CAPÍTULO 36

Síntesis,
procesamiento y
modificación de RNA
 Importancia biomedica
En células eucariotas,
producir RNA no es un
proceso simple.
ARN polimerasa depende del ADN , lo usa como
MOLDE para el FACTOR DE TRANSCRIPCION

-INICIACION
-ELONGACION
-TERMINACION

Secuencias
reguladoras
(contra como,
cuando y donde)
 ARN
codificante
ARN DIVIDE
EN DOS ARN no
codificante
ARN no ARN
codificante codificante
ARNr grande
ARNt
ARNt no codificante
ARNr
ARNSN de trasnferencia
no codificante
ARNm
ARN largo no codificante
Cadena plantilla es la cadena que se lee
Se lee 3′ 5′
A partir de ella se sintetiza el RNA 5′ 3′
La RNA polimerasa reconoce el promotor
En procariotas: la holoenzima Eσ
reconoce las secuencias −35 y −10.
En eucariotas: la RNA polimerasa II es
reclutada al promotor con factores
de transcripción.
Formación del complejo promotor abierto
La polimerasa separa las dos cadenas de DNA.
Queda expuesta la cadena plantilla.
 10–20 nucleótidos:

La RNA polimerasa incorpora el primer ribonucleótido Agrega nucleótidos al extremo 3′-OH.

(generalmente una purina). El RNA se sintetiza en dirección 5′ 3′.
Se forma el dinucleótido inicial
 Adición temprana del cap 5′ (solo eucariotas, Pol II)
Se añade 7-metilguanosina trifosfato al extremo 5′
del RNA naciente.
Ocurre mientras aún se está transcribiendo.

(Permite el procesamiento del pre-mRNA).

Terminación de la transcripción
La RNA polimerasa encuentra la secuencia de terminació[Link]
libera:
El RNA completo
El DNA
La RNA polimerasa

Reconocimiento del promotor complejo cerrado complejo abierto inicio liberación del
promotor elongación cap 5′ terminación.
Síntesis de RNA Proceso cíclico
La transcripción
bacteriana es un proceso
cíclico con múltiples
etapas.
La enzima principal es la
holoenzima RNA
polimerasa.
El ciclo inicia cuando
RNA polimeraza localiza y
se une a un promotor (P).
Glosario
TSS: sitio donde inicia la transcripción (+1).
RNAP: RNA polimerasa, enzima que sintetiza RNA desde DNA.
P (promotor): región de DNA donde se une la RNAP para iniciar.
σ (sigma): factor bacteriano que guía a la RNAP al promotor.
rut: sitio del RNA donde se une ρ para terminar transcripción.
ρ (rho): proteína que provoca terminación dependiente de rho.
TFIID: primer factor eucariota que reconoce el promotor (Pol II).
TBP: subunidad de TFIID que se une a la caja TATA.
PIC: complejo de preiniciación (RNAP + factores).
Caja TATA / −10: secuencia A/T que facilita apertura del DNA.
Región −35: elemento promotor bacteriano clave para unión inicial.
Reconocimiento de promotores
por la RNA polimerasa
¿Cómo encuentra la RNAP el sitio correcto de inicio?

Los estudios bioquímicos y genéticos han identificado secuencias

clave en el DNA que controlan el inicio y terminación de la
transcripción.
A partir de muchos genes bacterianos se han construido secuencias
consenso (modelos comunes de promotores).

E. coli: ~4,000 promotores en 4.2 × 10⁶ bp

Humanos: hasta 150,000 sitios de inicio en 3 × 10⁹ bp
 Mecanismo de búsqueda
RNAP se une Escanea Reconoce
débilmente al rápidamente (~10³ promotores
DNA bp/s) específicos

RNAP DNA

Inicia transcripción
Se une con alta
afinidad
Regulación de la transcripción
La finalidad y frecuencia de la transcripción dependen de proteínas
reguladoras unidas al DNA.
Estas proteínas pueden ser:
Activadores estimulan transcripción
Represores inhiben transcripción
Modulan la capacidad de la RNAP para formar el complejo de
iniciación (PIC).

PIC
Promotores bacterianos:
estructura básica
Las promotoras bacterianas son simples (~40 bp).
Contienen dos elementos conservados:
Región −35:
Consenso: 5′-TGTTGACA-3′
Región −10 (caja TATA):
Consenso: 5′-TATAAT-3′

Rica en A/T facilita apertura del DNA

Complejo cerrado apertura complejo abierto.
Factores σ y regulación
coordinada
Diferentes genes pueden
regularse en conjunto porque
comparten promotores similares.

Esto ocurre gracias a distintos

factores σ, que dirigen a la RNAP
hacia grupos específicos de
genes.

Eσ1, Eσ2… reconocen distintos promotores.

Terminación de la
transcripción en bacterias
Existen 2 mecanismos principales:
Terminación intrínseca
Horquilla en RNA + secuencia poliA
RNAP se detiene y se libera el RNA
Terminación dependiente de rho (ρ)
ρ se une al sitio rut en el RNA
Se desplaza 5′ 3′ y disocia el complejo
Transicíón Eucariotas vs bacterias
En bacterias la transcripción es relativamente directa.
En eucariotas, la regulación es más compleja porque:
El DNA está empaquetado en cromatina
Se requieren muchos factores adicionales
Hay múltiples RNA polimerasas
 TFIID y TBP: inicio eucariota
TFIID es el primer factor que reconoce el promotor.
Contiene:
TBP (TATA-binding protein)
TAFs (factores asociados)
TBP se une a la caja TATA y curva el DNA facilita ensamblaje del
PIC.

En bacterias, el control depende principalmente de promotores, σ y

terminación simple.
En eucariotas, iniciar transcripción requiere una maquinaria
multiproteica compleja, con Pol II y factores generales.
El inicio eucariota es un proceso altamente regulado y estructurado.
 LA MAQUINARIA DE
TRANSCRIPCIÓN EUCARIOTA ES
COMPLEJA
RNA Polimerasa I: Se encarga de fabricar el rRNA (el ARN de los
ribosomas, las fábricas de proteínas).

RNA Polimerasa II: Es la más famosa porque fabrica el mRNA (el ARN
mensajero que lleva las instrucciones de los genes para hacer
proteínas).

RNA Polimerasa III: Fabrica los ARN pequeños, como el tRNA (el que
transporta los aminoácidos).
Todas las RNA polimerasas eucariotas requieren (factores de transcripción) para
catalizar la transcripción específica.

La RNA polimerasa II: seis GTF: TFIIA, TFIIB, TFIID (o TBP), TFIIE, TFIIF y TFIIH

Las RNA polimerasas I y III requieren su propio conjunto único de GTF

específicos de polimerasa.

la maquinaria de transcripción interactúan con otro conjunto de proteínas,

coactivadoras o correguladoras.
Formación del complejo de
transcripción Pol II
sintetizar genes

Bacterias: la polimerasa tiene un asistente factor sigma.

Eucariotas: requiere tanto RNA Pol II y los seis GTF (TFIIA,

TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH).
A MENUDO, LOS NUCLEOSOMAS MODULAN LA ACCESIBILIDAD DEL
PROMOTOR Y, POR TANTO, LA FORMACIÓN DEL PIC
La maquinaria de transcripción no puede acceder a las secuencias del
promotor

Factores correguladores modificadores y remodeladores de la

cromatina, como Swi/Snf, SRC1, p300/CBP, P/CAF es posible
eliminar los nucleosomas represores.

los GTF y la RNA polimerasa II pueden unirse e iniciar la

transcripción del gen del mRNA.
 LA FOSFORILACION ACTIVA LA POL II

La Pol II tiene una estructura única que no tienen las bacterias: el

Dominio C-terminal (CTD) formada por la repetición de 7
aminoácidos (Tirosina, Serina, Prolina, Treonina, Serina, Prolina,
Serina).
En el extremo carboxilo de la subunidad Pol II más grande, el
llamado dominio C- terminal
 La Fosforilación

Permite la union

Coolabora

La polimerización de Pol II
Se activa cuando se fosforila en los residuos Ser y Tre
se reduce cuando se desfosforila el CTD.

La fosforilación/desfosforilación del CTD

eliminación, elongación, terminación e incluso el procesamiento
adecuado del mRNA del promotor
 EL PAPEL DE LOS ACTIVADORES Y CORREGULADORES DE LA
TRANSCRIPCIÓN

TFIID
maximiza la transcripcion

hay tres clases de factores de transcripción que intervienen en la

regulación de los genes Pol II: Pol II y GTF, correguladores y proteínas
activadoras o represoras de la unión al DNA
Dos modelos pueden explicar el ensamblaje del complejo de
preiniciación Pol II

1. Modelo de Ensamblaje Gradual (Paso a paso)

se lleva a cabo en una plantilla de DNA donde todas las proteínas de

transcripción tienen fácil acceso al DNA

funcionan estimulando la formación del PIC.

los complejos TAF o mediadores se ven como factores puente que se

comunican entre los activadores unidos corriente arriba y los GTF y Pol II
2. Modelo de la Holoenzima

los activadores no son del todo esenciales en sí mismos

para la formación del PIC

no hay más requisitos para el dominio

de activación del activador
 LAS MOLÉCULAS DE RNA SON PROCESADAS DE
MANERA EXTENSA ANTES DE SER FUNCIONALES

1. organismos procariotas:

las transcripciones primarias de los genes que codifican el mRNA

comienzan a servir como plantillas de traducción incluso antes
de que se complete su transcripción.
2. organismos eucariotes:

El procesamiento principal se produce dentro del núcleo

complejo denominado exportación de la transcripción

Aumenta muchas veces tanto la fidelidad como la velocidad de

procesamiento y movimiento del mRNA al citoplasma para su traducción.
Las porciones de codificación (exones) de la mayoría de los genes
que codifican el mRNA eucariota son interrumpidas por intrones

Exones (Secuencias Intrones (Secuencias

Codificantes): Intermedias):
Son las regiones que sí Son regiones de ADN que no
contienen la información se traducen a proteínas.
para fabricar proteínas. Se encuentran
Permanecen en el mRNA "interrumpiendo" a los
maduro. exones.
Tamaño promedio: 150 Son mucho más grandes y
nucleótidos. variados (desde 10 hasta
más de 1 millón de
nucleótidos)
Secuencias de consenso en el empalme

El empalme elimina
intrones y une exones en
el pre-ARNm.
Requiere tres regiones
clave:
Sitio 5′ (donante)
Sitio 3′ (aceptor)
Sitio de ramificación
 Proceso de Maduración (Splicing):

1. Se transcribe todo el gen (pre-

mRNA).
2. Los intrones se cortan y
eliminan en el núcleo.
3. Los exones se unen entre sí
para formar el mRNA final.
4. El mRNA maduro viaja al
citoplasma para ser traducido.
 Empalme alternativo y regulación del mRNA
El empalme alternativo permite producir diferentes mRNA y proteínas a partir de un solo
transcrito primario, aumentando enormemente la diversidad funcional del genoma.

REGULADO POR:
Tejidos
Señales del desarrollo
Marcas epigenéticas de la cromatina

Esta última influye en la forma en que se

acoplan la transcripción y procesamiento del
mRNA.
 SURGE GRACIAS A:
Inclusión o exclusión selectiva de exones.
Uso alternativo de sitios donadores 5′ o
aceptores 3′.
Uso de sitios de poliadenilación diferentes.
Todo esto modifica el orden habitual del empalme y
genera múltiples variantes de mRNA a partir de un solo
gen.

Las fallas en el empalme pueden causar enfermedades. En la β-talasemia, una mutación

en la unión exón-intrón del gen de la β-globina impide quitar un intrón y bloquea la
producción de hemoglobina.
Las mutaciones en el propio gen afectan solo ese alelo (cis), mientras que mutaciones en
proteínas del empalme afectan muchos mRNA (trans).
 La utilización de promotores alternativos también contribuye a
la regulación específica por tejido.
Como el gen de la glucocinasa (GK):
En hígado se utiliza un promotor hepático con su exón 1L.
En células β pancreáticas se usa un promotor diferente ubicado mucho más
arriba, que produce un exón 1β distinto.

Aunque ambos tejidos comparten los exones 2–10, la regulación difiere por el uso de
distintos promotores.
Procesamiento de rRNA y tRNA

rRNA y tRNA se forman a partir de precursores grandes.

rRNA 28S, 18S y 5.8S provienen del precursor 45S en el nucleolo.
Hay muchas copias de genes de rRNA para producir suficientes ribosomas.
rRNA es producto final, por eso requiere alta transcripción.
Los tRNA también se transcriben como precursores con secuencias extra y, a
veces, intrones.
 EL RNA PUEDE ACTUAR COMO CATALIZADOR
¿Qué es una ribozima?
son RNA con actividad enzimática
Suelen catalizar reacciones de transesterificación, como en el
empalme y la degradación de RNA.
Parte del rRNA del ribosoma actúa como peptidiltransferasa en
la formación del enlace peptídico.
Estos hallazgos muestran que el RNA puede funcionar como enzima y apoyan
teorías sobre el origen de la vida.
CASO CLINICO
Paciente masculino de 22 años, previamente sano,
acude por fatiga persistente, debilidad muscular
proximal y dificultad para concentrarse desde
hace dos meses. Refiere infecciones respiratorias
recurrentes y recuperación lenta. A la exploración
física presenta palidez leve y fuerza muscular 4/5
en extremidades proximales. Signos vitales dentro
de parámetros normales.
La biometría hemática muestra hemoglobina de
11.5 g/dL y leucocitos de 3,400/µL; plaquetas
normales. El perfil bioquímico no muestra
alteraciones. Estudios de biología molecular
revelan actividad normal de la RNA polimerasa II,
pero acumulación nuclear de pre-mRNA con
intrones no eliminados y disminución de mRNA
funcional en el citoplasma, secundaria a una
alteración del spliceosoma.
1. ¿Cuál es el principal proceso celular afectado en
este paciente?
A) Replicación del DNA
B) Iniciación de la transcripción
C) Empalme del RNA
D) Traducción proteica
E) Degradación del mRNA
C) Empalme del RNA
Justificación:
En el caso se describe acumulación nuclear de pre-mRNA
con intrones no eliminados y disminución de mRNA
funcional en el citoplasma. Esto indica que la transcripción
ocurre normalmente, pero el RNA no puede madurar
adecuadamente. El proceso encargado de eliminar
intrones y unir exones es el empalme (splicing), por lo que
este es el principal mecanismo afectado.
2. ¿Qué tipo de RNA participa directamente en el
proceso alterado?
A) tRNA
B) rRNA
C) miRNA
D) snRNA
E) lncRNA
D) snRNA
Justificación:
El empalme del RNA depende del spliceosoma, un
complejo formado por proteínas y RNA nucleares
pequeños (snRNA). Estos snRNA reconocen los
sitios de corte entre intrones y exones. La
alteración del spliceosoma descrita en el caso
implica directamente a los snRNA, no a tRNA,
rRNA o miRNA.
3. ¿Qué enzima sintetiza el RNA precursor que se
acumula en el núcleo?
A) RNA polimerasa I
B) RNA polimerasa II
C) RNA polimerasa III
D) DNA polimerasa
E) Transcriptasa reversa
B) RNA polimerasa II
Justificación:
La RNA polimerasa II es la enzima responsable de
transcribir los genes codificadores de proteínas,
generando el pre-mRNA que posteriormente será
procesado (cap 5’, cola poli-A y splicing). En el caso
se menciona actividad normal de esta enzima, lo
que confirma que el RNA precursor se sintetiza
correctamente.
4. ¿Cuál es la consecuencia directa de la alteración
descrita?
A) Aumento de la estabilidad del mRNA
B) Disminución global de la síntesis proteica
C) Mayor actividad ribosomal
D) Replicación defectuosa del DNA
E) Aumento de la traducción citoplásmica
B) Disminución global de la síntesis proteica
Justificación:
Si el pre-mRNA no es correctamente empalmado,
no puede salir del núcleo ni ser traducido por los
ribosomas. Como consecuencia, disminuye la
cantidad de proteínas funcionales producidas, lo
que explica la debilidad muscular, la leucopenia y
la susceptibilidad a infecciones observadas en el
paciente.
5. ¿En qué compartimento celular ocurre el
proceso afectado?
A) Citoplasma
B) Retículo endoplásmico
C) Aparato de Golgi
D) Núcleo
E) Mitocondria
D) Núcleo
Justificación:
El empalme del RNA es un proceso
exclusivamente nuclear en células eucariotas. La
evidencia de acumulación de RNA inmaduro
dentro del núcleo confirma que el defecto ocurre
en este compartimento celular, antes de la
exportación del mRNA al citoplasma.
¡Gracias!