Caracterización del nanche en Nayarit
Caracterización del nanche en Nayarit
Graciela Guadalupe López- RESUMEN. El nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K) pertenece a la familia
Malpighiaceae. El género Byrsonima tiene distribución noetropical y presenta gran
Guzmán1 ,
diversidad con más de 100 especies. El objetivo del trabajo fue caracterizar la
Rosendo Balois-Morales2 ,
variabilidad morfológica y genética del fruto de nanche nativo. El trabajo se realizó
Pedro Ulises Bautista- durante el año 2020, se hizo una recolecta en huertos comerciales en San Lorenzo
Rosales2 , (SL’s), municipio de Ruiz, Nayarit, se realizó una caracterización morfológica, fisico-
José Orlando Jiménez- química y molecular, el análisis estadístico se efectuó con el paquete (SAS) ver.9.0 y
Zurita2∗ los datos genéticos fueron analizados con el software GenAlEx. Los genotipos SL-4
y SL-8 (cultivados) y de los nativos NAT-5 y NAT-6, son de selección del productor,
1 Unidad Académica de Agri- que optan por las siguientes características: nanche grande, dulce, agridulce o
agrio, y de color amarillo. Se encontraron ocho marcadores microsatélites ISSRs
cultura, Universidad Autónoma
con los cuales se obtiene polimorfismo, el análisis de conglomerados formo cuatro
de Nayarit. Km. 9 Carretera
grupos con las 15 accesiones de nanche, el número máximo de alelos fue siete,
Tepic-Compostela. Xalisco, la heterocigosis esperada (He) se obtuvo en un rango de 0.58-0.62, la cual es una
Nayarit, México. medida de la diversidad genética, estos índices indican alta diversidad genética de
2 Unidad Tecnología de Alimen-
nanche en los municipios de Nayarit.
tos. Secretaria de Investigación Palabras clave: Byrsonima crassifolia, calidad de fruto, marcadores moleculares,
y posgrado. Universidad recursos filogenéticos, variabilidad.
Autónoma de Nayarit. Ciudad
ABSTRACT. The nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K) belongs to the
de la cultura S/N, CP. 63000,
Malpighiaceae family. The genus Byrsonima has a noetropical distribution and
Tepic, Nayarit, México. is highly diverse with more than 100 species. The objective of this work was to
characterize the morphological and genetic variability of the native nanche fruit. The
∗ Autor de correspondencia: work was carried out during the year 2020, a collection was made in commercial
jose-jimenez@[Link] orchards in San Lorenzo (SL’s), municipality of Ruiz, Nayarit, a morphological,
physicochemical and molecular characterization was carried out, the statistical
Artículo científico analysis was carried out with the package (SAS) ver.9.0 and the genetic data were
Recibido: 30 de marzo 2023 analyzed with the GenAlEx software. The SL-4 and SL-8 genotypes (cultivated) and
the native NAT-5 and NAT-6, are selected by the producer, who opts for the following
Aceptado: 15 de noviembre
characteristics: large, sweet, bittersweet or sour nanche, and yellow in color. Eight
2023
ISSRs microsatellite markers were found with which polymorphism is obtained, the
cluster analysis formed four groups with the 15 nanche accessions, the number of
Como citar: López-Guzmán alleles was seven maximums, the expected heterozygosity (He) was obtained in a
GG, Balois-Morales R, range of 0.58- 0.62, which is a measure of genetic diversity, these indices indicate
Bautista-Rosales PU, Jiménez- high genetic diversity of nanche in the municipalities of Nayarit.
Zurita JO (2023) Caracteri- Key words: Byrsonima crassifolia, fruit quality, molecular markers, phylogenetic
zación morfológica y molecular resources, variability.
de nanche (Byrsonima crassifo-
lia L.) nativo de Nayarit, México.
Ecosistemas y Recursos
Agropecuarios 10(3): e3714.
DOI: 10.19136/era.a10n3.3714
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López-Guzmán et al.
Caracterización morfológica y molecular de nanche
Ecosist. Recur. Agropec. 10(3): e3714, 2023
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Las variables evaluadas en el fruto fueron: peso mesa (Thermo Scientific, Waltham, MA, USA) a tem-
fresco fruto (PFF), longitud (LF), diámetro ecuatorial peratura ambiente. El sobrenadante fue transferido a
(DE) y diámetro polar (DP), utilizando un vernier elec- un tubo nuevo de 2 mL, repitiendo el proceso.
trónico (Mitutoyo). A los frutos (madurez de consumo) Se agregaron 800 µL de etanol frio (-20 °C)
se le separaron las semillas de la pulpa, éstas se al sobrenadante invirtiendo de manera suave los tu-
deshidrataron directamente expuestas a la radiación bos hasta que se forma la pastilla de ADN, luego se
solar, por un periodo de 72 horas, obteniendo el peso centrifugó a 10.000 rpm durante 6 min y se decantó
seco de la semilla (PSS). el sobrenadante, sin que se desprenda la pastilla de
De los 15 genotipos que se muestrearon, se ADN que se encuentra en el fondo. Se realizaron
seleccionaron al azar 10 hojas de tamaño homogé- lavados con etanol al 75 y al 95%. En cada lavado se
neo, evaluando área (A, cm2 ), longitud (B, cm), an- agregaron 1000 µL de solución agitando suavemente
chura media (C, cm) y anchura máxima de hoja (D, durante 10 min, seguido de una centrifugación a 10
cm) para esto se utilizó un integrador de área foliar 000 rpm durante 10 minutos. Las pastillas de ADN
(Li-Cor); adicional se obtuvo el peso fresco (PFH, g), se dejaron secar para evaporar completamente el al-
peso seco (PSH, g) de la hoja, utilizando una balanza cohol y luego se disolvieron en 300 µL de tampón TE
digital (Precisa) y balanza electrónica (Ohasus). (10mM Tris-HCl pH 8, 1 mM EDTA). Las muestras se
A los frutos de nache se le evaluaron con- almacenaron a -20 °C hasta su uso.
tenido de solidos solubles totales (°Brix) y acidez
titulable (AT), utilizando refractómetro (0-32 °, Atago) Cuantificación de ADN
poniendo directamente una gota de jugo en la celda La cantidad y calidad del ADN se determinaron
del aparato, la AT se evalúo en base al porcentaje por espectrofotometría (260/280 OD) en un Nanodrop
de ácido cítrico presente, la titulación se realizó con 2000 (Genova Nano, Jenway, USA); además, se
0.1% de NaOH y fenolftaleína 1% como indicador visualizaron las muestras mediante electroforesis de
(AOAC, 2005), el pH se midió de la pulpa macerada 100 ng de ADN genómico total en geles de agarosa
de 10 frutos (con dilución 10:1) con potenciómetro al 1% con la solución de TBE 1X (Tris Borato-EDTA
digital (Hanna). pH 8.0).
quete (SAS) ver. 9.0. donde se realizó un análisis (C) 4.34 cm y anchura máxima de la hoja (D) 6.28 cm.
de estadística descriptiva, se determinó varianza,
medias, coeficiente de variación (CV), un análi- Componentes principales
sis multivariado componentes principales y análisis Dos componentes principales (CP’s) expli-
de agrupamientos por el método de agrupamiento caron 81.48% de la varianza total (VT). CP1 explicó
de Ward. Con los datos obtenidos a partir de los 64.03% de la VT con un valor propio de 7.68% (Tabla
geles de agarosa se construyó una matriz binaria de 2); donde resultaron relevantes por los promedios de
datos dominantes (1 para presencia y 0 para ausen- sus vectores característicos: A, B, PFH, PSH, DE,
cia). Los datos fueron analizados con el software DP, D, PF, C, PSS y AC (Figura 1). El CP2 presentó
GenAlEx 6.5 para determinar parámetros de diver- una varianza proporcional de 17.45%, con un valor
sidad genética a nivel de población como porcentaje característico de 2.09. En este componente resul-
de loci polimórficos (% P) y heterocigosidad esperada taron importantes para la agrupación de los genoti-
(He) y heterocigocidad observada (Ho). A partir de pos de nanche con sólidos solubles totales del jugo
la matriz de distancias genéticas se generó un den- del fruto (°Brix), la anchura media de la hoja (C) y el
drograma basado en el método de Neighbor-Joining peso fresco del fruto.
(Nei 1977) utilizando el programa MEGA 5.
Tabla 2. Vectores característicos de las variables de fruto
y hoja en genotipos de nanche de los primeros tres compo-
nentes principales (CPs).
Tabla 1. Lista de primers usa-
dos para el análisis molecular en B. Variable CP1 CP2
crassifolia (L.) H.B.K y sus respecti- PFF: peso fresco del fruto (g) -0.82 -0.51
vas secuencias. PSH: peso seco de la hoja (g) -0.89 0.33
DP: diámetro polar de fruto (mm) -0.82 -0.50
No. Microsatélites
DE: diámetro ecuatorial de fruto (mm) -0.82 -0.48
1 (GACA)4
BX: °Brix de la pulpa del fruto 0.32 -0.13
2 (ATG)8 AC: acidez titulable 0.57 0.56
3 (GA)10 PFH: peso fresco de la hoja (g) -0.91 0.29
4 (TACA)6 PSS: peso seco de la semilla (g) -0.75 -0.44
5 (TC)4 (TG)(TC)15 A: área de la hoja (cm2 ) -0.93 0.34
6 (ACC)2 ATCGTCAC(ACC)9 B: longitud de la hoja (cm) -0.92 0.18
7 (GT)11 C: anchura media de la hoja (cm) -0.77 0.51
8 (GTTT)5 T(GTTT)1 D: anchura máxima de la hoja (cm) -0.85 0.47
9 (GTT)5 Valor característico 7.68 2.09
10 (ATTT)7 Varianza proporcional (%) 64.03 17.45
Varianza acumulada (%) 64.03 81.48
RESULTADOS
En el dendograma con corte a distancia eu-
Estadísticas simples clidiana de 0.30 se formaron tres grupos (Figura
En el análisis de varianza, todas las variables 2). El Grupo I intregrado por SL-1, NAT-2 y NAT-
originales de fruto de los genotipos de nanche 7 (agridulce), NAT-1, NAT-3, NAT-9 (dulces). Con
evaluados resultaron altamente significativas (Pr > respecto a los sólidos solubles totales (°Brix) encon-
F = 0.0001); los coeficientes de variación (CV) os- trados variaron de 17.2 (NAT-3) a 10.9 (NAT-9), Con
cilaron entre 11.98 a 2.91% vistos como una medida respecto a la acidez titulable SL-1 tiene menor valor
de precisión de las mediciones. La media general de (1.0) y NAT-2 con un valor de 2.14. (Tabla 3). El Grupo
las variables fue de 4.93 g para peso fresco del fruto II formado por SL-2, SL-7, SL-3, los cuales tienen un
(PFF), peso seco de la hoja (PSH) 0.59 g, diámetro sabor dulce, los NAT-5 y NAT-6 tienen sabor agrio, los
polar de fruto (DP) 17.76 mm, diámetro ecuatorial de sólidos solubles totales (°Brix) arrojaron valores de
fruto (DE) 20.06 mm, peso fresco de la hoja (PFH) para SL-2 de 17.65 el valor más alto y para NAT-5 de
1.47 g, peso seco de la semilla (PSS) 0.31 g, área 11.70, la acidez titulable fue para SL-2 0.42 y SL-7
(A) 53.44 cm2 , longitud (B) 11.99 cm, anchura media 0.26. El Grupo III donde encontramos a SL-4, SL-5,
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Ecosist. Recur. Agropec. 10(3): e3714, 2023
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Figura 1. Diagrama de dispersión de 16 genotipos de nanche con base en dos componentes principales.
Figura 2. Dendograma generado por 16 genotipos de nanche cultivados en Nayarit, utilizando el método
de Ward.
SL-6 y NAT-4, esos tienen una acidez titulable que Para los ocho loci polimórficos (P), se estimó el
fluctúa entre 2.23 y 0.31%, con nanches ácidos y número de alelos por locus (Na), heterocigosidad ob-
dulces. servada (Ho), heterocigosidad esperada (He), para
La relación entre los azúcares y ácidos orgáni- siete árboles de Tepic y nueve de San Lorenzo, en
cos presentes en los frutos definen el sabor final dos poblaciones se obtuvieron valores para Na de 7
que éstos tienen al momento de consumirlos y se a 1 en ambas poblaciones. Por lo tanto, se obtuvo
considera el parámetro más útil para clasificar a los el porcentaje promedio de loci polimórfico (P) donde
nanches por su sabor. Donde, toda la serie de San Tepic presentó el promedio de P más alto (53.87%) y
Lorenzo (SL’s), más NAT-6, NAT-3 y NAT-9 resultaron San Lorenzo de 47.75% (Tabla 3).
dulces; de la serie nativos NAT-7 y NAT-10 fueron El análisis de conglomerados (Figura 3) formo
agridulces y NAT-4, NAT-5, NAT-1, NAT-8, y NAT-2 4 grupos con las 15 accesiones de nanche con una
resultaron ácidos, dicha relación puede resultar un distancia euclidiana de 3.0. En el primer grupo for-
parámetro útil de selección (Tabla 3). Las selecciones mado por SL-1, NAT-3, SL-3, siendo NAT-6, NAT-7 y
UAA1, UAA10 y UAA17 las cuales mostraron el mayor SL-5, SL-7 con características muy semejantes con
contenido de solidos solubles totales, mientras que la tamaño chico y mediano de fruto, de forma esferoide
selección UAA4 (5.4 °Brix) presentó el contenido más y ovoide, con un rango de °Bx de 11.5-12.0 y ácido
bajo. En cuanto a la acidez titulable, muestran valores cítrico de 1.50-0.31. El grupo 2 formado por NAT-4 y
para la pulpa de nanche desde 0.29% hasta 2.76%, NAT-5 con características iguales con sabor agridulce
y la selección UAA5 (2.76%) presentó el mayor con- y tamaño mediano, con un °Bx de 12-13% y ácido
tenido y la selección UAA1 (0.29%) el contenido más cítrico de 12.23-3.4.
bajo. El índice de sabor (TSS/TA) en los frutos de El grupo 3 formado por SL-2, NAT-9, SL-4 y
nanche presentó una variación de 3.7 a 40.1, por lo SL-6 características similares siendo de sabor dulce
tanto, se consideran de ácido a dulce. y agrio, de tamaño mediano y grandes, °Bx de 11.5-
12.0 y el ácido cítrico de 1.50-0.31 y el grupo 4 consti-
Análisis molecular tuido por NAT-4 y NAT-2 los cuales tienen característi-
Los valores del coeficiente de heterocigocidad cas muy similares de sabor agrio, tamaño moderado,
esperada (He) oscila entre -1 a 1. El promedio de °Bx de 12.0-13.0 y ácido cítrico de 2.23-3.4, los
He de las tres zonas evaluadas fue de 0.050, Tepic cuales se agrupan de forma muy independiente de
obtuvo un valor de He promedio de 0.65, seguido de los demás grupos, esta formación de grupo la genero
San Lorenzo con un valor de 0.58. Estos resultados estos marcadores moleculares ISSRs lo cual indica
indican que las dos zonas evaluadas son materiales que son viables de utilizar para determinar variabili-
criollos y, por lo tanto, la variabilidad suele ser alta. dad de nanche.
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Figura 3. Dendograma de nanche (B. crassifolia (L.) H.B.K) por el método UPGMA (Dice) con marcadores
tipo ISSRs.
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aceroleira, siendo 38 provenientes de un jardín de bién observó una falta de correlación entre el grado
semillas y 18 de un jardín clonal, observando valores de similitud genética obtenido en base a marcadores
variando entre 0.358 a 0.766 (He) formando 28 gru- de ADN y origen de las accesiones. En este caso, los
pos en el dendograma. autores apuntan a la posibilidad de que el origen de
El uso de marcadores moleculares permite accesiones difiere del lugar de recolección.
identificar la diversidad genética, por lo que en
posible tener un panorama sobre la distribución de
la especies, ya sea por región, zona, país, este CONCLUSIONES
conocimiento es de suma importancia no solo para
el genetista sino también para los productores de Los genotipos SL-4 y SL-8 (cultivados) y de los
nanche, de tal manera que les permita llevar a cabo nativos NAT-5 y NAT-6, tienen las siguientes carac-
futuras investigaciones en el mejoramiento genético; terísticas: nanche grande, dulce, agridulce o agrio, y
al respecto, investigaciones en Tabasco, México con de color amarillo. Se encontraron ocho marcadores
árboles de nanche (Martínez et al. 2013) utilizando microsatélites los cuales determinaron la variabili-
seis amplificaciones aleatorias de ADN polimórfico dad genética de nanche en las poblaciones de B.
(RAPD), de éstos tres eran polimórficos, cuyos re- crassifolia (L.) H.B.K tanto cultivada como nativos. El
sultados fue de un 85.20% de diversidad genética, nanche tiene potencial, pero se necesitan más inves-
mientras que entre poblaciones fue de 14.80%, con- tigaciones para conocer todas las propiedades nutri-
cluyendo que los marcadores dominantes coadyu- cionales, domesticar y homogeneizar la producción y
van a identificar la variación genética del nanche. establecer las bases técnicas y tecnológicas para su
Al respecto, Spegiorin et al. (2002) realizaron cultivo.
una investigación donde el análisis de la matriz de
similitud genética y el dendrograma permitió identi-
ficar cinco grupos distintos entre las 24 accesiones AGRADECIMIENTOS
de acerola. Algunos grupos de accesiones se unieron
debido a que comparten características químicas A la Unidad Académica de Agricultura de la
y morfológicas. Mientras que Yee et al. (1999), Universidad Autónoma de Nayarit, por facilitar las
analizando accesiones de Vigna angulararia, tam- instalaciones para realizar esta investigación.
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