Ecologie, adaptation et évolution

moléculaire

EAEBL3

Dr. Liliane Boukhdoud

 Chapitre 1
Qu’est ce que l’écologie?
Origine du mot “Ecologie”

“Eco” = “oikos” = maison, milieu, habitat

“Logie” = “logos” = étude, science, connaissance

« Ecologie : Science de l’habitat »

Le terme ‘œcologie” fut introduit en 1866 par le biologiste

allemand Ernst Haeckel

Ecologie: Etude des relations et des interactions entre les

organismes et leur environnement.
Environnement

L’environnement est l’entourage d’un organisme, y compris d’autres organismes et les

facteurs physiques (température, eau, sol…)

abiotique
Environnement
biotique
Environnement abiotique:
- Les facteurs physiques

Facteurs climatiques: humidité, température, lumière…

Facteurs édaphiques: propriétés physico-chimiques du
sol
Facteurs topographiques: altitude, exposition…

Environnement biotique:
- Les facteurs biologiques
(animaux, végétaux, bactéries, champignons et
autres organismes vivants…)
Définition de l’écologie

L’écologie est la science qui étudie les conditions d’existence des êtres vivants et
les interactions de toutes sortes qui existent entre ces êtres vivants, d’une part, entre
ces êtres vivants et le milieu, d’autre part.

animaux

plante
Niveaux écologiques

Les écologistes ont organisé les interactions en différents niveaux

Niveaux écologiques
Niveaux écologiques

Organisme ou individu:
Le niveau le plus simple

Population:
Un ensemble d’individus appartenant à une même espèce
et vivant dans un endroit donné

Communauté:
Un assemblage de populations appartenant à des espèces
différentes.
Populations qui vivent et interagissent dans une région à
un moment particulier.

Communauté = [Link] l’espèce (a) + pop. l’espèce (b) +

pop. de l’espèce (c) + pop. de l’espèce (d) …….
Niveaux écologiques
Ecosystème:

Il s'agit d'un ensemble d'être vivants qui vivent au sein d'un milieu ou d'un
environnement spécifique et interagissent entre eux au sein de ce milieu et avec
ce milieu.

C’est l’interaction des populations d’une communauté dans une région donnée et
avec les facteurs abiotiques de cette région.

Unité écologique fonctionnelle douée d’une certaine stabilité, constituée par un

ensemble d’organismes vivants exploitant un milieu naturel déterminé.

Les écosystèmes avec une biodiversité plus importante sont souvent plus stables
et présentent une plus grande résistance et résilience face aux perturbations.

Biome:

Une vaste zone géographique caractérisée par un ensemble d’espèces végétales et

animales spécifiques.

L’ensemble des biomes constitue la biosphère

Niveaux écologiques

Les biomes
Niveaux écologiques

Biosphère

L'ensemble des organismes vivants et leurs milieux de vie

Le plus haut niveau d’organisation

3 compartiments :

- La lithosphère
- L’hydrosphère
- L’atmosphère
Niveaux écologiques

Les subdivisions du monde vivant

Définitions des termes en écologie

Autoécologie: étude de l’écologie d'une espèce précise, elle étudie les organismes
individuels ou espèces individuelles (aspects morphologiques, physiologiques et
comportementaux des réactions d’un organisme aux conditions de son milieu).

Démécologie: dynamique des populations, étude scientifique de populations d’individus,

leurs interactions et leurs réponses à leur environnement.

Variation de la taille de la population en fonction des conditions environnementales.

Taille (↑ naissance, immigration et ↓ décès, émigration), ȃge, densité, dispersion..
La croissance exponentielle est l'augmentation de la taille de la population lorsque les
ressources sont abondantes et illimitées.
La croissance logistique se produit lorsque l'augmentation de la taille de la population
est influencée par les ressources limitées de l'environnement.

croissance exponentielle croissance logistique

Définitions des termes en écologie

Grands mais rares

Progéniture faible

Petits mais nombreux

Progéniture nombreuse
Définitions des termes en écologie

Synécologie: étude des interactions entre des espèces multiples dans un même
milieu.

Etude scientifique de groupes d’espèces qui vivent ensemble dans un endroit

particulier.

Les écologistes s’intéressent à étudier la composition d’une communauté et de sa

structure, les interactions prédateurs/proies, la compétition...

Ecosystémologie: étude scientifique de groupes d’espèces qui vivent ensemble dans

un endroit particulier et l’influence des facteurs abiotiques sur leur vie…

Les résultats des études à ce niveau incluent le flux d’énergie, les réseaux
trophiques, le cycle des nutriments…

Ecosystème = Biocénose + Biotope

les etre vivant
Définitions des termes en écologie

Biocénose

Ensemble des êtres vivants qui peuplent un écosystème donné, vivant dans des
conditions de milieu déterminées et unis par des liens d’interdépendance.
Zoocénose et Phytocénose

Synusie: ensemble
d’organismes réunis
occasionnellement dans un but
défini temporaire.

Biotope
l’habitat
Territoire occupé par une biocénose. C’est l’ensemble des facteurs physiques, chimiques
et climatiques constituant l’environnement de cette biocénose.

C’est la composante non-vivante d’un écosystème et renfermant des ressources

suffisantes pour assurer le développement et le maintien d’une communauté d’êtres
vivants.
Définitions des termes en écologie

Ecosystème = Biocénose + Biotope

Définitions des termes en écologie
Les subdivisions du monde vivant et leurs disciplines scientifiques

Biologie cellulaire Cellule

& moléculaire

Individu
Autoécologie

Population
Démécologie

Synécologie Communauté

Ecosystémologie Ecosystème

Écologie du Paysage
paysage

Biosphère
Écologie Ecosphère
globale
Habitat et territoire

L’habitat d’un organisme est l’environnement physique où un organisme est

trouvé, il fournit de nombreuses niches. maniere global de vie de organsime

Les limites du territoire sont soit marquées par des:

- signes olfactifs (urine des souris)
- signes acoustiques (chant des oiseaux)
- signes visuels (excréments)

Aire qu’un individu se réserve soit pour se nourrir soit pour s’y accoupler.
Niche écologique la fonction d’une communaute

Le rôle qu’une espèce joue dans une communauté

La position qu’une espèce occupe dans son environnement, comprenant les

conditions dans lesquelles elle est trouvée, les ressources qu’elle utilise et le temps
qu’elle y passe.

La manière globale de la vie de l’organisme

Ex: le renard: omnivore, plutôt nocturne, …

Un créneau est déterminé par les limites de

tolérance d'un organisme, ou d’un facteur limitant
(tout facteur biotique ou abiotique qui limite
l'existence d'organismes dans un environnement
spécifique).
Niche écologique

Une niche fondamentale et une niche réalisée sont deux types de positions
environnementales dans un écosystème pouvant être occupées par une espèce particulière.

Niche fondamentale
Sans compétition, cas idéal…
Tout ce que l'organisme pourrait éventuellement
faire dans un environnement libre de compétition.

Niche réalisée infectee par des facteur

Lorsque l’espèce de la niche fondamentale doit faire
face à diverses interactions et pressions de Niche fondamentale
l’environnement → une petite niche, la niche réalisée.
Prédation
Tout ce que l'organisme fait après que la compétition le Niche Compétition
réalisée Parasitisme
limite.
Avec compétition,
Sous-ensemble de la niche fondamentale
 Composants de l’écosystème

Composants de l’écosystème

Composants Composants
abiotiques biotiques

Substances Substances
Producteurs Consommateurs Décomposeurs
organiques: inorganiques:
Protéines, lipides CO₂, H₂O,
… NaCl…
Composants de l’écosystème
1- Producteurs elle peut synthétiser sa matiere
Organismes autotrophes organic

Plantes Algues Cyanobactéries

2- Consommateurs
Organismes hétérotrophes (herbivores, carnivores, omnivores)

3- Décomposeurs
Décomposent la matière morte dérivée des producteurs et des consommateurs en
nutriments et en molécules simples.
Ils restituent au milieu les éléments minéraux.
Ils libèrent les éléments nutritifs à l'environnement (sol, eau, air) qui peuvent être
réutilisés de nouveau par les producteurs.
Composants de l’écosystème

Organisme autotrophes:
Ont la capacité de faire leur propre nourriture en utilisant des substances
inorganiques pour produire des molécules organiques.

Les consommateurs:
Ne peuvent pas faire leur propre nourriture.
Obtiennent de l'énergie en consommant d'autres organismes.

Les décomposeurs:
Décomposent les déchets et les organismes morts pour retourner les matières
premières à l'environnement.
Composants de l’écosystème
Les différents composants de l'écosystème sont
liés les uns aux autres par deux procédés
principaux:

- Flux énergétique
- Cycle nutritif dans l'écosystème

La Terre est comparable à un vaisseau

spatial: il y a une quantité fixe de la
matière qui doit nous soutenir pendant
un très long voyage!

Par conséquent, toute molécule d'eau

donnée, atome d'azote, de carbone,
d'oxygène, ou tout autre élément
essentiel doit être réutilisé plusieurs
fois, il doit être recyclé.
Au sein des écosystèmes, la matière et l'énergie sont conservées.
L'énergie circule dans le système, tandis que la matière est recyclée.
Cycle de l’eau
Cycle de l’eau

Evaporation: transformation de l'eau

d’un liquide en un gaz, un processus
qui humidifie l'atmosphère.

Evapotranspiration: transfert d'eau

dans l'atmosphère par les plantes et
les animaux.

Précipitation: transfert d'eau de

l'atmosphère vers la terre.

Infiltration: L'eau pénètre dans le

sol et s'écoule vers le bas jusqu'à ce
qu'elle rencontre une roche
imperméable, puis se déplace
latéralement.

Ruissellement: les rivières, les lacs

et les ruisseaux transportent l'eau de
la terre vers les océans.
Cycle du carbone

Les principaux processus biochimiques se déroulant lors du cycle du carbone

sont: la photosynthèse, la respiration, la décomposition et la fermentation, la
déforestation et les feux de forêt
Cycle du carbone

L’ensemble des échanges de carbone sur la planète.

Ce cycle se déroule entre les quatre principaux réservoirs de carbone:

1. dioxyde de carbone (CO₂) dans l'atmosphère

2. les composés de carbone organique dans les organismes
3. carbone dissous dans les masses d’eau
4. composés de carbone à l'intérieur de la terre
Cycle de l’azote

L’air est composé est le principal réservoir d'azote (N₂)

Tous les organismes ont besoin d’azote pour fabriquer des protéines et des
acides nucléiques, mais la plupart ne peuvent utiliser la molécule N₂ sous
cette forme.

→ Azote fixée comme par exemple NH₃ ou NO₃⁻.

Cycle de l’azote
Cycle de l’azote
Composants de l’écosystème

Aucune espèce n’est capable de capturer

l’énergie et en même temps recycler les
éléments nutritifs.

Les êtres vivants se regroupent toujours

en communautés comprenant des espèces
qui remplissent les différentes fonctions
nécessaires pour le recyclage de la matière
à travers un réseau trophique.
Chaîne alimentaire

Une chaîne alimentaire est une suite d’êtres

vivants dans laquelle chacun se nourrit de celui
qui le précède.

Montre le flux d'énergie d'un organisme à

l'autre à travers chaque niveau trophique.
Niveau trophique

L’énergie passe d’un organisme à l’autre à travers des relations trophique dans un
écosystème.

Niveau trophique: chaque étape dans le transfert de l’énergie dans une communauté.

Le niveau trophique représente

une étape d’alimentation dans le
transfert de l’énergie et de la
matière dans un écosystème.
Chaîne alimentaire
Composants de l’écosystème
Réseau trophique

Le réseau trophique : une représentation de toutes les chaînes trophiques

interconnectées dans un écosystème.
Il décrit l'ensemble des chaînes trophiques présentes dans un écosystème
déterminé.

Il montre tous les chemins possibles que peut prendre l'énergie dans un écosystème et
également comment les organismes sont dépendants les uns des autres dans l'écosystème.

Le réseau alimentaire est composé de

nombreuses chaînes alimentaires qui se
chevauchent dans un écosystème.

Ex: Wolves
Yellowstone park
Réseau trophique
Réseau trophique

Combien de chaînes alimentaires pouvez-vous identifier dans ce réseau alimentaire?

Mixotrophie

Orchidée
Mixotrophie

[Link]
Energie

En écologie, le flux d'énergie caractérise le transfert énergétique entre les organismes

du réseau trophique, ou les échanges réalisés d'un écosystème à un autre.

Les êtres vivants ont besoin d'un apport constant en énergie par l'assimilation des
nutriments ou d'un apport direct en énergie.

Les organismes vivants peuvent utiliser l'énergie sous deux formes:

- L'énergie rayonnante ou radiante: ex. la lumière.

- L'énergie fixée: énergie chimique potentielle liée à diverses substances organiques

qui peuvent être décomposées pour libérer leur contenu énergétique.
Photosynthèse

Le soleil: source ultime d’énergie sur terre

Au fond des océans, la lumière solaire est absente.

Comment quelques organismes y vivant se procurent l’énergie nécessaire à leur survie?

Chimiosynthèse
Les bactéries chimiosynthétiques utilisent des minéraux organiques (CH₄, H2S, H2,)
comme source d’énergie pour la synthèse des molécules organiques

Cheminées noires Riftia, vers tubicoles

Les Riftias sont très courants Des bactéries vivent en symbiose à l'intérieur de
autour des fumeurs noirs. leur corps.
Ces bactéries se nourrissent du soufre du fumeur
noir, puis les bactéries à leur tour nourrissent le ver.
Photosynthèse et chimiosynthèse

Quelle est la difference entre la photosynthèse et la chimiosynthèse?

Pyramides écologiques

Une pyramide est utilisée pour illustrer la structure des niveaux trophiques
dans une chaîne alimentaire.

Trois types de pyramides écologiques:

1. Pyramide des nombres

2. Pyramide de la biomasse

3. Pyramide énergétique
Pyramide des nombres

Pyramide des nombres: nombre d’individus à chaque niveau trophique.

Pyramide de la biomasse

Pyramide de la biomasse

La biomasse désigne la masse totale d'organismes vivants par unité de

surface (ou de volume) dans un biotope déterminé à un moment
donné.

Une pyramide de biomasse illustre la masse

totale des tissus vivants (= biomasse) à
chaque niveau trophique.

Elle représente la quantité de matière vivante

dans une chaîne alimentaire donc le poids sec
total des organismes dans une chaîne
alimentaire.

Masse / surface (g/m²)

Pyramide de la biomasse
 Pyramide d’énergie transfert d’energie d’un niveau a un autre

Quand un organisme mange, il obtient de l'énergie, puis il utilise beaucoup d'énergie dans
les processus vitaux comme la croissance et le mouvement.

Cela signifie que seule une partie de leur énergie est disponible pour l'organisme suivant
dans le réseau trophique.

Une pyramide d’énergie permet de

visualiser la déperdition d’énergie en
passant d’un niveau trophique à un
autre.

L’énergie n’est pas recyclable

comme la biomasse, elle se perd
mais elle est renouvelable.

l’energie au niveau de producteur est plus grand que le consomateur

Pyramide d’énergie

La plus grande quantité d'énergie est disponible au niveau des producteurs.

La moindre quantité d'énergie disponible est sur le sommet de la chaîne alimentaire.

Seulement environ 10% de l'énergie du niveau trophique est transféré au niveau

suivant.

(Kcal / m2 / year)
Pyramide d’énergie pour les sources de Springs, Floride. L’énergie est exprimée en kilocalories/ m2/ an.

Quelles sont les causes de pertes d’énergie de l’écosystème?

Pyramides écologiques
Productivité d’un écosystème

En écologie, la productivité est la vitesse à laquelle l’énergie est assimilée par des
organismes sous forme de biomasse.

La biomasse est simplement la quantité de matière stockée au sein d'un groupe

d'organismes.

La productivité peut être définie pour n'importe quel niveau trophique ou pour un autre
groupe et elle peut s'exprimer en unités d'énergie ou de biomasse. Il existe deux types
de productivité : brute et nette.
Productivité primaire premiere forme

Les plantes vertes fixent l'énergie solaire et l'accumulent sous forme organique
comme énergie chimique.

Comme c’est la première et la forme basique de stockage d'énergie, la vitesse à

laquelle l'énergie s’accumule dans les plantes vertes ou dans les producteurs est
appelée la productivité primaire.

La productivité primaire est le taux avec lequel l'énergie est lié ou la matière
organique est créé par photosynthèse par unité de surface terrestre par unité de
temps.

Exprimée en énergie en calories/cm²/an ou en matière organique sèche en g/m²/an

elle est au niveau des producteur

les plantes
Productivité primaire

La production primaire brute (PPB) est la quantité d'énergie solaire qui est
assimilée dans des molécules de sucre au cours de la photosynthèse.

Les producteurs comme les plantes utilisent une partie de cette énergie pour leur
métabolisme (respiration cellulaire) et leur croissance (construction de tissus).

La production primaire nette (PPN) correspond à la différence entre la production

primaire brute et l'énergie perdue dans le métabolisme et la maintenance.

En d'autres termes, c'est la quantité d'énergie fixée sous forme de biomasse par les
plantes ou les autres producteurs primaires et mise à disposition des consommateurs
de l'écosystème.

Productivité nette de l'énergie = productivité brute - énergie perdue dans la respiration

Productivité primaire

La productivité primaire représente donc la quantité d’énergie disponible pour les

consommateurs de premier ordre.

Plusieurs facteurs peuvent faire varier la productivité primaire d’un écosystème.

- La quantité de lumière

- La quantité d’eau disponible

- L’accès aux nutriments essentiels pour les producteurs
- La température..
Productivité primaire

Tourbière Marais à roseaux

2 à 10 t de matière sèche/ha/an 25 t de matière sèche/ha/an

Forêt de hêtres Forêt de pin sylvestre

8 à 13 t de matière sèche/ha/an 6,5 t de matière sèche/ha/an
Productivité secondaire
Productivité secondaire

Mesure de la productivité secondaire

Production secondaire brute (PSB ou GSP):

- Mesurer la masse de l'apport alimentaire (A) par un organisme (mieux si le régime

est contrôlé en laboratoire).

- Mesurer la masse des déchets (D) (excréments, excrétion, etc.) produite.

PSB = A – D

Production secondaire nette (PSN):

- Mesurer la masse initiale de l'organisme (Mi) et la masse finale (Mf) durant

l'expérience.

PSN = Mi-Mf

→ PSN=PSB-Respiration
Exercice

Dans une expérience visant à estimer le transfert d'énergie des producteurs aux
consommateurs primaires, un élève a placé une pousse de chou dans un récipient
aéré avec 15 larves.

Avant d'assembler le récipient, la masse des pousses de chou et la masse des larves
a été prise:

La masse des pousses de chou = 40 g et la masse des 15 larves = 0,3 g.

Après 4 jours, les masses ont été de nouveau mesurées en plus les matières fécales
excrétées par les larves ont également été pesés.

La masse des pousses de chou = 13 g et la masse des 15 Larves = 2 g

La masse des matières fécales des 15 larves = 0.8 g.

Calculer la productivité brute, la productivité nette et la respiration des larves

en g/larve/jour?
Ecotone

Un écotone est une zone de transition écologique entre deux écosystèmes.

Interface entre 2 écosystèmes voisins présentant une identité suffisamment

différente pour se différencier entre eux et ayant un fonctionnement écologique
particulier.

Ces zones de transition se forment sous l'action de différentes variables physiques et

environnementales (topographie, composition et la structure du sol, présence de
différents types d’animaux, végétaux..)
Ecotone
Ecotone

Cette zone de transition est parfois indispensable à la survie de certaines espèces.

Ecotope

Les écotopes sont des subdivisions qui se rencontrent dans un même écosystème
de grandes superficies.

Ces subdivisions dépendent des facteurs physiques de l’écosystème telle que le relief
ou l’exposition.

Ubac/Adret