Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Initiation à R

Chargé de cours : Idir Ouassou

Université Cadi Ayyad,

Ecole Nationale des Sciences Appliquées

Marrakech

[Link]@[Link]

26-11-2024
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Plan du chapitre

1 Généralités sur le logiciel R

Généralités
Obtenir R
Coment obtenir de l’aide pour utiliser R ?
Le console R
Commennt utiliser R ?
Base et packages additionnels
Quelques commandes basiques pour R

2 Les objets R

3 Manipulation d’Objets R
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Généralités

Généralités sur le logiciel R

le logiciel R à la fois logiciel de statistique et langage de

programmation.
Logiciel libre, gratuit et multiplateforme, développé par des
bénévoles.
Utilisable en ligne de commande, ou via une interface
graphique : R Commander.
Logiciel le plus utilisé dans la recherche en sciences
humaines et bio-médicales, ......
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Généralités

Références

P.-A. Cornillon et co-auteurs : Statistique avec R. Presses

universitaires de Rennes, 2012.
M. Maumy-Bertrand et F. Bertrand : Initiation à la
statistique avec R. Dunod, 2010
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Obtenir R

Obtenir R

On peut trouver le logiciel R sur son site officiel :

le CRAN (Comprehensive R Archive Network)

http ://[Link]/

R est disponible sur Windows

R est disponible sur toutes les distributions Linux.
Pour Mac OS X, en fonction de la version de votre OS
(10.4, 10.6, 10.9, ...),
R peut nécessiter l’installation de certains logiciels tiers
pour fonctionner correctement. Consulter la FAQ
spécifique sur CRAN.
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Coment obtenir de l’aide pour utiliser R ?

Coment obtenir de l’aide pour utiliser R ?

Une communauté d’utilisateurs très active, à retrouver sur :

http : //[Link] /logiciel − R/[Link]

De la documentation en Français et en Anglais sur le

CRAN :

http : //cran.r − [Link]/other − [Link]

R est open source : le code des fonctions peut être

consulté (simplement en tapant leur nom dans la console
R !), et l’aide de chaque fonction fournit l’adresse mail de
son auteur.
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Le console R

Le console R

R se présente basiquement comme une console.

Le signe > (prompt) en début de ligne indique R est prêt à
recevoir une commande.
Tester les commandes suivantes (touche Entrée pour les
exécuter) :

> 3+8
> 7^4
> 5*9
> 17-12
> 45/5
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Le console R

Le console R

Si vous interrompez la saisie d’une commande en

appuyant trop tôt sur la touche Entrée,
R offre la possibilité de compléter la saisie de la
commande sur la ligne suivante , la ligne commence alors
par le symbole + :

> 9-
+1
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Commennt utiliser R ?

Commennt utiliser R ?

Il y a plusieurs approches possibles pour utiliser le logiciel :

Utiliser le langage R en saisissant des lignes de
commandes directement dans la console R (déconseillé).
Utiliser uniquement l’interface graphique R Commander, et
réaliser toutes les analyses « à la souris » ( déconseillé).
Utiliser un EDI (environnement de développement intégré)
tel que R Studio, intégrant à la fois
un éditeur de script,
une console R
plusieurs raccourcis utiles.
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Base et packages additionnels

Base et packages additionnels

R est livré avec une certaine collection de fonctions de

base, permettant de réaliser les tâches les plus courantes
représentations graphiques usuelles,
estimations
tests classiques, etc..
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Base et packages additionnels

Base et packages additionnels

Pour mettre en œuvre des méthodes "rares" ou

spécifiques à une discipline, il existe plusieurs centaines
de packages additionnels, dont on peut obtenir la liste
grâce à la commande :
[Link]()
Il n’est nécessaire de les installer qu’une seule fois, mais
ils doivent ensuite être chargés à chaque démarrage du
logiciel grâce à la commande library.
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Quelques commandes basiques pour R

Quelques commandes basiques pour R

Trouver une commande répondant à un besoin précis

(accès Internet requis) :
RSiteSearch(" ")

Exemple
RSiteSearch("mantel mean").
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Quelques commandes basiques pour R

Quelques commandes basiques pour R

Obtenir de l’aide sur une commande :

help()

Exemple
help(mean))
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Quelques commandes basiques pour R

Quelques commandes basiques pour R

Installer un package additionnel :

[Link](" ")

Exemple
Pour l’installer l’interface graphique,
[Link]("Rcmdr", dep=TRUE)

Charger un package additionnel :

library()

Exemple
Pour charger l’interface graphique :
library(Rcmdr)
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Plan du chapitre

1 Généralités sur le logiciel R

2 Les objets R
Objets basiques
Vecteur
Facteur
Matrice
Liste
Data frame

3 Manipulation d’Objets R
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Les objets R

Définition (Objet)
Un objet R est une " boîte étiquetée " dans laquelle vous
pouvez placer l’information qui vous intéresse.
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Les objets R

Les variables, les données, les fonctions, les résultats

d’analyses sont stockés dans des objets.
Il existe plusieurs types d’objets : vecteurs, facteurs, etc.
Lorsque l’on importe un fichier dans R, on obtient dans R
un objet nommé data frame.
Les principaux objets seront présentés dans la suite .
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Les objets R

Les objets sont caractérisés par

z leur nom,
z leur contenu
z des attributs qui vont spécifier le type de données
représenté par l’objet.
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Les objets R

z Le nom d’un objet

doit commencer par une lettre
peut comporter des lettres, des chiffres, des points et des
espaces soulignés.
z R distingue les majuscules des minuscules pour les noms
des objets,
Exemple
C’est-à-dire que z et Z nommeront des objets distincts.
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Les objets R

z Les objets ont tous au moins deux attributs : le mode et la

longueur.
z Le mode est le type des éléments d’un objet. Il en existe
quatre principaux :
numérique,
caractère,
complexe,
logique (FALSE ou TRUE).
z Pour connaître le mode d’un objet on utilise la commande
mode( ).
z Pour connaître la longueur d’un objet on utilise la
commande length( ).
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Les objets R

z Plus formellement, il s’agit d’un espace de stockage dans

la mémoire de R, auquel on va donner un nom, et que l’on
va remplir avec un certain type d’information ou de
données.
z On peut ensuite y accéder à tout moment et réutiliser
cette information ou ces données dans le cadre de calculs,
de tests, etc.
z Ces objets peuvent être de différents types : c’est une
notion importante car chaque fonction de R ne peut
travailler qu’avec un type précis d’objet.
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Les objets R

z On crée des objets en utilisant l’opérateur = ou − > ou

< −.
z Le mode et le type de l’objet ainsi créé sont généralement
déterminés de façon implicite.
z Il est possible de créer un objet en précisant son mode, sa
longueur, son type, etc.
z On peut aussi créer des objets à partir d’autres objets.
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Les objets R

Le tableau 1 suivant indique les modes possibles pour les

objets :
z vecteur,
z facteur,
z array,
z matrice,
z [Link],
z ts
z liste.

1. tableau tiré du document R pour les débutants d’Emmanuel Paradis

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Les objets R

Objet Modes
vecteur num, car, comp, log
facteur num, car
array num, car, comp, log
matrice num, car, comp, log
[Link] num, car, comp, log
ts num, car, comp, log
liste num, car, comp, log, fonction, expression

num = numérique, car = caractère, comp = complexe, log =

logique, ts = les données de type séries temporelles.
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Valeurs manquantes

Les valeurs manquantes sont représentées par NA (Not

Avalaible) quel que soit l’objet ou le mode.
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Objets basiques

Objets basiques

z L’objet le plus basique est une constante, qui peut être

numérique,
complexe,
caractère,
logique.
z On affecte directement une valeur à un objet.
z L’objet n’a pas besoin d’être déclaré.
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Objets basiques

Objets basiques

Exemple
Par exemple, on saisit sur la console : n = 8.
z On tape ensuite n pour afficher sa valeur.
z On obtient le résultat suivant :

[1] 8

Remarque
Le symbole [1] indique que l’affichage commence au premier
élément de n.
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Objets basiques

Objets basiques

On aurait également pu affecter une valeur à l’objet n en

utilisant le signe < − ou − > :
Exemple
>n <- 8
>n
[1] 8
>8 -> n
>n
[1] 8
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Objets basiques

Objets basiques

Dans la suite du document, on utilisera le symbole " = ".

Exemple
>x=1
>x
[1] 1
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Objets basiques

Objets basiques

Si on affecte une valeur à un objet existant, sa valeur

précédente est effacée :
Exemple
>x = 10
>x
[1] 10
>y = 10 + 2
>y
[1] 12
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Objets basiques

Objets basiques

On utilise " ; " pour séparer des commandes distinctes sur la

même ligne :
Exemple
>w = 12 ; name = " Marwa "; dicton = "Aide-toi,
le bon Dieu t’aidera";
>w ; name ; dicton
[1] 12
[1] "Marwa"
[1] "Aide-toi, le bon Dieu t’aidera"
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Vecteur

Vecteur

Définition
Un vecteur est une suite indexée de valeurs toutes du même
type

Soit une suite de

nombres,
caractères,
complexes, etc.
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Vecteur

Comment saisir un vecteur

z On peut saisir un vecteur avec

la commande c( ).
La fonction vector ().
z La fonction vector () a deux arguments :
le mode des éléments qui compose le vecteur
la longueur du vecteur.
z < − est l’opérateur d’affectation : il sert à ranger une
certaine information dans un certain objet.
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Vecteur

Vecteur

Exemple

> x <- c(2,5.9,6.2,8.3)# définir un vecteur x

> x # afficher x
[1] 2.0 5.9 6.2 8.3
> x[1] # accéder au premier élément de x
[1] 2
> x[3] # accéder au troisième élément de x
[1] 6.2
> x[c(1,2)]#acceder aux éléments n° 1 et 2 de x
[1] 2.0 5.9
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Vecteur

Vecteur

Exemple

>a = vector("numeric", 5) ou a = numeric(5)

>b = vector("character",5) ou b = character(5)
>c = vector("logical", 5) ou c = logical(5)
>d = vector("complex", 5) ou d = complex(5)

Si on tape sur la console a ; b ; c ; d, le résultat suivant

s’affiche :

[1] 0 0 0 0 0
[1]"" "" "" "" ""
[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
[1] 0+0i 0+0i 0+0i 0+0i 0+0i
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Vecteur

Vecteur

On peut également construire un vecteur à l’aide de la fonction

c()
Exemple

>vect = c(5, 7.2, 3.6, 4.9);

>vect
[1] 5.0 7.2 3.6 4.9
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Facteur

Facteur

Définition
Un facteur est un vecteur qui contient uniquement des données
qualitatives.

La fonction factor() crée des variables qualitatives nominales.

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Facteur

Facteur

Exemple
factor(x, levels=sort(unique(x), [Link]=TRUE),
labels = levels, exclude = NA,
ordered = [Link](x))

z levels : spécifieles valeurs que peuvent prendre les

éléments du facteur.
z labels : définit les noms des niveaux
z exclude : définit les valeurs de x à ne pas inclure dans les
niveaux.
z ordered : argument logique spécifiant si les niveaux du
facteur sont ordonnés.
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Facteur

Facteur

Exemple

> fac <- c("a", "a", "b", "a", "b")

> fac # à ce stade, fac n’est pas un facteur
[1] "a" "a" "b" "a" "b"
> fac <- factor(fac)# on le convertit en facteur
> fac # la gestion est alors diff\’erente!
[1] a a b a b
Levels: a b
> levels(fac) # lister les niveaux du facteur
[1] "a" "b"
> nlevels(fac) # nombre de niveaux du facteur
[1] 2
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Facteur

Facteur

Exemple

>factor(1:3)
[1] 1 2 3
Levels: 1 2 3
>factor(1:3, levels = 1:5)
[1] 1 2 3
Levels: 1 2 3 4 5
> factor(1:3,levels=1:5,
labels=c("A","B","C","D","E"))
[1] A B C
Levels: A B C D E
>factor(c(5,7,8,9), levels=5 :8)
[1] 5 7 8 <NA>
Levels : 5 6 7 8
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Facteur

Facteur

z 9 ne fait pas partie des levels (ensemble de définition).

z Le chiffre 9 est donc codé comme valeur manquante.
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Facteur

Facteur

Exemple
10 personnes ont répondu à une enquête de satisfaction
auto-administrée.
Le degré de satisfaction est recueilli à partir d’une variable
comportant les 4 modalités suivantes :
1 très satisfait
2 satisfait
3 insatisfait
4 pas du tout satisfait
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Facteur

Facteur

Exemple (suite)
Voici les réponses des répondants : 1 1 2 3 1 0 4 2 3 4.
Définissez un facteur dans R pour coder ces réponses.

factor(c(1,1,2,3,1,0,4,2,3,4),levels=1:4)
[1] 1 1 2 3 1 <NA>4 2 3 4
Levels: 1 2 3 4

z La réponse 0 ne fait pas partie du domaine de définition.

z Elle est codée comme valeur manquante < NA >.
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Matrice

Matrice

Définition
Une matrice est un tableau constitué de valeurs toutes du
même type : des nombres, des caractères, etc.
Chaque valeur est indexée par son numéro de ligne et de
colonne.
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Matrice

Matrice

Exemple

> M <- matrix(c(1,2,3,4), ncol=2)

> M # afficher la matrice
[,1] [,2]
[1,] 1 3
[2,] 2 4
> M[1,2] # la valeur en ligne 1 et colonne 2
[1] 3
> M[ ,1] # le contenu de toute la colonne 1
[1] 1 2
> M[2, ] # le contenu de toute la ligne 2
[1] 2 4
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Matrice

Matrice

Remarque
z Une matrice est un vecteur qui possède un argument
supplémentaire qui définit les dimensions de la matrice.
z Tous les éléments d’une matrice doivent être de même
mode.
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Matrice

Comment saisir une matrice

matrix(data=NA,nrow=1,ncol=1,byrow=FALSE,dimnames=NULL)

z data : les données

z nrow : permet de donner le nombre de lignes
z ncol : permet de donner le nombre de colonnes
z byrow : indique si les valeurs données par data doivent
remplir successivement les colonnes (FALSE, par défaut)
ou les lignes (si TRUE).
z dimnames : permet de donner des noms aux lignes et
colonnes.
z colnames() : permet de donner des noms aux colonnes
z rownames() : permet de donner des noms aux lignes
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Matrice

Matrice

Exemple

matrix(0, 5, 7)
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7]
[1,] 0 0 0 0 0 0 0
[2,] 0 0 0 0 0 0 0
[3,] 0 0 0 0 0 0 0
[4,] 0 0 0 0 0 0 0
[5,] 0 0 0 0 0 0 0
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Matrice

Matrice

Exemple

>x = 1:20
> x
[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
[13] 13 14 15 16 17 18 19 20

>mat1 = matrix(x, 4, 5)
> mat1
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 1 5 9 13 17
[2,] 2 6 10 14 18
[3,] 3 7 11 15 19
[4,] 4 8 12 16 20
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Matrice

Matrice

Exemple

>mat2 = matrix(x, 4, 5, byrow = TRUE)

> mat2
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 1 2 3 4 5
[2,] 6 7 8 9 10
[3,] 11 12 13 14 15
[4,] 16 17 18 19 20
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Matrice

Matrice - fonction paste()

z La fonction paste() est utile dans une situation où on

souhaite nommer les lignes et / ou les colonnes d’une
matrice.
z La fonction paste() permet aussi de concaténer des objets.
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Matrice

Matrice

Exemple

> nom_var = paste("V", 1:5, sep = "")

> nom_var
[1] "V1" "V2" "V3" "V4" "V5"

Exemple

> nom_ind = paste("I", 1:4, sep = "")

> nom_ind
[1] "I1" "I2" "I3" "I4"
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Matrice

Matrice

Exemple

> colnames(mat2) = nom_var

> rownames(mat2) = nom_ind
ou bien
> dimnames(mat2)=list(nom_ind, nom_var)

> mat2
V1 V2 V3 V4 V5
I1 1 2 3 4 5
I2 6 7 8 9 10
I3 11 12 13 14 15
I4 16 17 18 19 20
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Liste

Liste

Définition
Une liste est un objet indexé très général permettant de stocker
des informations de type potentiellement différent.

Remarque
z le premier élément peut être un nombre,
z le deuxième un caractère,
z le troisième une matrice, etc.
Les éléments qui compose une liste
z ne sont pas nécessairement du même mode
z ne sont pas nécessairement de la même longueur.
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Liste

Liste

z Pour créer une liste, on utilise la commande list()

z Pour accéder au k ème élément d’une liste nommé L, on
utilise une notation en double crochet : L[[k ]].
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Liste

Liste

Exemple

> a = c(1, 2, 3, 4, 5)
> b = c("a", "b", "c")
> liste1 = list(a, b)
> liste1
[[1]]
[1] 1 2 3 4 5
[[2]]
[1] "a" "b" "c"
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Liste

On peut nommer les éléments d’une liste de la manière suivante

Exemple
> names(liste1) = c("L1", "L2") ;
> liste1
$L1
[1] 1 2 3 4 5
$L2
[1] "a" "b" "c"
> liste2 = list(L1 = a, L2 = b)
> liste2
$L1
[1] 1 2 3 4 5
$L2
[1] "a" "b" "c"
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Data frame

Data frame

z Un tableau de données est créé de façon implicite par la

fonction [Link].
z Il s’agit d’un tableau de données à n lignes (1 ligne = 1
individu) et p colonnes (1 colonne = 1 variable).
z Il peut y avoir des variables de différents types (des
facteurs, des variables numériques, etc.).
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Data frame

Data frame

Définition
Un data frame est le format par défaut donné par R aux jeux
de données que l’on importe depuis un tableur.

z On peut créer un tableau de données avec la fonction

[Link].
z Tous les éléments de la [Link] doivent être de la
même longueur.
z Dans le cas contraire, l’élément le plus court est recyclé un
nombre entier de fois.
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Data frame

Data frame

z Comme dans le cas des matrices, chaque valeur est

repérée par son numéro de ligne et de colonne.
z Si le data frame s’appelle df, la commande df[2,3] permet
d’accéder à la valeur du 2ème individu et de la 3ème variable.
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Data frame

Créer un Objet à partir d’un autre

Pour créer un Objet à partir d’un autre, on utilise les fonctions

suivantes :
[Link],
[Link],
[Link],
[Link], etc.
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Data frame

Vecteur 2 Facteur

Pour créer un facteur à partir d’un vecteur, on utilise la fonction

suivante : [Link], on procède de la manière suivante :
Exemple

> x <- c(1,2,1,2,2)

>x
[1] 1 2 1 2 2
> x <- [Link](x)
>x
[1] 1 2 1 2 2
Levels: 1 2
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Data frame

Vecteur 2 [Link]

Pour créer une [Link] à partir d’un vecteur numérique et

d’un vecteur caractère, on procède de la manière suivante :
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Data frame

Data frame

Exemple
> X= c(1, 2, 3) ; X ; mode(X);
[1] 1 2 3
[1] "numeric"

> Y= c("a", "b", "c") ; Y ; mode(Y)

[1] "a" "b" "c"
[1] "character"

> df = [Link](X,Y)
> df
X Y
1 1 a
2 2 b
3 3 c
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Data frame

Data frame

Pour créer avec une seule instruction une [Link] avec une
variable numérique et une variable caractère :
Exemple
> df2 = [Link](A = 1:6, B = letters[1:6]);
> df2
A B
1 1 a
2 2 b
3 3 c
4 4 d
5 5 e
6 6 f
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Data frame

Data frame

Si on juxtapose un vecteur de longueur 6 et un vecteur de

longueur 3, le deuxième vecteur est dupliqué :
Exemple

> A = c(1, 2, 3, 4, 5, 6)
> B = c("a", "b", "c")
> df = [Link](a, b)
>df
A B
1 1 a
2 2 b
3 3 c
4 4 d
5 5 e
6 6 f
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Data frame

Data frame

Il faut donc que la longueur de l’un des vecteurs soit un multiple

de la longueur de l’autre vecteur :
Exemple

>A = c(1, 2, 3, 4, 5)
>B = c("a", "b", "c")
>df = [Link](A, B)
Error in [Link](a, b) :
arguments imply differing number of rows: 5, 3
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Plan du chapitre

1 Généralités sur le logiciel R

2 Les objets R

3 Manipulation d’Objets R
Conversion de modes
Manipulation d’un vecteur
Manipulation d’un data frame
Importer des fichies de données
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Conversion de modes

Conversion de modes

le type d’un objet est une caractéristique "flottante",

modifiable.
Il existe des fonctions pour convertir un objet vers un
nouveau type (sans en modifier le contenu), afin qu’il soit
traité différemment.
Dans de nombreuses situations pratiques, il est utile de
convertir le mode d’un objet en un autre.
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Conversion de modes

Conversion de modes

Une telle conversion sera possible grâce à une fonction de la

forme :
[Link]
[Link],
[Link],
[Link]
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Exemples

Conversion de modes

Convertir des objets de mode logical en mode numeric

Exemple

> logique = c(FALSE, FALSE, TRUE, TRUE,

FALSE, TRUE)
conversion_numerique = [Link](logique)
conversion_numerique
[1] 0 0 1 1 0 1
Généralités sur le logiciel R Les objets R Manipulation d’Objets R

Exemples

Conversion de mode

Convertir des objets de mode character en mode numeric

Exemple

>caractere =c("1", "2","3", "A", "/", "T","%")

conversion_numerique = [Link](caractere)
>Warning message:
NAs introduced by coercion
conversion_numerique
[1] 1 2 3 NA NA NA NA
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Exemples

Conversion de mode

Convertir des objets de mode numeric en mode logical

Exemple

>numerique = 0:5
>conversion_logique1 = [Link](numerique)
>conversion_logique1
[1] FALSE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE
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Exemples

Conversion de mode

Convertir des objets de mode character en mode logical

Exemple

> caractere = c("FALSE","TRUE","F","T","false",

+ "t","A","(")
> conversion_logique2 = [Link](caractere)
> conversion_logique2
[1] FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE NA NA NA
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Exemples

Conversion de mode

Convertir des objets de mode numeric en mode character

Exemple

numerique = 1:8
conversion_caractere1 = [Link](numerique)
conversion_caractere1
[1] "1" "2" "3" "4" "5" "6" "7" "8"
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Exemples

Conversion de mode

Convertir des objets de mode logical en mode character

Exemple

logique = c(TRUE, FALSE)

conversion_caractere2 = [Link](logique)
conversion_caractere2
[1] "TRUE" "FALSE"
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Manipulation d’un vecteur

Manipulation d’un vecteur

Quelques commandes élémentaires à utiliser sur des vecteurs

numériques :
Exemple

> x<- c(10,12,8,10) # ex.: des notes sur 20

>x
[1] 10 12 8 10
> mean(x) # calculer la moyenne de x
[1] 10
> length(x) # nb de valeurs dans x
[1] 4
> max(x) # maximum de x
[1] 12
> x/2 # les memes notes sur 10
[1] 5 6 4 5
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Manipulation d’un vecteur

Manipulation d’un vecteur

Exemple (suite)

> x<- c(12,14,9,10.5) # ex.: des notes sur 20

> y <-c(8.5,14)# on saisit deux nouvelles notes
> z <- c(x,y)# z = regoupe celle de x et y
> z # afficher z
[1] 12.0 14.0 9.0 10.5 8.5 14.0
> c(y,x) # attention à l’ordre :
+ c(x,y) est diferent de c(y,x)!
[1] 8.5 14.0 12.0 14.0 9.0 10.5
> z[2:4] # 1:3 est un raccourci pour c(2,3,4)
[1] 14.0 9.0 10.5
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Manipulation d’un vecteur

Manipulation d’un vecteur

Exemple (suite)

> z[-2] # afficher tous les elements de z

+ sauf le numero 2
[1] 12.0 9.0 10.5 8.5 14.0
> sort(z) # tri croissant de z
[1] 8.5 9.0 10.5 12.0 14.0 14.0
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Manipulation d’un vecteur

Manipulation d’un vecteur

On peut attribuer des noms à chaque valeur de z :

Exemple (suite)

> names(z) <- c("Ali","Med.","Ismail","Hajar",

+ "Youssef","Marwa")
> z
Ali Med. Ismail Hajar Youssef Marwa
12.0 14.0 9.0 10.5 8.5 14.0
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Manipulation d’un vecteur

Manipulation d’un vecteur

On peut alors accéder aux valeurs par leur nom plutôt que leur
index :
Exemple (suite)

> z["Ismail"]
Ismail
11
> z["Ismail"] <- 11 # changer la note d’Ismail
> z # afficher la s\’erie de notes corrig\’ee
Ali Med. Ismail Hajar Youssef Marwa
12.0 14.0 11.0 10.5 8.5 14.0
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Manipulation d’un data frame

Manipulation d’un data frame

Chaque feuille de données importée dans R se verra

attribuer la class [Link].
Il est donc essentiel de savoir manipuler de tels [Link]
puisqu’ils seront à la base de toute pratique de R.
Nous allons voir les principales fonctions à connaître pour
cette classe d’objets, et surtout, la façon d’importer un data
frame dans R !
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Manipulation d’un data frame

Répertoire courant

Définition
Le répertoire courant d’une session R est le répertoire où le
logiciel ira chercher les feuilles de données, sauvegarder les
résultats, figures, etc.

Il est donc essentiel qu’il soit correctement défini, à chaque fois

que l’on ouvre le logiciel.
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Manipulation d’un data frame

Répertoire courant

X Sous Windows : aller dans Fichier > Changer le répertoire

courant.
X Sous Linux : il suffit tout simplement d’ouvrir une console
directement dans le répertoire où l’on souhaite travailler.
X Sous Mac OS : icône Divers > Changer de répertoire de
travail.
X Tous OS : utiliser la commande setwd() dans la console
R.
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Manipulation d’un data frame

Mise en forme des données

Important :
Utiliser R implique de respecter les conventions usuelles de
mise en forme des feuilles de données, faute de quoi il sera
impossible de les charger !
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Manipulation d’un data frame

Mise en forme des données

1 Pour éviter les soucis, texte brut uniquement (.txt, .csv) :

jamais de .xls ou .ods, encore moins de .xsl.
2 Aucune mise en forme autorisée ;
fusion de cellules interdite ;
les informations ne sont indiquées que par du texte,
jamais par de la mise en forme ou des couleurs.
3 Une ligne correspond à un individu
4 Une colonne correspond à une variable
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Manipulation d’un data frame

Mise en forme des données

1 Doublons interdits dans les noms des individus.

2 Noms de variables courts et sans espaces (utiliser des
underscores à la place)
3 Jamais de ligne ou de colonne vide ou aérer ou séparer.
4 Certains caractères spéciaux sont interdits : #, guillemets,
apostrophes,
5 Autres caractères spéciaux (accents, espaces, lettres
grecques) fortement déconseillés pour éviter les
problèmes d’encodage.
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Manipulation d’un data frame

Mise en forme des données

1 Les données manquantes s’indiquent de préférence par

une case vide, ou sinon par un codage unique qui sera
spécifié au logiciel est : NA (Not Available).
2 Pas de case vide si les données sont connues.
3 Séparateur décimal : point ou virgule, unique pour tout le
jeu de données.
4 Utiliser la fonction "Commentaire" de votre tableur pour
toute information qui n’a rien à voir avec le traitement
statistique.
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Manipulation d’un data frame

Mise en forme des données

Conclusion :
Penser à vérifier minutieusement les données avant toute
analyse.
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Importer des fichies de données

Importer une feuille de donnée

La commande générale à utiliser est [Link], ou plus

spécifiquement [Link] ou read.csv2 pour les fichiers CSV.
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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

1 Lancer l’application ( Excell sous Microsof où OpenOffice

sous Mac)
2 Saisir les données (si vous n’avez pas les données)
3 Enregistrer les données sous le nom TPR en format CSV
dans le dossier Documents :
Fichier ? Enregistrer sous.
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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

1 Lancer le logiciel R.
2 Choisir comme directoire de travail le dossier dans lequel
le fichier [Link] a été enregistré : Documents (Changer
le repertoire courant si vous voulez)
3 Vérifier que le fichier que l’on souhaite importer se trouve
bien dans le réepertoire de travail :
> dir()
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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

1 Importer les données du fichier [Link] en inscrivant

dans la console de R la commande :
> data <- [Link](file="[Link]")
2 Vérifier que l’importation s’est déroulée correctement :
> data
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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

Exemple
Après avoir défini correctement le répertoire courant, exécuter
la commande :

> dat <- [Link]("data_TPR.csv", header=TRUE, row.n

sep=";", dec=",", [Link]="")

Le jeu de données correspondant au fichier

"data_TPR.csv"

sera désormais stocké dans l’objet R dat.

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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

Pour des détails à propos de chaque argument de la

commande, consulter l’aide de la fonction [Link].
Remarque

la commande [Link] convient par défaut aux fichiers en

norme anglaise (séparateur de colonnes = virgule, séparateur
décimal = point), tandis que la commande read.csv2 convient
par défaut aux fichiers en norme française (séparateur de
colonnes = point-virgule, séparateur décimal = virgule).
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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

Si le fichier est en norme française, la simple commande :

> dat <- read.csv2("data_TPR.csv", [Link]="")

suffit à le charger correctement.

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Marche à suivre

Importer une feuille de donnée

SI le fichier est en norme anglaise, la simple commande :

> dat <- read.csv2("data_TPR.csv2", [Link]="")

suffit à le charger correctement.