Table des matières
Introduction...........................................................................................................1
Chapitre 1 : Étude bibliographique
1. L’appareil urinaire
1.1 Définition et fonction
1.2 Les éléments constituant l’appareil urinaire
1.2.1 Haut appareil urinaire
[Link] Les reins
[Link] Uretère
1.2.2 Appareil urinaire bas
[Link] La vessie
[Link] L’urètre
1.3 Les urines
1.3.1 Formation de l’urine
[Link] Filtration glomérulaire ou ultrafiltration
[Link] Réabsorption sélective
[Link] Sécrétion tubulaire
1.3.2 Urine normale et anormale
2. Les infections urinaires
2.1 Définitions
2.2 Classification des infections urinaires
2.2.1 Bactériurie asymptomatique
2.2.2 Infections urinaires aiguës non compliquées
2.2.3 Infections urinaires compliquées
2.2.4 Infections récurrentes des voies urinaires
2.3 Les types d’infection urinaire
2.3.1 Les infections du bas appareil urinaire
[Link] La cystite
[Link] La prostatite
2.3.2 Les infections du haut appareil urinaire
[Link] La pyélonéphrite
3. Facteurs favorisants l’apparition des infections urinaires
3.1 Facteurs liés aux bactéries
3.1.1 Virulence bactérienne
[Link] Facteurs d'adhésion
[Link] Flagellation
[Link] Lipopolysaccharide (LPS)
[Link] Toxines
[Link] Biofilm
[Link] Systèmes de sidérophores
3.2 Facteurs liés à l’hôte
3.2.1 Chez les deux sexes
3.2.2 Chez la femme
3.2.3 Chez l’homme
4. Les germes responsables des infections urinaires
4.1 Les bacilles à Gram négatifs
4.1.1 Les entérobactéries
[Link] Escherichia coli
[Link] Citrobacter
[Link] Klebsiella
[Link] Enterobacter
[Link] Serratia
[Link] Proteus, Morganella, Providencia
4.2 Autres germes
4.2.1 Les bacilles à Gram négatif
4.2.2 Les bacilles à Gram positif
4.2.3 Les cocci à Gram positif
Chapitre 2 : Matériels et méthodes
1. Prélèvement
2. Manipulation
2.1 Etude biochimique
2.1.1 Mode d’utilisation
2.2 Examen macroscopique des urines
2.3 Examen cytobactériologique des urines
2.3.1 Examen cytologique
- Examen qualitatif
- Examen quantitatif « Dénombrement »
2.3.2 Examen bactériologique
- Ensemencement des urines
- Dénombrement, observation des cultures et différentiation des colonies
- Identification bactérienne
- Tests d’orientation
- La galerie d’identification biochimique
- Antibiogramme
Chapitre 3 : Résultats et discussion
1. Étude biochimique
2. Examen macroscopique des urines
3. Examen cytobactériologique des urines
3.1 Examen cytologique
Examen qualitatif
Examen quantitatif
3.2 Examen bactériologique
3.3 Identification bactérienne
Tests d’orientation
La galerie d’identification biochimique
3.4 Résultat et interprétation de l’antibiogramme
4. Résultats épidémiologiques
4.1 Répartition des résultats selon les cas positifs, négatifs et contaminés
4.2 Répartition des infections urinaires selon le sexe
4.3 Répartition des espèces bactériennes selon le Gram
4.4 Répartition des souches bactériennes isolées
4.5 Répartition d’E. coli selon la résistance aux antibiotiques
4.6 Répartition de Pseudomonas aeruginosa selon la résistance aux antibiotiques
4.7 Répartition de Klebsiella pneumoniae selon la résistance aux antibiotiques
4.8 Répartition de Streptococcus spp. selon la résistance aux antibiotiques
Conclusion...........................................................................................................52
Références bibliographiques...............................................................................53
Annexes