Matériel génétique Chromosome unique dans le cytoplasme, ADN bicaténaire circulaire + histones

Cytoplasme Dépourvu de RE/Golgi/mitochondries, riche en inclusions/ARN/ribosomes (30S/50S)

Membrane Bicouche PL + prot, rôles : scissiparité (mésosome), semi-perméable (gradient osmotique, régulation métabolique),
respiration (phosphorylation oxydative)
Obligatoire

Paroi Peptidoglycane, rôle de morphologie, résistance pression/enzymes, antigénicité…

- GP : polysaccharides superposés, unis par ponts protéiques, solidifiés par acide teichoïque, ancrés à la membrane
par acide lipoteichoïque -> forme réticulée régulé par transpeptidase située dans l’espace périplasmique (entre
membrane et paroi)
- GN : fine couche peptidoglycane + enveloppe externe trilamellaire faite de porines, PL et LPS (grosse molécule
thermostable = fragment protéique + lipide A endotoxine pyrogène + polyoside O Ag)
Capsule Enveloppe inconstante polysaccharidique parfois protéique (Bacillus anthracis/Charbon), MEE par encre de Chine,
facteur de virulence anti phagocytaire, antigénicité (Ag K)
Glycocalyx Structure réticulée = feutrage de fibres polysaccharidiques, rôle d’adhésion (strep sur plaque dentaire) et
(biofilm) protection contre dessiccation/phagocytose/ATB/antiseptiques…
Flagelle/cil Structure protéique (flagelline) rigide et ondulée, fixée à la membrane plasmique, rôle de mobilité et antigénicité
(Ag H)
Facultative

Pili Prolongements protéiques (piline) sur la surface des GN surtout :

- Communs : petits, très nombreux, rôle d’adhésion, adsorption et virulence
- Sexuels : plus longs, moins nombreux, codés par facteur F du plasmide, rôle de conjugaison = amarrage et
transmission info génétique -> résistances
Plasmide ADN bicaténaire circulaire extra-chromosomique autonome (Ori C), rôle de transfert de gènes de
résistance/virulence par transformation, transduction ou conjugaison
Spore Forme de repos (métabolisme limité) de certaines bactéries GP (Anthracis) : résistance aux conditions défavorables
(dessiccation, chaleur, pH acide, agents chimiques…)
Méthodes d’étude :
Optique frais : forme et mobilité (intérêt suspicion Pseudomonas nosocomiale)
Optique après coloration : Gram pour bactéries à parois, ZN pour mycobactéries (dépourvues de paroi)
- Gram : GP en violet (paroi épaisse) et GN en rose : 1ère étape coloration violet gentiane, 2ème décoloration à l’alcool,
3ème contre-coloration fuchsine
- Ziehl-Nielsen : spécifique aux mycobactéries qui sont BAAR, 1ère étape coloration fuchsine, 2ème décoloration à
l’acide puis l’alcool, 3ème contre-coloration bleu méthylène
Electronique : ultrastructure : éléments obligatoires et facultatifs
Structure :
Physio : nutrition et croissance :
- Besoins C : autotrophe (CO2) ou hétérotrophe (composé organique)
- Besoins spécifiques (AA, bases, vitamines…) : auxotrophes = exigeantes (H.I -> facteurs V et X) ou prototrophes =
non exigeantes (E. Coli)
- Température optimale : psychrophiles 0-20° (Pseudomonas, Acinetobacter, Listéria, BK), mésophiles 20-40°,
thermophiles 45-65° (clostridium)
- pH : neutre ou légèrement alcalin 7-7,5 (exception E. Coli 4.4-8, Vibrio cholerae 9)
- Pression partielle d’O2 : aérobies strictes (Mycobactéries, Pseudomonas, Bordetella, Brucella, Legionella, Neisseria),
µaérophile (Campylobacter, HP), aéro-anaérobie facultative (CGN oxydase +), anaérobies aérotolérants (CGP
oxydase -), anaérobie stricte (clostridium, bacille tétanique)
- Stérilisation : par autoclave à 120° par vapeur d’eau pdt 20 min
Génétique : multiplication par scissiparité, variations :
Mutation : changement ADN chromosome ou plasmide spontané (ou provoqué), rare, discontinu (brusque = tout ou
rien), stable (transmissible par hérédité), spécifique (n’affecte qu’un seul caractère)
Transfert/recombinaison :
- Transformation : transfert passif partiel et limité (qlq GP et GN) d’ADN à une B en compétence sans contact direct
- Conjugaison : transfert partiel spécifique des BGN par contact (pili) d’ADN d’une B mâle F+ à une femelle F-
- Transduction/conversion : transfert par intermédiaire de virus bactériophage (lytique ou lysogénique) soit
généralisé (n’importe quel gène), ou restreint (toujours le même gène), ou abortif (gène transféré mais pas intégré)
ou lysogénique (génome du bactériophage qui s’intègre)
- Transposons : séquence d’ADN capable de se déplacer dans un même génome (gène sauteur)
- Intégrons : régions capables de perdre/recevoir des gènes mobiles = cassettes (système de capture des GN)
 Naturelle Acquise
β-lact - Modification cible : mycobactéries (pas de - Modification cible : SARM (mutation gène mec A = PLP -> PLP2a), pneumo
paroi) (péni-A et C3G), méningo (péni-A)
- ↘ perméabilité : BGN (porines étroites) - ↘ perméabilité : pseudomonas (imipenème)
- Synthèse enzymes : nombreuse souche de - Synthèse enzyme : staph (péni-G), gono, HI, entérobactérie, pseudomonas
staph, entérobactéries, Klebsiella - Efflux actif : pseudomonas (péni-A même avec AC)
Augmentin - ↘ perméabilité + synthèse enzymes :
pseudomonas
Aminoside - ↘ perméabilité (pas de transporteurs - Modification cible : synthèse nouvelle s/u 30S
actifs) : anaérobies comme strep pyogenes - Synthèse enzyme : plasmidique (rarement par mutation -> R croisée)
entérocoque et entérobactéries et staph multi-R (BLSE)
Macrolide - ↘ perméabilité : BGN comme E. Coli - Modification cible : plasmidique (rarement mutation -> R croisé aux MLS)
staph, pneumo, strep A/B/C (ARN ribosomal altéré par méthylase)
Cyclines - ↘ perméabilité : plasmidique chez presque toutes BGN, staph/strep
- Efflux actif : E. Coli
Glycopeptides - ↘ perméabilité : BGN (porines étroites) - ↘ perméabilité : mutation chez entérocoque et staph, ou transfert gène R
(vanco) comme HI de l’entérocoque au staph
Quinolones - Modification cible : mutation chez BGN et staph (ADN gyrase)
- Efflux actif : staph aureus
Phénicolés - Modification cible : mutation s/u 50S rare
- ↘ perméabilité
- Synthèse enzyme : plasmidique chez bacille d’Eberth (typhoïde)
Sulfamides - Modification cible : plasmidique ou mutation
- ↘ perméabilité : plasmidique ou mutation
- Synthèse enzyme : plasmidique chez Neisseria
GP GN
Catalase + Catalase - Neisseria : diplocoques en grain
Staph : aéro-anaérobie Strep : anaérobie aérotolérant Entéro : aéro- de café, aérobie strict, isolés en
facultatif anaérobie facultatif milieu sg cuit enrichi en facteurs
Aureus : en amas, immobile, SBHA Pneumo Diplocoque ou de croissance (Vit C) :
coagulase +, TSST-1, culture Chainettes, fragile, Diplocoque, fragile courte chainette, - Méningo : maltose +, moins
C possible en milieu hypersalé, exigeant, pyogène, exigeant, aspect γhémolytique, Ag D fragile, Ag capsulaires
entérotoxines thermostables βhémolysines O (Ag) flamme bougie, A/B/C/Y/W135,
(A-F), exfoliatine (A/B) anti et S (non Ag), αhémolytique, - Gono : maltose -, fragile
desmogléine 1, hyaluronidase, sensible optochine, exigeante
βhémolysines, hyaluronidase, kinase, DNase, toxine pas d’Ag diffusible,
kinase, DNase… érythrogène isolé en milieu
(scarlatine)… enrichi au sg + CO2
Résistance ATB : soit naturelle à transmission verticale ou acquise plus fréquemment (plasmidique 80% à
transmission horizontale ou mutation 20% au hasard à transmission verticale) par 4 mécanismes : modification cible,
↘ perméabilité, synthèse enzymes, efflux actif ATB
Classification :
GP GN
- Listeria : petite chainette ou amas, non Oxydase - Oxydase +
capsulée, aéro-anaérobie facultatif, esculine +, Entérobactéries : aéro- - Pseudomonas : pyocyanique, aérobie stricte, non
non exigeante, résistante aux T° ↘ (mobile à anaérobies facultatifs, Ag exigeante, mobile, Ag O, endotoxine (lipide A),
20° immobile à 37°), saprophyte ubiquitaire commun ECA, O (LPS), H pigments, saprophyte de la nature, infection noso
- Corynebacterium : palissades, non capsulée, (flagelle), K (capsule) - Vibrio cholerae : batônnets, aéro-anaérobies
B aéro-anaérobie facultatifs, exigeante, exotoxine - Pathogènes strictes : facultatifs, non exigeante, mobiles, Ag O (sérotypes O1
diphtérique salmonelle (Ag Vi), shigelle, et O139)
- Bacillus Anthracis (charbon) et Cereus yersinia - HP et Campylobacter : micro-aérophiles exigeants
- Clostridium sporule (botulisme, tétanos, - Opportunistes : E. Coli mobiles
perfringens, difficile) (non exigeante), Klebsiella, - HACEK
- Tropheryma whipplei Proteus… - Coccobacilles : Bordetella, Brucella, Legionella,
Pasteurella, Coxiella (Q), Haemophilus (HI, Ducreyi)
- Spirochète : tréponème (non cultivable non colorables au Gram), borréliose (Lyme), leptospirose