PÉRIODE D’ACCRÉDITATION : 2022 / 2026

UNIVERSITÉ PAUL SABATIER

SYLLABUS MASTER

Mention Biodiversité, écologie et évolution

M1 ECOLOGIE ET EVOLUTION

[Link]
[Link]

2022 / 2023

23 MARS 2023
 SOMMAIRE

SCHÉMA ARTICULATION LICENCE MASTER . . . . . . . . . . . 3

PRÉSENTATION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
PRÉSENTATION DE LA MENTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4
Mention Biodiversité, écologie et évolution . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4

Compétences de la mention . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4

PRÉSENTATION DE L’ANNÉE DE M1 ECOLOGIE ET EVOLUTION . . . . . 4

RUBRIQUE CONTACTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
CONTACTS PARCOURS . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
CONTACTS MENTION . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5
CONTACTS DÉPARTEMENT : [Link]́o . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5

Tableau Synthétique des UE de la formation . . . . . . . . . . . . . 7

LISTE DES UE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9
GLOSSAIRE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
TERMES GÉNÉRAUX . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
TERMES ASSOCIÉS AUX DIPLOMES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 47
TERMES ASSOCIÉS AUX ENSEIGNEMENTS . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48

2
 SCHÉMA ARTICULATION LICENCE MASTER

SCHÉMA ARTICULATION LICENCE-MASTER À UT3

Ce tableau précise les mentions de licences conseillées pour l’accès aux masters d’UT3 aux étudiants effectuant un cursus complet d’études à UT3.

Accès non sélectif avec capacité d’accueil Accès sélectif (concours ou dossier) * European Credits Transfer System

LICENCES ± 3 ANS MASTERS 2 ANS

0 ECTS * 180 ECTS 120 ECTS

Chimie
Chimie Génie des procédés et des bio-procédés
Sciences et génie des matériaux

Électronique, énergie électrique, automatique EEA

Électronique, énergie électrique, automatique
Énergie
(EEA)
Ingénierie de la santé

Génie civil
Génie civil
Énergie

Informatique
Informatique Réseaux et télécommunication
Bio-informatique

Information-communication Infomation-communication

Mathématiques Mathématiques et applications

Mécanique
Mécanique Génie mécanique
Énergie

Méthodes informatiques appliquées à la gestion des

Mathématiques et informatique appliquées aux entreprises-MIAGE
sciences humaines et sociales (MIASHS) Management des systèmes d’information
Physique fondamentale et applications
parcoursup

Sciences de l’univers et technologies spatiales

Physique Sciences de l’océan, de l’atmosphère et du climat
Énergie

Physique fondamentale et applications

Physique-chimie Sciences de l’océan, de l’atmosphère et du climat
Chimie

Sciences de la Terre et des planètes, environnement

Sciences de la Terre
Sciences de l’océan, de l’atmosphère et du climat

Biodiversité, Écologie et Évolution

Biologie Végétale

Bio-informatique

Sciences de la vie Neurosciences

Biotechnologies

Biologie moléculaire et cellulaire

Biologie-santé

Sciences et Humanités Information-communication

STAPS-Activité physique adaptée à la santé STAPS-Activité physique adaptée à la santé

STAPS-Entraînement et optimisation de la
STAPS-Education et motricité performance sportive

STAPS-Entraînement et optimisation de la
STAPS-Entraînement sportif performance sportive

STAPS-Management du sport STAPS-Management du sport

Toutes les mentions de licence permettent la poursuite vers des parcours du Master MEEF Sources : Arrêté d’accréditation UT3 du 31 aout 2021 et Arrêté du 31 mai 2021 modifiant l’arrêté du 6 juillet
qui sont portés par l’Institut National Supérieur du Professorat et de l’Éducation (INSPE) de 2017 fixant la liste des compatibilités des mentions du diplôme national de licence avec les mentions du diplôme
l’Université Toulouse II - Jean-Jaurès. national de master. [Link] et arrêté d’accréditation UT3

3
 PRÉSENTATION

PRÉSENTATION DE LA MENTION

MENTION BIODIVERSITÉ, ÉCOLOGIE ET ÉVOLUTION

La mention BEE a pour objectif de former des professionnels de la recherche en écologie, de la gestion de la
biodiversité, et de l’aménagement du territoire pour :
— Comprendre et savoir gérer le fonctionnement des systèmes naturels et anthropisés,
— Aborder d’un point de vue évolutif ou fonctionnel les grandes questions et enjeux liés à la biosphère et
aux interactions homme-biosphère, tels que les changements globaux, l’érosion de la biodiversité et les
perturbations anthropiques,
— Envisager les processus de l’individu aux écosystèmes.
en s’appuyant sur l’analyse de données, l’écologie comportementale, la télédétection ou la biologie de la conser-
vation.
Ces professionnels sont de futurs chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs en écologie fonctionnelle, écologie
évolutive et biologie de l’évolution, chargés d’études ou de missions, chefs de projets, conseillers en environnement,
animateurs de bassin, agents territoriaux, gestionnaires de sites protégés, ingénieurs en qualité de l’environnement
eau, air ou sol, etc.

COMPÉTENCES DE LA MENTION
L’Ecologie est souvent source d’une forte motivation personnelle chez les étudiant.e.s. L’objectif de l’équipe ensei-
gnante est d’aider à ce que cet enthousiasme se traduise par l’acquisition de connaissances et compétences solides,
que les diplômé.e.s pourront mettre au service de leurs projets et [Link] une culture générale so-
lide sur des cas de référence en écologieCollecter ou produire des données, bibliographiques ou de
terrainConcevoir et mettre en œuvre une étude en écologie (recherche, étude d’impact...)Répondre
à une question de recherche ou de gestion en écologieConcevoir et conduire un projet, seul ou en
équipeSynthétiser l’état de l’art dans un domaine de la spécialitéIdentifier et appliquer des outils
mathématiques et/ou informatiques aux objets écologiquesRestituer les résultats d’une étude person-
nelle ou celle d’un tiersOrganiser le socle de connaissances nécessaires pour définir des hypothèses de
travail dans un cadre théorique ou pratique adaptéComprendre et s’exprimer dans au moins une langue
étrangèreCompétences du C2i Métiers de l’Environnement et de l’Aménagement DurablesDétails :
https ://[Link]

PRÉSENTATION DE L’ANNÉE DE M1 ECOLOGIE ET EVOLUTION

4
 RUBRIQUE CONTACTS

CONTACTS PARCOURS
RESPONSABLE M1 ECOLOGIE ET EVOLUTION
ANDALO Christophe
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 59
BUISSON Laetitia
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 89 12
LOOT Geraldine
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 64 74
PELOZUELO Laurent
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 25
PONSARD Sergine
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 61 97
BLANCHARD Pierrick
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 53
THEBAUD Christophe
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 82 18

SECRÉTAIRE PÉDAGOGIQUE
LEPAGE Stella
Email : [Link]@[Link]

CONTACTS MENTION
RESPONSABLE DE MENTION BIODIVERSITÉ, ÉCOLOGIE ET ÉVOLUTION
ANDALO Christophe
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 59
BUISSON Laetitia
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 89 12
DEVAUD Jean-Marc
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 62
FICHANT Gwennaele
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 33 58 26
LOOT Geraldine
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 64 74
PELOZUELO Laurent
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 67 25
PONSARD Sergine
Email : [Link]@[Link] Téléphone : 05 61 55 61 97

CONTACTS DÉPARTEMENT: [Link]́O

DIRECTEUR DU DÉPARTEMENT

5
LUTZ Christel
Email : fsi-dptBG-dir@[Link] Téléphone : 05 61 55 66 31

SECRETARIAT DU DÉPARTEMENT
BLANCHET-ROSSEL Anne-Sophie
Email : [Link]-rossel@[Link]
 TABLEAU SYNTHÉTIQUE DES UE DE LA FORMATION

Obligatoire
semestre∗

Facultatif

TP DE

Terrain
ECTS

Projet
Cours

Stage
e-TP
TD

TP
page Code Intitulé UE
Premier semestre
10 KBEE7AAU ANALYSE DE DONNEES ET MODELISATION EN ECOLO- I 6 O 16 38
GIE
11 KBEE7ABU ECOLOGIE FONCTIONNELLE I 6 O 32 14 6
12 KBEE7ACU ECOLOGIE EVOLUTIVE I 6 O 22 18 14
Choisir 1 UE parmi les 4 UE suivantes :
13 KBEE7ADU PRATIQUE POUR L’ECOLOGIE FONCTIONNELLE I 3 O 2 4 4 6 4
14 KBEE7AEU SERVICES ECOSYSTEMIQUES (BSE) I 3 O 12 4 6 1
15 KBEE7AFU INITIATION A LA PROGRAMMATION ET OUTILS MATHE- I 3 O 10 6 12
MATIQUES (Prog Outils Maths)
16 KBEE7AGU SCIENCES, ENVIRONNEMENT ET SOCIETES I 3 O 20
17 KBEE7AHU ANGLAIS SCIENTIFIQUE I 3 O 24
Choisir 1 UE parmi les 3 UE suivantes :
18 KBEE7AIU COMMUNAUTES TERRESTRES (Commun. Terrestres) I 6 O 18 15 9 4
20 KBEE7AJU ECOLOGIE AQUATIQUE I 6 O 36 8 8
21 KBEE7AKU EVOLUTION ET PHYLOGENIE (evo phylo) I 6 O 20 22 18
Second semestre
Choisir 12 ECTS parmi les 4 UE suivantes :
22 KBEE8AAU STAGE PROFESSIONNALISANT II 12 O 6 20 2
23 KBEE8ABU PROJET DE RECHERCHE EN ECOLOGIE ET SCIENCES DE II 12 O 6 20 2
L’EVOLUTION (Initiation Recherche)
24 KBEE8ACU METHODOLOGIE II 6 O 2 14 12 55
25 KBEE8ADU PROJET TUTORE (Ptut) II 6 O 100
Choisir 18 ECTS parmi les 18 UE suivantes :

∗ AN :enseignenents annuels, I : premier semestre, II : second semestre

7
 Obligatoire
semestre∗

Facultatif

TP DE

Terrain
ECTS

Projet
Cours

Stage
e-TP
TD

TP
page Code Intitulé UE
26 KBEE8BAU SIG 1 II 3 O 6 18
27 KBEE8BBU BIOLOGIE DE LA CONSERVATION 1 II 3 O 12 6 6
28 KBEE8BCU ANTHROPOBIOLOGIE ET ECOLOGIE HUMAINE II 6 O 20 20 8
29 KBEE8BDU ECOLOGIE MICROBIENNE ET APPLICATIONS ENVIRON- II 6 O 22 12 14
NEMENTALES
30 KBEE8BEU ORIGINE ET HISTOIRE DE LA BIODIVERSITE II 6 O 18 16 14
31 KBEE8BFU BIODIVERSITE DYNAMIQUE ECOSYSTEMES TROPICAUX II 6 O 18 12 10 2,6666666666667
KBEE8BGU DEVELOPPEMENT DURABLE TRANSITION TRANSFOR- II 3 O
MATION ECOLOGIQUE (DDTTE)
34 KBEX8BG1 Développement Durable, Transition et Transformation Eco- 12
logique
32 KBEE8BG2 Développement Durable, Transition et Transformation Eco- 12
logique tp
33 KBEE8BGK e-Développement Durable, Transition et Transformation 4
Ecolog
35 KBEE8BHU SIG 2 II 3 O 6 18
36 KBEE8BIU BIOLOGIE DE LA CONSERVATION 2 II 3 O 12 12
37 KBEE8BJU ECOSYSTEMES TERRESTRES ET CHANGEMENT CLIMA- II 6 O 20 6 16 4
TIQUE (ecoter chgtclim)
38 KBEE8BKU ECOTOXICOLOGIE & EVALUATION DU RISQUE II 6 O 24 12 12
39 KBEE8BLU ECOLOGIE AQUATIQUE DE TERRAIN (eco aqua ter) II 6 O 12
41 KBEE8BMU APPROCHE PRATIQUE ECOLOGIE EVOLUTION II 6 O 4 2 14
42 KBEE8BNU COMMUNAUTES VEGETALES DU SUD DE L’EUROPE II 6 O 16 4 4 12
(ComSudEur)
43 KBEE8BOU EXPERTISE NATURALISTE II 6 O 8 16 10
44 KBEE8BPU GENOMIQUE ENVIRONNEMENTALE II 6 O 20 8 20
45 KBEE8BQU BIOSTATISTIQUES : UTILISATION DU MODELE NON LI- II 3 O 4 24
NEAIRE
46 KBEE8BRU ANALYSE DES DONNÉES MULTIVARIÉES II 3 O 8 16

∗ AN :enseignenents annuels, I : premier semestre, II : second semestre

8
LISTE DES UE

9
 ANALYSE DE DONNEES ET MODELISATION
UE 6 ECTS 1er semestre
EN ECOLOGIE
Enseignement Travail personnel
KBEE7AAU Cours : 16h , TP : 38h en français 96 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BUISSON Laetitia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Maı̂triser les méthodes d’analyse statistique de données les plus communément utilisées pour l’analyse et la
compréhension des phénomènes biologiques et écologiques.
Faire le lien entre le questionnement biologique et les méthodes d’analyse à mettre en œuvre afin de maı̂triser
l’ensemble de la démarche scientifique, depuis la formulation des hypothèses biologiques jusqu’à l’interprétation
des résultats, en passant bien évidemment par l’analyse concrète des données.
Acquérir une autonomie suffisante dans les analyses de données afin de répondre à des problématiques écologiques
simples mais variées.
Se familiariser avec le logiciel R pour le traitement et l’exploration de données biologiques.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les concepts et méthodes d’analyse abordés concerneront les lois de probabilité, les tests d’hypothèses (pa-
ramétriques et non paramétriques), le modèle linéaire (plans expérimentaux, analyse de variance, régression
simple et multiple), le modèle linéaire généralisé et une introduction aux analyses exploratoires multidimension-
nelles (méthodes de classification et méthodes factorielles).
Les aspects théoriques indispensables à la compréhension et à la bonne utilisation de ces méthodes seront traités
au cours des CM. Les TP, qui auront lieu en salle informatique, permettront aux étudiants de mettre en pratique
ces méthodes afin de répondre à des questions biologiques concrètes. Pour cela, ils seront familiarisés au logiciel
R.
Enfin, un projet réalisé en binôme permettra aux étudiants d’être confrontés à un problème biologique concret.
Ils devront ainsi identifier les méthodes d’analyse adaptées à la question biologique de leur choix et acquérir les
bons  réflexes  face aux difficultés de l’analyse de données en situation réelle.

PRÉ-REQUIS
Enseignement antérieur sur statistiques descriptives + tests d’hypothèses
Connaissances basiques du logiciel R : remise à niveau exigée avant la rentrée

SPÉCIFICITÉS
Enseignement en salle informatique à l’UPS

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Bertrand F. & Maumy-Bertrand M. 2014. Initiation à la statistique avec R. Cours et exercices corrigés. Dunod.
Scherrer B. 2008. Biostatistique volume 1. Editeur Gaëtan Morin.
Crawley M.J. 2012. The R Book. Wiley.

MOTS-CLÉS
Analyses univariées et bivariées, modélisation, tests d’hypothèses, programmation, logiciel R

10
 UE ECOLOGIE FONCTIONNELLE 6 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7ABU Cours : 32h , TD : 14h , TP : 6h en français 98 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
LECERF Antoine
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
— Renforcer et consolider le bagage de connaissances en écologie fondamentale
— Décrire et comprendre la structure et le fonctionnement de systèmes écologiques complexes
— Comprendre les mécanismes et processus agissant sur la stabilité des écosystèmes
— Connaı̂tre et quantifier le rôle fonctionnel de la biodiversité
— Analyser des données écologiques pour quantifier le fonctionnement des écosystèmes
— Mobiliser les connaissances en écologie scientifique pour analyser les relations entre l’Homme et la Nature,
ainsi que les grands enjeux environnementaux
— Mettre en œuvre une démarche scientifique dans le cadre d’une étude en écologie
— Présenter des résultats scientifiques de manière claire et synthétique

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Dans cette UE, l’écologie fonctionnelle est présentée comme une discipline scientifique intégrative profondément
enracinée dans les sciences naturelles et dont les bases théoriques dérivent de principes généraux issus de la biologie,
de la physique et de la chimie. Les cours magistraux apportent les connaissances fondamentales indispensables à
la compréhension des dynamiques écologiques. L’accent est mis sur le vivant et la biodiversité en tant que facteurs
de contrôle du fonctionnement des écosystèmes et de maintien de leur stabilité. Les travaux dirigés s’appuient
sur des exemples d’applications concrètes des connaissances en écologie dans les domaines de la surveillance et
l’exploitation des écosystèmes. Des travaux pratiques offrent l’opportunité aux étudiants de se familiariser avec
la démarche expérimentale et de mettre en application des outils pour l’étude quantitative des milieux naturels
et anthropisés.

PRÉ-REQUIS
Savoir définir les principaux objets d’étude en écologie : la biosphère, le biome, l’écosystème, la communauté et
la population

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Chapin [Link] al. (2011) Principles of Terrestrial Ecosystem Ecology, Springer
Weathers K.C. et al. (2013) Fundamentals of Ecosystem Science. Academic Press

MOTS-CLÉS
biodiversité, cycles biogéochimiques, écosystème, ingénierie écologique, services écologiques, traits fonctionnels

11
 UE ECOLOGIE EVOLUTIVE 6 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7ACU Cours : 22h , TD : 18h , TP : 14h en français 96 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
AGUILEE Robin
Email : [Link]@[Link]
LECOMPTE Emilie
Email : [Link]@[Link]
PONSARD Sergine
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
- Caractériser les variations (d’effectifs, de génotypes, de phénotypes et d’histoires de vie) dans les populations
naturelles,
- Comprendre les mécanismes qui génèrent, maintiennent et modifient ces variations,
- Maı̂triser les outils de description et d’analyse de ces variations.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Sélection naturelle (concepts et exemples)
Dynamique des populations (populations isolées, en interaction, structurées, métapopulations)
Génétique des populations (forces évolutives, structuration, régimes de reproduction, déséquilibre de liaison,
coalescence)
Dynamique adaptative (introduction)
Génétique quantitative (héritabilité, équation du sélectionneur)
Evolution des histoires de vie (application à l’évolution de la sénessence)
Allocation au sexe de la descendance
Evolution expérimentale (expériences de terrain et en laboratoire, sélection artificielle)
Diversité intraspécifique
La manipulation pratique des concepts et des outils se fera dans le cadre de séances de TD/TP et d’un  projet
transversal  qui vise à combiner l’ensemble des thèmes présentés au cours de l’UE dans le but de répondre à
une problématique d’écologie évolutive.

PRÉ-REQUIS
Concepts de base en écologie, biologie évolutive, génétique des populations, dynamique des populations, statistique
inférentielle. Mathématiques niveau L1.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
- Biologie évolutive, Thomas, Lefèvre et Raymond, ed de Boeck Supérieur, 2nde édition, 2016
- Ricklefs, R. E., et Miller, G. L. 2005. Écologie. Ed De Boeck

MOTS-CLÉS
Sélection, dynamique des populations et adaptative, génétique des populations et quantitative, modèles, histoires
de vie, allocation au sexe, diversité

12
 PRATIQUE POUR L’ECOLOGIE FONCTION-
UE 3 ECTS 1er semestre
NELLE
Travail personnel
KBEE7ADU Cours : 2h , TD : 4h , TP : 4h , Terrain : 4 demi-journées Enseignement
, TP DE : 6h
en français 47 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BUFFAN-DUBAU Evelyne
Email : [Link]-dubau@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Illustrer l’écologie fonctionnelle par des exemples issus de recherche fondamentale et/ou d’actions de gestion
des écosystèmes. La gestion durable d’écosystème s’appuie sur la connaissance du fonctionnement naturel et
les facteurs d’influence. La conservation de ce fonctionnement et des bénéfices associés, passe par le maintien
ou le renforcement des interactions entre sa structure (diversité des habitats et des populations) et les flux de
matières et d’énergie entre les compartiments fonctionnels (sous-systèmes, niveaux trophiques... ). Des exemples
de dynamique d’écosystèmes dans le temps et dans l’espace seront présentés. Le module met en pratique, sur le
terrain et en salle des cas d’étude comprenant des analyses et synthèses à réaliser.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L’articulation entre les conditions climatologiques, la structure du paysage, le développement des sols, de la
végétation et de la faune est illustrée le long d’un transect reliant les biotopes de la plaine toulousaine jusqu’aux
étages d’altitude des Pyrénées. Cet exemple illustre les facteurs naturels et l’influence des diverses activités
anthropiques sur le fonctionnement de ces milieux, y compris les milieux aquatiques d’eau douce. Un TD de
cartographie sert à la synthèse des observations faites sur le terrain. Pour les milieux aquatiques, une analyse
quantitative du cycle de la matière est illustrée par des manipulations en salle et/ou par des TD. Les étudiants
apprennent à compiler l’ensemble de résultats obtenus sur différents niveaux trophiques en termes de stocks
(composition de la matière, biomasses) et de flux (production primaire, broutage par le zooplancton, prédation
par les macro-invertébrés) afin de réaliser le cycle complet d’un élément (ex. le carbone) dans le fonctionnement
du système.

PRÉ-REQUIS
Connaissances de base en écologie au niveau Licence.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
[Link]
Le rôle de la diversité dans le fonctionnement des écosystèmes.
Gravel et al. 2010. Ciencia & Ambiente 39

MOTS-CLÉS
Compartiments fonctionnels, cycle de fonctionnement, quantification écosystème, paysage.

13
 UE SERVICES ECOSYSTEMIQUES (BSE) 3 ECTS 1er semestre
Travail personnel
KBEE7AEU Cours : 12h , TD : 4h , TP : 6h , Terrain : 1 demi-journée Enseignement
en français 50 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BURRUS Monique
Email : [Link]@[Link]
ESCARAVAGE Nathalie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Acquérir les connaissances scientifiques et techniques nécessaires pour comprendre les défis des évaluations des
services écosystémiques (SE) en vue de leur intégration dans les politiques publiques et leur planification.
A l’issue de l’enseignement, l’étudiant appréhendera les grands concepts et les méthodologies associées qui sous-
tendent une évaluation des SE, pourra identifier les intérêts et les limites d’une telle démarche.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cette UE rappellera les bases du concept de SE puis, à travers plusieurs exemples, abordera des notions clés
pour étudier, explorer et préserver les SE. Elle abordera également les méthodologies de l’évaluation des services
fournis par les écosystèmes, ainsi que leurs intérêts, limites et controverses. Après avoir abordé différents SE, un
focus sera apporté sur le service de pollinisation.
A la fin de cet enseignement, les étudiants seront capables de : définir le concept de SE dans ses dimensions
écologique, économique et sociale ; appréhender ses principes et ses limitations ; comprendre les services clés
associés à une ressource donnée ; évaluer les avantages et les risques potentiels de la monétarisation des SE.

PRÉ-REQUIS
Aucun

MOTS-CLÉS
Fonctions et services ; Pollinisation, Evaluation de la biodiversité ; Système socio-écologique ; Instrumentalisa-
tion/Marchandisation de la nature

14
 INITIATION A LA PROGRAMMATION ET OU-
UE 3 ECTS 1er semestre
TILS MATHEMATIQUES (Prog Outils Maths)
Enseignement Travail personnel
KBEE7AFU Cours : 10h , TD : 6h , TP : 12h en français 47 h
URL [Link]
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
AGUILEE Robin
Email : [Link]@[Link]
ANDALO Christophe
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Maı̂triser des outils mathématiques et informatiques standards permettant une modélisation formelle des questions
d’écologie et d’évolution.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L’enseignement sera basé sur des questions concrètes d’écologie et d’évolution.
- Algorithmique : raffinage, variable, boucle, test, fonction. Programmation en R ou python (au choix de
l’étudiant.e).
- Equations différentielles : résolution algébrique d’équations différentielles simples, résolution numérique dans
des cas plus complexes.
- Algèbre linéaire : espace vectoriel, matrice, déterminant, valeur et vecteur propres. Utilisation pour les modèles
en populations structurées et les modèles stochastiques. A noter que les connaissances/compétences acquises
dans ce domaine constitueront un atout pour suivre les UE de statistiques avancées du semestre 8.

PRÉ-REQUIS
- Goût pour la formalisation mathématique/informatique des questions biologiques
- Avoir validé sans compensation une UE de mathématiques en Licence

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
A Biologist’s Guide to Mathematical Modeling in Ecology and Evolution. 2007. Sarah P. Otto & Troy Day.
Princeton University Press.

MOTS-CLÉS
modélisation ; équation différentielles ; algèbre linéaire ; code informatique ; langage R ; langage python ; résolution
numérique

15
 UE SCIENCES, ENVIRONNEMENT ET SOCIETES 3 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7AGU TD : 20h en français 55 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BLOT Frederique
Email : [Link]@[Link]
DENEVE Stephanie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
- Développer une perspective réflexive sur son sujet d’étude et ses pratiques et découvrir l’intérêt d’une approche
interdisciplinaire de l’environnement et de son évolution.
- Prendre conscience que les relations sociétés/milieux sont multiples, varient dans le temps et résultent de l’inter-
action entre facteurs culturels, politiques, économiques, sociaux et écologiques. Identifier et analyser ces facteurs
et leurs interrelations. Analyser les concepts mobilisés par les sciences - écosystèmes, services écosystémiques,
résilience, adaptation, risques - et comprendre en quoi leur construction résulte de l’inscription de ces sciences
dans le temps, l’espace et les sociétés.
- Comprendre les enjeux sociaux (conflits, controverses, rapports de pouvoir) liés à la valorisation de l’environne-
ment.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cet enseignement se déroulera sur 5 séances de 2h appliquées à deux grandes approches de sciences humaines et
sociales :
Comprendre les relations êtres humains/environnement (Epistémologie et relations sciences / sociétés)
Séance 1 Introduction à l’histoire et aux humanités environnementales (Introduction à épistémologie, application
à la géographie)
Séance 2Exemples d’apports des sciences humaines à la compréhension des interactions entre l’être humain et
son environnement (Sciences et sociétés, croissance des controverses)
Séance 3Etude de cas (Etude de cas : 2 controverses)
Séance 4-5 Evaluation en CC (Evaluation en CC : mise en scène de forums hybrides)

PRÉ-REQUIS
Niveau L3 en écologie

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Chansignaud V. (2013). L’homme et la nature, une histoire mouvementée. Delachaux & Niestlé.
Feuerhahn W., Blanc G. & Demeulenaere E. (2017). Humanités environnementales : Enquêtes et contre enquêtes.
Pub. de la Sorbonne.

MOTS-CLÉS
Epistémologie - controverses socio-techniques - histoire environnementale - humanités environnementales

16
 UE ANGLAIS SCIENTIFIQUE 3 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7AHU TD : 24h en français 51 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
HAG Patricia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Niveau C1/C2 du CECRL
L’objectif de cette UE est de permettre aux étudiants de développer les compétences indispensables à la réussite
dans leur future vie professionnelle en contextes culturels variés. Il s’agira d’ acquérir l’autonomie linguistique
nécessaire et de perfectionner les outils de langue spécialisée permettant l’intégration professionnelle et la com-
munication d’une expertise scientifique dans le contexte international.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les étudiants développeront :- les compétences liées à la compréhension de publications scientifiques ou pro-
fessionnelles rédigées en anglais ainsi que les compétences nécessaires à la compréhension de communications
scientifiques orales.- les outils d’expression permettant de maı̂triser une présentation orale et/ou écrite et d’abor-
der une discussion critique dans le domaine scientifique, (ex. rhétorique, éléments linguistiques, prononciation...)
.- la maı̂trise des éléments d’argumentation critique à l’oral et/ou à l’écrit d’une publication scientifique- une
réflexion plus large sur leur place, leur intégration et leur rayonnement en tant que scientifiques dans la société,
abordant des questions d’actualité, d’éthique, d’intégrité..

PRÉ-REQUIS
Niveau B2 du CECRL

COMPÉTENCES VISÉES
S’exprimer avec aisance à l’oral, devant un public, en usant de registres adaptés aux différents contextes et
aux différents [Link] servir aisément d’une langue vivante autre que le français : compréhension et
expression écrites et orales :
- Comprendre un article scientifique ou professionnel rédigé en anglais sur un sujet relatif à leur domaine.
- Produire un écrit scientifique ou technique dans un anglais adapté, de qualité et respectant les normes et usages
de la communauté scientifique anglophone.
-Interagir à l’oral en anglais : réussir ses échanges formels et informels lors des colloques, réunions ou entretiens
professionnels.

MOTS-CLÉS
Projet - Anglais scientifique - Rédaction - Publication - Communications - esprit critique scientifique - interculturel

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 COMMUNAUTES TERRESTRES (Commun.
UE 6 ECTS 1er semestre
Terrestres)
Travail personnel
KBEE7AIU Cours : 18h , TD : 15h , TP : 9h , Terrain : 4 demi-journéesEnseignement
en français 96 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
PORNON Andre
Email : [Link]@[Link]
TABACCHI Anne-Marie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Ecologie des Communautés Terrestres : concepts, théories & applications, épisté[Link]́sentation
des approches théoriques & expérimentales sur la formation, le fonctionnement & la dynamique des assemblages
d’espèces en milieu terrestre à différentes échelles spatio-temporelles. Les mécanismes impliqués dans la coexis-
tence des espèces (facteurs abiotiques/traits de vie ; interactions inter/intra spécifiques...) seront particulièrement
examinés. Des exemples concrets illustreront ces mécanismes & les conséquences des activités humaines contem-
poraines & passées sur la structure, le fonctionnement & la diversité de ces communautés. Les TP en milieux
 naturels  sont une composante importante du module afin d’initier l’étudiant aux différentes étapes d’une

démarche scientifique.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

CM : Assemblage d’espèces, aspects théoriques & historiques des notions en contexte terrestre(niche
écologique, théorie neutraliste, densité dépendance...) ;Filtrage abiotique(traits de vie, groupes fonctionnels,
hétérogénéité spatiale & biodiversité) ; Interactions biotiques(inter & intra spécifique ; réseaux d’interact.) ;
espèces dominantes vs. subordonnées, espèces clés ; Diversité des communautés à différentes échelles(structure
spatiale, écotone, milieu riverain, milieu d’altitude...) ; Dynamiques passée & présente des écosystèmes & des
commu. animales & végétales(théorie(s) des successions, invasions, paléo environnement...) ;Perturbations &
notions associées(changement climatique, anthropisation, stress, résistance, résilience)
TD :Méthodes & critères d’évaluation de la diversité dans les milieux, au travers d’exemples concrets & de
publications scientifiques.
TP terrain & TP :Illustration pratique des notions & acquisition des outils & méthodes d’étude de la dynamique
de la biodiversité & des communautés seront réalisées lors de deux jours de terrain, complétés par des TP en
salle, organisés sous forme d’ateliers thématiques & autres.

PRÉ-REQUIS
Licence de biologie des organismes ou équivalent ou BGSTU.

SPÉCIFICITÉS
Deux jours de TP terrain au Parc de la confluence Ariège-Garonne auront lieu fin septembre-début octobre.
Un mémoire de recherche par groupe, résultant de cette expérimentation de terrain et de deux des séances TP
en salle (associés à cette expérimentation), sera à remettre en fin de semestre.

COMPÉTENCES VISÉES
- Savoir appréhender un écosystème
- Savoir lire une lame palynologique
- Savoir identifier des organismes
- Les Travaux in situ (communautés animales & végétales) & TD ont pour but d’initier les étudiants aux
différentes étapes d’une démarche scientifique à savoir i) formuler des hypothèses pertinentes portant sur une
question écologique donnée (ou un sujet donné d’écologie) en s’appuyant sur une bibliographie adaptée, ii)
proposer une méthodologie pour tester ces hypothèses et la mettre en pratique in situ, iii) s’adapter à la réalité
du terrain, iv) rédiger un mémoire de recherche basé sur l’analyse et la synthèse des résultats obtenus et sur une

18
solide argumentation et v) savoir travailler en équipe.
Compétences transversales : traitement de données, analyse de résultats et de publications & concevoir un mémoire
de recherche / respect des règles d’hygiène et de sécurité et gestion du travail en équipe.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Ramade F, 2020. Eléments d’Ecologie : Ecologie fondamentale. Ed. Dunod , Collection Sciences Sup. ; Tirard C,
Abbadie L, Laloi D. & Koubbi Philippe, 2016. Ecologie, Licence, Master & Capes. Ed. Dunod, Collection Tout
en fiches ; etc..

MOTS-CLÉS
Ecosystèmes, Paléoenvironnement,Communautés, Structure-Dynamique-Fonctionnement, Biodiversité., Succes-
sion, Invasions, Interactions, Perturbations & stress.

19
 UE ECOLOGIE AQUATIQUE 6 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7AJU Cours : 36h , TD : 8h , TP : 8h en français 98 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BROSSE Sebastien
Email : [Link]@[Link]
TEN HAGE Loic
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cet enseignement présente les principaux concepts régissant le fonctionnement et la biodiversité des écosystèmes
aquatiques d’eau douce (lacs, rivières). Les impacts anthropiques sur ces écosystèmes et sur la biodiversité
qu’ils abritent sont également abordés, et illustrent les enjeux actuels de conservation des écosystèmes aquatique
face aux changements globaux (ex : fragmentation par les barrages, pollution, introductions d’espèces exotiques,
changements climatiques) ainsi que les services que les écosystèmes aquatiques fournissent aux sociétés humaines.
Cet enseignement s’adresse aux étudiants qui souhaitent orienter leur projet professionnel vers l’étude des
écosystèmes aquatiques d’eau douce, que ce soit dans une optique de recherche ou de gestion de ces écosystèmes.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les cours présentent :
- Les patrons et déterminants de diversité des grands groupes d’organismes aquatiques (macrophytes, algues,
zooplancton, macro-invertébrés et poissons) dans les milieux courants (rivières) et stagnants (lacs).
- Le rôle des interactions biotiques et abiotiques dans la structure des communautés aquatiques
- Le fonctionnement physico-chimique des systèmes aquatiques.
- L’impact des activités anthropiques (fragmentation par les barrages, pollution, introductions d’espèces exotiques,
changements climatiques) sur la structure et le fonctionnement des systèmes aquatiques.
- Le rôle des organismes en tant que bio-indicateurs, et les services qu’ils procurent aux sociétés humaines.
Les travaux dirigés et travaux pratiques illustrent les cours par la présentation de cas concrets et l’analyse de
publications scientifiques.
Les travaux pratiques illustrent les cours par des experimentations en mesocosmes (aquariums) sur la reponse
d’organismes (Custacés) aux changements globaux.

PRÉ-REQUIS
- Bases théoriques en Ecologie
- Maitrise de l’anglais scientifique

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Allan DJ & Castillo MM 2007. Stream Ecology, structure and function of running waters. 2nd edition. Springer.
Keith P., Poulet N., Denys G., Changeux T., Feunteun E., Persat H. 2020. Les poissons d’eau douce de France.
MNHN/Biotope Editions.

MOTS-CLÉS
Cours d’eau, lacs, biodiversité, poissons, invertébrés, plancton, chimie, communautés, écologie fonctionnelle,
écologie évolutive, changements globaux

20
 UE EVOLUTION ET PHYLOGENIE (evo phylo) 6 ECTS 1er semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE7AKU Cours : 20h , TD : 22h , TP : 18h en français 90 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
LECOMPTE Emilie
Email : [Link]@[Link]
THEBAUD Christophe
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
— Appréhender les bases moléculaires de l’évolution, via l’étude des modifications au niveau de l’ADN (muta-
tions ponctuelles, duplications, inversions,...) et de leurs impacts à différentes échelles : gènes, populations
et espèces.
— Comprendre comment l’interaction entre les forces évolutives (sélection, dérive, mutation, migration et re-
combinaison) influence la composition génétique des populations et des espèces et conduit aux phénomènes
d’adaptation et de spéciation.
— Comprendre les concepts qui sous-tendent la construction d’hypothèses phylogénétiques et l’usage de la
méthode comparative.
— Etre capable de formuler des questions scientifiques et d’y répondre en utilisant les approches d’étude de
la diversité génétique (i.e. génétique des populations, évolution moléculaire, phylogénies).

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L’accent sera mis sur la compréhension des mécanismes d’évolution à différentes échelles (nucléotide, gène,
génome, population, espèce) ainsi que des concepts qui sous-tendent les méthodes d’analyses en évolution et
écologie moléculaire (évolution moléculaire, phylogénie, génétique des populations).
L’application de ces approches aux questions d’écologie et de biologie évolutive sera illustrée au travers de CM
et TD, en s’appuyant sur des projets de recherche existants. La manipulation pratique des concepts et des outils
se fera dans le cadre de séances de TD par l’analyse et l’interprétation des données issus d’articles scientifiques.
Les TP et projets permettront d’appliquer des outils de ces différentes approches et d’aboutir à des résultats que
les étudiants devront interpréter et présenter.

PRÉ-REQUIS
Maı̂trise des concepts de base de biologie évolutive et de génétique des populations, notamment l’équilibre de
Hardy-Weinberg et les forces évolutives.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Baum D & S. Stacey. (2013) Tree thinking : an introduction to phylogenetic biology
Graur D. & Li W.-H. Fundamentals of Molecular Evolution. (2000)
Hartl D.L. & Clark A.G. Principles of Population Genetics. (2007)

MOTS-CLÉS
Evolution moléculaire, Analyse phylogénétique, Méthode comparative, Génétique des populations, Histoire démographique
et adaptative, Génome, Recombinaison

21
 UE STAGE PROFESSIONNALISANT 12 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8AAU Cours : 6h , Stage : 2 mois minimum , Projet : 20h
en français 294 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BURRUS Monique
Email : [Link]@[Link]
GERINO Magali
Email : [Link]@[Link]
HAG Patricia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Découverte du monde professionnel par l’immersion et la réalisation d’un stage (2 mois) dans une structure
d’accueil dont une partie ou toute l’activité relève de l’écologie : établissement public, collectivité, bureau d’étude,
association, conservatoire, observatoire ...

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Ces missions peuvent être par exemple la gestion d’ espèces/ communautés, la gestion de milieux (conserva-
tion, restauration, aménagement), des actions associées à l’ingénierie écologique ou en faveur du développement
durable.
Stage continu ou discontinu selon UE du semestre 8.

PRÉ-REQUIS
aucun

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
https ://[Link]/particuliers/vosdroits/F16734

MOTS-CLÉS
Mission, filière professionnelle, acteurs de l’écologie, apprentissage, cahier des charges.

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 PROJET DE RECHERCHE EN ECOLOGIE ET
UE SCIENCES DE L’EVOLUTION (Initiation Re- 12 ECTS 2nd semestre
cherche)
Enseignement Travail personnel
KBEE8ABU Cours : 6h , Stage : 2 mois minimum , Projet : 20h
en français 294 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
GARDES Monique
Email : [Link]@[Link]
LECOMPTE Emilie
Email : [Link]@[Link]
HAG Patricia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Découverte du milieu professionnel de la recherche scientifique par la réalisation d’un projet personnel, sous
forme de stage encadré par des chercheurs, sur un sujet dans le domaine des sciences de l’évolution et l’écologie.
L’étudiant étant acteur de sa propre formation, ce stage a pour but de favoriser l’articulation entre les savoirs
théoriques enseignés et la pratique.
Formation à la démarche scientifique et à la présentation de travaux et résultats (rédaction d’un rapport scien-
tifique et d’un exposé de soutenance). Ce module vise à stimuler et à développer le sens de l’analyse critique et
de la réflexion, et à développer les compétences en matière de questionnement et de résolution de problèmes,
incluant des aspects méthodologiques variés.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Immersion dans le milieu professionnel de la recherche scientifique dans les domaines de l’écologie, l’étude de la
biodiversité et de la biologie évolutive.
Stage d’une durée de 2 mois (incluant la préparation de l’oral et la soutenance) sous la responsabilité d’un
maı̂tre de stage, titulaire d’une thèse : apprentissage de la réalisation d’un projet personnel, incluant la recherche
bibliographique, la formulation et le test d’hypothèses, l’analyse de données (produites au cours du stage ou
pré-existantes), l’interprétation des résultats en relation avec les connaissances scientifiques. Formation à la
communication écrite (rédaction d’un mémoire scientifique, présenté sous la forme d’un article scientifique) et
orale (exposé de soutenance).
Le tuteur du stage participe à l’évaluation en donnant un avis sur le travail produit, l’engagement et l’implication
de l’étudiant ainsi que la progression et les difficultés rencontrées. L’évaluation par le jury se fait sur la base du
mémoire écrit, de la présentation orale et des réponses aux questions, de l’avis du tuteur de stage, et de la tenue
d’un cahier de laboratoire détaillant les activités menées au quotidien.

SPÉCIFICITÉS
La réalisation d’un stage d’initiation à la recherche nécessite des étapes de préparation, pédagogique et adminis-
trative, qui doivent doit être terminées au plus tard début décembre.
Au cours du premier semestre, l’étudiant doit :
— rechercher une structure d’accueil dans le domaine auquel il s’intéresse ainsi qu’un tuteur (encadrant) de
stage qui l’accompagne et l’oriente jusqu’à la soutenance.
— soumettre, après accord de son encadrant, un projet de recherche au(x) responsable(s) du module pour
validation pédagogique.
— établir une convention définissant les engagements respectifs de chacun entre les différents intervenants. La
convention doit être signée par toutes les parties (stagiaire, tuteur de stage, enseignant-référent, organisme
d’accueil, établissement d’enseignement) avant le début du stage.

MOTS-CLÉS
Méthode scientifique, recherche, écologie, évolution, conduite de projet, communication

23
 UE METHODOLOGIE 6 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8ACU Projet : 55h , Cours : 2h , TD : 14h , TP : 12h
en français 122 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
GRENOUILLET Gael
Email : [Link]@[Link]
HAG Patricia
Email : [Link]@[Link]
RIBERON Alexandre
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cet enseignement s’adresse aux étudiants qui n’ont pas fait de stage lors de leur cursus (M1 compris). Il s’agit de
donner les bases méthodologiques à la conduite d’un projet scientifique en écologie et/ou évolution ainsi qu’en
communication scientifique.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cette UE s’articule autour de 3 pôles complémentaires :
1) Acquisition de méthodes où seront traités les points suivants : planification, conduite de projet ; plans
d’échantillonnage et d’expérience ; recherche et outils bibliographiques ; rédaction scientifique.
2) Organisation journée scientifique
3) Réalisation d’un Ted-talk en anglais

MOTS-CLÉS
Bibliographie, Méthodes scientifiques, Projet

24
 UE PROJET TUTORE (Ptut) 6 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8ADU Projet : 100h
en français 150 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
JARGEAT Patricia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cette UE a pour objectif de permettre aux étudiants de valoriser leur expertise (expériences professionnelles,
associatives...) sur un groupe taxonomique donnée ou dans un domaine en lien avec la biodiversité.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Ce module est basé sur un travail personnel de l’étudiant, encadré par un spécialiste du domaine choisi.
Evaluation en toute fin d’année sur 1) rapport écrit, dont la forme dépend du thème étudié (clé de détermination
+ descriptions, relevés + descriptions, herbiers, ...) et qui présente le sujet (groupe étudié, classification, objectifs,
dans quel cadre, intérêt d’étudier ce groupe) et une conclusion mettant en avant ce qu’a apporté ce travail, s’il
y a des perspectives ou une valorisation possible 2) oral qui met en avant les connaissances acquises lors de
ce travail. A l’issue de cette UE, l’étudiant doit être capable d’utiliser des clés de détermination, la littérature
spécialisée et de reconnaı̂tre les organismes in situ. Une partie terrain est donc souhaitable.
Exemples : clé des Vespidées, des Abeilles, des Coccinnelles, des Odonates, la flore messicole des Alpes du Sud,
la flore du Cantal, les mousses de Toulouse, clé de détermination des Ericacées, des Orchidées, les champignons
de Toulouse, diversité des champignons coprophiles, oiseaux de Toulouse, passereaux du Pays Basque, rapaces
du sud de la France, poissons carnivores, clé des Loricariidae, clé des rongeurs du Maroc.

PRÉ-REQUIS
UE s’adressant aux étudiants ayant de solides connaissances et compétences naturalistes, pour un ou plusieurs
groupes taxonomiques, et souhaitant les valoriser.

SPÉCIFICITÉS
cette UE ne comporte pas d’heure en présentiel. Il s’agit d’un travail en autonomie, évalué sur un rapport et une
présentation orale

MOTS-CLÉS
Biologie des organismes, taxonomie, systématique, classification, terrain, observations, descriptions

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 UE SIG 1 3 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BAU Cours : 6h , TP : 18h en français 51 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
DEMAREZ Valerie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Etre capable d’exploiter les Systèmes d’Informations Géographiques (SIG) pour analyser des données spatialisées
afin de répondre aux enjeux de développement durable et de la transition écologique. Les SIG sont des outils
d’aide à la décision indispensables pour tous les métiers qui traitent des données numériques spatialisées : chargés
de missions dans un service de l’état, une collectivité, un bureau d’études ou une association de protection de
l’environnement ou les laboratoires de recherche. Leur usage s’est généralisé pour organiser/traiter/transmettre
des données liées à un territoire en soutien aux politiques publiques.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours :
- Bases de la cartographie, systèmes de coordonnées et systèmes de projections.
- Définition, concept et domaines d’application des SIG.
Travaux Pratiques en salle informatique :
- Prise en main du logiciel de SIG Arcgis Pro
- Apprentissage des fonctionnalités de base du logiciel Arcgis Pro : modes de visualisation, requêtes spatiales ou
attributaires, mise en page à partir de données fournies en TP.

PRÉ-REQUIS
aucun

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
SIG : CONCEPTS OUTILS ET DONNEES de Patricia Bordin, Hermes Science Publications (2002), 259 pages.
ISBN-13 : 978-2746205543
SIG - La dimension géographique du système d’information de Henri Pornon, Dunod ; Edition (2015), 320 pages.

MOTS-CLÉS
Géomatique, SIG, Ecologie, aménagement, biodiversité

26
 UE BIOLOGIE DE LA CONSERVATION 1 3 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BBU Cours : 12h , TD : 6h , TP : 6h en français 51 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BURRUS Monique
Email : [Link]@[Link]
ESCARAVAGE Nathalie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Apprendre à utiliser les concepts d’écologie, génétique et dynamique des populations appliquées à la conservation
de populations, des espèces et des habitats.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Après une introduction sur l’historique de la discipline et son évolution, le cours développera plusieurs points :
- Effondrement de la biodiversité (6e extinction) : Menaces, enjeux et défis
- Evaluation et conservation de la diversité génétique
- Viabilité et dynamique des populations
- Gestion des populations et des espèces : renforcements de populations, translocations d’individus, re-introductions
- Conservation des habitats (protection, restauration)
- Illustration par une intervention d’un professionnel/chercheur impliqué dans des programmes de conservation
Les TP porteront sur l’étude de cas concrets de conservation par groupes d’étudiants (etude de publications en
anglais).

PRÉ-REQUIS
Bonnes connaissances générales en écologie, notamment en génétique et dynamique des populations (S7 M1BEE),
en zoologie/botanique (L3 BBE, ex BOPE).

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Primack R.B. et al. 2012. Biologie de la conservation. Dunod. 360p.
Frankham R. et al. 2004. A primer of conservation genetics. 236p.

MOTS-CLÉS
Perte de biodiversité - Vortex d’extinction - Viabilité des petites populations - Conservation des espèces et des
habitats.

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 ANTHROPOBIOLOGIE ET ECOLOGIE HU-
UE 6 ECTS 2nd semestre
MAINE
Enseignement Travail personnel
KBEE8BCU Cours : 20h , TD : 20h , TP : 8h en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BRAGA Jose
Email : [Link]@[Link]
RIBERON Alexandre
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
L’objectif de cet enseignement est d’initier les étudiants à l’anthropologie biologique, ses concepts et ses méthodes.
Par ailleurs, cette UE cherche à privilégier une approche pluridisciplinaire afin de familiariser les étudiants à
travailler sur un objet d’étude en intégrant toutes les dimensions des questionnements et des acquis scientifiques.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Il s’agit de décrire et d’expliquer la diversité humaine et ses adaptations passées et actuelles tant sur le plan
génétique que phénotypique (morphologie, anatomie, physiologie, comportements, ...) ainsi que les interactions
des populations humaines avec leur environnement. En d’autres termes, l’humain sera envisagé en tant qu’être
biologique interagissant et évoluant avec son environnement physique, culturel et social.
A côté des approches fondamentales, les thématiques liées à l’anthropologie médicale et médico-légale seront
développées.

PRÉ-REQUIS
De la curiosité

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Anthropobiologie chez Masson. Éléments d’anthropologie biologique chez Ellipses.
Santé, Médecine et sciences de l’évolution : une introduction chez de Boeck.
Essentials of Biological Anthropology chez Norton & Company.

MOTS-CLÉS
Paléogénomique, Paléoanthropologie, Morphométrie géométrique, Génétique des populations, Sciences foren-
siques

28
 ECOLOGIE MICROBIENNE ET APPLICATIONS
UE 6 ECTS 2nd semestre
ENVIRONNEMENTALES
Enseignement Travail personnel
KBEE8BDU Cours : 22h , TD : 12h , TP : 14h en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
ROLS Jean-Luc
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cet enseignement propose d’aborder les bases de l’Ecologie des micro-organismes des milieux naturels étendues
à certains aspects de la Microbiologie environnementale, et de présenter les principaux outils de l’Ecologie mi-
crobienne. Il s’adresse à des étudiant·e·s motivé·e·s par l’utilisation de concepts d’Ecologie microbienne et la
pratique d’outils relevant de ce champ. Les connaissances acquises permettent de comprendre les relations entre
la biodiversité microbienne d’un écosystème et les fonctions qu’elle y exprime.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours magistraux : Ecologie microbienne. Le cours est structuré autour de diaporamas accessibles : (i) Approches
moléculaires et fonctionnelles de la biodiversité microbienne, (ii) habitats microbiens et adaptations, interactions
biotiques et réseaux microbiens, (iii) fonctionnalités microbiennes et cycles biogéochimiques (C, N, S, Fe, Mn),
et (iv) quelques applications (efflorescences nuisibles, biofilms phototrophes, décomposition, bioremédiation).
Travaux dirigés : Outils de l’écologie microbienne. Les TD permettent d’aborder les outils avec des applications
concrètes : (i) techniques de prélèvement, culture et conservation, (ii) détermination de la diversité microbienne,
(iii) cytométrie, (iv) mesure de biomasse et d’activités microbiennes, et (v) isotopie et biomarqueurs.
Travaux pratiques : Analyse d’articles scientifiques. Les TP proposent d’analyser des publications scientifiques du
domaine en préparant une communication orale ainsi qu’un poster.

PRÉ-REQUIS
Connaissances générales en Microbiologie et Ecologie.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Biologie des micro-organismes (2007), Madigan et al. (Eds), Pearson Education
Ecologie microbienne (2011), Bertrand et al. (Eds), Presses universitaires UPPA
La métagénomique (2015), Champomier-Vergès et al. (Eds), Quae

MOTS-CLÉS
Micro-organismes, Environnement, Biodiversité, Fonctions métaboliques, Interactions microbiennes.

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 ORIGINE ET HISTOIRE DE LA BIODIVERSITE
UE 6 ECTS 2nd semestre

Enseignement Travail personnel

KBEE8BEU Cours : 18h , TD : 16h , TP : 14h en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
RIBERON Alexandre
Email : [Link]@[Link]
THEBAUD Christophe
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Appréhender les principes et les méthodes des approches en macroécologie, biogéographie, et macroévolution.
Comprendre comment on reconstruit l’histoire des changements de distribution et d’abondance ainsi que des
caractéristiques des organismes
Comprendre les développements modernes de type  interscience  entre géologie, écologie, évolution, et
génétique moléculaire.
Etre capable de formuler des questions scientifiques et de comprendre comment on acquiert de nouvelles connais-
sances dans les domaines de la macroécologie, de la biogéographie et de la macroévolution.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Exposé des faits et théories concernant la distribution et de l’abondance de la biodiversité aux échelles régionale
et globale. Notamment : réintégration de la biogéographie dans les sciences et perspective macroécologique ;
géographie de la diversification des organismes : pourquoi certaines lignées d’organismes contiennent plus d’espèces
que les autres ; phylogéographie et biogéographie historique : changements d’aires de distribution, extinction ;
gradients latitudinaux de biodiversité : pourquoi la richesse spécifique varie avec la latitude, etc.
Explorer à travers diverses approches et à différentes échelles la variation phénotypique afin d’appréhender les
mécanismes générant cette variation.

PRÉ-REQUIS
Maı̂trise des concepts de base de biologie évolutive et de phylogénétique ; passion pour l’histoire naturelle et
l’histoire des sciences.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Biologie évolutive. Dir Thomas et al. De Boeck Supérieur
Lomolino MV. 2020. Biogeography : a very short introduction. Oxford Univ Press

MOTS-CLÉS
ADN, Biogéographie, Forme, Morphométrie géométrique, Variation

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 BIODIVERSITE DYNAMIQUE ECOSYSTEMES
UE 6 ECTS 2nd semestre
TROPICAUX
Enseignement Travail personnel
KBEE8BFU Cours : 18h , TD : 12h , TP : 10h , Terrain : 2,6666666666667 demi-journées
en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
LEGAL Luc
Email : [Link]@[Link]
ROY Melanie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Savoir situer et connaı̂tre les grandes caractéristiques des biomes tropicaux et leur distribution, en distinguant les
écosystèmes secs, de montagnes, maritimes ou forestiers.
Connaı̂tre les spécificités de la biodiversité tropicale, en termes de distribution géographique, de diversité taxono-
mique et phylogénétique, d’histoire biogéographique et d’adaptations. Évaluer les contraintes de chaque milieu,
pour identifier les contraintes de sélection mais aussi les enjeux des programmes de conservation. Rencontrer des
professionnels et acteurs en ethnobiologie et de la conservation de la biodiversité tropicale.
Construire un poster pour présenter une synthèse bibliographique et des enjeux de recherche en milieu tropical

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les enseignements introduisent la distribution et la diversité des écosystèmes tropicaux ainsi que leur diversité
taxonomique, et développent les caractéristiques mais aussi la dynamique et les enjeux de conservation dans
des écosystèmes secs, montagnards, aquatiques et forestiers. Les TD permettent l’illustration de questions de
recherches et des discussions avec des professionnels du milieu tropical, et les TP permettent la construction
de projets bibliographiques autour d’une question choisie. Les sorties prévoient une introduction à la diversité
tropicale dans les serres et collections du muséum d’histoire naturelle. L’ensemble de ce module s’adapte aux
questions d’actualités, et souligne les enjeux non seulement pour les écosystèmes tropicaux mais aussi pour
l’agriculture en milieu tropical (café par exemple).

PRÉ-REQUIS
bases de taxonomie, écologie, phylogénie

COMPÉTENCES VISÉES
L’objectif est d’acquerir une culture générale sur la biodiversité tropicale, de faire des liens avec les recherches
en écologie tropicale réalisées à Toulouse, de connaitre des grands enjeux actuels, de mobiliser des liens avec la
biogéographie, et enfin de communiquer sur la biodiversité tropicale à travers la constitution d’un poster.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Puig, Henri. 2001. La forêt tropicale humide. Collection Botanique. Paris : Belin.

MOTS-CLÉS
biodiversité, tropiques, conservation, biogéographie, interactions hommes-milieux

31
 DEVELOPPEMENT DURABLE TRANSITION
UE 3 ECTS 2nd semestre
TRANSFORMATION ECOLOGIQUE (DDTTE)
Sous UE Développement Durable, Transition et Transformation Ecologique tp
Enseignement Travail personnel
KBEE8BG2 TP : 12h en français 47 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
MORDELET Patrick
Email : [Link]@[Link]
OLIVA Priscia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Analyser, interpréter et critiquer des résultats de politiques publiques ou d’initiatives menées dans le cadre du
développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.
Mettre en œuvre une démarche pour un projet de développement durable dans un des domaines d’intérêt (ali-
mentation, énergie, déchets, agriculture, industrie minière, ...) dans un cadre associatif, privé ou institutionnel.
Restituer sous la forme de documents à visée de communication pour le grand public des actions menées dans le
cadre du développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours : concepts et méthodes en développement durable, transition et transformation écologique. Depuis l’histo-
rique du concept de développement durable (rapport Meadows, lois et outils de planification...) jusqu’à la mise
en œuvre des objectifs de développement durable, ces enseignements abordent toutes les facettes y compris les
aspects de déontologie (éthique et morale) et les controverses (greenwashing, ...). Les notions de ressources, de
durabilité, de déchets, de recyclage et de cycles de vie et d’une manière plus générale les relations Homme-Nature
sont au centre de ces enseignements qui s’articuleront autour de contenus théoriques et de mises en situations
(travaux pratiques) et qui bénéficieront d’approches pédagogiques innovantes et des TICES.
TP : en BEE : les démarches pour la mise en œuvre d’un Agenda 21, d’un PADD, d’un PCAET ou autres
(initiatives associatives autour de l’alimentation, des déchets, de l’énergie, de l’agriculture, ...) ou en ST : les
démarches autours de la mine responsable (aspects social et sociétal, énergie, environnement, biodiversité, res-
source, réhabilitation autours des initiatives et des normes internationales).

PRÉ-REQUIS
Connaissances générales en environnement, fonctionnement des institutions nationales et grands enjeux sociétaux
et écologiques actuels.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Bidou D., 2011. Le développement durable, l’intelligence du XXIème siècle / Bourg D. et al., 2016. L’âge de la
transition. / Hopkins R., 2010. Manuel de transition / Latouche S., 2019. La décroissance.

MOTS-CLÉS
Développement durable, transition écologique, transformation écologique, déontologie, initiatives, mine respon-
sable

32
 DEVELOPPEMENT DURABLE TRANSITION
UE 3 ECTS 2nd semestre
TRANSFORMATION ECOLOGIQUE (DDTTE)
Sous UE e-Développement Durable, Transition et Transformation Ecolog
Enseignement Travail personnel
KBEE8BGK e-TP : 4h en français 47 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
MORDELET Patrick
Email : [Link]@[Link]
OLIVA Priscia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Analyser, interpréter et critiquer des résultats de politiques publiques ou d’initiatives menées dans le cadre du
développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.
Mettre en œuvre une démarche pour un projet de développement durable dans un des domaines d’intérêt (ali-
mentation, énergie, déchets, agriculture, industrie minière, ...) dans un cadre associatif, privé ou institutionnel.
Restituer sous la forme de documents à visée de communication pour le grand public des actions menées dans le
cadre du développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours : concepts et méthodes en développement durable, transition et transformation écologique. Depuis l’histo-
rique du concept de développement durable (rapport Meadows, lois et outils de planification...) jusqu’à la mise
en œuvre des objectifs de développement durable, ces enseignements abordent toutes les facettes y compris les
aspects de déontologie (éthique et morale) et les controverses (greenwashing, ...). Les notions de ressources, de
durabilité, de déchets, de recyclage et de cycles de vie et d’une manière plus générale les relations Homme-Nature
sont au centre de ces enseignements qui s’articuleront autour de contenus théoriques et de mises en situations
(travaux pratiques) et qui bénéficieront d’approches pédagogiques innovantes et des TICES.
TP : en BEE : les démarches pour la mise en œuvre d’un Agenda 21, d’un PADD, d’un PCAET ou autres
(initiatives associatives autour de l’alimentation, des déchets, de l’énergie, de l’agriculture, ...) ou en ST : les
démarches autours de la mine responsable (aspects social et sociétal, énergie, environnement, biodiversité, res-
source, réhabilitation autours des initiatives et des normes internationales).

PRÉ-REQUIS
Connaissances générales en environnement, fonctionnement des institutions nationales et grands enjeux sociétaux
et écologiques actuels.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Bidou D., 2011. Le développement durable, l’intelligence du XXIème siècle / Bourg D. et al., 2016. L’âge de la
transition. / Hopkins R., 2010. Manuel de transition / Latouche S., 2019. La décroissance.

MOTS-CLÉS
Développement durable, transition écologique, transformation écologique, déontologie, initiatives, mine respon-
sable

33
 DEVELOPPEMENT DURABLE TRANSITION
UE 3 ECTS 2nd semestre
TRANSFORMATION ECOLOGIQUE (DDTTE)
Sous UE Développement Durable, Transition et Transformation Ecologique
Enseignement Travail personnel
KBEX8BG1 Cours : 12h en français 47 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
MORDELET Patrick
Email : [Link]@[Link]
OLIVA Priscia
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Analyser, interpréter et critiquer des résultats de politiques publiques ou d’initiatives menées dans le cadre du
développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.
Mettre en œuvre une démarche pour un projet de développement durable dans un des domaines d’intérêt (ali-
mentation, énergie, déchets, agriculture, industrie minière, ...) dans un cadre associatif, privé ou institutionnel.
Restituer sous la forme de documents à visée de communication pour le grand public des actions menées dans le
cadre du développement durable, de la transition ou de la transformation écologique.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours : concepts et méthodes en développement durable, transition et transformation écologique. Depuis l’histo-
rique du concept de développement durable (rapport Meadows, lois et outils de planification...) jusqu’à la mise
en œuvre des objectifs de développement durable, ces enseignements abordent toutes les facettes y compris les
aspects de déontologie (éthique et morale) et les controverses (greenwashing, ...). Les notions de ressources, de
durabilité, de déchets, de recyclage et de cycles de vie et d’une manière plus générale les relations Homme-Nature
sont au centre de ces enseignements qui s’articuleront autour de contenus théoriques et de mises en situations
(travaux pratiques) et qui bénéficieront d’approches pédagogiques innovantes et des TICES.
TP : en BEE : les démarches pour la mise en œuvre d’un Agenda 21, d’un PADD, d’un PCAET ou autres
(initiatives associatives autour de l’alimentation, des déchets, de l’énergie, de l’agriculture, ...) ou en ST : les
démarches autours de la mine responsable (aspects social et sociétal, énergie, environnement, biodiversité, res-
source, réhabilitation autours des initiatives et des normes internationales).

PRÉ-REQUIS
Connaissances générales en environnement, fonctionnement des institutions nationales et grands enjeux sociétaux
et écologiques actuels.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Bidou D., 2011. Le développement durable, l’intelligence du XXIème siècle / Bourg D. et al., 2016. L’âge de la
transition. / Hopkins R., 2010. Manuel de transition / Latouche S., 2019. La décroissance.

MOTS-CLÉS
Développement durable, transition écologique, transformation écologique, déontologie, initiatives, mine respon-
sable

34
 UE SIG 2 3 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BHU Cours : 6h , TP : 18h en français 51 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
DEMAREZ Valerie
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Aborder le développement durable, les impacts de l’aménagement du territoire sur les écosystèmes, les solutions
pour les éviter/réduire/compenser.
Etre capable d’exploiter les Systèmes d’Informations Géographiques (SIG) pour analyser des données spatialisées
afin de répondre aux enjeux de développement durable et de la transition écologique. Les SIG sont des outils
d’aide à la décision indispensables pour tous les métiers qui traitent des données numériques spatialisées : chargés
de missions dans un service de l’état, une collectivité, un bureau d’études ou une association de protection de
l’environnement ou les laboratoires de recherche. Leur usage s’est généralisé pour organiser/traiter/transmettre
des données liées à un territoire en soutien aux politiques publiques.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours en amphi privilégiant une pédagogie interactive :
- Gestion écologique et différenciée, aménagement des écosystèmes, du territoire, perturbations anthropiques,
développement durable et transition écologique, paysages, étude d’impact environnemental, diagnostic territorial,
agriculture durable,  questions écologiquement vives  (trame verte et bleue, périurbanisation, gestion de l’eau,
pratiques agricoles...).
Travaux Pratiques en salle informatique :
Objectif : Etre capable, à la fin de l’UE, de mobiliser les outils découverts dans le module SIG-1, afin de mener
en autonomie un projet sur la thématique du développement durable et de la transition écologique.
Pour cela vous apprendrez à :
- définir les besoins d’un projet SIG (recherche bibliographique, webographique, rédaction d’un cahier des charges)
- Collecter des données (internet, in-situ) en utilisant les outils appropriés
- Réaliser des requêtes (spatiales, attributaires) élaborées
- Construire un Atlas cartopraphique
- les outils de webmapping seront également abordés

PRÉ-REQUIS
Avoir suivi les enseignements du module SIG-1.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
SIG : CONCEPTS OUTILS ET DONNEES de Patricia Bordin, Hermes Science Publications (2002), 259 pages.
ISBN-13 : 978-2746205543
SIG - La dimension géographique du système d’information de Henri Pornon, Dunod ; Edition (2015), 320 pages.

MOTS-CLÉS
Géomatique, SIG, Ecologie, aménagement, biodiversité

35
 UE BIOLOGIE DE LA CONSERVATION 2 3 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BIU Cours : 12h , TP : 12h en français 51 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BURRUS Monique
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Connaı̂tre les principaux outils, instances et directives en France et à l’international pour la conservation et la
protection des espèces et des espaces
Comprendre que la Biologie de la conservation est une science interdisciplinaire, incluant par essence l’homme,
et ses potentiels aspects normatifs

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Seront abordées les diverses composantes pratiques de la conservation, par exemple les statuts de protec-
tion/conservation, les outils usuels de protection et de conservation (aires protégées, ZNIEFF, Natura2000...), les
outils d’aménagement du territoire (Trames, SRCE...), les Plans Nationaux d’Action, les conventions internatio-
nales, les liens agriculture et biodiversité...
Les TP porteront sur la préparation et la soutenance d’un mémoire à partir d’articles scientifiques, d’enquêtes ou
d’interviews portant sur la conservation de populations et d’espèces (in situ et ex-situ), pertinence des politiques
nationales, bilan de programmes de conservation...

PRÉ-REQUIS
Ce module nécessite d’avoir suivi [u]impérativement [/u]l’UE Biologie de la conservation-1 de M1 BEE

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Biologie de la conservation Primack, Sarrazin, Lecompte. 2012.

MOTS-CLÉS
L’Homme face aux espaces naturels et espèces sauvages - Listes rouges IUCN - Espèces déterminantes - Politiques
d’aménagement - Agroécologie

36
 ECOSYSTEMES TERRESTRES ET CHANGE-
UE 6 ECTS 2nd semestre
MENT CLIMATIQUE (ecoter chgtclim)
Travail personnel
KBEE8BJU Cours : 20h , TD : 6h , TP : 16h , Terrain : 4 demi-journéesEnseignement
en français 96 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
LAMAZE Thierry
Email : [Link]@[Link]
PELLE Nathalie
Email : jaroszn@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Comprendre et analyser le fonctionnement carboné, azoté, hydrique et énergétique des écosystèmes terrestres
dans le contexte du changement climatique.
Evaluer les potentiels d’atténuation des émissions de gaz à effet de serre (notamment CO2, N2O, CH4) de ces
écosystèmes sur le réchauffement global.
Comprendre et reconstituer les variations climatiques passées pour comprendre l’évolution du climat actuel et
futur.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Dans un premier temps, est présenté le contexte général des changement climatiques et les interrogations scien-
tifiques associées. Sont ensuite abordés les principaux processus régissant les bilans carbone, hydrique, azote et
radiatif ainsi que les potentiels d’atténuation des émissions de gaz à effet de serre (CO2, N2O et CH4) des
écosystèmes terrestres ainsi que leurs variations en fonction des facteurs biotiques et abiotiques. Diverses échelles
d’étude sont présentées ainsi que les méthodologies actuellement utilisées permettant d’appréhender ces échanges
de masse et d’énergie entre les couverts végétaux, l’atmosphère et le sol. Les travaux dirigés sont dédiés à la
lecture critique d’articles scientifiques. Enfin, les travaux pratiques sont consacrés à l’analyse et l’interprétation
de jeux de données en partie acquis lors des sorties terrain, sur des sites expérimentaux sur cultures et en forêt
afin étudier les processus régissant le fonctionnement des écosystèmes terrestres et leurs réponses aux conditions
environnementales : mesures d’échanges gazeux, mesures dendrométriques, mesures agrométéorologiques ainsi
que reconstitution des variations climatiques passées.

PRÉ-REQUIS
Ecologie générale.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Campbell G.S. & J. Norman (1998) An Introduction to Environmental Biophysics. Springer. 2nd ed.
Jones H.G. (2014) Plants and microclimate. A quantitative approach to environmental plant physiology. Cam-
bridge University Press. 3rd ed.

MOTS-CLÉS
Fonctionnement des écosystèmes terrestres, climat, gaz à effet de serre, atténuation

37
 ECOTOXICOLOGIE & EVALUATION DU
UE 6 ECTS 2nd semestre
RISQUE
Enseignement Travail personnel
KBEE8BKU Cours : 24h , TD : 12h , TP : 12h en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
GAUTHIER Laury
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Les enseignements dispensés dans le cadre du module ont pour objectif principal de familiariser l’étudiant.e
avec les concepts fondamentaux de la discipline et de comprendre leur utilisation dans le contexte règlementaire
actuel sur l’environnement. A partir des connaissances générales acquises sur la structure et le fonctionnement
de l’environnement, la notion de  dysfonctionnement  est discutée notamment en lien avec les activités
humaines. Les connaissances générées permettent à l’étudiant de mieux appréhender Les outils de diagnostic et
de prédiction des effets sur les systèmes biologiques tels qu’ils sont appliqués aujourd’hui, notamment dans le
cadre des démarches règlementaires d’évaluation du risque environnemental.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

A partir d’une présentation des concepts historiques, le caractère pluridisciplinaire de l’écotoxicologie (interrela-
tions physico-chimie / toxicologie / écologie) est présenté ainsi que les grandes familles de polluants. Les principes
de l’intoxication des systèmes biologiques sont analysés aux différentes échelles de l’organisation du vivant. Les ou-
tils de l’écotoxicologie sont abordés en insistant sur l’apport des biomarqueurs et leur utilisation dans l’évaluation
du risque environnemental. La prédiction des effets est envisagée à travers les outils normalisés développés en
écotoxicologie règlementaire.
Des exemples sont traités à travers des études de cas concernant les risques liés aux activités humaines (traitement
de dépollution, production de déchets, risques sanitaires et environnementaux, etc...). Selon les disponibilités, ces
activités pourront être illustrées au cours de visites de sites industriels, par exemple.

PRÉ-REQUIS
Pas de prérequis particulier pour les étudiants issus des filières écologie et/ou sciences du vivant en général

SPÉCIFICITÉS
Possibilité de déplassement sur sites extérieurs à l’Université

COMPÉTENCES VISÉES
Acquisition des connaissances fondamentales en toxicologie environnementale
Compréhension de la mise en oeuvre des outils de l’écotoxicologie dans le cadre d’actions de dépollution
Poser un diagnostic environnemental dans le cadre règlementaire actuel

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Ecotoxicologie, coll. Sciences Sup, cours et applications, DUNOD Edt, 2022
Chimie & Environnement, coll. Sciences Sup, cours, études de cas et exercices corrigés, Dunod Edt

MOTS-CLÉS
Ecotoxicologie, Evaluation du Risque Environnemental, pollution, remédiation, biomarqueurs

38
 ECOLOGIE AQUATIQUE DE TERRAIN
UE 6 ECTS 2nd semestre
(eco aqua ter)
Enseignement Travail personnel
KBEE8BLU Terrain : 12 demi-journées
en français 114 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
BROSSE Sebastien
Email : [Link]@[Link]
JACQUIN Lisa
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cet enseignement a pour but de former les étudiants aux techniques d’études et de diagnostic des écosystèmes
d’eau douce, depuis l’échantillonnage sur le terrain jusqu’à l’exploitation des données recueillies. Ces compétences
sont recherchées dans le milieu professionnel de la recherche fondamentale et appliquée, ainsi que dans les bureaux
d’études en environnement.
Il s’agit d’un enseignement de terrain au cours duquel les étudiants s’initieront à l’utilisation de différentes
techniques de collecte de données concernant les poissons, les macro-invertébrés benthiques, le plancton et la
physico-chimie de l’eau. Les données recueillies seront ensuite traitées par les étudiants et les résultats obtenus
feront l’objet d’un rapport individuel.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

L’enseignement se fait sous la forme d’un stage de terrain durant lequel les étudiants seront formés aux :
- Mesures physicochimiques en lac et en cours d’eau.
- Échantillonnage de plancton et d’algues benthiques, détermination de biomasse algale et de production primaire.
- Échantillonnage de macro-invertébrés benthiques sur le terrain, puis détermination en salle de TP des grands
groupes de macro-invertébrés et calcul d’indices biotiques reflétant l’état écologique des cours d’eau.
- Échantillonnage de poissons en cours d’eau par pêche électrique, calcul de stock et analyse des données dans
une optique de diagnostic environnemental.
Chaque étudiant sera évalué sur la base d’un rapport individuel faisant la synthèse des travaux réalisés sur le
terrain et en laboratoire.

PRÉ-REQUIS
aucun

SPÉCIFICITÉS
Enseignement en français.
Lieux : terrain en Région Occitanie et TP sur le campus Université Paul Sabatier

COMPÉTENCES VISÉES
- Réaliser des mesures physico-chimiques et biologiques sur le terrain
- Réaliser une pêche électrique par déplétion
- Réaliser des collectes standardisées de macro-invertébrés et de plancton
- Estimer un stock de poissons
- Identifier la faune aquatique (poissons et macro-invertebrés) à l’aide de clés de détermination
- Traiter et interpréter des données de terrain
- Calculer des indices de qualité environnementale
- Faire un diagnostic d’état écologique d’un cours d’eau
- Rédiger un rapport synthétique

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES

39
Allan D.J. and Castillo M.M. 2007. Stream Ecology, structure and function of running waters. 2nd edition.
Springer.
Persat H., Keith P., Feunteun E., Allardi J. [Link] poissons d’eau douce de France. MNHN/Biotope Editions

MOTS-CLÉS
Indices biotiques, pêche électrique, estimation de stock, invertébrés aquatiques, inventaire faunistique, qualité
environnementale, diagnostic écologique

40
 APPROCHE PRATIQUE ECOLOGIE EVOLU-
UE 6 ECTS 2nd semestre
TION
Enseignement Travail personnel
KBEE8BMU Cours : 4h , TP : 2h , Terrain : 14 demi-journées
en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
ANDALO Christophe
Email : [Link]@[Link]
BLANCHARD Pierrick
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Conduire une étude scientifique de terrain dans son intégralité de manière autonome en petits groupes.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les étudiants élaborent une hypothèse de travail en rapport avec une question scientifique de leur choix, conduisent
les plans d’expériences et/ou d’échantillonnage correspondants et restituent leur démarche et résultats par oral
et par écrit. Pour cela, les étudiants auront à leur disposition du matériel technique, informatique et des ouvrages
scientifiques.
L’évaluation se fera sous forme de deux soutenances orales (l’une individuelle, ayant comme support une publica-
tion récente extraite d’un journal de premier plan dans la discipline et l’autre, par groupe, sur le travail mené au
cours du stage) et sur la base d’un court rapport rédigé par groupe au format d’une publication scientifique.

PRÉ-REQUIS
Accepter le manque de confort et la vie en collectivité.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
The R Book, 2nd Edition. M.J. Crawley. 2012. Wiley
Qu’est-ce que la science ? Alan F. Chalmers. 1990. Le Livre de Poche.
Guides naturalistes.

MOTS-CLÉS
Hypothèses scientifiques ; plans d’expérience / d’échantillonnage ; récolte et analyse de données ; terrain ; écologie
évolutive

41
 COMMUNAUTES VEGETALES DU SUD DE
UE 6 ECTS 2nd semestre
L’EUROPE (ComSudEur)
Travail personnel
KBEE8BNU Cours : 16h , TD : 4h , TP : 4h , Terrain : 12 demi-journéesEnseignement
en français 90 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
JARGEAT Patricia
Email : [Link]@[Link]
KANIEWSKI David
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Cette UE a pour objectifs 1) d’apporter les connaissances et les outils pour comprendre le déterminisme de la
végétation du Sud de la France et 2) de présenter les adaptations des plantes en milieu contraignant (littoral,
montagne, zones humides, milieu méditerranéen).

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours et TD :
- Déterminismes climatiques et stationnels de la végétation
- Approche historique de la couverture végétale
- Rôle de l’homme dans la dynamique des communautés végétales
- Adaptations morphologiques et physiologiques
TP terrain :
6 jours de TP terrain en région méditerranéenne et dans les landes de Gascogne permettront aux étudiants de
réaliser des relevés floristiques qui seront ensuite analysés pour comprendre la distribution des communautés
végétale et permettront d’illustrer le cours (observations des adaptations in situ).
TP :
Traitement statistique des relevés floristiques effectués sur le terrain, et confrontation de ceux-ci à des données
publiées, dans une optique de diagnostic et de gestion des milieux étudiés

PRÉ-REQUIS
PRE-REQUIS :
Pas de pré-requis exigé mais cet enseignement s’adresse néanmoins à des étudiants ayant acquis des bases de
botanique - systématique

SPÉCIFICITÉS
1 semaine de TP terrain en zone méditerranéenne (autour de Perpignan)

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Ozenda P. (1994) Végetation du continent européen, Delachaux et Niestlé, 271 p.
Dupias G. (1985) Notice détaillée de la végétation des Pyrénées 69-Bayonne, 70-Tarbes, 71-Toulouse, 72- Car-
cassonne, 76-Luz, 77-Foix, 78-Perpignan. CNRS, 212 p

MOTS-CLÉS
Phytoécologie de terrain, Diagnostic écologique, Anthropisation, Déterminisme de la végétation

42
 UE EXPERTISE NATURALISTE 6 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BOU Cours : 8h , TP : 16h , Terrain : 10 demi-journées
en français 96 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
CAMPAN Erick
Email : [Link]@[Link]
PELOZUELO Laurent
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Acquisition de compétences scientifiques et naturalistes en Entomologie et Herpétologie pour une orientation vers
les métiers de l’étude et de la gestion conservatoire des espèces d’intérêt (entomologiste, herpétologue, chargé
d’étude, chef de projet, chargé de mission, animateur de site natura 2000...).

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cours magistraux : Diversité entomologique et herpétologique / Causes de leur effondrement / Techniques
d’études et bases pour l’identification de spécimens (Odonates, Orthoptères, Lépidoptères,  Amphibiens  et
 Reptiles ) incluant des aspects évolutifs et de l’écologie chimique / Méthodes d’échantillonnages des popu-

lations d’insectes.
Travaux pratiques : Utilisation de clés de détermination et de guides spécialisés pour l’identification de spécimens
en collection et l’apprentissage de leurs écologies et statuts.
Sortie de terrain : 5 jours de terrain à la rencontre des groupes étudiés et de leurs milieux de vie en zone
méditerranéenne. Mise en pratique sur le terrain des techniques et des protocoles d’échantillonnage, identification
de spécimens, rencontre avec des gestionnaires d’espaces naturels.

PRÉ-REQUIS
Ce module nécessite de bonnes connaissances dans les domaines de la zoologie et de l’entomologie (Lic. BOPE
/ BBE).

COMPÉTENCES VISÉES
Utiliser une clé pour la détermination d’insectes
Evaluer les enjeux écologiques représentés par une espèce d’Insecte ou de  Reptile , d’ Amphibien 

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Orthoptères de France, Belgique, Luxembourg et Suisse. 2015. E. Sardet, C. Roesti & Y. Braud.
Libellules de France, Belgique et Luxembourg. 2012. D. Grand & J.P. Boudot.
Reptiles de France, Belgique, Luxembourg et Suisse. 2010. J.P. Vacher.

MOTS-CLÉS
Entomofaune, Herpétofaune, Espèces menacées, Espèces protégées, Gestion conservatoire, Contrôle des insectes
 nuisibles .

43
 UE GENOMIQUE ENVIRONNEMENTALE 6 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BPU Cours : 20h , TD : 8h , TP : 20h en français 102 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
ROY Melanie
Email : [Link]@[Link]
SEGUIN-ORLANDO Andaine
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
Définir la génomique environnementale, les objets qu’elle permet d’étudier (communauté complexe, génome
d’organismes non modèles, niveau de variabilité, ADN ancien), les conditions de mise en œuvre (échantillonnage,
choix des marqueurs et des techniques de séquençage), les outils bioinformatiques nécessaires (différents pipelines),
les limitations et précautions (variabilité intra et interspécifique, contaminations, seuils...).
Choisir et utiliser des outils bioinformatiques pour analyser un jeu de données dans le cadre d’un projet défini en
début de module pour illustrer par des exemples précis et concrets les applications de ces techniques en lien avec
les questions écologiques ou évolutives initiales.

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Les CM introduiront les définitions, outils et applications de la génomique environnementale et creuseront des
grands thèmes d’actualité tels l’étude de la biodiversité passée via l’ADN ancien, l’écologie microbienne et des
interactions, et les applications dans le domaine de la conservation. Les limites de ces techniques, telles que la
notion d’individu, les limites de détection et le choix des marqueurs, seront abordées afin d’encourager une lecture
critique d’articles proposée en TD. Les TD seront l’occasion de rencontres avec des professionnels utilisant la
génomique environnementale au laboratoire et sur le terrain. Les TP permettront d’analyser un jeu de données
simplifié pour découvrir les outils de la génomique environnementale.

PRÉ-REQUIS
utilisation de R, connaissances de bases de biologie moléculaire (ADN, amplification)

COMPÉTENCES VISÉES
L’objectif est de mobiliser des connaissances, de comprendre des bases de langage bioinformatique, et d’avoir les
outils pour suivre les actualités dans le domaine de la génomique environnementale.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Faure D. & Joly D. La génomique environnementale : La révolution du séquençage à haut débit. ISTE Group,
2016.
Taberlet P., Coissac E., Hajibabaei M. & Rieseberg L.H.. Environmental DNA. Molecular ecology21, no. 8 (2012) :
1789-1793.

MOTS-CLÉS
eDNA, metabarcoding, -omics, NGS

44
 BIOSTATISTIQUES : UTILISATION DU MO-
UE 3 ECTS 2nd semestre
DELE NON LINEAIRE
Enseignement Travail personnel
KBEE8BQU Cours : 4h , TP : 24h en français 47 h
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ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
ANDALO Christophe
Email : [Link]@[Link]
FERDY Jean-Baptiste
Email : [Link]@[Link]

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 UE ANALYSE DES DONNÉES MULTIVARIÉES 3 ECTS 2nd semestre
Enseignement Travail personnel
KBEE8BRU Cours : 8h , TP : 16h en français 51 h
[ Retour liste de UE ]

ENSEIGNANT(E) RESPONSABLE
GRENOUILLET Gael
Email : [Link]@[Link]

OBJECTIFS D’APPRENTISSAGE
A l’issue de cet enseignement, les étudiants devront être à même :
— d’organiser des données et de formuler une problématique pertinente
— de choisir la (ou les) méthode(s) d’analyse en fonction de la nature des données et de la problématique
formulée
— de mettre en œuvre ces méthodes (utilisation du logiciel R)
— de représenter graphiquement et d’interpréter les résultats
— de rédiger les conclusions dans un rapport de synthèse

DESCRIPTION SYNTHÉTIQUE DES ENSEIGNEMENTS

Cet enseignement propose une présentation des principales méthodes d’analyse adaptées aux données multidi-
mensionnelles. Les méthodes abordées seront illustrées à partir d’exemples réels provenant d’études écologiques.
L’enseignement cherchera à montrer plus particulièrement en quoi (1) la nature complexe des systèmes biolo-
giques conduit souvent à la nécessité de prendre en compte un grand nombre de descripteurs, et (2) l’écologie
est un champ d’application privilégié des diverses méthodes abordées.
Les aspects théoriques indispensables à la compréhension et à la bonne utilisation de ces méthodes seront traités
au cours des CM. Les TP, en salle informatique, permettront aux étudiants de mettre en pratique ces méthodes
et donneront une place importante à l’interprétation écologique des résultats statistiques. Enfin, un projet réalisé
en fin d’UE par binôme permettra aux étudiants d’être confrontés à un problème biologique concret. Ce projet
portera sur l’analyse d’un jeu de données collecté dans le cadre d’une étude écologique et aboutira à la rédaction
d’un rapport.

PRÉ-REQUIS
Une UE de biostatistiques élémentaires est exigée, ainsi que des connaissances de base du logiciel R.

RÉFÉRENCES BIBLIOGRAPHIQUES
Escoffier & Pagès. Analyses factorielles simples et multiples - Objectifs, méthodes et interprétation. Dunod
Lebart, Piron, & Morineau. Statistiques exploratoire multidimensionnelle. Dunod

MOTS-CLÉS
Analyses factorielles ; structure des tableaux de données en écologie ; liaisons entre descripteurs (biologiques,
environnementaux, ...)

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 GLOSSAIRE

TERMES GÉNÉRAUX

SYLLABUS
Dans l’enseignement supérieur, un syllabus est la présentation générale d’un cours ou d’une formation. Il inclut :
objectifs, programme de formation, description des UE, prérequis, modalités d’évaluation, informations pratiques,
etc.

DÉPARTEMENT
Les départements d’enseignement sont des structures d’animation pédagogique internes aux composantes (ou
facultés) qui regroupent les enseignantes et enseignants intervenant dans une ou plusieurs mentions.

UE : UNITÉ D’ENSEIGNEMENT
Un semestre est découpé en unités d’enseignement qui peuvent être obligatoires, à choix ou facultatives. Une UE
représente un ensemble cohérent d’enseignements auquel sont associés des ECTS.

UE OBLIGATOIRE / UE FACULTATIVE
L’UE obligatoire fait référence à un enseignement qui doit être validé dans le cadre du contrat pédagogique.
L’UE facultative vient en supplément des 60 ECTS de l’année. Elle est valorisée dans le supplément au diplôme.
L’accumulation de crédits affectés à des UE facultatives ne contribue pas à la validation de semestres ni à la
délivrance d’un diplôme.

ECTS : EUROPEAN CREDITS TRANSFER SYSTEM

Les ECTS constituent l’unité de mesure commune des formations universitaires de licence et de master dans
l’espace européen. Chaque UE obtenue est ainsi affectée d’un certain nombre d’ECTS (en général 30 par semestre
d’enseignement, 60 par an). Le nombre d’ECTS varie en fonction de la charge globale de travail (CM, TD, TP,
etc.) y compris le travail personnel. Le système des ECTS vise à faciliter la mobilité et la reconnaissance des
diplômes en Europe.

TERMES ASSOCIÉS AUX DIPLOMES

Les diplômes sont déclinés en domaines, mentions et parcours.

DOMAINE
Le domaine correspond à un ensemble de formations relevant d’un champ disciplinaire ou professionnel commun.
La plupart des formations de l’UT3 relèvent du domaine  Sciences, Technologies, Santé .

MENTION
La mention correspond à un champ disciplinaire. Il s’agit du niveau principal de référence pour la définition des
diplômes nationaux. La mention comprend, en général, plusieurs parcours.

PARCOURS
Le parcours constitue une spécialisation particulière d’un champ disciplinaire choisie par l’étudiant·e au cours de
son cursus.

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LICENCE CLASSIQUE
La licence classique est structurée en six semestres et permet de valider 180 crédits ECTS. Les UE peuvent
être obligatoires, à choix ou facultatives. Le nombre d’ECTS d’une UE est fixé sur la base de 30 ECTS pour
l’ensemble des UE obligatoires et à choix d’un semestre.

LICENCE FLEXIBLE
À la rentrée 2022, l’université Toulouse III - Paul Sabatier met en place une licence flexible. Le principe est
d’offrir une progression ”à la carte” grâce au choix d’unités d’enseignement (UE). Il s’agit donc d’un parcours
de formation personnalisable et flexible dans la durée. La progression de l’étudiant·e dépend de son niveau de
départ et de son rythme personnel. L’inscription à une UE ne peut être faite qu’à condition d’avoir validé les
UE pré-requises. Le choix de l’itinéraire de la licence flexible se fait en concertation étroite avec une direction
des études (DE) et dépend de la formation antérieure, des orientations scientifiques et du projet professionnel de
l’étudiant·e. L’obtention du diplôme est soumise à la validation de 180 crédits ECTS.

DIRECTION DES ÉTUDES ET ENSEIGNANT·E RÉFÉRENT·E

La direction des études (DE) est constituée d’enseignantes et d’enseignants référents, d’une directrice ou d’un
directeur des études et d’un secrétariat pédagogique. Elle organise le projet de formation de l’étudiant·e en
proposant une individualisation de son parcours pouvant conduire à des aménagements. Elle est le lien entre
l’étudiant·e, l’équipe pédagogique et l’administration.

TERMES ASSOCIÉS AUX ENSEIGNEMENTS

CM : COURS MAGISTRAL(AUX)
Cours dispensé en général devant un grand nombre d’étudiantes et d’étudiants (par exemple, une promotion
entière), dans de grandes salles ou des amphithéâtres. Ce qui caractérise également le cours magistral est qu’il est
le fait d’une enseignante ou d’un enseignant qui en définit les structures et les modalités. Même si ses contenus
font l’objet de concertations avec l’équipe pédagogique, chaque cours magistral porte donc la marque de la
personne qui le crée et le dispense.

TD : TRAVAUX DIRIGÉS
Ce sont des séances de travail en groupes restreints (de 25 à 40 étudiantes et étudiants selon les composantes),
animées par des enseignantes et enseignants. Les TD illustrent les cours magistraux et permettent d’approfondir
les éléments apportés par ces derniers.

TP : TRAVAUX PRATIQUES
Méthode d’enseignement permettant de mettre en pratique les connaissances théoriques acquises durant les CM
et les TD. Généralement, cette mise en pratique se réalise au travers d’expérimentations et les groupes de TP
sont constitués de 16 à 20 étudiantes et étudiants. Certains travaux pratiques peuvent être partiellement encadrés
ou peuvent ne pas être encadrés du tout. A contrario, certains TP, du fait de leur dangerosité, sont très encadrés
(jusqu’à une enseignante ou un enseignant pour quatre étudiantes et étudiants).

PROJET OU BUREAU D’ÉTUDE

Le projet est une mise en pratique en autonomie ou en semi-autonomie des connaissances acquises. Il permet de
vérifier l’acquisition de compétences.

TERRAIN
Le terrain est une mise en pratique encadrée des connaissances acquises en dehors de l’université.

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STAGE
Le stage est une mise en pratique encadrée des connaissances acquises dans une entreprise ou un laboratoire
de recherche. Il fait l’objet d’une législation très précise impliquant, en particulier, la nécessité d’une convention
pour chaque stagiaire entre la structure d’accueil et l’université.

SESSIONS D’ÉVALUATION
Il existe deux sessions d’évaluation : la session initiale et la seconde session (anciennement appelée ”session
de rattrapage”, constituant une seconde chance). La session initiale peut être constituée d’examens partiels et
terminaux ou de l’ensemble des épreuves de contrôle continu et d’un examen terminal. Les modalités de la seconde
session peuvent être légèrement différentes selon les formations.

SILLON
Un sillon est un bloc de trois créneaux de deux heures d’enseignement. Chaque UE est généralement affectée à un
sillon. Sauf cas particuliers, les UE positionnées dans un même sillon ont donc des emplois du temps incompatibles.

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