Estructura y Enlace Peptídico en Proteínas
Estructura y Enlace Peptídico en Proteínas
GENERAL
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
TEMA 4, ENLACE PEPTÍDICO Y NIVELES ESTRUCTURALES DE
LAS PROTEÍNAS.
Un péptido es una secuencia de aa unidos por enlaces peptídicos.
Diferenciamos un aa con el grupo amino libre (N-terminal) y otro con el
grupo carboxilo libre (C-terminal). El orden de la cadena es de orden N -> C,
coincide con el orden de síntesis. La posición de aa dentro del péptido se
llama secuencia. Cada aa se llama residuo. Se usan sus abreviaturas
separadas por guiones. Si están separados por comas hace referencia a su
composición, no a su secuencia. Para nombrarlos se añade el sufijo -il a
todos los aa menos al último.
ENLACE PEPTÍDICO:
Se forma por la unión del grupo carboxilo de un aa con el grupo amino de otro aa con la pérdida de una molécula de
agua. Se forma un enlace covalente de tipo amida que presenta las siguientes propiedades:
• Es un enlace muy estable y difícil de hidrolizar e ionizar.
• Es una reacción de condensación entre 2 aa.
• Los átomos que forman parte del enlace no son ionizables lo que permite que las proteínas adopten
estructuras complejas.
• Tienen mucha capacidad para formar enlaces de hidrógeno:
o El -NH3+ procedente del grupo amino es un buen dador de hidrógeno.
o El -COO- procedente del carboxilo es un buen aceptor de hidrógeno.
• Es un enlace parcialmente doble (tiene propiedades de enlace sencillo y doble).
• Es un enlace plano: cis y trans, esta última hace más estable y fácil la plegación.
Al ser un enlace doble y rígido, por lo tanto plano, puede adoptar configuración cis
y trans, aunque en los enlaces peptídicos se debe conseguir una configuración
TRANS ya que si fuera CIS, el H y el O se repelerían y el enlace no sería estable.
Solo la prolina adopta una configuración CIS, ya que no puede ser trans debido a
que es un ciclo con el mismo átomo.
• Debido a su resonancia, es un pequeño dipolo y eso hace que tenga una elevada capacidad de formación de
puentes de hidrogeno, y que tenga cargas positivas y negativas en la misma molécula.
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Propiedades del enlace peptídico:
- Resistente a la hidrolisis.
- Enlace C-N plano.
- Participa en enlaces de hidrogeno.
- Permite formar estructuras complejas por no tener carga.
La naturaleza de las cargas de las cadenas y el espacio disponible condiciona la configuración proteica. Por tamaño:
Aminoácidos --> Oligopéptidos -> Polipéptidos -> Proteínas
Péptidos de interés biológico:
PROTEÍNAS
- Son polímeros lineales de aa con diversos grupos funcionales (tiol, alcohol, carboxilo, básicos,
carboxiamidas) que interaccionan entre ellos y con otras moléculas, mediante interacciones fuertes o débiles,
lo que va a condicionar la estructura de la proteína.
- Algunas son rígidas, otras flexibles.
- Hidrofílicas o hidrofóbicas.
Hay cuatro niveles estructurales:
1. Estructura primaria: enlaces covalentes (enlace peptídico).
2. Estructura secundaria: puentes de hidrógeno.
3. Estructura terciaria: estructura tridimensional final que adaptan las proteínas. Hidrofóbicas.
4. Estructura cuaternaria: solo tienen las proteínas oligoméricas. Electroestáticas (puentes salinos).
ESTRUCTURA PRIMARIA:
Depende de la secuencia de aa y la posición de los puentes disulfuro si los hay. Es el punto de unión entre el código
genético y la función de la proteína. El cambio de un solo aa puede conducir a un estado patológico. La estructura
primaria sirve para:
• Entender los mecanismos de acción de las proteínas. Establecer relaciones
entre proteínas. Colabora en la determinación de la secuencia evolutiva.
Estima la posible función de la proteína.
Fragmentación de la estructura primaria: empleada para saber la secuencia de aa
de una proteína. Se usan enzimas capaces de romper el enlace peptídico de dos
tipos:
- Exopeptidasas: actúan rompiendo los enlaces peptídicos en los extremos de las proteínas, los últimos
aminoácidos. La exopeptidasa corta el último aminoácido menos a la prolina, porque la prolina no forma un
enlace péptico común por su cadena lateral.
- Endopeptidasas: actúan rompiendo el enlace peptídico en posiciones media de la proteína.
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o C-> rompen el enlace peptídico por el lado carbonilo de un aa. Pueden ser tripsinas, que se activan
cuando detectan lisina o arginina (aa básicos), y las quimotripsinas que rompe enlaces cuando
detecta los aa aromáticos (Phe, Tyr, Trp)
o N-> rompen el enlace peptídico por el lado amínico de un aa. Son la termolisina, que actúa sobre los
aa ramificados apolares (Met, Val, Ile, Leu) y la pepsina que actúa sobre los aa aromáticos (Phe, Tyr,
Trp).
ESTRUCTURA SECUNDARIA:
Es el ordenamiento de la cadena peptídica dentro de un mismo plano o dirección. Empieza a desarrollar distintas
estructuras y se mantiene por enlaces de hidrógeno fundamentalmente entre los planos peptídicos. Destaca la α-
hélice y la lámina-β o hoja β.
α-HÉLICE:
o El esqueleto se enrolla en sentido dextrógiro formando una estructura helicoidal característica. Los
planos peptídicos quedan paralelos al eje mientras que las cadenas laterales se exponen hacia el
exterior, siendo los carbonos α los que van girando para formar la hélice.
o Para que esta cadena sea regular, todos los aa deben tener la misma configuración (L).
o Tiene unos parámetros definidos: aloja unos 3,6 aa cada vuelta con una separación de 1,5 Aº
(amstrong), el ángulo de rotación es de 100°, el diámetro de cada giro es de 5,4 A°.
o Esta estructura se mantiene gracias a la formación de enlaces de hidrógeno intracatenarios y
direccionales entre los planos peptídicos que, a pesar de ser muy débiles, hay tantos que forman una
estructura cilíndrica hueca pero muy estable. Son cooperativos.
o Cada aa puede formar E.H con un aa situados 4 residuos (aa) por arriba o por debajo situados en la
cadena peptídica. La formación de E.H no es un proceso espontáneo, empieza por un extremo y
condiciona la formación en el resto de la cadena. Además, son reaccionales (más estables).
- Aa que no pueden formar parte de la α-hélice: ya que sus cadenas laterales pueden condicionar la estructura
de la α-hélice, y la hacen inestable. Esta depende de la secuencia de aminoácidos, se forman enlaces de
hidrógeno intarcatenarios, en la misma cadena.
Prolina y glicina-> no pueden formar α-hélices. La prolina forma codos en la dirección y la glicina es
más idónea para la formación de láminas-β.
Los aa con carga -> pueden establecer distorsiones debido a repulsiones/alteraciones.
Los aa aromáticos -> tienden a compartir e-, por lo tanto también desestabilizan o alteran los
parámetros de la α-hélice.
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Los aa voluminosos y ramificados-> tampoco formarán α-hélices.
Los aa (glutamina y asparagina) con mucha tendencia a formar enlaces de hidrógeno -> alteran la
estructura de la α-hélice porque compiten con los planos peptídicos en la formación de E.H, pueden
robar el enlace de hidrógeno del enlace peptídico.
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➢ Proteínas globulares:
- Encontramos distintos tramos de lámina-β unidos a otras estructuras secundarias mediante E.H
intracatenarios.
HELICES Nm es otro tipo de estructura secundaria menos frecuente, es similar a la α-hélice pero con diferentes
parámetros. La N hace referencia al número de aa por vuelta (3,6 Aº en la α-hélice) y la m, al número de átomos que
quedan encerrados en el E.H que estabiliza la estructura.
LOS GIROS-β permiten un cambio en la dirección de la secuencia (180°). Los encontramos siempre en la
superficie. Están formados principalmente por prolina (por sus cambios de dirección en la cadena) y glicina.
Participan en las interacciones. Unen tramos de α-hélices y de láminas-β.
Las estructuras supersecundarias o motivos: plegamientos: Asociaciones muy regulares y estables de tramos de
estructura secundaria regular. Hay diferentes tipos:
Los dominios estructurales son asociaciones regulares de tramos de estructura secundaria que presentan una
funcionalidad definida y que constituyen una unidad estructural particular. Solo es una cadena pero distintas
estructuras. Por ejemplo: CD4 esta formada por cuatro dominios estructurales.
ESTRUCTURA TERCIARIA:
Es la estructura tridimensional final del plegamiento que adopta una proteína.
- Las fibrosas no presentan estructura tridimensional, alcanzan la estabilidad mediante la superposición de
estructuras secundarias.
- La estructura terciaria de una proteína es su estructura tridimensional completa.
- La función de la proteína está íntimamente ligado a la estructura terciaria, solo una determinada estructura
terciaria permite su funcionalidad. Esta podrá variar de forma sutil.
- Además, el plegamiento de una proteína se debe fundamentalmente a su secuencia y al entorno en que se
encuentra, por eso hay que considerar el plegamiento inicial que adopte la proteína en un modelo de
estructura secundaria, la presencia de aa de la secuencia que estabilicen o desestabilicen ese modelo
concreto, giros en la dirección de la cadena, las interacciones con el entorno (de forma que oculte los aa con
polaridad opuesta) y las que se puedan dar entre las cadenas laterales de los aa.
- Estabilidad en la estructura terciaria:
• Interacciones con el medio: las proteínas globulares son solubles en agua. Se disponen con los grupos
polares hacia el exterior y los apolares hacia el interior. Hay otras proteínas globulares como las de la
membrana que se organizan exponiendo los grupos apolares y los polares en el interior, al contrario que las
demás.
• Interacciones entre cadenas de aa: hay distintos tipos de interacciones.
o Enlaces de hidrógeno: son débiles y las proteínas tienen muchos grupos capaces de formarlos
incluyendo los enlaces peptídicos. Los aa ácidos, amidas, aa básicos y alcoholes son capaces de
formarlos.
o Fuerzas electrostáticas o puentes salinos: se establecen entre grupos ionizados. La fuerza del enlace
depende de la carga de los residuos y de la distancia que los separe. Se dan entre los aa de carga
negativa (ácidos) y con carga positiva (básicos)
o Interacciones dipolo-dipolo (Van der Walls): se dan entre residuos con dipolos. Son generalmente
débiles y de corto alcance. Pueden darse entre aa alcoholes y amidas (dipolos permanentes) y entre
aa aromáticos (dipolos inducidos). Pueden tener cargas positivas y negativas.
o Fuerzas hidrófobas o hidrofóbicas: suponen la asociación entre grupos apolares para minimizar el
contacto con el entorno acuoso. Son las fuerzas más débiles pero las más abundantes. Por eso son las
que más contribuyen a mantener la estructura globular. Están en el interior y se encargan de
estabilizar a la proteína y su estructura terciaria.
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o Puentes disulfuro: se establecen entre residuos de cisteína, son los más fuertes y son los únicos
covalentes. Son poco frecuentes en las proteínas globulares excepto en las proteínas de secreción.
• Dentro de la estructura terciaria encontramos motivos que son asociaciones regulares y muy estables de
tramos de estructura secundaria que aparecen en proteínas diferentes. Hay distintas tipos de motivos: un
mismo motivo los podemos encontrar en distintas proteínas.
• También encontramos dominios estructurales, asociaciones regulares de tramos de estructura secundaria que
presenta funcionalidad definida que constituyen una unidad estructural particular. En proteínas de grandes
tamaños encontraremos varios dominios, en las pequeñas, solo uno. Son motivos con funcionalidad.
ESTRUCTURA CUATERNARIA:
Solo la forman proteínas constituidas por más de una subunidad, es decir, con más de una cadena polipeptídica, el
número de subunidades es variables (2-100) y se mantienen mediante interacciones entre sus aa. Se da entre la unión
de varias estructuras terciarias de diferente secuencia.
- La forman solo proteínas oligoméricas (proteínas con varias subunidades). Para que las proteínas
oligoméricas sean funcionales requieren la unión de distintas subunidades que se unen buscando ejes de
simetría (figuras simétricas). Las proteínas buscan estructuras simétricas y estables.
- Estabilizando estas subunidades encontraremos los mismos tipos de interacciones que en la estructura
terciaria. La más importante es el puente salino (interacciones electroestáticas) intercatenarios (entre
distintas cadenas). Estas ganan importancia en la estructura cuaternaria porque al formarse mediante la unión
de dos subunidades por su zona polar, las interacciones hidrofóbicas del interior de cada una pierden
relevancia.
- Presentan enlaces de hidrógeno, interacciones electroestáticas (la más importante),
interacciones dipolo-dipolo, interacciones hidrofóbicas y puentes disulfuro.
Pueden ser disociadas y reasociadas en función de la concentración de sales que compiten con las
interacciones electroestáticas. Los puntos de unión entre subunidades se llaman interfase.
La composición en subunidades y la disposición relativa de las mismas en las proteínas
oligoméricas puede ser bastante variada.
ESTRUCTURA NATIVA: es la conformación que adopta una proteína en el medio natural, en el que posee la
máxima actividad biológica. Es su estructura tridimensional concreta, incluye todos los niveles estructurales, incluso
el cuaternario en proteínas oligoméricas. Es la configuración más estable que le permite desarrollar su función.
DESNATURALIZACIÓN: si se extrae la proteína de su medio biológico puede alterarse la forma de tal manera que
pierde su función. Es importante conocer los mecanismos de desnaturalización para poder evitarlos. Hay distintos
parámetros para evaluar la desnaturalización de la proteína: las medidas directas y las indirectas.
• Medidas directas: analizan la pérdida de la funcionalidad. No siempre es viable porque no siempre se puede
observar la función, por eso se recurre a las medidas indirectas.
• Medidas indirectas: no son tan fiables, requieren interpretación, para ello podemos observar el descenso de
la solubilidad (la pérdida de la estructura hace que la proteína precipite), el incremento de la absorción de
UV a 280-60nm (si pierde la estructura globular los anillos aromáticos que suelen estar orientaos al interior
quedan expuestos y aumenta la absorción), un aumento en la reactividad química (si expongo más residuos
la reactividad aumentará) y un aumento de la viscosidad.
Principales agentes desnaturalizantes:
- Procesos químicos o naturales que alteran las interacciones entre proteínas, afectando a cualquiera de los
niveles estructurales menos al primario:
Variaciones del pH: puede producir reacciones entre las cadenas laterales de los aa y afecta
especialmente a puentes salinos. A nivel estructural, afecta a la estructura terciaria y cuaternaria.
Concentraciones elevadas de sal: desmoronan los puentes salinos. Afecta a la estructura terciaria y
cuaternaria.
Disolventes orgánicos: promueven la salida de los aa apolares y afecta fundamentalmente a la
estructura terciaria y cuaternaria.
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Sales de metales pesados: la acción de este agente depende de la carga neta de la proteína en ese
momento. En medios básicos tendrá carga negativa (los metales tienen carga positiva) y en función
de cómo actúe el complejo proteína-metal, la proteína resultará soluble o no en medio acuoso.
Altas temperaturas: la temperatura aumenta los niveles energéticos de los átomos. La temperatura
que puede resistir una proteína es característica de cada una. Generalmente son estables a bajas
temperaturas e inestables a partir de 50 grados. Las proteínas con muchos puentes disulfuro son más
resistentes. Afecta a todos los niveles menos la estructura primaria.
Agitación energética y ultrasonidos: aumenta la vibración de los átomos que conduce a la ruptura
de las fuerzas intermoleculares. Tienden a distorsionar todo tipo de interacciones y conducen a la
pérdida de estructura.
- Agentes químicos: Urea 8M y cloruro de queridinio 6M
Son pequeñas moléculas con facilidad de formar enlaces de hidrógeno. La proteína tiende a
desplegarse para interaccionar con ellos. Afecta a todos los niveles estructurales menos la estructura
primaria.
Si las proteínas tienen puentes disulfuro es habitual añadir también en el medio un agente reductor de
disulfuros, como el β-mercaptoetanol o el ditiotreitol (DTT).
- Detergentes iónicos: sustancias anfipáticas que destruyen las fuentes hidrofóbicas al intercalarse entre los
lípidos e interaccionando con los aa apolares. Afecta a la terciara y, en menor medida, a la cuaternaria.
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TEMA 5, PROTEÍNAS DE LA MATRIZ EXTRACELULAR
Estas proteínas van a ser fibrosas:
- Desempeñarán misiones estructurales.
- Son insolubles en medio acuoso.
- No presentan estructura terciaria, su motivo estructural predominante es su estructura secundaria.
- Las asociaciones de cadenas se producen a través de puentes covalentes.
COLÁGENO
- Es la proteína fibrosa más abundante de los animales.
- Es una proteína extracelular que se organiza en fibras insolubles, se caracteriza por tener una gran fuerza de
tensión y desempeñar funciones de soporte, gracias a esas fibras que sirven de sostén.
- Tiene una estructura muy fuerte y estable, a la vez es muy versátil y presenta distintas organizaciones.
- Se encuentra en tejidos conjuntivos o conectivos: en huesos, dientes, cartílagos, tendones, ligamentos y
matrices fibrosas de la piel y vasos sanguíneos.
ESTRUCTURA
- Tropocolágeno:
La unidad estructural básica del colágeno, que se une por enlaces covalentes, es el
tropocolágeno, que está formado por tres cadenas α, iguales o distintas, (estructura
secundaria propia del colágeno), estas cadenas no tienen enlaces de hidrógeno, y son
levógiras individualmente. Además su secuencia está ligeramente torcida debido a la cadena
lateral que tienen sus aminoácidos, en concreto la prolina, ya que es rico en este aminoácido.
Estas cadenas α se unen de tres en tres, y se enrollan en sentido dextrógiro gracias a los puentes de hidrogeno
covalentes intercatenarios (ningún enlace intracatenario), además esta queda muy compactada gracias al pequeño
tamaño de todos los aminoácidos, por su cadena corta, que la componen.
Las unidades de tropocolágeno se ordenan de forma escalonada (con la de abajo crea como
una forma de escalera) entre sí, y esto aporta más estabilidad a la estructura. Están
desplazadas 1/4 las unas de las otras (las cabezas y las colas). Como estas están bastante
separadas los entrecruzamientos covalentes se dan entre residuos de lisina. Con la edad los
espacios aumentan y se forman más entrecruzamientos, lo que supone más elasticidad
(menos número de puentes de lisina), aunque en función de la calidad y la cantidad de estos
puentes, las fibras también pueden ser duras y resistentes, depende de la función que tengan estas en el cuerpo, y por
tanto encontramos más puentes de lisina. El tropocolágeno es una varilla resistente y muy larga (1000 aa).
- Cadenas-α:
Las cadenas-α del tropocolágeno describen una hélice levógira distorsionada, forma ángulos muy determinados
debido a la abundancia de prolina e hidroxiprolina (estos aa no forman α-hélice) que hace que los planos peptídicos
queden perpendiculares al eje. Incapacita la formación de E.H intracatenarios.
- Composición:
Las cadenas α pueden tener secuencias iguales o distintas, pero todas tienen la misma longitud (1000 aa aprox). Glicina
(33%), alanina (11%), prolina (20%), hidroxiprolina (25%), de forma abundante lisina (forma los enlaces covalentes) e
hidroxilina, carecen de triptófano (aminoácido esencial, es aromático y por tanto desestabilizaría la cadena), carecen de
cisteína en el colágeno maduro, en el inmaduro si que tenemos presencia de cisteina, son glicoproteína, ya que contienen
glucosa y galactosa unidas a los residuos de hidroxilisina.
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la prolil-hidroxilasa y la lisil-hidroxidasa. Ambas usan como cofactor (catalizador no metálico) el ascorbato (ácido
ascórbico / vitamina C) como oxidante. Una deficiencia de ácido ascórbico / vitamina C produce una enfermedad,
escorbuto.
Las cadenas-α tienen una secuencia determinada. Encontramos la secuencia Gly-X-Y repetida en la proteína.
- X: muchas veces es ocupada por la prolina.
- Y: por hidroxiprolina (OH-Pro), lisina (Lys) e hidroxilisina (OH-Lys).
En los tropocolágenos la glicina se posiciona en el interior por su pequeño tamaño y hace que las
cadenas queden muy unidas entre sí, ya que se pone ne los huecos que quedan entre las tres cadenas,
confiriendo una gran tensión. Los aa quedan en una posición desplazada entre las cadenas α
(orientadas en el mismo sentido N->C). Si hacemos el corte transversal encontraremos siempre un
residuo de glicina que quedará orientado hacia el interior de la hélice.
Las cadenas α del tropocolágeno describen una hélice levógira distorsionada. La abundancia de
residuos de prolina e hidroxiprolina condiciona que la cadena tienda a adoptar determinados ángulos.
Los planos peptídicos quedan perpendiculares al eje de la hélice. No se forman enlaces de hidrógeno
intracatenarios, se forman intercatenarios.
- Factores que estabilizan la cadena-α:
• Repulsiones entre los residuos de prolina, debido a la presencia de la prolina se
generan esas repulsiones que da fuerza de tensión aportando rigidez.
• E.H entre residuos de hidroxiprolina e hidroxilisina con el medio (agua).
• Lo que más estabiliza es la asociación de cadenas-α enrolladas en sentido dextrógiro
entre las que se establecen E.H intracatenarios y forman el tropocolágeno. Hay una
asociación por puentes de hidrógeno que forma una triple hélice de colágeno.
• Entrecruzamientos covalentes entre tropocolágenos: se dan entre la lisina y la
hidroxilisina mediante interacciones covalentes. Son oxidaciones y desaminaciones medidas por la enzima
lisiloxidasa, que forma una molécula de aldollisina o allisina. En función del número de aa implicados
hablamos de puentes dobles (si están implicados dos residuos de lisina) o puentes triples (si están implicados
tres residuos de lisina). Estos enlaces dan fuerza de tensión al colágeno, cuantos más enlaces mayor fuerza
de tensión que resiste.
• Una mutación que suponga el cambio de glicina por cualquier otro aa va a suponer la fibra del colágeno -> la
osteogénesis se debe a una mutación de glicina.
BIOSÍNTESIS DEL COLÁGENO:
1. La cadena peptídica se sintetiza en el ribosoma, los aa
se sitúan en el orden que mandan el código genético.
2. Modificaciones post-traduccionales, hidroxilaciones:
modificación de los aa una vez se han incorporado,
ocurren en el retículo endoplasmático.
3. Glicosilación: se une la glucosa a la galactosa y se pasa
a llamar procolágeno.
4. Las 3 cadenas-α se unen por los extremos por la unión
de puentes disulfuro entre las cisteínas (colágeno
inmaduro) para estabilizarse las cadenas se enrollan en
sentido dextrógiro, para formar el tropocolágeno.
5. Cuando se enrollan salen al espacio intercelular, donde hay proteasas que reconocen los extremos y cortan
los enlaces peptídicos de estos (cortan unos 500 aa) formando tropocolágeno. De esta forma salen el espacio
extracelular donde hay unos ovillos que reconocen los extremos N y C terminal y los corta, ocurriendo una
ordenación cabeza-cola. Se cortan aproximadamente 500-> este es el tropocolágeno maduro (no tiene
cisteína, pero el inmaduro si).
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6. Estas se orientan todas en la misma dirección desplazándose un cuarto entre sí, y después se unen los
residuos de glicina, formándose los enlacen covalentes. Una vez cortado a queda ordenado y escalonado. La
síntesis se produce en el interior celular y la maduración, en el exterior celular.
PROCOLÁGENO (se da en medio intracelular) ->TROPOCOLAGENO (el inmaduro en intracelular y el maduro en
extracelular) ->COLÁGENO (se forma en medio extracelular).
TIPOS DE COLÁGENO:
Hay 15 tipos distintos (se nombran en nº romanos) y se encuentran en todos los tejidos. En función de su
organización encontramos:
• Huesos y dientes: Colágeno muy denso, presenta un entrecruzamiento muy regular, aparte de colágeno
también presenta un polímero de fosfato cálcico.
• Córnea: Colágeno extremadamente uniforme que permite que el tejido conserve su transparencia.
• Tendones: Organización paralela y muy enlazados, aporta gran resistencia a la tracción.
• Piel: Fibras entrelazadas sin mucha cohesión. Presentan puentes triples en abundancia en todas las
direcciones, le aporta elasticidad.
• Vasos sanguíneos: Forman redes helicoidales elásticas. También tienen una gran cantidad de contenido de
elastina.
ELASTINA:
Proteína fibrosa, presente en el tejido conjuntivo amarillo elástico (pulmones, vasos, garganta). Presentan una gran
elasticidad, se estiran y recuperan su forma inicial. Su unidad fundamental es la tropoelastina, no presenta una
estructura secundaria característica, tiene una configuración “al azar” lo que hace que tenga una elevada flexibilidad
conformacional, no hay secuencias repetidas.
Conformación similar al colágeno, es rica en glicina y prolina, también posee hidroxiprolina, menos lisina que el
colágeno y no contiene hidroxilisina, por lo que no es una glucoproteína, además da lugar a la formación de una
estructura menos compacta que la del colágeno, ya que la hidroxilisina es donde se dan los enlaces covalentes. Por la
abundancia de prolina y lisina no se pueden formar α-hélices ni láminas-β, no forma una hélice de colágeno porque
la prolina no está regularmente distribuida en la estructura primaria, está al azar, además no se pueden formar estos
dos tipos de estructura por la abundancia de glicina y prolina.
Las cadenas de tropoelastina se unirán por enlaces covalentes largos en los que están implicados los residuos de
lisina, aunque la vamos a encontrar con modificación post-traduccionales:
• Puentes cruzados de aldol de alisina y lisilnorleucina, son puentes dobles y triples (implican 2 o 3 aa).
• Puentes de desmosina e isodesmosina, son puentes cuádruples (implican 4 aa) aportan elasticidad a la
elastina al permitir el movimiento en las 4 direcciones.
Se entrelazan fibras de colágeno y elastina que aparecen entretejidos unos con otros. El colágeno hace que la elastina
no se rompa al aportar resistencia mecánica. El equilibrio entre resistencia mecánica y elasticidad del tejido, está
controlado por el grado de entrecruzamientos (+ resistencia / + puntos de unión). La resistencia mecánica de la
elastina aumenta al aumentar los puntos de unión.
La elastina aporta elasticidad y el colágeno resistencia. Su forma depende del tipo de tejido en el que se encuentra.
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TEMA 6, INMUNOGLOBULINAS
Son proteínas globulares:
Estructura:
- Presentan dos cadenas pesadas (cadenas H) y dos cadenas ligeras (cadenas L).
- Las cadenas pesadas se abren por uno de los extremos para interaccionar separadamente
con cadenas L.
- Las cadenas se unen entre sí mediante interacciones débiles, enlaces no covalentes, pero
también con puentes disulfuro.
En la zona donde se abre (bisagra) pueden actuar unas proteasas que dan lugar a una región Fc
(dominio constante) y otra Fab, que es lugar donde se une el antígeno.
Dentro de cada cadena encontramos distintos dominios, unos son constantes y otros, variables. Los
dominios constantes son los mantenidos a lo largo de la evolución y que le aportan esa estructura
característica a la proteína (estructura tipo inmunoglobulina, tipo Y). En las cadenas H encontramos 3 dominios constantes,
mientras en en los L, solo 1 constante. Tanto las cadenas H como las L presentan solo 1 dominio variable, juntos forman el sitio
donde se une el antígeno.
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TEMA 7, HEMOGLOBINA Y MIOGLOBINA
Ambas son proteínas conjugadas (hemo proteínas), tienen como ligando el O2. Tienen ambas una funcionalidad dinámica, una
función de unión de un ligando específico, tienen un sitio de unión y unas estructuras 3D complejas. Las dos se unen a oxígeno.
MIOGLOBINA: Almacena oxígeno en músculo, donde se ubica, como reserva supletoria para oxigenarlo cuando el
consumo excede el aporte normal de hemoglobina. El O2 le aporta esa tonalidad roja que lo caracteriza.
Estructura:
- PARTE PROTEICA: apomioglobina-> una proteína pequeña, formada por 153 aa y más
del 70% de la α-hélice, se diferencian 8 segmentos helicoidales de esta (de la A a la H, así
ubicamos la histidinas), que se nombran por letras, separadas por ramos helicoidales que
se nombras por doble letra. La cadena polipeptídica localiza los aa polares hacia el interior
y los apolares hacia el exterior.
- GRUPO PROSTÉTICO: hemo b-> formado por un anillo de protoporfirina IX (formada
por cuatro anillos Tetrapirrólicos) y un átomo de hierro (Fe 2+ ion ferroso) que forma 6
enlaces de coordinación, 4 con los nitrógenos de los anillos de protoporfirina IX, un
quinto que se une a la proteína globina en la histidina proximal (His F8) y sexto, al O2,
cuando el oxigeno se une esta cambia de conformación, y el átomo de hierro pasa a
interaccionar con la histidina distal (His E7). Estos dos últimos quedan situados
perpendicularmente al anillo.
El grupo hemo se une a la proteína en un bolsillo hidrofóbico a través de la
apomioglobina. Todos los aa de este bolsillo son apolares menos dos histidinas (His F8 o
proximal, y la His E7 o distal). La ventaja del bolsillo hidrofóbico es que protege al hierro
de su oxidación al Fe 3+ ya que no puede entrar O2.
La hemoglobina es capaz de unirse a 1 oxigeno, pero también a CO y NO a los que son más
afines (el CO se une de forma irreversible y desplaza la union del enlace de O2 en la
hemoglobina). El papel de la His E7 (distal) es generar un impedimento estérico que regule la
union del CO, hace que este se una con un determinado ángulo, por lo que su afinidad con el
hierro disminuye.
Las proteínas Mb y Hb, encargadas de unir al O2 regulan el acceso del CO y otras moléculas
mediante la unión del grupo hemo al bolsillo hidrofóbico de la apoproteína, debido a la
presencia residual de histidina.
HEMOGLOBINA:
Se encuentra principalmente disuelta en el eritrocito (que transportan hemoglobina en altas concentraciones en el citosol), esta
colabora con la circulación venosa en el transporte de O2 desde los pulmones a los tejidos y del CO2 como producto de desecho
del metabolismo oxidativo, que debe ser conducido a pulmones para su eliminación. Los seres humanos tenemos un
metabolismo oxidativo por lo que necesitamos oxígeno. Se encarga del transporte de gases a través de la sangre (O2, CO2, H+).
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Estructura: Es una proteína globular conjugada:
- Grupo prostético: gr. Hemo (anillos que dan lugar a la protoporfirina, que van a estar dentro del bolsillo hidrofóbico).
- Parte proteica: apohemoglobina (parte proteica de la enzima).
- Es una proteína oligomérica formada por distintas subunidades variables: En el adulto: 2-α y 2-β. En el embrión: 2-α y
2-ε. En el feto: 2-α y 2-γ.
- Las subunidades se mantienen a través de distintas interacciones: E.H, fuerzas hidrofóbicas… pero fundamentalmente
a través de puentes salinos.
- Sus 4 subunidades son funcionales, todas son capaces de ligar oxígeno. Cada una de las cadenas tiene una parte
proteica unida a un grupo hemo.
- Las interacciones que se establecen entre las unidades distintas son más fuertes, por eso, a concentraciones moderadas
de sal (afecta solo a la formación de puentes salinos) la proteína se rompe en dos dímeros formados por una subunidad
α y β, pero a concentraciones elevadas de sal, se rompen todas las interacciones y encontramos las subunidades sueltas.
- Cada una de sus cadenas tiene una parte proteica y otra prostética gr. Hemo.
- La hemoglobina tiene 4 sitios de unión al oxígeno, la unión de uno modifica los demás.
DIFERENCIAS ENTRE MIOGLOBINA Y HEMOGLOBINA:
CINÉTICAS:
Ambas proteínas presentan distintas cinéticas de saturación debido a que la hemoglobina es alostérica, mientras que la
mioglobina no. Las proteínas alostéricas son aquellas en las que la unión de un ligando afecta a las propiedades de unión de
otro sitio de la misma proteína. En la hemoglobina tenemos 4 sitios de unión, al unirse uno modifica los demás.
Voy a poner una cantidad finita de mioglobina y hemoglobina y voy a empezar a colocar concentraciones crecientes del sustrato
(oxígeno). Si aumento la concentración de oxígeno, que se mide en presión (atm, mmHg) las moléculas se comenzaran a unir a
las proteínas, hasta un punto en el que estarán todas saturadas, esta medida se llama fracción de saturación (de 0 a 1)
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Cuanto menor sea el valor de p50, más rápido se va a saturar. La mioglobina tiene valores más pequeños de afinidad al O2 que
la hemoglobina. La p50 indica la presión de oxigeno a la que hay un 50% de saturación (la mitad de la hemoglobina ocupada),
va a ser inversamente proporcional a la afinidad.
A la primera molécula de O2 le cuesta unirse, pero supone un cambio de conformación que facilita la unión del resto de
moléculas de O2, esto se llama unión cooperativa por sustrato. Se consigue gracias a que es una proteína alostérica, es decir,
por un diferente comportamiento gracias a la transición entre dos estados: desoxihemoglobina (estado T, tenso) que tiene una
baja afinidad por el O2 y la oxihemoglobina (estado R, relajada) que tiene una alta afinidad por el O2. Es una curva sigmoidea
porque se van uniendo los oxígenos en orden, primero se tiene que unir el 1, es cooperativo.
Cuando se une la primera molécula de O2 a la primera subunidad se produce un ángulo de 15° grados
en el eje de la proteína. Este cambio favorece la unión de O2 a las demás subunidades. La forma T se
estabiliza por la formación de puentes salinos cuando se une la primera molécula de O2. Se produce
la ruptura de los puentes salinos y se producen cambios en las subunidades adyacentes que producen
un cambio conformacional.
1. Interacciones homotrópicas o homoalostéricas: Cuando el ligando, que se une por el sitio de unión, y el modulador son
la misma molécula (la afinidad de la Hb con el O2 se ve afectada por el mismo O2). En la hemoglobina hablamos de
cooperatividad positiva por unión de sustratos.
Hay distintas hipótesis para explicar el fenómeno de cooperatividad:
o Modelo secuencial: la unión del primer ligando induce cambios configuracionales en las subunidades
adyacentes y se favorece el cambio de la forma T a R, ocurre de forma gradual.
o Modelo de estados múltiple o concertado: el estado T y R coexisten. Al aumentar la presión parcial de O2 se
desplaza el equilibrio de la forma T a la forma R.
2. Interacciones heterotópicas o heteroalostéricas: El ligando y el modulador son distintos.
En las proteínas alostéricas, además del sistema de unión por ligando hay otro sitio de unión alostérica (para moléculas distintas
del ligando, los moduladores). Si al unirse estas moléculas al sitio alostérico, aumenta la afinidad de las proteínas por el
ligándose llaman moduladores alostéricos positivos o activadores, si por el contrario la afinidad baja (inhiben la actividad de la
proteína), se llaman moduladores alostéricos negativos o inhibidores.
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2. EFECTO DEL CO2: se transporta de 3 formas distintas:
a. Un pequeño porcentaje soluble en agua (5%).
b. En forma de bicarbonato (80%).
c. Con la hemoglobina (15%).
Tiene un efecto directo o indirecto en afinidad de la hemoglobina por el O2.
-INDIRECTO: el CO2 se transporta sobre todo en forma de bicarbonato, HCO3- (gas insoluble). El CO2 se hidrata por acción
de la anhidrasa carbónica con acción reversible, para formar bicarbonato. En esta reacción también se liberan protones que
contribuyen al efecto Bohr.
Como productos de deshecho del metabolismo tenemos el CO2 y H+. Al cargarse la hemoglobina en los pulmones de O2, se
transporta a los tejidos donde hay mayor concentración de CO2 y H+ que favorecen la forma T de la hemoglobina, liberando el
O2. Se carga de ellos y se dirige a los pulmones de nuevo donde hay mayor concentración de O2 que, tras unirse la primera
molécula, por cooperatividad, facilita la unión de las demás moléculas de O2.
Los protones se eliminan por acción de la anhidrasa carbónica que forma H2O y CO2, por tanto, el CO2 y los H+ resultantes
del metabolismo se eliminan por exhalación del aire en los pulmones.
- Transmisión de O2 a la hemoglobina fetal, la hemoglobina fetal tiene subunidades alfa y gamma, las gamma aportan
3,5 cargas positivas en total. Su afinidad será menor por la BPG que en la hemoglobina adulta. Con esto aumenta la
afinidad por el O2, permitiendo la transferencia de O2 de la madre al feto.
- Adaptaciones fisiológicas a la altitud. A partir de cierta altura la presión parcial de O2 es menor. La respuesta
fisiológica es aumentar la glucólisis, aumentando la formación del BPG. Al aumentarlo disminuye la afinidad de la
hemoglobina con el O2. Los pulmones captan menos O2, pero los tejidos producen más O2 y así se compensa.
Personas con problemas respiratorios también presentan altos niveles de BPG.
Los pacientes con hipoxia van a tener mayores niveles BPG (disminución del suministro de oxígeno a un tejido).
CAMBIOS EN LA SECUENCIA DE UNA PROTEÍNA AFECTAN A LA VIABILIDAD DE LA PROTEÍNA, UN
CAMBIO EN UN ÚNICO AA SUPONE UN CAMBIO EN LA ESTRUCTURA PRIMARIA, Y, LA SÍNTESIS DE UNA
PROTEÍNA DISTINTA.
- Hay más de 300 variantes de la hemoglobina, muchas de ellas son deletéreas (letales).
ANEMIA FALCIFORME: mutación de ácido glutámico por valina en la posición 6 de la cadena polipeptídica de globina beta,
que forma una hemoglobina S que es insoluble. Estos se atascan en los capilares más pequeños de los órganos, alterando su
funcionalidad. Como consecuencia los eritrocitos se rompen y producen anemia. Puede producirse por ciertos alimentos y
ejercicio excesivo.
Los eritrocitos falciformes favorecen la supervivencia a la malaria, por eso está muy extendida por el norte de África.
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TEMA 8, ENZIMAS
Son moléculas biológicas muy estables en el entorno suave de la célula, donde las reacciones son muy lentas e incluso
desfavorables energéticamente. Las reacciones deben realizarse en condiciones fisiológicas y a velocidades útiles, gracias a las
enzimas podemos regular la velocidad de las reacciones, es decir, se pueden coordinar.
La mayoría de los biocatalizadores de nuestro organismo son enzimas (proteínas con función catalítica), tienen características
comunes con los catalizadores y, además, unas características propias:
a. Como catalizadores, se caracterizan porque pueden trabajar en concentraciones muy bajas, no se consumen en la
reacción (pueden sufrir modificaciones, pero se regeneran), aumentan la velocidad de la reacción sin alterar otros
parámetros.
b. Como enzimas, tienen una gran especificidad de sustrato y de reacción. Reconocen un determinado sustrato y lo van a
unir con una determinada orientación que va a favorecer un determinado ataque químico. Elevada eficiencia. Catalizan
en condiciones suaves (pH, temperatura… suaves). Pueden someterse a regulaciones, modulando su actividad.
La velocidad depende de la energía que necesitan los reactivos para activarse, es decir, a
mayor E.A, menor velocidad.
La energía de activación es la energía mínima que debe aportarse para que la reacción
tenga lugar. Esta depende de la presencia de catalizadores, de la temperatura y de la
presión, que, a su vez, afectan a la velocidad de la reacción (cantidad de sustrato
convertido en producto por unidad de tiempo). Las enzimas tienen baja energía de activación, pero alta velocidad de reacción.
En las enzimas, el grupo prostético se llama cofactor (si son moléculas inorgánicas) y coenzima (si son orgánicas).
Actúan como catalizadores porque presentan un centro o sitio activo, formado por el sitio de unión y el sitio catalítico.
- El sitio de unión: lo forman aa que se unen directa o indirectamente al sustrato y todos los aa que aporta el entorno
adecuado para que se produzca la unión.
- El sitio catalítico: todos los grupos encargados de realizar la reacción química, ya sean las cadenas laterales de los aa o
cofactores o coenzimas.
Hay diferentes hipótesis sobre la unión enzima-sustrato:
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Catálisis por iones metálicos: están implicados iones metálicos en reacciones redox (se ceden o captan e-) o formando
complejos E-S.
- Proximidad y orientación: la enzima dispone el sustrato con una orientación determinada para que se pueda realizar el
ataque de los grupos catalíticos.
- Unión preferencial de la enzima al estado de transición: conduce a la formación del estado de transición y, por tanto, la
formación del producto.
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS: se añade el sufijo -asa a una pequeña descripción de su función. Se agrupan todas las
proteínas siguiendo un código numérico.
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TEMA 9 CINÉTICA ENZIMÁTICA
La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas y los factores que afectan a estas.
Esta se mide en función de la desaparición de sustrato en función del tiempo o de la aparición de producto por unidad de
tiempo (establece criterios de comparación).
1. FACTORES INTRÍNSECOS:
a. CONCENTRACIÓN DE SUSTRATO-> Ecuación de Michaelis-Menten.
b. CONCENTRACIÓN DE ENZIMA.
2. FACTORES EXTRÍNSECOS:
a. CARACTERÍSTICAS DEL MEDIO-> pH, Temperatura.
b. INHIBIDORES de la acción enzimática-> inhiben la capacidad de fijación del sustrato.
1. FACTORES INTRÍNSECOS
Michaelis y Menten desarrollaron una ecuación que relaciona la velocidad de reacción de una enzima con la
concentración del sustrato.
- ECUACIÓN DE MICHAELIS-MENTEN
Considerando:
- Enzimas mono-saturadas.
- [Enzimas totales] (tanto libres como enzimas en complejo E-S).
- Velocidad de formación de E-S= velocidad de degradación de E-E.
La velocidad de una reacción (Vo): Es la cantidad de producto producida por unidad de tiempo.
La constante de Michaelis (Km): aporta información sobre la afinidad de la enzima por el sustrato. Si disminuye Km,
aumenta la afinidad de una enzima por su sustrato y, por tanto, disminuye la concentración de sustrato requerida para
alcanzar Vmax. Km es CTE para cada enzima con su sustrato, es un valor independiente que se ve afectado por la acción
de inhibidores. No tiene unidades, se emplean las mismas que las del sustrato.
- Vmax: la velocidad máxima se alcanza cuando las enzimas alcanzan su saturación, y ya no pueden hacer
reaccionar con más sustrato.
- Km: concentración de sustratos para la cual la velocidad de reacción es la mitad de Vmax. Es inversamente
proporcional a la afinidad.
Métodos de linealización de la ecuación de Michaelis-Menten.
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B. Concentración de la enzima.
Si [S] es mucho mayor que [E], Vmax depende de [E], pues por mucho sustrato que se añada no aumenta la velocidad de
la reacción. A mayor [E], mayor velocidad de reacción.
2. FACTORES EXTRÍNSECOS:
A. Temperatura:
Todo enzima tiene una temperatura óptima (Vmax característica de cada E), por encima de la cual la velocidad de
reacción puede desnaturalizar a la proteína. La zona de desnaturalización suele encontrarse entre los 40-60 grados. Un
aumento en la temperatura supone un aumenta en la reacción.
B. pH:
Suele presentar un perfil acampanado, pero algunas presentan un patrón diferente. Por encima o debajo del pH, la
velocidad baja porque la proteína se desnaturaliza.
C. Fuerzas iónicas:
Presentan un perfil acampanado. Cada enzima tiene una concentración óptima de fuerzas iónicas, por encima o por
debajo actúan peor. La concentración de sales estabiliza la formación de puentes salinos, si la concentración de puentes
salinos aumenta pueden desbordar la estructura de las proteínas. Las fuerzas iónicas estabilizan el sitio activo.
Si se requieren es a bajas concentraciones, siguen la ley del todo o nada: SI se necesitan y no está, no se produce la
reacción, si se necesitan y están presentes hay actividad enzimática.
2.2. MODULADORES: moléculas ajenas a la reacción que pueden modular la actividad enzimática potenciándola o
inhibiéndola.
Los inhibidores inhiben la actividad enzimática al unirse a la enzima, alterando la capacidad para fijar el sustrato o la
capacidad de los sitios catalíticos, si disminuye a actividad enzimática, disminuye la velocidad de la reacción. Tipos:
- IRREVERSIBLES: se unen a través de enlaces covalentes, incapacitando la enzima de forma permanente. Son
sustancias tóxicas naturales o artificiales. Por ejemplo: penicilina (inhibe la formación de las paredes bacterianas)
y DFP.
- REVERSIBLES: se unen a la molécula por enlaces no covalentes, se unen de forma temporal. Se unen mediante
interacciones débiles iguales a las que se dan entre los sustratos y enzimas. Como son uniones temporales son
reversibles. Se forman complejos disociables E-I o E-I-S. Pueden ser:
o COMPETITIVOS: tienen el mismo sitio de unión a la enzima que el
sustrato, es decir, compiten con el sustrato por la unirse a la enzima,
por lo que son mutuamente excluyentes. El grado de inhibición
depende de la concentración de los inhibidores, es directamente
proporcional. Aumenta Km cuando hay inhibidor, pero no cambia
Vmax, y se necesita más sustrato para alcanzar la misma Vmax.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
o NO COMPETITIVOS: inhibidor y sustrato se unen a
distintos sitios activos, se van a unir a la enzima de forma
independiente. Encontramos complejos E-I, y complejos
E-I-S. Como no compiten por la unión, el inhibidor reduce
la acción de la enzima, pero no la unión de ésta por el
sustrato. Como no afecta la concentración de sustrato, Km
no cambia, varía Vmax.
o ACOMPETITIVA: para que pueda unirse el inhibidor es necesario que previamente se haya formado el
complejo E-S, es decir, siempre lo encontraremos en estado terciario. La unión del inhibidor hace que
aumente la afinidad de la enzima y el sustrato. Vmax disminuye porque disminuye la eficiencia de la
reacción por la unión del inhibidor. Km también disminuye porque la formación del complejo E-S-I
induce la unión de la E al S. Se forma producto, pero a un ritmo más bajo.
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TEMA 10 REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Las reacciones no ocurren de forma aislada, si no que se encuentran de forma secuencial, el producto de una es el sustrato
de otra hasta obtener un producto mayoritario. Esta secuencia se llama VÍA O RUTA METABÓLICA.
Cada ruta metabólica se debe adaptar su velocidad a las necesidades de la célula y va a estar condicionada por las demás
vías metabólicas y por la relación con el entorno. Para mantener la homeostasis (equilibrio interno normal a pesar de las
reacciones que se están produciendo, por ejemplo, los niveles de glucosa) la célula necesita regular todas las rutas
metabólicas. Para controlarlas, como tienen muchas etapas y reacciones, se controlan unas pocas etapas dentro de cada
ruta metabólica, así, controlando esa etapa se regula toda la vía. La etapa donde recae una ruta metabólica es la etapa
limitante, regulada por enzimas limitantes. Son irreversibles por ser la reacción más lenta de la vía y suelen estar en las
primeras etapas o cerca de las ramificaciones, para no gastar energía innecesaria.
Existen 3 tipos de regulación de la actividad enzimática: la disponibilidad de sustrato, los niveles enzimáticos y la
actividad de las enzimas en etapas limitantes.
1. DISPONIBILIDAD DE SUSTRATO: para que haya reacción se necesita la presencia de sustrato y que esté en
el compartimento adecuado, para ello se emplean distintos sistemas:
- De transporte. Hay dos sistemas que facilitan la accesibilidad al producto intermedio, no al producto inicial
aumentando la velocidad de la reacción:
o Difusión pasiva: se transportan metabolitos impermeables de mayor a menor concentración.
o Difusión facilitada: metabolitos impermeables de mayor a menor concentración a través de proteínas
transportadoras.
o Transporte activo: metabolitos impermeables a la membrana de menor a mayor concentración, a través
de proteínas transportadoras y con consumo de ATP.
o Lanzadoras: se produce en ocasiones en las que el metabolito no puede cruzar la membrana plasmática.
Se emplea una isoenzima que modifica el metabolito A - B que sí puede penetrar la membrana. Una vez
el metabolito B ha atravesado la membrana, otra enzima lo devuelve a su estado original.
▪ Isoenzimas:
• Glucoquinasa / hexoquinasa: La glucoquinasa (hígado, células β páncreas): Km alta para
la glucosa, no se inhibe por GTP. La hexoquinasa (en el resto de células): Km baja para
la glucosa, se inhibe por producto.
• Creatinina fosfoquinasa (CPK): CPK1: cerebro, pulmones. CPK2: corazón. CPK3:
músculo.
• Lactato deshidrogenasa. LDH: LDH1: músculo cardiaco y eritrocitos. LDH2: glóbulos
blancos. LDH3. pulmones. LDH4: riñones, placenta, páncreas. LDH5: hígado, músculo
esquelético.
- Los complejos multienzimáticos son sistemas que facilitan la accesibilidad del intermediario metabólico. Pueden
ser:
o Enzimas libres: cada metabolito intermediario actúa como producto enzimático de la siguiente. Quedan
orientados hacia el sitio catabólico de la siguiente reacción. Siguiendo este sistema, podemos encontrar:
▪ Complejos enzimáticos: asociaciones de proteínas.
▪ Enzimas de membrana: el producto queda en la membrana.
o Enzimas multifuncionales: en vez de tener presentes varias enzimas, se tiene una con diversas
capacidades enzimáticas que actúa sobre una misma cadena peptídica con varios centros activos.
2. NIVELES ENZIMÁTICOS: la biosíntesis y degradación de enzimas es un proceso a largo plazo. Las enzimas están
sometidas a procesos de recambio proteico, están constantemente sintetizándose y degradándose.
- Enzimas constitutivas: no nos van a servir para regular la vía metabólica, ya que se sintetizan de forma
constante, su velocidad de síntesis no se modifica.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
- Enzimas inducibles: Estas sí que nos sirven para regular las rutas metabólicas, ya que están sometidas a
diferentes estímulos. Hay otras que la velocidad de síntesis es variable y tras la respuesta de estímulos se induce
su expulsión.
La degradación de proteínas puede estimularse por varios motivos, ya sea la dieta, hormonas, el conjunto de la tasa de
biosíntesis y de degradación, determina la cantidad de enzimas que hay en la célula. La velocidad de la vía metabólica
depende de la concentración de enzimas. En este tipo de regulación hablamos de regulación a largo plazo porque es lenta,
tardan en verse los efectos. La velocidad de biosíntesis y sus degradación es lo que va a determinar la concentración de la
enzima y por lo tanto la velocidad de la vía.
Tienen una cinética sigmoidea, a bajas concentraciones de sustrato, la enzima actúa de forma lenta, pero, a partir de una
determinada concentración, la velocidad de la enzima se dispara. Aumenta la velocidad como consecuencia del aumento
de la concentración del sustrato, esto se debe a que presenta dos configuraciones, la forma T (tensa, baja afinidad) y la
forma R (relajada, mayor afinidad). Se asemeja a una enzima que sigue la cinética de Michaelis-Menten.
La unión del primer sustrato (ligando) induce cambios configuracionales en las subunidades subyacentes que modifican la
afinidad por el sustrato. Se da el fenómeno de cooperatividad, el ligando y modulador es la misma molécula (el producto
de una reacción es el sustrato de otra y la concentración de éste condiciona el funcionamiento de la vía), es decir,
hablamos de una interacción homotrópica.
Las interacciones heterotrópicas se caracterizan porque las enzimas, además de presentar el sitio activo, presentan otros
sitios de unión, sitios alostéricos: sitios de unión específico para otros ligandos que no participan en la reacción
enzimática. Los moduladores alostéricos son inhibidores o activadores. El modulador y sustrato son moléculas distintas.
El modulador alostérico se puede unir y modificar la afinidad de la enzima por el sustrato. Los moduladores alostéricos
son moléculas que no participan en la reacción enzimática, pero van a regular la
afinidad de sustrato sobre el centro activo.
- Positivos/activador: aumentan afinidad de la encima por el sustrato,
favorece el paso a la forma R.
- Negativos/inhibidor: disminuyen la actividad de la enzima por el
sustrato, favorece el paso a la forma T.
Si aumenta la velocidad, la cinética sigmoidea se desplaza a la izquierda. Si la
velocidad disminuye, se desplaza a la derecha, se necesita mucho más sustrato
para elevar la velocidad.
- Subunidades de enzimas alostéricas: las enzimas alostéricas están
formadas por una subunidad catalítica y otra reguladora. Cuando el
modulador alostérico se una a la subunidad reguladora induce un cambio en la configuración que deja disponibles
los centros activos. La unión del modulador a la subunidad reguladora es no covalente y reversible.
- Feedback negativo o retroalimentación por producto: inhibe a enzima de la etapa limitante. Cuando se acumula
por encima de las necesidades de la célula se convierte en una señal para reducir su propia formación, no solo
ocurre con el producto final sino con otros metabolitos.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
Hay diferentes tipos de reacciones químicas por las que cambian sus estado químico de inactivo a activo.
- Metilaciones, adeninaciones, ADP ribosilaciones (adición de ADP ribosa a una proteína), uridilaciones…
- Las más comunes son las fosforilaciones de los residuos OH. Las quinasas se encargan de añadir los grupos
fosfato y activar la enzima y de desfosforilar la fosfatasas. La ventaja que tiene este tipo de reacciones es que la
misma señal actúa sobre muchas enzimas a la vez, por lo que sus efectos se ven rápido.
Ejemplo:
o Cascada de señal de la glucosa: la misma señal afecta a distintas rutas metabólicas para regular todo el
metabolismo de manera más rápida.
Ejemplos:
- Peptidasas: Se sintetizan como zimógenos, solo actúan durante la digestión porque degradarían las estructuras del
cuerpo.
- Enzimas implicadas en la coagulación sanguínea: El fibrinógeno es el precursor de la fibrina que coagula la
sangre.
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TEMA 11 COENZIMAS Y VITAMINAS HIDROSOLUBLES
Algunas enzimas además de su sustrato necesitan otros compuestos para realizar su actividad enzimática, estos son
llamados cofactores enzimáticos: las holoenzima esta formadas por una parte proteica (APOENZIMA) + parte no proteica
(COFACTOR)
Grupo prostético: cuando la unión es permanente (covalente). En este caso la parte proteica se llama apoenzima y la
molécula que actúa de sustrato, cofactor.
De naturaleza orgánica: hablamos de COENZIMAS que vamos a clasificar en coenzimas de origen vitamínico y de origen
no vitamínico. Estas las vamos a encontrar en reacciones redox (transferencia de e-) o transferencia de grupo
(transferasas, clase 2). Las coenzimas comparten propiedades con el sustrato y enzimas. Al igual que las enzimas, no se
consumen en las reacciones químicas, pero, al contrario, no son específicas, un mismo cofactor puede participar en
distintas reacciones. No están sujetas a regulación. Forman intermediarios de reacción que favorecen la transferencia de
electrones o de grupos entre dos sustratos.
1. COENZIMAS VITAMÍNICAS: algunas coenzimas son vitaminas, pero no todas las vitaminas son coenzimas,
solo las hidrosolubles.
* Coenzima A: Vitamina B5 -> Transferencia de grupo acilo y síntesis y metabolismo de ácidos grasos.
* Tiamina o pirofosfato de tiamina: Vitamina B1 -> Transferencia de grupos aldehídos. Reacciones de deshidrogenación.
Regulación de transmisión nerviosa (por canales de Cl-).
* Piridoxal fosfato: Vitamina B6 -> transferencia de grupos amino. Metabolismo de aa y glucógeno. Hormonas esteroideas.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
* Metilcobalamina-adenosilcobalamina: Vitamina B12 -> 2 formas coenzimaticas. Transferencia de grupos metilo.
Coenzimas de mutases. Síntesis de ácido fólico.
* Cobalamina: Vitamina B12 -> No en vegetales, en alimentos de origen animal. Síntesis intestinal por bacteria. Deficiencia:
Anemia megaloblástica.
* Tetrahidrofolato: Vitamina B9 -> Síntesis de ácidos nucleicos. Transferencia de fragmentos de 1C.
* Ácido Fólico -> Fuentes: Espinacas, verduras de hoja verde, fruta, pescado, carne. Deficiencia: Anemia megaloblástica,
leucopenia, defecto tubo neural.
Vitaminas: moléculas orgánicas necesarias para un determinado organismo y que éste no puede sintetizar por lo que debe
ingerirlo en la dieta. Se denominan nutrientes esenciales a aquellos que no se pueden generar, pero son necesarios. Si no
se consumen en cantidades adecuadas pueden dar lugar a un estado carencial (hipovitaminosis) que desencadena ciertas
patologías. Pueden encontrarse formando parte de coenzimas o participando directamente en procesos fisiológicos
completos.
- TIPOS DE VITAMINAS:
VITAMINAS HIDROSOLUBLES: son de naturaleza hidrosoluble que se absorben y
eliminan bien, no se acumulan y no generan problemas de toxicidad. Forman parte
de coenzimas y los estados de hipervitaminosis generan problemas metabólicos.
VITAMINAS LIPOSOLUBLES: se absorben mal debido a su naturaleza liposoluble al igual que se eliminan mal. En
exceso pueden generar patologías tan graves como los estados carenciales. No forman parte de coenzimas, están
implicados en procesos específicos. Para ser transportadas necesitan unirse a lipoproteínas o a proteínas específicas.
2. COENZIMAS NO VITAMÍNICAS:
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BLOQUE 8: INTRODUCCION AL METABOLISMO Y BIOENERGÉTICA
1. CATABOLISMO:
Procesos en los que se obtiene materia y energía. Caracterizados por ser procesos degradativos, oxidativos,
exergónicos (liberan energía) y convergentes (varias moléculas diferentes van a dar al mismo producto). Para que
tengan lugar necesitaremos coenzimas oxidadas (NAD+, FAD+), que dan lugar a coenzimas reducidas (NADH,
FADH) y energía.
2. ANABOLISMO:
Tiene lugar la síntesis de macromoléculas. Son procesos de biosíntesis, reductores, energéticos y divergentes (del
mismo sustrato se obtienen diferentes productos). Necesita coenzimas reducidas (NADPH) y un aporte energético
(ATP).
1º Degradación de las macromoléculas (monómeros estructurales) a aa, monosacáridos, lípidos. Apenas se libera energía
y la que se libera no es útil pues lo hace en forma de calor.
2º Degradación de los intermediarios metabólicos, se libera más energía en forma de ATP, no demasiada.
3º Degradación de los intermediarios a moléculas sencillas, la oxidación completa de estos. Se libera mucha energía. Ej:
cadena respiratoria y la fosforilación oxidativa.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
TEMA 16 BIOENERGÉTICA CELULAR. COMPUESTOS
RICOS EN ENERGÍA DE INTERÉS BIOLÓGICO.
TERMODINÁMICA: ciencia que estudia las transformaciones energéticas de la
materia.
BIOENERGÉTICA: ciencia que estudia las transformaciones energéticas de la materia viva. La adquisición, el
intercambio e interconversión de energía.
La energía libre de Gibbs (ΔG) es la energía capaz de producir trabajo y determinar la espontaneidad de una reacción.
o Si ΔG < 0 . Reacción exergónica (espontánea).
o Si ΔG > 0 . Reacción endergónica (no espontánea).
o Si ΔG = 0 . Reacción en equilibrio.
TIPOS DE REACCIONES:
1. Reacción exergónica: son termodinámicamente posibles, liberan energía y se lleva a cabo de forma espontánea.
AG0’<0: Está favorecida la formación de producto.
2. Reacción endergónica: no se lleva a cabo de forma espontánea, requiere energía. AG0’>0: está favorecida la
formación de sustrato.
3. Reacción acoplada: se aprovecha la energía liberada de las reacciones exergónicas para favorecer las
endergónicas. Para que funcione se necesita un producto final exergónico para aportar un exceso energético.
Ejemplo: primera etapa de la glucólisis. La fosforilación de la glucosa es endergónica, se acopla a la hidrólisis del
ATP que le aporta la energía necesaria para poder realizarla.
COMPUESTOS DE ELEVADO POTENCIAL DE TRANSFERENCIA DE GRUPOS:
En el acoplamiento energético se necesita la presencia de compuestos que almacenan energía (compuestos de elevado
potencial de transferencia de grupo). Son compuesto que liberan energía cuando transfieren determinados grupos
químicos a otros compuestos o al agua. A veces se representa ese enlace rico en energía. Son compuestos ricos en energía
aquellos que liberan por hidrólisis más de 30 KJ/ mol (ΔG<-30KJ/mol).
Estos compuestos ricos en energía se clasifican en función del grupo que transfieren:
1. Compuestos con elevado potencial de transferencia de fosfato: enolfosfatos, anhídridos mixtos, fosfoguanidinas,
nucleótidos.
2. Compuestos con elevado potencial de transferencia de acilo: ésteres de CoA.
3. Compuestos con elevado potencial de transferencia de metilo: S-adenosil metionina (SAM).
1. COMPUESTOS CON ELEVADO POTENCIAL DE TRANSFERENCIA DE FOSFATO:
ENOLFOSFATOS: El compuesto más importante es el fosfoenol piruvato
(PEP).
- Es un intermediario de la glucólisis.
- Tiene alto potencial de transferencia de grupo por lo que permite la
síntesis de ATP por fosforilación a nivel de sustrato (se da en
condiciones anaerobias (sin oxígeno)).
Las formas enólicas siempre están en equilibrio con las formas ceto (es la forma de configuración más estable) por
tautomería (tautómeros: isómeros que se diferencian solo por la posición de un grupo funcional). Al incorporarse un
grupo fosfato, se impide que se alcance la forma ceto (la estable), por esto el fosfoenol piruvato cede el grupo fosfato para
facilitar la formación más estable, permitiendo la tautomería enólica liberando energía, es el compuesto que más energía
libera. Es un intermediario de la glucolisis.
Reservados todos los derechos. No se permite la explotación económica ni la transformación de esta obra. Queda permitida la impresión en su totalidad.
ANHÍDRIDOS MIXTOS (Acil-Fosfato; Carboxilo-Fosfórico): el metabolito de más importancia es el 1,3-
bisfosfoglicerato, tiene dos grupos fosfato, pero el del carbono 1 es un enlace rico en energía, mientras que el de posición
3 en el enlace ester no lo es.
Está formado por 3 grupos fosfato, una ribosa (pentosa) y una base nitrogenada de adenina. Es una molécula inestable
porque el oxígeno es de gran tamaño y está cargado negativamente, por eso, al desprender el oxígeno (al desprender un
grupo fosfato) se libera energía porque se favorece la estabilidad de la molécula. Los grupos fosfato se une entre sí por
enlaces esteres anhidridos
- Hidrólisis del ATP:
1. Hidrólisis simple de ATP: se da en situaciones normales. ATP -> ADP + Pi. El ATP se hidroliza (se
rompe) para dar ADP y fosfato inorgánico.
2. Hidrólisis pirofosfatolítica de ATP: se da cuando se necesita un aporte
extra de energía. ATP -> AMP + Pi (pirofosfato, 2 grupos fosfato). Se
libera mas energía, y el APT se hidroliza para formar AMP y pirofosfato).
FUNCIÓN del ATP: es llamado la moneda de energía libre ya que funciona como
almacén de energía procedente de nutrientes, además de distribuir energía en los procesos
celulares que la precisan. A pesar de que el aporte energético del ATP sea más bajo, es el
más usado porque es fácil de recargar. Los niveles de ATP están regulados, están en
continuo intercambio. La concentración relativa de ATP, ADP y AMP condicionan el
metabolismo de la célula.
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Los procesos de BIOSÍNTESIS de ATP se llaman fosforilación y hay de dos tipos:
1. Fosforilación a nivel de sustrato: compuestos ricos en energía que contienen grupos fosfato, ceden al ADP el
grupo fosfato y la energía necesaria para la síntesis de ATP. Estas reacciones son catalizadas por unas enzimas
llamadas quinasas (añaden grupos fosfato). Esta es la forma minoritaria de sintetizar ATP, pero es muy importante
ya que es la única forma de sintetizar ATP, en condiciones anaerobias, o en líneas celulares que no tienen
mitocondrias, como los eritrocitos.
2. Fosforilación oxidativa: es la forma de sintetizar ATP en presencia de oxigeno. Es la vía mayoritaria de síntesis
de ATP. El ATP se forma a partir de ADP y fosfato inorgánico que se unen para formar ATP usando la energía que
se libera de la cadena de e- (cadena respiratoria), la cual esta catalizada por la enzima ATP sintasa (sintetasa).
REGULACIÓN METABOLICA EN FUNCIÓN DEL ESTADO ENERGÉTICO CELULAR:
Los niveles de ATP, ADP y AMP definen el metabolismo celular. El estado energético global de una célula se puede
expresar en función de la carga energética (Qen).
- Si hay una elevada concentración de ATP se favorece el
anabolismo.
- Si hay una elevada concentración de AMP se favorece el
catabolismo.
Una tasa de carga energética normal (en la que las vías anabólicas y
catabólicas están equilibradas) es de 0,9 y deben mantenerse entre 0,85 y
0,95, la célula tiene una especie de tampón energético para que los valores
de energías siempre estén por ahí.
- Si la carga energética disminuye, se detiene el anabolismo y se activa el
catabolismo, para obtener energía.
- Si la carga energética aumenta, se detiene el catabolismo y se activa el
anabolismo, para perder energía.
2. COMPUESTOS DE ELEVADA TRANSFERENCIA DE ACILO:
Incluye a todos los derivados de la Coenzima A (a partir de la vitamina B5). Están
formados por un enlace tioéster (impide la resonancia (alcanzar la forma estable) del
grupo carboxilo) con el grupo carboxilo de todos los ácidos grasos, formando las
formas activas (unirlo a la CoA lo activa). Destaca acetil-CoA,
intermediario común para muchas vías metabólicas.
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TEMA 17 CADENA RESPIRATORIA Y FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
Los procesos catabólicos son principalmente oxidativos (reacciones de oxidación-reducción, degradamos las
macromoléculas para obtener energía, y también generamos productos de desecho). En este tipo de reacciones con
transferencia de e-, los e- pasan de un donador (reductor) a un aceptor (oxidante). Las principales reacciones redox del
organismo son las deshidrogenaciones, catalizadas por deshidrogenasas. Éstas emplean como cofactor coenzimas
vitaminadas, algunas son:
- NADH + H+ y NAD+: su precursor es la vitamina B3, van a pasar de forma oxidada a reducida durante los
procesos catabólicos. Nicotinamido adenin dinucleótido (estado reducido NADH + H+)
- FADH2 y FAD: su precursor es la vitamina B2, para que se puedan seguir empleando hay que regenera las formas
oxidadas. Flavin adenin dinucleótido (estado reducido FADH2).
- NADPH y NADP+: su precursor es la vitamina B3, se regeneran en función de las condiciones en las que está la
célula. Nicotinamido adenin dinucleótido fosfato (estado reducido NADPH)
Las coenzimas deben regenerar su forma original (oxidada) cediendo los electrones a otros sustratos con mayor capacidad
de aceptarlos.
En condiciones anaerobias, cualquier sustrato oxidado puede captar estos e-. En estas reacciones no se aprovecha la
energía de oxidación, son las reacciones de fermentación: Láctica, alcohólica.
En condiciones aerobias, el O2 (aceptor) capta los e- y se reduce para formar agua. Se libera mucha energía, que se
emplea para sintetizar ATP. Esta ruta es la cadena respiratoria o la cadena transportadora de electrones, en la que los
e- pasan de coenzimas reducidas al oxígeno molecular, va a ser un proceso irreversible.
1. CADENA RESPIRATORIA
Es un proceso irreversible, a través del cual las coenzimas reducidas (NADH, FADH2) ceden sus e- a una serie de
aceptores internos en cadena hasta llegar a un aceptor final, que es el O2, que se reduce a agua.
Tiene 2 funciones:
- Regenerar las formas oxidadas (FAD, NAD) para que puedan seguir participando en los procesos catabólicos.
- En el transporte escalonado de e- se libera energía que se empleará en la síntesis de ATP.
El transporte de e- se hace a través de transportadores de forma escalonada. Están ordenados en orden creciente de
potencial de reducción (informa sobre la afinidad que tiene el transportador por los e-), siendo el último eslabón el más
afín a los e-, el que más tiene (que es el O2). Esto permite que, al liberar la energía poco a poco, sea más fácil de
almacenarla, si es en un único paso resultara muy difícil almacenarla. Por otra parte, también por este mismo motivo, voy
a poder sintetizar varias moléculas de ATP.
Tiene lugar en las crestas de la membrana mitocondrial interna hay complejos formados por proteínas con grupos
prostéticos de naturaleza redox (pueden aceptar y dar e-, transfieren electrones). Estos complejos se llaman complejos
respiratorios o de Green. La cadena está formada por 4 complejos respiratorios (nombrados con números romanos) y 2
transportadores libres.
Los e- entran en la cadena respiratoria a través de las coenzimas reducidas NADH y FADH2 que ceden e- a la cadena
respiratoria para regenerar las formas oxidadas (se reoxidan) NAD y FAD. Estos e- pasan por transportadores
intermedios, ordenados en sentido creciente de potencial de reducción.
Estos transportadores intermedios nos los encontramos formando parte de los complejos respiratorios o en forma de
transportadores libres. Inicialmente, se parte de la forma oxidada de los transportadores, el aceptor de los e- del
transportador anterior se reduce y, al cederlos al siguiente transportador, se reoxida.
Los transportadores intermediarios son: mononucleótidos de flavina, complejos hierro-azufre (ferro proteínas sin grupos
hemo), coenzima Q o ubiquinona, distintos tipos de citocromos, complejos de cobre asociado a citocromos. El aceptor
final es el O2 que se reduce y forma H2O.
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1. FLAVÍN MONONUCLEÓTIDOS (FMN) se encuentra en el complejo I de la cadena respiratoria, por lo que son
los transportadores de menor potencia de reducción. Serán los aceptores de los e- del NADH + H+ (intervienen en
su regeneración) pero no aceptan los e- de FADH2 (no intervienen en su regeneración).
2. CENTROS HIERRO-AZUFRE: ferro proteínas sin grupo hemos en su estructura. Se encuentra en complejos I, II
y III de la cadena respiratoria y van a tener distinto potencial de reducción en función de cómo se ordenen el
conjunto Fe-S y la cadena proteica. Es el Fe el encargado de transporte de e-.
3. COENZIMA Q o UBIQUINONA: se encuentra libre, es decir, no está asociada a ningún complejo. Tiene
naturaleza hidrofóbica lo que le permite difundirse por la membrana. Su potencial de reducción es mayor que el
del complejo I y II, pero menor que el III, tiene un potencial intermedio.
4. CITOCROMOS: proteínas que tienen de grupo prostético un grupo hemo, vamos a tener distintos tipos de grupos
hemo lo que va a dar a distintos tipos de citocromos. Hay distintos tipos de citocromos con distintos potenciales
de reducción en función de la estructura concreta del grupo hemo y de la cadena proteica, que también van a ser
distintos. Destacamos el citocromo C ya que es un transportador libre, no se une a ningún complejo, el resto los
encontraremos formando parte de los complejos III y IV de la cadena respiratoria.
Transportadores libres:
1. COENZIMA Q: coenzima no vitamínico, tiene una cadena alifática que explica su naturaleza hidrofóbica, esto
junto a su pequeño tamaño es lo que le permite moverse.
2. CITOCROMO C: no forma parte de una proteína integral de membrana (se encuentra en el espacio
intermembrana, no está anclado a la membrana) por lo que puede difundirse por la membrana, ademas también es
pequeño.
Complejos respiratorios de la cadena:
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deshidrogenasa, enzima del ciclo de Krebs, que usa como grupo prostético (unido permanentemente) el FAD. Como
transportadores de e-:
- FADH2
- Proteínas Fe-S.
Es la vía de entrada de e- procedentes de FADH2. En el momento en que los e- pasan a la coenzima Q (ubiquinona), se
libera energía, pero no suficiente para bombera protones en corta de gradiente, por lo tanto no funciona como bomba de
protones, ya que no bombea protones al espacio intermembrana.
Otras enzimas también usan FAD como cofactor, como algunas deshidrogenasas, por lo que obtenemos FADH2:
- Acetil CoA deshidrogenasa, en la β-oxidación de los ácidos grasos.
- Glicerol fosfato deshidrogenasa, participa en la lanzadera de glicerol fosfato.
PROCESO: En el paso final se liberan los e- al oxigeno molecular para formar agua.
Es un proceso irreversible (realmente solo el C. IV que sí es irreversible, el resto son reversibles). El O2 se reduce a H2O
con aporte de 4e- procedentes de 2NADH + H+ o 2 FADH2. Si el O2 se reduce con menos de 4e- se generan radicales
libres (ROS).
FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
Es un proceso endergónico íntimamente ligado a la cadena respiratoria (si se
bloquea la cadena, se bloquea la síntesis de ATP), este lo que va a hacer es
utilizar la energía que se libera en la cadena respiratoria para generar ATP. El
ADP se une a fosfato inorgánico para formar ATP por acción de la ATPsintasa.
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ATPsintasa: está formada por 2 subunidades:
- FO: de naturaleza hidrofóbica, integrado en la membrana mitocondrial interna, va
a ser la vía de entrada de los protones.
- F1: proteína periférica que encontramos proyectada hacia la matriz. Es la
subunidad catalítica a la que se une ADP y Pi para formar ATP. A su vez está
formado por subunidades: 3 unidades α, 3. unidades β, 1 unidad δ, 1 unidad γ, 1
unidad ε. β es la única que tiene poder catalítico. Las unidades β se encuentran de
3 formas distintas tanto en su afinidad por el sustrato como en su afinidad
catalítica. La forma de interaccionar con las subunidades γ influye en su
capacidad catalítica, y la configuración en la que se presenta depende de la
interacción con γ. Siempre voy a tener una de cada. Actúa por catálisis rotacional.
1. β ADP (laxa, L): une débilmente ADP y Pi (fosfato inorgánico) (sustratos). No tiene
capacidades catalíticas, solo capta los sustratos (baja afinidad).
2. β ATP (tensa, T): une fuertemente los sustratos (ADP + Pi) y productos (ATP). Tiene
capacidad catalítica (alta afinidad).
3. β vacío (abierto, O): incapaz de unir sustratos ni productos (no tiene afinidad).
Cuando los protones regresan por el canal de FO liberan energía que produce un cambio conformacional en la proteína.
Tiene catálisis rotacional, según rota va adquiriendo capacidad catalítica (gira el anillo C, gira la subunidad γ y cambia la
configuración β). Al girar la subunidad γ por el paso de los protones, la subunidad β-ADP pasa a β-ATP, y sintetiza ATP.
Al volver a girar, β-ATP pasa a β-vacío, se pierde la afinidad y se libera ATP. Luego, pasa de β-vacío a β-ADP, por lo que
va a captar los sustratos, y así constantemente.
Por cada molécula de NADH se rinden 3 ATP, la oxidación de NADH + H+ a NAD+ permute generar 3 ATP. A lo largo
del transporte de e- procedentes de NADH en la cadena hay 3 puntos donde se libera energía, parte de ella se usa para
bombear protones al espacio intermembrana (CI, CIII, CIV) que implica 3 pasos de protones a través de la ATPsintasa.
Por cada molécula de FADH2 se rinden 2 ATP, por la oxidación de FADH2 a FAD+ se generan 2 ATP. Hay 2 puntos
donde se translocan protones al espacio intermembrana (CII, CIV).
NOTA: 1NADH genera 2.5 ATP y 1FADH2 genera 1.5 ATP. Parte de la energía almacenada no se usa para generar ATP,
se usa para transportar iones dentro y fuera de la mitocondria (fosfato).
Hay moléculas que inhiben o desacoplan la cadena respiratoria y fosforilación oxidativa, que son los inhibidores de la
cadena respiratoria (sustancias tóxicas):
Complejo I: Rotenona, amital, pieridicina A. Actúan inhibiendo el complejo I, inhiben la reoxidación del NADH, pero no
afectan al FADH2.
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ATP. Ej: detergentes (fragmentan MMI, generan poros por donde los H+ vuelven a la matriz), ácidos débiles liposoluble,
solo cuando no están ionizados (captan H+ del espacio intermembrana y liberan los H+ en la matriz, alterando el flujo
natural de H+ que ya no se ven obligados a regresar exclusivamente por la ATP sintetasa, ej: DNP), termogenina (UCP-1
(proteína desacoplante), proteína con poros conductores de H+ de la MMI de mitocondrias del tejido adiposo marrón, más
rico en mitocondrias. Los H+ regresan a la matriz por esta proteína en vez de la ATPsintasa, al pasar por ella liberan
energía, pero en forma de calor. Es un proceso importante en neonatos y animales hibernantes. Se llama proceso de
termogénesis, va a aumentar el consumo de oxígeno.
Para que el oxígeno se reduzca se necesitan 4e-. Si durante la cadena respiratoria se pierden e- se produce una reducción
parcial del O2 y se originan especies reactivas de oxígeno (ROS, son altamente oxidativa y reactivas) como el anión
superóxido, agua oxigenada y el radical hidroxilo. Son especies muy reactivas con capacidad oxidante, producen daño
oxidativo en nuestras moléculas. Pueden atacar a proteínas, lípidos y ácidos nucleicos. Implicados en el desarrollo de
cáncer o tumores y procesos de envejecimiento celular.
La MMI es muy impermeable tanto para H+ como para otras moléculas como NADH. El NADH mitocondrial se
regenera mediante la cadena respiratoria. Para regenerar NADH en el citosol la célula emplea sistemas para introducir los
e- en el interior de las mitocondrias y a la cadena respiratoria. Se reduce en el citosol y viajan los e- a través de sistemas
de lanzaderas al interior mitocondrial. Las células tienen mecanismos llamados lanzaderas que permiten la entrada a la
mitocondria de los electrones citosólicos:
- Lanzadera glicerol-3-fosfato: los e- citosólicos entran a la cadena por el complejo II. El balance energético es de
2 ATP. Utiliza intermediarios de la glucolisis para hacer llegar los e- del citosol la matriz mitocondrial,
dihidroxiacetona fosfato (intermediario de la glucolisis). Se da en el músculo y cerebro.
- Lanzadera malato-aspartato: entran por el complejo I. El balance energético es 3 ATP. Usa intermediarios de
ácido cítrico y aa par. Se da en el hígado y en el corazón
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La regeneración del NAD mitocondrial es siempre igual, el balance depende de la lanzadera que se emplee para entrar en
la mitocondria.
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