REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE
MINISTERE DE L'ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE
SCIENTIFIQUE
UNIVERSITE ABOU BEKR BELKAID TLEMCEN
FACULTE DES SCIENCES DE LA NATURE ET DE LA VIE DE LA TERRE
ET DE L’UNIVERS
DEPARTEMENT DE BIOLOGIE
Laboratoire de Microbiologie Appliquée à l’Agroalimentaire, au Biomédical et à
l’Environnement
« LAMAABE »
MEMOIRE
Présenté par :
SEGHIR SOUHAIB
En vue de l’obtention du diplôme
de MASTER
En Microbiologie Fondamentale
Caractérisation des gènes de résistance aux antibiotiques chez Acinetobacter
baumannii
Soutenu le 12/07/2023, devant le jury composé de :
Présidente Mme Bendimerad Nahida Maître de conférences B Université de Tlemcen
Encadrante Mme Mesli Merad boudia Maître de conférences B Université de Tlemcen
Esma
Examinatrice Mme Ayad Amel Maître de conférences B Université de Tlemcen
Année Universitaire : 2022-2023
1
Plan de travail
1-Introduction
2-Généralités
3-Objectif de travail
4-Matériel et méthodes
5-Résultats et Discussion
6-Conclusion
7-Perspectives
4-Matériel et méthodes
Isolement et identification
1. Réalisation des prélèvements
2. Mise en culture des prélèvements
2. Isolement et purification
3. L’identification par le système VITEK® 2 Compact
1. Préparation de l’inoculum
2. Préparation de la cassette
3. Manipulation sur l’instrument VITEK®2 Compact
4. Conservation
5. Antibiogramme
1. L’antibiogramme par diffusion des disques d’antibiotiques sur la gélose
2. Réalisation de l’antibiogramme par le système VITEK® 2 Compact
6-Conclusion
Cette étude révèle une augmentation de la fréquence et de la résistance des souches
d'[Link], ce qui représente un défi pour la prise en charge thérapeutique. Pour résoudre
ce problème, il est nécessaire de contrôler l'environnement hospitalier, ajuster l'antibiothérapie
pour chaque patient en se basant sur les résultats de l'antibiogramme et d'optimiser l'utilisation
des antibiotiques à l'hôpital.
7-Perspectives
Elargissement de la période d’étude
Réalisation d’une étude multicentrique
Développer des stratégies visant a prévenir les infections causées par A. baumannii en
Algerie.
Créer une base de données exhaustive regroupant toutes les informations relatives aux
souches d'Acinetobacter baumannii Algeriennes,
évaluer les autres possibilités thérapeutiques de traitements des infections à [Link]
1-Introduction
Acinetobacter baumannii, une bactérie ubiquitaire et opportuniste, se présente comme un
coccobacille à Gram négatif. Elle est souvent impliquée dans les infections nosocomiales, en
particulier dans les unités de soins intensifs. Le traitement de ces infections est souvent difficile, à
cause de leur résistance naturelle et acquise aux nombreux antibiotiques, ainsi que de leurs multiples
facteurs de virulence.
en seulement 40 ans, cette espèce est passée d'une "bactérie insignifiante" peu pathogène et
sensible à la plupart des antibiotiques disponibles à l'époque, à une bactérie pathogène capable
d'acquérir facilement une multi-résistance aux antibiotiques
2-Généralités
Les bactéries appartenant au genre Acinetobacter sont considérées comme des
microorganismes coccobacillaires à gram négatif et ubiquitaires
[Link] est l'espèce la plus commune et celle qui est le plus souvent associée aux
infection nosocomiales et communautaires
[Link] est l'espèce la plus commune et celle qui est le plus souvent associée aux
infection nosocomiales et communautaires
Les mécanismes de résistance chez Acinetobacter baumanni
1. Résistance naturelle
2. Résistance acquise
3-Objectif de travail
L'objectif de cette étude consiste à évaluer la fréquence d'isolement et à décrire le profil de
résistance d'Acinetobacter baumannii vis-à-vis des divers antibiotiques, isolés à partir de trois
hôpitaux : CHU de Tlemcen (service de réanimation et de chirurgie), l’hôpital de Beni Saf (service de
chirurgie, d’infectiologie, des urgences et de maternité) et l’hôpital d’Ain Témouchent (service de
réanimation).
5-Résultats et Discussion
1. Mise en culture des prélèvements
cultures positives cultures négative
8%
92%
Le taux de cultures positives et cultures négatives
2. Les résultats d’identification
Identifier Non édentifier
12,19%
87,80%
Le taux d’identification des BGN
3. Répartition des souches identifiées
BGNnF Entérobactéries Autres bactéries
12,19%
35,36%
52,43%
Répartition des BGN à partir des prélèvements
Acinetobacter baumannii Pseudomonas aeruginosa
31,03%
68,96%
Répartition des BGNnF
6
Réanimation
5
Chirurgie
4
Chirurgie
3 Maternité
2 Infectiologie
1 Blocs opératoires Urgences et
Chirurgie
0 Réanimation
Le nombre d’isolats d’[Link] selon les services d’hospitalisation des trois hôpitaux
[Link] répartition des isolats d’[Link] selon la nature des prélèvements
Sonde urinaire Plaie
Aspiration endo-trachéale Mains
20% 30%
20%
30%
La Répartition des souches d’[Link] selon les prélèvements des patients dans les trois hôpitaux
Lit
Table
Appareil de ventilation mécanique (AVM)
Poignée de porte
Chariot de soins
Poignée de poubelle
Couloir
10%
10% 20%
10%
20%
10% 20%
La Répartition des souches d’[Link] selon les prélèvements environnementaux dans les trois
hôpitaux
5. Profil de résistance d'Acinetobacter baumannii aux antibiotiques
R S I
5%
35%
60%
La Résistance des souches d’[Link] contre l’antibiotique gentamycine
Taux des souches résistantes % Taux des souches intermédiaires %
Taux des souches sensibles %
37,5%
50%
50% 50% 50% 50%
0% 12,5% 50%
0% 0%
0% 87,5%
12,5% 0%
50% 50% 50% 50%
37,5% 50%
50%
TZP 0%
CTX
CAZ
IMI 12,5%
GEN
CIP
CS
TMP/SMX
Profil de résistance des isolats d’Acinetobacter baumannii testées par le système VITEK®2 Compact