UNIVERSIDAD NACIONAL DE LA AMAZONÍA PERUANA
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA DE FORMACIÓN PROFESIONAL DE BIOLOGÍA
EXAMEN DE BIOINFORMATICA
ASIGNATURA:
BIOINFORMATICA
DOCENTE:
BLGA. MARTHA RENGIFO PINEDO
ESTUDIANTE:
ACOSTA GAMA PAUL DAVID
GRUPO 1
IQUITOS - PERU
1. SELECCIONAR LA PROTEÍNA DE INTERÉS (NCBI): EN ESTE CASO SE SELECCIONÓ
ADENINA
buscamos en la base de datos del NCBI la proteína y además usamos un Booleano y una
característica o un organismo de preferencia en este caso phosphoribosyltransferase
2. luego escogemos un ítem de preferencia en este caso el ítem 4
3. se procede a descargar la secuencia proteica en formato FASTA
este es el bloc de notas de la secuencia proteica descargada en formato FASTA
BASE DE DATOS UNIPROT: CON LA MISMA PROTEINA YA TRABAJADA EN LA BASE DE DATOS
DEL NCBI SE PUEDE BUSCAR EN LA BASE DE DATOS DE UNIPROT EN ESTE CASO
IDENTIFICAMOS LA PROTEINA CON EL CODIGO DE ACCESSION DE LA PROTEINA EN EL NCBI =
CAI2798740 CON EL OBJETIVO QUE LA BUSQUEDA SEA MAS RAPIDA
EN ESTE CASO NOS MUESTRA UN RESULTADO POR QUE LA BUSQUEDA ES MAS ESPECIFICA
UNIPROT TE OFRECE MAS CARACTERISTICAS DE LA PROTEINA COMO LA FUNCION,
ESTRUCTURA, SECUENCIA PROTEICA, SECUENCIA DE AMINOACIDOS ETC.
FUNCION DE PROTEINA
SECUENCIA DE AMINOACIDOS
MODELO 3D DE LA PROTEINA EN UNIPROT
PARA DESCARGAR LA SECUENCIA PROTEICA EN DORMATO FASTA SE PRESIONA EN LA
HERRAMIENTA DE DESCARGAR
LUEGO ACEPTAS LA DESCARGA Y SE DESCARGARA UN BLOC DE NOTAS CON LAS SECUENCIA
PROTEICA
LUEGO DE LA DESCARAGA CONFIRMAMOS SI TENEMOS LA MISMA SECUENCIA EN ESTE CASO
SI
BASE DE DATOS PDB: PROTEIN DATA BANK
EN EL PDB REALIZAMOS UNA BUSQUEDA SIMPLE CON LA PROTEINA TRABAJADA EN EL NCBI Y
UNIPROT, PARA FACILITAR LA BUSQUEDA EN EL PDB DE LA ESTRUCTURA DE LA PROTEINA
USAMOS EL NUMERO DE PROTEINA OBTENIDA DE UNIPROT ; 5znq.1.A
SE VISUALIZA LA ESTRUCTURA DE LA PROTEINA YA QUE SE REALIZO UNA BUSQUEDA DIRECTA
DESCARGA DE SECUENCIA PROTEICA
SELECCIONAMOS FORMATO FASTA Y DESCARGAMOS
SE VERIFICA SI TENEMOS LA MISMA SECUENCIA EN ESTE CASO ES CORRECTO
OTRO TIPO SE SECUENCIA
ESTRUCTURA 3D EN PDB