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Función y Especificidad de las Enzimas

Las enzimas son proteínas que aceleran las reacciones químicas en el cuerpo. Funcionan uniéndose a sustancias llamadas sustratos y catalizando su conversión en productos. Las enzimas son específicas tanto para los sustratos como para las reacciones, y contienen sitios activos que participan en la catálisis. La velocidad de las reacciones enzimáticas puede regularse a través de mecanismos como la concentración de productos, proteínas reguladoras y modificaciones covalentes de la enzima.

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Función y Especificidad de las Enzimas

Las enzimas son proteínas que aceleran las reacciones químicas en el cuerpo. Funcionan uniéndose a sustancias llamadas sustratos y catalizando su conversión en productos. Las enzimas son específicas tanto para los sustratos como para las reacciones, y contienen sitios activos que participan en la catálisis. La velocidad de las reacciones enzimáticas puede regularse a través de mecanismos como la concentración de productos, proteínas reguladoras y modificaciones covalentes de la enzima.

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ENZIMAS

Casi todas las enzimas son proteínas, excepto un pequeño grupo de moléculas de
RNA que también son catalíticamente activas. Estas moléculas tienen la facultad de
acelerar notablemente la velocidad de una reacción metabólica. Las enzimas están
involucradas en todos los procesos vitales.

5.1. Actividad catalítica y poder catalítico

El proceso catalítico lo realizan en tres etapas:


- La enzima se une a la sustancia sobre la que debe actuar, el sustrato.
- Se forma el producto
- Se libera el sustrato y la enzima puede volver a catalizar la misma reacción
sobre un sustrato que tenga la misma identidad.

Las enzimas aceleran las reacciones multiplicando su velocidad por un millón de veces
e incluso más. Por ejemplo el dióxido de carbono se transfiere desde los tejidos hasta
la sangre y desde la sangre al aire alveolar gracias a una enzima: la anhidrasa
carbónica que tiene la capacidad de hidratar 106 moléculas de anhídrido carbónico por
segundo.

5.2. Especificidad

Emil Fisher utilizó la metáfora de la llave y la cerradura para describir la relación


enzima-sustrato, en efecto, las enzimas son sumamente específicas, tanto en el
sustrato sobre el que actúan como la reacción que catalizan. Una enzima cataliza una
sola reacción química o un grupo de reacciones estrechamente relacionadas.
5.3. Sitio activo

Es una pequeña parte de la proteína, la cual toma contacto con el sustrato y contiene
los aminoácidos que participan en la producción y ruptura de enlaces. Estos
aminoácidos forman: 1) un sitio para la unión con el sustrato y 2) un sitio catalítico,
responsable de los mecanismos de reacción. Las enzimas no reaccionan con los
sustratos, ni alteran el equilibrio de la reacción

Las condiciones que favorecen la eficiencia catalítica de las enzimas son: el pH, la
temperatura, cofactores, concentración tanto de la enzima como del sustrato,
proximidad estrecha entre el sitio activo y el sustrato, enlace covalente enzima-
sustrato, presencia de grupos funcionales donadores o aceptores, modificaciones en
las ligaduras para una fácil ruptura.

Centro activo
El lugar de unión de un sustrato a una enzima y donde se da la reacción de catálisis se
denomina centro activo. En el centro activo encontramos restos de aminoácidos con
sustituyentes funcionales para la catálisis de un sustrato. Al haber pero muchísimas
variedades de reacciones que pueden ser catalizadas, no hay suficientes
combinaciones de restos de aminoácidos como para ser cada catálisis específica para
una de estas combinaciones, por tanto nuestras células utilizan las llamadas
coenzimas. Las coenzimas acostumbran a ser complejas moléculas orgánicas, que
sufren modificaciones durante la reacción enzimática para ayudar a la modificación
final del sustrato. También pueden servir de donadoras o aceptoras de hidriones (H-) y
electrones, o pueden transferir grupos funcionales. Tras la catálisis la coenzima vuelve
a su estado original. Si la coenzima de queda unida de forma temporal a la enzima es
llamada cosustrato. Si está anclada a la enzima, la llamamos grupo prostético.
Los centros activos de las enzimas pueden ser desnaturalizados, es decir, inactivada
su especificidad de unión por la modificación de las proteínas de unión con el sustrato.
La desnaturalización puede darse por una variación alta de la temperatura o del pH del
ambiente donde se encuentre. A cual de los grupos de la clasificación pertenecen la
enzimas no tiene importancia, ya que todas éstas se relacionan, de una forma
transitoria con sus sustratos. Las enzimas y sus sustratos deben influirse mutuamente,
por lo menos, en tres puntos para que se realice y complete la reacción. Esta
interacción es específica y se realiza en un punto de la estructura proteica que se
denomina el sitio activo o sitio catalítico de la enzima.
5.4. Regulación

La velocidad de catálisis de una enzima es regulada por varios mecanismos:


- Por concentración del producto, (Retroinhibición ó inhibición por
retroalimentación)
- Por proteínas reguladoras.- Estas proteínas pueden estimular o inhibir las
reacciones. Por ejemplo la calmodulina que se inactiva cuando el calcio se une
a ella.
- Modificación covalente.- Por ejemplo introducción de un grupo fosforilo.
- Precursor inactivo.- Algunas enzimas se sintetizan como precursores inactivos
y son activados solamente en el momento y en el lugar apropiados. Por
ejemplo el tripsinógeno se sintetiza en el páncreas, pero se activa recién en el
intestino delgado.

5.5 Clasificación de las enzimas

1. Oxido-reductasas.- A este grupo pertenecen dos subclases: Oxidasas y


Dehidrogenasas. Participan en reacciones de respiración y fermentación en
algunas rutas metabólicas. Catalizan reacciones de óxidorreducción, es decir,
transferencia de hidrógeno o electrones de un sustrato a otro, por ejemplo la
citocromo c oxidasa que actúa en la fosforilación oxidativa en la membrana
interna mitocondrial.

2. Transferasas.- Catalizan reacciones de transferencia de grupos funcionales


(distintos al hidrógeno) de un sustrato (dador) a otro (aceptor), tales como el
carbono, aldehido o cetona, acilo, grupos glicosídicos, nitrogenados, fosfato,
azufre. Un ejemplo de transferasa es la glucoquinasa, enzima que transfiere
un fosfato a la glucosa para formar glucosa-6—fosfato y una molécula de ADP.

3. Hidrolasas.- Actuan normalmente sobre moléculas del protoplasma como el


glicógeno, grasas y proteínas. Catalizan reacciones de hidrólisis de ésteres,
uniones glicosídicas, uniones peptídicas, unión de carbono-nitrógeno,
anhídridos ácidos. La lactasa que hidroliza el disacárido lactosa en dos
monosacáridos: glucosa + galactosa. A este grupo también pertenecen otras
enzimas digestivas como la pepsina, tripsina, quimiotripsina, etc.

4. Liasas.- Catalizan la adición de dobles enlaces al extraer algunos grupos, como


C=C, C=O, C=N. La acetato descarboxilasa cataliza la reacción en la que el
ácido acetacético produce dióxido de carbono + acetona. Algunas liasas
actúan sobre compuestos orgánicos fosforados escindiéndolos.

5. Isomerasas.- Catalizan reacciones de isomerización óptica, geométrica,


funcional, de posición, etc, es decir, interconversión de isómeros. A este grupo
pertenecen las racemasas y epimerasas. La fosfoglucosa isomerasa cataliza
una reacción en la que la glucosa-6-fosfato es convertida a fructosa-6-fosfato.

6. Ligasas.- Catalizan reacciones de formación de enlaces dependientes de la


energía proveniente de la hidrólisis del ATP. La piruvato carboxilasa utiliza al
piruvato + dióxido de carbono + ATP para producir oxaloacetato + ADP +
fósforo inorgánico.
5.6. Cinética enzimática

Para que una reacción enzimática se efectúe, un enzima debe actuar sobre un
sustrato para transformarlo en producto, pero además, suelen participar otras
moléculas que coadyuvan con la reacción enzimática, por ejemplo las vitaminas y
algunos minerales.

Considerando cómo afecta la concentración de los reactivos a la velocidad de la


reacción, estas suelen clasificarse de acuerdo al orden, en reacciones de orden 0,
primer, segundo y tercer orden.

5.6.1. Energía libre de activación

Bajo ciertas condiciones, las moléculas que forman parte de un reactivo alcanzan un
estado activado, “estado de transición”, este consiste en el aumento de la energía
cinética y la disminución de las fuerzas de atracción intermolecular. Cuando esto
ocurre estas moléculas se encuentran predispuestas a romper un enlace y/o a
establecer otro.

Para activar a las moléculas se requiere cierta cantidad de energía que se conoce
como “Energía libre de activación” ∆G‡, y se define como “la cantidad de energía
necesaria para levar todas las moléculas de 1 mol de sustancia a una temperatura
determinada al estado de transición, en la cima de la barrera de activación”.

Este proceso se puede lograr incrementando la temperatura o por la adición de un


catalizador que actúa disminuyendo la energía de activación.

5.6.2. Reacción enzimática

Una reacción enzimática difiere de una reacción química en que la enzima suele
saturarse, esto determina que el orden de la velocidad de la reacción catalizada por
un enzima varíe en relación a la concentración del sustrato, del siguiente modo:

1º La velocidad de la reacción aumenta proporcionalmente con el aumento de la


concentración del sustrato, por tanto, la velocidad de la reacción es de primer orden.

2º Mientras mayor es la cantidad de sustrato, la velocidad de la reacción aumenta pero


ya no proporcionalmente, por tanto, el orden de la reacción es mixto (entre orden 0 y
primer orden)

3º Finalmente la velocidad de reacción vuelve independiente de la concentración del


sustrato y, la reacción es de orden 0
5.6.3. Ecuación de Michaelis – Menten

De acuerdo a estos autores, la reacción ezimática se produce en dos etapas:

1º La enzima se une al sustrato para formar el complejo Enzima-Sustrato E+S


ES

2º El complejo E-S se escinde para dar lugar a la enzima libre y al producto ES


E+P

La ecuación de Michaelis – Menten es la ecuación de velocidad para las reacciones


catalizadas por enzimas que solo actúan sobre un sustrato.

La deducción de la ecuación de Michaelis – Menten considera los diferentes ordenes


de la reacción y utiliza una constante, la constante de Michaelis – Menten, que resulta
de dividir la velocidad máxima entre dos. El resultado de la deducción muestra que la
constante de Michaelis – Menten es igual a la concentración de sustrato cuando la
velocidad inicial de la reacción es la mitad de la velocidad máxima

5.6.4. Ecuación de Lineawaver – Burk

Es una transformación de la ecuación de Michaelis – Menten en la que se toman los


recíprocos de ambos miembros de la ecuación. Con esta modificación se linealiza la
curva de velocidad de una reacción enzimática.

5.6.5. Representación de Eadie – Hofstee

Se la obtiene multiplicando ambos miembros de la ecuación de Lineweaver – Burk por


la velocidad máxima

5.7. Inhibición enzimática

Existen varios tipos de inhibición enzimática, por ejemplo:

- Inhibición competitiva. El inhibidor compite con el sustrato por unirse al sitio


activo del enzima. Al unirse a la enzima forma el complejo enzima – inhibidor.

- Inhibición acompetitiva E inhibidor se une al complejo enzima – sustrato para


formar un complejo inactivo: enzima – sustrato – inhibidor

- Inhibición no competitiva. El inhibidor se une a un centro de la enzima


diferente al centro activo, esta unión hace que el centro activo se deforme
impidiendo el ingreso del sustrato.
Enzima

Estructura de la triosafosfato isomerasa. Conformación en forma de diagrama de


cintas rodeado por el modelo de relleno de espacio de la proteína. Estaproteína es una
eficiente enzima involucrada en el proceso de transformación
de azúcares en energía en las células.

Las enzimas1 son moléculas de naturaleza proteica y estructural


quecatalizan reacciones químicas, siempre que seantermodinámicamente posibles:
una enzima hace que una reacción química que es energéticamente posible
(ver Energía libre de Gibbs), pero que transcurre a una velocidad muy baja, sea
cinéticamente favorable, es decir, transcurra a mayor velocidad que sin la presencia de
la enzima.2 3 En estas reacciones, las enzimas actúan sobre
unasmoléculas denominadas sustratos, las cuales se convierten en moléculas
diferentes denominadas productos. Casi todos los procesos en las células necesitan
enzimas para que ocurran a unas tasas significativas. A las reacciones mediadas por
enzimas se las denomina reacciones enzimáticas.
Debido a que las enzimas son extremadamente selectivas con sussustratos y su
velocidad crece solo con algunas reacciones, el conjunto (set) de enzimas sintetizadas
en una célula determina el tipo de metabolismo que tendrá cada célula. A su vez, esta
síntesis depende de la regulación de la expresión génica.

Como todos los catalizadores, las enzimas funcionan disminuyendo la energía de


activación (ΔG‡) de una reacción, de forma que se acelera sustancialmente la tasa de
reacción. Las enzimas no alteran el balance energético de las reacciones en que
intervienen, ni modifican, por lo tanto, el equilibrio de la reacción, pero consiguen
acelerar el proceso incluso millones de veces. Una reacción que se produce bajo el
control de una enzima, o de un catalizador en general, alcanza el equilibrio mucho más
deprisa que la correspondiente reacción no catalizada.

Al igual que ocurre con otros catalizadores, las enzimas no son consumidas por las
reacciones que catalizan, ni alteran su equilibrio químico. Sin embargo, las enzimas
difieren de otros catalizadores por ser más específicas. Las enzimas catalizan
alrededor de 4 000 reacciones bioquímicas distintas.4 No todos los catalizadores
bioquímicos son proteínas, pues algunas moléculas de ARN son capaces de catalizar
reacciones (como la subunidad 16S de los ribosomas en la que reside la
actividad peptidil transferasa).5 6 También cabe nombrar unas moléculas sintéticas
denominadas enzimas artificialescapaces de catalizar reacciones químicas como las
enzimas clásicas.7

La actividad de las enzimas puede ser afectada por otras moléculas. Los inhibidores
enzimáticos son moléculas que disminuyen o impiden la actividad de las enzimas,
mientras que los activadores son moléculas que incrementan dicha actividad.
Asimismo, gran cantidad de enzimas requieren de cofactores para su actividad.
Muchas drogas o fármacos son moléculas inhibidoras. Igualmente, la actividad es
afectada por la temperatura, el pH, la concentración de la propia enzimay del sustrato,
y otros factores físico-químicos.

Algunas enzimas son usadas comercialmente, por ejemplo, en la síntesis


de antibióticos y productos domésticos de limpieza. Además, son ampliamente
utilizadas en diversos procesos industriales, como son la fabricación de alimentos,
destinción de vaqueros o producción de biocombustibles.

 1 Etimología e historia
 2 Estructuras y mecanismos
o 2.1 Especificidad
 2.1.1 Modelo de la "llave-cerradura"
 2.1.2 Modelo del encaje inducido
o 2.2 Mecanismos
 2.2.1 Estabilización del estado de transición
 2.2.2 Dinámica y función
o 2.3 Modulación alostérica
 3 Cofactores y coenzimas
o 3.1 Cofactores
o 3.2 Coenzimas
 4 Termodinámica
 5 Cinética
 6 Inhibición
 7 Función biológica
 8 Control de la actividad
 9 Implicaciones en enfermedades
 10 Clasificación y nomenclatura de enzimas
 11 Aplicaciones industriales
 12 Véase también
 13 Referencias
 14 Lecturas complementarias
 15 Enlaces externos

Etimología e historia[editar]

Eduard Buchner.

Desde finales del siglo XVIII y principios del siglo XIX, se conocía la digestión de


la carnepor las secreciones del estómago8 y la conversión del almidón en azúcar por
los extractos de plantas y la saliva. Sin embargo, no había sido identificado el
mecanismo subyacente.9aunque la primer enzima fue descubierta por Anselme
Payen y Jean-François Persoz en1833.10

En el siglo XIX, cuando se estaba estudiando la fermentación del azúcar en


el alcohol conlevaduras, Louis Pasteur llegó a la conclusión de que esta fermentación
era catalizada por una fuerza vital contenida en las células de la levadura,
llamadas fermentos, e inicialmente se pensó que solo funcionaban con organismos
vivos. Escribió que "la fermentación del alcohol es un acto relacionado con la vida y la
organización de las células de las levaduras, y no con la muerte y la putrefacción de
las células".11 Por el contrario, otros científicos de la época como Justus von Liebig, se
mantuvieron en la posición que defendía el carácter puramente químico de la reacción
de fermentación.

En 1878 el fisiólogo Wilhelm Kühne (1837-1900) acuñó el término enzima, que viene


delgriego ενζυμον "en levadura", para describir este proceso. La palabra enzima fue
usada después para referirse a sustancias inertes como la pepsina. Por otro lado, la
palabra "fermento" solía referirse a la actividad química producida por organismos
vivientes.

En 1897 Eduard Buchner comenzó a estudiar la capacidad de los extractos de


levadura para fermentar azúcar a pesar de la ausencia de células vivientes de
levadura. En una serie de experimentos en la Universidad Humboldt de Berlín,
encontró que el azúcar era fermentado inclusive cuando no había elementos vivos en
los cultivos de células de levaduras.12 Llamó a la enzima que causa la fermentación de
la sacarosa, “zimasa”.13 En 1907 recibió el Premio Nobel de Química "por sus
investigaciones bioquímicas y el haber descubierto la fermentación libre de células".
Siguiendo el ejemplo de Buchner, las enzimas son usualmente nombradas de acuerdo
a la reacción que producen. Normalmente, el sufijo "-asa" es agregado al nombre del
sustrato (p. ej., la lactasa es la enzima que degrada lactosa) o al tipo de reacción (p.
ej., la ADN polimerasaforma polímeros de ADN).

Tras haber mostrado que las enzimas pueden funcionar fuera de una célula viva, el
próximo paso era determinar su naturaleza bioquímica. En muchos de los trabajos
iniciales se notó que la actividad enzimática estaba asociada conproteínas, pero
algunos científicos (como el premio Nobel Richard Willstätter) argumentaban que las
proteínas eran simplemente el transporte para las verdaderas enzimas y que las
proteínas per se no eran capaces de realizar catálisis. Sin embargo, en 1926, James
B. Sumner demostró que la enzima ureasa era una proteína pura y la cristalizó.
Summer hizo lo mismo con la enzima catalasa en 1937. La conclusión de que las
proteínas puras podían ser enzimas fue definitivamente probada por John Howard
Northrop y Wendell Meredith Stanley, quienes trabajaron con diversas enzimas
digestivas como la pepsina (1930), la tripsina y la quimotripsina. Estos tres científicos
recibieron el Premio Nobel de Química en 1946.14

El descubrimiento de que las enzimas podían ser cristalizadas permitía que sus
estructuras fuesen resueltas mediante técnicas de cristalografía y difracción de rayos
X. Esto se llevó a cabo en primer lugar con la lisozima, una enzima encontrada en
las lágrimas, la saliva y los huevos, capaces de digerir la pared de algunas bacterias.
La estructura fue resuelta por un grupo liderado por David Chilton Phillips y publicada
en 1965.15 Esta estructura de alta resolución de laslisozimas, marcó el comienzo en el
campo de la biología estructural y el esfuerzo por entender cómo las enzimas trabajan
en el orden molecular.

Estructuras y mecanismos[editar]

Diagrama de cintas que representa la estructura de una anhidrasa carbónica de tipo II.


La esfera gris representa al cofactor zinc situado en el centro activo.

Las enzimas son generalmente proteínas globulares que pueden presentar tamaños
muy variables, desde 62 aminoácidos como en el caso del monómero de la 4-
oxalocrotonato tautomerasa,16 hasta los 2 500 presentes en la sintasa de ácidos
grasos.17
Las actividades de las enzimas vienen determinadas por su estructura tridimensional,
la cual viene a su vez determinada por la secuencia de aminoácidos.18 Sin embargo,
aunque la estructura determina la función, predecir una nueva actividad enzimática
basándose únicamente en la estructura de una proteína es muy difícil, y un problema
aún no resuelto.19

Casi todas las enzimas son mucho más grandes que los sustratos sobre los que
actúan, y solo una pequeña parte de la enzima (alrededor de 3 a 4 aminoácidos) está
directamente involucrada en la catálisis.20 La región que contiene estos residuos
encargados de catalizar la reacción es denominada centro activo. Las enzimas
también pueden contener sitios con la capacidad de unir cofactores, necesarios a
veces en el proceso de catálisis, o de unir pequeñas moléculas, como los sustratos o
productos (directos o indirectos) de la reacción catalizada. Estas uniones de la enzima
con sus propios sustratos o productos pueden incrementar o disminuir la actividad
enzimática, dando lugar así a una regulación por retroalimentación positiva o negativa,
según el caso.

Al igual que las demás proteínas, las enzimas se componen de una cadena lineal
de aminoácidos que se pliegan durante el proceso de traducción para dar lugar a
una estructura terciaria tridimensional de la enzima, susceptible de presentar actividad.
Cada secuencia de aminoácidos es única y por tanto da lugar a una estructura única,
con propiedades únicas. En ocasiones, proteínas individuales pueden unirse a otras
proteínas para formar complejos, en lo que se denominaestructura cuaternaria de las
proteínas.

La mayoría de las enzimas, al igual que el resto de las proteínas, pueden ser
desnaturalizadas si se ven sometidas a agentes desnaturalizantes como el calor,
los pHs extremos o ciertos compuestos como el SDS. Estos agentes destruyen la
estructura terciaria de las proteínas de forma reversible o irreversible, dependiendo de
la enzima y de la condición. Una consecuencia de la desnaturalización es la pérdida o
merma de la función, de la capacidad enzimática.
Especificidad[editar]

Las enzimas suelen ser muy específicas tanto del tipo de reacción que catalizan como
del sustrato involucrado en la reacción. La forma, la carga y las
características hidrofílicas/hidrofóbicas de las enzimas y los sustratos son los
responsables de dicha especificidad. Las enzimas también pueden mostrar un elevado
grado de estereoespecificidad,regioselectividad y quimioselectividad.21
Algunas de estas enzimas que muestran una elevada especificidad y precisión en su
actividad son aquellas involucrados en la replicación y expresión del genoma. Estas
enzimas tienen eficientes sistemas de comprobación y corrección de errores, como en
el caso de la ADN polimerasa, que cataliza una reacción de replicación en un primer
paso, para comprobar posteriormente si el producto obtenido es el correcto.22 Este
proceso, que tiene lugar en dos pasos, da como resultado una media de tasa de error
increíblemente baja, en torno a 1 error cada 100 millones de reacciones en
determinadas polimerasas de mamíferos.23 Este tipo de mecanismos de comprobación
también han sido observados en laARN polimerasa,24 en la ARNt aminoacil
sintetasa25 y en la actividad de selección de los aminoacil-tRNAs.26

Aquellas enzimas que producen metabolitos secundarios son denominadas


promiscuas, ya que pueden actuar sobre una gran variedad de sustratos. Por ello, se
ha sugerido que esta amplia especificidad de sustrato podría ser clave en la evolución
y diseño de nuevas rutas biosintéticas.27

Modelo de la "llave-cerradura"[editar]

Las enzimas son muy específicas, como sugirió Emil Fischer en 1894. Con base a sus
resultados dedujo que ambasmoléculas, la enzima y su sustrato, poseen
complementariedad geométrica, es decir, sus estructuras encajan exactamente una en
la otra,28 por lo que este modelo ha sido denominado como modelo de la "llave-
cerradura", refiriéndose a la enzima como a una especie de cerradura y al sustrato
como a una llave que encaja de forma perfecta en dicha cerradura. Una llave solo
funciona en su cerradura y no en otras cerraduras. Sin embargo, si bien este modelo
explica la especificidad de las enzimas, falla al intentar explicar la estabilización
del estado de transición que logran adquirir las enzimas.

Modelo del encaje inducido[editar]

Diagrama que esquematiza el modo de acción del modelo del encaje inducido.
En 1958, Daniel Koshland sugiere una modificación al modelo de la llave-cerradura:
las enzimas son estructuras bastante flexibles y así el sitio activo podría cambiar su
conformación estructural por la interacción con el sustrato.29 Como resultado de ello,
lacadena aminoacídica que compone el sitio activo es moldeada en posiciones
precisas, lo que permite a la enzima llevar a cabo su función catalítica. En algunos
casos, como en las glicosidasas, el sustrato cambia ligeramente de forma para entrar
en el sitio activo.30 El sitio activo continua dicho cambio hasta que el sustrato está
completamente unido, momento en el cual queda determinada la forma y la carga
final.31
Mecanismos[editar]

Las enzimas pueden actuar de diversas formas, como se verá a continuación, siempre
dando lugar a una disminución del valor de ΔG‡:32

 Reducción de la energía de activación mediante la


creación de un ambiente en el cual el estado de
transición es estabilizado (por ejemplo, forzando la
forma de un sustrato: la enzima produce un cambio de
conformación del sustrato unido el cual pasa a un
estado de transición, de modo que ve reducida la
cantidad de energía que precisa para completar la
transición).
 Reduciendo la energía del estado de transición, sin
afectar la forma del sustrato, mediante la creación de
un ambiente con una distribución de carga óptima para
que se genere dicho estado de transición.
 Proporcionando una ruta alternativa. Por ejemplo,
reaccionando temporalmente con el sustrato para
formar un complejo intermedio enzima/sustrato (ES),
que no sería factible en ausencia de enzima.
 Reduciendo la variación de entropía necesaria para
alcanzar el estado de transición (energía de activación)
de lareacción mediante la acción de orientar
correctamente los sustratos, favoreciendo así que se
produzca dicha reacción.
 Incrementando la velocidad de la enzima mediante un
aumento de temperatura. El incremento de temperatura
facilita la acción de la enzima y permite que se
incremente aún más su velocidad de reacción. Sin
embargo, si la temperatura se eleva demasiado, la
conformación estructural de la enzima puede verse
afectada, reduciendo así su velocidad de reacción, y
solo recuperando su actividad óptima cuando la
temperatura se reduce. No obstante, algunas enzimas
son termolábiles y trabajan mejor a bajas temperaturas.

Cabe destacar que este efecto entrópico implica la desestabilización del estado
basal,33 y su contribución a la catálisis es relativamente pequeña.34

Estabilización del estado de transición[editar]

La comprensión del origen de la reducción del valor de ΔG‡ en una reacción


enzimática requiere elucidar previamente cómo las enzimas pueden estabilizar su
estado de transición, más que el estado de transición de la reacción. Aparentemente,
la forma más efectiva para alcanzar la estabilización es la utilización de
fuerzas electrostáticas, concretamente, poseyendo un ambiente polar relativamente
fijado que pueda orientarse hacia la distribución de carga del estado de transición. Ese
tipo de ambientes no existen ni se generan en ausencia de enzimas.35

Dinámica y función[editar]

La dinámica interna de las enzimas está relacionada con sus mecanismos de


catálisis.36 37 38 La dinámica interna se define como el movimiento de diferentes partes
de la estructura de la enzima, desde residuos individuales de aminoácidos, hasta
grupos de aminoácidos o incluso un dominio proteico entero. Estos movimientos se
producen a diferentes escalas de tiempo que van
desde femtosegundos hasta segundos. Casi cualquier residuo de la estructura de la
enzima puede contribuir en el proceso de catálisis por medio de movimientos
dinámicos.39 40 41 42 Los movimientos de las proteínas son vitales en muchas enzimas.
Dichos movimientos podrán ser más o menos importantes según si los cambios
conformacionales se producen por vibraciones pequeñas y rápidas o grandes y lentas,
y dicha importancia dependerá del tipo de reacción que lleve a cabo la enzima. Sin
embargo, aunque estos movimientos son importantes en el proceso de unión y
liberación de sustratos y productos, aún no está claro si estos movimientos ayudan a
acelerar los pasos químicos de las reacciones enzimáticas.43 Estos nuevos avances
también tienen implicaciones en la comprensión de los efectos alostéricos y en el
desarrollo de nuevos fármacos.
Modulación alostérica[editar]

Transición alostérica de una enzima entre los estados R y T, estabilizada por


unagonista (A), un inhibidor (I) y un sustrato (S).

Los sitios alostéricos son zonas de la enzima con capacidad de reconocer y unir


determinadas moléculas en la célula. Las uniones a las que dan lugar son débiles y
no covalentes, y generan un cambio en la conformación estructural de la enzima que
repercute en el sitio activo, afectando así a la velocidad de
reacción.44 Las interacciones alostéricas pueden tanto inhibir como activar enzimas, y
son una forma muy común de controlar las enzimas en las células.45

Cofactores y coenzimas[editar]
Cofactores[editar]

Algunas enzimas no precisan ningún componente adicional para mostrar una total
actividad. Sin embargo, otras enzimas requieren la unión de moléculas no proteicas
denominadas cofactores para poder ejercer su actividad.46 Los cofactores pueden ser
compuestos inorgánicos, como los iones metálicos y los complejos ferrosulfurosos, o
compuestos orgánicos, como la flavina o el grupo hemo. Los cofactores orgánicos
pueden ser a su vez grupos prostéticos, que se unen fuertemente a la enzima,
o coenzimas, que son liberados del sitio activo de la enzima durante la reacción. Las
coenzimas incluyen compuestos como el NADH, el NADPH y el adenosín trifosfato.
Estas moléculas transfieren grupos funcionales entre enzimas.47

Un ejemplo de una enzima que contiene un cofactor es la anhidrasa carbónica, en la


cual el zinc (cofactor) se mantiene unido al sitio activo, tal y como se muestra en la
figura anterior (situada al inicio de la sección "Estructuras y mecanismos").48 Estas
moléculas suelen encontrarse unidas al sitio activo y están implicadas en la catálisis.
Por ejemplo, la flavina y el grupo hemo suelen estar implicados en reacciones redox.

Las enzimas que requieren un cofactor pero no lo tienen unido son


denominadas apoenzimas o apoproteínas. Una apoenzima junto con cofactor(es) es
denominada holoenzima (que es la forma activa). La mayoría de los cofactores no se
unen covalentemente a sus enzimas, pero sí lo hacen fuertemente. Sin embargo, los
grupos prostéticos pueden estar covalentemente unidos, como en el caso de la tiamina
pirofosfato en la enzima piruvato deshidrogenasa. El término "holoenzima" también
puede ser aplicado a aquellas enzimas que contienen múltiples subunidades, como en
el caso de laADN polimerasa, donde la holoenzima es el complejo con todas las
subunidades necesarias para llevar a cabo la actividad enzimática.
Coenzimas[editar]

Modelo tridimensional de esferas de la coenzima NADH.

Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas que transportan grupos químicos
de una enzima a otra.49 Algunos de estos compuestos, como la riboflavina, la tiamina y
el ácido fólicoson vitaminas (las cuales no pueden ser sintetizados en cantidad
suficiente por el cuerpo humano y deben ser incorporados en la dieta). Los grupos
químicos intercambiados incluyen el ion hidruro (H-) transportado por NAD o NADP+, el
grupo fosfato transportado por el ATP, el grupo acetilo transportado por la coenzima A,
los grupos formil, metenil o metil transportados por el ácido fólico y el grupo metil
transportado por la S-Adenosil metionina.

Debido a que las coenzimas sufren una modificación química como consecuencia de
la actividad enzimática, es útil considerar a las coenzimas como una clase especial de
sustratos, o como segundos sustratos, que son comunes a muchas enzimas
diferentes. Por ejemplo, se conocen alrededor de 700 enzimas que utilizan la
coenzima NADH.50

Las coenzimas suelen estar continuamente regenerándose y sus concentraciones


suelen mantenerse a unos niveles fijos en el interior de la célula: por ejemplo, el
NADPH es regenerado a través de la ruta de las pentosas fosfato y la S-Adenosil
metionina por medio de la metionina adenosiltransferasa. Esta regeneración continua
significa que incluso pequeñas cantidades de coenzimas son utilizadas
intensivamente. Por ejemplo, el cuerpo humano gasta su propio peso en ATP cada
día.51
Termodinámica[editar]

Gráfica de las energías de las diferentes fases de una reacción química. Los sustratos
precisan mucha energía para alcanzar el estado de transición, pero una vez
alcanzado, se transforman en productos. La enzima estabiliza el estado de transición,
reduciendo la energía necesaria para formar los productos.

Al igual que sucede con todos los catalizadores, las enzimas no alteran el equilibrio
químico de la reacción. Generalmente, en presencia de una enzima, la reacción
avanza en la misma dirección en la que lo haría en ausencia de enzima, solo que más
rápido. Sin embargo, en ausencia de enzima, podría producirse una reacción
espontánea que generase un producto diferente debido a que en esas condiciones,
dicho producto diferente se forma más rápidamente.

Además, las enzimas pueden acoplar dos o más reacciones, por lo que una reacción
termodinámicamente favorable puede ser utilizada para favorecer otra reacción
termodinámicamente desfavorable. Por ejemplo, la hidrólisis de ATP suele ser utilizada
para favorecer otras reacciones químicas.52

Las enzimas catalizan reacciones químicas tanto en un sentido como en el contrario.


Nunca alteran el equilibrio, sino únicamente la velocidad a la que es alcanzado. Por
ejemplo, la anhidrasa carbónicacataliza su reacción en una u otra dirección
dependiendo de la concentración de los reactantes, como se puede ver a
continuación:

 (en tejidos; alta
concentración de CO2)
 (en pulmones; baja
concentración de CO2)

Si el equilibrio se ve muy desplazado en un sentido


de la reacción, es decir, se convierte en una
reacción muy exergónica, la reacción se hace
efectivamente irreversible. Bajo estas condiciones,
la enzima únicamente catalizará la reacción en la
dirección permitida desde un punto de vista
termodinámico.

Cinética[editar]

Artículo principal: Cinética enzimática

Mecanismo para una reacción catalizada por una


enzima con un único sustrato. La enzima (E) une un
sustrato (S) y genera un producto (P).

La cinética enzimática es el estudio de cómo las


enzimas se unen a sus sustratos y los transforman
en productos. Los datos de equilibrios utilizados en
los estudios cinéticos son obtenidos
mediante ensayos enzimáticos.

En 1902, Victor Henri53 propuso una teoría


cuantitativa sobre la cinética enzimática, pero sus
datos experimentales no fueron muy útiles debido a
que la importancia de la concentración del ion
dehidrógeno aún no era considerada. Después de
que Peter Lauritz Sørensen definiera la escala
logarítmica del pH e introdujera el concepto de
"tampón" (buffer) en 1909,54 el químico
alemán Leonor Michaelis y su postdoctoral
canadiense Maud Leonora Menten repitieron los
experimentos de Henri confirmando su ecuación,
que actualmente es conocida como cinética de
Henri-Michaelis-Menten (o simplemente cinética de
Michaelis-Menten).55 Su trabajo fue desarrollado
más en profundidad por George Edward Briggs y J.
B. S. Haldane, quienes obtuvieron las ecuaciones
cinéticas que se encuentran tan ampliamente
extendidas en la actualidad.56

La mayor contribución de Henri fue la idea de dividir


las reacciones enzimáticas en dos etapas. En la
primera, el sustrato se une reversiblemente a la
enzima, formando el complejo enzima-sustrato
(también denominado complejo Michaelis). En la
segunda, la enzima cataliza la reacción y libera el
producto.

Curva de saturación de una reacción enzimática


donde se muestra la relación entre la
concentración de sustrato y la velocidad de la
reacción.

Las enzimas pueden catalizar hasta varios millones


de reacciones por segundo. Por ejemplo, la
descarboxilación no enzimática de laorotidina 5'-
monofosfato tiene una vida media de 78 millones de
años. Sin embargo, cuando la enzima orotidina 5'-
fosfato descarboxilasaestá presente en el medio,
ese mismo proceso tarda apenas 25
milisegundos.57 Las velocidades de las enzimas
dependen de las condiciones de la solución y de la
concentración de sustrato. Aquellas condiciones
que desnaturalizan una proteína, como
temperaturas elevadas, pHs extremos o altas
concentraciones de sal, dificultan o impiden la
actividad enzimática, mientras que elevadas
concentraciones de sustrato tienden a incrementar
la actividad. Para encontrar la máxima velocidad de
una reacción enzimática, la concentración de
sustrato se incrementa hasta que se obtiene una
tasa constante de formación de producto (véase la
curva de saturación representada en la figura de la
derecha). La saturación ocurre porque, cuando la
concentración de sustrato aumenta, disminuye la
concentración de enzima libre, que se convierte en
la forma con sustrato unido (ES). A la máxima
velocidad (Vmax) de la enzima, todos los sitios
activos de dicha enzima tienen sustrato unido, y la
cantidad de complejos ES es igual a la cantidad
total de enzima. Sin embargo, Vmax es solo una de
las constantes cinéticas de la enzima. La cantidad
de sustrato necesario para obtener una
determinada velocidad de reacción también es
importante. Este parámetro viene dado por
la constante de Michaelis-Menten (Km), que viene a
ser la concentración de sustrato necesaria para que
una enzima alcance la mitad de su velocidad
máxima. Cada enzima tiene un valor
de Km característico para un determinado sustrato,
el cual puede decirnos cómo de afín es la unión
entre el sustrato y la enzima. Otra constante útil
es kcat, que es el número de moléculas de sustrato
procesadas por cada sitio activo por segundo.

La eficiencia de una enzima puede ser expresada


en términos de kcat/Km, en lo que se denomina
constante de especificidad, que incorpora
la constante de velocidad de todas las fases de la
reacción. Debido a que la constante de
especificidad contempla tanto la afinidad como la
capacidad catalítica, es un parámetro muy útil para
comparar diferentes enzimas o la misma enzima
con diferentes sustratos. El valor máximo teórico de
la constante de especificidad es denominado límite
de difusión tiene un valor de 108-109 (M−1 s−1).
Llegados a este punto, cada colisión de la enzima
con su sustrato da lugar a la catálisis, con lo que la
velocidad de formación de producto no se ve
limitada por la velocidad de reacción, sino por la
velocidad de difusión. Las enzimas que poseen
esta propiedad son llamadas enzimas
catalíticamente perfectas o cinéticamente perfectas.
Ejemplos de este tipo de enzimas son la triosa
fosfato isomerasa, la anhidrasa carbónica,
la acetilcolinesterasa, la catalasa, la fumarasa,
la beta-lactamasa y la superóxido dismutasa.

La cinética de Michaelis-Menten depende de la ley


de acción de masas, que se deriva partiendo de los
supuestos dedifusión libre y colisión al azar. Sin
embargo, muchos procesos bioquímicos o celulares
se desvían significativamente de estas condiciones,
a causa de fenómenos como el crowding
macromolecular, la separación de etapas entre
enzima-sustrato-producto, o los movimientos
moleculares uni- o bidimensionales.58 No obstante,
en estas situaciones se puede aplicar una cinética
de Michaelis-Menten fractal.59 60 61 62

Algunas enzimas presentan una cinética más


rápida que la velocidad de difusión, lo que en
principio parecería ser imposible. Se han propuesto
diversos mecanismos para tratar de explicar este
fenómeno. Uno de los modelos propone que
algunas proteínas podrían tener la capacidad de
acelerar la catálisis secuestrando el sustrato y
orientándolo mediante campos eléctricos dipolares.
Otro modelo propone un mecanismo de efecto
túnel cuántico, donde un protón o un electrón
pueden formar un túnel a través de barreras de
activación, aunque existe cierta controversia en
cuanto al efecto túnel que pueda generar un
protón.63 64 El efecto túnel mediado por protones ha
sido observado en triptamina.65 Esto sugiere que la
catálisis enzimática podría ser definida más
exactamente como una "barrera", en lugar de como
hace el modelo tradicional, donde el sustrato
requiere a la enzima para alcanzar una barrera
energética más baja.

Inhibición[editar]

Artículo principal: Inhibidor enzimático

Los inhibidores competitivos se unen


reversiblemente al enzima, evitando la unión del
sustrato. Por otro lado, la unión del sustrato
evita la unión del inhibidor. Así pues, sustrato e
inhibidor compiten por la enzima.
Tipos de inhibición según la clasificación
introducida por W. W. Cleland.66

Los inhibidores son moléculas que regulan la


actividad enzimática, inhibiendo su actividad. A
grandes rasgos, pueden clasificarse
en reversibles e irreversibles. Las irreversibles se
unen covalentemente a la enzima sin posibilidad de
revertir la modificación, siendo útiles
enfarmacología. Algunos de los fármacos que
actúan de este modo son la eflornitina, utilizada
para tratar latripanosomiasis
africana,67 la penicilina y la aspirina.
Las reversibles se unen de forma reversible a la
enzima, pudiendo clasificarse a su vez, según la
forma en que intervienen en la reacción,
en competitivas,acompetitivas y mixtas.
Habitualmente, por su amplia presencia en multitud
de procesos, se habla también de inhibición no
competitiva, que en realidad no es más que una
variante de la ya mencionada inhibición mixta. Sin
embargo, por sus características se suele presentar
como opuesta a la competitiva, con la que es
comparada frecuentemente.

 En la inhibición competitiva, el sustrato y el


inhibidor no se pueden unir a la misma enzima
al mismo tiempo, como se muestra en la figura
de la derecha.68 Esto generalmente ocurre
cuando el inhibidor tiene afinidad por el sitio
activo de una enzima en el cual también se une
el sustrato; el sustrato y el
inhibidor compiten para el acceso al sitio activo
de la enzima. Por ejemplo, elmetotrexato es un
inhibidor competitivo de la enzima dihidrofolato
reductasa, que cataliza la reducción de
dihidrofolato a tetrahidrofolato. La similitud entre
las estructuras del ácido fólico y el metotrexato
permite que se establezca una inhibición de tipo
competitivo. Este tipo de inhibición se puede
superar con concentraciones suficientemente
altas del sustrato, es decir, dejando fuera de
competición al inhibidor. En la inhibición
competitiva la velocidad máxima de la reacción
no varía, pero se necesitan concentraciones
más elevadas de sustrato para alcanzar una
determinada velocidad, incrementándose así la
Kmaparente.
 En la inhibición acompetitiva el inhibidor no
puede unirse a la enzima libre, sino únicamente
al complejo enzima-sustrato (ES). Una vez
formado el complejo con el inhibidor (EIS) la
enzima queda inactiva. Este tipo de inhibición
es poco común, pero puede darse en enzimas
multiméticas.
 La inhibición no competitiva es una forma de
inhibición mixta donde la unión del inhibidor con
la enzima reduce su actividad pero no afecta la
unión con el sustrato. Como resultado, el grado
de inhibición depende solamente de la
concentración de inhibidor, independientemente
de la concentración de sustrato, con lo que
varía el valor de la Vmax aparente. Sin embargo,
como el sustrato aún puede unirse a la enzima,
el valor de Km no varía.
 En la inhibición mixta, el inhibidor se puede
unir a la enzima al mismo tiempo que el
sustrato. Sin embargo, la unión del inhibidor
afecta la unión del sustrato, y viceversa. Este
tipo de inhibición se puede reducir, pero no
superar al aumentar las concentraciones del
sustrato. Aunque es posible que los inhibidores
de tipo mixto se unan en el sitio activo, este tipo
de inhibición resulta generalmente de un efecto
alostérico donde el inhibidor se une a otro sitio
que no es el sitio activo de la enzima. La unión
del inhibidor con el sitio alostérico cambia la
conformación (es decir, laestructura terciaria)
de la enzima de modo que la afinidad del
sustrato por el sitio activo se reduce.

La coenzima ácido fólico (izquierda) y el
fármaco anti-cancerígenometotrexato (derecha)
son muy similares en estructura. Como
resultado, el metotrexato es un inhibidor
competitivo de muchas enzimas que utilizan
folato.

En muchos organismos, los inhibidores pueden


actuar como parte de un mecanismo de
realimentación. Si una enzima produce una
sustancia en demasiada cantidad en el organismo,
esta misma sustancia podría actuar como un
inhibidor de la enzima al inicio de la ruta que lo
produce, deteniendo así dicha producción cuando
haya una cantidad suficiente de la sustancia en
cuestión. Este sería una forma de realimentación
negativa. Las enzimas que se encuentran sujetas a
este tipo de regulación suelen ser multiméricas y
poseer sitios alostéricos donde se unen sustancias
reguladoras. Las gráficas que representan la
velocidad de la reacción frente a la concentración
de sustrato de estas enzimas no son hipérboles,
sino sigmoidales (forma de S).

Usos de los inhibidores

Debido a que los inhibidores modulan la función de


las enzimas, suelen ser utilizados como fármacos.
Un típico ejemplo de un inhibidor que es utilizado
como fármaco es la aspirina, la cual inhibe las
enzimas COX-1 y COX-2 implicadas en la síntesis
de un intermediario inflamatorio,
las prostaglandinas, con lo que suprime así los
efectos derivados, el dolor y lainflamación. Sin
embargo, otros inhibidores enzimáticos actúan
como venenos. Por ejemplo, el cianuro es un
inhibidor irreversible que se une a los átomos
de hierro y cobre en el sitio activo de la citocromo c
oxidasa de células animales (lasplantas son
resistentes al cianuro), bloqueando así
la respiración celular.69
Función biológica[editar]

Las enzimas presentan una amplia variedad de


funciones en los organismos vivos. Son
indispensables en la transducción de señales y en
procesos de regulación, normalmente por medio
de quinasas y fosfatasas.70 También son capaces
de producir movimiento, como es el caso de
la miosina al hidrolizar ATP para generar
la contracción muscular o el movimiento de
vesículas por medio del citoesqueleto.71 Otro tipo
de ATPasas en la membrana celular son
las bombas de ionesimplicadas en procesos
de transporte activo. Además, las enzimas también
están implicadas en funciones mucho más exóticas,
como la producción de luz por la luciferasa en
las luciérnagas.72 Los virus también pueden
contener enzimas implicadas en la infección celular,
como es el caso de la integrasa del virus HIV y de
la transcriptasa inversa, o en la liberación viral,
como la neuraminidasa del virus de la gripe.

Una importante función de las enzimas es la que


presentan en el sistema digestivo de los animales.
Enzimas tales como las amilasas y
las proteasas son capaces de degradar moléculas
grandes (almidón o proteínas, respectivamente) en
otras más pequeñas, de forma que puedan ser
absorbidas en el intestino. Las moléculas de
almidón, por ejemplo, que son demasiado grandes
para ser absorbidas, son degradadas por diversas
enzimas a moléculas más pequeñas como
lamaltosa, y finalmente a glucosa, la cual sí puede
ser absorbida a través de las células del intestino.
Diferentes enzimas digestivas son capaces de
degradar diferentes tipos de alimentos.
Los rumiantes que tienen una dieta herbívora,
poseen en sus intestinos una serie de
microorganismos que producen otra enzima,
la celulasa, capaz de degradar la celulosapresente
en la pared celular de las plantas.73

Varias enzimas pueden actuar conjuntamente en un


orden específico, creando así una ruta metabólica.
En una ruta metabólica, una enzima toma como
sustrato el producto de otra enzima. Tras la
reacción catalítica, el producto se transfiere a la
siguiente enzima y así sucesivamente. En
ocasiones, existe más de una enzima capaz de
catalizar la misma reacción en paralelo, lo que
permite establecer una regulación más sofisticada:
por ejemplo, en el caso en que una enzima
presenta una actividad constitutiva pero con una
baja constante de actividad y una segunda enzima
cuya actividad es inducible, pero presenta una
mayor constante de actividad.

Las enzimas determinan los pasos que siguen


estas rutas metabólicas. Sin las enzimas, el
metabolismo no se produciría a través de los
mismos pasos, ni sería lo suficientemente rápido
para atender las necesidades de la célula. De
hecho, una ruta metabólica como la glucólisis no
podría existir sin enzimas. La glucosa, por ejemplo,
puede reaccionar directamente con el ATP de
forma que quede fosforilada en uno o más
carbonos. En ausencia de enzimas, esta reacción
se produciría tan lentamente que sería
insignificante. Sin embargo, si se añade la
enzima hexoquinasa que fosforila el carbono 6 de la
glucosa y se mide la concentración de la mezcla en
un breve espacio de tiempo se podrá encontrar
únicamente glucosa-6-fosfato a niveles
significativos. Por tanto, las redes de rutas
metabólicas dentro de la célula dependen del
conjunto de enzimas funcionales que presenten.

Control de la actividad[editar]

La actividad enzimática puede ser controlada en la


célula principalmente de estas cinco formas:

 Producción de la enzima (a nivel de


la transcripción o la traducción): la síntesis de
una enzima puede ser favorecida o
desfavorecida en respuesta a determinados
estímulos recibidos por la célula. Esta forma de
regulación génica se denomina inducción e
inhibición enzimática. Por ejemplo,
las bacterias podrían adquirir resistencia a
antibióticos como la penicilina gracias a la
inducción de unas enzimas llamadas beta-
lactamasas, que hidrolizan el anillo beta-
lactámicode la molécula de penicilina. Otro
ejemplo, son las enzimas presentes en
el hígado denominadas citocromo
P450oxidasas, las cuales son de vital
importancia en el metabolismo de drogas y
fármacos. La inducción o inhibición de estas
enzimas puede dar lugar a la aparición
de interacciones farmacológicas.
 Compartimentalización de la enzima: las
enzimas pueden localizarse en diferentes
compartimentos celulares, de modo que puedan
tener lugar diferentes rutas metabólicas de
forma independiente. Por ejemplo, los ácidos
grasos son sintetizados por un conjunto de
enzimas localizadas en el citosol, en el retículo
endoplasmático y en el aparato de Golgi, y
posteriormente, dichos ácidos grasos son
utilizados por otro conjunto de enzimas
diferentes como fuente energética en
la mitocondria, a través de la β-oxidación.74
 Inhibidores y activadores enzimáticos: las
enzimas pueden ser activadas o inhibidas por
ciertas moléculas. Por ejemplo, el producto final
de una ruta metabólica suele actuar como
inhibidor de alguna de las enzimas implicadas
en las primeras reacciones de la ruta,
estableciendo así una realimentación
negativa que regula la cantidad de producto
final obtenido por esa ruta. Este mecanismo de
realimentación negativa permite ajustar
efectivamente la velocidad de síntesis de los
metabolitos intermedios con la demanda de la
célula, y permite distribuir económicamente
materiales y energía para evitar exceso o
escasez de los productos finales. Este control
enzimático permite mantener un ambiente
relativamente estable en el interior de los
organismos vivos.
 Modificación postraduccional de enzimas:
las enzimas pueden sufrir diversas
modificaciones postraduccionales como
la fosforilación, la miristoilación y
la glicosilación. Por ejemplo, en la respuesta
a insulina, se produce la fosforilación de
multitud de enzimas, como la de la glucógeno
sintasa, que ayuda en el control de la síntesis o
degradación del glucógeno y permite a la célula
responder a las variaciones de los niveles
de azúcar en sangre.75 Otro ejemplo de
modificación postraduccional es la degradación
de la cadena polipeptídica. La quimiotripsina,
una proteasadigestiva, es sintetizada en una
forma inactiva, quimiotripsinógeno, en
el páncreas y transportada en este estado hasta
el estómago, donde será activada. De este
modo se evita que la enzima digiera el
páncreas y los demás tejidos por los que pasa
antes de llegar al estómago. Este tipo de
precursor inactivo de una enzima es
denominado zimógeno.
 Activación dependiente del ambiente:
algunas enzimas pueden ser activadas cuando
pasan de un ambiente con unas condiciones a
otro con condiciones diferentes, como puede
ser el paso del ambiente reductor
del citoplasma al ambiente oxidativo
del periplasma, el paso de un ambiente con
elevado pH a otro con bajo pH, etc. Por
ejemplo, lahemaglutinina del virus de la gripe es
activada mediante un cambio conformacional
que se produce cuando el pH del medio es
suficientemente ácido, lo cual ocurre cuando el
virus entra en el interior de la célula a través de
unlisosoma.76

Implicaciones en enfermedades[editar]

Estructura tridimensional de la
enzima fenilalanina hidroxilasa(PDB 1KW0 ).

Debido a que es necesario un fuerte control de la


actividad enzimática para lahomeostasis, cualquier
fallo en el funcionamiento (mutación, incremento o
reducción de la expresión o deleción) de una única
enzima crítica puede conducir al desarrollo de
una enfermedad genética. La importancia de las
enzimas se pone de manifiesto en el hecho de que
una enfermedad letal puede ser causada por el mal
funcionamiento de un único tipo de enzima de todos
los miles de tipos que existen en nuestro cuerpo.

Un ejemplo de esto es el tipo más común


de fenilcetonuria. En esta enfermedad genética se
produce una mutación de un único aminoácido en
la fenilalanina hidroxilasa, una enzima que cataliza
la primera reacción de la ruta de degradación de
la fenilalanina y de compuestos relacionados. Al ser
esta enzima inactiva, se acumulan una serie de
productos que terminan dando lugar a la aparición
de retardo mental si no se recibe tratamiento.77

Otro ejemplo es cuando se produce una mutación


en los genes de la línea germinal que codifican las
enzimas implicadas en la reparación del ADN. En
este caso, al no repararse adecuadamente el ADN
de las células, se acumulan mutaciones que suelen
derivar en el desarrollo de diversos tipos de cáncer
hereditarios, como laxerodermia pigmentosa.

Clasificación y nomenclatura de enzimas[editar]

El nombre de una enzima suele derivarse del


sustrato o de la reacción química que cataliza, con
la palabra terminada en -asa. Por
ejemplo, lactasa proviene de su
sustrato lactosa; alcohol deshidrogenasa proviene
de la reacción que cataliza que consiste en
"deshidrogenar" el alcohol; ADN
polimerasa proviene también de la reacción que
cataliza que consiste en polimerizar el ADN.

La Unión Internacional de Bioquímica y Biología


Molecular ha desarrollado una nomenclatura para
identificar a las enzimas basada en los
denominados Números EC. De este modo, cada
enzima queda registrada por una secuencia de
cuatro números precedidos por las letras "EC". El
primer número clasifica a la enzima según su
mecanismo de acción. A continuación se indican las
seis grandes clases de enzimas existentes en la
actualidad:

 EC1 Oxidorreductasas: catalizan reacciones


de oxidorreducción o redox. Precisan la
colaboración de las coenzimasde
oxidorreducción (NAD+, NADP+, FAD) que
aceptan o ceden
los electrones correspondientes. Tras la acción
catalítica, estas coenzimas quedan modificadas
en su grado de oxidación, por lo que deben ser
recicladas antes de volver a efectuar una nueva
reacción
catalítica. Ejemplos: deshidrogenasas, peroxida
sas.
 EC2 Transferasas: transfieren grupos
activos (obtenidos de la ruptura de ciertas
moléculas) a otras sustancias receptoras.
Suelen actuar en procesos de interconversión
de monosacáridos, aminoácidos,
etc. Ejemplos:transaminasas, quinasas.
 EC3 Hidrolasas: catalizan reacciones
de hidrólisis con la consiguiente obtención
de monómeros a partir de polímeros. Actúan en
la digestión de los alimentos, previamente a
otras fases de su degradación. La
palabra hidrólisis se deriva dehidro → 'agua'
y lisis →
'disolución'. Ejemplos: glucosidasas, lipasas, est
erasas.
 EC4 Liasas: catalizan reacciones en las que se
eliminan grupos H2O, CO2 y NH3 para formar un
doble enlace o añadirse a un doble
enlace. Ejemplos: descarboxilasas, liasas.
 EC5 Isomerasas: actúan sobre determinadas
moléculas obteniendo o cambiando de ellas
sus isómeros funcionales o de posición, es
decir, catalizan la racemización y cambios de
posición de un grupo en determinada molécula
obteniendo formas isoméricas. Suelen actuar
en procesos de
interconversión. Ejemplo: epimerasas (mutasa).
 EC6 Ligasas: catalizan la degradación o
síntesis de los enlaces denominados "fuertes"
mediante el acoplamiento a moléculas de alto
valor energético como
el ATP. Ejemplos: sintetasas, carboxilasas.

Aplicaciones industriales[editar]

Las enzimas son utilizadas en la industria química,


y en otros tipos de industria, en donde se requiere
el uso de catalizadores muy especializados. Sin
embargo, las enzimas están limitadas tanto por el
número de reacciones que pueden llevar a cabo
como por su ausencia de estabilidad en solventes
orgánicos y altas temperaturas. Por ello,
laingeniería de proteínas se ha convertido en un
área de investigación muy activa donde se intentan
crear enzimas con propiedades nuevas, bien
mediante diseño racional, bien mediante
evolución in vitro.78 79 Estos esfuerzos han
comenzado a tener algunos éxitos, obteniéndose
algunas enzimas que catalizan reacciones no
existentes en la naturaleza.80

A continuación se muestra una tabla con diversas


aplicaciones industriales de las enzimas:

Aplicación Enzimas utilizadas Usos


Producción de azúcares desde
elalmidón, como por ejemplo
en la producción de jarabe de
maíz.81 En la cocción al horno,
Procesado de
cataliza la rotura del almidón
alimentos Amilasas de hongos y pl
de la harina en azúcar.
antas.
Lafermentación del azúcar
llevada a cabo
por levaduras produce
el dióxido de carbono que
La amilasa cataliza
la degradación del hace "subir" la masa.
almidón en
azúcares sencillos.
Los fabricantes de galletas las
utilizan para reducir la
Proteasas
cantidad de proteínas en la
harina.

Alimentos para Para pre-digerir el alimento


Tripsina
bebés dirigido abebés.

Elaboración de Las enzimas liberadas


cerveza degradan el almidón y las
Las enzimas de la
proteínas para generar
cebada son liberadas
azúcares
durante la fase de
sencillos, aminoácidos y
molido en la elaboración
péptidos que son usados por
de la cerveza.
las levaduras en el proceso de
fermentación.

Cebada germinada
utilizada para la
Enzimas de cebada Ampliamente usadas en la
elaboración de
malta. producidas a nivel elaboración de cerveza para
industrial sustituir las enzimas naturales
de la cebada.

Amilasa, glucanasa y Digieren polisacáridos y


proteasas proteínas en lamalta.

Betaglucanasas y Mejoran la filtración del mosto


arabinoxilanasas y la cerveza.

Producción de cerveza baja en


Amiloglucosidasas y
calorías y ajuste de la
pululanasas
capacidad de fermentación.

Eliminan la turbidez producida


Proteasas durante el almacenamiento de
la cerveza.

Incrementa la eficiencia de la
Acetolactatodecarboxila fermentación mediante la
sa (ALDC) reducción de la formación
de diacetilo.82

Zumos de frutas Celulasas, pectinasas Aclarado de zumos de frutos.

Industria láctea Renina, derivado del


estómago de
Producción de queso, usada
animales rumiantes jóve
para hidrolizar proteínas.
nes (como terneros y
ovejas).

Enzimas producidas por Actualmente, cada vez más


bacterias usadas en la industria láctea.

Se introduce durante el
proceso de producción
Lipasas
del queso Roquefort para
favorecer la maduración.
Queso de Roquefort.

Rotura de
Lactasas la lactosa en glucosa ygalacto
sa.

Digestión de Ablandamiento de la carne


Papaína
carne utilizada para cocinar.

Amilasas, Conversión
Industria del amiloglucosidasas y del almidón en glucosa y
almidón glucoamilasas diversos azúcares invertidos.

Conversión
de glucosa en fructosadurante
la producción de jarabe de

Glucosa. maíz partiendo de sustancias


ricas en almidón. Estos
Glucosa isomerasa
jarabes potencian las
propiedades edulcorantes y
reducen las calorías mejor que
Fructosa. la sacarosa y manteniendo el
mismo nivel de dulzor.

Industria del Amilasas, xilanasas, cel Degradación del almidón para


reducir su viscosidad,
añadiendo apresto. Las
papel
xilanasas reducen el
blanqueador necesario para la
decoloración; las celulasas
alisan las fibras, favorecen el
ulasas yligninasas
drenaje de agua y promueven
la eliminación de tintas; las
Una fábrica de lipasas reducen la oscuridad y
papel enCarolina las ligninasas eliminan la
del Sur.
lignina para ablandar el papel.

Industria del Utilizadas para degradar


biofuel Celulasas la celulosa en azúcares que
puedan ser fermentados.

Utilizada para eliminar


Ligninasas
residuos delignina.
Celulosa en 3D.

Detergentes Utilizadas para ayudar en la


biológicos Principalmente proteasa eliminación de tintes proteicos
s, producidas de forma de la ropa en las condiciones
extracelular de prelavado y en las
por bacterias. aplicaciones directas de
detergente líquido.

Detergentes de lavadoras para


Amilasas eliminar residuos resistentes
de almidón.

Lipasas Utilizadas para facilitar la


eliminación de tintes grasos y
oleosos.

Utilizadas
Celulasas
en suavizantes biológicos.

Para eliminar restos proteicos


Limpiadores de
Proteasas de laslentes de contacto y así
lentes de contacto
prevenir infecciones.

Para generar oxígeno desde
Industria del hule Catalasa elperóxido, y así convertir
el látex en huleespumoso.

Disolver la gelatina de
las películas
Industria fotográficas usadas,
Proteasa (ficina)
fotográfica permitiendo así la
recuperación de su contenido
en plata.

Biología
Utilizadas para manipular
molecular
el ADNmediante ingeniería
genética. De gran importancia
Enzimas de
en farmacología,agricultura, m
restricción, ADN
edicina y criminalística.
ligasa ypolimerasas
Esenciales para digestión de
restricción y para la reacción
ADN de doble
en cadena de la polimerasa.
hélice.

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