ELECTIVA IV: INTRODUCCIÓN A LA QUÍMICA COMPUTACIONAL.

GRUPO NÚMERO 01.

CÓDIGO 45783.

TUTORIAL 7: ENTROPY AND GIBBS FREE ENERGY

Fábregas Domínguez Geraldine Paola1, Fernando Castro Gómez 2.
gfabregas@[Link] 1, Profesor 2

Resumen

En el siguiente informe vamos a describir el proceso de configuración del software spartan

14 para calcular las propiedades termodinámicas de la reacción entre ciclohexeno y bromo, y
de las demás moléculas relacionadas como lo son,1-bromociclohexeno y ácido bromhídrico
(HBr). En la utilización de este software comenzamos dibujando las distintas moléculas para
visualizar también su espectro infrarrojo y así mismo, calcular las propiedades
termodinámicas como H∘ (entalpía) y G∘ (energía libre de Gibbs) en unidades atómicas (au).
Para después realizar la conversión de unidades de au a kcal/mol, para finalizar realizando el
calculo de entalpia de la reacción estudiada.

Palabras clave: entalpia, termodinámica, espectro infrarrojo. Unidades atómicas.

Abstract

In the following report we are going to describe the configuration process of the spartan 14
software to calculate the thermodynamic properties of the reaction between cyclohexene and
bromine, and the other related molecules such as 1-bromocyclohexene and hydrobromic acid
(HBr). When using this software, we begin by drawing the different molecules to also
visualize their infrared spectrum and also calculate thermodynamic properties such as H∘
(enthalpy) and G∘ (Gibbs free energy) in atomic units (au). To then carry out the conversion
of units from au to kcal/mol, to finish by calculating the enthalpy of the reaction studied.

Keywords: enthalpy, thermodynamics, infrared spectrum. Atomic units.

 1. Introducción
La química computacional es el modelado cuantitativo de fenómenos de interés químico
usando técnicas computacionales: destacan en esta definición por un lado modelado
cuántico, es decir, la creación de modelos capaces de reproducir la realidad de forma
precisa en estos modelos son los que provee la química teórica en el sentido más general
por otro lado técnicas constitucionales es decir la implementación eficiente de los modelos
y su utilización a través y gracias a la tecnología informática. En este contexto, se
desarrollan algoritmos eficientes se utilizan distintos paradigmas de computación y se usa o
desarrollan técnicas de visualización y representación de datos y de moléculas. De
vibraciones de Gran amplitud la mayoría de las moléculas que nos encontramos en la
naturaleza sobre todo las de interés orgánico o biológicos son flexibles y ese
comportamiento. hay que tenerlo en cuenta en las simulaciones utilizadas para reproducir o
predecir propiedades moleculares normalmente se considera que los movimientos de los
átomos a las moléculas son armónicos, es decir, que los átomos son muy poco de su
posición de equilibrio esto solo es así de manera muy aproximada pues el movimiento que
son de muy gran amplitud e incluso ocurren grandes desplazamientos de grupos de núcleos
con rotura o formación de enlaces reacción química.
La termodinámica como estudio de las relaciones energéticas de todo tipo la cual es
fundamental y se aplica prácticamente en toda la ciencia en el área de estudio. La
termodinámica química son las reacciones de cierta clase de energía en los sistemas
químicos la termodinámica abarca la medición interpretación de los cambios caloríficos
que acompañan a los procesos químicos.
La entalpía.
Definimos la entalpía de una reacción química como el valor absorbido o desprendido en
dicha reacción química cuando esta transcurre a presión constante, es decir, el valor de
entalpía es distinto según a qué presión y a qué temperatura se lleva a cabo la reacción. por
este motivo, se define unas condiciones estándar las condiciones estándar termoquímica son
25°c y 1 atm de presión, cuando la reacción se lleva a cabo en dichas condiciones
estándares su variación recibe el nombre de entalpía estándar de reacción o también
entalpía normal de reacción y se representa como ΔH.
Reacciones endotérmicas y reacciones exotérmicas
En las ecuaciones termoquímicas indicadas previamente aparecen los correspondientes
valores de entalpía estándar de reacción para diversas reacciones, y todas ellas tienen
signo negativo.
Una Reacción Exotérmica: Es una reacción química que desprende energía en forma de
luz o calor. En ella, la energía o entalpía de los reactivos es mayor que la de los productos.
Por lo tanto, en una Reacción Exotérmica: ΔH = HProductos- HReactivos< 0
Una reacción endotérmica es aquella que para efectuarse necesita calor. A temperatura
ambiente, algunas reacciones endotérmicas toman el calor suficiente del medio en que se
encuentran, para producir una disminución de temperatura observable. La reacción se siente
“fría al tacto”.
Las reacciones exotérmicas y endotérmicas, de manera general, se llaman reacciones térmicas
para resaltar el papel del calor en el cambio.

La espectroscopía infrarroja (IR) se basa en el hecho de que la mayoría de las moléculas absorben
la luz en la región infrarroja del espectro electromagnético, convirtiéndola en vibración molecular.
Esta absorción es característica de la naturaleza de los enlaces químicos presentes en una
muestra. Con un espectrómetro, esta absorción se mide como una función de longitud de onda
(como números de onda, típicamente de 4000 - 600 cm-1). El resultado es un espectro IR que sirve
como una característica "huella digital molecular" que se puede utilizar para identificar muestras
orgánicas e inorgánicas.

2. Objetivo general
Calcular las propiedades termodinámicas como la entalpia de la reacción estudiada y
del mismo modo, analizar y visualizar los espectros infrarrojos (IR) para comprender
los cambios energéticos en la reacción y el comportamiento vibracional de cada
molécula.

2.1 Objetivos específicos:

 Configurar y realizar cálculos termodinámicos para cada molécula y obtener su
espectro infrarrojo.
 Analizar los valores de entalpía de cada molécula y realizar la conversión de
unidades.
 Calcular el cambio de entalpía de la reacción y realizar una interpretación de
los resultados.
3. Tutorial

Desarrollo del tutorial para obtener el espectro infrarrojo de 5 moléculas en el software

de spartan 14.

1. Primera molécula ciclohexano. Se abrió el software spartan 14 y dibujar la

molécula con que se va a trabajar en este caso el ciclohexano, hacerlo como en
los tutoriales anteriores, luego de esto se seleccionó el botón de “view” para
visualizar la molécula en 2D y comenzar con la configuración.

2. Se realizo la configuración de los cálculos:

Se hizo clic en el icono de “setup” y luego se seleccionó la opción de
“calculations” como se muestra en la imagen, seguido de esto, luego de que
apareció la ventana emergente, se procede a realizar la configuración, como en
los tutoriales anteriores, con la diferencia que se seleccionó la opción del IR,
como se muestra en la imagen. y se le dio clic en la opción “submit”.
3. Aparecerá dos ventanas emergentes, una avisando que iba a comenzar el proceso
y otra, avisando que ya va a terminar el proceso, a ambas se le da clic “ok”.

4. Se selecciono la opción de “Display” y seguido de esto la opción de “properties”

como se ve en la primera imagen, apareció una ventana emergente donde se
observo las propiedades de dicha molécula, se dio clic en la opción
“termodinámica”.
5. Se procedió a dar clic en la opción de “display” pero esta ver se seleccionó la
opción de “spectra” para visualizar el espectro, luego se le dio clic en el icono
de + .

6. En esta nueva ventana emergente se le da clic en la opción de calcular espectro

infrarrojo como se muestra en la imagen, para visualizar el espectro infrarrojo
de la molécula ciclohexano.

2. Segunda molécula de bromo.

Comenzamos siguiendo el proceso como en la anterior molécula, se dibujo y se
procedió a visualizarla en 2D, en el software sparta 14.
3. Se procedió a seleccionar “setup” y luego “calculations”, en la ventana emergente
que apareció se configuro como con la molécula anterior. Para finalizar damos clic
en la opción “submit”.

4. Le dio “OK” a las dos ventanas emergente, la primera para confirmar que ha
empezado con la configuración y la segunda para confirmar que se ha terminado
con la configuración.

5. En la pantalla se vuelve a seleccionar la opción “display” y a su vez la opción

“properties” en donde se visualizó las propiedades termodinámicas de esta
molécula.
6. Se procedió a seleccionar la opción “display” y luego “specta” como se muestra en
la imagen, luego se hace clic en la opción de +, para visualizar el espectro
infrarrojo.

7. En la ventana emergente que salió, se seleccionó la opción de calculo de IR como se

muestra en la imagen para así visualizar el IR de la molécula como se muestra en la
imagen.
3. Tercera molécula 1,2-dibromociclohexano.
Se realiza a la molécula en el software y procedió a visualizarlo en 2D para
realizar la configuración.

2. Se realizo la configuración, igual como en las moléculas anteriores y como

se muestra en la imagen.

3. Luego se darle clic a botón de “submit” en la configuración anterior, se le da

clic en el “ok” lo que confirma que ha comenzado y ha finalizado la
configuración.
4. Se le da clic a la opción de “display” y luego “properties” aparecerá el
recuadro de las propiedades termodinámicas de la molécula.

5. Para visualizar el espectro infrarrojo de la molécula, se da clic en “display” y

luego “spectra” para finalizar la opción +.

6. Para visualizar el espectro infrarrojo de la molécula se da clic en calculo de

infrarrojo como se ve en la imagen y se visualiza el IR.
 4. Cuarta molécula 1-bromociclohexeno.
Realizamos la molécula en el software y la visualizamos en 2D

2. se procede a dar clic en la opción de “setup” y luego en “calculations”, en la ventana

emergente, se realizó la misma configuración que en las moléculas anteriores.

3. luego de darle clic en el botón de “submit” se de la “ok” a las dos ventanas

emergentes que salieron.
4. Se selecciono la opción de “display” y luego “properties” para visualizar las
propiedades termodinámicas.

5. Se vuelve a seleccionar la opción “display” y luego la opción” spectra” para

finalizar se le da clic a la opción IR calculated.

6. Se visualizo el espectro infrarrojo de la molécula.

 5. Quinta molécula: se realizó la molécula en el software, se visualizó en 2D.

1. Se procedió a configurar la molécula como con las moléculas anteriores.

2. Se le da “oK” en las dos ventanas emergentes para comenzar y finalizar con la

configuración.
3. Se procede a verificar las propiedades de la molécula, del mismo modo con las
moléculas anteriores, siguiendo los pasos de la imagen.

4. Se procede a darle clic al botón de “display” y seguido de esto a la opción de

“spectra” y finalmente se le clic en el +, y por ultimo un clic en la opción de “ IR
calculade”.

5. Se procedió a visualizar la molécula con su espectro infrarrojo

Conversiones de unidades termodinámicas
Molécula H°(au) H°(Kcal/mol) G°(au) G°(Kcal/mol)
0.135969299 85.28 kcal/mol 0.101627533 63.76Kcal/mol

0.00841024275 5.28Kcal/mol -0.0194834394 −12.22Kcal/mol

0.106005952 66.54Kcal/mol 0.0636829669 39.96Kcal/mol

0.126585381 79.43270Kcal/m 0.0872126552 54.73Kcal/mol

ol

-0.0159781330 10.02Kcal/mol -0.0385593607 −24.19Kcal/mol

Cálculos para la conversión:

H° a Kcal/mol
 H°(kcal/mol) = 0.135969299 au x 627.509 kcal/mol/au ≈ 85.28 kcal/mol
 H°(Kcal/mol) =0.0084102475×627.509≈5.28Kcal/mol
 H°(Kcal/mol) = 0.126585381×627.509≈79.43270Kcal/mol
 H°(Kcal/mol) =0.106005952×627.509≈66.54Kcal/mol
 H°(Kcal/mol) =−0.0159781330×627.509≈−10.02Kcal/mol
De G° a Kcal/mol

 G°(Kcal/mol) =0.101627533×627.509≈63.76Kcal/mol
 G°(Kcal/mol) =−0.0194834394×627.509≈−12.22Kcal/mol
 G°(Kcal/mol) =0.0636829669×627.509≈39.96Kcal/mol
 G°(Kcal/mol) =0.0872126552×627.509≈54.73Kcal/mol
 G°(Kcal/mol) =−0.0385593607×627.509≈−24.19Kcal/mol
Hallar la entalpia: teniendo en cuenta la siguiente reacción. Re

Identificar los reactivos en la reacción:

 Ciclohexeno: H∘=85.28 Kcal/mol

 Bromo: H∘=5.28 Kcal/mol

Identificar los productos en la reacción:

 1-Bromociclohexeno: H∘=66.54 Kcal/mol

 Ácido bromhídrico (HBr): H∘=10.02 Kcal/mol

Se aplica la siguiente formula:

ΔH = (66.54+10.02) −(85.28+5.28)

=−14.0 Kcal/mol

Luego de analizar el resultado obtenido que fue de =−14.0 Kcal/mol, se pudo determinar
que se trata de una reacción exotérmica, ya que según el resultado de la entalpia ΔH en
este caso es negativo, lo que demuestra que la energía que se libera en la formación de los
productos es mucho mayor que la energía absorbida cuando se rompen los enlaces en los
reactivos.
Conclusión:
A manera de conclusión según los resultados obtenidos y el calculo de las propiedades
termodinámicas como la entalpia, permitió una compresión mas profunda sobre los
cambios energéticos y la estabilidad de los productos de la reacción, gracias al calculo de la
entalpia se pudo analizar y determinar que se trataba de una reacción exotérmica, ya que, el
resultado de la entalpia fue negativo, lo que sugiere que la reacción es energéticamente
favorable, por otro lado las distintas visualizaciones de las moléculas en cuanto a su
espectro infrarrojo permitió observar los modos vibracionales característicos de cada
molécula estudiada confirmando así la presencia de enlaces específicos en las estructuras.
Bibliografía.

 1 Reacción exotérmica y endotérmica. Portal Académico del CCH. 2015

. [citado el 15 octubre de 2024]. Disponible en:
[Link]
sQuimicas/reaccionexotermicaendotermica
 Guía sobre espectroscopía FT-IR. [Link]. [citado el 15 Octubre de
2024]. Disponible en: [Link]
solutions/infrared-and-raman/ft-ir-routine-spectrometer/what-is-ft-ir-
[Link]
 Fallas AGT. INTRODUCCIÓN A LA TERMOQUÍMICA. [Link].
[citado el 15 de octubre de 2024]. Disponible en:
[Link]
ISC%200003%[Link]?sequence=1&isAllowed=y
 SPARTAN 14