‫جامعة محمد بوضياف المسيلة‬

UNIVERSITE MOHAMED BOUDIAF DE M’SILA

‫كلية العلوم‬
FACULTÉ DES SCIENCES
DÉPARTEMENT DE SIENCE DE LA NATURE ET DE LA VIE

FILIÈRE
ÉCOLOGIE ET ENVIRONNEMENT

Module

Méthodes d’études et d’inventaires

des peuplements (MEIP)

Option : écologie des milieux naturels (EMN)

1er année Master LMD S1
Volume horaire globale (VHG) : 90h (Cours +TD+ TP)

Réalisé par :
SARRI Djamel

Année 2021

0
Intitulé du Master : Ecologie des milieux naturels
Semestre : S1
Intitulé de l’UE : Fondamentale
Intitulé de la matière : Méthodes d’études et d’inventaires des peuplements
Crédits : 8
Coefficients : 4

Objectifs de l’enseignement
Permettre à l’étudiant d’acquérir les notions de bases d’échantillonnage des grandes formations
végétales d’Algérie.

Connaissances préalables recommandées

Notions de biologie végétale des phanérogames
Contenu de la matière :
- Le pré-modèle
- Méthodes d’étude (reptiles, avifaune aquatique, amphibiens…)
-Techniques d’échantillonnage (Unité minimale d’échantillonnage,
échantillonnage aléatoire simple, échantillonnage systématique,
échantillonnage stratifié, autres types d’échantillonnage et échantillonnage
des populations animales).
- Collecte et analyse des données faunistiques (Présentation des données,
applications des différentes méthodes pour l’estimation des densité,
traitements statistiques des données et application des méthodes
multivariées par l’identification des groupements d’espèces).

Mode d’évaluation :
Références sera faite aux textes des L.M.D. portant organisation sur les dites modalités.
L’importance à accorder à chaque parcours est indéniablement liée à la spécialité et à
l’importance des valeurs horaires dispensées.

Références (Livres et polycopiés, sites Internet, etc).

1. Lamotte J. et Bourliere A. (1969) Problèmes d’écologie: l’échantillonnage des peuplements

animaux des milieux terrestres. Masson. 151p.
2. Legendre L. et Legendre P. (1979) Ecologie numérique: la structure des données écologiques
Tome 2. Masson. 255 p.
3. Frontier S. Pichod-Viale D. (1998). Structure, fonctionnement et évolution des écosystèmes.
Edition Lavoisier. 419p.
4. Siri E. (1973). L’étang : sa faune et sa flore. Edition Boubée. 198p.
5. Blondel J. (1995). Biogéographie : approche écologique et évolutive. Edition Masson. 297p.
6. Elhaï H. (1968). Biogéographie. Edition Armand Colin. 408p.

Etablissement : Mohamed Boudiaf -M’sila Intitulé du master : Ecologie des milieux naturels Page 22
Année universitaire : 2016/2017

1
 Sommaire du cours
Avant-
Propos………………………………………………………………………………..9
But du
module………………………………………………………………………………9
Introduction……………………………………………………………………………
……10
CHAPITRE 1 – STRATÉGIE
ÉCHANTILLONNAGE…………………………………10.
1.1 - Pré-
modèle………………………………………………………………………………10
1.1.1 - Définition du
problème……………………………………………………………..…11
1.1.2 - Nécessité de
l'échantillonnage………………………………………………………...11
1.1.3 - Bute de
l'échantillonnage……………………………………………………………...11
1.1.4 - Condition d'un échantillonnage
correct……………………………………………….12
1.1.5 - Type
d'échantillons……………………………………………………………………12
1.1.6 - Choix des espèces à prendre en
considération………………………………………...12
1.1.7 - Choix de la quantité à
mesurer………………………………………………………..13
1.1.8 - Type
d'échantillonnage………………………………………………………………..13
1.2.1 - Echantillonnage qualitatif (Stratégies d’échantillonnage)
…………………………….13
[Link] - Échantillonnage
probabiliste………………………………………………………..14
[Link].1 - Echantillonnage
systématique…………………………………………………….14

2
a - Dispositif
Devries…………………………………………………………………………14
b - Dispositif linéaires (Parker 1951, 1954 et Long 1958)
……………………………………15
c - Dispositif des points
quadra……………………………………………………………….16
d - Dispositif des points
alignés………………………………………………………………17
[Link].2 - Echantillonnage au hasard (aléatoire)
……………………………………………..17
[Link].3 - Echantillonnage
stratifié…………………………………………………………..19
[Link].4 - Analyse
exhaustive………………………………………………………………..23
a - Grilles ou bandes de placettes contiguës (Greig-Smith 1952)
…………………………….23
b - Lignes de segments
contigus……………………………………………………………...23
c - Ordination des individus le long d'une ligne ou d'une
bande……………………………..23
[Link].5 - Echantillonnage
mixte…………………………………………………………….24
[Link] - Echantillonnage subjectif (non probabiliste)
………………………………………..24
1.2.2 - Echantillonnage quantitatif
…………………………………………………………...24
[Link] - Analyse
linaires……………………………………………………………………..24
[Link].1- Principe de l’analyse
linaires………………………………………………………24
[Link].2 - Matériel utilisé et recommandations...
…………………………………………….25

3
[Link].3 - Choix de la
station………………………………………………………………...25
[Link].4 - Précaution à prendre pour
l’installation…………………………………………...26
[Link].5 - la disposition des
lignes…………………………………………………………...26
[Link].6 - Enregistrement des
renseignements……………………………………………….27
[Link].7 - Exécution des
observations……………………………………………………….27
[Link].8 -
Hiérarchisation……………………………………………………………………28
[Link] - Point
quadra…………………………………………………………………………29
1.2.3 - Autres types
d’échantillonnage………………………………………………………..30
[Link] - Echantillonnage par la méthode des
quotas…………………………………………30
[Link] - Les quotas et l'aspect
mathématique………………………………………………...30
CHAPITRE 2 - LA VÉGÉTATION ET LE
MILIEU…………………...…31
2.1 - Matériel
végétal………………………………………………………………………....31
2.1.1 - Complexité des rapports espèces –
milieu……………………………………………32
2.1.2 - Limite de la variabilité écologique des
espèces………………………………………………..32
2.2 - Le
milieu………………………………………………………………………………...32
2.2.1 -
Définition……………………………………………………………………………...3
2

4
2.2.2 - Espèces indicatrices et facteurs
actifs…………………………………………………33
2.3 - Structure et Homogénéité des
peuplements……………………………………………..34
2.3.1 - Structure d'un
peuplement…………………………………………………………….34
[Link] -
Définition…………………………………………………………………………....34
[Link] - Physionomie ……………………….
……………………………………………….34
[Link].1 - La
forêt…………………………………………………………………………….34
[Link].2 -
Matorral……………………………………………………………………….......35
[Link].3 - La
pelouse…………………………………………………………………………35
[Link] -
Stratification………………………………………………………………………...35
[Link].1 - Structure verticale (stratification)………….
…………………………………...…35
a - La notion de la
stratification………………………………………………………………35
b - Le
recouvrement…………………………………………………………………………..3
6
[Link].2 - Structure horizontale
……………………………………………………..............36
a - L'abondance -
dominance……………………………………………………………..…..37
b - La sociabilité…………...
……………………………………………………………….…37
c - Vitalité et
périodicité………………………………………………………………………38

5
d - Types biologiques (forme biologiques)…………...
………………………………………38
e- Définition des Types biologique…………..
………………………………………………39
f - Le spectre biologique…………...
…………………………………………………………41
h - L'influence de l'Homme……………………………………………………...
……………41
2.3.2 – définition de l'homogénéité des peuplements…..
…………………………………….42
[Link] - Histogramme et courbe de
fréquences………………………………………………42
[Link] - La courbe aire espèce et l'aire
minimale…………………………………………….44
[Link] - Exemple d'aire
minimale……………………………………………………………45
CHAPITRE 3 - CLASSIFICATION DES TYPES DE
VEGETATION…...46
3.1 - Méthodes
physionomiques……………………………………………………………...47
3.1.1 –
Définition……………………………………………………………………………..4
7
3.1.2 - Les grandes formations végétales
forestières…………………………………………48
3.1.3 - Critique de la
méthode……………………………………………………………….. 48
3.2 - Méthode phvtosociologique de Braun-
Blanquet………………………………………..49
3.2.1 - La reconnaissance
préliminaire……………………………………………………….49
3.2.2 - Réalisation des
relevés………………………………………………………………..49

6
3.2.3 - Comparaison des relevés (méthodes des tableaux)
…………………………………...50
[Link] - Tableau
brute………………………………………………………………………..50
[Link] - Tableau de
présence…………………………………………………………………51
[Link] - Tableau
partiel………………………………………………………………………51
[Link] - Tableau partiel
ordonné……………………………………………………………..52
[Link] - Tableau différentiel
définitif………………………………………………………..52
[Link] - Remarques sur la méthode des
tableaux……………………………………………53
3.2.4 - Concept d'association
végétal…………………………………………………………54
3.2.5 - Critère de
classification……………………………………………………………….54
[Link]- Espèces
caractéristiques……………………………………………………………..54
[Link] - La
fidélité……………………………………………………………………………54
a- Les espèces
caractéristiques………………………………………………………………..55
b- Les espèces
transgressives…………………………………………………………………55
c- Les espèces
différentielles…………………………………………………………………55
d- Les
campagnes……………………………………………………………………………..5
5
3.2.6 - Hiérarchisation des
associations………………………………………………………55

7
[Link] - Syntaxons
supérieurs………………………………………………………………..55
[Link] - Syntaxons
inférieur…………………………………………………………………56
[Link] - Les autres variantes de
l'association………………………………………………..57
3.3 - Méthode
phytoécologique………………………………………………………………57
3.3.1 - Relevés
phytoécologiques…………………………………………………………….58
3.3.2 - Relevé floristique
……………………………………………………………………..58
3.3.3 - Formulaire d'inventaire de la végétation (relevé donnée de Godron 1983)
…………...58
3.3.4 - Récapitulation sur les données
écologiques…………………………………………..59
3.4 - Méthodes
dynamique……………………………………………………………………59
CHAPITRE 4 - TRAITEMENT DES DONNEES DE
VEGETAUX……….60
4.1 - Méthodes simples (les Analyses différentielles)
………………………………………..60
4.1.1- Analyse différentielle de Czekanowski (1909)
………………………………………..60
4.1.2 - Méthode de
dendrite…………………………………………………………………..62
4.1.3 - Analyse des associations
interspécifiques……………………………………………62
4.2 - Analyse multivariable (multidimensionnelle)
………………………………………….63
4.2.1- Classification
hiérarchique……………………………………………………………63
4.2.2 - Analyse factorielle des

8
correspondances……………………………………………..64
4.2.3 - Exemple d’Analyse factorielle des
correspondances…………………………………65
4.2.4 - Signification écologique des axes
factoriels…………………………………………..68
4.2.5 - Groupes écologique et espèces indicatrices (Analyse fréquentielle)
………………….68
[Link]- Notion de groupes
écologiques………………………………………………………68
[Link].1 - Conception sociologique (Duvigneau 1946)
……………………………………...68
[Link].2 - Conception
autoécologique……………………………………………………….69
[Link].3 - Ensemble
écologique……………………………………………………………...69
[Link].4 - Remarque sur ces trois
méthodes…………………………………………………69
[Link] - Notion d'espèces
indicatrices………………………………………………………..70
[Link].1 - Difficultés
théoriques……………………………………………………………...70
[Link].2 -
Définitions………………………………………………………………………..70
a- Facteurs écologiques d'après Gounot (1969)
………………………………………………71
b- Classe d'intensité d'un
facteur……………………………………………………………...71
c- Espèces
indicatrices………………………………………………………………………..71
d- Domaine
écologique……………………………………………………………………….72
e- Facteurs discriminants et seuils
écologiques………………………………………………72

9
[Link] - Définition et obtention des profils
écologiques……………………………………..72
[Link].1 - Définition du découpage des facteurs en
classes……………………………………73
[Link].2 - Profil
brut…………………………………………………………………………73
a- Profil
d'ensemble………………………………………………………………………..…73
b- Profil de fréquences
absolues……………………………………………………………...74
[Link].3 - Profil
élaboré……………………………………………………………………...74
a- Profil de fréquences
relatives………………………………………………………………74
b- Profils des fréquences corrigés (profils des indices de fréquences corrigées)
……………..75
c- Profils des fréquences
pondérés……………………………………………………………76
d- Obtention des profils
pondérés…………………………………………………………….76
e - Représentation graphique (schématique)
………………………………………………….77
f- Profils
combinés……………………………………………………………………………78
[Link] - Groupes écologiques statistiques (Gounot 1959)
…………………………………...78
4.3 - Approche phytoécologique (formulaire d'inventaire de la végétation)
…………………79
CHAPITRE 5 - METHODES D'ECHANTILLONNAGE DE LA
FAUNE.80
5.1- Méthodes d'échantillonnage des
Arthropodes…………………………………………...81
5.1.1 - Position systématique des

10
Arthropodes……………………………………………….81
5.1.2 - Caractéristique des
Arthropodes………………………………………………………81
5.1.3 - Méthodes d’étude ou d’échantillonnage des Arthropodes………………….
…………83
[Link] - Classification des
méthodes…………………………………………………………83
[Link] - Exemple d’étude (l'analyse des peuplements d'Araignées)
…………………………84
[Link].1 - La chasse à
vue……………………………………………………………………84
[Link].2 - Le carré de
ramassage……………………………………………………………..84
[Link].3 - Les prélèvent de
rameaux…………………………………………………………85
[Link].4 - Le
battage………………………………………………………………………….85
[Link].5 - Le piégeage au
sol………………………………………………………………...86
5.2 - Méthodes d'échantillonnage des
Oiseaux……………………………………………….86
5.2.1- Les principales méthodes de
dénombrement…………………………………………..86
[Link] - Méthodes de recensement (ou Méthodes absolues)
…………………………………87
[Link].1 - Les comptages au sol et
aériens…………………………………………………...88
a- Conseils
d’utilisation……………………………………………………………………….88
b - Quelques
contraintes………………………………………………………………………88
[Link].2 - La méthode des plans
quadrillés…………………………………………………. 88

11
a-
Principe…………………………………………………………………………………
….89
b-
Déroulement……………………………………………………………………………
….89
[Link] - Méthodes de sondage, (ou méthodes relatives)
…………………………………….89
[Link].1 - L'indice kilométrique d'abondance (I.K.A.)
………………………………………89
[Link].2 - Variantes : les lignes
transects……………………………………………………90
[Link].3 - L’indice ponctuel d’abondance (I.P.A.)
…………………………………………..90
[Link].4 - La méthode des Echantillonnages Fréquenciels Progressifs (E.F.P.)
……………..90
[Link].5 - Avantage des E.F.P sur les
I.P.A………………………………………………….91
[Link].6 - Le programme
STOC……………………………………………………………..91
5.2.2 - Les raison et finalité principal pour dénombrer les oiseaux d’un espace
donné……...91
5.3 - Méthodes d'échantillonnage des
mammifères…………………………………………..92
5.3.1 - Principes déontologiques et
juridiques………………………………………………..93
5.3.2 - Matériel et préparation d’une campagne de recensement…………………………
93
5.3.3 - Echantillonnage des petits mammifères (Bennun et al. 2002)………………...
……...94
[Link] - Recensement des chauves-souris dans leur aire de
repos…………………………..95
[Link] - Capture (ou Piégeage) des animaux

12
vivants………………………………………..95
[Link].1 - Les chauves-
souris………………………………………………………………...95
[Link].2 - Rongeurs et
insectivore……………………………………………………………96
[Link].3 - Analyse des
données………………………………………………………………96
[Link].4 - Autre technique de recensement des petits
mammifères………………………….97
5.3.4 - Echantillonnage des grands et moyens mammifères (Bennun et al. 2002)...
…………98
[Link] -
Biologie……………………………………………………………………………...98
[Link] - Généralité sur les méthodes de
recensements…………………………………………99
[Link] - Identification des espèces
………………………………………………………..99
[Link] - Cris d’appel des chasseurs, attractifs et postes
d’observation……………………..101
[Link].1- Sélection de sites et de
matériel………………………………………………101
[Link].2 -
Procédure………………………………………………………………………..102
[Link].3 - Enregistrement des
données……………………………………………………..102
5.4 - Reptiles (Classe des Reptilia)
………………………………………………………….103
5.4.1 -
Biologie………………………………………………………………………………
103
5.4.2 - Méthode d’inventaire (Enquêtes génériques)
…………………………………………104
5.4.3 -

13
Matériel………………………………………………………………………………
104
5.4.4 -
Identification…………………………………………………………………………
105
5.4.5 - Sélection du site et
procédure………………………………………………………..105
5.5 - Amphibiens (Classe des Amphibia)
…………………………………………………...105
5.5.1 -
Biologie………………………………………………………………………………
105
5.5.2 - Méthode
d’inventaire…………………………………………………………………….106
5.5.3 -
Identification…………………………………………………………………………
106
5.5.4 - Sélection du site et
procédure………………………………………………………..106
5.5.5 - Echantillonnage et inventaire des amphibiens dans les
mares………………………107
[Link] - Description du
site…………………………………………………………………107
5.5.6 - Autres techniques d’inventaire des amphibiens et des
reptiles……………………...107
5.5.7 - Enregistrement des données pour les reptiles et les
amphibiens…………………….109
5.5.8 - Exemple de Formulaire d’Enregistrement des captures de
herptiles………………...110
5.6 - Dénombrement des oiseaux d’eaux (avifaune aquatique)
…………………………….111
5.6.1 - Difficultés des observations et de
dénombrement…………………………………...111

14
Conclusion
générale……………………………………………………………..................112
Bibliographie…………………………………………………………………………
…….113

15
 Avant-Propos

Ce cours provient de l'ancien module dit Méthode d'Étude et d'Inventaire des

Populations Végétales et Animales (MEIP). Ce cours est destiné aux étudiants de 1ere
année Master, Filière: SNV Option : écologie des milieux naturelle.
Il présente des difficultés de compréhension, elles sont dues au but, aux notions
abstraites, à la terminologie utilisée et aux divergences des écoles. Cela ne signifie pas
que ce module est difficile à comprendre, si l'étudiant suit avec attention les cours, les
TD, les TP (sortie de terrain) et consulte les documents traitant ce module, il ne
trouvera pas de problème pour comprendre ce dernier. Malgré ces difficultés, il est
d'une utilité importante, car sa compréhension et son application permet de
comprendre le comportement et le fonctionnement des végétaux et des animaux dans
leur milieu.
L’effort demandé à l'étudiant est immense surtout dans le système LMD où les
lacunes de connaissance sont à combler avec la consultation d'une documentation
surtout numérique assez accessible de nos jours.
Ce cours est appelé à être amélioré avec des séances de travaux pratique et
surtout une sortie scientifique sur terrain pour une imprégnation des étudiants

But du module
Les scientifiques essayés toujours de comprendre les phénomènes qui gèrent le
fonctionnement des végétaux et la vie des annimaux en créant des méthodes et
techniques d'études. Ces méthodes et techniques (généralement se sont les
investigations sur terrain et les techniques statistiques) prennent en considération
certains facteurs dont les plus importants sont : la structure du végétal en
communauté, son homogénéité et le milieu et la vie sociale des animaux. Nous avons
à connaître quelque importante méthodes et techniques qui ont été créés et utilisées
depuis le jour ou l'homme a commencé à se préoccuper de la présence des végétaux et
des animaux autour de lui. Elles se sont succédé au fil des temps de manière à ce que
la nouvelle complète et corrige l'ancienne.

16
Introduction
L'objectif de l'échantillonnage est de connaître les propriétés d'une population
à partir de l'analyse d'une fraction de celle-ci. Cette pratique est née de l'impossibilité
de procéder, pour des raisons de coûts et de temps, à des recensements exhaustifs des
caractéristiques d'une population, à commencer par sa taille ! On ne cherche pas à
connaître, en général, les valeurs de la (les) caractéristique(s) sur tous les éléments de
la population, mais plutôt à inférer (en termes statistiques) ou à «prédire» et
«extrapoler» (en termes courants) une fonction de ces valeurs, à partir d'un
échantillon, donc d'un sous-ensemble de ces valeurs. Bien évidemment, comme on
examine seulement une partie de la population, la prédiction sera entachée d'une
erreur due au fait que l'on échantillonne. Elle est appelée erreur d'échantillonnage et
c'est elle qu'on cherche à minimiser en choisissant le plan de sondage le plus pertinent
pour obtenir la meilleure prédiction possible.

17