Se dio cuenta de que si Doomsday realmente llegaba a Metrópolis, la batalla
resultante posiblemente podría destruir la ciudad y matar a millones de personas
inocentes. Doomsday desarrolló un fuerte deseo de asesinar a Superman, un
deseo que luego se explicó en la miniserie Hunter/Prey: "a partir de la agonía de
morir continuamente durante su proceso de creación, Doomsday desarrolló en sus
genes la capacidad de sentir a cualquier kryptoniano, así como un instinto
primordial para tratar a cualquier ser como una amenaza automática".
En el espacio de unos pocos números de la serie de cómics de Superman,
Doomsday luchó contra Superman en una lucha titánica, lo que llevó al héroe a
concluir que la criatura continuaría atacando sin descanso y sin cesar, sin miedo ni
compasión. Las cosas llegaron a un punto crítico en Superman (vol. 2) # 75, en el
que tanto Doomsday como Superman se mataron a golpes frente al edificio Daily
Planet en Metrópolis.[10]
Después de la batalla, aparecieron cuatro súper seres y tomaron el manto de
Superman, dos de ellos se declararon a sí mismos como el verdadero Superman.
Uno era mitad hombre/mitad máquina que se parecía mucho a Superman con
implantes cibernéticos donde Superman había sufrido la mayor cantidad de daño
por los golpes de Doomsday. Este "Superman" tomó la custodia del cuerpo de
Doomsday. Después de atar el cuerpo a un asteroide con un dispositivo
electrónico adjunto, el cyborg arrojó a Doomsday al espacio profundo en una
trayectoria supuestamente segura de nunca cruzarse con ningún otro planeta. El
problema terminó con un panel de Doomsday despertado y riendo, todavía
encadenado al asteroide pero vivo.
Rematch: Hunter/Prey
Después de atravesar un agujero de gusano, el asteroide de Doomsday fue
encontrado por una nave carroñera del espacio profundo. Tras examinar la roca
flotante de aspecto peculiar, la tripulación de la nave recuperó el objeto con la
esperanza de encontrar algo de valor. La nave del carroñero estaba en una ruta a
Apokolips, el hogar del ahora poderoso tirano Darkseid, ahora empoderado por la
legendaria Fuerza Omega mucho después de su primer encuentro con Doomsday.
Doomsday estaba completamente descansado y, después de matar a la
tripulación de la nave de salvamento, se encontró aterrizando en el duro mundo.
Esta iba a ser la configuración para un enfrentamiento final entre Doomsday y
Superman, que se había sentido inquieto por la posibilidad de la resurrección de
Doomsday. Con la ayuda de sus contactos de la Liga de la Justicia, Superman
adquirió una Caja Madre, una computadora sensible, después de que el sirviente
de Darkseid, DeSaad, contactara a la Tierra por un problema en Apokolips.
Sin que Superman lo supiera, Doomsday se había enfrentado y vencido a
Darkseid en combate singular, incluso después de resistir el efecto completo de
los Omega Beams de Darkseid, y estaba arrasando con Apokolips. Antes de que
Superman pudiera lidiar con Doomsday, Desaad abrió un boom tube a Calaton, el
primer mundo donde Doomsday fue derrotado con éxito, y envió a Doomsday a lo
que creía que era su derrota a manos de Radiant. Sin embargo, Doomsday pudo
adaptarse y vencer a cualquier oponente debido al proceso por el cual fue creado,
por lo que, aunque Radiant lo había derrotado una vez, no podría volver a
derrotarlo. Del mismo modo, aunque Superman había matado a Doomsday una
vez antes, no pudo volver a hacerlo. Superman, sabiendo esto, habiendo
aprendido la historia de Doomsday por el manipulador del tiempo Waverider,
estaba obsesionado con detener a Doomsday y lo siguió a Calaton. Luchó contra
Doomsday nuevamente con la ayuda de la Caja Madre, pero, a pesar de que le
proporcionó armas adicionales, como una pistola ultrasónica y una espada de
energía, Superman fue derrotado cuando las evoluciones de Doomsday lo
volvieron inmune a los ataques de Superman, como sus canales auditivos, siendo
sellado por nuevos crecimientos óseos o sus nudillos pueden salir disparados de
su cuerpo para 'fijar' a Superman en el aire. Eventualmente, con su brazo
izquierdo habiendo sufrido una fractura compuesta y la mayoría de sus armas
perdidas, Superman se vio obligado a usar uno de los dispositivos de viaje en el
tiempo de Waverider para dejar a Doomsday varado en el Fin de los Tiempos,
donde Doomsday se encontró con la única fuerza que no pudo vencer: entropía. Al
devolver a Superman al presente, la Caja Madre curó las heridas de Superman y
luego "murió". En Apokolips, Darkseid, a pesar de haber sido golpeado casi hasta
la muerte por Doomsday, quedó fascinado con él después de presenciar sus
habilidades de primera mano y conocer su origen de Waverider.