Tema central

Estructura y función de los aminoácidos y proteínas

Funciones de las proteínas

• Son las macromoléculas más abundantes de la célula.

• Participan en casi todos los procesos biológicos: enzimas, hormonas, anticuerpos,

transporte, fibras musculares, estructuras (plumas, cuernos, telarañas), proteínas
de la leche, venenos, etc.

Aminoácidos

• Unidades básicas de las proteínas (20 estándar, más de 300 descritos en células).

• Pueden ser precursores de vitaminas, neurotransmisores, intermediarios

metabólicos y componentes estructurales.

• Tienen una estructura general: Cα unido a un grupo amino, un carboxilo, un

hidrógeno y una cadena lateral (R) variable.

• El Cα es quiral (excepto en glicina), lo que da lugar a enantiómeros (L y D).

• En proteínas solo se encuentran L-aminoácidos.

Clasificación de aminoácidos (según el grupo R a pH 7)

1. Apolares alifáticos (hidrofóbicos): Ala, Val, Leu, Ile, Gly, Pro.

2. Aromáticos (hidrofóbicos): Phe, Tyr, Trp.

o Absorben luz UV (importante en análisis de proteínas).

3. Polares sin carga: Ser, Thr, Cys, Asn, Gln.

o Forman puentes de hidrógeno, algunos pueden fosforilarse.

4. Cargados positivamente (básicos): Lys, Arg, His.

5. Cargados negativamente (ácidos): Asp, Glu.

Propiedades químicas

• Los aminoácidos pueden actuar como ácidos y bases débiles (anfóteros).

• En solución acuosa predominan como iones dipolares (zwitteriones).

• Cada aminoácido tiene un punto isoeléctrico (pI) donde su carga neta es cero.

• Presentan curvas de titulación características según sus grupos ionizables.

Aminoácidos no estándar y modificaciones

• Existen modificaciones naturales después de la síntesis:

o 4-hidroxiprolina y 5-hidroxilisina (colágeno).

o γ-carboxiglutamato (proteínas que unen calcio).

o Selenocisteína (síntesis especial).

• Modificaciones reversibles: fosforilación, metilación, acetilación, ADP-ribosilación.

o Regulan la función y actividad de proteínas.

Propiedades físicas importantes

• Masa molecular entre 57–186 Da (promedio 110 Da).

• Altos puntos de fusión (~250 °C).

• Muy solubles en agua, insolubles en solventes no polares.

• Algunos absorben luz UV (Trp, Tyr, Phe).

Conceptos clave

• Dalton (Da): unidad de masa atómica usada en biología molecular.

• kDa: 1000 Da, útil para expresar masas de proteínas.

• Clasificación y comportamiento ácido–base permiten separar, identificar y

cuantificar aminoácidos y proteínas.
 Resumen final de la clase:
Los aminoácidos son los bloques fundamentales de las proteínas. Su estructura, carga,
polaridad y modificaciones determinan las propiedades químicas, físicas y funcionales de
las proteínas. Estas propiedades explican por qué las proteínas son tan diversas y
esenciales en la biología.

Tema central

Niveles de estructuración de las proteínas: primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.

Péptidos y proteínas

• Son polímeros de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos (reacción de

condensación).

• Clasificación:

o Oligopéptidos: 2–12 aa.

o Polipéptidos: >12 aa, masa <10 kDa.

o Proteínas: masa >10 kDa.

• Pueden ser simples (solo aa) o conjugadas (tienen un grupo prostético, como
metales o cofactores).

1. ¿Qué es un grupo prostético?

Imagina que una proteína simple está hecha solo de aminoácidos (ejemplo: la
ribonucleasa).
Pero algunas proteínas necesitan “accesorios químicos extra” que no son aminoácidos
para poder funcionar.
Ese “accesorio” adicional se llama grupo prostético.

Definición:
Un grupo prostético es una molécula no proteica, fuertemente unida (covalente o no
covalentemente) a la proteína, y que es esencial para su función biológica.

Ejemplos:

• Hemoglobina → tiene un grupo prostético llamado heme, que contiene hierro

(Fe²⁺). Gracias a él puede unir y transportar oxígeno.
 • Flavoproteínas → tienen FAD (flavín adenín dinucleótido) como grupo prostético,
esencial en reacciones de oxidación-reducción.

• Glucoproteínas → tienen cadenas de carbohidratos unidas, importantes en

reconocimiento celular.

Si eliminas el grupo prostético → la proteína pierde su función.

2. Niveles de organización de las proteínas (más detallado)

Las proteínas no son solo “cadenas largas de aminoácidos”. Se pliegan en niveles de

complejidad:

a) Estructura primaria

• Qué es: la secuencia lineal de aminoácidos (como letras en una palabra). Unido
por enlaces covalentes

• Ejemplo: Ala–Gly–Ser–Phe…

• Importancia: el orden de los aminoácidos dicta cómo se va a plegar la proteína y

qué función tendrá.

• Enfermedades: una mutación (cambio en un aa) puede causar una proteína

defectuosa → ej. anemia falciforme (sustitución de Glu por Val en la hemoglobina).

b) Estructura secundaria

• Qué es: formas locales regulares que adopta la cadena de aa, estabilizadas por
puentes de hidrógeno.

• Tipos principales:

1. Hélice α

▪ Forma de espiral enrollada hacia la derecha.

▪ 3.6 aa por vuelta.

▪ Los grupos R sobresalen hacia afuera.

▪ Ejemplo: α-queratina del cabello y uñas.

2. Lámina o hoja β (plegada)

 ▪ Cadena en zig-zag.

▪ Se juntan varias cadenas para formar una hoja, unidas por puentes
de H.

▪ Puede ser paralela o antiparalela.

▪ Ejemplo: fibroína de la seda.

3. Giros β (o vueltas)

▪ Pequeños giros de 180°.

▪ Comunes en la superficie de las proteínas, comunes Pro y Gly.

▪ Facilitan que la proteína se compacte en lugar de ser una cadena

larga.

c) Estructura terciaria

• Qué es: el plegamiento tridimensional completo de la proteína.

• La cadena polipeptídica se organiza en una forma compacta y funcional.

• Fuerzas que la estabilizan:

o Efecto hidrofóbico: los aa no polares se esconden en el interior.

o Puentes de hidrógeno (entre grupos polares).

o Puentes disulfuro (covalentes, entre cisteínas).

o Interacciones iónicas (entre aa cargados).

o Fuerzas de van der Waals.

• Ejemplo: la mioglobina.

Aquí aparece el concepto de conformación nativa = la forma más estable y funcional.

d) Estructura cuaternaria

• Qué es: cuando dos o más cadenas polipeptídicas (subunidades) se asocian para
formar una proteína funcional.

• Se mantienen unidas por interacciones débiles o enlaces disulfuro.

 o Pueden ser oligómeros con subunidades iguales (protómeros) o distintas.

• Ejemplo clásico: hemoglobina → formada por 4 cadenas (2 α y 2 β).

Analogía para entenderlo mejor

Piensa en una proteína como un texto escrito con letras:

1. Estructura primaria → las letras (orden de aminoácidos).

o Ejemplo: P-E-R-R-O.

2. Estructura secundaria → las sílabas o patrones repetitivos (hélices y hojas β).

o Ejemplo: “PE”, “RRO”.

3. Estructura terciaria → la palabra completa con forma tridimensional.

o Ejemplo: “PERRO” escrito.

4. Estructura cuaternaria → una oración formada con varias palabras (varias

cadenas).

o Ejemplo: “EL PERRO CORRE”.

Propiedades del enlace peptídico

• Es plano y rígido por su carácter parcial de doble enlace (resonancia).

• No permite rotación libre → solo giran enlaces N–Cα (phi) y Cα–C (psi).

• Gráfica de Ramachandran: muestra combinaciones permitidas de ángulos φ y ψ

según restricciones estéricas.

Resúmenes clave

• La estructura de una proteína depende directamente de su secuencia de

aminoácidos.

• La conformación nativa se mantiene por interacciones débiles y es la más estable.

• Estructura secundaria: hélice α, lámina β y giros β.

• El plegamiento determina la función; proteínas mal plegadas → enfermedades

 En conclusión:
Las proteínas presentan una organización jerárquica:

• Primaria (secuencia de aa) → determina

• Secundaria (estructuras locales) → se pliega en

• Terciaria (estructura 3D global) → que en algunos casos forma

• Cuaternaria (ensamble de varias cadenas).

Clase 3

1. Estructura terciaria

• Es la forma tridimensional completa de una sola cadena polipeptídica.

• Se debe a la interacción entre los grupos R (cadenas laterales) de los aminoácidos.

• Interacciones principales que estabilizan:

o Hidrofóbicas: los aa no polares se esconden en el interior, lejos del agua.

o Electrostáticas (puentes salinos): atracción entre cargas opuestas (ej. Lys⁺

con Glu⁻).

o Puentes de hidrógeno: entre grupos polares o con el agua.

o Puentes disulfuro: enlaces covalentes fuertes entre dos Cys → cistina.

o Fuerzas de van der Waals: atracciones débiles, pero muchas suman

estabilidad.

Resultado: proteína compacta, específica, estable pero flexible (se mueve un poco sin
perder función).

Ejemplo: Mioglobina, la primera proteína globular cuya estructura se determinó.

2. Estructura cuaternaria

• Es la organización cuando una proteína tiene varias cadenas polipeptídicas

(subunidades).
 • Cada subunidad puede ser:

o Igual → homodímero (ej. dos copias de la misma cadena).

o Distinta → heterodímero (ej. una cadena α + una cadena β).

• Se mantienen unidas por las mismas fuerzas de la estructura terciaria

(hidrofóbicas, puentes de H, iónicas, disulfuro).

• Ejemplo clásico: Hemoglobina

o Tiene 4 subunidades (2 α y 2 β).

o Cada subunidad lleva un grupo prostético heme con hierro, que permite
unir oxígeno.

o Es un tetrámero y su peso es de 64,500 Da.

3. Motivos y dominios

• Motivos (plegamientos o supersecundarias): combinaciones de estructuras

secundarias (hélices y láminas) que se repiten y forman un patrón.

o Ejemplo: barril α/β en la enzima piruvato cinasa.

• Dominios: regiones independientes (>100 aa) que se pliegan de manera estable y

pueden tener una función propia.

o Ejemplo: troponina C en músculo tiene dominios que unen calcio.

Los motivos y dominios son como “piezas de Lego” que la proteína usa para formar su
estructura.

4. Plegamiento de proteínas

• El plegamiento no es al azar, sigue reglas:

1. El efecto hidrofóbico dirige a los aa no polares hacia el interior.

2. Las hélices α y hojas β se organizan en capas separadas.

3. Segmentos cercanos en la secuencia tienden a quedar juntos en la

estructura final.
• Plegamiento jerárquico:
Secundaria → motivos → dominios → conformación nativa.

• Chaperonas moleculares (Hsp70, Hsp40): ayudan a plegar correctamente.

• Chaperoninas (GroEL/GroES): forman una “cápsula” donde las proteínas se pliegan

protegidas.

• Errores de plegamiento → enfermedades.

Ejemplo:

• Alzheimer y Parkinson → depósitos de proteínas amiloides.

• Priones → proteínas mal plegadas que contagian a otras (vacas locas, Creutzfeldt-
Jakob, Kuru).

• Fibrosis quística → defecto en CFTR por mutación puntual (deleción de Phe508).

5. Desnaturalización y renaturalización

• Desnaturalización: pérdida de la estructura tridimensional → la proteína se

inactiva.

• Causada por calor, pH extremo, solventes, detergentes, sales, agentes reductores.

• La estructura primaria NO se destruye (los enlaces peptídicos siguen intactos).

• A veces puede ser reversible (renaturalización) si se recuperan las condiciones

adecuadas.

Experimento de Anfinsen (1950s):

• Desnaturalizó ribonucleasa A y luego la renaturalizó.

• Demostró que la secuencia de aminoácidos dicta cómo se pliega la proteína.

6. Tipos de proteínas según estructura terciaria

1. Fibrosas:

o En forma de hebras largas, insolubles en agua.

o Un solo tipo de estructura secundaria repetida.

 o Función: estructural, soporte y resistencia.

o Ejemplo: colágena, queratina, fibroína.

2. Globulares:

o Forma esférica compacta, solubles en agua.

o Combinan varios tipos de estructura secundaria.

o Funciones diversas: enzimas, transporte, regulación.

o Ejemplo: mioglobina, hemoglobina, enzimas digestivas.

7. Caso especial: Colágena

• Proteína fibrosa del tejido conectivo (tendones, huesos, cartílago, córnea).

• Estructura: tres hélices enrolladas (tropocolágena), más fuerte que el acero del
mismo diámetro.

• Su estabilidad depende de la hidroxilación de Pro y Lys, proceso que requiere

vitamina C.

• Deficiencia de vitamina C → escorbuto: fragilidad vascular, sangrados, pérdida de

dientes, mala cicatrización.

Conclusiones

• La estructura terciaria es el plegamiento tridimensional de una cadena; la

cuaternaria, la unión de varias cadenas.

• Motivos y dominios son unidades estructurales que se repiten y facilitan la

función.

• El plegamiento correcto es vital para la vida → si falla, surgen enfermedades

graves.

• La desnaturalización destruye la función, pero a veces es reversible.

• Las proteínas se dividen en fibrosas (estructurales, resistentes) y globulares

(funcionales, variadas).
 • La colágena es un ejemplo clave de proteína fibrosa, dependiente de vitamina C
para ser estable.

Clase 04

1. Estructura y función de las proteínas

• Las proteínas globulares se pliegan en estructuras compactas gracias a

interacciones hidrofóbicas, enlaces de hidrógeno, puentes salinos, etc.

• Su diversidad estructural explica la gran diversidad funcional: enzimas, transporte,

regulación, inmunidad, contracción muscular.

• El plegamiento es clave: la secuencia de aminoácidos determina la conformación y,

por tanto, la función.

2. Mioglobina (Mb)

• Monomérica: una sola cadena polipeptídica (153 aa, 16.7 kDa).

• Contiene un grupo prostético hemo (Fe²⁺ en protoporfirina IX).

• Se encuentra en músculo → almacena y facilita la difusión de O₂.

• 8 hélices α, con residuos hidrofóbicos hacia el interior.

• Unión al O₂: curva hiperbólica (un solo sitio de unión).

• Alta afinidad por O₂ → eficiente para almacenamiento pero no para liberación.

3. Hemoglobina (Hb)

• Tetramérica: 2 cadenas α (141 aa) + 2 cadenas β (146 aa), cada una con un grupo
hemo.

• Transporta O₂ en sangre, dentro de los eritrocitos.

• Presenta dos estados conformacionales:

o T (tenso): baja afinidad por O₂, estabilizado por puentes salinos.

o R (relajado): alta afinidad por O₂.

 • La unión de O₂ a una subunidad facilita la unión en las demás → cooperatividad
positiva.

• La curva de unión al O₂ es sigmoidea, típica de proteínas alostéricas.

4. Regulación de la afinidad de la Hb

• Efecto de Bohr: aumento de H⁺ o CO₂ reduce la afinidad de la Hb por O₂.

• 2,3-bifosfoglicerato (BPG): se une en la cavidad central de Hb, estabiliza el estado T

y disminuye la afinidad por O₂ (importante en adaptación a altitud).

• CO y NO: el CO se une con mayor afinidad que el O₂ → tóxico

(carboxihemoglobina).

5. Comparación Mb vs Hb

• Mioglobina: monómero, almacena O₂ en músculo, curva hiperbólica, no coopera.

• Hemoglobina: tetrámero, transporta O₂ en sangre, curva sigmoidea, coopera

(alostérica).

6. Otras globinas

• Neuroglobina: en neuronas, protege contra hipoxia.

• Citoglobina: en vasos sanguíneos, regula óxido nítrico.

7. Enfermedades relacionadas

• Anemia falciforme: mutación puntual (Glu → Val en posición 6 de la cadena β).

o Produce zonas hidrofóbicas anormales → agregación en fibras →

deformación de eritrocitos.

o Consecuencias: anemia, obstrucción vascular, resistencia parcial a malaria.

Ideas clave para examen o repaso rápido

 1. Mb = almacenamiento O₂ / Hb = transporte O₂.

2. Hb es alostérica y cooperativa → curva sigmoidea.

3. Regulación Hb: Bohr (pH, CO₂), BPG, CO.

4. Estados T y R determinan afinidad de Hb por O₂.

5. Enfermedades como anemia falciforme reflejan cómo un cambio en un solo aa

altera la función.

Comparación entre Mioglobina (Mb) y Hemoglobina (Hb)

Característica Mioglobina (Mb) Hemoglobina (Hb)

Monómero (1 cadena Tetrámero (2 cadenas α y 2

Estructura
polipeptídica, 153 aa) cadenas β)

4 por molécula (1 por

Grupo hemo 1 por molécula
subunidad)

Localización Músculo esquelético y cardíaco Eritrocitos (sangre)

Almacenar y facilitar difusión de Transportar O₂ desde

Función principal
O₂ en el músculo pulmones a tejidos

Curva de unión O₂ Hiperbólica (1 sitio de unión) Sigmoidea (cooperativa)

Moderada, regulada (libera O₂

Afinidad por O₂ Muy alta (no lo libera fácilmente)
en tejidos)

Sí, positiva (un sitio afecta a los

Cooperatividad No (unión independiente)
otros)

T (tenso, baja afinidad) ↔ R

Estados conformacionales No presenta cambios relevantes
(relajado, alta afinidad)

Efecto Bohr (pH y CO₂ ↓

afinidad), 2,3-BPG (↓
Regulación No regulada
afinidad), CO (↑ afinidad
peligrosa)
Característica Mioglobina (Mb) Hemoglobina (Hb)

No se relaciona con mutaciones Mutaciones → anemia

Enfermedades asociadas
graves falciforme (Glu → Val en β)

Idea clave:

• Mb = almacén de O₂, curva hiperbólica.

• Hb = transporte de O₂, curva sigmoidea, regulada por pH, CO₂ y BPG.