition de ces articles Access Thesis and Dissertation
encore non publiés permet de découvrir (OATD).
rapidement les approches de recherche
les plus récentes. Découvrez ▼arXiv,
une archive de prépublications en
mathématiques, physique et astronomie.

Moteurs de recherche
spécialisés : ces moteurs
agrègent les contenus en libre
accès et facilitent ainsi leur
découverte. ▼Core ([Link])
Entrepôts de données : est un moteur de recherche
pluridisciplinaires ou spécialisés, spécialisé dans les publications
ils permettent la recherche de académiques en libre accès
différents types de données ainsi (ouvrages, articles, thèses…).
que le dépôt, la conservation et le ▼Unpaywall s’installe comme
partage des données de la recherche. une extension sur un navigateur
▼[Link] répertorie des et propose pour chaque article
entrepôts de données disponibles. disponible dans sa base une
version en libre accès.

7
Prévoir la gestion des données

LES DONNÉES DE LA RECHERCHE, C’EST QUOI ?

« Les données de la recherche sont définies comme des

enregistrements factuels (chiffres, textes, images, sons, etc.), qui sont
utilisés comme sources principales pour la recherche scientifique et
sont généralement reconnus par la communauté scientifique comme
nécessaires pour valider les résultats de la recherche. »
(source : Organisation de Coopération et de Développement
Économiques - OCDE)

Pourquoi gérer les données de recherche ?

Dès le début de vos recherches, vous allez collecter, produire et exploiter des
données. La gestion des données de la recherche (Research Data Management -
RDM) contribue au processus de recherche. Elle concerne l’ensemble des opérations
de collecte, description, stockage, traitement, analyse, archivage et mise en
accès des données.

Comment gérer les données de recherche ?

La gestion des données s’anticipe dès le début du projet, grâce à l’élaboration
d’un Plan de gestion des données (Data Management Plan - DMP). Ce document
vous aide à réfléchir à la manière dont vous organisez vos données, vos dossiers
et autres documents d’appui pendant et à l’issue du projet. De nombreuses
agences de financement de la recherche, dont l'Agence nationale de la recherche
(ANR), demandent désormais la fourniture d’un DMP.
Le DMP est un document évolutif à concevoir avant le démarrage de la collecte
des données et à mettre à jour tout au long de votre projet de recherche.

8
 collecte

mise en accès

description

archivage

stockage

traitement
et analyse

Une bonne gestion des données est utile pour soi et pour les autres.
Elle permet de retrouver facilement ses données, de les rendre
accessibles et réutilisables par d’autres. À l’issue du projet,
elle facilite l’archivage et la diffusion
des jeux de données.

9
Que doit contenir un Plan de gestion des données ?
Collecte et documentation : l’objectif est de décrire le type, le format et le volume des
données que vous allez collecter. Le format des données produites, généralement
lié aux logiciels utilisés, a des conséquences sur les possibilités d’archivage à long
terme et de partage. Cette première description permet de créer une documentation
(métadonnées) utile pour la compréhension de vos données et qui sera à enrichir lors
de la phase de production.

Sauvegarde et stockage : comment les données seront-elles stockées et

sauvegardées pendant la recherche ? Qui sera responsable de la récupération des
données en cas d’incident ?

Points juridiques et sécurité : quelles règles de protection s’appliquent à vos

données ? Quelles méthodes allez-vous utiliser pour garantir la protection des
données personnelles ou autres données sensibles ? Renseignez-vous en particulier
sur le Règlement général sur la protection des données (RGPD) et consultez
le guide juridique sur l’ouverture des données qui vous propose une analyse du cadre
juridique en France.

Partage des données et conservation à moyen et long terme, réfléchissez :

• aux personnes qui pourraient avoir un usage de vos données,
• aux critères de choix des données à partager,
• à leur durée de conservation,
• à l’entrepôt de données où vous pourriez les déposer,
• à la manière d’identifier vos données (identifiant pérenne/DOI),
• à la manière d’identifier les différents contributeurs du jeu de données
(identifiant pérenne personnel/ ORCID).

Responsabilité et ressources : précisez les rôles et les responsabilités de chaque

acteur du projet, notamment pour les projets de collaboration qui impliquent
de nombreux chercheurs, institutions et groupes ayant des méthodes de travail
différentes.

▼DMP OPIDoR facilite l’élaboration de plans de gestion de données et

de logiciels.

Voir aussi « Ouvrir les données de recherche », p. 25

10
Travailler de manière reproductible :
pour soi, pour les autres

De quoi parle-t-on ?
Une recherche est dite reproductible
si toutes les informations relatives
au travail de recherche sont rendues
accessibles…

… ce qui rend possible la

reproduction des résultats obtenus.

La reproductibilité se décline en fonction des disciplines et des méthodes

utilisées : elle permet de conduire à l'identique un protocole expérimental, de
reproduire un traitement statistique de données quantitatives, de reconstituer les
étapes d'analyse d'un corpus d'images ou de textes…

Mener une recherche reproductible suppose de garantir l'exactitude des méthodes

utilisées et de documenter toutes les étapes de la démarche scientifique afin
d'assurer sa transparence et sa traçabilité.

BON À SAVOIR

La reproductibilité de la recherche ne garantit pas à elle seule la qualité

du travail de recherche. Les méthodes sont au cœur du débat sur la
reproductibilité. Au-delà des explications données dans les rubriques
méthodologiques des articles, il est important que les chercheurs convergent
vers des méthodes communes en matière d'analyse de données.

11
Les avantages d’une démarche reproductible
Les erreurs sont plus faciles à identifier et à corriger. Dès le départ et à chaque
modification, vous avez tracé les évolutions de vos données et/ou de votre code.
Reconstituer ce chemin a posteriori est plus pénible et bien moins sûr.
Les résultats obtenus peuvent être plus facilement attestés devant les pairs. Lors
de la soumission d'un article pour publication, il vous sera plus facile de répondre aux
demandes de vos relecteurs.
L’avenir est moins incertain. Vous vous ménagez la possibilité de réexploiter des
données, du code, des documents, etc.

Comment mettre en pratique

Gérez vos références bibliographiques avec un outil de gestion comme ▼Zotero.
L’exigence d’une norme bibliographique fiable est commune à toutes les disciplines.
Organisez les données, les fichiers et les dossiers : appliquez des conventions de
nommage, construisez des arborescences de dossiers avec une structure cohérente
et évolutive, séparez les données brutes des données analysées...
Initiez-vous aux principes de base du contrôle de version y compris si votre
pratique de recherche ne nécessite pas de compétences de codage. Rétablir une
version particulière d’un document rédigé sur plusieurs années peut être précieux.
Automatisez certaines tâches récurrentes. Vous augmenterez la fiabilité de vos
résultats et faciliterez la rédaction des articles scientifiques car vous pourrez faire
varier les paramètres plus facilement.
Vous disposez de peu de moyens ? Pensez aux approches collectives !
Formez-vous aux méthodes de travail collaboratif ; privilégiez des jeux de données
publics, lorsqu’ils existent.

Vous faites de l’analyse de données ?

Automatisez vos traitements et vos processus (workflows) : concevez des scripts
pour traiter les données et pour gérer les étapes de votre workflow. Par exemple,
évitez le tableur pour les grands jeux de données.
Documentez code et données : ce qui est clair sur le moment l’est moins deux
mois plus tard, même quand on en est l’auteur. Il s’agit d’expliciter la finalité des
fonctionnalités plutôt que de décrire leur fonctionnement.
Optez pour des solutions libres pour une transparence accrue et un accès garanti.

Pour retrouver les principes méthodologiques pour une science ouverte

et transparente, rendez-vous dans le MOOC : ▼Recherche reproductible :
principes méthodologiques pour une science transparente ([Link]
[Link]/fr/cours/recherche-reproductible-principes-methodologiques-
pour-une-science-transparente/).

12
 Sacha H., doctorant en génie électrique,
Sur le terrain G2Elab, Grenoble

Avant mon doctorat, en tant qu’ingénieur de J'ai pu faire une résidence avec un
recherche, j’ai participé au développement collectif d'artistes, Organic Orchestra,
d’OMEGAlpes, un outil d'optimisation de qui était à la recherche de solutions
systèmes énergétiques en open source. technologiques pour être autonomes
Cet outil permet de modéliser et d'explorer en énergie tout en réduisant l’impact
différents scénarios énergétiques pour environnemental de leur spectacle vivant
déterminer celui qui répond le mieux à d’arts numériques. Nous avons travaillé
l'objectif choisi. ensemble pour définir les contraintes
et les objectifs, et ainsi proposer des
scénarios énergétiques.
Aujourd’hui, je fais des recherches
transdisciplinaires sur des modèles,
méthodes et outils pour une approche de L’aspect ouvert d’OMEGAlpes
conception collaborative et ouverte des était une accroche pour eux : ils
composants et systèmes énergétiques ont participé à produire du savoir
au service de la transition. qui peut être utile aux autres, en
utilisant un outil ouvert.

Je suis convaincu de l'intérêt et la nécessité de la science ouverte pour faire face

au dérèglement climatique : les chercheurs doivent ouvrir les articles, données,
méthodes et outils lorsque c'est possible pour bien travailler ensemble, mais aussi
avec les citoyens, les collectifs et les autorités publiques.

13
 2

Diffuser
sa recherche
Diffuser ses publications en accès ouvert
La diffusion en accès ouvert est la mise à disposition immédiate, gratuite et
permanente sur Internet des publications scientifiques. Pour diffuser en accès
ouvert, vous disposez de plusieurs options : publier dans une revue en accès ouvert
ou déposer votre travail dans une archive ouverte. Elles ne sont pas exclusives l’une
de l’autre et vous pouvez les combiner pour assurer une diffusion maximale de vos
travaux, tout en respectant la propriété intellectuelle.

Publier dans une revue en accès ouvert

Dans le modèle traditionnel de la revue scientifique, l’accès aux articles est réservé
à ceux (particuliers ou institutions) qui ont souscrit un abonnement payant. Au
contraire, publier dans une revue scientifique en accès ouvert permet à tous d’avoir
un accès gratuit et immédiat à votre article. Pour couvrir les coûts de publication,
différents modèles de financement existent. Ils évoluent constamment et se
regroupent en deux grandes catégories :
• Avec frais : des frais de publication (souvent appelés APC - Article Processing
Charges) sont facturés. Ces frais peuvent faire l’objet d’une prise en charge par
votre laboratoire ou organisme de rattachement.

COMBIEN ÇA COÛTE ?

Le coût à l’article varie selon la revue, de plusieurs centaines à plusieurs

milliers d’euros. Le ▼Directory of Open Access Journals (DOAJ) est
un répertoire mondial des revues en accès ouvert. Il précise si la revue
facture des APC et leur montant indicatif le cas échéant.

• Sans frais : il n’y a pas de frais pour l’auteur. Le financement de la revue est
pris en charge en amont par l’organisme qui édite ou diffuse la publication
selon différentes modalités (financement institutionnel, freemium,
souscription…).
16
//////////////////// Attention ! ////////////////////
REVUES HYBRIDES
Pour augmenter leurs revenus, certains éditeurs conservent le modèle traditionnel
d’accès par abonnement tout en proposant en option payante la publication de
l’article en accès ouvert. Cette pratique revient à faire payer deux fois l’institution :
une première pour accéder à la revue ; une deuxième pour publier l’article.
Ce modèle économique controversé concerne souvent les grands éditeurs
commerciaux. Il est déconseillé de payer ces frais supplémentaires, d’autant que
vous pouvez diffuser également votre article via une archive ouverte.

ÉDITEURS PRÉDATEURS : MÉFIEZ-VOUS DES APPARENCES

Le développement du numérique a conduit à l’apparition d’éditeurs aux pratiques
douteuses, qui vous sollicitent en promettant une publication rapide. La qualité
éditoriale et le processus d’évaluation par les pairs ne sont pas garantis par ces
éditeurs, qui peuvent en revanche facturer des frais de publication. Outre le
préjudice financier, c’est votre crédibilité scientifique qui sera entachée. Il est
parfois difficile de repérer une revue prédatrice, mais des outils peuvent vous y
aider. Il existe aussi des conférences prédatrices organisées sur le même modèle.
▼Think. Check. Submit. : ce site Internet vous donne accès à un ensemble de
checklists vous permettant d’évaluer la fiabilité de la revue dans laquelle vous
envisagez de publier.

17
Déposer dans une archive ouverte
Une archive ouverte vous permet de diffuser vos travaux scientifiques, qu’ils aient
fait ou non l’objet d’une publication. Un dépôt en archive ouverte ne se substitue pas
au processus de publication dans une revue. Contrairement aux réseaux sociaux
académiques (ResearchGate, Academia), une archive ouverte garantit
la conservation pérenne et l'accessibilité à un large public.
Vous n’êtes pas limité aux articles : vous pouvez aussi déposer une thèse,
un chapitre de livre, un poster, un jeu de données, un rapport, un cours, une
communication dans un congrès, un mémoire de HDR, un compte-rendu…

L’archive ouverte peut être disciplinaire, institutionnelle ou nationale. Si vous

n’avez pas de consignes particulières, vous pouvez demander conseil à la
bibliothèque de votre établissement pour choisir le dépôt le plus approprié.

▼bioRxiv, une archive de prépublications (ou preprints) en biologie.

▼RePEc, une plateforme de documents de travail en économie.
▼Archimer, l’archive institutionnelle de l’Ifremer.
▼HAL, l’archive pluridisciplinaire de la recherche française.
▼OpenDOAR recense les dépôts d’archives ouvertes du monde entier.

BON À SAVOIR

Les archives ouvertes proposent généralement une aide au dépôt, sous

la forme de guides en ligne ou de tutoriels vidéo.

18
Vous pouvez déposer différentes versions d’un article :
• La version soumise pour publication (prépublication, appelée aussi preprint ou version
auteur) : version envoyée par les auteurs à une revue, avant le processus de révision par
les pairs.
• La version auteur acceptée pour publication (author accepted manuscript ou AAM) :
version comportant les révisions issues du processus d’évaluation par un comité de
lecture (peer-reviewing). Version sans la mise en page finale de l’éditeur.
• La version finale publiée (version of record, PDF éditeur) : article avec la mise en page
finale de l’éditeur, publié dans la revue. La diffusion de cette version peut être réservée
à l’éditeur en fonction du contrat d’édition que vous avez signé.

Quels sont mes droits ?

Quel que soit le mode de diffusion que vous choisissez, la publication en accès
ouvert doit respecter les règles de la propriété intellectuelle.
• En tant qu’auteur, vous êtes titulaire de l’ensemble des droits moraux et
patrimoniaux sur votre texte scientifique, jusqu’à la signature du contrat d’édition,
par lequel vous cédez certains de ces droits à l’éditeur qui publie le texte.
• Pour les articles scientifiques, si vos recherches sont financées pour moitié
au moins sur fonds publics (cela inclut votre salaire si vous êtes doctorant
contractuel), la Loi pour une République numérique du 7 octobre 2016 (article 30)
vous permet de diffuser certaines versions de votre article en accès ouvert,
en particulier à travers le dépôt dans une archive ouverte. Cela concerne la
version soumise pour publication et la version auteur acceptée pour publication.
L'éditeur peut fixer une durée d'embargo, pendant laquelle il restreint cette
possibilité, mais la loi limite cette durée à 6 mois pour les articles en sciences,
techniques et médecine et 12 mois pour les articles en sciences humaines et
sociales.
• Pour les autres types de publications, c’est le contrat d'édition ou la politique
de l’éditeur qui font foi. ▼SHERPA/RoMEO vous permet de connaître les
politiques des éditeurs en matière d'accès ouvert.

BON À SAVOIR

Vous souhaitez déposer une publication en archive ouverte, diffuser des

données avec une licence permettant la réutilisation ? Discutez-en avec
vos coauteurs.

19
 Ségolène V., jeune docteure en archéologie,
Sur le terrain Université Paris 1

Je suis spécialisée en géoarchéologie,

j’étudie l’occupation humaine des grottes Dans le cadre de ma thèse, j’ai développé
à partir de la présence de suie dans les une méthode pionnière dans ma
concrétions calcaires. discipline : la fuliginochronologie, qui
permet d'établir très précisément (avec
une résolution annuelle) la chronique des
occupations des cavités.
En plus, je peux
archiver mon travail
de manière pérenne, La diffusion de ma thèse en accès ouvert
et ça me permet me permet de rendre accessible des
également, au besoin, contenus qui n’ont pas tous été publiés et
de prouver l'antériorité de donner de la visibilité à cette méthode
de mes travaux dans ce encore peu connue. J’aime pouvoir
nouveau domaine. accéder aux thèses des autres, alors je
rends la mienne disponible.

Aujourd’hui, je travaille pour mon laboratoire, avec d'autres chercheurs,

à une base de données collaborative sur la plateforme ArchéoScopie.
J’y classe mes photos prises sous microscope. Ce partage de données
donne de la visibilité aux chercheurs qui les ont produites, permet à
chacun de réutiliser les images (plutôt que de réinventer sans cesse
la roue !), fournit des exemples pour les enseignements, et sert de
plateforme d’échanges et de discussions scientifiques.

20
Rendre sa thèse librement accessible

Déposer sa thèse
En tant que doctorant et docteur, vous êtes concerné par les dispositions de
l’arrêté du 25 mai 2016 fixant le cadre national du doctorat (formation, délivrance
du diplôme). Votre fichier électronique de thèse fait l’objet d’un dépôt obligatoire
auprès de votre établissement.
Votre établissement procède ensuite à l’archivage pérenne et au référencement
de votre thèse dans le catalogue national Sudoc et dans le portail ▼[Link].

Diffuser sa thèse
Une fois votre thèse déposée et traitée, celle-ci va être diffusée en ligne :
• librement sur Internet si vous donnez votre accord dans le contrat que vous
signez avec l'établissement de soutenance ;
• sinon, en accès restreint au sein de la communauté universitaire française
(obligatoire).
Vous pouvez différer la diffusion en ligne de votre thèse en la soumettant à une
période d’embargo pendant laquelle le fichier est disponible uniquement au sein
de la communauté universitaire.
Seules les thèses confidentielles ne peuvent être diffusées. La confidentialité est
décidée par le chef d’établissement, non par le docteur, et s’accompagne d’une
soutenance de thèse à huis clos. Elle est toujours limitée dans le temps.
Votre établissement de soutenance définit l'archive ouverte (par exemple,
HAL-TEL) utilisée pour la diffusion de votre thèse. Vous pouvez aussi déposer
vous-même votre thèse dans une archive ouverte.

La diffusion de votre thèse implique de votre part le respect :

• du code de la propriété intellectuelle : Si votre thèse contient des œuvres
sous droits, vous devez obtenir l'autorisation des ayants droits pour
les réutiliser et les diffuser. Les œuvres du domaine public ne sont pas
concernées par cette disposition ;
• du Règlement général sur la protection des données (RGPD) : si votre thèse
contient des données personnelles concernant des tiers, celles-ci doivent
être anonymisées ou pseudonymisées.

21
 Les étapes du dépôt et de la diffusion

1. Vous
soutenez 2. Vous apportez
votre les corrections
thèse. demandées et
faites valider
votre thèse.

3. Vous déposez
la version finale
de votre thèse et
signez le contrat
de diffusion.

4. La bibliothèque
universitaire
se charge du
traitement
et de la
diffusion
de votre thèse.
Vous pouvez
aussi déposer
vous-même votre
thèse dans une
archive ouverte.

22
Pourquoi choisir l’accès ouvert pour sa thèse ?
La diffusion large d’une thèse est aujourd’hui une bonne pratique, largement
encouragée.
• Votre travail sera nettement plus visible, plus téléchargé et davantage cité par
d’autres chercheurs et étudiants.
• Cela favorise votre insertion dans la communauté académique (consultation
par un jury de sélection).
• Une thèse plus largement diffusée est bien mieux protégée contre le plagiat
qu’un travail diffusé de manière restreinte.
• Les statistiques de téléchargement peuvent conduire un éditeur à proposer
un projet d’édition. Attention toutefois aux sollicitations par des sociétés qui se
présentent comme des maisons d’édition mais ne proposent en réalité aucun
travail éditorial de qualité sur le texte de votre thèse.
• Votre thèse disposera d’une adresse de consultation en ligne pérenne et
validée.

PUIS-JE DIFFUSER MA THÈSE SI J'AI UN PROJET DE PUBLICATION ?

La diffusion de votre thèse soutenue n’est pas un obstacle. Cependant,

il peut exister des raisons objectives d'en restreindre temporairement la
diffusion, notamment en cas de projet de publication rapide d’un article.
Il est alors conseillé d’attendre quelque temps avant d'en ouvrir l'accès.
Parlez-en avec votre directeur de thèse ou lors du jury de soutenance.

Si vous souhaitez publier une monographie tirée de votre thèse, ce

projet s'inscrit dans un temps long et nécessite un travail éditorial, une
réécriture et une adaptation. On ne publie jamais telle quelle la version
soutenue d'une thèse, sa diffusion ne pose donc pas de difficulté.
Demandez conseil à votre éditeur ou à votre directeur de thèse.

23
 Minh-Châu N., doctorante en phonétique,
Sur le terrain Université Sorbonne Nouvelle - Paris 3

Je suis phonéticienne : j’étudie les sons

Pendant mon master, j’ai fait des visites
des langues, notamment les dialectes peu
sur le terrain dans la province de Phú Thọ
étudiés du Vietnam.
pour enregistrer des données du dialecte
peu documenté de Kim Thượng Mường :
des contenus phonologiques et lexicaux,
des récits, des dialogues et des chansons.

L’article est cité et téléchargé,

mais il sera progressivement
Avec deux autres chercheurs, j’ai publié
remplacé par de nouveaux
un article qui est disponible dans HAL.
travaux, alors que les données
Les jeux de données ont été déposés
primaires ont une valeur illimitée.
en ligne, dans la collection Pangloss du
CNRS, un fonds sonore de langues rares.

Dans mon doctorat, je continue en mode science ouverte : en plus

de l’étude phonétique, une partie de mon travail consiste à préparer
toutes les données qui ont été enregistrées pour la conservation à
long terme dans Pangloss. Je suis contente de contribuer ainsi à la
préservation des langues de mon pays d'origine !

24
Ouvrir les données de recherche
Un principe essentiel est à retenir : les données doivent être « aussi ouvertes que
possible, aussi fermées que nécessaire ». Autrement dit : il convient de diffuser
largement les données mais certaines situations peuvent justifier la mise en place
de restrictions d’accès.

Diffuser les données de recherche, pourquoi ?

POUR UNE RECHERCHE PARTAGÉE ET TRANSPARENTE
L’ouverture des données au niveau international permet à chaque chercheur
de réutiliser des jeux de données produits par d’autres. Les jeux de données
disponibles peuvent également être exploités en masse grâce à des technologies
de fouille de données (Text & Data Mining, TDM).
Le coût engendré par la création, la collecte, le traitement des données peut
être très élevé. Les mauvaises pratiques autour des données entraînent également
un coût important estimé en Europe à 10 milliards d’euros par an (European
Commission, 2018).
Les recherches financées par l’argent public doivent pouvoir bénéficier à
tous. Ouvrir les données renforce la confiance des citoyens et leur permet de
s’impliquer, notamment dans le cadre des sciences participatives.
Mettre vos données en ligne contribue à augmenter la visibilité de vos travaux
et permet d’être davantage cité. Selon une étude publiée dans la revue PLOS
ONE, la diffusion des données liées à une publication augmente de 25 % les
citations de l’article (Colavizza, Hrynaszkiewicz, Staden et al., 2020).
Rendre vos données disponibles offre une meilleure garantie de transparence
de la recherche et vous permet de vous prémunir contre les erreurs et la fraude.

POUR RÉPONDRE À UNE OBLIGATION

La Loi pour une République numérique assimile les données de recherche à
des données publiques. A l’instar des données produites par l’administration
en France, elles sont désormais incluses « par défaut » dans le principe de
données ouvertes. En principe, les données de recherche doivent être publiées
sur Internet et rendues librement réutilisables. Il y a des exceptions liées à la
protection des données personnelles et de la vie privée (RGPD), à la protection
des droits de propriété intellectuelle, au respect des secrets industriels et
commerciaux.
Les financeurs de vos travaux de recherche peuvent également imposer
la diffusion de vos données.
Enfin, pour valider vos travaux et diffuser votre article, un éditeur peut exiger
le dépôt de vos données dans un entrepôt de données.

25
 Comment bien diffuser vos données ?
RESPECTEZ LES PRINCIPES FAIR

Le principe Findable (Facile à trouver) a pour

objectif de faciliter la découverte des données
par les humains et les systèmes informatiques et
requiert une description et une indexation des
données et des métadonnées.

Le principe Accessible encourage à stocker

durablement les données et les métadonnées et à
faciliter leur accès et/ou leur téléchargement, en
spécifiant les conditions d’accès (accès ouvert ou
restreint) et d’utilisation (licence).

Le principe Interoperable peut se

décomposer en : téléchargeable, utilisable,
intelligible, et combinable avec d'autres
données, par des humains et des machines.

Le principe Reusable (Réutilisable) met en avant

les caractéristiques qui rendent les données
réutilisables pour de futures recherches ou
d’autres finalités (enseignement, innovation,
reproduction/transparence de la science).

Source : Produire des données FAIR. In Dzalé Yeumo, E., L'Hostis, D., Cocaud, S. Gestion
et partage des données scientifiques. INRA [Internet]. 9/08/2018 [consulté le 15 mai
2020]. Disponible sur [Link]

26
POUR CHOISIR LE BON ENTREPÔT, VÉRIFIEZ :
• les conditions d’utilisation de l’entrepôt, dont les licences,
• les types et formats de données acceptés,
• la possibilité de déposer plusieurs versions d’un jeu de données,
• les garanties offertes en matière d’archivage et d’accès pérenne.
Le dépôt dans un entrepôt de données peut être gratuit ou payant en
fonction du modèle économique de l'entrepôt. Dans certains cas, les coûts de
fonctionnement de l'entrepôt sont pris en charge par des institutions.

▼Zenodo, entrepôt généraliste pour la recherche européenne

▼Dryad, [Link], pour les sciences de la vie, l’agronomie,
les géosciences
▼[Link], répertoire des entrepôts de données multidisciplinaire

VOUS POUVEZ AUSSI CHOISIR DE PUBLIER VOS DONNÉES

DANS UN DATA PAPER
Un data paper est un article scientifique consacré à la description
d'un jeu de données. Il peut faire l'objet d'une publication dans un data
journal, entièrement consacré à ce type d'article, ou dans une revue
classique. Dans tous les cas, il fait l'objet d'une évaluation par les pairs.
En publiant un data paper, votre objectif est de porter à la connaissance
de la communauté scientifique l'existence d'un jeu de données original,
pouvant faire l'objet d'une réutilisation par d'autres chercheurs et dans
d'autres contextes scientifiques.
Un data paper comporte généralement les éléments suivants :
• un accès au jeu de données même, sous la forme soit de fichiers
annexés, soit d'un lien pérenne vers un entrepôt de données ;
• une description fine (métadonnées) du jeu de données (contexte de
production, auteurs, droits attachés…).

27
28
 3

Préparer
l’après-thèse,
rejoindre le
mouvement

29
Des politiques publiques enracinées
Née dans les années 2000 de l’initiative de chercheurs engagés, la science ouverte
est désormais enracinée dans les politiques publiques.

La France s’engage en faveur de la science ouverte !

2016, Loi pour une République numérique
Cette loi offre un cadre juridique permettant la diffusion en libre accès des
travaux publiés dans une revue et définit le principe d’ouverture par défaut des
données administratives.
2018, 2021, premier, puis deuxième Plan national pour la science ouverte
Couvrant un domaine plus large, le plan définit un programme d'actions
organisées autour de quatre objectifs : généraliser l'accès ouvert aux
publications, structurer, partager et ouvrir les données de la recherche, ouvrir
et promouvoir les codes sources produits par la recherche, transformer les
pratiques pour faire de la science ouverte le principe par défaut. Le plan
s’articule avec les dynamiques européennes et internationales. Il prévoit
l’organisation de formations pour disséminer les bonnes pratiques et encourage
les établissements à se doter de politiques de science ouverte.

30
 Votre établissement s’est-il déjà doté d’une politique/d’une charte de science
ouverte comme Sorbonne Université, Université Toulouse - Jean Jaurès,
et le CNRS ? Renseignez-vous !

L’Agence nationale de la recherche (ANR)

L’ANR conditionne désormais l’attribution de financements au respect des principes
de science ouverte, parmi lesquels l’accès complet et immédiat aux publications
(articles) résultant des appels à projets lancés à partir du 1er janvier 2021. Un plan de
gestion des données est également exigé.

Et au niveau européen ?
Horizon Europe
Ce programme de financement qui débute le 1er janvier 2021 consolide la politique
de science ouverte initiée par le programme Horizon 2020. Il inclut une obligation
de diffusion des publications en accès ouvert et une incitation forte à la diffusion
de données selon les principes FAIR, avec plan de gestion des données associé.
Le Plan S
Issu de la cOAlition S qui regroupe des agences de financement de la recherche
engagés dans le développement de la science ouverte, le Plan S fixe comme
principe la diffusion libre et immédiate des publications financées par ces
agences dans des revues, des plateformes en accès ouvert ou dans des archives
ouvertes. Il prend effet à compter de janvier 2021.
HRS4R
Le label HR Excellence in Research (HRS4R), attribué par la Commission
européenne, valorise les établissements signataires de la Charte européenne des
chercheurs et du Code de conduite de recrutement des chercheurs et conditionne
l’obtention de financements européens. La Charte des chercheurs contient
notamment une section « Ethique et bonnes pratiques professionnelles » qui
inclut les pratiques de la science ouverte.

Votre établissement a-t-il déjà obtenu, ou est-il engagé dans une démarche
d’obtention du label HRS4R ? Si oui, existe-t-il un volet science ouverte ?
Renseignez-vous !

31
Évaluer la recherche autrement
Parce qu’elle représente une évolution profonde de la science et de la recherche,
la science ouverte interroge désormais les pratiques d’évaluation.

Réinventer l’évaluation par les pairs

L’évaluation par les pairs (peer review) est un préalable à toute publication et une
garantie de la fiabilité des résultats scientifiques. Le processus est généralement
organisé par la revue ou l’éditeur qui soumet le manuscrit à d’autres chercheurs du
même domaine que l’auteur et non connus de lui. Or ce système est aujourd’hui en
difficulté, notamment parce que les évaluateurs peuvent être des concurrents des
évalués. A l’inverse, certains évaluateurs travaillent parfois sur des thématiques
trop éloignées de celle de l’article à évaluer. De manière générale, l’évaluation par
les pairs n’est pas une garantie infaillible : depuis les années 2000 on observe une
augmentation de la publication d’articles frauduleux ou contestables, en raison de
manipulation de données ou de plagiat (Grieneisen & Zhang, 2012 ; Fang, Steen &
Casadevall, 2013).
Avec la science ouverte, des pratiques d’Open Peer Review ont vu le jour, selon
deux modalités principalement : le nom des évaluateurs devient public et/ou
l’évaluation se fait sur une plateforme qui permet à tous les utilisateurs de
commenter l’article. Cette pratique est facilitée par l’existence de plateformes de
prépublications, comme ▼arXiv et ▼bioRxiv, sur lesquelles les revues peuvent
s’appuyer pour relever les commentaires.

Exemple
La plateforme ▼Peer Community in organise une évaluation par les pairs
sur des prépublications déposées en archive ouverte : cette relecture peut
aboutir à l’obtention d’un certificat de validation. Les revues peuvent alors les
publier librement sans avoir à solliciter de rapporteurs.

Dans certaines disciplines comme la biologie-santé, le pré-enregistrement des

hypothèses et protocoles (rapports enregistrés ou registered reports) dans des
registres ou dans des revues conduit à faire évoluer les pratiques. L’évaluation
par les pairs a lieu en deux temps, ce qui réduit l’effet de biais de publication
(tendance à publier uniquement les résultats positifs) et met en valeur le
processus de recherche.

32
L’évaluation des chercheurs et des chercheuses
au regard de la science ouverte
La volonté de modifier le processus d’évaluation s’appuie notamment sur la
Déclaration de San Francisco (DORA) de 2013 et sur sa première préconisation :
éviter le recours à des métriques basées sur les revues, comme le facteur d’impact,
pour évaluer le chercheur.
Construits selon les principes de la science ouverte, les nouveaux standards de
l’évaluation des chercheurs doivent :
• inciter à la diffusion sans entrave des productions scientifiques,
• prendre en compte l’ensemble des aspects d’une activité de recherche.
Exemple
La nouvelle feuille de route du CNRS prévoit l'évaluation des résultats
eux-mêmes et non des publications. Les données, les codes des logiciels
développés et les prépublications doivent être fournis aux évaluateurs et
les productions doivent être accessibles dans HAL, lorsque c'est possible.

Enfin, ces nouveaux standards doivent tenir compte de la science ouverte en

valorisant de nouvelles pratiques :
• la diffusion en accès ouvert des résultats, y compris lorsqu’ils sont négatifs,
• la publication de travaux consistant à reproduire des expériences,
• la publication d’un carnet de recherche décrivant les étapes de construction
de sa démarche scientifique,
• la mise en ligne d’une base de sources textuelles ou iconographiques,
• la soumission des protocoles de recherche à l’évaluation par les pairs avant
l’expérimentation…

33
Agir dès maintenant
Quand vous le pouvez, soumettez vos publications à des revues en accès ouvert.

Déposez vos publications dans une archive ouverte :

• Gardez la dernière version validée par les pairs mais pas encore mise
en page par l'éditeur.
• Demandez l’accord de vos coauteurs.
• Déposez la dernière version validée par les pairs dans une archive ouverte.
Participez aux discussions de votre communauté disciplinaire sur
des prépublications déposées en archive ouverte.

Documentez et partagez les données de recherche et/ou le code source

que vous avez développé :
• Stockez les données sur un support pérenne, en accord avec la politique
de votre équipe ou de l’établissement.
• Documentez les données par des métadonnées afin de les rendre
réutilisables.
• Déposez les jeux de données associés à vos publications dans
un entrepôt en ligne.
• Déposez vos codes dans une archive ouverte pérenne dédiée,
comme ▼Software Heritage.

Suivez les évolutions de la science ouverte, et impliquez-vous !

DES QUESTIONS ?
Ce guide consacré à la science ouverte vous a permis de balayer toutes
les problématiques à prendre en compte et les pistes à explorer pour votre
travail de thèse. Pour aller plus loin, n’hésitez pas à solliciter les services
universitaires qui peuvent répondre à vos questions, vous accompagner
individuellement et vous proposer des formations dédiées à ces sujets.
Vos interlocuteurs :
• votre école doctorale (en premier lieu) et/ou votre laboratoire de
rattachement ;
• le service commun de la documentation de votre établissement / la
bibliothèque universitaire (formation, dépôt du sujet de thèse, gestion du
portail d’archives ouvertes, accès à la documentation, etc.) ;
• le réseau des URFIST (Unité Régionale de Formation à l’Information
Scientifique et Technique) qui propose des formations sur place ou à
distance.

34
Aller plus loin
RESSOURCES GÉNÉRALES
Ouvrir la science : Ressources
Ressources et guides diffusés par le Comité pour la science ouverte.
[Link]
Deuxième Plan national pour la science ouverte
Ce document présente le plan d'action français mis en place par le ministère de
l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation.
[Link]
FOSTER Open Science
Portail de formations en ligne sur la science ouverte (en anglais), créé par FOSTER, un
consortium d’institutions universitaires et de recherche dans 6 pays européens, financée
par l’Union européenne. [Link]
CoopIST (Coopérer en information scientifique et technique)
Un site web du Cirad qui propose de nombreuses fiches techniques sur différents aspects
de la science ouverte. [Link]
Le site Couperin de la science ouverte en France
Le consortium Couperin propose des liens et des guides concernant plusieurs aspects
de la science ouverte, notamment la diffusion des publications en accès ouvert.
[Link]
DoRANum (Données de la recherche : apprentissage numérique)
Un ensemble de ressources (fiches et vidéos) libres et réutilisables d’aide à la gestion des
données de recherche, proposé par le réseau des URFIST et l’Inist-CNRS. [Link]
RESSOURCES SPÉCIFIQUES
Publications et questions juridiques
Comité pour la science ouverte. Je publie, quels sont mes droits ? 2e édition. 2020.
Disponible sur [Link].
Reproductibilité
DESQUILBET, Loïc, GRANGER, Sabrina, HEJBLUM, Boris, et al. Vers Une Recherche
Reproductible. Bordeaux : Urfist de Bordeaux, 2019.
[Link]
Intégrité scientifique
Hcéres. Vademecum : Intégrité scientifique. 2017.
[Link]
Gestion des données
REYMONET, Nathalie, MOYSAN, Magalie, CARTIER, Aurore, et al. Réaliser un plan de gestion
de données “FAIR” : modèle. 2018. [Link]
RIVET, Alain, BACHELIERE, Marie-Laure, DENIS-MEYERE, Auriane, et al. Traçabilité des
activités de recherche et gestion des connaissances : guide pratique de mise en place. CNRS,
2018. [Link]
gestion_connaissances.pdf

35
Glossaire
Accès ouvert
Un contenu en accès ouvert est accessible à tous sans barrière : sans authentification
requise, sans ressource sous embargo, sans accès payant… Cela peut concerner des
publications scientifiques, des données, du code…
Il existe plusieurs façons de diffuser des publications en accès ouvert : l'auto-archivage
des productions scientifiques dans une archive ouverte (parfois appelé voie verte ou green
open access) ; et la publication dans une revue en libre accès, avec ou sans APC (parfois
appelé voie dorée ou gold open access).
APC (frais de publication / article processing charges)
Frais de publication qui peuvent être facturées à l'auteur (ou son institution) pour publier
en libre accès immédiat. Voir Publication en accès ouvert.
Archive ouverte
Les chercheurs déposent directement leurs travaux dans des archives thématiques ou
institutionnelles pour en permettre la consultation à tous publics, sans barrière.
Article : version soumise pour publication, version auteur ou prépublication / preprint
Version d'un article envoyée par les auteurs à une revue, avant le processus de révision
par les pairs.
Article : version auteur acceptée pour publication / accepted author manuscript
Version d'un article comportant les révisions du processus d'évaluation par un comité de
lecture ; sans la mise en page finale de l'éditeur.
Article : version finale publiée / version of record
Version d'un article avec la mise en page finale de l'éditeur, publié dans la revue.
Données de la recherche
Enregistrements factuels (chiffres, textes, images et sons), qui sont utilisés comme
sources principales pour la recherche scientifique et sont reconnus par la communauté
scientifique comme nécessaires pour la validation des résultats.
Données personnelles
Données concernant une personne physique qui est identifiée ou identifiable.
Éditeurs prédateurs ou revues prédatrices
Éditeurs ou revues avec des pratiques d'évaluation par les pairs ou des pratiques commer-
ciales contestables.
Embargo
Période pendant laquelle une production scientifique ne peut pas être diffusée en accès
ouvert. Pour les publications scientifiques financées par l'Etat, la Loi pour une République
numérique limite la période d'embargo après laquelle l'écrit peut être diffusé ouvertement,
quel que soit le contrat avec l'éditeur (voir Loi pour une République numérique). Pour les
thèses, il est possible pour l'auteur de définir une période d'embargo pendant laquelle la
thèse est disponible uniquement au sein de la communauté universitaire.

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Entrepôt de données
Pluridisciplinaire ou thématique dans une discipline, des jeux de données y sont déposés,
documentés et diffusés. Un entrepôt permet un meilleur archivage et un accès plus large
aux données qu'un serveur de laboratoire ou une autre solution locale.
FAIR (principes)
Les principes FAIR visent à rendre les données faciles à trouver, accessibles, interopé-
rables et réutilisables.
Identifiant pérenne
Référence unique et stable pour un objet ou un sujet numérique (un jeu de données, un
article, un auteur...). Exemple : digital object identifier (DOI) ou l’identifiant auteur - Open
Researcher and Contributor ID (ORCID).
Licence de diffusion
La licence permet de définir les conditions de diffusion et de réutilisation d'un contenu
scientifique (exemple: Creative Commons).
Loi pour une République numérique
Cette loi de 2016 offre un cadre juridique permettant de déposer en libre accès certaines
versions des articles des revues, si les recherches sont financées pour moitié au moins sur
fonds publics. Cette loi, en assimilant les données de recherche à des données publiques,
crée une obligation légale de les diffuser librement.
Métadonnées
Informations permettant de décrire de manière normalisée des données ou des documents
numériques (par exemple, la date et les coordonnées GPS pour une photo numérique). La
qualité des métadonnées garantit le partage et la possibilité de réutilisation des données.
Plan de gestion des données (PGD, ou DMP pour Data Management Plan)
Plan évolutif, rédigé en début d'un projet de recherche, qui précise les modalités de la
gestion des données (collecte, documentation, stockage, gestion des données sensibles,
conditions d’ouverture ou de partage...).
Publication en accès ouvert
Revue ou livre diffusé immédiatement en accès ouvert. Les modèles économiques de
ces livres et revues sont variés : subventions publiques, paiements par les institutions
des auteurs (voir APC), contribution financière de sociétés savantes ou de bibliothèques
universitaires… Renseignez-vous sur le ▼DOAJ (Directory of Open Access Journals) et le
▼DOAB (Directory of Open Access Books) .
Reproductibilité
La capacité pour un autre chercheur d'obtenir les mêmes résultats en utilisant les mêmes
méthodes et données (met en lumière l'importance des méthodes de production des
résultats).
RGPD (Règlement général sur la protection des données)
Cadre juridique défini par l’Union européenne pour la gestion des données personnelles.
Voir sur : [Link]

37
Sources
ADDA, Gilles, ASKENAZI, Philippe, GANASCIA, Jean-Gabriel, et al. Les publications à l’heure de la science ouverte.
[Link]
science-ouverte_Avis-[Link]
BROWN, Titus. Software and Workflow Development Practices. [Link]
[Link]
CHRISTENSEN, Garret, FREESE, Jeremy, MIGUEL, Edward. Transparent and Reproducible Social Science
Research: How to Do Open Science. [Link]
reproducible-social-science-research
CNRS. Feuille de route du CNRS pour la science ouverte. [Link]
info/2019-11/Plaquette_ScienceOuverte.pdf
COLAVIZZA, Giovanni, HRYNASZKIEWICZ, Iain, STADEN, Isla, et al. The citation advantage of linking publications
to research data. [Link]
Comité pour la science ouverte. Types de documents, productions et activités valorisées par la science ouverte
et éligibles à une évaluation. [Link]
valorisees-par-la-science-ouverte-et-eligibles-a-une-evaluation
DESQUILBET, Loïc, GRANGER, Sabrina, HEJBLUM, Boris, et al. Vers Une Recherche Reproductible. [Link]
[Link]/hal-02144142
DoRANum. Données de la recherche : Apprentissage numérique. [Link]
Euraxess Spain. The European Charter & Code for Researchers. [Link]
charter-code-researchers#Charter
European Commission. 2019. Horizon Europe - Investing to shape our future. [Link]
horizon-europe-investing-shape-our-future_en
European Commission. 2018. Cost of not having FAIR research data. [Link]
uploads/2019/03/Cost-Benefit-analysis-for-FAIR-research-data_KI0219023ENN_en.pdf
European Science Foundation. Addendum to the cOAlition S Guidance on the Implementation of Plan S :
Principles and Implementation. [Link]
implementation-of-plan-s/principles-and-implementation/
FANG, Ferric. C., STEEN, R. Grant, CASADEVALL, Arturo. Correction for Fang et al. Misconduct accounts for the
majority of retracted scientific publications. [Link]
GRIENEISEN, Michael. L., ZHANG, Minghua. A Comprehensive Survey of Retracted Articles from the Scholarly
Literature. [Link]
INRAe. Produire des données FAIR. [Link]
Loi n° 2016-1321 du 7 octobre 2016 pour une République numérique, article 30. [Link]
[Link]?cidTexte=JORFTEXT000033202746&categorieLien=id#JORFARTI000033202841
LOWNDES, Julia S. Stewart, BEST, Benjamin D., SCARBOROUGH, Courtney, et al. Our Path to Better Science in
Less Time Using Open Data Science Tools. [Link]
MARKOWETZ, Florian. Five Selfish Reasons to Work Reproducibly. [Link]
MAUREL, Lionel. L’ouverture des données de recherche : un retour aux sources de l’Ethos de la Science. https://
[Link]/2019/06/05/louverture-des-donnees-de-recherche-un-retour-aux-sources-de-lethos-de-la-
science/
PINEAU, Joelle. How the AI community can get serious about reproducibility. [Link]
how-the-ai-community-can-get-serious-about-reproducibility/
POLDRACK, Russell A. The Costs of Reproducibility. [Link]
WHITAKER, Kirstie, AINSWORTH, Rachael, ARNOLD, Beckie, et al. The Turing Way. [Link]
com//introduction/[Link]

38
Crédits Remerciements

Direction de la publication Les doctorants des écoles doctorales

Ministère de l’Enseignement supérieur, de Lille qui ont participé aux échanges
de la Recherche et de l’Innovation sur la première version du guide
Kaouther Azouz, Paul Cambourian,
Coordination éditoriale Olivier Capra, Camille Cornut,
Université de Lille Quentin Devignes, Clémentine Garric,
Frédéric Géhanno, Marie Genge,
Conseil scientifique
Mathilde Greuet, Juliette Le Marquer,
Collège Compétences et formation
Margaux Lyonnet, Caroline Maupas,
du Comité pour la science ouverte
Meriam Meziani Mekki, Nadia Moujtahid,
Cheffe de projet Jonathan Olivier, Alizée Petitmangin,
Jennifer Morival Elena Tagliani, Hélène Villain,
Marie Winter
Rédacteurs
Johann Berti, Marin Dacos, Les doctorants qui ont partagé leurs
Gabriel Gallezot, Madeleine Géroudet, expériences de la science ouverte
Sabrina Granger, Joanna Janik, Sacha Hodencq, Minh-Châu Nguyên,
Claire Josserand, Jean-François Lutz, Ségolène Vandevelde
Christine Okret-Manville, Sébastien Perrin,
Experts consultés
Noël Thiboud
Laurence Crohem, Romain Féret,
Pour créer ce guide, le groupe Jacques Lafait, Yvette Lafosse,
de travail s’est appuyé sur la Maïté Roux.
taxonomie de la science ouverte
créée par Foster Open Science : La version numérique de ce guide est
[Link] disponible sur [Link].
resources

Design graphique
Studio 4 minutes 34
Studio [Link]
Ce guide est mis à disposition selon les
Impression termes de la licence Creative Commons
CC BY-SA 4.0 Attribution - Partage dans
L'Artésienne, Liévin
les mêmes conditions.
1ère édition: juillet 2020
Achevé d'imprimer :
Août 2021
à 15 000 exemplaires
 Le Passeport pour la science ouverte est
un guide conçu pour vous accompagner
à chaque étape de votre parcours de
recherche, depuis l’élaboration de votre
démarche scientifique jusqu’à la diffusion
de ses résultats. Il vous propose une série
de bonnes pratiques et d’outils directement
activables et il s’adresse à l’ensemble des
champs disciplinaires.

Nous souhaitons qu’il vous donne l’envie et

les moyens de concrétiser les ambitions de la
science ouverte, en partageant avec le plus
grand nombre les résultats et les données
des recherches que vous allez conduire.

Soutenu par