INTRODUCTION
La biochimie est l’étude de corrélation entre la structure des molécules biologiques et les
conséquences sur leur activité. Elle permet de comprendre selon quels "processus chimiques"
fonctionnent les organismes vivants, des plus simples jusqu'aux plus complexes.
La biochimie s'intéresse en particulier aux structures, aux fonctions et aux interactions
des macromolécules biologiques.
Particulièrement la biochimie structurale étudie la composition atomique précise des
molécules biologiques, les quatre classes principales de ces molécules , sont : les glucides,
les lipides, les acides aminés et les protéines.
Les structures et les propriétés de ces molécules sont abordées dans des chapitres distingués,
ce qui devrait permettre d’intégrer de façon plus aisée la diversité des molécules du vivant.
Après chaque chapitre, nous proposons des exercices avec des corrigés détailles.
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Chapitre I : LES GLUCIDES
Objectifs
• Connaître les familles des glucides.
• Maîtriser la représentation de Fischer des sucres.
• Connaître les différentes formes d’isoméries liées aux sucres.
• Maîtriser la représentation cyclique des oses selon Haworth.
1. Définition
Ce sont des molécules organiques dont les carbones sont porteurs :
- de fonctions alcools
- d’une fonction aldéhyde ou cétonique (fonction carbonylique)
- parfois d’une fonction acide ou aminée.
2. Classification des glucides
En se basant sur les critères de classification des glucides, on peut distinguer deux principales
classes : les oses et les osides.
Glucides
Oses Osides
Sucres simples (monosaccharides): sucres complexes (polysaccharides)
Ce sont des molécules dont l’hydrolyse
Unités simples non hydrolisable. fournit 2 ou plusieurs molécules d’oses ces
sont des hydrates de Carbones, oses sont identiques (Holosides) ou
différents (Hétérosides).
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Les osides
Holosides Hétérosides
Oligosides Polyosides Ils donnent par
hydrolyse
Oligosaccharides Polysaccharides X oses+aglycone (partie
2≤x≤10 unités non glucidique)
Homopolyosides Hétéropolyosides
Un seul type d’oses Plusieurs types
3. Structure linéaire des oses (la représentation de Fischer)
C’est une représentation en deux dimensions dont les liaisons sont projetées sur un même
plan. Le C* se situe dans le plan de la feuille, la chaine carbonée la plus longue est verticale et
les liaisons sont orientées en dessous du plan de la feuille, les autres substituants non carbonés
du C* sont placés à l’horizontale et les liaisons sont orientés vers le dessus du plan de la
feuille.
Cette représentation est formée à partir du D-Glycéraldéhyde, par l’addition successive des
atomes de carbones.
Triose → Tétrose → Pentose → Hexose
3C 4C 5C 6C
3.1. La série D et L des oses
En général, on parle de la configuration du OH porté par le C* le plus éloigné de la
fonction réductrice (aldéhyde ou cétone) qui détermine la configuration D ou L. Si
l’hydroxyle (OH) est situé à droite du plan de la chaîne carbonée, c’est la configuration D,
s’il est à gauche on parle donc de la configuration L.
La majorité des oses naturels sont de la série D.
D- glycéraldéhyde L- glycéraldéhyde
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3.2. Filiation des aldoses
3.3. Filiation des cétoses
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3.4. Les isomères
Deux molécules sont dite isomères si elles ont la même formule brute, mais la formule
développé, semi- développé et la représentation spatiale différente.
3.4.1. Enantiomère
Sont deux molécules qui sont images en miroir l’une de l’autre, comme le sont les deux
mains, on parle de la série D et L.
3.4.2. Diastéréo-isomères
Représentent le cas des composés qui ont au moins 2 carbones asymétriques, ils sont des
stéréo-isomées qui ne sont pas énantiomères. Exemple : le D-glucose et le D-gulose (car ils
différent par la configuration de 2 sur 4 de leurs C*).
3.4.3. Les épimères
Deux épimères sont deux isomères ne différant que par la configuration absolue d'un seul et
même C*. Exemple le D-glucose et le D-mannose (épimères en C2)
3.4.4. Les isomères de fonctions
Ont la même formule brute, mais des propriétés physiques et chimiques différentes.
Exemple : le D-Glucose et le D-fructose.
4. Structure cyclique des oses : structure de Haworth
- Le cycle est formé par une liaison dans la molécule d’ose entre la fonction carbonylique
(aldéhyde ou cétone) et un OH alcoolique = liaison hémiacétalique.
- La fonction aldéhyde ou cétonique de l’ose, partiellement dissimulée, est appelée
pseudoaldéhydique ou pseudocétonique.
- L’anomère α a un OH hémiacétalique du même côté que le OH porté par le C subterminal
qui détermine la série. Il a le pouvoir rotatoire le plus élevé.
- L’anomère β a les propriétés inverses.
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- Deux structures cycliques sont possibles.
• La forme pyranique correspond à un hérérocycle à 6 sommets (5 C et 1 O).
• La forme furanique correspond à un hétérocycle à 5 sommets (4 C et 1 O).
4.1. Cyclisation des oses
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5. Les osides
• Les osides sont des molécules qui donnent par hydrolyse 2 ou plusieurs molécules d’oses. Ces
oses peuvent être identiques ou différents.
• Deux oses sont unis entre eux par une liaison osidique (ou glycosidique) pour donner un
diholoside.
• Selon le mode de liaison des 2 oses le diholoside est non réducteur ou réducteur.
5.1. Diholoside non réducteur : liaison osido-oside
Il y a condensation de la fonction hémiacétalique de chaque ose par une liaison osido-oside
5.2. Diholoside réducteur : liaison osido-ose
• Il y a condensation d’une fonction hémiacétalique d’un ose avec une fonction alcoolique
d’un second ose par une liaison osido-ose.
• Il reste donc dans le diholoside un -OH hémiacétalique libre responsable du pouvoir
réducteur de la molécule.
5.3. Nomenclature des diholosides
Osyl: le 1er ose dont à la fonction hémiacétalique engagée dans la liaison osidique,
Oside: le dernier ose dont la fonction hémiacétalique engagée à la liaison osidique,
Ose: le dernier ose dont sa fonction hémiacétalique est libre.
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6. Polysacharide
Sont des polymères de la famille des glucides constitués de plusieurs oses liés
entre eux par des liaisons osidiques. On distingue deux catégories de
polysaccharides :
- Les homopolysaccharides : constitués du même monosaccharide. Tel
que : l’amidon, le glycogène, cellulose...
- Les hétéropolysaccharides : formés de différents monosaccharides.
On a comme exemple : Les pectines, L'agar-agar…