Analyse Instrumentale en Biotechnologie
Analyse Instrumentale en Biotechnologie
Polycopié de cours
« Analyse instrumentale »
Semestre : 6
I. Introduction
III.1. Filtration
III.2. Centrifugation
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TABLE DES MATIÈRES
I. Introduction………………………………………………………………………..... 01
Chapitre II : Techniques spectrales…………………………………………………... 02
1. Spectrophotométrie d'absorption moléculaire…………………………………….. 02
1.1. Spectrométrie d’absorption Uv- visible…………………………………………. 05
1.2. Spectrométrie d’absorption infrarouge (IR)…………………………………….. 06
2. Spectrophotométrie d'absorption atomique (AA)………………………………… 07
2.1. Spectrométrie d’absorption atomique avec flamme…………………………….. 08
2.2. Spectrophotométrie d'émission de flamme………………………………………. 08
3. Fluorescence…………………………………………………………………………. 09
4. Spectrométrie de masse (MS)………………………………………………………. 09
5. Spectrométrie de résonance magnétique nucléaire (RMN)………………………. 09
Chapitre III : Techniques de séparation (fractionnement)………………………… 11
1. Filtration…………………………………………………………………………… 11
1.1. Intérêt de filtration………………………………………………………………... 12
1.2. Procédure de filtration……………………………………………………………. 12
1.3. Matériels de filtration…………………………………………………………….. 13
1.4. Procédés de la filtration au laboratoire……………………………………… 15
1.5. Types de filtration en fonction de la taille des particules…………………… 18
2. Sédimentation et Centrifugation…………………………………………………. 21
2.1. Principe de centrifugation………………………………………………………. 22
2.2. Matériel de centrifugation………………………………………………………. 22
2.3. Type de machines centrifugeuses………………………………………………. 23
2.4. Les rotors………………………………………………………………………… 23
2.5. Types de centrifugation…………………………………………………………. 25
1. Les gradients discontinus…………………………………………………………… 25
2. Les gradients continus………………………………………………………………. 27
2.6. Intérêt et applications ……………………………………….……………………. 29
3. Techniques chromatographiques…………………………………………………... 30
1. Choix de la technique chromatographique………………………………………... 30
2. Divers types de chromatographie…………………………………………………... 31
Exemple 1. Chromatographie sur couches minces (CCM)………………………….. 32
Exemple 2. Chromatographie en phase gazeuse (CPG)……………………………... 33
Exemple 3. Chromatographie liquide (LC - HPLC)………………………………… 34
Chapitre IV : Microscope électronique………………………………………………. 36
1. Microscopes électroniques………………………………………………………….. 36
1.1. Microscopie électronique à transmission………………………………………… 38
1.2. Microscopie électronique à balayage…………………………………………….. 39
Références bibliographiques ………………………………………………………….. 41
Glossaire ……………………………………………………………………………….. 42
LISTE DES FIGURES
i
LISTE DES TABLEAUX
ii
Avant-propos
Avant-propos
________________________
Ce document réparti sur trois chapitres qui portent les différents types technique
d’analyse en laboratoire, et cela, suivant le canevas établi pour ce module. En effet,
dans le but de faciliter le parcours de recherche bibliographique aux étudiants de
cette spécialité, il a été conçu ce support pédagogique qui porte l’ensemble des
analyses instrumentales dont l’étudiant en les a besoin le long de son parcours de
licence. Les principaux intérêts de ce module sont : i) améliorer la connaissance des
étudiants de ces outils d’analyse en laboratoire, ii) connaitre l’importance de chaque
analyse et son application et iii) comment choisir la technique qui convient aux
objectifs ciblés dans l’étude à réaliser. Enfin, pour avoir des résultats fiables et non
douteux il est impérativement savoir maitriser et manipuler ces techniques avec
succès.
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Introduction
I. Introduction
Biotechnologies « Biotechnologie » est un terme relativement récent, son apparition remonte aux
années de 1960. IL se compose de bios (« vie » en grec) et de technologie (entré dans la langue
française en 1656, au sens d’« étude des outils, machines et matières premières »). Sa définition
est un peu plus vague, en effet, l’application de la science et de la technologie aux organismes
vivants. Un sens plus restreint du terme « biotechnologie », l’associe aux réalisations des 60
dernières années comprenant toutes les techniques de culture « in vitro » ainsi que les différents
aspects de la génétique moléculaire, tels que le clonage de gènes, le séquençage, et aussi la
microbiologie, la biochimie, la biophysique, la bio-informatique. La biotechnologie est un
domaine clairement multidisciplinaire impliquant la biochimie, la biologie moléculaire, la
génétique, l’immunologie, la microbiologie, la pharmacologie, la fermentation, et l’agriculture
(Chaib, 2021).
Le domaine des biotechnologies végétales est un domaine qui est basé sur l’utilisation des
technologies en laboratoire sur les cellules, les tissus, les organes ou l’ADN des végétaux. Son
importance apparait essentiellement pour i) accélérer la production, ii) améliorer ses
caractéristiques, au service de la recherche, de l’agriculture ou de productions industrielles et iii)
la protection de ces produits végétaux.
En effet, la biotechnologie utilise principalement les microorganismes ainsi que les cellules
végétales, animales ou humaines pour la production de certaines substances à l’échelle
agroalimentaire et industrielle. La biotechnologie végétale étudie les plantes et les cultures de
tissus végétaux, vu leur importance en production d’aliments, de matière première et de
médicaments. Pour garantir la faisabilité, il est nécessaire de faire appel à plusieurs techniques
sophistiquées mais aussi la disponibilité de différents produits.
Dans ce contexte, ce cours est considéré comme une de route au profit de l’étudiant ou autres,
dont diverses analyses ont été démontrées et l’appareillage a aussi été représenté.
1
Chapitre II. Méthodes spectrales
Introduction
Principe
Un spectrophotomètre mesure l'absorbance d'une solution à une longueur d’onde donnée.
Dans la pratique, l'appareil réalise une mesure de l'intensité de la lumière après son passage au
travers d'une cuve contenant la solution à étudier. L'intensité de la lumière monochromatique
émise (I0) est connue. À partir de la mesure de l'intensité de la lumière transmise (I), l'appareil
donne l'absorbance (A) selon la formule suivante :
A = LOG(I0/I)
Figure 1 : Spectrophotomètre
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Chapitre II. Méthodes spectrales
3
Chapitre II. Méthodes spectrales
Pour déterminer la concentration d’une solution inconnue à partir de l’absorbance, on
cherche d’abord maximale de la solution contenant l’espèce à doser en établissant le spectre A=
f ( ƛ)
AMAX correspond à une longueur d’onde maximale ƛmax. Le spectromètre sera réglé à cette
longueur d’onde maximale ƛmax.
A partir d’une solution contient l’espèce à doser de titre connue (calibrateur), on mesure
l’absorbance et on établit la droite de calibration.
C'est la méthode analytique la plus utilisée en analyse d'eau. Elle nécessite la mise en œuvre
préliminaire d'une réaction colorée spécifique de (élément recherché). Elle s'appuie sur le fait
que toute solution colorée traversée par un faisceau de lumière laisse passer une fraction de la
lumière incidente ; la quantité de lumière absorbée est proportionnelle à la concentration du
composé coloré recherché (loi de Beer-Lambert).
Principe
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Chapitre II. Méthodes spectrales
-une anti-liante, d’énergie supérieure à celle des O.A
Principe : est basée sur l’absorption des radiations lumineuses par l’usage de la lumière
pour mesurer une concentration qui est proportionnelle à l’absorption de la lumière. Cette lumière
comprend des particules d’énergie discrète : le photon (modèle de Bohr) : quand un
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Chapitre II. Méthodes spectrales
électron saute d’une orbite de plus haute énergie à une de plus basse énergie. L’énergie de
ce photon est un multiple entier (quantification) de la valeur hν, ou ν=c/λE :
ΔE=hν = hc/λ
E: énergie de la radiation
h: constante de Planck h = 6,626.10−34J/s
c: vitesse de la lumièrec = 2,998. 108m/s,
λ: longueur d’onde
NB: plus la fréquence, ν, est élevée, plus son énergie est importante et plus la couleur tend
vers le bleu.
Il s'agit d'une méthode essentiellement qualitative, qui permet d'obtenir des informations
structurales, ou pour tester la pureté d'une substance. Les différentes fonctions chimiques
présentes sur une molécule donnée sont responsables de bandes d'absorption caractéristiques.
Les spectres d’absorption IR sont caractérisés par de faibles coefficients d’absorption molaire
(compris entre 10 et 1500) donc la méthode est peu sensible.
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Chapitre II. Méthodes spectrales
7
Chapitre II. Méthodes spectrales
L’échantillon d'eau qui contient les éléments métalliques recherchés, est dispersé en nuage de
fines gouttelettes dans la flamme. Les métaux ainsi libérés forment un plasma d'atomes libres
(Figure 7).
La pulvérisation d'une solution d'eau contenant des métaux dans une flamme se caractérise
par une décomposition et une dissociation à l'état atomique des traces métalliques. Les atomes
des métaux sont ainsi excités thermiquement par la flamme, et leur retour à l'état fondamental
s'accompagne de l'émission d'une radiation dont la longueur d'onde est spécifique
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Chapitre II. Méthodes spectrales
3. Fluorescence
La spectrométrie de masse est une méthode destructive, qui permet à la fois d'accéder à la
mesure de la masse moléculaire d'une substance ainsi que d'obtenir des données structurales : la
substance ionisée se trouve dans un état excité qui provoque sa fragmentation. L'analyse de ces
fragments informe sur la structure de la molécule. Chacun des ions formés est caractérisé par son
rapport masse/charge (m/z) et l'appareil est capable de séparer ces ions (par un champ
magnétique) et de les détecter/caractériser (qualitativement et quantitativement).
Elle est basée sur l’utilisation des propriétés de résonance des atomes placés dans un champ
magnétique, est particulièrement puissante.
Principe : elle est basée sur l’utilisation d’un champ magnétique pour orienter les spins
nucléaires des atomes, l’excitation des spins par une onde radio à la fréquence de résonance
permet de basculer certains spins, ces spins excités reviennent à leur état initial, mais ceci n’est
pas instantané cette relaxation dépend d'une composante appelée spin-réseau (interaction des
spins avec les autres atomes) et d'une composante spin-spin (interaction entre les spins). Le spin
nucléaire se définit comme la résultante des moments cinétiques (= rotation sur eux-mêmes) des
protons + neutrons (= nucléons) d'un atome. A ce spin nucléaire est associé un nombre quantique
I. La RMN concerne essentiellement les noyaux avec un nombre de spin = 1/2 (1H, 13C, 19F,
31P). Cette méthode permet, à condition de disposer d'une substance parfaitement pure et en
quantité suffisante, d'aboutir à la détermination complète des structures avec en particulier la
stéréochimie des liaisons entre atomes. Il est possible d'utiliser la RMN du proton (1H-RMN),
celle du carbone (13C-RMN) ou celle du phosphore (31P-RMN).
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Chapitre II. Méthodes spectrales
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
Définition de la séparation
La séparation est l’isolement des substances ou des micro/macromolécules des solutions ou des
mélanges dans le but de les purifier.
1. Filtration
a. L’amélioration de qualité des produits (alimentaires, chimiques, productions etc….)
nécessite des procédés de filtration. Par laquelle les particules seront éliminées des ces
produits. De ce fait, la filtration permet d’extraire les particules de ces produits par des
systèmes conçus en fonction de l’utilité de produit à traiter (Anonyme, 2024).1
b. La filtration est une méthode de séparation qui permet de séparer des constituants ou
particules en suspension dans un mélange / fluide dont elle est basée sur la différence de
pression et de taille à travers une membrane appelée des « filtres ». Le liquide ayant subi
la filtration se nomme filtrat, et ce que le filtre retient se nomme un résidu.
1
[Link]
surface-zone-rurale/comment-fonctionne-filtration
11
Chapitre III. Méthodes de fractionnement
c. Cette technique consiste à retenir des particules solides en suspension dans un liquide ou
un gaz au travers un filtre, une substance filtrante ou un réseau poreux.
d. Consiste à séparer les particules solides les plus denses d’un mélange hétérogène (jus de
fruit, infusion, ….) par décantation. Les fines particules qui restent sont filtrées par des
matériaux poreux dont les mailles doivent etre plus fins pour capter ces particules. Le
résultat est la récupération d’un « résidu » solide dans le filtre et un mélange homogène
appelé « filtrat ». La filtration ne peut etre utiliser pour séparer les composants d’un
mélange homogène.
e. La filtration est une technique séparative consistant à séparer grâce à un milieu poreux les
différents constituants d’un mélange possédant une phase liquide et une phase solide.
La filtration permet de purifier les solutions en éliminant toutes les particules solides. La filtration
permet de purifier les solutions en éliminant toutes les particules solides. Elle est également
utilisée pour retenir toutes les particules en suspension dans l’air.
Le but de la filtration est d’arrêter les contaminants d’une taille donnée, d’une façon constante et
définitive dans les conditions d’utilisation des filtres.
La filtration est fréquemment employée en biochimie pour un grand nombre d’applications :
stérilisation, décontamination, récupération des précipités, élimination de sels de solutions,
concentration de macromolécules…etc.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
engagées dans les canalicules du réseau, vont provoquer une orientation des ions de la solution à
l’interface du solide adsorbé, et du liquide qui s’écoule. Cette orientation entraîne la formation
d’une charge continue, responsable d’un effet de répulsion, sur les molécules de la phase liquide,
ce qui facilité l’écoulement. En effet, la phase liquide, les ions négatifs de la solution sont
repoussés par les particules négatives déjà plaquées sur les parois des canalicules. Les ions
positifs de la solution sont repoussés par les charges positives de même signe de la paroi.
Le matériel utilisé généralement pour procéder la filtration est le filtre dont plusieurs types sont
disponibles en fonction de l’intérêt de séparation.
a. Les filtres
Pour que les filtres soient efficaces il est important de déterminer son pouvoir de séparation qui
définit la performance de filtre. La rétention des particules peut etre définitive dans la mesure où
la structure de filtre est stable.
En effet, on peut distinguer deux types filtre selon la substance filtrante utilisée à savoir :
+ Filtres rigides
+ Filtres non rigides
• Elles sont peu utilisées, elles sont très résistantes, faciles à confectionner.
• Les matières plastiques filables et tissables sont utilisées pour la confection des filtres :
polyamides, polyméthanes, polyesters…
• Les tissus obtenus sont très résistants et cèdent peu de fibres.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
d. Membranes organiques
Ce sont des membranes d’esters de cellulose très utilisées dans la filtration du fait que ces
filtres offrent des pores de diamètre très bien défini jusqu’au 1/100ème du μm .
• Ils peuvent être stérilisés dans l’autoclave par la chaleur humide à 120° C.
• Le verre fritté est très utilisé dans la filtration du fait de son inertie chimique.
• Il est composé d’un réseau rigide poreux de charge électrique négative, constitué par soudure
entre elles de particules de verre dont le calibre conditionne la porosité.
Un entonnoir est un instrument en forme conique, terminé par un tube et servant à verser un
liquide, une poudre, un granulé ou une pâte dans un récipient de petite ouverture. Ils sont
généralement en verre, plastique ou métal, mais parfois en papier ciré lorsqu'ils sont destinés à un
usage unique. On distingue deux types d’entonnoirs :
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
a b
La filtration par gravité est utilisée pour récupérer le liquide (filtrat). Il s’écoule librement
à travers le filtre. Ce dernier, placé sur un entonnoir, est soit conique, soit plissé (filtration
accélérée). La filtration peut également être réalisée sur un tampon de coton de verre.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
b. Filtration sous vide : La filtration sous vide est utilisée pour isoler un solide. Elle est
plus rapide que la filtration par gravité car une dépression est créée par un dispositif
d’aspiration avec une trompe à eau.
Protocole opératoire
▫ Ne pas exercer immédiatement une forte aspiration car de fines particules vont obturer les pores
du filtre, ce qui diminue la vitesse de filtration.
▫ Laver le solide avec le solvant froid en arrêtant l’aspiration.
▫ Essorer le solide en le pressant avec un tapon en maintenant le vide.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
On augmente la vitesse de filtration en exerçant une pression sur le liquide à filtrer en amant
du matériel filtrant représenté par une membrane filtrante. Ce système de filtration sous
pression avec membranes filtrantes existe également sous forme de cartouches filtrantes
(millipore) adaptable sur une seringue pratique pour la filtration des petits volumes de
solution à filtrer.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
L’ultrafiltration
• Elle permet d’arrêter des contaminations de 0.001 um à 0.01 um (10 à 100 A°).
Est une filtration d’un liquide à travers une membrane semi-perméable grace à une différence de
pression, dont la rétention des particules de grand poids moléculaire et le passage des petites
molécules. Dans le cas des particules virales, l’élimination de la totalité des virus fait recours à
une ultrafiltration, qui permet d'éliminer des fluides traités les particules dissoutes de 0.001 à
0.1 µm (soit 1 à 100 nm). Elle bloque donc les bactéries, les levures et la plupart des virus. Ce
procédé est utilisé dans les domaines de : l'industrie laitière, l'industrie alimentaire, l'industrie
textile et l'industrie du métal, par exemple la séparations d'émulsion huile/eau.
L'ultrafiltration peut aussi être mise en place comme prétraitement de l'eau (dessalement des
eaux de surfaces) avant une nanofiltration ou une étape d'osmose inverse. Elle est utilisée
également en recherche fondamentale, pour la séparation et la purification et la concentration des
protéines. Lorsque les pores du filtre sont encore plus étroits, on parlera
de nanofiltration puis d’osmose inverse.
La nanofiltration
Ce procédé membranaire est placé entre l’osmose inverse et l’ultrafiltration sur la base de
taille. Permettant la rétention des sels minéraux avec une pression plus faible (« 20 bars). Il est
plus économique que l’osmose inverse dont elle effectue le dessalement partiel.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
L’osmose inverse :
Permettant d’arrêter des contaminants de 0,0001 um à 0,001 um (1 A° à 10 A°). Est un
procédé membranaire utilisé pour le passage de l’eau du milieu le plus concentré vers le milieu
le moins concentré sous l’effet d’un gradient de pression. Les stations d’osmose inverse sont
destinées pour la déminéralisation des eaux.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
2. Sédimentation et Centrifugation
Introduction
De nombreuses expériences de différents domaines exigent une ou plusieurs
étapes de centrifugation. Cette technique permet d’exposer des échantillons à de fortes
accélérations qui permettent la séparation des constituants. Il est possible ainsi de fractionner une
préparation en un sédiment (culot), constitué de matériel plus ou moins solidement entassé dans
le fond du tube à centrifuger, et en un surnageant qui sera le liquide résiduel au-dessus du
sédiment. Parmi les procédés mis en œuvre pour le traitement mécanique des liquides, la
sédimentation et la centrifugation qui sont basées sur la différence de densité des phases. Les
phénomènes physiques utilisés et les forces qui en résultent caractérisent ces deux procédés.
Définitions
a. Sédimentation
La sédimentation est une technique d’analyse permettant de séparer un solide au sein d’un
liquide ou un liquide au sein d’un autre liquide non miscible et de densités différentes. Cette
séparation peut se faire d’elle-même sous l’action de la pesanteur.
➢Lorsque la préparation est formée d’une substance beaucoup plus dense que le liquide :
on parle de Décantation
➢Lorsque la densité de la substance est plus faible, la sédimentation en est gênée. Il faut
avoir recours à des champs de force plus intense (centrifugation).
b. Centrifugation
La centrifugation est une technique permettant de séparer les composés d’un mélange en
fonction de leur densité sous l’effet d’une force centrifuge. Le mélange à séparer peut etre
composer soit de deux phases liquides, soit de particules solides en suspension dans un fluide.
C’est une technique de séparation qui permet de récupérer un précipité (culot) et un surnageant.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
L’appareil utilisé est une machine tournante à grande vitesse appelée centrifugeuse. La
centrifugeuse est équipée d’un axe de rotation enfermé dans une enceinte. Excepté pour les
centrifugeuses de paillasse dont la vitesse de rotation et le temps typique d’utilisation sont
relativement limités, il est nécessaire d’empêcher l’échauffement des échantillons. Pour cela,
l’enceinte est réfrigérée et souvent soumise à un vide poussé pour éviter les frottements. La mise
en place des échantillons doit etre équilibrée. Il faut mettre les tubes deux à deux, chaque couple
de tubes doit être placé symétriquement par rapport à l’axe de rotation.
Figure 16 : Centrifugeuse
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
Pour la séparation d’une particule au sein d’une suspension, il faut travailler avec de
grandes accélérations par les centrifugeuses. Ces appareils comportent les éléments suivants :
Un moteur capable de tourner à plusieurs dizaines de milliers tours par minute
Un rotor capable de supporter des rotations aussi rapides (en titane), en général conçu
pour les rotors des ultracentrifugeuses résistant à de fortes températures
Une enceinte dans laquelle est disposé le rotor qui est réfrigérée et sous vide
(ultracentrifugeuse). Les centrifugeuses de paillasse ne sont pas réfrigérées. En effet, pour
des vitesses de rotation importantes, le déplacement du rotor entrainerait un échauffement
de l’appareil.
• Cette enceinte est plus blindée pour éviter des accidents en cas d’explosion du rotor.
• La principale limite qui détermine la vitesse de rotation du rotor est la force du moteur qui le
fait tourner. Plus le rotor est lourd et volumineux, plus l’effort que doit fournir le moteur
est grand.
Selon l’axe de rotation, il existe trois catégories de machines à centrifuger : Les centrifugeuses
à axe horizontal, les centrifugeuses à axe vertical et les centrifugeuses à axe oblique.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
a. Centrifugation différentielle
Elle est basée sur des différences de vitesse de sédimentation de particules de tailles et de
densités variables. Les particules de même masse mais de densités différentes, celles qui
présentent la densité la plus élevée se sédimentent plus rapidement.
Dans cette technique, le matériel de départ (homogénat) est fractionné en augmentant la vitesse
de centrifugation. On utilise très fréquemment des rotors à angle fixe caractérisés par des tubes
inclinés de 14 à 40°.
Principe
L’homogénat est d'abord soumis à une centrifugation à basse vitesse pour sédimenter les
particules les plus grosses (ou les plus denses) présentes. Après cela, le matériau non sédimenté
(surnageant) est transféré dans un autre tube et centrifugé à une vitesse plus élevée (et
généralement également une période plus longue) pour sédimenter des particules de taille un peu
plus petite (et / ou de densité plus faible) et à chaque étape, on améliore le rendement avec une
seconde centrifugation dans les mêmes conditions à partir du culot précédent.
On peut utiliser cette méthode pour récupérer les éléments figurés du sang (GR, GB,
plaquettes,,,) qui sédimentent par des accélérations très faibles. En outre, on peut relancer un
deuxième cycle de centrifugation en utilisant le surnageant précédent, mais avec une accélération
plus élevée. Exemple : Isolement des organites cellulaires.
25
Chapitre III. Méthodes de fractionnement
Ce type de centrifugation est utilisé pour accentuer les méthodes de séparation. En effet,
un des facteurs qui influence la vitesse de sédimentation est la différence entre la densité de la
particule et celle du solvant.
Les particules sédimentent dans le cas où la densité est plus grande que celle du milieu.
Plus la différence de densité est grande plus la sédimentation est rapide. S’il n’y a aucune
différence de densité, il n’y aura aucune sédimentation, quelle que soit l’accélération.
Les particules les moins denses que celle du milieu, peuvent atteindre le niveau de densité
qui est égal à celle du milieu ou peuvent flotter à la surface.
Donc, pour obtenir des solutions de densités différentes, la méthode la plus classique est
d’utiliser des solutions de concentration croissante en saccharose, mais aussi du chlorure
de césium.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
Ils sont constitués d’un empilement de solutions de moins en moins dense. Les différents
éléments s’accumulent aux interfaces entre les solutions de densité différentes. Au-dessus, leur
densité étant plus élevée ils migrent vers le bas, et au-dessous leur densité étant plus faible ils
migrent vers le haut.
Ce sont des gradients pour lesquels la variation de densité est continue. Les différents
constituants vont alors migrer jusqu’à atteindre le point précis où leur densité est égale à celle du
solvant formant des bandes parfois visibles à l’œil nu.
A) Le saccharose (sucrose)
Il est très souvent employé. Il permet d’atteindre des densités assez élevées. Ce produit a
l’avantage d’être peu coûteux, électriquement neutre et plutôt inerte pour la plupart des fractions
cellulaires.
Il est utilisé, particulièrement dans la séparation des acides nucléiques. Ce sel peut atteindre
une densité très élevée. Son principal avantage est la possibilité d’atteindre des densités si élevées
en solution aqueuse. Son coût et sa nature comme un sel c-à-d de molécules chargées, réduisent
son champ d’application. D’autres sels de césium peuvent aussi être employés comme le sulfate
de césium (CsSO4).
• Les godets sont disposés sur des crochets, lors de la centrifugation, grâce à la force
centrifuge, ils passent en position horizontale. Les particules se sédimentent directement
dans le fond du tube à centrifuger.
• Ils sont généralement utilisés dans les centrifugations en gradient continu ou discontinu
(séparations plus fines) car la force centrifuge s’exerce dans le sens de la longueur du
godet. Les particules sont alors séparées en fonction de leur densité.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
• Un des facteurs qui influence la vitesse de sédimentation est la différence entre la densité
de la particule et celle du solvant. On peut donc moduler cette vitesse en faisant varier de
façon continue ou discontinue cette différence de densité en créant un gradient de
concentration.
• Inconvénient : Ils ne peuvent pas atteindre des vitesses très élevées parce que les godets
en position horizontale allongent le rayon du rotor, ce qui est plus difficile de lui conférer
des vitesses élevées.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
2.4. Intérêt
Applications de la centrifugation
Détermination du poids moléculaire : notamment pour les acides nucléiques et les
protéines;
Détermination des constantes de sédimentations : les acides nucléiques, les sous-
unités des ribosomes et des ARN ribosomaux. Certains organites ont les mêmes
constantes que les acides nucléiques ;
Séparation d’un mélange : deux molécules de masse molaires différente
sédimentent séparément ;
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
3. Méthodes chromatographiques
Définitions
Définition 1
La chromatographie est une méthode de séparation des constituants des mélanges variés.
Elle sert pour identifier et quantifier des composés au sein d’échantillons divers.
Le principe de base: repose sur les équilibres de concentration présence de deux phases
non miscibles, l’une, dite stationnaire, est emprisonnée dans une colonne ou fixée sur un support
et l’autre, dite mobile, se déplace au contact de la première. La séparation est basée sur
l’entrainement différentiel des constituants du mélange. Ces derniers parcourent la phase
stationnaire avec des temps proportionnels à leurs propriétés intrinsèques (taille, structure,…) ou
à leur affinité avec la phase stationnaire (polarité,…).
Définition 2
La chromatographie, méthode d’analyse physico-chimique, utilisée pour la séparation des
constituants d’un mélange (les solutés), l'identification et le dosage des MO par entraînement au
moyen d’une phase mobile (liquide ou gaz) le long d’une phase stationnaire (solide ou liquide
fixé), grâce à la répartition sélective des solutés entre ces deux phases. Chaque soluté est donc
soumis à une force de rétention (exercée par la phase stationnaire) et une force de mobilité (due
à la phase mobile).
Le chromatogramme est une courbe qui traduit la variation au cours du temps d’un
paramètre relié à la concentration instantanée du soluté en sortie de colonne.
De la nature du soluté : gaz, liquide volatil, liquide peu volatil, solide, macromolécule,
espèce organique, polaire, ionique,…
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
préparatives), suivi de réaction en continu pour optimiser des paramètres, dosages
(quantification)…
Selon le type de chromatographie, elle peut servir à identifier (CCM, HPLC, CPG), séparer
ou purifier les composés d’une réaction (chromatographie sur colonne, HPLC). Cette technique
peut également, grâce à un témoin, permettre de quantifier un produit (CPG, HPLC).
Le choix de l’une ou l’autre de ces techniques dépend de la nature des composés à séparer
et en fonction de celle-ci, le choix de la phase stationnaire que l’on utilise.
31
Chapitre III. Méthodes de fractionnement
La CCM est une technique qualitative et quantitative, la révélation des spots se fait soit par
une réaction colorée, soit par fluorescence. L'identification des constituants du mélange se fait
par comparaison avec des témoins, en calculant le rapport au front (Rf) de chaque soluté, ou
encore le rapport à un témoin (Rt) lorsque le solvant a dépassé le niveau supérieur de la plaque.
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
Cette méthode permet de séparer des mélanges gazeux par suite d'équilibres entre deux phases :
- une phase stationnaire qui peut être soit liquide (chromatographie de partage ; GLC), soit
solide (chromatographie d’adsorption ; GSC)
- une phase mobile : un gaz ou mélange de gaz
• La méthode s'adresse à des molécules volatiles naturellement ou des molécules rendues
volatiles par des réactions de dérivatisation (à des températures ne provoquant pas leur
décomposition). Les différents composants du chromatographe sont indiqués dans la
figure ci dessous. Les détecteurs peuvent être :
• Non spécifiques : cathétomètre, détecteur à ionisation de flamme, photomètre de flamme
• Spécifiques : détecteur thermo ionique, par capture d'électrons, spectromètre de masse
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
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Chapitre III. Méthodes de fractionnement
35
Chapitre IV. Microscope électronique
Les microscopes électroniques sont des instruments beaucoup plus volumineux. Ils
utilisent eux aussi un système de lentilles qui sont organisées dans une colonne électronique. Le
microscope électronique à balayage permet typiquement d'accéder à des pouvoirs de résolution
de l'ordre de 10 nm. Le un microscope électronique en transmission, plus volumineux encore que
le microscope électronique à balayage, avec un système de lentilles plus complexe. Il permet
d'accéder à des résolutions de l'ordre de 0,1nm et donc de voir directement les atomes. Le
principe est d'utiliser un système optique. Il y a évidemment une source d'électrons qui émet un
faisceau d'électrons. Dont l’utilisation d’un système de lentilles pour focaliser, éclairer un
échantillon. Ça c'est le principe de fonctionnement du microscope électronique à balayage.
L'échantillon est massif et il va réfléchir ce faisceau d'électrons. On va détecter les faisceaux
réfléchis dans un détecteur et l'image est formée en balayant ce faisceau d'électrons sur la surface
de l'échantillon. On obtient ainsi une image qui est fabriquée de manière séquentielle comme sur
un écran cathodique de télévision, grâce à l'utilisation d'un écran d'ordinateur. Dans le cas d'un
microscope électronique en transmission, la géométrie est différente dont le passage se fait à
travers l'échantillon. Donc on a un échantillon mince. Le système de lentilles est disposé de part
et d'autre de l'échantillon le long de la colonne. Où il y a les mêmes éléments. Un système
condenseur, une lentille objective qui permet de fabriquer l'image et un système projecteur qui
va permettre d'agrandir l'image sur un écran.
36
Chapitre IV. Microscope électronique
Contrairement au MET et au microscope optique, l'image n'est pas formée par une lentille
objectif. L'image est formée de manière séquentielle en balayant la surface de l'échantillon par
un faisceau d'électrons. Le MEB fournit des images de la surface en relation avec le mode de
diffusion des électrons par l'échantillon.3
- Les électrons se déplacent à l’intérieur d’une enceinte où règne un vide poussé (de l’ordre
de 105 mm de mercure). Sous cette pression, seules les substances non volatiles peuvent être
observées. Les cellules sont riches en eau (un composé volatil), une étape de déshydratation est
donc nécessaire. Comme pour la microscopie optique la déshydratation est nécessairement
précédée d’une étape de fixation pour ne pas endommager l’échantillon.
2
Odile Stephan. MOOC : Comprendre les nanosciences 2017, MOOC Nano,
COMUE Université Paris Saclay & Université Paris-Sud
3
Marie-Paule Bassez ; Julien Bortoluzzi ; Benjamin Malatrait ; Ludovic Ribstein 2012. Les microscopes
électroniques [Link] Université de Strasbourg.
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Chapitre IV. Microscope électronique
- Le pouvoir de pénétration des électrons est très faible, par conséquent l’échantillon doit
être ultrafin, pas plus de 0,1 m. L’observation par microscope électronique à transmission
nécessite l’augmentation du contraste des objets observés grâce à l’utilisation d’éléments de
numéro atomique élevé qui diffusent fortement les électrons 4.
1. Microscopes électroniques
Principe
Le principe de fonctionnement d'un microscope électronique ressemble un peu à celui
d'un microscope optique sauf que:
Les photons sont remplacés par des électrons.
Les lentilles de verre sont remplacées par des lentilles électromagnétiques.
La limite de résolution du ME est plus élevée à celle du MO. Elle est de 2 nm
(c’est-à-dire 1000 fois plus élevé que le MO). L’agrandissement du ME peut
atteindre jusqu’à 500.000 contre 2000 pour un MO.
La qualité des observations et des analyses en MET est conditionnée par la qualité des
échantillons.
Microscope électronique de transmission (TEM) : dans ce cas, un objet est irradié par des
électrons. Les microscopes TEM (microscopes électroniques de transmission) sont comme les
microscopes de lumière transmise, où l’absorption joue un rôle important. Actuellement la
résolution obtenue est d’environ 0,05 nm.
4
Extrait PDF ([Link]): Chapitre 1- Les méthodes d’étude en biologie cellulaire
38
Chapitre IV. Microscope électronique
Microscope électronique à transmission (MET), les électrons traversent l’échantillon traité par
des métaux lourds. Sur l’écran du MET apparait une image claire et agrandie. L’image est due à
l’absorption différentielle des électrons par les différentes structures de l’échantillon. Le MET se
compose essentiellement de :
o Une source des électrons (fil métallique chauffé à un degré très élevé sous vide).
o Sous vide, les électrons vont être accélérés en appliquant une différence de potentiel de 10 à 100
kV
o Espace tubulaire sous vide.
o Des lentilles électromagnétiques (Bobines) permettent la diffraction du trajet des électrons 5.
5
ZOUAGHI Youcef. 2021. Chapitre II : Méthodes d’étude de la cellule TD N°1 : Méthodes de microscopie
optique et électronique Université Frères Mentouri Constantine 1. 1ère année LMD/TC/SNV. Cours de Biologie
Cellulaire
39
Chapitre IV. Microscope électronique
cette technique donne des images absolument spectaculaires, en 3D. Lorsque le faisceau
d'électron bombarde la préparation, une partie des électron la traverse, le reste est ré-émis. Ce
sont eux qui serviront à construire l'image. Le résultat est une représentation de la surface de
l'objet observée. 6
Le MEB permet d'observer l’objet en trois dimensions. Il est utilisé dans l’étude des
surfaces des objets massifs après leur traitement par des substances métalliques réfléchissantes
telles que le platine, l’argent et l’or. Le flux d’électrons balaye la surface de l’objet. Ce sont les
électrons secondaires, renvoyés par la surface métallique, qui sont utilisés pour fournir une
image.
6
Naciri M. 2011. Les techniques de préparation des coupes pour les microscopies optique et électronique.
Techniques histologiques PDF ([Link]). Université Mohammed V-Agdal. Faculté des Sciences de
Rabat. Laboratoire de Zoologie et de Biologie générale
40
Références bibliographiques
Références bibliographiques
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Glossaire
Glossaire
transformation de matériaux par des agents biologiques pour produire des biens et
entre la science des êtres vivants (la biologie) et un ensemble de techniques nouvelles
l’informatique…..
d’ADN. Les applications de la PCR est multiples dans plusieurs domaines à savoir :
exister entre deux points contigus pour qu’ils soient correctement discernés au travers
un milieu aqueux à 25° C une solution avec un PH : inférieur à 7 est acide, supérieur
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Glossaire
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