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Mécanisme de l'ATP synthase mitochondriale

Le document traite des mitochondries et de leur rôle dans la phosphorylation oxydative, expliquant la structure des mitochondries et le mécanisme de synthèse de l'ATP via l'ATP synthase. Il aborde également les maladies génétiques mitochondriales et leurs implications pathologiques, notamment les maladies cardiovasculaires et neurodégénératives. Enfin, il évoque le dogme central de la biologie moléculaire, qui décrit le transfert d'information génétique dans les cellules.

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Mécanisme de l'ATP synthase mitochondriale

Le document traite des mitochondries et de leur rôle dans la phosphorylation oxydative, expliquant la structure des mitochondries et le mécanisme de synthèse de l'ATP via l'ATP synthase. Il aborde également les maladies génétiques mitochondriales et leurs implications pathologiques, notamment les maladies cardiovasculaires et neurodégénératives. Enfin, il évoque le dogme central de la biologie moléculaire, qui décrit le transfert d'information génétique dans les cellules.

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Cours 12, 18 dec 2018

Rappeler

15.5. Les Mitochondries,


Le mechanisme de phosphorylation oxydative
ULTRASTRUCTURE
(une mitochondrie typique)
1. Membrane externe 2. Membrane interne
(crêtes ou cristae)
3. L'espace entre
les deux membranes
4. Matrice

ADN

Mito-ribosomes F0 F1= ATPase = ATP


synthase
Phosphate de calcium

1-10 µm
MP210802 2
Peter Mitchell (1920-1992)
- théorie de la chimiosmose mitochondriale
(le gradient de concentration de protons
formé de part et d’autre de la membrane
interne sert de réservoir d'énergie libre pour
la synthèse d’ATP)
le prix Nobel de
chimie en 1978

3
• Le rapport des composantes est différent:
• à un complexe NADH déhydrogénase correspondent: 3 complexes b-c1,
7 complexes cytochrome oxydase, 9 molécules de cit. c et 50 molécules Coenz .Q

a1 a3

malate
glutamate
pyruvate
isocitrate

FADH2

succinate
Dans la respiration, l'énergie est libérée par
étapes (et non d'un seul coup).

Les électrons riches en énergie (niveau élevé) du


glucose sont transférés à d'autres molécules: les
transporteurs.
5
À chaque transfert, l'électron perd de l'énergie.
6
ATP synthase

7
Comme un moteur,
Vitesse de rotation
= 50 à 100 tours / seconde

Le passage des ions H+ entraîne


la rotation de la sous-unité « c ».
C’est ce mouvement qui permet
la formation d’ATP à partir
d’ADP et P dans la partie qui
dépasse de la membrane.

L’ATP synthase La « turbine à protons8 »


La force protomotrice
(ions H+ qui diffusent à
travers l'ATP
synthétase) permet la
formation d'ATP à partir
d'ADP et P.
(3H+ ------1 ATP) Matrice

Espace intermembranaire
9
L'ATP syntase

• Région sphérique

• La tije - OSCP (Oligomycin


Sensitivity Conferring Protein) -
Région intermediaire...comme
un arbre d'entraînement

• Région membranaire (F0)

L'ATP synthase est composée d'une partie mobile (rotor) et d'une partie fixe (stator).
Le passage des protons à l'interface entre rotor (sous-unité c) et stator (sous-unité a) dans le domaine
membranaire (F0) cause la rotation.
C'est la rotation de la tige (g) qui déforme les sous-unités Beta du domaine extra-membranaire F1 et
fournit à celles-ci l'énergie nécessaire à la synthèse d'ATP.
11
On a fixé un long filament
d'actine (une protéine) sur la
portion mobile de la protéine
pour pouvoir observer le
mouvement de rotation.

Vitesse de rotation
= 50 à 100 tours / seconde

12
13
Demonstration, exp. de
Racker et Stoeckenius
Moteur, reversibilite de la pompe

Halobacterium halobium, (exp de R et S)


15.6. Transport des ions – au niveau de la mb. int.

Transport pour:
[Link]. antiporte ATP-ADP,
2. Anions: pyruvate, phosphate,
3. Aspartate-glutamate,
4. Les acides gras (avec carnitine)
5. Calcium (qui reste dans la matrice mitochondriale). 16
antiporteur ATP-ADP

ATP cytosol
ADP

matrice
18
L’origine evolutionnaire

19
20
21
Les implications des
mitochondries en pathologie

Il y a deux categories des maladies liées aux


mitochondries:

I. Maladies genetiques mitochondriales


II. Processus pathologiques

22
Dans la
plupart (pas
toujours!) des
cas les maladies
mitoc. sont
transmises par
la mère en
raison de
l'origine
exclusivement
ovulaire des
mitochondries.
23
I. Maladies génétiques mitochondriales
I. Maladies génétiques mitochondriales
Les maladies dues aux défauts de la
chaîne de phosphorylation oxydative

Les manifestations cliniques sont:


• - des neuropathies

• - myopathies (ptose palpebrale)

• - cardiopathies isolées
(ou combinées entre elles)

 Les maladies mitochondriales sont


sévères, souvent mortelles
25
L’organisation chaîne de transport d'électrons

26
27
28
29
30
II. Processus pathologiques
La mitochondrie est le siège des réactions qui produisent
de l’énergie, mais aussi, des déchets énergétiques sous la
forme de radicaux libres de I’oxygène.

31
32
L’ADNmt d’une cellule de foie est 10 fois plus
endommagé que l’ADN de la cellule elle-même!

Implications:
les maladies cardiovasculaires,
cancer,
maladies neurodegeneratives
diabète sucré, etc.

33
Conclusions - plusieurs fonctions
des mitochondries

34
!!!Fragments exclus de pag. 73, 74, 75, 76

35
36
Cours 12, 9 Jan 2017

Ch 19.
LE DOGME CENTRAL DE LA
BIOLOGIE MOLÉCULAIRE ET
LES APPLICATIONS
MÉDICALES

37
- Le "dogme central", introduit par F. Crick
(le co-découvreur de la structure de l‘ADN):
dans tous les êtres vivants l'information ne
soit transmise que dans un sens:

Le dogme centrale est valable pour


procaryotes et eucaryotes; 38
Définition donnée par son inventeur
(F. Crick, 1958):

• “Le dogme central de la biologie


moléculaire a trait aux modalités
du transfert d’information
séquentielle résidu-par-résidu. Il
postule qu’une telle information
ne peut être transférée d’une
protéine vers une protéine où un
acide nucléique”.
39
40
Figure 5-21 Essential Cell Biology (© Garland Science 2010)
1. replication d’ADN
2. transcription
3. traduction

42
Pour les eucaryotes:

43
Gene Function

> DNA sequence


AATTCATGAAAATCGTATACTGGTCTGGTACCGGCAACAC
TGAGAAAATGGCAGAGCTCATCGCTAAAGGTATCATCGAA
> Protein sequence
TCTGGTAAAGACGTCAACACCATCAACGTGTCTGACGTTA
MKIVYWSGTGNTEKMAELIAKGIIESGKDVNTINVSDV
ACATCGATGAACTGCTGAACGAAGATATCCTGATCCTGGG DELLNEDILILGCSAMGDEVLEESEFEPFIEEISTKISGK
TTGCTCTGCCATGGGCGATGAAGTTCTCGAGGAAAGCGAA KVALFGSYGWGDGKWMRDFEERMNGYGCVVVETPL
TTTGAACCGTTCATCGAAGAGATCTCTACCAAAATCTCTG PDEAEQDCIEFGKKIANI
GTAAGAAGGTTGCGCTGTTCGGTTCTTACGGTTGGGGCGA
CGGTAAGTGGATGCGTGACTTCGAAGAACGTATGAACGGC
TACGGTTGCGTTGTTGTTGAGACCCCGCTGATCGTTCAGA 44
ACGAGCCGGACGAAGCTGAGCAGGACTGCATCGAATTTGG
TAAGAAGATCGCGAACATCTAGTAGA
45
a) Chez les eucaryotes

47
48
49
50

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