18/11/2016
IDR2-Tronc commun
juillet 2015
Initiation au logiciel R
R est un système d’analyse statistique et graphique créé
par Ross Ihaka et Robert Gentleman
Initiation au logiciel R
R est à la fois un logiciel et un langage qualifié
1Ihaka R. & Gentleman R. 1996. R: a language for data analysis and
Martin Bienvenu SOMDA, PhD en Biologie graphics. Journal of Computational and Graphical Statistics 5 : 299–314
somdabienvenu@[Link]
Initiation au logiciel R Initiation au logiciel R
Une fois R installé sur votre ordinateur, il suffit de
lancer l’exécutable correspondant pour démarrer le
programme.
L’attente de commandes (par défaut le symbole ‘>’)
apparait alors indiquant que R est prêt à exécuter les
commandes.
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18/11/2016
Introduction au logiciel R Introduction au logiciel R
Le fait que R soit un langage peut effrayer plus d’un les "vecteurs" : une suite de caractères ou chiffres.
utilisateur potentiel pensant « Je ne sais pas programmer».
Cela ne devrait pas être le cas pour deux raisons. les "array" ou "matrix": matrice simple de chiffres
D’abord, R est un langage interprété et non compilé, càd les "dataframe" : matrices de donnée pouvant contenir des
que les commandes tapées au clavier sont directement éléments de nature différentes: chiffres ou caractères.
exécutées sans qu’il soit besoin de construire un programme
complet comme cela est le cas pour la plupart des langages les "list" : ce sont des collections d'objets, des sortes de
informatiques containers, pouvant contenir plusieurs objets,
éventuellement de nature différentes (vecteurs,
Ensuite, la syntaxe de R est très simple et intuitive. dataframe, ou même des list).
Initiation au logiciel R
Changer le répertoire courant: spécifier où on a les
données
Installer des packages: packages (programmes)= installer
choisir une plateforme (Lyon 1)