DNA

1. Ácidos Nucleicos: Componentes más 11. H-DNA: Estructura con triples hélices
fundamentales de la célula, únicos capaces formadas por tripletes de bases &
de autoduplicarse & de almacenar & apareamientos de Hoogsteen.
transmitir información genética. 12. Horquilla: Estructura secundaria del DNA
2. A-DNA: Forma deshidratada del DNA; en mol. de cadena simple que se pliegan
presenta 11 pb por vuelta, con un surco sobre sí mismas.
mayor profundo & un surco menor casi 13. Ley de Apareamiento de Bases: Principio
invisible. según el cual la Adenina (A) se empareja
3. B-DNA: Forma más común del DNA en con la Timina (T) mediante dos enlaces de
condiciones fisiológicas; tiene 10 pb por hidrógeno, & la Guanina (G) con la
vuelta, con un diámetro de 2 nm. Citosina (C) mediante tres enlaces de
4. Cruciformes: Estructura secundaria poco hidrógeno.
habitual del DNA; requiere una secuencia 14. Mutación: Cambio en el orden de los
palindrómica & forma horquillas dobles. nucleótidos en la estructura primaria del
5. Desnaturalización: Pérdida de la DNA, que altera la información genética.
estructura secundaria debido a cambios en 15. Superenrollamiento: Estado
pH o temperatura, acompañado de un tridimensional habitual del DNA cerrado
aumento en la absorbancia UV a 260 nm. que facilita el empaquetamiento & diversos
6. DNA Circular (DNAci): Forma del DNA procesos biológicos.
sin extremos libres 3' o 5'; puede ser de 16. Temperatura de Fusión (Tm):
cadena sencilla o doble. Temperatura en la cual ocurre la
7. Estructura Primaria del DNA: Secuencia desnaturalización del DNA.
u orden de nucleótidos que almacena & 17. Topoisómeros: Moléculas de DNA que
codifica la información genética. difieren en su topología, como formas
8. Estructura Secundaria del DNA: relajadas o superenrolladas.
Disposición espacial de las dos cadenas de 18. Topoisomerasas: Enzimas que
DNA estabilizada por enlaces de interconvierten topoisómeros mediante
hidrógeno, interacciones de Van der Waals, cortes & uniones del DNA.
electrostáticas e hidrofóbicas. 19. Z-DNA: Forma secundaria del DNA con
9. Estructura Terciaria del DNA: Modelo hélice de rotación hacia la izquierda & 12
tridimensional propuesto por Watson & pares de bases por vuelta; surco mayor
Crick, caracterizado por una doble hélice. apenas visible & surco menor estrecho &
10. Gen: Secuencia concreta de DNA que profundo.
codifica información genética mediante un
lenguaje de tres letras.
 Ácidos Nucleicos

• Definición: Componentes más fundamentales de la célula

• Propiedades:

1. Única sustancia biológica capaz de autoduplicarse.

2. Depósitos & transmisores de la información genética de:

▪ Células. ▪ Organismos.

▪ Tejidos.

• Tipos:

1. Ácido Ribonucléico (RNA).

2. Ácido Desoxirribonucleico (DNA).

• Composición: Polímeros formados por nucleótidos unidos mediante enlaces

covalentes 3’, 5’-fosfodiéster. (¿Cómo se llama el enlace que une un nucleótido con

otro en el DNA & RNA? Enlace 3’,5’-fosfodiéster.)

• Ley de Apareamiento de Bases (Chargaff)

1. Adenina (A) se empareja con Timina (T). A=T (Según la Ley de Apareamiento

de Bases, aplicada al DNA, es correcto decir: A va con T.)

2. Guanina (G) se empareja con Citosina (C). G≡C

• Uniones mediante enlaces de hidrógeno (débiles).

Estructuras del ADN

• Estructura Primaria (1)

o Definición: Secuencia u orden de los nucleótidos o bases.

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o Relevancia:

o Almacena & codifica la información genética.

o Gen: Secuencia específica de DNA que codifica información mediante un

lenguaje de 3 letras, cada una correspondiente a una base nitrogenada.

• Estructura Secundaria

o Definición: Disposición espacial de las dos cadenas de DNA.

o Formas principales del DNA: A, B & Z.

o Estabilización:

1. Puentes de hidrógeno: Entre A=T (2 puentes) &

G≡C (3 puentes). (¿Cuántos enlaces de

hidrógeno se forman entre A & T en el DNA? 2.)

(¿Qué tipo de enlaces unen las 2 cadenas del DNA? De hidrógeno.) (¿Cuántos

enlaces de hidrógeno se forman entre G & C en el DNA? 3.)

2. Interacciones de Van der Waals: Entre bases apiladas.

3. Interacciones electrostáticas (iónicas).

4. Interacciones hidrofóbicas.

• Estructura Terciaria

o Modelo de Watson & Crick (1953):

o Definición: Doble hélice formada por dos cadenas.

o Características:

▪ Las columnas hidrofílicas (desoxirribosa &fosfato) están hacia el exterior.

▪ Las bases hidrofóbicas están apiladas internamente, perpendiculares al eje

de la hélice.
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▪ Genera un surco mayor & un surco menor.

o Propiedades:

▪ Rotación entre los pares de bases:

▪ Cada par de bases (pb) presenta una rotación de 36° respecto al siguiente.

▪ Número de pares de bases por vuelta de la hélice:

▪ Se acomodan 10 pares de bases en cada vuelta de la hélice.

▪ Distancia entre los pb:

▪ Hay una distancia de 0.34 nm entre los pb.

B-DNA (forma más común en condiciones fisiológicas): (Mencione 5 características del

DNA-B.)

• Punto estándar de referencia.

• 10 pares de bases (pb) por vuelta. (¿Cuántos pares de base hay en una vuelta o giro de

la doble hélice el DNA-B? 10.)

• Distancia entre bases: 0.34 nm.

• Un giro completo mide 3.4 nm.

• Diámetro de la hélice: 2 nm.

A-DNA (forma deshidratada):

• 11 pb por vuelta. (¿Cuántos pares de base hay en una vuelta o giro de la doble hélice

el DNA-A? 11.)

• Es la forma de DNA que se da cuando el DNA se deshidrata: DNA-A.

• Surco mayor profundo, surco menor casi invisible.

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• Comparación A-DNA vs. B-DNA

Propiedad B-DNA A-DNA

Posición de las bases Cercanas al eje Más alejadas del eje

Surcos mayores y menores Bien diferenciados Surcos de anchura similar

DNA in vivo

• Generalmente de doble cadena (DS; double strand) en la mayoría de los seres vivos.

• El DNA humano es de _____ cadena (DS). Doble.

• El RNA humano es de _____ cadena (SS). Sencilla.

• Cadena sencilla (SS; single strand) en algunos virus.

• Forma circular en mayoría de seres vivos; lineal en humanos.

DNA Circular (DNAci):

• No posee extremos libres 3' o 5'.

• Tamaño variable: desde pequeños círculos hasta inmensas moléculas.

• Puede ser de cadena sencilla (SS) o doble (DS).

Superenrollamiento

• Definición: Estado habitual de las moléculas cerradas de

DNA.

• Características:

o Proceso dinámico tridimensional.

o Facilita diversos procesos biológicos.

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o Permite el empaquetamiento del DNA en una forma compacta.

• Topoisómeros: Mol. de DNA que difieren únicamente en la disposición de sus espacios

(topología), formas relajadas o superenrolladas.

• Topoisomerasas: Enzimas que pueden interconvertir los topoisómeros mediante el

corte & la nueva unión del DNA.

Estructuras Secundarias Poco Habituales

I. Z-DNA III. Cruces.

II. Horquillas. IV. H-DNA (3 Hélices)

• Z-DNA (Forma Z):

o Hélice con rotación hacia la izquierda.

o Residuos de purina en conformación sin alternan con pirimidinas en

conformación anti.

o La columna de DNA adopta una apariencia de zigzag (por eso Z-DNA).

o Características:

▪ 12 pares de bases (pb) por vuelta. (¿Cuántos pares de bases hay en una

vuelta o giro de la doble hélice en el DNA-Z? 12.)

▪ Surco mayor apenas visible; surco menor estrecho & profundo.

• Horquilla:

o En moléculas de cadena simple (SS), la cadena es autocomplementaria & se

pliega sobre sí misma.

• Cruciformes: Forman horquillas dobles; requiriendo una secuencia palindrómica.

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• Es la forma de DNA que requiere una palíndromo para producirse: DNA Cruciforme.

o Palíndromo: Secuencia que, al leer una cadena de derecha a izquierda, es idéntica

a la complementaria leída de izquierda a derecha.

• Triples hélices (H-DNA):

o Formación de tripletes desoxi (T-A-T & C-G-C.

▪ Con apareamientos no convencionales llamados de Hoogsteen.

o Requiere: (Es la forma de DNA que require segmentos moleculares que posean

una cadena con pirimidinas & la otra solo con purinas. DNA-H)

1. Una cadena solo con pirimidinas (Pi).

2. Otra cadena solo con purinas (Pu).

o Características: (Mencione 2 características del DNA-H.)

o Inestable: Pérdida de apareamiento de bases.

o Se forman cuando una cadena se pliega hacia atrás para crear una triple hélice.

Desnaturalización de los Ácidos Nucléicos

• Definición:

• Pérdida de la estructura secundaria en regiones grandes por cambios;

1. En pH. 2. En temperatura.

• En cuento a la desnaturalización del DNA, se puede decir: Se separan las 2 cadenas

de DNA.

• ¿Cuál de las siguientes aservaciones es correcta?La desnaturalización del DNA puede

ser reversible.

• Características:
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o El estado nativo absorbe menos luz UV que el estado desnaturalizado.

o Al desnaturalizarse, aumenta la absoción de luz UV, a 260 nm (pico de

absorción).

o Proceso conocido como fusión de la doble hélice.

• Temperatura de fusión (Tm):

o Es la temperatura en la cual ocurre la desnaturalización.

o Al alcanzar Tm, hay un incremento brusco en la absorbancia debido a la fusión

del DNA.

Transformaciones no Enzimáticas

• Generalidades:

o La estabilidad del DNA es crucial para preservar la información genética a largo

plazo.

o Mutación: Alteración en la estructura del DNA que produce cambios en la

información genética.

▪ Otra definición: Cambio en el orden de los nucleótidos (Estructura

primaria).

Tipos de Transformaciones Químicas

1. Desaminación.

2. Hidrólisis del enlace β-N-glucosídico entre la base & la desoxirribosa.

3. Por radiación:

o Luz UV: Formación de dímeros de pirimidinas.

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o Radiación ionizante (rayos X, gamma): Apertura de anillos & fragmentación

de bases.

4. Por agentes ambientales:

o Agentes alquilantes.

5. Daño oxidativo (Radicales libres).

Overview

• El DNA (ácido desoxirribonucleico) es un polímero de nucleótidos unidos por enlaces 3’,5’-

fosfodiéster.
• Es único por su capacidad de autoduplicarse y transmitir información genética en células, tejidos y
organismos.
• Sigue la Ley de Chargaff: Adenina (A) se empareja con Timina (T) y Guanina (G) con Citosina (C)
mediante enlaces de hidrógeno.

Estructura
Aspecto Estructura Primaria Estructura Terciaria
Secundaria
Disposición espacial
Secuencia u orden de los Doble hélice formada por dos cadenas
Definición de las dos cadenas de
nucleótidos o bases. según el modelo de Watson & Crick.
DNA.
Almacena & codifica la Organiza el DNA de manera compacta &
Relevancia -
información genética. funcional para procesos biológicos.
Hidrofílicas: desoxirribosa & fosfato
Componentes Bases nitrogenadas (A,
Formas A, B & Z. (exterior). Hidrofóbicas: bases apiladas
clave T, G, C).
internamente.
Codifica información Rotación de 36° entre pares de bases. 10
Propiedades mediante tripletes de - pares de bases por vuelta. Distancia entre
bases (genes). pares de bases: 0.34 nm.
Genera un surco mayor y un surco menor
Lenguaje de tres letras
Particularidades - que facilitan la interacción con proteínas
por triplete de bases.
y otras moléculas biológicas.

• El DNA, generalmente de doble cadena (DS), es lineal en humanos & circular en otros organismos.
• Puede presentar superenrollamiento, un estado dinámico que facilita procesos biológicos & empaqueta
el DNA de forma compacta.
• Las topoisomerasas regulan el superenrollamiento al modificar la topología del DNA.
H-DNA (Triple
Aspecto B-DNA A-DNA Z-DNA
Hélice)
Forma con triple
Forma común en Forma
Hélice con rotación hélice generada
Definición condiciones deshidratada del
hacia la izquierda. por tripletes
fisiológicas. DNA.
desoxi.
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Pares de
10 pb. 11 pb. 12 pb.
bases/vuelta
Distancia entre
0.34 nm.
bases
Giro completo 3.4 nm. -
Diámetro de
2 nm.
hélice
Surco mayor
Surco mayor & Surco mayor apenas -
profundo; surco
Surcos menor bien visible; surco menor
menor casi
diferenciados. estrecho & profundo.
invisible.
Alternancia de purinas
Más alejadas del
Posición de bases Cercanas al eje. (conformación sin) y
eje.
pirimidinas (anti).
Forma de la
Regular. Regular. Apariencia en zigzag.
columna
Ocurre al Requiere cadenas
Punto estándar de
Particularidades deshidratarse el - de pirimidinas &
referencia.
DNA. purinas.

Estructuras Secundarias Poco Habituales

H-DNA
Aspecto Z-DNA Horquillas Cruciformes (Triple
Hélice)
Estructura que Estructura
Estructura
Hélice con forma horquillas formada por
autocomplementaria
Definición rotación hacia la dobles a partir de tripletes
en cadena simple
izquierda. secuencias desoxi (T-A-
(SS).
palindrómicas. T y C-G-C).
Forma Zigzag. Horquilla. Doble horquilla. Triple hélice.
Alternancia de Una cadena
Requisitos purinas & Secuencia Secuencia con
de pirimidinas en autocomplementaria palindrómica en pirimidinas
secuencia conformaciones en una sola cadena. doble cadena. & otra con
sin & anti. purinas.
Una cadena
Dos cadenas se pliega
Formación Se pliega sobre sí forman hacia atrás
-
especial misma. horquillas para formar
opuestas. la triple
hélice.

• La desnaturalización del DNA implica la separación reversible de sus cadenas por cambios en pH o
temperatura, aumentando la absorción UV a 260 nm.
• Absorbancia UV: Estado desnaturalizado absorbe más luz UV (260 nm).
• La temperatura de fusión (Tm) marca este proceso.