ECBU : EXAMEN CYTOBACTERIOLOGIE DES URINES
Cystite : Inflammation de la vessie, souvent causée par une infection urinaire. Symptômes
typiques : douleur ou brûlure en urinant, besoin fréquent d'uriner.
Pyélonéphrite : Infection des reins, souvent due à une infection urinaire qui remonte vers
les reins. Symptômes : fièvre, douleur dans le bas du dos, frissons.
Prostatite : Inflammation de la prostate, généralement causée par une infection.
Symptômes : douleur en urinant, douleurs pelviennes, difficulté à uriner.
CIRCONSTANCES DE PRELEVEMENT :
L’urine est normalement stérile, toute présence de germes est pathologique.
L’urètre contient des germes commensaux entraînés par le flot urinaire ( (streptocoques non
pathogènes / Lactobacillus ) .
Les infections urinaires peuvent survenir spontanément ou après des gestes médicaux
(iatrogènes), et sont la première cause d’infections nosocomiales.
Signe clinique :
Infection basse (cystite, urétrite)
Dysurie : Difficulté ou douleur lors de la miction, souvent causée par une
inflammation de la vessie ou de l'urètre.
Pollakiurie : Besoin fréquent d'uriner, même si la quantité d'urine est faible, signe
d'irritation de la vessie.
Infection haute (pyélonéphrite)
Douleurs lombaires : Douleurs dans la région des reins (bas du dos), indiquant une
inflammation ou infection rénale.
Fièvre : Signe systémique d’infection, typique des atteintes plus graves comme une
pyélonéphrite.
o Une cystite peut évoluer vers une pyélonéphrite avec passage de bactéries dans sang et
entrainer un état septicémique
o Chez l’homme toute infection urinaire doit faire rechercher une atteinte de la
prostate
Conditions de prélèvement :
Un prélèvement mal réalisé peut contenir des bactéries commensales de l’urètre.
Adulte :
o Laver les mains, nettoyer le méat urinaire et les parties génitales (chez la femme).
o désinfecté doucement,
o recueillir le milieu du jet d’urine du matin ou après 4 heures dans la vessie.
Sondé :
o Ne pas prélever dans la poche.
o Clamper la tubulure pendant 15 minutes,
o désinfecter le site de prélèvement avec un antiseptique alcoolique, puis prélever.
Nourrisson : Utiliser une poche collectrice et vérifier après 30 minutes.
Test de screening : Utilisation de bandelette chimique dès l’émission des urines.
Détecte :
o Polynucléaires (présence d’inflammation).
o Nitrites (présence d’entérobactéries).
Respecter les temps de lecture des bandelettes (possible lecture automatique avec
enregistrement papier).
Bonne valeur prédictive négative (98%) si absence de polynucléaires et de nitrites
Conduite de l’examen urinaire :
Aspect macroscopique :
o Urine limpide ou trouble.
o Couleur (jaune, hématique, etc.).
o Présence de sédiments.
Cytologie :
o Leucocytes : Plus de 10⁴/mL indique une infection.
o Autres cellules : Noter la présence ou l’absence de :
Cellules épithéliales (ex. vaginales).
Cristaux (urate, phosphate ammoniacomagnésien, oxalate de calcium,
etc.).
Examen direct :
o État frais : Observer la présence de bactéries et leur mobilité (résultat limité).
o Gram : Sensibilité augmentée après centrifugation.
Mise en culture :
o Sur milieux usuels.
o Ensemencer une quantité fixe pour dénombrer les bactéries (UFC/mL).
o Incubation pendant 24 heures.
Identification :
o Identifier la ou les bactéries (les infections à 2 germes sont rares mais
possibles).
o Réaliser un antibiogramme pour déterminer la sensibilité aux antibiotiques.
Seuils de significativité :
Leucocyturie : > 10⁴/mL.
Hématurie : > 10⁴/mL.
Bactériurie :
o ≥ 10³ UFC/mL : Cystite aiguë (E. coli, S. saprophyticus).
o ≥ 10⁵ UFC/mL : Cystite aiguë (autres germes).
o ≥ 10⁴ UFC/mL : Pyélonéphrite ou prostatite.
o ≥ 10⁴ UFC/mL : Infection nosocomiale.
Étiologie des infections urinaires (IU) :
IU communautaires :
o Principales bactéries :
Escherichia coli (80%)
Proteus mirabilis
Klebsiella, Enterobacter, Serratia
Staphylococcus saprophyticus
Staphylococcus aureus
o Bactéries rares :
Oligella urethralis
Aerococcus urinae
Corynebacterium urealyticum
Lactobacillus spp
IU nosocomiales :
o Principales bactéries :
Escherichia coli (50%)
Pseudomonas aeruginosa
Enterobacteriaceae
Enterococcus faecalis
Staphylococcus aureus
Acinetobacter spp
o Levures.