MICROBIOLOGIE

BGN : Entérobactéries · Pseudomonas · Vibrionaceae

Faculté de Médecine d'Alger — 3ème Année Médecine

Réo complete & tableaux de synthèse
by Dr Larab Sara

I. ENTEROBACTERIES — GENERALITES
Grande famille bactérienne : > 30 genres, 140 espèces. Hôtes habituels du tube digestif de l'homme et des
animaux.

Caractères définissant la famille

CARACTÈRE DÉTAIL

Morphologie BGN (Bacilles à Gram Négatif)

Oxydase Négative ❌

Milieu de culture Se développent sur milieux ordinaires

Métabolisme Aéro-anaérobie facultatif (AAF)

Nitrates Réduction des NO₃⁻ en NO₂⁻

Glucose Fermentation du glucose

Mobilité Mobiles (ciliature péritriche) SAUF Klebsiella et Shigella (immobiles)

Les 3 types d'antigènes

Antigène Localisation Nature chimique Toxicité / Remarque

O (somatique) Paroi (LPS) Polyosidique Endotoxine - TRÈS TOXIQUE

H (flagellaire) Flagelles Protéique Non toxique

K / Vi
Enveloppe / Capsule Polyosidique Adhésines sur pili (fimbriae)
(capsulaire)

Répartition en genres — critères biochimiques

La distinction entre genres se fait par : fermentation du lactose, production d'indole, production d'uréase,
production d'acétoïne...

1 — ESCHERICHIA COLI
Caractères bactériologiques
• Mobile, Indole (+), Lactose (+), Citrate (-)
• Sérotypes selon : Ag O + H (ex. O157:H7) ou Ag K (ex. K1)
• Espèce dominante de la flore aérobie colique

Pathotypes intestinaux (IMPORTANT ++)

Sigle Nom Mécanisme Clinique

ETEC Entérotoxinogènes Sécrétion d'entérotoxine Diarrhée cholera-like

Cytotoxine SLT (Shiga-like

Diarrhée aqueuse →
toxin) + abrasion de la
EHEC Entérohémorragiques hémorragique, sans pus ni
bordure en brosse des
fièvre
villosités intestinales

Invasion de la muqueuse Diarrhée aigue Dysenterie-

EIEC Entéroinvasifs
colique like

Adhésion particulière (ni

EPEC Entéropathogènes sécrétrices d'entérotoxine, ni Diarrhée (surtout enfant)
entéro-invasives)

Infections extra-intestinales
• Infections urinaires (souches uropathogènes)
• Intra-abdominales : cholécystites, péritonites, appendicites
• Méningites néonatales (E. coli K1 +++)
• Bactériémies, infections ostéo-articulaires, infections de plaies

Diagnostic bactériologique
• Prélèvements : urines, hémocultures, LCR, pus, selles
• Diagnostic bactériologique direct : Isolement et identification de la bactérie
• Recherche Ag solubles ([Link] K1) — recherche entérotoxines

Résistance aux antibiotiques

• Naturellement sensible à toutes les β-lactamines
• Résistance acquise enzymatique : pénicillinase, céphalosporinase, BLSE
• Résistance aminosides : inactivation enzymatique
• Résistance quinolones : chromosomique (diminution d’affinité de l’ADN gyrase ou imperméabilité par
porines modifiées)
• Résistantes aux macrolides, lincosamides et synergistines

2 — SALMONELLA

Les Salmonelles sont des bactéries ubiquitaires, mobiles, présentes dans le tube digestif et disséminées
dans l’environnement via les selles.

Le genre comprend deux espèces principales : Salmonella enterica et Salmonella bongori. Elles sont
classées en environ 2500 sérovars selon les antigènes O, H et K (classification de Kauffmann-White).

Pouvoir pathogène
• Sérovars typhiques (Typhi, Paratyphi A, B, C) : strictement humains, responsables des fièvres
typhoïdes.
 • Salmonelles non typhiques : zoonotiques, transmises par aliments d’origine animale.
→ causent surtout :

o gastro-entérites

o infections extra-intestinales (urinaires, méningites, articulations)

Diagnostic bactériologique
• Prélèvements : selles, hémocultures, autres…

• Identification : tests biochimiques + sérotypage (Kauffmann-White)

• Sérodiagnostic possible pour la fièvre typhoïde

Traitement
• Généralement sensibles aux antibiotiques actifs sur les bacilles Gram négatif, mais résistances
possibles → antibiogramme nécessaire

• Fièvre typhoïde : céphalosporines de 3e génération ou fluoroquinolones (chloramphénicol

parfois utilisé selon contexte)

• Gastro-entérites : traitement surtout symptomatique (réhydratation + régime)

3 — SHIGELLA
Caractères spécifiques
• TOUJOURS IMMOBILE (≠ autres entérobactéries mobiles)
• Ne fermente PAS le lactose
• Strictement humaine — transmission féco-orale

Les 4 espèces
Espèce Sérotypes Remarque

S. dysenteriae 10 Bacille de Shiga sérotype 1 → dysenterie bacillaire

S. flexneri 6 —

S. boydii 15 —

S. sonnei 1 —

Clinique
• Dysenterie bacillaire (S. dysenteriae)
• Adulte : colites infectieuses
• Enfant : gastro-entérites sévères avec diarrhée mucopurulente et sanglante, fièvre, déshydratation

Diagnostic & Traitement

• Coproculture sur milieux sélectifs → identification biochimique + agglutination avec sérums spécifiques
• Traitement : antibiogramme indispensable (résistances acquises possibles)
4 — AUTRES ENTEROBACTERIES IMPORTANTES
Groupe Genres / espèces Caractères Habitat Pathogénicité
principaux

Tribu -Proteus Mobiles TDA + -Environnement - Infections diverses

Proteeae (mirabilis, (tryptophane Commensales opportunistes
vulgaris, penneri) désaminase) PDA intestinales homme et
-Morganella + (phénylalanine animaux
(morganii) - désaminase)
Providencia Proteus : uréase +
(stuartii, rettgeri)

Klebsiella – -Klebsiella -Klebsiella : -Environnement :Eau, -Infections

Enterobacter (pneumoniae, immobile, sol, poussière nosocomiales chez
– Serratia oxytoca) capsulée, VP+ -Commensales du tube les patients
-Enterobacter digestif et orifices fragilisés, broncho-
(cloacae, -Enterobacter et naturels pulmonaires,
aerogenes) Serratia : mobiles, urinaires, post-
-Serratia VP+ chirurgicales,
(marcescens, bactériémies
liquefaciens) -Souvent
multirésistantes →
antibiogramme
nécessaire

5 — YERSINIA
Caractères généraux
• Petits BGN à coloration bipolaire
• Immobiles à 37°C, Uréase + mais pas de désaminases
• Petites colonies sur milieux ordinaires ou gélose SS

Les 3 espèces pathogènes

Espèce Caractéristiques / Maladies principales Diagnostic Traitement /
transmission sensibilité

Yersinia pestis - Agent de la peste - Peste bubonique : Ponction Souvent résistante aux
- Réservoir : rongeurs. adénite réactionnelle, ganglionnaire, atb : (streptomycine,
- Transmission par bactériémie, atteinte hémocultures, cyclines)
puce du rat (Pulex pulmonaire crachats
irritans). - Peste pulmonaire :
Peut se transmettre transmission
aussi par voie aérienne interhumaine par voie
(forme pulmonaire). aérienne

Yersinia Bactérie - Adénite — —

pseudotuberculosis environnementale, mésentérique - Iléite
"bacille de Malassez zoonose, transmission terminale -> Syndrome
et Vignal" digestive. appendiculaire
(appendice normal, un
ou plusieurs
ganglions congestifs)
 -une des étiologies de
l’érythème noueux

Yersinia Ubiquitaire, - Gastro-entérites – — Résistante aux bêta-

enterocolitica transmission digestive Syndrome lactamines
homme/animaux appendiculaire -
Polyarthrites - Sensible : aminosides,
Érythème noueux triméthoprime-
sulfaméthoxazole,
tétracyclines

II. PSEUDOMONAS AERUGINOSA (BACILLE PYOCYANIQUE)

Genre Pseudomonas, famille des Pseudomonaceae — Agent opportuniste nosocomial majeur.

Caractères bactériologiques (CLÉS)

CARACTÈRE DÉTAIL

Morphologie BGN, aérobie STRICT

Mobilité Ciliature POLAIRE (≠ péritriche des entérobactéries)

Oxydase POSITIVE ✓ (critère différentiel clé)

Glucose NE fermente PAS (oxydation uniquement)

Pigment Pigments diffusibles VERTS (pyocyanine + pyoverdine)

Capables de se multiplier sur milieux usuels

Milieu électif
Colonies LACTOSE (-) sur milieux entérobactéries

Eau, sol, ENVIRONNEMENT HOSPITALIER (siphons, antiseptiques,

Habitat humidificateurs)
+flore de transit de l'homme (tube digestif)
Existence de plusieurs sérotypes définis par l’antigène O, impliqués
Épidémiologie
lors d’épidémies.

Naturellement résistant à de nombreux atbs (mauvaise perméabilité

Résistance ATB
mb externe) + résistances acquises multiples

Infections (nosocomiales / opportunistes)

• Locales : oculaires, cutanées (brûlures +++), urinaires
• Pulmonaires (mucoviscidose +++), ostéo-articulaires, méningées
• Bactériémies

Diagnostic bactériologique
• Prélèvements selon site clinique
• Croissance facile en aérobiose stricte sur milieux ordinaires
• Colonies LACTOSE (-) sur milieux électifs entérobactéries
• Identification : oxydase +, pigment vert, aérobiose stricte, mobilité, non-fermentation des sucres
III. VIBRIONACEAE
Famille regroupant : Vibrio, Aeromonas, Plesiomonas. BGN mobiles (ciliature polaire) ou immobiles,
se développant sur milieu nutritif ordinaire, oxydase +, fermentant les glucides, réduisant nitrates en
nitrites.
Genre Vibrio
Les Vibrio sont des bacilles Gram négatif non sporulés, en forme de bâtonnets droits ou incurvés
(aspect de virgule), très mobiles grâce à un flagelle polaire. Ils sont oxydase positifs.
Espèces pathogènes pour l’homme :
• Vibrio cholerae
• Vibrio parahaemolyticus
• Vibrio alginolyticus
Caractères bactériologiques
• Bacilles incurvés, très mobiles (flagelle polaire)
• Oxydase positive
• Aéro-anaérobies facultatifs
• Fermentent le glucose
• Sérogroupes O1 et O139 responsables du choléra
Habitat et transmission
L’homme est le principal réservoir + disséminateur (selles de malades, convalescents et porteurs
sains).
La transmission se fait par l’eau contaminée, les aliments et les mains sales.

Vibrio cholerae — Le Choléra (DÉTAIL)

Étape Détail

Incubation 1 à 5 jours

Toxine Toxine cholérique → hypersécrétion intestinale

Diarrhée aqueuse abondante (selles eau de riz 10-20L/j) + vomissements SANS

Clinique
fièvre → déshydratation + acidose métabolique + anurie

Isolement par coproculture sur TCBS (colonies jaunes) + enrichissement en

Diagnostic
eau peptonée alcaline + agglutination anti-O:1 ou anti-O:139

URGENCE : réhydratation parentérale + correction hydro-électrique.

Traitement
ATB : cyclines, cotrimoxazole, fluoroquinolones, macrolides

Vue d'ensemble — Genres et espèces

Genre / Espèce Habitat Pathologie principale

CHOLERA : diarrhée eau de riz (10-20L/j),

V. cholerae O1/O139 Homme (selles), eau de boisson vomissements, déshydratation aiguë,
sans fièvre

V. parahaemolyticus _ Gastro-entérites

Isolé de pus divers, otites, conjonctivites,

V. alginolyticus Eau de mer
lésions cutanées

Septicémies (immunodéprimés), plaies,

Aeromonas hydrophila Eau douce, sol, aliments
gastro-entérites, méningite, péritonite,
 endocardite, pneumonie ostéomyélite,
cholécystite...

Plesiomonas Isolée de l'intestin de sujets sains et lors

shigelloides Homme, mammifères de diarrhées.
(unique espèce de domestiques Sensible : TMP, C3G, chloramphénicol,
Plesimonas) quinolones

TABLEAU DE SYNTHÈSE : BGN EN UN COUP D'ŒIL

Comparaison des 3 grandes familles au programme — l'essentiel pour vos QCM !

Critère Entérobactéries Pseudomonas Vibrio

Oxydase NEGATIVE ❌ POSITIVE ✓ POSITIVE ✓

Métabolisme O2 Aéro-anaérobie F. Aérobie STRICT Aéro-anaérobie F.

Glucose Fermentation Pas de fermentation Fermentation

Ciliature Péritriche Polaire Polaire

Forme Droits Droits Incurvés (virgule)

Mémo mnémotechnique
• Entérobactéries = Oxydase NEGATIVE, AAF, ciliature péritriche
• Pseudomonas = Oxydase POSITIVE, aérobie STRICT, pigment VERT, ciliature POLAIRE
• Vibrio = Oxydase POSITIVE, forme en VIRGULE, milieu sélectif TCBS
• Klebsiella + Shigella = les 2 IMMOBILES dans leur famille respective
• Salmonella Typhi/Paratyphi = STRICTEMENT HUMAINS (les autres sont zoonotiques)
• E. coli K1 = Méningites néonatales (retenir le sérotype K1 !)
• EHEC → SLT (Shiga-Like Toxin) → diarrhée hémorragique sans fièvre

Bonne révision ! ✓ Faculté de Médecine d'Alger

This work was prepared with care and the intention to support learning and
clarity. If it has been helpful, I kindly ask you to remember me and my
parents in your du‘as.

Wishing you success and ease in your studies