Uso del DNA Microarray para comparar la expresión génica entre células sanas y
cancerosas
1. Introducción (capítulo 1 de la simulación)
Durante gran parte del siglo XX, el estudio de los genes se realizaba de manera individual,
analizando uno o unos pocos genes a la vez. Sin embargo, los organismos vivos poseen una
gran cantidad de genes. Por ejemplo, el ser humano tiene alrededor de 20 000 genes, lo que
hacía que su estudio uno por uno fuese un proceso extremadamente lento.
Frente a esta limitación surgió una nueva área del conocimiento llamada genómica, cuyo
objetivo es estudiar muchos genes al mismo tiempo, o incluso todos los genes de un organismo
en un solo experimento. Una de las herramientas más importantes que permite este análisis
global es el DNA microarray (microarreglo de ADN).
En el laboratorio virtual en donde se trabajó, se simuló el uso de esta tecnología para responder
una pregunta fundamental en biología y medicina: ¿Cuál es la diferencia entre una célula sana
y una célula cancerosa a nivel de expresión génica?
2. Objetivos de la simulación
2.1. Objetivo general
Comprender el funcionamiento del DNA microarray como herramienta para comparar la
expresión génica entre células sanas y células cancerosas.
2.2. Objetivos específicos
• Explicar el concepto de genómica y su relación con el DNA microarray.
• Entender cómo se mide la expresión génica mediante el ARN mensajero (ARNm).
• Describir paso a paso el experimento virtual realizado con microarrays.
• Analizar los resultados obtenidos al comparar células sanas y células de melanoma.
• Reconocer las ventajas y limitaciones del análisis por DNA microarray.
3. Marco teórico (capítulo 2)
3.1 Genómica: una nueva ciencia
La genómica es una rama moderna de la biología que estudia todos los genes de un organismo
al mismo tiempo, en lugar de analizarlos de manera individual. Esto representa un cambio
importante respecto a la genética clásica. Gracias a la genómica, es posible observar cómo
funcionan miles de genes de forma simultánea y entender cómo interactúan entre sí dentro de
una célula. El DNA microarray es una de las herramientas principales que hacen posible este
enfoque global.
3.2 Expresión génica
Aunque casi todas las células del cuerpo humano contienen los mismos genes, no todos los
genes están activos en todas las células. Algunos genes están “encendidos” (activos) y otros
“apagados” (inactivos), dependiendo del tipo de célula. Un gen se considera expresado cuando
produce ARN mensajero (ARNm), que es la molécula que lleva la información genética para
fabricar una proteína. Por ejemplo:
• Las células musculares producen ARNm
para proteínas musculares.
• Las células de la piel no producen ARNm
para insulina.
Así pues, medir qué genes producen ARNm y en qué
cantidad permite saber qué procesos biológicos
están ocurriendo dentro de una célula.
3.3 DNA Microarray
Un DNA microarray es una lámina de vidrio que contiene
miles de pequeños puntos, y cada punto posee muchas
copias de un fragmento de ADN que representa un gen
específico.
Cuando se coloca ADN complementario (cDNA) sobre el
microarray, este se une (por apareamiento de bases
complementarias) al gen correspondiente. Este proceso se
llama hibridación (unión entre cadenas de ADN
complementarias).
El color que aparece en cada punto indica si ese gen está activo en uno u otro tipo de célula.
4. Materiales del laboratorio virtual (capítulo 3)
• Microarray de ADN humano
• Muestras de tejido sano y tejido canceroso (melanoma)
• Tubos de ensayo
• Escalpelo
• Pipetas
• Solventes orgánicos
• Vórtex
• Centrífuga
• Columnas con perlas poli-T
• Mezclas de etiquetado fluorescente (verde y rojo)
• Escáner de microarrays
• Sistema computacional para análisis de datos
5. Metodología (procedimiento experimental)
Paso 1: Recolección de tejido
Se recolectaron muestras de:
• Tejido sano de piel
• Tejido canceroso de piel (melanoma)
Ambas muestras provinieron del mismo paciente, aseguran do que las diferencias observadas
se deban a la enfermedad y no a variaciones genéticas entre personas.
Paso 2: Aislamiento de ARN
Las muestras de tejido se disolvieron en solventes
orgánicos para separar:
• ADN
• Proteínas
• Otros componentes celulares
Mediante centrifugación, se obtuvo el ARN puro de
cada muestra.
Paso 3: Aislamiento de ARNm
El ARN total contiene varios tipos:
• ARNm (mensajero)
• ARNt (transferencia)
• ARNr (ribosomal)
Solo el ARNm indica qué genes están
activos. Este se aisló gracias a su cola
poli-A (secuencia de adeninas), que se
une a perlas con poli-T.
Paso 4: Obtención de ADN complementario etiquetado
El ARNm fue convertido en ADN complementario
(cDNA) usando: Transcriptasa inversa (enzima que copia
ARN en ADN)
Se etiquetó:
• cDNA de células sanas con color verde
• cDNA de células cancerosas con color rojo
Paso 5: Aplicación del ADN al microarray
Los cDNA se aplicaron sobre el microarray, donde se unieron a los genes correspondientes
mediante hibridación. El exceso de cDNA no unido fue eliminado mediante lavado.
Paso 6: Escaneo del microarray
El microarray fue escaneado:
• Primero para detectar señales verdes
• Luego señales rojas
• Finalmente se fusionaron ambas imágenes
Paso 7: Análisis de datos
Los colores obtenidos indican:
• Amarillo: gen expresado en células sanas
y cancerosas
• Rojo: gen más activo en células
cancerosas
• Verde: gen menos activo en células
cancerosas
6. Resultados
Se observaron patrones distintos de expresión génica entre células sanas y cancerosas. Muchos
genes mostraron mayor actividad en células cancerosas (rojo), otros genes mostraron menor
actividad en cáncer (verde) y genes expresados en ambos tipos de células aparecieron en color
amarillo.
Ejemplos:
• Gen 4263: sobreexpresado en cáncer; regula negativamente otros genes.
• Gen 6219: aparece amarillo, pero su proteína no se produce en células cancerosas
debido a un defecto, lo que no puede detectarse con el microarray.
7. Discusión
El DNA microarray permite comparar todos los genes al mismo tiempo, lo que lo convierte en
una herramienta muy poderosa. Sin embargo, el experimento demuestra que:
• La expresión de ARNm no siempre
significa producción de proteína.
• No todos los genes defectuosos pueden
identificarse con esta técnica.
Por ello, el microarray es útil para detectar cambios
generales, pero no reemplaza otros métodos más
espícíficos.
8. Limitaciones del DNA Microarray
El análisis por DNA microarray no puede:
• Identificar directamente qué gen causó una enfermedad.
• Detectar todos los genes defectuosos.
• Confirmar si un gen produce realmente una proteína.
• Curar enfermedades.
9. Conclusiones
Desde mi punto de vista, el DNA microarray es una herramienta fundamental en la biología
molecular moderna, ya que permite analizar miles de genes en un solo experimento, algo
impensable en la genética tradicional. En el caso del melanoma, esta tecnología ayuda a
identificar qué genes cambian su nivel de actividad en las células cancerosas en comparación
con las células sanas.
Sin embargo, el experimento deja claro que el microarray no detecta todos los errores genéticos,
especialmente aquellos que ocurren después de la producción del ARNm, como fallos en la
traducción a proteína. Esto demuestra que, aunque es una técnica muy poderosa para el estudio
de la expresión génica, debe complementarse con otros análisis para comprender
completamente una enfermedad como el cáncer.
10. Referencia bibliográfica
DNA Microarray. (2025). [Link]. [Link]