INTRODUCTION GÉNÉRALE
1. Définitions de métabolisme :
= ensemble des transformations chimiques de matière et d’énergie se déroulant dans les
systèmes vivants, nécessaire pour la vie, le développement…etc de la cellule.
- Ensemble => complexité, nombre, organisation, compartimentation, coherence, regulation
- Transformation chimiques => respecte les règles de la thermodynamique, réactivité des
molecules
- Systèmes vivants => avec des spécificité : catalyse (enzymes), systèmes hétérogènes,
systèmes ThD ouverts (hors équilibre/adaptation permanente), thermodynamique
Les conditions réelles de la cellule ne sont pas celles du tube a essai (in vivo / in vitro).
- Conditions du tube a essai : milieu homogène, solution idéales, système ferme, evolution vers
l'équilibre ThD
- Conditions réelle de la cellule : très hétérogène, solution non idéale, système ouvert,
déséquilibre permanent
2. Différents types trophiques :
Classification métabolique des
organismes selon leur source
d’énergie et de carbone.
On s’intéressera au
chimiohétérotrophe dans ce
cours.
L’énergie solaire est la principale source
d’énergie pour la vie. Le flic d’énergie dans la
biosphere est couplé aux cycles du carbone
et de l’oxygène.
3. Organisation générale du métabolisme carbone chez les chimiohétérotrophes :
- Catabolismes = Dégradation de macromolécules
- Anabolisme = Synthèse des macromolécules
Ces deux mécanismes sont dependants et nécessitent des systèmes de regulation. Que ce soit
dans l’un ou l’autre, on de l’énergie qui sera stockée et de l’énergie qui sera rejetée sous forme de
chaleur.
L’énergie doit être extraite de molecules « carburants ».
Ce carburants est dans la cellule sous forme de nutriments, combiné a de l’oxygène.
4. Le catabolisme :
Les atomes de carbone réduits sont
p ro g re s s i v e m e n t o x y d e s l o r s d u
catabolisme.
Lors de l’oxydation biologique du glucose, on récupérera de l’enneige dans des molecules
organiques = « Molécules batteries », et on va perdre de l’énergie sous forme de chaleur.
Il y a cependant différents états
d’oxydation des molecules.
Le catabolisme est un processus oxydatif.
Il y aura un flux d’electrons dans le métabolisme, prix en charges par les coenzymes qui vont se
réduire et vont permettre un transports d’electrons qui lui permettra de fournir de l’ATP a la cellule
et d’alimenter certaines reactions.
5. Organisation générale du métabolisme carboné chez les chimiohétérotrophes :
La matière organique est la source de carbone et d’énergie :
Le métabolisme, est compose de sequences métaboliques, de successions de reactions
chimiques, catalysées pour la plupart par une enzymes. Il existe plus d’un milliers de reactions
mais avec de nombreux motifs communs, et un nombre limité de types de reactions (6 grandes
classes de reactions).