BIOSINTESIS DE AMINOÁCIDOS
FISIOLOGIA MICROBIANA
2021
Dra. Fabiana María Saguir
AMINOÁCIDOS
• Síntesis del esqueleto carbonado (Familias)
• Incorporación del grupo amino (NH4+)
FIJACIÓN DEL NITRÓGENO
(Bacterias fijadoras de nitrógeno
Géneros claves; Azotobacter y Azomonas)
Ventaja competitiva a las células
Algunas formas de fijación de N2 son de gran importancia agrícola
Bacterias y aequeas de vida libre (suelo) y simbióticas (plantas)
Complejo Enzimático: Nitrogenasa (dinitrogenasa y dinitrogenasa-reductasa)
INCORPORACIÓN DEL GRUPO AMINO
A) Vía glutamina (Sistema Glutamina sintetasa-glutamato sintasa, GS-
GOGAT)
Glutamina sintetasa
1. Glutamato + NH4+ +ATP Glutamina + ADP + Pi + H+
Glutamato sintetasa
2. -Cetoglutarato + Glutamina + NADPH + H+ 2 Glutamato + NADP +
R. -Cetoglurato + NH4++ NADPH + ATP L-Glutamato + NADP+ +ADP + Pi
Muchas bacterias lo utilizan cuando los niveles de amonio son bajos
B) Vía glutamato (Aminación reductiva)
Glutamato Deshidrogenasa
-Cetoglutarato + NH4++ NADPH + H+ L-Glutamato + NADP+ + H2O
- Bacterias y hongos
- Ocurre cuando la concentración de amonio es elevada
Transferencia de grupo amino: Transaminación
Glutamato Oxalacetato Aspartato -cetoglutaratoA
Aspartato Glutamina Asparagina Glutamato
- Enzimas: Transaminasas o amino transferasas (dependientes de piridoxal 5´fosfato)
- Síntesis de aminoácidos comunes cuando Tranasaminasas deseables están presentes
Reducción asimilativa del nitrato
- Este proceso difiere de la reducción desasimilativa, Nitrato aceptor de electrones en
respiración anaeróbica.
- Este común en bacterias, hongos, protistas fotosintéticos y es un importante paso en el
ciclo del nitrógeno
Familias de aminoácidos (esqueleto carbonado)
En la Biosíntesis de aminoácidos participan los
Cofactores comunes:
pos
• Fosforribosil pirofosfato (grupo aminos)
• Acetil coA (grupo acilo)
• Tetrahidrofolato (fragmentos monocarbonados)
• S-adenosilmetionina (grupos metilo)
- La biosíntesis de aminoácidos es un Procesos
redox
• Pasos reductivos: NADPH dependientes
• Pasos oxidativos: NAD dependientes
Arginina Citrulina
Semialdehído Ornitina
Acetil-S-CoA
2-oxoglutarato
Glutamato Prolina
Glutamina
Familia del glutamato
1. Glutamina sintetasa, 2. γ Glutamil quinasa, 3. Glutamato γ semialdehído deshidrogenasa, 4. Pirrolina-5-
carboxilato reductasa, 5. Carboxilato reductasa, 6. N-acetilglutamato quinasa, 7. N-acetilglutamil-fosfato
reductasa, 8. N-acetil-ornitina carbamilfosfato transferasa, 9. N-acetil ornitina, 10. Ornitina carbamil transferasa,
11. Argininsuccinato sintasa, 12. Argininsuccinato carbamil fosfato
Asparagina Lisina
Oxalacetato
Aspartato
Treonina
Isoleucina
Metionina
Familia del aspartato.
1a,b. Asparagina sintetasa, 2. Aspartato quinasa, 3. Aspartato semialdheído deshidrogenasa, 4. Homoserina
deshidrogenasa, 5. Homoserina quinasa, 6. Treonina sintetasa (piridoxal fosfato), 7. Homoserina succinil
transferasa, 8. Cistationa γ liasa, 9. Cistationa liasa (piridoxal fosfato), 10. Homocisteína metilasa (vitamina
B12 dependiente).
Vía de interés
- Ácido dipicolínico,
producido durante la
esporulación de Bacillus
sp.
- Ácido diaminopimélico
Piruvato + Aspartato y lisina, presentes en
semialdehído peptidoglican de
procariotas.
Lisina
Síntesis de Lisina vía meso-diaminopimelato
1. Sintasa dihidropicolinato, 2. Dihidropicolinato reductasa, 3. Tetrahidrodipicolinato sucinilasa, 4. Succinil
diaminopimelato, 5. Diaminpimelato epimerasa, 6. Diamino epimerasa, 7. Diamino epimerasa decarxilasa.
En levaduras y hongos,
Biosíntesis de lisina se origina a partir del -cetoglutarato.
Diferencia filogenética principal entre bacterias y hongos.
Transulfuración
Sulfuración directa
Biosíntesis de metionina en Eubacteria.
Dependiendo del microorganismos la
formación de homocisteína puede ocurrir
por transulfuración y/o sulfuración
directa (incorporación de S)
Síntesis de metionina en bacterias por transulfuración y sulfidración directa
Homoserina Homoserina Homoserina
O- Succinil-L-homoserina O-Acetilhomoserina O-Acetilhomoserina
L- Cistationina L- Cistationa
L- Homocisteína L- Homocisteína L- Homocisteína
Metionina Metionina Metionina
2-oxobutirato
Isoleucina
Piruvato
Valina
Acetil-CoA + 2- Leucina
oxoisovalerato
Biosíntesis de valina, isoleucina y leucina
Vía muy eficiente:
8 enzimas
3 aminoácidos
Se ha demostrado que esta vía de AA ramificado (BCAA biosybthetic pathway)
es vital para el crecimiento y supervivencia de bacterias patógenas como
Mycobacterium tubercolisis. Esta características posiciona a estas enzimas como
muy atractivas para el desarrollo de nuevas drogas antibacterianas
3-Fosforo-glicerato
Serina
Cisteína
Glicina
Síntesis de aminoácidos de la familia de la Serina
1. 3, Fosfoglicerato deshidrogenasa, 2. 3, Fosfoserina amino transferasa, 3. Fosfoserina fosfatasa, 4. Serina
hidroximetil transferasa, 5. enzima de clivaje de glicina, 6. Serina transcetilasa, 7. O- acetilserina sulfhidrasa
Síntesis de cisteína por transulfuración (hongos)
H2S
Cuando metionina es la única fuente de azufre:
Metionina + ATP S-adenosilmetionina S-adenosilhomocisteína
metilo Adenosina
Homocisteína
Fosfoenolpiruvato + D-Eritrosa-4-fosfato
3-Deoxi-D arabinoheptulosonato-7-fosfato sintetasa
5- Dihidro quinato sintetasa
Síntesis de corismato
Corismato precursor común de aminoácidos aromáticos
Corismato
Tirosina Fenilalanina
Triptófano
Síntesis de aminoácidos aromáticos a partir de corismato
Prefenato
Tirosina Fenilalanina
Vía alternativa para la síntesis de fenilalanina y tirosina en Pseudomona sp.
Fosforibosil
pirofosfato Síntesis de histidina
(PRPP)
Histidina
5 pasos
4 pasos
glutamina
cetoglutarato
glutamato
glutamato
Ribonucleótido 5-aminoimidazol-4- Imidazol glicerol fosfato
carboxiamida (AICAR)
Síntesis de nucleótidos
(ATP, GTP)
MECANISMOS DE INHIBICIÓN POR PRODUCTO FINAL o RETROINHIBICIÖN
SIMPLE
- Biosíntesis de Arginina: N-acetilglutamato quinasa
- Biosíntesis de Prolina: -glutamil quinasa
- Biosíntesis de Isoleucina: treonina desaminasa
MULTIPLICIDAD DE ENIMAS (ISOENZIMAS)
-Biosíntesis de lisina, treonina y metionina en E. coli: Aspartato quinasa
-Biosíntesis de aminoácidos aromáticos: 2-ceto-3-desoxi-D-arabinoheptulosanato-7-fosfato
sintaza.
SECUENCIAL
Biosíntesis de aminoácidos aromáticos en Bacillus subtilis
CONCERTADA
Biosíntesis de treonina y lisina en Lactobacillus helveticus y Corynebacterium glutamicum
(treonina + lisina): Aspartato Kinasa
ACUMULATIVA
Regulación de la actividad Glutamina sintetasa en E. coli (Gln, carbamil fosfato, triptófano,
histidina, glucosamina 6-fosfato, AMP y CTP)
COOPERATIVA
Regulación de la actividad Glutamina sintetasa en Bacillus llicheniformes y cereus (hys y AMP)
Ejemplo de aplicación: Producción de aminoácidos en gran escala (Lisina por C.
glutamicum)
Ejemplo de
retroinhibición
por Isoenziomas
Ruta común que conduce a la síntesis de aminoácidos aromáticos: Contiene tres DAHP (3-
desoxi-D-arabino-heptulosonato-7-fosfato). Cada una de ellas es retroinhibida
específicamente por uno de los aminoácidos aromáticos.
MODIFICACIÓN DE ENZIMAS
Las bacterias se regulan por Modificación covalente, generalmente por eliminación
o adición de alguna pequeña molécula orgánica.
En las proteínas alostéricas, la unión covalente de una molécula pequeña, grupo
modificador (por ejemplo AMP) cambia su conformación afectando su actividad
catalítica.
Regulación de la enzima
Glutamina Sintetasa por
modificación covalente
Regulación de la transcripción
Represión de la síntesis de enzimas
Mecanismo de control muy común en la biosíntesis de aminoácidos, purinas y
pirimidinas
Proceso de la represión enzimática
Operón triptófano
Triptófano: reprime la síntesis de las 5 enzimas requeridas en la conversión del ácido
corísmico en triptófano.
Genes regulatorios Genes estructurales
Cuando el sistema deja de estar reprimido y comienza la transcripción se
ajuste mediante un segundo proceso de regulación: Atenuación de la
transcripción
OPERONES CON CENTROS ATENUADOR
- OPERÓN TRIPTÓFANO Péptido guía: 14 residuos, 2 Trp
-Lys – Ala – Ile - Phe - Val – Leu - Lys – Gly- Trp - Trp -Arg – Thr – Ser – Stop
- OPERÓN TREONINA Péptido guía: 21 residuos, 8 Thr y 4 Ile
Met-Lys-Arg-Ile-Ser-Thr-Thr-Ile-Thr-Thr-Thr-Ile-Thr-Ile-Thr-Thr-Gly-Asn-Gly-Ala-Gly
- OPERÓN FENILALANINA Péptido guía: 15 residuos, 7 Phe
Met-Lys-His-Ile-Pro-Phe-Phe-Phe-Ala-Phe-Phe-Phe-Thr-Phe-Pro
- OPERÓN HISTIDINA Péptido guía: 7 residuos de Hys en fila
Met-Thr-Arg-Val-Gln-Phe-Lys-His-His-His-His-His-His-His-Pro-Asp