UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
FACULTAD DE INGENIERÍAS
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA
AMBIENTAL
INFORME: “Análisis de Secuencias de ADN mediante BioEdit y
Comparación en GenBank”
CURSO: Microbiología Ambiental
DOCENTE: Dr. Soto Gonzales, Hebert Hernan
CICLO: VII
ALUMNA: Flora Vanesa Cueva Apaza
CÓDIGO: 2022205036
ILO - PERÚ
2025
I. INTRODUCCIÓN:
El análisis de secuencias de ADN se ha convertido en una herramienta esencial en
la biología molecular moderna, ya que permite identificar organismos, estudiar
relaciones evolutivas, caracterizar especies y comprender la función genética de
diversos microorganismos. Para realizar este tipo de análisis, es fundamental
contar con herramientas bioinformáticas que faciliten la edición, organización y
comparación de las secuencias obtenidas en el laboratorio o proporcionadas para
fines académicos. Entre estas herramientas, BioEdit destaca por ser un software
de uso sencillo, ligero y ampliamente utilizado en la enseñanza y el análisis inicial
de secuencias biológicas. BioEdit permite visualizar fragmentos de ADN,
editarlos en formato FASTA, revisar su longitud, corregir errores, y prepararlos
para análisis posteriores en plataformas especializadas. Su implementación en
actividades formativas facilita a los estudiantes familiarizarse con el manejo de
datos genéticos y comprender los procesos que forman parte del análisis
molecular.
II. OBJETIVOS:
2.1 Objetivo general:
• Analizar secuencias de ADN proporcionadas por el docente mediante su
edición en BioEdit y su posterior comparación en un banco genético para
identificar su origen y características biológicas.
2.2 Objetivos especificos:
• Organizar y editar las secuencias en formato FASTA dentro del programa
BioEdit para facilitar su interpretación y manejo.
• Comparar las secuencias analizadas utilizando un banco genético (GenBank –
NCBI) con el fin de identificar similitudes, organismos relacionados y
posibles funciones biológicas.
III. METODOLOGIA:
En el presente trabajo se analizaron varias secuencias de ADN proporcionadas por
el docente. Estas fueron organizadas y editadas en formato FASTA mediante el
programa BioEdit, lo que permitió revisar su longitud y características básicas.
Figura 1: Exportando las secuencias a FASTA
Posteriormente, cada secuencia fue comparada en el banco genético GenBank
utilizando la herramienta BLAST, con el fin de identificar similitudes y
determinar el posible organismo de origen. Los resultados obtenidos se integraron
en una tabla comparativa que incluyó tamaño, tipo de organismo, porcentaje de
identificación y nombre científico. Este proceso permitió relacionar el uso de
BioEdit con herramientas bioinformáticas de búsqueda, facilitando la
interpretación y clasificación de las secuencias analizadas.
Figura 2: Colocando la secuencia en el Banco Genético
A continuación, mostrare la Tabla de las secuencias:
Tabla 1: Características básicas de cada secuencia
Cod O. ADN Tamaño Tipo de organismo % Identificación Nombre Cientifico
Bacteria
E09_5_09 981 gramnegativas 83.46% [Link]
Bacterias
E10_13_10 1017 gramnegativas 66.75% [Link]
Bacterias
F07_6H_11 915 gramnegativas 95.43% [Link]
Bacterias
F09_6_11 956 gramnegativas 82% [Link]
Bacterias
GO7_7H_13 931 gramnegativas 91.07% [Link]
Bacterias
G09_7_13 935 gramnegativas 73.58% [Link]
Bacterias Enterobacter
G10_14_15 950 gramnegativas 93.40% asburiae
Bacterias
H10_16_16 948 gramnegativas 84.42% Enterobacter sp.
Fuente: Propia
IV. CONCLUCIONES:
• El uso de BioEdit permitió organizar, editar y preparar adecuadamente las
secuencias de ADN en formato FASTA.
• Los porcentajes de identificación, que oscilaron entre 66.75 % y 95.43 %,
demuestran que la mayoría de las secuencias presentan una coincidencia
significativa con organismos registrados en bases de datos.
• La combinación de BioEdit y BLAST constituye un procedimiento
eficiente para el análisis molecular, ya que integra la edición de secuencias
con la identificación taxonómica, fortaleciendo la comprensión y
aplicación práctica de técnicas de biología molecular.
V. ANEXOS
Identificación de la secuencia genética de árbol filogenético del articulo
Figura 3: Árbol de máxima verosimilitud para Candida metapsilosis cepa SH1.
Fuente: Tomado del artículo
Tabla 2: Secuencia Genetica del Arból genetico
Código Tamaño Tipo de organismo % Nombre
Identificación Cientifico
KM361387 1701 Virus 100% Influenza A
virus
KM361836 499 Hongo Unicelular 100% Candida
(Levadura) metapsilosis
FM178394 525 Hongo(Levadura) 100% Candida
orthopsilosis
FM178400 532 Hongo(Levadura) 100% Candida
orthopsilosis
FM178399 517 Hongo(Levadura) 100% Candida
orthopsilosis
EF568034 478 Hongo (Levadura) 100% Candida
parapsilosis
KJ451653 844 Hongo levaduriforme 100% Candida
parapsilosis
AJ865083 546 Hongo (Levadura) 100% Candida
dubliniensis
KJ722418 1184 Levadura 100% Candida maltosa
NR111018 591 Hongo 100% Babjeviella
inositovora
Fuente: Propia
“Biodegradación de hidrocarburos alifáticos saturados por microorganismos
aislados de suelo contaminado con derivados del petróleo”
Resumen:
El estudio identificó dos microorganismos nativos capaces de usar queroseno como única fuente de
carbono. Estas cepas degradaron hidrocarburos de cadena larga, generando compuestos más
cortos. Se evidencia su potencial para la biorremediación de suelos contaminados.
Muestreo: Suelo recolectado en un taller de
bicicletas contaminado con gasolina y ACPM.
Aislamiento de microorganismos: Se aislaron
4 bacterias y 1 levadura.
Materiales y Se realizó pruebas en queroseno a 2%, 6% y 10%.
y se seleccionaron las más tolerantes: SH1 y SH3.
Métodos:
Identificación: SH3: Burkholderia cepacia.
SH1: Candida metapsilosis.
Ensayos de biodegradación: Incubación durante
67 días con queroseno (2%, 6% y 10%),
Cuantificación de hidrocarburos (C10–C16).
Introducción:
Los derrames de petróleo Ambos microorganismos degradaron
generan toxicidad en hidrocarburos de cadena larga (C14–C16).
suelos y ecosistemas, y
Resultados y discusión :
los métodos químicos
pueden empeorar el C. metapsilosis SH1
daño. La biorremediación y B. cepacia SH3 B. cepacia mostró mayor capacidad
ofrece una alternativa crecieron con degradadora y mayor fragmentación.
mediante queroseno al 10%.
microorganismos
capaces de degradar B. cepacia podría generar enzimas
hidrocarburos. El estudio inducibles especializadas en
analiza si microbios degradación de hidrocarburos.
nativos pueden degradar
queroseno.
Candida metapsilosis SH1 y Burkholderia
cepacia SH3 toleran y degradan
eficientemente queroseno.
Fragmentan hidrocarburos alifáticos de
Concluciones: cadena larga hacia compuestos más
simples.
C. metapsilosis se propone como un nuevo
organismo útil en biorremediación de suelos
contaminados
Importante:
Los resultados demuestran que los microorganismos nativos pueden ser una solución viable
para descontaminación de áreas afectadas con derivados del petróleo.