AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
AMINOÁCIDOS
❖Los aminoácidos son todos aquellos compuestos que tienen un grupo amino y un grupo
carboxilo en su estructura.
❖Muchos de ellos tienen importancia biológica.
❖Los aminoácidos de mayor importancia biológica son llamados -aminoácidos, es decir,
compuestos en que el grupo amino se encuentra en el C-2 del ácido (C-).
❖Los -aminoácidos que forman las proteínas son de la familia L, es decir, en que el grupo
amino se encuentra a la izquierda en las proyecciones de Fischer.
❖ La configuración del centro estereogénico es S excepto:
➢ glicina que no tiene centro estereogénico (R = H)
➢ cisteína cuyo centro estereogénico es R (R = CH2SH)
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Los aminoácidos se diferencian entre sí por la estructura de la cadena lateral R.
❖Tienen nombres IUPAC pero se les conoce por sus nombres vulgares.
❖Cada aminoácido tiene dos formas de escribirlos: mediante un sistema de tres letras que
corresponden a las letras iniciales del nombre y mediante un sistema de una letra
mayúscula que corresponde, en general, a la letra inicial del nombre.
❖Como hay varios aminoácidos que comienzan por la misma letra, a algunos se les asigna
otra letra del alfabeto.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖De acuerdo a sus propiedades fisicoquímicas y estructurales, los aminoácidos se pueden
clasificar de distintas formas.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖De acuerdo a las propiedades ácido-base los aminoácidos se clasifican en tres categorías:
i. aminoácidos neutros: son aquellos en que la cadena R no tiene propiedades ácido-base.
Por ejemplo, alanina, glicina, valina, leucina, serina y triptófano.
Alanina (ala, A) Glicina (gli, G) Valina (val, V)
Leucina (leu, L) Serina (ser, S) Triptofano (trp, W)
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
ii. aminoácidos ácidos: son aquellos en que la cadena R tienen un grupo carboxilo. Son el
ácido aspártico y el ácido glutámico.
Ácido aspártico (asp, D) Ácido glutámico (glu, E)
iii. aminoácidos básicos: son aquellos en que la cadena R tienen un grupo amino. Son la
lisina, la arginina y la histidina.
Lisina (lis, K) Arginina (arg, R) Histidina (his, H)
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Debido a los grupos ácido-base, los aminoácidos tienen al menos dos pKa: el del grupo
carboxilo (pKa1) y el del grupo amino (pKa2). Los aminoácidos ácidos y básicos tienen un
grupo ácido-base en la cadena que se designa como pKa3.
Aminoácidos neutros estructura pKa1 pKa2 pKa3 pI
Alanina (ala, A) 2,34 9,69 6,01
Asparagina (asn, N) 2,02 8,80 5,41
Cisteína (cis, C) 1,96 10,28 8,18 5,07
Glutamina (gln, Q) 2,17 9,13 5,65
Glicina (gli, G) 2,34 9,60 5,97
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
Aminoácidos neutros estructura pKa1 pKa2 pKa3 pI
Isoleucina (ile, I) 2,36 9,60 6,02
Leucina (leu, L) 2,36 9,60 5,98
Metionina (met, M) 2,28 9,21 5,74
Fenilalanina (fen, F) 1,83 9,13 5,48
Prolina (pro, P) 1,99 10,60 6,30
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
Aminoácidos neutros estructura pKa1 pKa2 pKa3 pI
Serina (ser, S) 2,21 9,15 5,88
Treonina (tre, T) 2,09 9,10 5,60
Triptofano (trp, W) 2,83 9,39 5,89
Tirosina (tir, Y) 2,20 9,11 10,07 5,66
Valina (val, V) 2,32 9,62 5,96
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
Aminoácidos ácidos estructura pKa1 pKa2 pKa3 pI
Ácido aspártico (asp, D) 2,10 9,80 3,90 3,00
Ácido glutámico (glu, E) 2,19 9,67 4,25 3,22
Aminoácidos básicos estructura pKa1 pKa2 pKa3 pI
Arginina (arg, R) 2,10 9,00 12,50 10,80
Histidina (his, H) 1,82 9,17 6,00 7,59
2,18 8,95 10,53 9,74
Lisina (lis, K)
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Las estructuras neutras de los aminoácidos no representan a éstos cuando están en
disolución o estado sólido.
❖Debido a las características fisicoquímicas de los aminoácidos en disolución y en estado
sólido, éstos tienen propiedades de compuestos iónicos.
compuesto estructura Masa molar (g/mol) Solubilidad en agua Solubilidad en éter Punto de fusión
(°C)
Ácido isobutírico 88 20 - 47
∞
Ácido láctico 90 53
∞ ∞
3-amino-2-butanol 89 9
∞ ∞
Alanina 89 insoluble ca. 300
∞
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖La estructura iónica de los aminoácidos indica que el grupo carboxilo está como carboxilato
y el grupo amino como ion amonio. Esta estructura iónica dipolar se denomina zwitterión
(del alemán zwitter, híbrido).
❖Esta estructura de naturaleza iónica explica la alta solubilidad de los aminoácidos en agua,
su baja solubilidad en éter y sus altos puntos de fusión a pesar de ser moléculas de bajo
peso molecular.
❖Su estructura iónica permite la interacción por puentes de hidrógeno en la estructura
cristalina, aumentando considerablemente los puntos de fusión.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Debido a la presencia de estos grupos ácido-base, las estructuras iónicas dependerán del pH
de la disolución en que se encuentran.
❖Así, a pH neutro la alanina se encuentra en su forma zwitteriónica. Pero a pH más bajos, las
funciones ácido-base se protonan alterando el equilibrio.
❖Lo mismo ocurre a pH más altos, en que las funciones ácido-base se desprotonan.
❖La proporción de los pares ácido-base a distintos pH se puede determinar mediante la
ecuación de Henderson-Hasselbalch.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Por ejemplo, determinar la proporción de especies de una disolución de alanina 0,1 M a pH
9. pKa1 = 2,34; pKa2 = 9,69
❖Para pH = 9 se debe tomar el pKa2 = 9,69
Es decir, a pH= 9,0 hay 83% de la forma
zwitteriónica y 17% de la forma aniónica
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Para un aminoácido, el equilibrio entre las especies neutras y cargadas en disolución están
dadas por el pH en que se encuentra.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖En estos equilibrios, hay un pH en que la especie tiene carga total cero (especie neutra).
❖Este pH se denomina punto isoeléctrico (pI) y es característico de cada aminoácido.
❖Para determinar el punto isoeléctrico de un aminoácido se debe tomar en cuenta los pKa de
los grupos ácido-base.
❖Puesto que existen tres tipo de aminoácidos dependiendo de las características ácido-base,
el cálculo del pI será distinto para cada grupo.
i. pI de aminoácidos neutros. Tomado como ejemplo la alanina se tiene:
A pH menores a pKa1, tanto la función carboxilato como amino se encuentran protonadas, de
manera que la especie mayoritaria es una especie catiónica (carga total positiva). En cambio, a
pH mayores a pKa2, la función carboxilato y amino están desprotonadas de manera que la
especie mayoritaria es aniónica (carga total negativa)
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖La carga neutra en estos aminoácidos se encuentra a pH entre pKa1 y pKa2.
❖Por lo tanto, el punto isoeléctrico en aminoácidos neutros se determina como el promedio
entre los dos pKa.
➢ Para la alanina se
tiene:
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
ii. pI de aminoácidos ácidos. Tomado como ejemplo el ácido aspártico se tiene:
A pH menores a pKa1, todas las funciones se encuentran protonadas, de manera que la
especie mayoritaria es una especie catiónica (carga total positiva). A pH entre pKa1 y pKa3, la
función más ácida se comienza a desprotonar de modo que la especie mayoritaria tiene
carga total 0. Por último, a pH mayores a pKa2, todas las funciones se encuentran
desprotonadas, de modo que la especie mayoritaria es aniónica (carga total negativa)
Se puede observar que la especie neutra se hace mayoritaria cuando el pH se encuentra
entre los pKa de las funciones más ácidas.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Por lo tanto, el punto isoeléctrico en aminoácidos neutros se determina como el promedio
entre los dos pKa más bajos.
➢ Para el ácido aspártico
se tiene:
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
iii. pI de aminoácidos básicos. Tomado como ejemplo la arginina se tiene:
A pH menores a pKa1, todas las funciones se encuentran protonadas, de manera que la
especie mayoritaria es una especie catiónica (carga total positiva). A pH entre pKa2 y pKa3, la
función amonio más ácida se comienza a desprotonar de modo que la especie mayoritaria
tiene carga total 0. Por último, a pH mayores a pKa3, todas las funciones se encuentran
desprotonadas, de modo que la especie mayoritaria es aniónica (carga total negativa)
Se puede observar que la especie neutra se hace mayoritaria cuando el pH se encuentra
entre los pKa de las funciones menos ácidas.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖Por lo tanto, el punto isoeléctrico en aminoácidos básicos se determina como el promedio
entre los dos pKa más altos.
➢ Para la arginina se tiene:
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖ La distribución de las especies cargadas en una muestra puede ser demostrada
experimentalmente al observar el movimiento de las moléculas solubles en un campo
eléctrico, usando la técnica de electroforesis.
❖ Para tales experimentos una disolución buffer iónica es incorporada en una capa de matriz
sólida, compuesta de papel o una substancia tipo gelatina (poliamida).
❖ Una pequeña cantidad de muestra del aminoácido, péptido o proteína es puesta cerca del
centro de la cubeta de la matriz y se aplica un potencial eléctrico en los extremos de la
cubeta
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖ Dependiendo del pH en que está embebido el gel o papel, el aminoácido estará en forma
catiónica, aniónica o neutra y migrará a uno u otro electrodo dependiendo de su carga.
➢ Si tiene forma catiónica migra al cátodo (electrodo negativo).
➢ Si tiene forma aniónica migra al ánodo (electrodo positivo).
➢ Si tiene forma neutra, el aminoácido no migra.
❖ La migración del aminoácido depende de la diferencia del pH y del pI de cada aminoácido.
➢ Si el pH es menor que el pI, el aminoácido migra al cátodo (a pH más ácidos el aminoácido
tiene forma catiónica).
➢ Si el pH es igual al pI, el aminoácido no migra.
➢ Si el pH es mayor al pI, el aminoácido migra al ánodo (a pH básicos el aminoácido tiene
forma aniónica)
❖ De manera que mediante esta técnica se pueden separar los aminoácidos de una mezcla y
se pueden identificar mediante la comparación de la distancia de migración con
aminoácidos patrones.
❖ Se debe tener en cuenta que la distancia recorrida depende también de la masa molar del
aminoácido: a mayor masa, menor distancia de migración.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
Electroforesis en un buffer de pH 6.0 de una
aplicación de un voltaje
muestra que contiene alanina e isoleucina
(aminoácidos neutros), arginina (aminoácido
básico) y ácido aspártico (aminoácido ácido).
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
❖ Los -aminoácidos, excepto la prolina, sufren una reacción única con el hidrato de
tricetohidrindeno conocido como ninhidrina. Entre los productos de esta inusual reacción
es un imino derivado de color púrpura, que proporciona un útil test de color para estos
aminoácidos, muchos de ellos incoloros. Una aplicación común de la ninhidrina es la
visualización de los aminoácidos en la cromatografía en papel.
Cromatograma en papel de aminoácidos
revelados con ninhidrina
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
SÍNTESIS DE -AMINOÁCIDOS
i. Aminación de ácidos -bromocarboxílicos: se lleva a cabo por tratamiento de ácidos -
bromocarboxílicos, obtenidos mediante la reacción de Hell-Volhard-Zelinsky, con
amoniaco.
➢ Aunque el método de aminación de halogenuros de alquilo proporciona pobres
rendimientos cuando se usa para preparar aminas simples, la aminación de -bromoácidos
es muy efectiva para preparar -aminoácidos, gracias a la baja nucleofilia del nitrógeno en
el producto.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
ii. Síntesis ftalimidomalónica: se conjugan las reacciones de Gabriel para aminas primarias y
la síntesis malónica para derivados de ácidos carboxílicos.
➢ Aunque el método de aminación de halogenuros de alquilo proporciona pobres
rendimientos cuando se usa para preparar aminas simples, la aminación de -bromoácidos
es muy efectiva para preparar -aminoácidos, gracias a la baja nucleofilia del nitrógeno en
el producto.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
➢ Una modificación de la reacción es el uso de acetamidomalonato de dietilo, un derivado
del malonato de dietilo que ya contiene el grupo amino en la posición , mejorando los
rendimientos.
AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS
iii. Síntesis de Strecker: la reacción se lleva en pocas etapas mejorando sustancialmente los
rendimientos. Mezcla la aminación reductiva con la formación e hidrólisis de cianhidrinas.
➢ Se lleva a cabo mediante la reacción de una aldehido con una mezcla de cloruro de amonio
y cianuro de potasio, los cuales generan HCN y NH3 en el medio de reacción.
➢ El NH3 se une al carbonilo generando una imina que rápidamente reacciona con el HCN
para dar el aminonitrilo correspondiente.
➢ La posterior hidrólisis ácida o alcalina del grupo CN lleva a la formación del -aminoácidos.