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Isomérie et Stéréoisomérie en Chimie

Le chapitre II traite de l'isomérie et de la stéréoisomérie, définissant les différents types d'isomères et leurs caractéristiques. Il aborde l'isomérie plane, les représentations tridimensionnelles des molécules, ainsi que les stéréoisoméries de conformation et de configuration, y compris la chiralité. Les concepts de stabilité des conformations et les implications biologiques des énantiomères sont également discutés.

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Isomérie et Stéréoisomérie en Chimie

Le chapitre II traite de l'isomérie et de la stéréoisomérie, définissant les différents types d'isomères et leurs caractéristiques. Il aborde l'isomérie plane, les représentations tridimensionnelles des molécules, ainsi que les stéréoisoméries de conformation et de configuration, y compris la chiralité. Les concepts de stabilité des conformations et les implications biologiques des énantiomères sont également discutés.

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Chapitre II :

Isomérie et stéréoisomérie

1
Plan du Cours

II.1- Isomérie plane ( de constitution) et degré d’insaturation

II.2- les différentes représentations des molécules dans l’espace

II.3- La stéréoisomérie (de conformation: hydrocarbures et cycles)

II.4- Stéréoisomères de configuration ( chiralité)

II.5- Configuration relative

II.6- Stéréoisomérie géométrique (cis/trans et Z/E)

2
ISOMÉRIE
Notion d’isomérie

Les isomères sont des espèces chimiques de même formule brute qui diffèrent par :
- Leur formule développée :l’ordre ou la nature des liaisons (isoméries plane - de
constitution),
- ou par leur représentation dans l’espace:la disposition des atomes dans l’espace
(stéréoisomérie).

Il existe 3 grands types d’isoméries:

1. Isomérie de constitution (structurale).

2. Isomérie stérique (stéréoisomérie).


3. Isomérie plane géométrique.

3
II.1- a) Isomérie plane ( ou de constitution)

Formule brute: Plusieurs enchaînements ≠ d’atomes Isomères de constitutions


Ou Isomères structuraux

Teb, Tf, S,
Les isomères de constitutions: propriétés physiques et chimiques ≠
Réactivité, …≠

Les isomères de constitution comprennent les isomères de fonction, de position ,


de squelette et les tautomères.
Exemple : C4H10O

4
1. Isomérie de fonction :
les fonctions (principale ou
secondaires) portées par le
squelette diffèrent.

2. Isomérie de position : seules les positions d’introduction des fonctions sur le squelette
diffèrent.

• Position des insaturations.

• Position des ramifications.

• // des fonctions sur une chaine linéaire.

5
3. Isomérie de squelette (de chaîne): l’enchaînement de leurs carbones différent.

4. Tautomérie : un atome (H) migre d’un site à un autre au cours d’un équilibre rapide.
Ex: tautomérie céto-énolique

O O H

6
7
II. composés azotés:

Hsat = 2nC+2 + nN
1. CH5N Heffectif = 5 Hsat : nC=1 => Hsat= 2x1+2+1=5
DI =(Hsat-Heffectif)/2 = (5-5)/2 = 0 C'est le cas du méthylamine CH3-NH2.

2. C6H8N2 Heffectif = 8 Hsat : nC=6 => Hsat=2nC+2+ 2 = 16


DI =(Hsat-Heffectif)/2 = (16-8)/2 = 4 C'est le cas de p-diaminobenzène :

3 "liaisons π " + 1 cycle = 4

III. composés halogénés:

Hsat = 2nC+2 - nX
1. C6H5Cl Heffectif = 5 Hsat : nC=6 => Hsat= 2x6+2-1= 13
DI =(Hsat-Heffectif)/2 = (13-5)/2 = 4 C'est le cas du chlorobenzène

3 "liaisons π " + 1 cycle = 4

8
9
II.2- les différentes représentations des molécules dans l’espace

II.2.1 L’information tridimensionnelle

•Les formules de constitution ne précisent pas l’organisation spatiale


•Outre les modèles moléculaires et certains logiciels informatiques, différentes
représentations sont mises en œuvre afin de fournir une information
tridimensionnelle:

Représentation de Cram (procédé du coin volant)


Représentation de Newman
Représentation de Fischer
Représentation en perspective

10
Représentation de Cram

en avant du plan
en arrière du plan
dans le plan
Ex: EtOH H H
HH OH
H3C H H
H
H HH OH CH2OH

Représentation (projection) de Newman


Elle est particulièrement employée lorsqu’on s’intéresse aux aspects conformationnels
des molécules.

11
Représentation de Fischer

i) Disposer la chaîne hydrocarbonée la plus longue sur l’axe vertical ;


ii) Placer le chaînon de plus petit indice (le plus souvent associé au nombre
d’oxydation de l’atome de carbone le plus élevé) vers le haut

12
13
Représentation en perspective

axial (a) et équatorial (e).

Utilisée essentiellement lors de la représentation de molécules cycliques

14
II.3 Stéréoisomérie: première approche

Les stéréoisomères diffèrent par la disposition des atomes dans l’espace

 deux catégories de stéréoisomères: - de configuration


- De conformation

15
II.3.1 Stéréoisomérie de conformation

Deux stéréoisomères de conformation (conformères) ne diffèrent que par rotation(s)


autour de liaison(s) σ. La déformation associée est généralement peu coûteuse en
énergie.

Interconversion par permutation


Interconversion par rotation (σ) circulaire sur 3 sub

Interconversion par permutation circulaire


sur 3 sub liés à un atome central

16
II.3.1 a) Stéréoisomérie de conformation en série aliphatique (hydrocarbures linéaires
1. Cas de l’éthane
H 60° H
H H H H H

H H H
H H H H H
H
H H
Conformation éclipsée Conformation décalée
T amb. (éclipsée  décalée) = des
millions de fois/s

Barrière d’énergie (assez basse)

Conformation décalée est plus stable


(appelée conformère)

Fig. Energie potentielle de la molécule


d’éthane en fonction de sa conformation
17
2. Cas du butane et chaînes plus longues
CH3
CH 3 H H
CH 3
H H H
H 3C H H CH3
CH 3 H
H Conformation éclipsée Conformation décalée (anti)
H La moins stable La plus stable
H H

Fig. Energie potentielle de


la molécule de butane en
fonction de sa
conformation.

18
H H H H H H
H La conformation préférentielle des chaînes
H carbonées acycliques saturées (décalée
H H H H H H anti).

décalée

anti

19
II.3.1. b) Stéréoisomérie de conformation en série cyclique

Molécule plane
Création d’une
tension (contrainte)

R. Kaïd Slimane, 2011 20


1. Le cyclohexane

Intérêt particulier: structure de nombreux composés naturels.


Deux conformations principales: « forme chaise » et « forme bateau »
Interaction importante

« forme chaise » « forme bateau »

Plus stable (C-H décalées) Moins stable (8 C-H éclipsées)

• 6 liaisons C-H axiales « a »


• 6 liaisons C-H équatoriales « e »
21
500 000 foix par seconde à T.a.

22
2. Le cyclohexane monosubstitué

A
La conformation la + stable d’ un Cyclohexane
A monosubstitué est la conformation chaise pour
laquelle le substituant est en position équatorial.

Plus stable

 Si le substituant est axial sur C1: Э une gêne entre lui et les atomes « a » du C3 et C5 .

CH3 5 H
Intéraction 1-3 H
H
(gêne)
H 1 3 H
H H
CH3

23
Exemples:

24
3. Le cyclohexane disubstitué
Deux Conformères différents à considérer : cis et trans .
Ex1: 1,4-diméthylcyclohexane

Plus stable

Cis-1,4-diméthylcyclohexane trans-1,4-diméthylcyclohexane

 le cis et le trans-1,4-diméthylcyclohexane sont des isomères géométriques


=> 2 composés distincts (propriétés physiques différentes).
→ possible de les séparer.
 Il existe 2 conformères chaises pour chacun.
25
1. le cis-1,4-diméthylcyclohexane:

Me : « a » et « e » dans les 2 conformations => même stabilité


2. le trans-1,4-diméthylcyclohexane:

 sub. « e, e »
Plus stable que
sub « a , a »

26
Ex 2: le 1-tert-butyl-3-méthylcyclohexane:
1. l’isomère cis:

2. l’isomère trans:

Le plus stable est celui qui a le substituant le plus volumineux en position équatoriale.
27
3. Le cyclohexane polysubstitué

Conformation Privilégiée : celle où les sub. encombrés sont « e ».

Et Me
Me
Me
Et Me

Plus stable

→ la présence d’un sub volumineux « bloque » la conformation et supprime


l’interconversion entre les 2 formes chaises.

28
II.4 Stéréoisomérie de configuration
 Des stéréoisomères qui ne sont pas des conformères sont stéréoisomères de
configuration.
 Le passage de l’un à l’autre nécessite des ruptures de liaisons .
 La déformation associée est coûteuse en énergie.

Interconversion par rupture et formation de


liaisons σ

29
Interconversion par permutation circulaire sur 2 substituants

Conformères: stéréoisomères de configuration


•en général inséparables à •ne s’interconvertissent généralement pas
température ambiante. dans les conditions expérimentales
• un seul nom à la famille des utilisées.
conformères. • problème pour la nomenclature!

30
principales situations dans lesquelles ce
problème se pose

C=C , C=N un atome en environnement tétraédrique


porteur de quatre substituants distincts

A≠B et A’≠B’

31
A≠B ≠C≠D
C* : asymétrique (stéréogène).

32
II.4- 1 Isomérie optique (chiralité, asymétrie)

 Chiralité

La chiralité d’un objet désigne sa propriété de ne pas être superposable à son


image dans un miroir plan.
un objet possédant un plan ou un centre de symétrie est achiral (non doué de
chiralité).

Exemples :
– Une main est un objet chiral (du grec :chiral=main).

33
– Une molécule contenant un carbone asymétrique (4 substituants ≠) est chirale

Molécule chirale
34
• Une molécule contenant plus d’un carbone asymétrique n’est pas
nécessairement chirale:

Molécule chirale Plan de symétrie: centre de symétrie I:


Molécule achirale Molécule achirale

35
• La chiralité est liée à l’absence de certains éléments de symétrie: plan de symétrie,
centre de symétrie.

H H
Cl Cl Cl Br
H H
Br Br H H
H H Br Cl

Un plan de symétrie Un centre de symétrie


(achirale) (achirale)
Ex:
CH3 CH3 CH3

H H H CH3
COOH HO CH3 HO
HO

-Pas de plan de symétrie Plan de symétrie


Chirale
- pas de centre de symétrie Molécule achirale

36
Les règles de priorités de Cahn, Ingold et Prelog (1956)

1. La priorité des atomes augmente lorsque leur numéro atomique Z augmente,


2. Pour deux atomes isotopes, la priorité augmente lorsque leur masse augmente.

configuration absolue (S) configuration absolue (R)


latin “sinister”= gauche “rectus” = droite

37
2
1. Ex : 4
H
3 *
H3C Br 1 3 1
F
2

Configuration absolue S
Br > F > C > H (par la règle 1)

4
H

H3C D3 Configuration absolue S


2 OH
1

D >H (par la règle 2).

38
1
OH

* Configuration absolue R
2
4

Cl
*
* *
HO 1
* CH 3 Configuration absolue R
*2 H 3
4
Cl * * OH

39
Les conséquences de la chiralité
 Existence d’un type particulier d’isomérie (énantiomérie).
 certaines propriétés particulières des molécules.
1. L’énantiomérie
Molécule chirale: relation (objet-image) = énantiomérie
Énantiomères: isomères optiques ou inverses optiques ou antipodes optiques.

2 énantiomères: R et S
40
Les énantiomères ont strictement les mêmes propriétés chimiques: F °C, Eb °C, IR
UV, RMN.
Par contre, leur activité biologiques (goût, odeur, toxicité…) et pharmacologiques

Sont ≠. H NH3+
H
H NH3+
H
-OOC N COOCH3 -OOC N COOCH3
Ex: l’Aspartame :
O H O H

Édulcorant 200 fois > sucré Goût amer


et la carvone: que la saccharose

O O
(R) Cavone (S) Cavone
Odeur de cumin Odeur de menthe
H H

41
Activité pharmacologique

O O O O
N N
O O

HN NH

O O

(R)-(+)-Thalidomide (S)-(-)-Thalidomide
Sédatif 3 provoque des
malformations3
(calmant)

42
R. Kaïd Slimane, 2011 43
2. Diastéréoisomérie
Deux stéréoisomères non énantiomères sont diastéréoisomères

Exemple de diastéréoisomères

3. Relations d’énantiomérie/diastéréoisomérie

une molécule possédant n carbones asymétriques comporte 2n stéréoisomères

Ex: n=2 C* : 4 stéréoisomères: RR RS


----------------------
SS SR
44
HO COOH
* *
HO OH

45
 cas particulier: 2C* portant les même substituants  La forme méso
CH3-CH(OH)-CH(OH)-CH3

Forme méso (unique)

46
 ex: l’acide tartrique

1 molécule achiral: composé méso (SR=RS)

3 stéréoisomères: RR , SS , SR=RS

47
L’activité optique
2 énantiomères = propriétés identiques, sont indiscernables.
1 seul point sur lequel les énantiomères se différencient toujours et s’opposent:
Le « pouvoir rotatoire », ils n’interagissent pas de la même façon sur une onde plane
polarisée rectilignement.
Une substance chirale : possède tjr une activité optique ou pouvoir rotatoire

48
• Une molécule capable de changer la direction de polarisation d’une onde plane
polarisée rectilignement est dite optiquement active.
• Pour qu’un composé soit optiquement actif, il doit être chiral.
Déviation vers la droite  composé dextrogyre  noté (+)
// // la gauche  // lévogyre  noté (-)

Mélange racémique: mélange en quantités égales (50%) des 2 énantiomères (+) et (-)
On l’indique par (±) ou (d,l).
 Le racémique n’a pas d’activité optique (par compensation externe).
 les F sont ≠ de celui des énantiomères. Ex: F(-)-phénylalanine=276 °C,
F(+)-phénylalanine=276 °C, F(±)-phénylalanine=267 °C 49
R. Kaïd Slimane, 2011 50
II.6. Stéréoisomérie de configuration (Z/E et cis/trans)

1. Introduction

Deux stéréoisomères (mm formule semi-développée mais structure spatiale ≠) sont dits
stéréoisomères de configuration s’il est nécessaire de rompre des liaisons pour passer
de l’un à l’autre

mm formule semi-développée mais structure spatiale


≠  stéréoisomères
Nécessaire de casser 1 ou + liaisons pour passer de
l’un à l’autre => diastéréoisomère.

mm formule semi-développée mais structure spatiale


≠  stéréoisomères
Nécessaire de casser 1 ou + liaisons pour passer de
l’un à l’autre (pas de rotation π) => diastéréoisomère.

Rq: ces 2 isomères ne sont pas images l’un de l’autre par miroire => diastéréoisomère.
• Isomérie cis-trans

La diastéréoisomérie cis/trans traduit les relations stériques par rapport à la double


liaison ou le cycle. Elle est rencontrée pour les substituants des cycles (ou les jonctions
de composés polycycliques)

R' H (ou R) R' R'

H (ou R) R' H (ou R) H (ou R)

Isomère trans Isomère cis


Plus stable

2. Pour les cyclanes:

 utilisée dans les composés cycliques qui portent deux substituants


Cl

Cl
cis diméthyl-1,2-cyclopropane
trans dichloro-1,3-cyclobutane
Cis : du même coté /cycle
Trans : de cotés opposés/cycle
Ex: CH3 CH2OH Pas de C*  molécule achirale
(Plan de symétrie)

Pourtant 2 représentations spatiales sont possibles:

CH2OH

CH2OH

CH3 CH3
Cis : du même coté /cycle Trans : de cotés opposés/cycle

L’origine de cette stéréoisomérie est la présence du cycle

53
53
 Isomérie Z-E

 Principe du système de nomenclature

configuration absolue (Z) configuration absolue (E)


“Zusammen” = ensemble “Entgegen” = opposé

54
1’ H
O H 2 1 . .2’
N
1’
HO 2
2’ 1

Configuration absolue E
Configuration absolue E

1 Cl CH3 2’
Configuration absolue E
2 H Cl 1’

55
 Nomenclature erythro et thréo (ancienne nomenclature, pas recommandée par
l'UICPA.):

Utilisée Pour 2 C* adjacents  4 stéréoisomères au maximum: 2 couples d’énantiomères:


• les groupes défilent dans le même sens la configuration relative est érythro ;
• les groupes défilent dans des sens opposés la configuration relative est thréo.

Ex:

1 3 1 3

1 3 3 1
C3: OH>CH2OH>H C3: OH>CH2OH>H
C2: OH>CHO>H C2: OH>CHO>H 2
2 2 Même sens => érythro 2
sens opposé => thréo
56
 la forme méso:

Composé méso (du grec mesos : milieu): composé comportant deux centres chiraux de
configurations absolues opposées. C’est un composé achiral (Son pouvoir rotatoire est nul).
• Si les substituants des 2 C* sont les même => forme méso => 3 stéréoisomères .

Ex:

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