MECANISMES MOLECULAIRES
DES MALADIES INFECTIEUSES
David COULIBALY N’GOLO
MSc. bioMol, PhD biol. [Link]
PLAN
• Module 1 : Introduction aux maladies infectieuses
• Définition et types de maladies infectieuses
• Notions d’épidémiologie
• Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• Module 2: Biologie cellulaire et moléculaire de l'infection
• Interaction hôte-pathogène
• Mécanismes d’entrée des pathogènes dans les cellules hôtes
• Réponses moléculaires à l'infection
• Module 3 : Mécanismes moléculaires des infections virales
• Cas des infections virales
• Cas des infection bactériennes
• Cas des infections parasitaires et fongiques
Module 1
INTRODUCTION AUX MALADIES INFECTIEUSES
INTRODUCTION
• Plusieurs êtres vivants vivent dans et sur
notre corps (microbiome humain)
• Aucun dommages observé
• Dans certains cas ces organismes
➔Maladies
• Maladie = tout trouble ou altération de
l'esprit ou du corps ➔problèmes de
santé
• caractérisée par des manifestations
ou symptômes physiques/mentaux
particuliers
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
2 catégories de maladie
Maladie non infectieuse Maladie infectieuse (MI)
• Ne peut s’attraper d’une autre • Peut s’attraper d’une autre personne
personne par simple contact • Contagieux
• N’est pas contagieux • Est transmissible
• N’est pas transmissible • e.g.: Covid-19, Mpox, paludisme
• e.g.: HTA, diabète, asthme,…
Définition: Les maladies infectieuses (maladies transmissibles)= maladies
causées par des agents pathogènes qui peuvent se propager entre les organismes
et infecter des personnes, des animaux ou des plantes simplement par exposition
à l'agent pathogène ou à un autre organisme infecté.
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
• Agents pathogènes➔ maladies infectieuses
• Principaux agents pathogènes:
• Bactéries➔ maladies bactériennes (tuberculose,…)
• Virus➔ maladies virales (Mpox virus,…)
• Parasites➔ maladies parasitaires (Amibiase, paludisme,…)
• Champignons/levures➔maladies fongiques= mycoses(candidoses)
• Protéines➔ maladies à prion (Creutzfeldt-Jakob (MCJ),vache folle)
• Les MI peuvent être
• Aiguës (courte durée) ou chroniques,
• Gravité variable : de l’infections bénignes ➔infections mortelles.
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
• Moyens de transmission des MI = variés
• Ils sont dépendant de l'agent pathogène (bactérie, virus, champignon,
parasite), des conditions environnementales et de l’hôte.
• On distingue
• Les transmissions directes
• Les transmissions indirectes
• Les zoonoses
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
Transmissions Directes: le pathogène est transmis d'une personne ou
d'un animal infecté à un hôte sain sans intermédiaire.
• Mode de transmission directe
• Contact physique
• Contact peau à peau (Gale, Herpès) ➔contact physique proche
• Rapports sexuelles (MSTs) ➔ contact direct entre muqueuses
• Gouttelettes respiratoires
• Toux, éternuements ou la parole ➔ gouttelettes contenant des agents pathogènes (H1N1,
SARSCoV2,…) comme dans le cas de la grippe, de la rougeole ou de la COVID-19
• Transmission périnatale
• Une mère peut transmettre une maladie à son enfant pendant la grossesse,
l'accouchement ou l'allaitement (ex. : VIH, syphilis congénitale)
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
Transmission indirecte: implique intermédiaire (objet, environnement
ou vecteur) entre la source de l'infection et l'hôte.
• Mode de transmission indirecte
• Par objets contaminés (fomites)
• Les agents pathogènes transmis via des surfaces ou des objets contaminés, comme les
poignées de porte, les jouets, ou les équipements médicaux (ex. : Staphylococcus aureus).
• Par ingestion d'aliments ou d'eau contaminés: e.g. maladies alimentaires
(salmonellose ou le choléra)
• Vecteurs vivants (vecteurs biologiques ou mécaniques)
• vecteurs biologiques (moustiques, tiques ou puces)infectés ➔ pathogènes (ex. :
paludisme, dengue, maladie de Lyme).
• Vecteurs mécaniques (ex. : mouches) transportent les agents pathogènes sans être
infectés
DÉFINITION ET TYPES DE MALADIES INFECTIEUSES
Zoonoses: maladies infectieuses transmises d’un animal à l’humain.
• Mode de transmission des zoonoses
• Contact direct avec des animaux infectés
• Ex. : La rage (morsure d'un animal infecté), la brucellose (contact avec des animaux
d'élevage infectés).
• Consommation de produits d'origine animale contaminés
• Ex. : La listériose (produits laitiers), la trichinose (viande mal cuite)
• Transmission par vecteurs
• Ex. : La fièvre jaune, le virus Zika, le CHIKV transmises par les moustiques, et la peste
transmise par les puces des rongeurs, Fièvre de Lassa
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
• Epidémiologie
• Déf.: branche de la médecine qui étudie la distribution, les déterminants, la
fréquence et le contrôle des maladies dans une population donnée.
• Elle vise à comprendre comment les maladies se propagent, identifier les
facteurs de risque et développer des stratégies pour prévenir ou contrôler les
épidémies.
• 4 notions en épidémiologie ➔ évaluer la santé d'une population et la
dynamique des maladies: morbidité, mortalité,incidence et prévalence
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Morbidité
• Définition : La morbidité désigne l’état de maladie dans une
population donnée. Elle inclut toutes les personnes touchées par une
pathologie spécifique.
• Indicateurs associés :
• Taux de morbidité : Proportion de personnes malades dans une population.
• Exemple : Si 10 % d'une population souffre d'hypertension, le taux de
morbidité pour cette maladie est de 10 %.
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Mortalité
• Définition : La mortalité représente le nombre de décès dans une
population sur une période donnée.
• Indicateurs associés :
• Taux de mortalité brut : Nombre total de décès pour 1 000 habitants par an.
• Taux de mortalité spécifique : Décès attribués à une maladie spécifique (ex. :
cancer, paludisme).
• Exemple : Si 100 décès liés à une maladie surviennent dans une population de
10 000 personnes sur un an, le taux de mortalité spécifique est de 1 %.
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Incidence
• Définition : L’incidence mesure le nombre de nouveaux cas d’une
maladie survenant dans une population sur une période donnée.
• Indicateurs associés :
• Taux d'incidence : Nombre de nouveaux cas par unité de population et de
temps (souvent exprimé pour 100 000 habitants par an).
• Utilité : Évalue la vitesse de propagation d’une maladie.
• Exemple : Si une communauté de 1 000 personnes recense 50 nouveaux cas
de grippe en un mois, le taux d’incidence est de 5 %.
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Prévalence
• Définition : La prévalence représente le nombre total de cas (anciens
et nouveaux) d'une maladie dans une population à un moment donné.
• Indicateurs associés :
• Taux de prévalence : Nombre total de cas pour une population donnée,
souvent exprimé en pourcentage.
• Utilité : Montre la charge globale d’une maladie dans une population.
• Exemple : Si, à un instant T, 100 personnes sur 1 000 sont atteintes de diabète,
la prévalence est de 10 %.
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Incidence Vs Prévalence
Critère Incidence Prévalence
Ce qui est mesuré Nouveaux cas dans une période Tous les cas à un moment donné
Perspective Dynamique : vitesse de survenue Statique : charge globale
Exemple Nouveaux cas de Mpox en 2024 Total des cas actifs de Mpox en 2024
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
• Incidence Vs Prévalence
Critère Incidence Prévalence
Ce qui est mesuré Nouveaux cas dans une période Tous les cas à un moment donné
Perspective Dynamique : vitesse de survenue Statique : charge globale
Exemple Nouveaux cas de Mpox en 2024 Total des cas actifs de Mpox en 2024
• Relations : La prévalence dépend de l'incidence et de la durée de la maladie
Prévalence = Incidence × Durée moyenne maladie
• Maladies chroniques : Haute prévalence mais faible incidence (ex. : diabète).
• Maladies aiguës : Faible prévalence mais haute incidence (ex. : grippe saisonnière).
NOTIONS D’ÉPIDÉMIOLOGIE
Selon l'étendue géographique et l'impact des maladies on parlera:
• Épidémie: augmentation soudaine et anormale du nombre de cas d'une maladie
dans une région donnée, dépassant les niveaux normalement attendus pour une
période donnée. Elle peut concerner des maladies infectieuses (comme la grippe) ou
non infectieuses (par exemple, une épidémie d'intoxication alimentaire).
• Endémie: Maladie présente de manière constante ou récurrente dans une région
géographique spécifique, avec un taux relativement stable. Les populations locales y
sont souvent habituées et peuvent développer une immunité partielle; Les cas
surviennent de manière régulière et le niveau de transmission reste prévisible.
• Pandémie: épidémie qui s'étend à une échelle mondiale, touchant un grand nombre
de pays et de populations en même temps. Les pandémies concernent souvent des
maladies infectieuses nouvelles ou émergentes, pour lesquelles les populations n'ont
pas d'immunité.
PATHOGÉNICITÉ ET VIRULENCE DES MICRO-ORGANISMES
• Pathogénicité et virulence des micro-organismes = concepts
fondamentaux➔ microbiologie et infectiologie.
• 2 notions ➔comprendre comment???
• Interaction microorganismes - hôte,
• Microorganismes ➔ maladies
• Microorganismes➔ mécanismes pour contourner défenses immunitaires
Explorons les différents aspects de la pathogénicité et la virulence!
Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• Pathogénicité : capacité d'un microorganisme à causer une maladie.
Cela distingue les microorganismes pathogènes (capables de
provoquer une infection) des micro-organismes commensaux ou
opportunistes.
• Virulence : degré ou intensité de pathogénicité. Un microorganisme
hautement virulent provoquera une maladie plus grave ou plus
facilement qu'un micro-organisme moins virulent
NB: la virulence varie selon la souche microbienne ou l’état de l’hôte
Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• Les facteurs de virulence
• Les facteurs de virulence sont les mécanismes ou structures qui
permettent à un microorganisme de coloniser, envahir et nuire à
l’hôte.
• Ils incluent:
• Adhésion
• Invasion
• Production de toxines
Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• L’adhésion
• Étape clé pour l’établissement d’une infection.
• Les microorganismes utilisent des structures spécialisées pour se fixer
sur les cellules de l’hôte.
• Pili ou fimbriae (ex: Staphylococcus aureus)
• Adhésines(ex : protéine M de Streptococcus pyogenes).
• Glycocalyx ou capsules (ex: Streptococcus mutans sur les dents).
Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• Les Pili ou fimbriae
• Extensions de la membrane cytoplasmique
constitués d'une protéine oligomérique appelée
pilin
• Structures filamenteuses protéiques permettant la
liaison à des récepteurs spécifiques sur les cellules
hôtes.
• Jouent un rôle très important dans les
phénomènes d'adhésion des bactéries aux
muqueuses
• Autres fonctions: conjugaison, motilité
Pathogénicité et virulence des micro-organismes
• Les adhésines
• protéines spécifiques à la surface
des bactéries qui reconnaissent les
récepteurs cellulaires de l’hôte
• antigènes à la surface des germes,
qui permet aux bactéries d'adhérer
aux cellules qu'elles infectent.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Le glycocalyx ou capsules
• permettent une adhésion non spécifique en créant un biofilm qui aide à la
colonisation des surfaces
• Structures qui confèrent une protection aux bactéries et augmentent leur
capacité à survivre et à se multiplier (environnements hostiles)
• La capsule, par sa structure plus organisée et son rôle crucial dans la
virulence, est un facteur clé dans certaines infections sévères. À l'inverse, le
glycocalyx, souvent associé aux biofilms= atout pour les infections
chroniques et la colonisation de surfaces.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• L’invasion
• Certains micro-organismes pénètrent dans les tissus de l'hôte pour
échapper aux défenses et se propager. Pour cela ils utilisent:
• Enzymes dégradant les barrières :
• Hyaluronidase : dégrade l’acide hyaluronique des tissus conjonctifs.
• Collagénase : dégrade le collagène pour faciliter l'invasion.
• Mécanismes d’endocytose induite : certaines bactéries (ex. Salmonella) ou
virus forcent les cellules hôtes à les internaliser via des modifications du
cytosquelette.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Les toxines
• substances produites par les micro-organismes qui endommagent
directement ou indirectement les cellules de l’hôte
• Exotoxines (protéines sécrétées) :
• Cytotoxines : détruisent les cellules (ex. toxine diphtérique de Corynebacterium
diphtheriae).
• Neurotoxines : perturbent le système nerveux (ex. toxine botulinique de Clostridium
botulinum).
• Entérotoxines : affectent le système digestif (ex. toxine cholérique de Vibrio cholerae).
• Endotoxines (composants structuraux des bactéries Gram-négatives) :
• Lipopolysaccharides (LPS) : libérés lors de la lyse bactérienne, provoquant une
réponse inflammatoire sévère (choc septique).
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Échappement aux défenses de l’hôte
• Les micro-organismes développent également des mécanismes pour
échapper au système immunitaire
• Capsules : inhibent la phagocytose.
• Variation antigénique : modification des antigènes de surface pour éviter
la reconnaissance par les anticorps.
• Sécrétion d'enzymes : par exemple, la coagulase permet à certaines
bactéries (ex. Staphylococcus aureus) de former un caillot protecteur
autour d'elles.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
En conclusion
• la pathogénicité dépend de la capacité du micro-organisme à
envahir l’hôte, tandis que
• la virulence est modulée par la présence et l’efficacité de facteurs
de virulence spécifiques.
• Ces 2 mécanismes permettent aux micro-organismes d'assurer leur
survie et leur propagation, tout en causant des dommages à l'hôte.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Les différents réservoirs de pathogènes
• Définition: ce sont les milieux ou les hôtes dans lesquels des agents
pathogènes peuvent survivre, se développer ou se multiplier, tout en étant
une source potentielle d'infection pour d'autres organismes.
• 4 principaux type de réservoirs: humains, animaux, environnementaux et
anthropiques(artificiels
• Importance des réservoirs
• Mieux comprendre les modes de transmission des pathogènes
• De développer des stratégies de prévention et de contrôle (ex. :
vaccination, traitement des eaux, gestion des porteurs asymptomatiques)
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Les réservoirs humains de pathogènes
• Définition: ils désignent les individus ou populations dans lesquels des micro-
organismes pathogènes peuvent survivre, se multiplier et à partir desquels ils
peuvent être transmis à d'autres hôtes.
• Types de réservoirs humains
• Porteurs symptomatiques : Les individus présentant des signes cliniques de la
maladie (ex. : patients atteints de grippe).
• Porteurs asymptomatiques : Des personnes infectées, mais sans symptômes
apparents, qui peuvent propager le pathogène (ex. : porteurs sains de Salmonella
typhi ou porteurs asymptomatiques du VIH).
• Porteurs chroniques : Des individus qui hébergent le pathogène pendant une
longue période, parfois toute leur vie (ex. : porteurs chroniques de l’hépatite B).
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Mode de transmission à partir des réservoirs humains
• Les pathogènes présents dans les réservoirs humains peuvent se
transmettre par divers mécanismes :
• Transmission directe :
o Contact physique (ex. Treponema pallidum responsable de la syphilis).
o Gouttelettes respiratoires (ex. Mycobacterium tuberculosis).
• Transmission indirecte via des objets contaminés (fomites) ou des
vecteurs.
• Transmission verticale de la mère à l'enfant (ex. Toxoplasma gondii, VIH).
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Importance des réservoirs humains dans les maladies infectieuses
• Certains pathogènes ont un réservoir strictement humain, ce qui rend leur
contrôle et leur éradication possibles, comme : La variole (éradiquée grâce
à la vaccination ciblée), le Poliovirus (éradication presque totale via des
campagnes de vaccination)
• Pour certaines maladies, la persistance des porteurs asymptomatiques
complique les efforts de contrôle. Par exemple :
• Le virus de l'hépatite B peut être porté par des individus
asymptomatiques pendant des années.
• Neisseria meningitidis peut coloniser la gorge de porteurs sains sans
provoquer de maladie.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Stratégies pour contrôler les réservoirs humains
• Dépistage : identification des porteurs asymptomatiques (ex. dépistage du
VIH ou de la tuberculose latente).
• Traitement prophylactique : élimination des pathogènes chez les porteurs
(ex. antibiotiques pour éliminer S. typhi).
• Vaccination : réduire l’incidence des infections dans la population et limiter
la transmission (ex. HBV, rougeole).
• Isolement/Quarantaine des individus infectés symptomatiques pour éviter
la transmission active.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Réservoirs humains ➔rôle essentiel dans le cycle des maladies
infectieuses.
• Compréhension des réservoirs humains permet ➔ stratégies
• Interrompre la chaine transmission
• Limiter la propagation des pathogènes.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Les réservoirs animaux de pathogènes
• Définition: Un réservoir animal est une espèce animale qui héberge un pathogène
et sert de source d'infection pour d'autres animaux ou les humains (zoonoses).
• Types de réservoirs animaux
• Sauvages : animaux ➔ héberger pathogènes sans montrer de signes cliniques.
• Exemples Chauves-souris (ex : Ebola, coronavirus), Rongeurs (Yersinia pestis).
• Domestiques : les animaux d'élevage /compagnie = source de pathogènes de l’H.
• Exemples : Bovins (réservoirs d'Escherichia coli O157:H7.,CCHV), Chats (Toxoplasma gondii.
• Vecteurs biologiques (indirectement liés)
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Mode de transmission à partir des réservoirs animaux
• Contact direct :Toucher ou manipuler un animal infecté. Ex.: rage
(morsures), brucellose.
• Contact indirect : Par le biais de l’environnement contaminé par les
excréments, urine ou sécrétions animales. Ex.: leptospirose, hantavirus.
• Ingestion: Consommation de produits animaux contaminés
➔salmonellose, listériose.
• Piqûres de vecteurs : Transmission via des vecteurs infectés par le
pathogène animal. Ex. : paludisme (moustiques), maladie de Lyme (tiques).
• Aérosols : Inhalation de particules infectieuses pduites/animaux (grippe
aviaire)
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Importance des réservoirs animaux en maladies infectieuses
• Santé publique
• Les zoonoses : près de 60 % des maladies infectieuses humaines.
• Compréhension des réservoirs ➔prévenir les épidémies.
• Écologie des maladies
• Les changements environnementaux (déforestation, urbanisation) augmentent le
contact entre les humains et les réservoirs animaux.
• Surveillance et contrôle :
• PEV(ex : rage canine), les mesures de biosécurité et la surveillance des espèces
sauvages réduisent les risques de transmission.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Prévention et gestion des réservoirs animaux
• Éducation sur les comportements à risque (contact avec des animaux
sauvages ou malades).
• Surveillance des animaux domestiques et d’élevage.
• Contrôle des vecteurs (tiques, moustiques).
• Respect des pratiques d’hygiène alimentaire.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Les réservoirs environnementaux de pathogènes
• Définition: Les réservoirs environnementaux sont des niches où les agents
pathogènes survivent en dehors d’un hôte humain ou animal.
• Ces réservoirs jouent un rôle clé dans l’épidémiologie des maladies, car ils
permettent la persistance des microorganismes dans la nature et leur
transmission aux hôtes.
• Types de réservoirs environnementaux???
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Rôle dans la transmission des maladies
• Les réservoirs environnementaux contribuent aux infections via :
• Transmission directe : contact avec le sol, ingestion d’eau contaminée.
• Transmission indirecte : consommation d’aliments contaminés ou contact
avec des fomites.
• Transmission aérienne : inhalation de spores ou gouttelettes.
• Facteurs favorisant la persistance des pathogènes dans l’environnement
• Résistance aux conditions environnementales (température, dessiccation, UV).
• Formation de biofilms pour les pathogènes aquatiques (ex. Pseudomonas
aeruginosa).
• Capacité à produire des spores ou à entrer en dormance.
Pathogénicité et virulence des microorganismes
• Prévention et contrôle
• Hygiène et assainissement : désinfection des surfaces et traitement de
l’eau.
• Surveillance environnementale : suivi des microorganismes pathogènes
dans les réservoirs.
• Vaccination : prévention de maladies transmises par ces réservoirs (ex.
vaccin contre le choléra).