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Atelier ERT : Installation Python et Pygimli

Ce document fournit des instructions détaillées pour préparer un atelier sur l'interprétation des mesures géophysiques ERT en utilisant Python et la bibliothèque Pygimli. Il décrit les étapes d'installation d'Anaconda, de création d'un environnement, et d'installation des bibliothèques nécessaires, ainsi que l'ouverture de JupyterLab pour travailler avec un notebook spécifique. À la fin, l'utilisateur est prêt à commencer l'atelier.

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Atelier ERT : Installation Python et Pygimli

Ce document fournit des instructions détaillées pour préparer un atelier sur l'interprétation des mesures géophysiques ERT en utilisant Python et la bibliothèque Pygimli. Il décrit les étapes d'installation d'Anaconda, de création d'un environnement, et d'installation des bibliothèques nécessaires, ainsi que l'ouverture de JupyterLab pour travailler avec un notebook spécifique. À la fin, l'utilisateur est prêt à commencer l'atelier.

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Préparation de l’atelier " Interprétation des mesures géophysiques ERT "

ASAONline#2, juin 2025

Nous allons utiliser le langage Python, la bibliothèque Pygimli ainsi que quelques bibliothèques
complémentaires. Pour les systèmes Windows :

1/ Installer Anaconda (distribution de Python avec de nombreuses bibliothèques)


→ aller sur la page d’Anaconda: [Link]
→ aller sur " Free Download " (en haut à droite)
→ donner une adresse email vers laquelle vous sera envoyé un lien pour le téléchargement.
→ sélectionner la version adaptée à votre système d’exploitation et télécharger l’exécutable
→ lancer l’exécutable (Anaconda3-2024.10-1-Windows-x86_64.exe)
→ à la fin de l’installation (qui peut durer 10 à 90 minutes), vous aurez l’image ci-dessous

→ faites « Next » puis « Next » puis « Finish »


→ attendez ensuite que Anaconda s’ouvre puis fermez le et redémarrez votre ordinateur

2. Ouvrir Anaconda et créer un environnement


→ Tapez « Anaconda Navigator » dans la barre de recherche du menu Démarrer.
→ Cliquez sur l’icône pour ouvrir l’interface graphique.
→ dans Anaconda, cliquer sur " Environnements " (à gauche) puis " Create " (en bas) pour créer un
nouvel environnement dans lequel vous allez installer les bibliothèques pour la géophysique.
Donner un nom simple à cet environnement (par exemple geophy).

Attention !, choisir python 3.11.11 ou une version antérieure lors de la création de l’environnement
comme illustré ci-dessous.
3. Installer la bibliothèque " ipywidgets " (permet de faire des figures interactives)
Taper " ipywidgets " dans la barre de recherche en haut à droite, sélectionner " ipywidgets "dans
la fenêtre principale plus " apply " en bas pour lancer l’installation.

4. Installer la bibliothèque " PyGIMLi " (pour la géophysique)


→ Depuis votre environnement (par exemple " Geophy "), cliquer sur la flèche verte et sélectionner
" open terminal ".

→ dans le terminal, écrire " conda install -c gimli -c conda-forge "pygimli>=1.5.0 " puis valider
pour installer PyGimli.
5. Ouvrir " JupyterLab " (utilisation de Python depuis votre navigateur internet)
→ depuis votre environnement, cliquer sur la flèche verte puis " open terminal "
→ dans le terminal, aller dans le répertoire où vous avez stocké le fichier " " TD_ERT_V1.ipynb "
en tapant " cd le chemin (par exemple C:\…..) "
→ ensuite, lancer JupyterLab en tapant " jupyter lab ".

7. Ouvrir le notebook " TD_ERT_v1.ipynb" (pour inverser et modéliser ERT)


→ depuis le panneau à gauche " File Browser " aller chercher le fichier.

Et voilà, vous êtes prêt, Bravo !!

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