TRANSCRIPCION
Introducción a la expresión genética
1. Definición de expresión genética, sus procesos y gasto energético.
Un gen se define como un segmento de DNA que contiene la información para una
sola cadena polipeptídica o para uno o más RNA funcionales.
La expresión génica se refiere a la producción de un producto funcional (p. ej., una
enzima) usando la información codificada en un gen. La información presente en un
segmento de DNA se pone a disposición de la célula mediante la formación de una
molécula de RNA. La síntesis de un RNA a partir de una plantilla de DNA se
denomina transcripción. El término transcripción denota un proceso en el que la
información codificada en las cuatro letras desoxirribonucleótidas del DNA se
reescribe, o se transcribe, en un lenguaje similar compuesto por cuatro letras
ribonucleótidos de RNA.
El concepto de un gen con base en DNA que codifica un mensaje basado en RNA,
que luego se traduce en una proteína, se conoce como el dogma central.
Las proteínas se sintetizan en el citoplasma mediante un complejo proceso llamado
traducción genética. La traducción requiere la participación de docenas de
diferentes componentes, incluidos los ribosomas.
Tanto los rRNA como los tRNA deben su actividad a sus complejas estructuras
secundarias y terciarias. A diferencia del DNA, que tiene una estructura helicoidal
similar de doble cadena que no depende de la fuente, muchos RNA se pliegan en
una forma tridimensional compleja, que es marcadamente diferente entre un tipo de
RNA y otro.
2. Definición del Código genético
1. Definición de transcripción (síntesis de ARN) y gasto energético
La transcripción es un proceso en el que una hebra de DNA proporciona la
información para la síntesis de una hebra de RNA. Las enzimas responsables de la
transcripción en células procariotas y eucariotas se denominan RNA polimerasa
dependiente de DNA, o simplemente RNA polimerasas. Estas enzimas son capaces
de incorporar nucleótidos, uno a la vez, en una hebra de RNA cuya secuencia es
complementaria a una de las hebras del DNA que sirve como plantilla.
2. Características de la transcripción eucariota
2.1. Ubicación celular del proceso
El sitio del DNA al que se une una molécula de RNA polimerasa antes de iniciar la
transcripción se denomina promotor. Las RNA polimerasas celulares no son
capaces de reconocer a los promotores por sí mismas, sino que requieren la ayuda
de proteínas adicionales llamadas factores de transcripción. Además de
proporcionar un sitio de unión para la polimerasa, el promotor contiene la
información que determina cuál de las dos hebras de DNA se transcribe, y el sitio
donde comienza la transcripción.
2.2. Sentido de la síntesis de ARN
La RNA polimerasa se mueve a lo largo de la hebra plantilla de DNA hacia su
extremo 5 (es decir, en una dirección 3 →5 ). A medida que la polimerasa progresa,
el DNA se desenrolla temporalmente y la polimerasa ensambla una hebra
complementaria de RNA que crece con inicio en su extremo 5 en una dirección 3 .
La RNA polimerasa cataliza la reacción altamente favorable
Para que no se realice una reacción inversa (condición) a la hora de sintetizar ácidos
nucleicos y proteínas, se cumple durante la transcripción una segunda reacción
favorable catalizada por una enzima llamada pirofofatasa. La hidrólisis del
pirofosfato libera una gran cantidad de energía libre, y hace que la reacción de
incorporación de nucleótidos sea esencialmente irreversible.
Una vez que la polimerasa ha pasado un determinado tramo de DNA, la doble hélice
del DNA se reforma. En consecuencia, la hebra de RNA no permanece asociada
con su plantilla como un híbrido DNARNA.
2.3. Tipos de ARN polimerasa en eucariotas y funciones
Las células eucariotas tienen tres enzimas de transcripción distintas en sus núcleos
celulares. Cada una de estas enzimas es responsable de sintetizar un grupo
diferente de RNA
2.4. Tipos de ARN (mensajero, ribosomal, de transferencia, de interferencia,
pequeños nucleares, pequeños nucleolares)
Los tres tipos principales de RNA eucariotas —mRNA, rRNA y tRNA— se derivan
de moléculas de RNA precursoras que son considerablemente más largas que el
producto RNA final. El RNA precursor inicial es equivalente en longitud a la longitud
total, del DNA transcrito, y se denomina transcrito primario, o pre-RNA. El segmento
correspondiente de DNA a partir del cual se transcribe una transcripción primaria se
denomina unidad de transcripción.
El genoma humano tiene cinco clústeres de rDNA, cada uno en un cromosoma
diferente. En una célula no divisoria (interfase), los clústeres de rDNA se reúnen
como parte de una o más estructuras nucleares de forma irregular llamadas
nucléolos, que funcionan en la producción de ribosomas
3. Estructura funcional del gen
3.1. Unidad de transcripción (sitio de iniciación y terminación, intrones,
exones, UTR)
Sitios de iniciación: Con frecuencia los sitios de unión de los factores de
transcripción están cerca del promotor del gen. Sin embargo, también pueden estar
en otras partes del ADN, en ocasiones muy lejanas del promotor, y aun así afectar
la transcripción del gen.
La flexibilidad del ADN es lo que permite que los factores de transcripción que están
en sitios de unión lejanos hagan su trabajo. El ADN serpentea como un espagueti
cocido para reunir los sitios de unión y los factores de transcripción lejanos con los
factores generales de transcripción o las proteínas "mediadoras".
Intrones: Regiones que no serán traducidas, y que son retirados por medio del
proceso corte y empalme del mRNA primario o heterogéneo nuclear (hnRNA).
Exones: Regiones que codifican para el producto génico; secuencia puntual de
bases nitrogenadas que permiten sintetizar una proteína.
3.2. Secuencias reguladoras o elementos de control CIS
Un elemento regulador en cis es una secuencia contigua a un gen que tengan un
efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen.
3.2.1. Sitio promotor (caja TATA)
Es una secuencia consenso de ADN que se encuentra en todos los linajes de
organismos vivos y es ampliamente conservada. La secuencia es 5′-TATAAA-3′ y
pueden seguirle algunas adeninas repetidas.
La localización de la caja es arriba (o rio arriba, como suele llamarse en la literatura)
del inicio de la transcripción. Esta se ubica en la región promotora de los genes,
donde ocurrirá la unión con factores de transcripción. Además de estos factores, la
ARN polimerasa II suele unirse a la caja TATA..
3.2.2. Otras secuencias de control proximal
•Promotores: Sitio de la molécula de DNA donde se une la RNA polimerasa antes
de iniciar la transcripción. Contiene la información que determina cuál de las dos
cadenas de DNA se transcribe y el sitio donde se inicia. Muchos promotores
eucariontes tienen secuencia TATA.
La secuencia iniciadora Inr se sitúa entre las posiciones –3 y +5, su secuencia
consenso es NYYAN(TA)YY o (Y)2CA(Y)5, donde la A es el primer nucleótido que
se transcribe.
La orientación de la transcripción la proporciona la secuencia BRE (elemento de
respuesta al TFIIB). Suele aparecer en algunos de los promotores con caja TATA,
con lo que la contienen tan solo el 12% de los promotores. Se localiza entre las
posiciones –32 y –37, muy cerca de la caja TATA. A veces se puede encontrar
detrás de la caja TATA.
La secuencia DPE (downstream core promoter element) se encuentra ya en la zona
codificante entre las posiciones +28 to +32. Suele aparecer sobre todo en los
promotores que carecen de caja TATA. Cuando hay DPE, actúa sinérgicamente con
Inr. Por ejemplo, es la caja que promueve la transcripción de los LINE.
El motivo MTE (motif ten element) funciona en sinergia y dependencia de la
secuencia Inr, y aparece en los promotores sin caja TATA.
*Elementos proximales: Secuencias localizadas entre la caja TATA y -200 pb (o
más lejos) y que determinan una transcripción eficiente y regulada del gen.
Estructura modular. La localización y organización de estos módulos es variable.
La caja CAAT se localiza entre –50 y –100. Su consenso es CC(CT)ACCTCT. Fue
uno de los primeros módulos descritos como importantes para el promotor. Se
puede encontrar en muchas posiciones y su papel es más importante que el de la
caja TATA en proporcionar eficacia al promotor, pero, curiosamente, no siempre
está presente.
La caja GC suele aparecer varias veces (hasta 6 copias). Su secuencia suele ser
de tipo GGGCGG, con la C sin metilar. Pueden encontrarse tanto delante como
detrás de la caja CAAT (pero siempre delante del promotor mínimo) y son más
frecuentes en promotores sin TATA, como la mayoría de los genes de
mantenimiento o domésticos (housekeeping). Su función es permitir una expresión
constante, pero baja.
Las secuencias distales específicas (SDE) son las más alejadas de todas (–100
a –200) y suelen constar de 6 a 10 nt. Son reconocidas específicamente por
determinadas proteínas. Funcionalmente no se distinguen de los elementos
distales, pero se diferencian de éstos en que se localizan en la zona proximal. Un
ejemplo son las secuencias Oct1 y Oct2 reconocidas por los homeodominios que
se verán en el tema siguiente.
Cuando los promotores carecen de estos elementos proximales se dice que son
genes constitutivos o de mantenimiento. Da igual que los genes constitutivos se
expresen de forma muy abundante, como que se transcriban a baja velocidad,
puesto que lo importante es que lo hagan de manera continua y no regulada.
3.2.3. Sitios de control distal
● Secuencias potenciadoras o enhancers
Son secuencias cortas que aumentan la transcripción del gen con otras
secuencias reguladoras y alteran la estructura del ADN, induciendo al
superenrollamiento de la zona del promotor basal y aumenta la unión de TF,
dándole flexibilidad al ADN favoreciendo el inicio de la transcripción.
Aumentan mucho la velocidad de inicio de transcripción de los promotores mínimos
que se colocan en su misma cadena de DNA. En las levaduras hay elementos
análogos a los potenciadores: las UAS (upstream activating sequences), pero se
diferencian de los potenciadores en que sólo funcionan si se localizan en 5’ del
promotor, nunca detrás.
● Secuencias silenciadoras o silencers
Son secuencias cortas de nucleótidos de dos tipos: los elementos silenciadores o
los elementos de regulación negativa (NRE, negative regulation elements) y pueden
actuar de varias maneras:
● Modifican la estructura de la cromatina evitando sé que activen los genes.
● Al reclutar factores transcripcionales represores y evitar que factores
transcripcionales inductores se unen al DNA.
● Al alterar el proceso de corte y empalme del RNA heterogéneo nuclear y evitar su
maduración.
● Al crear señales que bloquean la traducción, e inactivar así la expresión génica.
3.3. Factores de transcripción o elementos de control TRANS
La mayoría de las secuencias reguladoras no pueden modificar la velocidad de
transcripción por si solas. Las responsables de la modificación de la velocidad son
las proteínas que obran recíprocamente con ellas. A este tipo de regulación es que
se le llama regulación en trans.
Son proteínas reguladoras que se unen a secuencias de reconocimiento específicas
del ADN.
→ Factores de transcripción basales o generales: se unen al promotor mínimo
para iniciar la transcripción.
Factores Basales de transcripción Clase II (TFII)
• TFIID: TBP (proteína de unión a caja TATA) y factores accesorios
• TFIIA: Estabiliza la unión de TFIID
• TFIIB: Ayuda a posicionar al complejo de factores y la RNA pol II sobre el
promotor
• TFIIF: Proporciona la ocupación de 30 pb, tiene actividad de helicasa para abrir
la doble cadena en el sitio +1
• TFIIE: Recluta a TFIIH y regula sus actividades de helicasa y cinasa
• TFIIH: Complejo de 9 subunidades: actividad de helicasa para abrir la doble
hélice e iniciar transcripción; actividad de cinasa para fosforilar el Dominio
Carboxilo Terminal (CTD) de la RNA pol II y permitir escape del promotor;
actividad de exonucleasa para reparar errores en NER
→ Factores de transcripción: proteínas que se pueden unir a secuencias del
promotor, activadores y silenciadores afectando a la transcripción. Si incrementan
la transcripción se denominan activadores, si la disminuyen represores. Controlan
el nivel de expresión y la especificidad tisular y temporal.
4. Fases de la transcripción del ARN mensajero y proteínas encargadas
4.1. Inicio: ensamblado del complejo de inicio de la transcripción
El primer paso en el ensamblaje del complejo de preinicio es la unión de una
proteína, llamada proteína enlazante TATA (TBP), que reconoce la caja TATA de
estos promotores. Por tanto, como en las células bacterianas, una polimerasa
eucariota purificada no puede reconocer un promotor directamente, y no
puede iniciar una transcripción precisa por sí misma (importante). La TBP está
presente como una subunidad de un complejo proteico mucho más grande llamado
TFIID. Mientras que el TBP se une a la TATA, otras subunidades del complejo TFIID
se unen a otras regiones del DNA, incluidos los elementos que se encuentran
corriente abajo del sitio de inicio de la transcripción.
La interacción de tres de los GTF
(TBP de TFIID, TFIIA y TFIIB) con el
DNA unidos al promotor proporciona
una plataforma para la posterior unión
de la enorme RNA polimerasa de
múltiples subunidades con su TFIIF
adjunto. Una vez que la RNA
polimerasa-TFIIF está en posición,
otro par de GTF (TFIIE y TFIIH) se
unen al complejo y transforman la
polimerasa en una activa máquina de
transcripción.
El TFIIH es el único GTF conocido por
poseer actividades enzimáticas. Una
de las subunidades de TFIIH funciona
como una proteína quinasa para
fosforilar la RNA polimerasa, mientras
que otras dos subunidades de este
complejo de proteína funcionan como
enzimas del despliegue del DNA
(helicasas). Se requiere la actividad
de la helicasa en el DNA para separar
las hebras de DNA del promotor y
permitir que la hebra de plantilla
encuentre su camino en el sitio activo
de la polimerasa. Una vez que
comienza la transcripción, algunos de
los GTF (incluido el TFIID) se pueden
dejar atrás en el promotor, mientras
que otros se liberan del complejo.
La fosforilación de la polimerasa por la TFIIH puede actuar como el activador
que desacopla la enzima de los GTF y/o el DNA del promotor, lo que permite que la
enzima escape del complejo de preinicio y mueva hacia abajo la plantilla de DNA.
Tiene varias actividades: ATPasa, helicasa y cinasa, que puede fosforilar el
dominio CTD de la ARN pol II. La fosforilación del dominio carboxiterminal (CTD)
está implicado en el abandono del promotor basal y el inicio de la fase de
elongación.
4.2. Elongación (desenrollamiento del ADN, formación híbrido transitorio
ADN-ARN)
Se cree que la fosforilación proporciona el desencadenante para la separación de
la maquinaria transcripcional de los factores de transcripción generales y/o el ADN
promotor. TFIIS, ELL y P-TEFb son tres de los diversos factores de elongación que
pueden asociarse con la polimerasa a medida que se mueve a lo largo del ADN.
TFIIS ayuda a que la polimerasa vuelva a moverse después de que se detenga,
mientras que P-TEFb es una quinasa que fosforila los residuos de Ser2 del CTD
una vez que comienza la elongación. Se cree que la fosforilación de los residuos de
Ser2 promueve el reclutamiento de factores de empalme de ARN y poliadenilación.
En la elongación, la enzima ARN pol II se mueve a lo largo del ADN y sintetiza la
cadena naciente de ARN. A medida que la enzima avanza sobre el ADN, lo
desenrolla para exponer un nuevo segmento de cadena sencilla de ADN, que
fungirá como molde. Los nucleótidos se añaden de forma covalente al extremo 3’OH
y en la región desenrollada se forma un híbrido ADN-ARN.
4.3. Terminación: reconocimiento de las secuencias de terminación y
poliadenilación
La polimerasa de RNA reconoce también señales de terminación de la cadena. Se
dan dos tipos de terminación: directa o mediada por proteínas.
Directa:
La terminación de la transcripción implica el reconocimiento de una secuencia que
contiene una región rica en GC, en una serie de seis o más adeninas contenidas en
el tránscrito de ARN. En la transcripción del ARN se leería como la señal de
poliadenilación que determina el final de la adición de nucleótidos a la cadena y la
desintegración del complejo de transcripción. Se presume que este proceso puede
ser mucho más complejo. Cuando se añade el último nucleótido a la burbuja de
transcripción se colapsa al desaparecer el híbrido ADN-ARN, y se libera la ARN pol
II.
La terminación directa hace referencia a determinadas secuencias palindrómicas
que cuando el ARN se transcribe se enrollan en forma de horquilla y pierde
estabilidad con lo que la cadena se disocia.
Después de la horquilla viene una región de poli(U) que parece actuar como señal
para que se suelte la polimerasa de ARN y termine la transcripción.
Mediada por proteínas:
Uno de los procedimientos para terminar la transcripción depende de la presencia
de un factor proteico denominado factor ρ (Rho). Esta proteína funciona como una
helicasa respecto al híbrido ADN-ARN, y con gasto energético provoca la rotura de
los enlaces que mantienen al ARN recién sintetizado unido al ADN y causa la
separación de la ARN polimerasa de la cadena de ADN.
Es importante mencionar que existe una superposición de eventos, de tal
manera que los procesos de elongación, terminación y maduración del ARNhn
son simultáneos, por lo que cuando termina la transcripción ya existe un
ARNm maduro y listo para transportarse al citoplasma.
5. Procesamiento del transcrito primario (hnARN). Edición de ARNm
(modificaciones postranscripcionales)
5.1. Adición de casquete de 7-metil guanosina del extremo 5´.
Los extremos 5 de todos los RNA poseen inicialmente un trifosfato, derivado del
primer nucleósido trifosfato incorporado en el sitio de inicio de la síntesis del RNA.
En el primer paso, se elimina el último de los tres fosfatos y se convierte el extremo
5 en un difosfato. Luego, se agrega un GMP en una orientación invertida de modo
que el extremo 5 de la guanosina se encuentre frente al extremo 5 de la hebra de
RNA. Como resultado, los dos primeros nucleósidos están unidos por un inusual
puente 5-5trifosfato. Finalmente, la guanosina invertida terminal está metilada en la
posición 7 en su base de guanina, mientras que el nucleótido en el lado interno del
puente trifosfato está metilado en la posición 2de la ribosa. El extremo 5del RNA
ahora contiene una tapa de metilguanosina.
La tapa de metilguanosina en el extremo 5de un mRNA cumple varias funciones:
evita que el extremo 5del mRNA sea digerido por las exonucleasas, ayuda a
transportar el mRNA fuera del núcleo, y desempeña un papel importante en el inicio
de la traducción de mRNA.
Esta modificación necesita de tres actividades enzimáticas:
Una nucleosidil-trifosfatasa que elimina el fosfato γ del extremo 5’, que es distinta
a las fosfatasas habituales que sólo eliminan el fosfato α.
Una guanilil-transferasa que añade un grupo guanililo (5’-fosfo-guanosina) al
extremo difosfato del hnRNA mediante el enlace fosfodiéster 5’-5’.
Una metilasa que introduce metilos a partir de SAM en varias posiciones.
5.2. Poliadenilación del extremo 3´.
Como se indicó anteriormente, el extremo 3de un mRNA contiene una hebra de
residuos de adenosina que forma una cola de poli(A). A medida que se
secuenciaron varios mRNA, se hizo evidente que la cola de poli(A) comienza
usualmente de 10 a 30 nucleótidos corriente abajo de la secuencia AAUAAA. Esta
secuencia en el transcripto primario sirve como un sitio de reconocimiento para el
ensamblaje de un gran complejo de proteínas que llevan a cabo las reacciones de
procesamiento en el extremo 3 del mRNA.
Entre las proteínas del complejo de procesamiento se incluye una endonucleasa
que divide el pre-mRNA corriente abajo a partir del sitio de reconocimiento. Después
de la división por la nucleasa, una enzima llamada poli(A) polimerasa agrega
aproximadamente 250 adenosinas sin la necesidad de una plantilla. La cola de
poli(A) junto con una proteína asociada protege al mRNA de la degradación
prematura por las exonucleasas.
La PABP o PBP (proteína que se une al poli-A:
Poli(A) Binding Protein) se une a esta cola de
manera específica para estabilizarla. Su unión
determina la cantidad de ATP que va a
polimerizar la PAP puesto que se une una
molécula de PABP cada 25-27 adeninas. Las
mutaciones de la PABP son letales, y la
proteína interviene también en la traducción de
este mRNA.
5.3. Corte y empalme (splicing) realizado por el espliceosoma
Para empalmar un RNA se deben introducir rupturas en el filamento en los extremos
5y 3 (los sitios de empalme) de cada intrón, y los exones situados a cada lado de
los sitios de corte y empalme se deben enlazar de forma covalente (ligarse).
El G/GU en el extremo 5 del intrón (el sitio de empalme 5), el AG/G en el extremo 3
del intrón (el sitio de empalme 3) y el tracto de polipirimidina cerca del sitio de
empalme 3 están presentes en la vasta mayoría de los pre-mRNA eucarióticos.
Secuencias específicas, sobre todo las potenciadoras de empalmes exónicos, o
ESEs, situadas dentro de los exones (véase figura 11-30, recuadro A) proporcionan
los indicios adicionales que permiten distinguir la maquinaria de empalme entre los
exones y los intrones. Los cambios en la secuencia de DNA dentro de un sitio de
corte y empalme, o una ESE, pueden conducir a la inclusión de un intrón o a la
exclusión de un exón.
La principal diferencia es que el pre-mRNA no es capaz de empalmarse, lo que
requiere en su lugar un anfitrión de gran cantidad de RNA nucleares pequeños
(snRNA) y sus proteínas asociadas. A medida que se transcribe cada molécula de
hnRNA grande, se asocia con una variedad de proteínas para formar una
ribonucleoproteína nuclear heterogénea (hnRNP), que representa el sustrato
para las reacciones de procesamiento que siguen. El procesamiento ocurre cuando
cada intrón del pre-mRNA se asocia con una máquina macromolecular dinámica
llamada espliceosoma. Cada espliceosoma consiste en una variedad de proteínas
y varias partículas de ribonucleoproteínas diferentes, llamadas
ribonucleoproteínas nucleares pequeñas (snRNP) porque están compuestas de
snRNA unidos a proteínas específicas. Los espliceosomas no están presentes
dentro del núcleo en un estado prefabricado, sino que se ensamblan cuando sus
componentes snRNP se unen al pre-mRNA. Una vez que se ensambla la
maquinaria espliceosoma, los snRNP llevan a cabo las reacciones que cortan los
intrones de la transcripción, y pegan los extremos de los exones. Los intrones
extirpados, que constituyen más de 95% del pre-mRNA de mamífero promedio,
simplemente se degradan dentro del núcleo.
El espliceosoma actuaría como una ribozima, y las proteínas cumplirían varias
funciones complementarias, tales como mantener la estructura tridimensional
apropiada del snRNA y seleccionar los sitios de empalme que se utilizarán durante
el procesamiento de un pre-mRNA particular.
Los U, son snRNA.
6. Procesamiento del transcrito primario de los genes de los ARNr.
• Síntesis y procesamiento del precursor Rrnr
Los ribosomas son tan numerosos que más de 80% del RNA en la mayoría de las
células consiste en RNA ribosómico. Este DNA, llamado rDNA, por lo general está
agrupado en una o unas pocas regiones del genoma. El genoma humano tiene cinco
clústeres de rDNA, cada uno en un cromosoma diferente.
Nota: La mayor parte de un nucléolo se compone de subunidades ribosomales
nacientes, que le dan al nucléolo una apariencia granular
Los ribosomas eucarióticos tienen cuatro RNA ribosómicos distintos, tres en la
subunidad grande y uno en la subunidad pequeña. En los humanos la subunidad
grande contiene una molécula de RNA 28S, 5.8S y 5S, y la subunidad pequeña
contiene una molécula de RNA 18S.1
Tres de estos rRNA (28S, 18S y 5.8S) están conformados por varias nucleasas de
un único transcripto primario (llamado el pre-rRNA) que es sintetizado por una
enzima llamada RNA polimerasa I, que se especializa en transcribir el pre-rRNA y
lo hace en el nucleolo. El 5S rRNA se sintetiza a partir de un precursor separado de
RNA, fuera del nucléolo (nucleoplasma), mediante una enzima diferente llamada
RNA polimerasa III.
El procesamiento del pre-rRNA se logra con la ayuda de un gran número de RNA
nucleolares pequeños (o snoRNA) que están empaquetados con proteínas
particulares para formar partículas llamadas ribonucleoproteínas nucleolares
pequeñas (o snoRNP, small, nucleolar RNA). Un rRNA 5S, de aproximadamente
120 nucleótidos de longitud, está presente como parte de la gran subunidad
ribosomal, las moléculas de rRNA 5S se encuentran fuera del nucleolo, después de
su sintesis se trasladan al nucleolo para ensamblar los ribosomas.
Nota: El nucléolo es el sitio no sólo de procesamiento de rRNA, sino también
de ensamblaje de las dos subunidades ribosomales.
Se han encontrado más de 200 proteínas diferentes asociadas con los rRNA en
diferentes etapas del ensamblaje de ribosomas. Estas proteínas se pueden dividir
en dos grupos: las proteínas ribosomales que permanecen en las subunidades, y
las proteínas accesorias que tienen una interacción transitoria con los intermediarios
del rRNA y sólo se requieren para el procesamiento. Entre este último grupo se
encuentran más de una docena de helicasas de RNA, que son enzimas que
desenrollan las regiones de RNA de doble hebra.
7. Procesamiento del transcrito primario de los genes de ARNt.
Todos los tRNA maduros tienen la secuencia triple CCA en su
extremo 3. Estos tres nucleótidos pueden estar codificados en el gen
tRNA.
Los RNA de transferencia traducen una secuencia de codones de
mRNA a una secuencia de residuos de aminoácidos. La información
contenida en el mRNA se decodifica a través de la formación de
pares de bases entre secuencias complementarias en los RNA de
transferencia y mensajero. La parte del tRNA que participa en esta
interacción complementaria con el codón del mRNA es un tramo de
tres nucleótidos secuenciales, llamado anticodón, que está situado
en el lazo medio de la molécula de tRNA.
Este ciclo está compuesto invariablemente por siete nucleótidos, los tres
intermedios constituyen el anticodón. El anticodón se encuentra en un extremo de
la molécula de tRNA en forma de L, opuesta al extremo al que está unido el
aminoácido.
Las reglas que gobiernan la oscilación en la tercera posición del codón son las
siguientes: la U del anticodón puede emparejarse con la A o G del mRNA; la G del
anticodón puede emparejarse con la U o C del mRNA; y la I (inosina, que se deriva
de la guanina en la molécula de tRNA original) del anticodón se puede emparejar
con la U, C o A del mRNA. Como resultado de la oscilación, los seis codones para
la leucina, por ejemplo, requieren sólo tres tRNA.
Los aminoácidos están unidos en forma covalente a los extremos 3 de sus tRNA
afines por una enzima llamada aminoacil-tRNA sintetasa (aaRS, aminoacyl-tRNA
synthetase). Las aminoacil-tRNA sintetasas proporcionan un excelente ejemplo de
la especificidad de las interacciones proteína-ácido nucleico. Deben existir ciertas
características comunes entre todas las especies de tRNA que especifiquen un
aminoácido determinado para permitir que una única aminoacil-tRNA sintetasa
reconozca todos estos tRNA, y al mismo tiempo discrimine todos los demás tRNA
de otros aminoácidos
• Corte de un intrón en el extremo 5‘, por una ribozima ARNasa p.
• Corte en el extremo 3‘ por una ARNasa convencional y agrega la terminación
CCA.
• Modificación química de sus bases por bases no convencionales
(hipoxantina,metilguanina dihidrouracilo, ribotimina pseudouracilo).
TRADUCCCION
1. Definición de traducción y gasto energético
La síntesis de proteínas, o traducción. La síntesis de una cadena de polipéptido se
puede dividir en tres actividades bastante diferentes: inicio de la cadena, elongación
de la cadena, y terminación de la cadena.
2. Componentes del complejo traduccional:
2.1. ARNm citoplasmático.
Es una molécula de ácido nucleico de cadena sencilla que contiene la información
genética almacenada en el ADN y su secuencia es complementaria a una de las
cadenas del ADN, a la que se la llama cadena molde. Presenta una disposición de
tripletes de nucleótidos o codones, esto es, que están agrupados de tres en tres de
manera secuencial, los cuales determinan la secuencia de aminoácidos en la
proteína. Dicho de otro modo, esta molécula se obtiene mediante la transcripción,
en la cual secuencias específicas de ADN son copiadas a ARNm, que transporta al
citoplasma el mensaje contenido en el ADN a los sitios de síntesis proteica (los
ribosomas).
2.1.1. Dirección de la lectura para la traducción
Los codones en un ARNm se leen durante la traducción; se comienza con un codón
de inicio, y se sigue hasta llegar a un codón de terminación. Los codones de ARNm
se leen de 5' a 3' y especifican el orden de los animoácidos en una proteína de N-
terminal (metionina) hasta C-terminal.
2.1.2. Características del código: universalidad, degenerado, no superpuesto)
El código genético es específico y continuo, ya que cada codón tiene un significado
único y los códigos se leen de manera continua y lineal; esto es, cada base puede
pertenecer sólo a un codón, de tal forma que no hay duplicación ni omisión de
ningún nucleótido en la lectura, y por lo tanto no hay sobre posicionamiento.
Se dice que una base es cuatro veces degenerada si, con cualquiera de las bases
nitrogenadas presente en una posición específica, el resultado es que codifique el
mismo aminoácido, como sería el caso de la alanina, en la cual los codones que
codifican para este aminoácido deben contener GC como primera y segunda base;
sin embargo, la tercera base puede ser cualquiera de las cuatro bases nitrogenadas,
sin cambiar el sentido de la lectura.
El código genético es casi universal. Se le considera así, porque es el mismo para
todos los organismos existentes, con excepciones mínimas, observadas en
mitocondrias y en algunos protistas.
2.1.3. Diccionario de decodificación del código genético
[Link] Tipos de codones (de inicio, sin sentido, codificantes)
2.2. Ribosomas
2.2.1. Composición molecular y funciones
El ribosoma es una estructura muy irregular con protuberancias, lóbulos, canales y
puentes.
Durante la traducción un ribosoma se somete a un ciclo repetitivo de cambios
mecánicos, que se controla con la energía liberada por la hidrólisis del GTP. A
diferencia de la miosina o la cinesina, que simplemente se mueven a lo largo de una
trayectoria física, los ribosomas se mueven a lo largo de una “cinta” de mRNA que
contiene información codificada.
2.2.2. Sitios específicos (E, P, A)
Cada ribosoma tiene tres sitios para asociarse con moléculas de RNA de
transferencia. Estos sitios, denominados el sitio A (aminoacilo), el sitio P (peptidilo)
y el sitio E (salida), reciben cada tRNA en pasos sucesivos del ciclo de elongación.
Los tRNA se enlazan dentro de estos
sitios y cubren el espacio entre las dos
subunidades ribosomales. Los
extremos anticodón de los tRNA
unidos entran en contacto con la
subunidad pequeña, que desempeña
un papel clave en la decodificación de
la información contenida en el mRNA.
Por el contrario, los extremos que
llevan los aminoácidos de los tRNA
enlazados entran en contacto con la
subunidad grande
2.2.3. Definición de polirribosomas y su localización durante el proceso de
traducción (libres del citosol, asociados a membranas y mitocondriales)
Cuando se examina en el microscopio electrónico un RNA mensajero durante el
proceso de traducción, se observa invariablemente que varios ribosomas se unen a
lo largo de la fibra del mRNA. Este complejo de ribosomas y mRNA se llama
polirribosoma o polisoma. A medida que cada ribosoma se aleja del codón de
inicio, otro ribosoma se une al mRNA y comienza su actividad de traducción.
La orientación de los ribosomas dentro de un polisoma “libre” (es decir, no unido a
la membrana) están muy altamente ordenados. Los ribosomas que componen este
modelo de polisoma están densamente empaquetados y han adoptado un arreglo
de “doble fila”. Además, cada uno de los ribosomas individuales está orientado de
modo que su polipéptido naciente (filamentos rojos o verdes) está situado en la
superficie exterior que mira al citosol. También hay polisomas que se unen a la
membran del ER Se presume que estos polisomas se habían dedicado a la síntesis
de membrana y/o proteínas de organelos en el momento en que se fijó la célula.
2.2.4 Destino de los productos de la traducción.
También llamado topogénesis. Se refiere a la ruta que siguen las proteínas en la
célula hasta alcanzar su localización (intra o extracelular) donde ejercerán su
función. Esta topogénesis se realiza en el citosol, en donde participan varios
organelos (retículo endoplásmico, aparato de Golgi, mitocondrias, peroxisomas y
lisosomas entre los más destacados).
Las proteínas sintetizadas en la célula que son iniciadas por ribosomas libres del
citosol como las proteínas nucleares, las citosólicas y las que están destinadas a
cloroplastos, mitocondrias o peroxisomas, concluyen su síntesis en dichos
ribosomas para luego dirigirse al citosol. La clave del proceso por el que las
proteínas se dirigen a su sitio son las señales de clasificación, conocidas como
secuencias señal, péptido señal o etiqueta señal, entre las que se encuentran
las proteínas de membrana, lisosomales y de secreción, mientras que las proteínas
que no presentan secuencias señal permanecen en el citosol (citosólicas,
nucleares, de mitocondria y de peroxisomas).
El péptido señal y la región señal determinan el destino celular correcto de las
proteínas. Los péptidos señales cuentan con una secuencia corta de aminoácidos
(13-60 aa), situados con frecuencia cerca del extremo amino (N-terminal) de la
cadena que marcan a la proteína recién sintetizada.
2.3. Los ARNt
2.3.1. Elementos importantes de su estructura: anticodón y extremo 3´
Los ARNt contienen en su secuencia al anticodón, un triplete de bases que se
encuentra en el asa central del ARNt, en las posiciones 34, 35 y 36, que se une de
manera complementaria con el codón del ARNm, durante la síntesis de una
proteína, con la finalidad de introducir un aminoácido específico a la cadena
polipeptídica naciente.
El dominio del anticodón está implicado de manera lejana en la discriminación entre
las formas de iniciación y elongación del ARNt y en las funciones alternas del ARNt,
tales como la iniciación de la transcriptasa inversa en los retrovirus.
2.3.2. Interacción codón-anticodón (hipótesis de bamboleo)
La interacción codón/anticodón permite al ARNm, dirigir el orden de incorporación
de los aminoácidos dentro de la cadena polipeptídica. Estas interacciones ocurren
dentro de la subunidad [Link] reconocimiento se da entre la complementariedad
de las bases 1, 2 y 3 del codón con las bases 3, 2 y 1 del anticodón,
respectivamente. Para explicar este fenómeno se estableció la hipótesis de
bamboleo o fluctuación, que expresa dos reglas:
1. Las bases tercera y segunda del anticodón forman puentes de hidrógeno con las
bases primera y segunda del codón, lo que determina la especificidad de la
interacción codón/anticodón.
2. La primera base del anticodón puede orientarse o girarse de formas ligeramente
distintas (bamboleo o fluctuación), para interaccionar con distintas bases en la
posición tercera del codón. Estas uniones presentan enlaces de hidrógeno
diferentes a los observados en las bases tercera y segunda. Debido a esto, la
interacción codón/anticodón es más débil.
Dicho de otra manera, esta hipótesis ocurre entre la tercera base del codón y la
primera base del anticodón. Las reglas originales del bamboleo sugirieron que el
primer nucleótido del anticodón podía complementarse con más de un nucleótido
en la tercera posición del codón. Así, los anticodones con un uracilo en la primera
posición podían unirse con los codones que tenían adenina o guanina en la tercera
posición. Los que presentaban una guanina en la posición 3, podían unirse con los
codones que terminaban con uracilo o citosina. Pero algo más interesante se
observó cuando el ARNt que presentaba una inosina en la posición 3 podía
reconocer los codones que terminaban con citosina, uracilo o adenina. Por ejemplo,
el ARNt-Ala de la levadura, anticodón 5’-IGC-3’, se puede unir a tres codones: 5-
GCC-3’, 5’-GCU-3’ y 5’-GCA-3’.
3. Fases de la traducción y proteínas reguladoras
3.1. Activación de los aminoácidos
3.1.1. Función de las Aminoacil ARNt-sintetasas
Los aminoácidos son activados mediante la acción de la enzima aminoacil-ARNt-
sintetasa y la hidrólisis de dos moléculas de ATP, uno para la remoción del
pirofosfato (PPi) y el segundo para la hidrólisis de PPi a dos ácidos fosfóricos
inorgánicos (2Pi), esta última reacción, con la intervención de la enzima
pirofosfatasa, lo que permite que un aminoácido pueda unirse a su ARNt específico,
y genera un aminoacil-ARNt cargado.
En este proceso se libera un AMP + 2Pi y, tras ellos, la enzima, que vuelve a
utilizarse. Cada tipo de ARNt, al unirse al aminoácido, lleva antepuesto el nombre
del aminoácido que transporta; por ejemplo, leucinil-ARNt para el que transporta
leucina, metionil-ARNt para la metionina, y así para todos los aminoácidos. Por otro
lado, el ARNt unido al aminoácido compatible con él se designa aminoacil-ARNtAA,
en el que “AA” corresponde a la sigla del aminoácido.
3.2. Inicio de la síntesis proteica
3.2.1. Conformación del complejo de inicio de la traducción en eucariotas
(Factores de inicio, reconocimiento de codón 5´AUG, ensamblaje del
ribosoma)
Los ribosomas eucarióticos tienen subunidades grandes y pequeñas que son 60S
y 43S. Los mRNA eucariotas posee características especializadas, como tapas 5 y
colas 3. Las células eucariotas requieren al menos de 12 factores de inicio,
conocidos como eIFs que comprenden un total de más de 25 hebras polipeptídicas
varias de estas eIF se enlazan a la subunidad 40S, que prepara la subunidad para
enlazarse al mRNA. El tRNA iniciador unido a una metionina también se une a la
subunidad 40S antes de su interacción con el mRNA. El tRNA iniciador entra en el
sitio P de la subunidad en asociación con el IF2-GTP
Una vez que se han producido estos eventos, la pequeña subunidad ribosomal con
sus factores de inicio asociados y el tRNA cargado está listo para encontrar el
extremo 5 del mRNA, que porta la tapa de metilguanosina. El complejo 43S se
recluta originalmente al mRNA con la ayuda de un grupo de factores de inicio que
ya están unidos al mRNA. Entre estos factores:
1) el eIF4E se une a la tapa 5 del
eucariota mRNA;
2) el eIF4A se mueve a lo largo del
extremo 5 del mensaje eliminando
cualquier región de doble hebra que
pueda interferir con el movimiento del
complejo 43S a lo largo del mRNA; y
3) el eIF4G sirve de conector entre el
extremo tapado 5 y el extremo 3
poliadenilado del mRNA
Una vez que el complejo 43S se une al extremo 5 del mRNA, el complejo hace un
escaneo detallado a lo largo del mensaje hasta que alcanza una secuencia
reconocible de nucleótidos (por lo general 5¬CCACCAUGC¬3) que contiene el
codón de inicio AUG. Una vez que el complejo 43S alcanza el codón AUG
apropiado, el GTP unido al IF2 se hidroliza y la subunidad grande (60S) se une al
complejo. La formación del ribosoma 80S completo requiere la actividad de otra
proteína de unión al GTP llamada eIF5B-GTP, cuyo GTP unido también se hidroliza.
La hidrólisis de los dos GTP unidos, y la formación del ribosoma completo, va
acompañada de la liberación de todos los factores de inicio. Estos eventos dejan el
anticodón del iniciador tRNA unido al codón de inicio AUG en el sitio P del ribosoma
ensamblado. Sólo bajo estas condiciones el ARNt iniciador es el único ARNt que
puede entrar por el sitio P; los siguientes entrarán por el sitio [Link] complejo ahora
está listo para el primer paso en la elongación.
3.3. Elongación de la cadena polipeptídica
Con el tRNA iniciador cargado en su lugar dentro del sitio
P, el ribosoma está disponible para la entrada del segundo
aminoacil- tRNA en el sitio A vacante, que es el primer
paso en la elongación.
La unión del segundo aminoacil-tRNA en el sitio A
requiere una GTPasa, conocida como factor de
elongación EF-Tu (o Tu) en las bacterias y eEF1A en las
eucariotas. Se requiere que el EF-Tu entregue los
aminoacil-tRNA al sitio A del ribosoma. Aunque cualquier
complejo aminoaciltRNA- Tu-GTP puede entrar en el sitio,
sólo uno cuyo anticodón es complementario al codón de
mRNA situado en el sitio A, activará los cambios
conformacionales necesarios dentro del ribosoma que
hacen que el tRNA permanezca unido al mRNA en el
centro de decodificación.
Una vez que el aminoacil-tRNA-Tu-GTP apropiado se une
al codón de mRNA, el GTP se hidroliza y se libera el
complejo Tu-GDP, dejando el aa-tRNA recién llegado
ubicado en el sitio A del ribosoma.
3.3.1. Formación de enlaces peptídicos por la
ribozima peptidil transferasa
El sitio P contendrá un tRNA unido a la hebra peptídica
en crecimiento. En todos los casos el sitio A contiene el
aminoacil-tRNA recién llegado que se debe agregar para
que la hebra se alargue.
La formación del enlace peptídico se realiza cuando el
nitrógeno amínico del RNAaa en el sitio A lleva a cabo un
ataque nucleofílico sobre el carbono carbonílico del
aminoácido unido al tRNA del sitio P, desplazando el
tRNA del sitio P. Como resultado de esta reacción, el
tRNA unido en el sitio A tiene un dipéptido unido,
mientras que el tRNA en el sitio P está desacilado. La
peptidil transferasa, un componente de la gran
subunidad del ribosoma, cataliza la reacción (la peptidil
transferasa es una ribozima, compuesto de residuos
nucleótidos tRNA y ribosoma).
El siguiente paso, llamado translocación, se caracteriza
por un pequeño movimiento de trinquete (6°) de la
subunidad pequeña en relación con la subunidad grande. Como resultado de este
movimiento el ribosoma mueve tres nucleótidos (un codón) a lo largo del mRNA en
la dirección 5→3
En la etapa final de elongación el tRNA desacilado sale del ribosoma y deja vacío
el sitio E. Para cada ciclo de elongación, al menos dos moléculas de GTP se
hidrolizan: una durante la selección del aminoacil-tRNA y otra durante la
translocación. Una vez que el peptidil-tRNA se ha trasladado al sitio P por
translocación, el sitio A se abre nuevamente a la entrada de otro aminoacil-Trna
3.4. Terminación de la síntesis de proteínas
Tres de los 64 codones de trinucleótidos funcionan como codones de terminación,
que finalizan el ensamblaje del polipéptido en vez de codificar un aminoácido. No
existen tRNA cuyos anticodones sean complementarios a un codón de terminación.
Cuando un ribosoma alcanza uno de estos codones, UAA, UAG o UGA, la señal se
lee para detener la elongación adicional y liberar el polipéptido asociado con el
último tRNA.
3.4.1. Factores proteicos de terminación
Los factores de liberación se pueden dividir en dos grupos: RF de clase I, que
reconocen codones de terminación en el sitio A del ribosoma, y RF de clase II,
proteínas de unión al GTP (proteínas G) cuyas funciones no se conocen bien. Las
eucariotas tienen un único RF de clase I, el eRF1, que reconoce los tres codones
de parada.
Los pasos finales en la traducción incluyen la liberación del tRNA desacilado del
sitio P, la disociación del
mRNA del ribosoma y el
desensamblaje del
ribosoma en sus
subunidades grandes y
pequeñas, en preparación
para otra ronda de
traducción. Estos pasos
finales requieren una serie
de factores proteicos, y son
bastante diferentes en
eucariotas y bacterias. En
las células bacterianas
estas proteínas incluyen la
EF-G, IF3 y RRF (factor de
reciclado del ribosoma),
que promueve la
separación de la subunidad
ribosomal.
MECANISMOS DE REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GENÉTICA
1. Definición de control de la expresión genética
2. Utilidad para organismos multicelulares
3. Niveles de control de la expresión genética y gasto energético
3.1. Pretranscripcional:
Por regla general, todas las células de un organismo pluricelular contienen el
mismo conjunto de genes.
El primer nivel de control se ejerce en el genoma. En plantas y animales
pluricelulares, cada tipo de célula especializada expresa sólo una pequeña fracción
del número total de genes contenidos en el genoma, ya que casi todas las células
de cada organismo (excepto los espermatozoides y los óvulos, que son células
haploides) contienen exactamente el mismo conjunto de genes.
La amplificación génica
Es la replicación selectiva de ciertos genes. La amplificación génica puede
considerarse un ejemplo de control genómico, es decir, un cambio de regulación
en la organización estructural del genoma.
Deleción génica
Es decir, disminución de DNA: Un ejemplo extremo de deleción génica (también
denominada disminución de DNA) se encuentra en los eritrocitos de mamíferos, que
eliminan completamente su núcleo después de que se han sintetizado las
cantidades adecuadas de mRNA para sintetizar hemoglobina. De esta forma, más
de la mitad del contenido total de DNA del organismo se elimina de los cuerpos
celulares.
Los reordenamientos de DNA pueden alterar el genoma
Se conocen algunos casos en los que la regulación génica está basada en el
movimiento de segmentos de DNA de un sitio a otro dentro del genoma, un proceso
conocido como reordenamiento del DNA.
• Reordenamiento de los alelos de apareamiento.
Se da cuando las células haploides de dos tipos de apareamiento distintos,
denominados α y a, se fusionan dando lugar a una célula diploide. Todas las células
haploides llevan los dos tipos de alelo s de apareamiento; sin embargo, el fenotipo
de apareamiento real depende de cuál de los dos alelos, α o a, esté presente en
un sitio especial del genoma, denominado locus MAT.
El locus MAT, con el alelo α o
a, está localizado en el
cromosoma 3 de la levadura.
El locus donde se encuentra la
copia extra del alelo α se
denomina HMLα.; el locus con
una copia extra del alelo a se
denomina HMRa. En el cambio
de tipo de apareamiento, una
célula de levadura sintetiza
una copia del otro alelo de tipo
de apareamiento, HMRa o
HMÚI., e inserta este nuevo
«cassette» en el locus MAT.
Sin embargo, antes de que el
nuevo cassette pueda
insertarse, el viejo cassette
debe eliminarse.
3.1.1. Modificaciones epigenéticas
● Adición o eliminación de grupos metilo al ADN
La metilación de los residuos de citosina puede inhibir la transcripción de genes en
vertebrados. La regulación de la expresión génica mediante metilación desempeña
un importante papel en la impresión genómica, que controla la transcripción de
algunos genes relacionados con el desarrollo de mamíferos como el Cromosoma X,
durante este proceso de inactivación del cromosoma X, el DNA del mismo se metila
extensamente, las fibras de cromatina se condensan en una densa masa de
heterocromatina y cesa la transcripción génica.
● Fosforilación, metilación, acetilación y ubiquitinación de las histonas.
La metilación de la histona H3 promueve la compactación de la cromatina e inhibe
la transcripción.
Por otra parte, la acetilación (la adición de grupos acetilo a cadenas laterales de
los aminoácidos de las histonas) de residuos de lisina en las histonas tiene un efecto
opuesto, es decir, esta acetilación evita que las fibras de cromatina se condensen
dejando expuestos segmentos de ADN, para ser reconocidos por factores
transcripcionales, y se forme el complejo basal de la transcripción.
Las enzimas encargadas de agregar residuos de acetilo a las lisinas en las histonas
se denominan acetiltransferasas. La unión de un factor transcripcional al ADN
recluta a una proteína, llamada coactivador, a la región de la cromatina destinada
a la transcripción. El coactivador acetila, entonces, a las histonas de los
nucleosomas, que pierden su carga positiva, liberan el ADN del nucleosoma y dejan
libre el promotor, lo que permite la unión de más factores transcripcionales,
ensamblándose la maquinaria de transcripción e iniciando este proceso.
La eliminación de los grupos acetilo se lleva a cabo mediante desacetilasas de
histonas (HDACs, histone deacetylases).
Además de la acetilación, las cadenas laterales de los aminoácidos de las histonas
están sujetas a varias modificaciones, que incluyen la fosforilación que podría
alterar la estructura de la cromatina, y por lo tanto influir en la actividad génica.
● Heterocromatina facultativa (condensada: transcripcionalmente inactiva —
silenciada—.
La ausencia de acetilación de las histonas, combinada con la presencia de
metilación, está asociada con la condensación de la cromatina para dar lugar a la
heterocromatina inactiva.
● Eucromatina (descondensada: transcripcionalmente activa).
Otra evidencia de que las histonas afectan a la estructura de la cromatina y a su
actividad, es la observación de que la histona Hl está normalmente ausente de
regiones transcripcionalmente activas de la cromatina. Ya que la histona Hl es
necesaria para el plegamiento de la cromatina en fibras de cromatina de 30 nm, la
ausencia de la histona Hl podría ayudar a mantener la cromatina activa en forma no
enrollada de fibras de 10 nm.
Una RNA polimerasa eucariota debe interaccionar tanto con el DNA como con
proteínas específicas (factores generales de transcripción) en la región promotora
de un gen. Excepto cuando el gen está siendo transcrito, su región promotora está
embebida en la cromatina, una superestructura de fuertemente plegada y
ordenada. La descondensación de la cromatina (desplegamiento) parece ser
necesaria para la expresión de los genes eucariotas.
3.2. Transcripcional (Regulación CIS y TRANS)
En regulación Cis: Promotor (Caja Tata), Potenciadores y silenciadores
En regulación Trans: los factores de transcripción, cofactores, activadores y
represores.
a. Secuencias reguladoras de acción en CIS promotores y
estimuladores
La transcripción de los genes la controla el promotor (ejemplo caja TATA). Algunos
promotores son sencillos y están regidos por una sola señal que controla la actividad
de los genes. Otros son complejos, responden a una variedad de señales y actúan
como pequeños procesadores que interpretan e integran estas señales, controlando
así el encendido y apagado de los genes. La transcripción es, entonces, controlada
por los factores transcripcionales que se unen a estos promotores.
Además del promotor, la transcripción de la mayoría de los genes eucarióticos se
regula por otras secuencias en el ADN, llamadas potenciadores (enhancer) o
inhibidores (silencer), que se localizan a cientos o miles de bases de distancia del
sitio de inicio de la transcripción. Mutaciones en los genes que codifican para
factores transcripcionales pueden ocasionar que éstos actúen activando o
inactivando genes sin control.
Potenciadores (enhancer). Esta secuencia sirve como sitio de anclaje de factores
transcripcionales inducibles, los cuales, mediante un cambio conformacional y
formando una horquilla, interactúan directamente con los factores generales de la
transcripción y la ARN polimerasa, para inducir la transcripción.
De esta manera, la región en el ADN que controla la expresión de un gen está
conformada por el promotor y uno o más potenciadores; por lo tanto, la región
reguladora es una secuencia de ADN de tamaño variable que controla la velocidad
de transcripción (ej caja GC y caja CAAT).
b. Regulación TRANS: (Proteínas de regulación transcripcional)
Factores de transcripción:
Por otro lado, los factores de transcripción que se unen selectivamente a uno de
éstos, o a otros elementos de control del DNA localizados fuera del promotor, se
denominan factores de transcripción reguladores. Estos factores incrementan (o
en algunos casos, disminuyen) la iniciación de la transcripción, aparentemente
interaccionando con componentes del aparato de transcripción.
La regulación de la transcripción en eucariotes es mucho más compleja que en
procariotes, principalmente por dos razones:
a) Los factores transcripcionales actúan a distancia del sitio de inicio de la
transcripción.
b) La ARN polimerasa eucariótica (ARN polimerasa II) requiere de la acción conjunta
de un grupo de al menos 15 proteínas reguladoras denominadas factores generales
de la transcripción, que se ensamblan de manera coordinada y secuencial en el
promotor de los genes y que son necesarias para la acción de la ARN polimerasa
II.
Como por ejemplo los factores de transcripción al inicio de la de la transcripción
(TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH y TFIIJ (TF, transcriptional factor, y II, por
asociarse a la ARN polimerasa II)) se ensamblan de forma coordinada en el
promotor de los genes y asisten la unión y acción de la ARN polimerasa.
Estructura de los factores transcripcionales
Debido a que los factores transcripcionales son proteínas, su análisis
conformacional y cristalográfico ha permitido conocer que todos ellos presentan
dominios con estructura similar que les permiten unirse al ADN o a otros factores
transcripcionales y formar grandes complejos que regulan la expresión de los genes.
En su región de contacto con el ADN, existe una serie de aminoácidos básicos
(cargados positivamente) que le facilitan su unión al ADN, que tiene carga negativa.
Las posibles estructuras que pueden observarse en un factor transcripcional son
cuatro: hélice-vueltahélice, hélice-asa-hélice, dedos de cinc y zipper de
leucinas.
Hélice-vuelta-hélice
Fueron las primeras proteínas de unión al ADN que se reconocieron; de hecho, la
mayoría de las proteínas que se unen al ADN tienen esta conformación. Estas
proteínas constan de dos estructuras α-hélice, unidas por una cadena corta de
aminoácidos, lo que provoca un giro específico en cada una de las α-hélice y facilita
su unión al ADN. Un ejemplo de este tipo de factor transcripcional es el represor del
operón Lac.
Hélice-asa-hélice
Los factores transcripcionales que presentan esta estructura constan de una α-
hélice corta conectada por una horquilla a otra α-hélice igual o más grande,
formando homodímeros o heterodímeros. El factor transcripcional Oct-1 presenta
esta conformación.
Dedos de cinc
Un tercer grupo de proteínas de unión al ADN está formado por una estructura α-
hélice y una β-plegada, o dos α-hélices unidas por uno o más átomos de cinc, que
adquiere una forma similar a uno o más dedos. Entre los factores transcripcionales
que presenta esta estructura están los receptores de esteroides, los
glucocorticoides y estrógenos, y el factor transcripcional SP1 (de los descritos en
primer lugar).
Zipper de leucinas
La mayoría de los factores transcripcionales con esta estructura forman dímeros
para lograr una unión más fuerte al ADN, que se facilita por la presencia de residuos
de lisina en los dos monómeros alternados cada siete u ocho aminoácidos. Las
lisinas les permiten realizar interacciones hidrofóbicas que mantienen unidas a las
dos subunidades
Coactivadores:
Los factores de transcripción logran esta hazaña a través de la acción de
intermediarios conocidos como coactivadores. Los coactivadores son complejos
grandes que consisten en numerosas subunidades. Los coactivadores se pueden
dividir ampliamente en dos grupos funcionales:
1) los que interactúan con los componentes de la maquinaria de transcripción basal
(los factores de transcripción generales y la RNA polimerasa II) y
2) los que actúan sobre la cromatina, convirtiéndola de un estado que es
relativamente inaccesible para la maquinaria de transcripción a un estado que es
mucho más “amigable” con la transcripción.
Dada la gran cantidad de factores de transcripción codificados en el genoma y la
diversidad limitada de coactivadores, cada complejo coactivador funciona en
conjunción con una gran variedad de diferentes factores de transcripción. El
coactivador CBP, por ejemplo, que se analiza a continuación, participa en las
actividades de cientos de diferentes factores de transcripción.
El componente clave es la proteína de unión TATA (TBP, TATA binding protein),
que se une a la caja TATA. Su unión se ve facilitada por una serie de factores
asociados denominados factores asociados a TBP (TAFs, TBPassociated factors).
Los grupos acetilo se agregan a residuos específicos de lisina en las histonas
nucleares por una familia de enzimas llamadas histonas acetiltransferasas (HAT,
histone acetyltransferases).
La figura 12-50 muestra una serie
ordenada de reacciones que se han
propuesto que ocurren después de la
unión de un activador transcripcional,
como el receptor de glucocorticoides, a su
elemento de respuesta en el DNA.
Una vez unido al DNA, el activador recluta
un coactivador (p. ej., CBP) en una región
de la cromatina que se dirige a la
transcripción. Una vez colocado en la
región blanco, el coactivador acetila las
histonas nucleares de los nucleosomas
cercanos, lo que expone un sitio de unión
para un complejo de remodelación de
cromatina (que se analiza a continuación).
Las acciones combinadas de estos
diversos complejos aumentan la
accesibilidad del promotor a los
componentes de la maquinaria de
transcripción, que se ensambla en el sitio
donde se iniciará la transcripción.
Este último grupo de factores de
transcripción puede actuar como
activadores transcripcionales, que
estimulan la transcripción del gen adyacente,
o represores transcripcionales, que inhiben la
transcripción. El trabajo de los activadores
transcripcionales consiste en unir sitios
reguladores específicos dentro del DNA e
iniciar el reclutamiento de una gran cantidad
de complejos proteicos que provocan la
transcripción real del propio gen.
c. Estructura y función de los ACTIVADORES de la transcripción
La actividad de los factores transcripcionales se regula en su mayoría por
modificaciones postranscripcionales; es decir, la proteína se produce pero
permanece inactiva hasta que no recibe una señal de activación.
Sin embargo, hay diversos mecanismos por los cuales los factores transcripcionales
pueden activarse, que se describen en los siguientes párrafos.
1. Transcripción. El factor transcripcional se sintetiza sólo cuando se necesita y se
degrada rápidamente por proteólisis de tal manera que nunca se acumula.
2. Unión ligando-receptor. Un factor requiere de la unión de un ligando para
activarse. Un ejemplo de este tipo de factor transcripcional es el receptor de
esteroides. El receptor se encuentra inactivo en el citoplasma. Los esteroides, al ser
liposolubles, atraviesan la membrana celular por difusión simple, se unen a su
receptor en el citoplasma y lo activan, propiciando su transporte hacia el núcleo y
su unión al ADN en los promotores de los genes que contengan la secuencia de
reconocimiento.
3. Fosforilación. Es el mecanismo más común para la activación de la mayoría de
los factores transcripcionales y consiste en la adición de un grupo fosfato por una
cinasa en aminoácidos predeterminados, generalmente serina o treonina del factor
transcripcional. El factor transcripcional AP-1 es un ejemplo característico de este
mecanismo de activación.
4. Formación de complejos. El acoplamiento de varias proteínas da como
resultado un factor transcripcional activo con capacidad de migrar al núcleo y unirse
al ADN. El factor transcripcional AP-1, formado por dos subunidades, Fos y Jun, es
un ejemplo característico de este mecanismo de activación.
5. Liberación del inhibidor. El factor transcripcional se encuentra inactivado por
un inhibidor. Cuando éste es fosforilado sufre un cambio conformacional que libera
el factor transcripcional y permite su traslado al núcleo y su unión al ADN. El factor
transcripcional NF-κB se activa a través de este mecanismo en donde la proteína
que funciona como inhibidor es llamada I-κB.
d. Represores eucarióticos
Eliminación de acetilacion
La eliminación de los grupos acetilo se lleva a cabo mediante desacetilasas de
histonas (HDACs, histone deacetylases). Mientras que las HAT están asociadas
con la activación transcripcional, las HDAC se asocian con la represión
transcripcional.
Metilación del DNA
Uno de los factores clave para silenciar una región del genoma implica un fenómeno
conocido como metilación del DNA. Los grupos metilo se agregan al DNA mediante
una familia de enzimas llamadas DNA metiltransferasas codificadas en los humanos
por genes DNMT. La metilación del DNA no es un mecanismo universal para
inactivar genes eucariotas.
RNA largos no codificantes (lncRNA) como represores transcripcionales
Una gran fracción del genoma de los mamíferos se transcribe en los RNA, entre
ellos miles de especies que son lo suficientemente grandes como para ser descritas
como RNA largos no codificantes o lncRNA.
3.2. Postranscripcional (casquete 5´, cola poliA 3´y empalme alternativo)
Una vez que se transcribe un RNA, por lo general debe someterse a una serie de
eventos de procesamiento, antes de que pueda funcionar. Esto es, en particular,
cierto en el caso de los mRNA, que deben tener una estructura de casquete
agregado en 5’, estar empalmados correctamente y tener una cola intacta de poli(A)
en el extremo 3’. Cada uno de estos eventos debe estar regulado de manera
adecuada, para permitir que el mRNA salga del núcleo y sirva como plantilla para el
ensamblaje de proteínas.
1. Splicing diferencial
2. Diferentes tipos de poliadenilación
3. Estabilidad de los ARNm
4. Almacenamiento de los ARN
Exportación regulada de mRNA a través de los poros nucleares.
Control del procesamiento del ARN (splicing)
Durante la transcripción, en organismos eucariotes se producen ARN precursores
llamados transcritos primarios o pre-ARNm, posteriormente procesados para
producir una molécula de ARNm maduro a través del proceso de corte y empalme
(splicing). El tránscrito primario es aproximadamente 10 veces más grande que el
ARNm maduro. En este procesamiento, los intrones se eliminan del tránscrito
dejando exclusivamente los exones, para constituir un ARNm maduro. Un mismo
tránscrito primario puede procesarse de diversas formas, lo que da lugar a
diferentes ARNm y, por lo tanto, a diferentes cadenas polipeptídicas.
Algunos genes presentan secuencias ambiguas; es decir, regiones que en unos
tejidos se consideran exones y en otros, intrones, por lo que en cada tejido se realiza
un procesamiento diferente conocido como procesamiento o splicing alternativo,
que origina en cada uno de ellos ARNm y proteínas diferentes. Este fenómeno,
denominado ayuste alternativo del RNA, está controlado por proteínas que se
unen a las moléculas de pre-mRNA, haciendo que se ignoren algunos sitios de
ayuste y que otros se activen. Incrementando las formas de ayuste de un
determinado pre-mRNA, estos mecanismos hacen posible que un solo gen pueda
dar lugar a docenas o incluso cientos de mRNAs diferentes.
Edición del ARN
Este tipo de control postranscripcional se refiere a la modificación en una o más
bases en la secuencia del ARNm maduro que provoca cambios en el mensaje
original. La modificación más frecuente es el cambio de citocina por uracilo, con
lo que la secuencia original se altera hasta en un 50%. En el primer caso, una
citocina se cambia por un uracilo, con lo que se genera un codón de terminación
prematuro que produce una versión truncada de la proteína. En el segundo caso,
se cambia un nucleótido a la mitad de la molécula de ARNm; esto origina el
reemplazo de un aminoácido por otro, lo que altera la permeabilidad del canal de
calcio.
Control del transporte de ARN
Transporte del núcleo al citoplasma. El ARN, como cualquier otra molécula que sale
del núcleo, lo hace a través del complejo de poro. Para poder salir del núcleo, el
ARN sufre tres modificaciones importantes: la adición del nucleótido modificado
7 metilgualnosina en el extremo 5’, la adición de la cola de PoliA en el extremo
3’ y la eliminación de los intrones (splicing).
Cuando una molécula de ARNm cruza por un poro nuclear y se introduce en el
citoplasma, se encuentra con los ribosomas, que la traducen en una cadena
polipeptídica. Si el ARNm codifica para una proteína de secreción o de membrana,
la presencia de un péptido señal en la región amino terminal determina su
transporte hacia el retículo endoplásmico. La célula reconoce este péptido tan
pronto como sale del ribosoma; entonces, el complejo formado por el ribosoma, el
ARNm y la proteína naciente se dirige a la membrana del retículo endoplásmico,
donde la cadena polipeptídica terminará de sintetizarse. En otros casos la proteína
entera es sintetizada por ribosomas libres en el citosol, y señales en su estructura
la dirigen al sitio en la célula en donde se necesita.
3.4. Traducción del ARNm
3.4.1. Factores de traducción (proteínas que identifican extremo 5´)
Proteínas inhibidoras de la traducción
La expresión de un gen puede inhibirse si la traducción se bloquea mediante la
unión de proteínas inhibidoras en el extremo 5´ del ARNm cerca del sitio de inicio
de la traducción. Este tipo de mecanismo se llama control negativo de la traducción.
3.4.2. Función de microARN
Los miRNA actúan principalmente uniéndose a sitios en la UTR 3 de sus mRNA
blanco. Cada vez es más evidente que los miRNA son importantes reguladores de
casi todos los procesos biológicos. Se cree que los microRNA ejercen su actividad
reguladora mediante múltiples mecanismos
1. El trabajo más reciente respalda un modelo que se descubrió por primera vez en
embriones de peces cebra, que demostró que miR-430 funcionaba para eliminar
embriones de mRNA maternos, al inducir la desadenilación y la descomposición.
En este modelo, el emparejamiento de miRNA recluta exonucleasas en el extremo
3 de un mRNA blanco, dando como resultado un acortamiento de la cola de poli(A),
seguido de degradación.
2. Un cuerpo de evidencia también sugiere que los miRNA pueden actuar inhibiendo
la traducción de mRNA. La mayoría de las pruebas apuntan a miRNA que actúa en
el paso donde se inicia la traducción, pero también pueden actuar para bloquear el
alargamiento de la traducción.
3. Varios estudios preliminares sugieren que
los miRNA pueden reclutar proteasas que
degraden las proteínas nacientes durante la
traducción.
3.4.3. Función del 3UTR
Los mRNA contiene regiones que no codifican, llamadas regiones no traducidas
(UTRs, untranslated regions), en sus extremos 5’ y 3’. La UTR 5 se extiende desde
el casquete 5’ hasta el codón de iniciación AUG, mientras que la UTR 3’ se extiende
desde el codón de terminación hasta el final de la transcripción del RNA
La inestabilidad de estos ARNm se debe a que su secuencia rica en A y U en la
región 3’ no traducida (UTR) acelera la eliminación de la cola de poli-A y, por ende,
la degradación del ARNm. Otros ARNm son reconocidos en sus extremos 3’ UTR
por endonucleasas que cortan el ARNm. Sin embargo, la estabilidad de un ARNm
cambia en respuesta a señales extracelulares.
Una vez más, se ha demostrado que las diferencias en la secuencia de nucleótidos
de la UTR 3 tiene un papel en la velocidad a la que se acorta la cola de poli(A). Por
el contrario, los mRNA de vida corta contiene, a menudo, elementos ricos en AU (p.
ej., repeticiones de AUUUA) en su UTR 3, que desestabilizan el mensaje.
3.4.4. Degradación del ARNm
1). Como un mRNA permanece en el citoplasma, su cola de poli(A) tiende a
reducirse gradualmente en longitud, ya que es mordisqueada por un tipo de
exonucleasa conocida como desadenilasa. No se observa ningún efecto drástico
sobre la estabilidad del mRNA, hasta que la cola se acorta a cerca de 30 residuos
2). Una vez que la cola se acorta a esta longitud, el mRNA, por lo general, se
degrada rápidamente por cualquiera de las dos vías. En una de estas vías, la
degradación del mRNA comienza en su extremo 5, después de la eliminación de la
poli(A) restante en el extremo 3 del mensaje. El hecho de que la cola de poli(A) en
el extremo 3 del mensaje proteja el casquete en el extremo 5 de la molécula sugiere
que los dos extremos del mRNA se mantienen en proximidad cercana
3)Una vez que se retira la cola 3 el mensaje se decapita
4) y se degrada desde el extremo 5 hacia el extremo 3
5). La desadenilación, la descapsulación, y la degradación del 5 → 3 ocurre dentro
de pequeños gránulos citoplasmáticos transitorios llamados cuerpos P Además de
destruir los mRNA “no deseados”, los cuerpos P también pueden actuar como sitios
donde los mRNA que ya no se traducen se almacenan temporalmente.
3.5. Modificaciones postraduccionales a proteínas sintetizadas en ribosomas
libres y su utilidad
Muchas cadenas polipeptídicas se modifican mientras están unidas al complejo
ribosomal o cuando finaliza su síntesis. Como las modificaciones se realizan ya
iniciada la traducción se denominan modificaciones postraduccionales. Tras la
traducción hay proteínas enzimáticas que ya son activas y otras que precisan ser
modificadas. En estas modificaciones participan remociones de aminoácidos
(generalmente se separa el aminoácido metionina o aminoácido iniciador); la
adición de uno o varios grupos químicos, y la asociación de iones o coenzimas
(grupo prostético) en algunas enzimas.
Las proteínas pueden estar constituidas por una cadena polipeptídica o por varias
subunidades, y estas últimas pueden ser iguales o distintas, según provengan del
mismo gen o de genes diferentes. El control de calidad del plegamiento de las
proteínas para adquirir la estructura cuaternaria o conformación tridimensional se
lleva a cabo por chaperonas y proteasas. Las proteínas chaperonas tienen la
función de plegar o replegar de forma correcta las proteínas recién sintetizadas
(modificación postraduccional), y las proteasas deben degradar aquellas proteínas
que, a pesar de la acción de las chaperonas, no se pliegan de forma correcta.
● Acetilación
Muchas proteínas están modifi cadas en su N-terminal. En la mayoría de los casos,
la metionina (iniciador) es hidroxilada y un grupo acetilo se agrega al nuevo
aminoácido N-terminal; se observa hasta en un 50% en proteínas de eucariotas.
Uno de los efectos que presentan esta modifi cación es el incremento de la
resistencia a su degradación. También se observa una acetilación en la lisina de la
histona H4 de manera reversible, que le hace responsable de la regulación de la
condensación de la cromatina.
● Metilación
La metilación postraduccional de las proteínas ocurre en los nitrógenos y en los
oxígenos; el donador de grupos metilo activado es la S-adenosilmetionina (SAM).
Las metilaciones más comunes están en la ε-amina de los residuos de lisina, y
algunas metilaciones de nitrógeno adicionales se encuentran en el anillo imidasólico
de la histidina, en el grupo guanino de la arginina y en los grupos R del glutamato
y del aspartato. La N metilación es una modificación permanente y no se conocen
enzimas en los mamíferos que puedan eliminar el grupo metilo
● Fosforilación
La fosforilación postraduccional es una de las modifi caciones de la proteína más
comunes que ocurren en las células animales y actúa casi siempre de forma
reversible (fosforilación y desfosforilación). La gran mayoría de fosforilaciones
ocurren como un mecanismo para regular la actividad biológica de una proteína
(regulación por modifi cación covalente).
En otros términos, un fosfato (o más de uno en muchos casos) se agrega y después
se quita. Las proteínas que provocan la fosforilación son las cinasas y las que
eliminan los fosfatos son las fosfatasas.
● Ubiquitinación
Modificación post-traduccional dependiente de
ATP que consiste en la unión covalente de
ubiquitina a proteínas intracelulares.
o La primera etapa es una reacción ATP-
DEPENDIENTE, el carboxilo de la ubiquitina
se conjuga vía un enlace tio-éster con el
enzima E1 que se encarga de activar la Ub
o En la segunda la Ub es tranferida a un
sulfridrilo de una de los muchos enzimas
E2s.
o Y en la tercera la E3-ligasa se encarga de la
transferencia de la Ub-activada por la E2 al
grupo amino de una Lys de una proteína
previamente seleccionada.
● Proteólisis
Probablemente la gran mayoría de las proteínas maduras deben modificarse de esta
manera: a todas se les deben retirar algunas porciones de la cadena [metionina (o-
Met)], después de emerger del ribosoma. Muchas proteínas involucradas en una
gama de procesos biológicos se sintetizan como precursores inactivos, que se
activan en condiciones adecuadas mediante la proteólisis limitada. A las proteínas
inactivas, activadas al retirarles segmentos de la cadena, se las denomina
proproteínas, y a los segmentos extraídos, propéptidos.
3.6. Modificaciones postraduccionales a proteínas sintetizadas en ribosomas
adheridos
● Eliminación del péptido señal
● Glicosilación
Se le da este nombre debido a que se unen de manera covalente las cadenas de
oligosacáridos (glicanos), con algunos aminoácidos de la cadena proteica y en
general no desempeña un papel en la regulación de la actividad de la proteína. Sin
embargo, debido al fenómeno hidrofílico de los azúcares, mantienen la solubilidad
de las glicoproteínas y aseguran el plegamiento correcto de los dominios, por lo que
dan la estabilidad extracelular de la proteína contra la degradación. Esta
modificación es frecuente en proteínas de membrana, y casi no se observan en
proteínas intracelulares
● Hidroxilación
La función de un gran número de hidroxilasas, presentes en el RE, es la de catalizar
la incorporación de grupos –OH a algunas proteínas. Estas modificaciones que
dependen de la vitamina C como cofactor incluyen hidroxilaciones de prolina, lisina
(se observa en 50% de las prolinas presentes en colágeno) y la amidación del C-
terminal. Las enzimas que se hidroxilan se identifican como prolil hidroxilasa y lisil
hidroxilasa. Las proteínas hidroxiladas más importantes son los colágenos. Varias
hormonas peptídicas, como la oxitocina y la vasopresina, tienen amidación el C-
terminal.
● Formación de puentes disulfuros
Los enlaces de disulfuro se forman generalmente en el lumen del RER, pero no en
el citosol, por la enzima proteína- disulfuro isomerasa. Esto se debe al ambiente
oxidante del retículo endoplásmico y al ambiente reductor del citosol.
Así, los enlaces de disulfuro se encuentran, sobre todo, en proteínas secretoras,
lisosomales, y en los dominios exoplasmáticos de las proteínas de la membrana.
TEMA: EL CICLO CELULAR, SUS MECANISMOS DE REGULACIÓN Y
CONSECUENCIAS DE FALLOS EN LA REGULACIÓN
1. Definición de ciclo celular y gasto energético
Cada célula pasa por una serie de etapas definidas, que constituyen el ciclo celular
Este se puede dividir en dos fases principales: fase M e interfase.
2. Requisitos para la progresión del ciclo celular
● Daños en el genoma y su reparación a lo largo del ciclo
● Factores tróficos
● Disponibilidad de nutrientes para síntesis de las biomoléculas
3. Fases del ciclo celular
A. Interfase: definición y descripción de los eventos
Es el periodo entre las divisiones celulares, es un momento en que la célula crece
y se involucra en diversas actividades metabólicas. Mientras que la fase M por lo
general dura alrededor de una hora, en los mamíferos la interfase puede extenderse
durante días, semanas o más, en dependencia del tipo de célula y las condiciones.
● Fase G0
○ Metabolismo activo sin proliferación
Se dice que muchas células en el cuerpo están inactivas, lo que significa que están
en un estado que no las llevará a una próxima división celular, aunque conservan la
capacidad de dividirse si las condiciones cambian. Las células inactivas a menudo
se describen como que se encuentran en el estado G0, para diferenciarlas de las
típicas células de fase G1 que pueden entrar pronto en la fase S. Una célula debe
recibir una señal promotora del crecimiento para pasar de G0 a la fase G1, y así
reingresar al ciclo celular.
● Fase G1
○ Síntesis proteica (histonas, proteínas necesarias para la replicación y regulación
del inicio del ciclo).
○ Síntesis de desoxirribonucleótidos trifosfatados
● Fase S
(1) Definición de replicación (síntesis de ADN)
La autoduplicación es la capacidad que presenta el material genético de actuar
como plantilla de copiado de sí mismo, en la fase S previa a la división celular. Este
proceso permite la continuidad de la vida al garantizar un mecanismo que traspase
la información genética entre generaciones.
La replicación del ADN ocurre una sola vez por ciclo celular, lo cual está bajo estricto
control molecular.
• El resultado del proceso de duplicación será que cada molécula de ADN dé
origen a dos moléculas hijas idénticas entre sí, e idénticas a la molécula
parental o molde.
• Cada una de estas dos moléculas hijas es denominada en eucariontes
cromátide hermana y se mantendrán juntas hasta ser separadas durante la
división celular.
• Las dos cromátides hermanas constituyen un cromosoma duplicado que solo
podrá visualizarse durante la división celular.
• En eucariontes, la replicación demanda la producción de histonas.
(2) Características generales de la replicación (semiconservadora,
bidireccional, discontinua)
La replicación del ADN es semiconservativa ya que las nuevas hélices de ADN
están formadas por una cadena original (preexistente) que sirvió de molde y una
cadena nueva (recién sintetizada).
La replicación es bidireccional. Comenzada en un punto de la molécula de ADN el
proceso se desarrolla hacia los dos extremos de la cadena; en cada lazo, los
extremos u horquillas de replicación avanzan en el proceso de síntesis hasta
completar la copia.
(3) Fases de la Replicación y proteínas encargadas
(a) Iniciación:
(i) Reconocimiento de sitios de inicio de replicación (Proteínas de reconocimiento
de sitio de origen ORC, topoisomerasas)
Las células eucarióticas replican su genoma en pequeñas porciones, denominadas
replicones. Cada replicón tiene su propio origen a partir del cual las horquillas de
replicación avanzan hacia afuera en ambas direcciones. Los replicones localizados
muy juntos en un cromosoma dado experimentan replicación simultáneamente.
Nota: Las regiones más altamente compactadas y menos acetiladas del cromosoma
están empaquetadas en heterocromatina, y son las últimas regiones en ser
replicadas.
En el centro de cada replicón se encuentra un origen de replicación donde la síntesis
de DNA se inicia, el fragmento de DNA insertado se denominó secuencia de
replicación autónoma o ARS. En primer lugar, se une al ARS un complejo
multiproteico conocido como Complejo de Reconocimiento de Origen (ORC). El
siguiente componente que se une es el complejo MCM, que contiene varias
enzimas denominadas helicasas
del DNA, que facilitan la
replicación del DNA,
desenrollándolo. Para el
reclutamiento del complejo MCM al
sitio de origen, se requiere un
tercer grupo de proteínas,
conocido como cargadores de
helicasas, que median la unión de
las proteínas del MCM al ORC. En
este momento, el grupo completo
de proteínas unidas al DNA se
denomina complejo de pre-
replicación y se dice que el DNA
está «autorizado» para replicarse.
Sin embargo, la replicación no
comienza hasta que se incorporan
varias proteínas adicionales,
incluidas las enzimas que catalizan
la síntesis del DNA.
La replicación siempre comienza en lugares
específicos del ADN, que se llaman orígenes
de replicación y se reconocen por su
secuencia.
Proteínas especializadas reconocen el origen,
se unen a este sitio y abren el ADN. Conforme
se abre el ADN, se forman dos estructuras en
forma de Y llamadas horquillas de
replicación, en conjunto conforman lo que se
llama burbuja de replicación. Las horquillas
de replicación se mueven en direcciones
opuestas a medida que avanza la replicación.
(ii) Formación del replicón y las burbujas de replicación (acción de: helicasa,
proteínas estabilizadoras de unión al ADN monocatenario, primasa)
Los estudios de la formación del pre-RC se han centrado en un conjunto de seis
proteínas MCM relacionadas (Mcm2-Mcm7). Las proteínas MCM se cargan en el
origen de replicación en una etapa tardía de la mitosis, o poco después, con la ayuda
de factores accesorios que se han unido previamente al ORC.
Las seis proteínas Mcm2-Mcm7
interactúan entre sí para formar un
complejo hexámero (de seis miembros)
en forma de anillo (el complejo MCM)
que posee actividad helicasa. La
evidencia sugiere con fuerza que el
complejo MCM es la helicasa
replicativa eucariota; es decir, la
helicasa responsable de desenrollar el
DNA en la horquilla de Replicación. En
la etapa pre-RC mostrada en el paso 2,
cada uno de los orígenes contiene un
complejo MCM doble hexamérico, es
decir, dos helicasas replicativas
completas, que permanecen inactivas
en esta etapa del ciclo celular. Cada una
de estas réplicas viajará en direcciones
opuestas lejos del origen una vez que
comience la replicación.
(b) Elongación:
(i) Características de las ADN polimerasa
La replicación del ADN está a cargo de una familia de enzimas denominadas en
conjunto ADN polimerasas (ADN Pol). Una característica general de todas ellas es
poseer un único sentido de síntesis: 5’→3’.
Dado que la molécula de ADN está formada por dos cadenas antiparalelas, cuando
ambas cadenas son separadas al inicio de la replicación, solo una de ellas queda
expuesta en la orientación correcta (3’ → 5’) para permitir la síntesis continua, esta
cadena se denomina cadena adelantada o cadena líder.
La otra cadena nueva, que corre de 5' a 3' y se aleja de la horquilla, es más difícil.
Esta cadena se produce en fragmentos porque, conforme avanza la horquilla, la
ADN polimerasa (que se aleja de la horquilla) debe separarse y volver a unirse al
ADN recién expuesto. Esta cadena más difícil, que se produce en fragmentos, se
llama cadena rezagada.
Una característica compartida por todas las ADNPol es su actividad exonucleasa
3´→ 5´. Esta actividad les permite, en caso de comprobar que el nucleótido recién
adicionado es erróneo y que existe un apareamiento de bases incorrecto, eliminar
dicho nucleótido y reemplazarlo por el correcto antes de continuar la polimerización
en sentido 5´→ 3´. Este mecanismo de corrección de pruebas se desarrolla durante
el proceso mismo de replicación.
Otros enzimas que participan en el proceso de replicación
Para la replicación se necesitan, aparte de las ADN polimerasas descritas, alrededor
de 20 proteínas diferentes, el conjunto de las mismas se denomina sistema ADN
replicasa o replisoma ya que aunque no formen una unidad física, constituyen una
unidad funcional. Dentro de las enzimas que participan están:
Helicasas, enzimas que separan las dos cadenas de la molécula de ADN parental.
Desplazándose a lo largo de la molécula de ADN eliminan los enlaces entre las
cadenas consumiendo en el proceso ATP.
La primasa hace un cebador de ARN, un corto segmento de ácido nucleico
complementario al molde, que proporciona un extremo 3' con el que la ADN
polimerasa puede trabajar. Un cebador típico es de cinco a diez nucleótidos de
largo. El cebador ceba la ADN polimerasa, es decir, le proporciona lo que necesita
para funcionar. Una vez que el cebador de ARN está en su sitio, la ADN polimerasa
lo "extiende", añadiendo nucleótidos uno a uno para hacer una cadena nueva de
ADN complementaria a la cadena molde.
La topoisomerasa también juega un papel importante de mantenimiento durante la
replicación del ADN. Esta enzima impide que la doble hélice de ADN que está por
delante de la horquilla de replicación se enrolle demasiado cuando se abre el ADN.
Actúa haciendo mellas temporales en la hélice para liberar la tensión, las cuales
vuelve a sellar para evitar daños permanentes lo relajan.
Proteínas fijadoras de ADN, proteínas que estabilizan las cadenas separadas
uniéndose a ellas.
ADN ligasas, enzimas que se encargan de unir trozos formados de cadenas,
realizando un enlace fosfodiéster entre los nucleótidos pertenecientes a dos
segmentos de una cadena
(ii) Tipos de ADN polimerasa y función.
Hasta la fecha, se han aislado cinco DNA polimerasas “clásicas” a partir de células
eucariotas, y se denominan α, β, Y, δ y ε. De estas enzimas, la polimerasa γ replica
el DNA mitocondrial y las funciones de la polimerasa β en la reparación del DNA.
Las otras tres polimerasas tienen funciones replicativas.
La polimerasa α está estrechamente asociada con la primasa, y juntas inician la
síntesis de cada fragmento de Okazaki. El complejo de polimerasa α-primasa
reconoce y se une al DNA desenrollado que está recubierto por una proteína de
unión a DNA de hebra simple llamada RPA. La primasa inicia la síntesis mediante
el ensamblaje de un RNA primario corto, que luego se amplía mediante la adición
de aproximadamente 20 desoxirribonucleótidos por la polimerasa α.
La polimerasa δ requiere una “abrazadera corrediza” que ata la enzima al DNA, lo
que permite que se mueva progresivamente a lo largo de una plantilla. La
abrazadera corrediza de células eucariotas es muy similar en estructura y función
a la abrazadera de la E. coli. En eucariotas, la abrazadera corrediza se llama PCNA.
El cargador de abrazadera que carga PCNA en el DNA se llama RFC. Después de
sintetizar un RNA-DNA primario, la polimerasa α se reemplaza en cada unión
plantilla-primario por el complejo de PCNA-polimerasa δ, que completa la síntesis
del fragmento de Okazaki. Cuando la polimerasa δ alcanza el extremo 59 del
fragmento de Okazaki previamente sintetizado, la polimerasa continúa a lo largo
de la hebra plantilla retrasada y desplaza al primario. El primario desplazado se
corta de la hebra de DNA recién sintetizada mediante una endonucleasa (FEN-1)
y la muesca resultante en el DNA se sella mediante una DNA ligasa. Se cree que
FEN-1 y la DNA ligasa se reclutan en la horquilla de replicación a través de una
interacción con la abrazadera corrediza PCNA.
A medida que la enzima helicasa abre la doble hélice, dos enzimas
complementarias: la topoisomerasa I y la topoisomerasa II o girasa, van
disminuyendo la tensión torsional acumulada por el superenrollamiento en el sector
no replicado de la doble hélice.
(iii) Formación de fragmentos de Okazaki
La otra cadena molde queda expuesta en la orientación 5’ → 3’. Su hebra hija debe
necesariamente ser sintetizada en forma discontinua, ya que la dirección de síntesis
(5´ → 3´) es opuesta a la dirección en que avanza la horquilla. Por ello, esta cadena
hija se denomina cadena rezagada o discontinua. Se generan así, pequeñas
cadenas denominadas fragmentos de Okazaki, los cuales se unen entre sí a medida
que se sintetizan, por acción de la enzima ADN-ligasa.
(c) Terminación:
(i) Maduración de fragmentos de Okazaki (remoción de cebadores y unión de
extremos resultantes)
Por último, se debe hacer un poco de trabajo de limpieza si queremos que el ADN
no contenga ARN ni brechas. La ADN polimerasa I, la otra polimerasa que participa
en la replicación, elimina los cebadores de ARN y los sustituye por ADN. La enzima
ADN ligasa sella las brechas que permanecen después de reemplazar los
cebadores.
(ii) Replicación del telómero (Función de la telomerasa)
Para evitar la pérdida de genes por el desgaste de los extremos del cromosoma, las
puntas de los cromosomas eucariontes tienen “tapones” de ADN especializado
llamadas telómeros. Los telómeros se componen de cientos o miles de repeticiones
de la misma secuencia corta de ADN, que varía entre organismos, pero en seres
humanos y otros mamíferos es 5'-TTAGGG-3'.
Los telómeros necesitan protegerse de los sistemas de reparación del ADN de la
célula porque tienen cadenas sobresalientes que "parecen" ADN dañado. La
cadena sobresaliente en el extremo de la cadena rezagada del cromosoma se debe
a la replicación incompleta de los extremos. La parte sobresaliente en el extremo de
la cadena líder del cromosoma se genera por enzimas que cortan y eliminan parte
del ADN^1.
En algunas especies (como los seres humanos), las cadenas sobresalientes se
unen a repeticiones complementarias en ADN de doble cadena cercano y causan
que los extremos del telómero formen bucles protectores. Las proteínas asociadas
a los extremos de los telómeros también ayudan a protegerlos y evitan que se
activen vías de reparación del ADN.
Las repeticiones que componen un telómero se pierden lentamente después de
muchos ciclos de división, y proporcionan un amortiguador que protege las regiones
internas del cromosoma que contienen los genes (al menos por un periodo de
tiempo). El acortamiento de los telómeros se ha relacionado con el envejecimiento
celular y la pérdida progresiva de los telómeros podría explicar por qué las células
solo pueden dividirse un cierto número de veces
Telomerasa
Algunas células tienen la capacidad de revertir el acortamiento de los telómeros por
la expresión de la telomerasa, una enzima que extiende los telómeros de los
cromosomas. La telomerasa es una ADN polimerasa dependiente de ARN, lo que
significa que es una enzima que puede producir ADN usando un molde de ARN.
La enzima extiende (añade
nucléotidos a) la cadena
sobresaliente de ADN
telomérico al usar este ARN
complementario como molde.
Cuando la proyección tiene un
largo suficiente, la maquinaria
de replicación del ADN normal
(es decir, la que usa cebadores
de ARN y ADN polimerasa)
puede sintetizar una cadena
complementaria y se produce
ADN de doble cadena.
El cebador no puede colocarse
justo en el extremo del
cromosoma y no puede
reemplazarse por ADN, por lo
que todavía estará presente una
cadena sobresaliente. Sin
embargo, la longitud total del
telómero será mayor.
● Fase G2: eventos importantes
(1) Revisión y corrección de la replicación
Durante la fase del segundo intervalo, o fase G2 la célula crece más, hace proteínas
y organelos, y comienza a reorganizar su contenido en preparación para la mitosis.
La fase G2 termina cuando la mitosis comienza.
• Síntesis de proteínas esenciales para la división celular.
• Aparecen factores proteicos solubles.
• Transcripción diferencial para la síntesis de la “maquinaria” del huso acromático
o mitótico.
• También duplica una estructura de organización de microtúbulos llamada
centrosoma. Los centrosomas ayudan a separar el ADN durante la fase M.
• Duplicación de centriolos y condensación de cromatina o cromosomas.
Punto de transición de G2-M:
Verifica que el ADN se duplique completa y exactamente. Se ve influenciado por:
a. Tamaño celular
b. Daño ADN
c. Replicación del ADN
B. Fase M: Definición de cariocinesis (mitosis y meiosis) y citocinesis.
Durante la fase mitótica (M), la célula separa su ADN en dos grupos y divide su
citoplasma para formar dos nuevas células.
• Condensación progresiva de toda la cromatina, formación de cromosomas.
• La transcripción cesa por completo.
• La actividad de síntesis de proteínas disminuye.
• Implica dos procesos: mitosis y citocinesis.
• La mitosis ocurre en cuatro etapas: profase, metafase, anafase y telofase.
Punto de transición de Metafase-Anafase:
Verifica que los cromosomas estén alineados correctamente en la placa de la
metafase. Se ve influenciado por:
a. Unión de cromosomas al huso mitótico
4. Regulación del ciclo celular
A. Eventos que ocurren en los puntos de revisión del ciclo celular y proteínas
implicadas
● Activadoras del ciclo (ciclinas y cinasas dependientes de ciclinas)
CDK
Se ha encontrado que las Cdk (cinasas dependientes de ciclinas) no solo están
involucradas en la fase M, sino que son las agentes clave que orquestan las
actividades a lo largo del ciclo celular. Las Cdk llevan a cabo esta función mediante
la fosforilación de una gran variedad de proteínas. Cada evento de fosforilación
ocurre en un punto apropiado durante el ciclo celular, estimulando o inhibiendo de
ese modo un proceso celular particular involucrado en la división celular.
Ciclinas
Las ciclinas son proteínas cuya concentración oscila elevándose y reduciéndose,
permitiéndoles así controlar la actividad de varias Cdks en diferentes puntos del
ciclo celular.
● En Interfase
o De G1 a S
La ciclina D-Cdk4/6 de G1 regula la progresión a
través del punto de restricción, mediante la
fosforilación de la proteína Rb. La proteína Rb,
una molécula que controla la expresión de genes
cuyos productos son necesarios para traspasar el
punto de restricción y entrar en la fase S. Antes de
ser fosforilado Rb se une e inhibe al factor de
transcripción E2F, Mientras la proteína Rb
permanezca unida a E2F, la molécula de E2F es
inactiva y estos genes permanecen silenciados,
impidiendo que la célula entre en la fase S.
Pero cuando se estimula a la célula a dividirse
mediante la adición de factores de crecimiento, se
activa una ruta que produce y activa a las Cdk-
ciclinas de G1 que catalizan la fosforilación de Rb.
La fosforilación de Rb bloquea la capacidad de Rb
de unirse a E2F, quedando E2F libre.
La fosforilación de la pRb conduce a la transcripción de varios genes, incluidos los
que codifican las ciclinas E y A, la Cdk1 y las proteínas implicadas en la
replicación.
La transición G1-S, que incluye el inicio de la replicación, está dirigida por la
actividad de los complejos ciclina E-Cdk2 y ciclina A-Cdk2. Es normal que el inicio
de la duplicación del centrosoma en la transición G1-S se desencadene por la
fosforilación de una proteína centrosómica por la Cdk2, el mismo agente
responsable del inicio de la replicación del DNA
P53 vigilante tumoral o guardián del genoma
Vigila que el ADN sea material de calidad y que no tenga mutaciones dañinas.
Detiene el ciclo célula en etapa G1. Sintetiza P21 y esta inhibe la Cdk ciclina de G1,
al no fosforilar Rb se detiene el ciclo y permite que se pueda corregir el material
genético.
Si no se corrige el defecto del ADN entra en un proceso de apoptosis, por medio de
un modulador PUMA que inhibe la Bcl-2 y programa su muerte.
o Intra S
En las células de mamíferos, por ejemplo, la actividad de un complejo de ciclina E-
Cdk2 conduce a la célula a la fase S. El paso del S a G2 requiere la activación de
la cdk2 por un grupo diferente de ciclinas como la ciclina A.
o De G2 a M
Las Cdk que contienen una ciclina mitótica que fosforilan los sustratos requeridos
para que la célula entre en la mitosis. La actividad de un complejo de ciclina B1-
Cdk1 (el MPF de mamífero) conduce a la célula a la mitosis.
La actividad de la ciclina B1-Cdk1 durante el G2 evita que una célula vuelva a
replicar el DNA que ya se ha replicado antes en el ciclo celular. Esto ayuda a
garantizar que cada región del genoma se replique una vez, y solo una, por ciclo
celular. La transición de G2 a M y el paso a M temprana se debe a la actividad
secuencial de los complejos ciclina A-Cdk1 y ciclina B1-Cdk1, que fosforilan
sustratos tan diversos como proteínas citoesqueléticas, histonas y proteínas de la
envoltura nuclear.
Los tres componentes principales de la envoltura nuclear —los complejos de poro
nuclear, la lámina y las membranas nucleares— se desmontan en procesos
separados. Sin embargo, todos estos procesos se deben iniciar por la fosforilación
de sustratos clave mediante cinasas mitóticas, particularmente la ciclina B-Cdk1.
CDK-Mitótico
la activación de B1-Cdk1 (MPF) también requiere la fosforilación y desfosforilación
de la propia Cdk. La unión de la ciclina mitótica a la Cdk mitótica produce un
complejo ciclina-Cdk que es inactivo (paso 1). Para desencadenar la mitosis, el
complejo requiere la incorporación de un grupo fosfato activador en un determinado
aminoácido de la Cdk. Sin embargo, antes de que se produzca esta fosforilación,
unas quinasas inhibitorias fosforilan la molécula de Cdk en otras dos posiciones,
bloqueando el sitio activo (paso 2). Posteriormente, una quinasa activadora añade
el grupo fosfato activador, marcado en amarillo en el paso 3. La última etapa de la
secuencia de activación es la eliminación de los fosfatos inhibido res, por la
actuación de una fosfatasa específica (paso 4).
Una vez que las fosfatasas han eliminado los fosfatos inhibidores, se establece un
bucle de retroalimentación: la Cdk mitótica activada generada por esta reacción
estimula a la fosfatasa, y hace que el proceso de activación suceda más
rápidamente. La Cdk-ciclina activa provoca ahora la entrada en mitosis
● En fase M
o Metafase a Anafase
La Cdk-ciclina mitótica contribuye a la activación del complejo promotor de la
anafase
La Cdk-ciclina mitótica participa en este proceso fosforilando y contribuyendo de
esta manera a la activación del complejo promotor del anafase, un complejo
multiproteico, que controla las fases finales de la mitosis promoviendo la destrucción
de determinadas proteínas. El complejo promotor del anafase es una ubiquitina
ligasa, un tipo de enzima que marca a proteínas específicas para su degradación,
mediante la unión de la pequeña proteína ubiquitina. Las proteínas que han sido
marcadas con ubiquitina se destruyen después
La Cdk-ciclina mitótica participa en este proceso fosforilando y contribuyendo de
esta manera a la activación del complejo promotor de la anafase, un complejo
multiproteico, que controla las fases finales de la mitosis promoviendo la destrucción
de determinadas proteínas. El complejo promotor de la anafase es una ubicuitin
ligasa, un tipo de enzima que marca a proteínas específicas para su degradación,
mediante la unión de la pequeña proteína ubicuitina. Las proteínas que han sido
marcadas con ubiquitina se destruyen después
Cuando el APC/C se activa, transfiere
tres ubiquitinas a la ciclina B1 y a la
proteína segurina, marcándolas de este
modo para su degradación vía
proteosoma 26S. La segurina es
importante porque se encarga de
mantener secuestrada a la proteasa
separasa; cuando ésta es liberada,
gracias a la degradación de la segurina,
tiene lugar la degradación de la
cohesina que mantiene unidas a las
cromátidas hermanas. La degradación
de la cohesina permite la segregación
cromosómica, mientras que la
degradación de la ciclina B1 tiene como
resultado la inactivación de la CDK1;
gracias a esto se consigue salir de
mitosis.
● Inhibidoras del ciclo (p53, p21 y otras)
Punto de control de DNA dañado
Revisan la existencia de alteraciones y que detienen el ciclo celular en las fases G
1 tardía, S o G2 tardía, gracias a la inhibición de complejos Cdk-ciclina diferentes.
Una proteína denominada p53, denominada a menudo «el guardián del genoma»,
desempeña un papel capital en estas rutas de control. Cuando las células se
encuentran con agentes que producen un daño de gran alcance en el DNA, éste
provoca la activación de una enzima denominada proteín quinasaATM, que a su vez
cataliza la fosforilación de p53 (y de muchas otras proteínas diana). La fosoforilación
de p53 impide su interacción con Mdm2, una proteína que de otra manera marcaría
a p53 para su destrucción, añadiendo ubicuitina (de la misma manera que el
complejo promotor de la anafase marca a proteínas para su degradación
provocando su unión a ubiquitina). La fosforilación de p53, mediada por ATM, la
protege de su degradación, permitiendo que aumente p53 en presencia de DNA
dañado.
La acumulación de p53 a su vez activa
dos procesos: la detención del ciclo y
la muerte celulares. Ambas
respuestas se basan en la capacidad de
p53 de unirse al DNA y de actuar como
un factor de transcripción que estimula
la transcripción de genes específicos.
Uno de los genes claves activados por
p53 es el gen que codifica a p21, una
proteína que detiene la progresión del
ciclo celular en múltiples puntos
inhibiendo la actividad de varias Cdk-
ciclinas diferentes. p53 fosforilada
también estimula la producción de
enzimas implicadas en la reparación del
DNA. Pero si el daño no puede ser
reparado con éxito, p53 activa
entonces un grupo de genes que
codifica para proteínas implicadas en
desencadenar la muerte celular por
apoptosis. Una proteína clave en esta
ruta, llamada Puma (<<modulador de la
apoptosis regulado al alta por p53»),
promueve la apoptosis uniéndose e in
activando a un inhibidor común de la
apoptosis, conocido como Bcl-2.
B. Duración del ciclo celular en humanos
5. Origen de las mutaciones
A. Mutación natural (errores durante la replicación)
Son aquellas que se producen en condiciones naturales de crecimiento, influidas
por el medio ambiente. Éstas representan la base de la evolución.
B. Mutaciones inducidas
Son aquellas provocadas por algún mutágeno (agente exógeno tanto físico, químico
o biológico con la capacidad de provocar mutaciones en una tasa mayor a la basal).
● Definición de mutágenos y tipos (físicos, químicos y biológicos)
Un mutágeno es un agente que ocasiona que se incremente a frecuencia en la que
ocurren las mutaciones. Son sustancias o agentes que tienen la capacidad de
ocasionar cambios en el material genético de las células vivas. La efectividad de
una sustancia con capacidad mutagénica se determina por el aumento en la tasa
de mutación espontánea que provoca. Se ha descrito que más de la mitad de los
carcinógenos son mutágenos.
La acción de los mutágenos debe entenderse por efecto directo que producen sobre
la molécula de ADN o por las consecuencias que genera de forma indirecta, cuando
se rebasa la capacidad de los mecanismos de reparación para corregir este daño.
• Agentes físicos: los agentes físicos son radiaciones que alteran la estructura y la
secuencia del ADN. Ejemplos de ello son: la radiación ultravioleta, la radiación
ionizante, las partículas alfa, beta y gamma, el choque térmico o las radiaciones
electromagnéticas.
• Agentes químicos: compuestos que tienen la capacidad de alterar la estructura del
ADN al reaccionar directamente con ella o intercalarse entre los nucleótidos,
Ejemplos: los colorantes de acridina, la formalina, el ácido nitroso, agentes
alquilantes, el benzopireno, el ácido bórico, la colchicina, el LSD, la nicotina, el
sulfato de cobre o el ácido fórmico, entre otros.
• Agentes biológicos: son organismos que tienen la capacidad de alterar la
estructura del material genético de su hospedero, al integrarse al ADN de este
último, los virus, las bacterias, los hongos, etcétera.
● Definición de teratógeno
Existen agentes químicos presentes en el ambiente con capacidad de causar daño
al ser humano durante el periodo de vida perinatal denominados teratógenos. Estos
compuestos pueden producir efectos adversos, tanto fisiológicos como bioquímicos,
en cualquiera de las etapas del desarrollo, y con frecuencia causan muerte en el
útero, abortos, prematurez e intoxicaciones neonatales, entre otros daños.
● Definición de cancerígeno
El cáncer es un proceso genético en el que una serie de mutaciones en secuencia
dirigen a la malignización de una célula en división. Se desencadena como
consecuencia de múltiples mutaciones que provocan un crecimiento anormal de las
células hasta convertirse en masas de tejido conocidas como tumores o neoplasias.
El proceso inicia cuando se producen alteraciones irreversibles en la información
genética que convierten genes normales en anormales (por ejemplo,
protooncogenes en oncogenes), capaces de inducir la iniciación del tumor.
Posteriormente, factores ambientales hacen que estas células con información
genética alterada desarrollen más mutaciones, y la acumulación de mutaciones
ocasiona que escapen a los mecanismos de reparación y a las restricciones de
proliferación, lo que las lleva a multiplicarse sin control.
6. Clasificación de las mutaciones
A. De acuerdo con el tipo de célula afectada
● Somática
Es aquella que ocurre en cualquier célula del cuerpo, excepto en las células
germinales, por lo que no se transmiten a la descendencia, sólo a las células que
se originen a partir de ésta, y desaparece al morir el individuo. Si la mutación se
produce en un tejido cuyas células están en división, existe la posibilidad de que
surja un clon mutante que descontrole la célula de tal forma que se pueda
desencadenar una neoplasia. En cambio, si la mutación ocurre en una célula que
no volverá a dividirse, entonces su efecto será mínimo o nulo (el mejor escenario
posible).
● Germinal
Es aquella que ocurre en la línea germinal, las células sexuales (óvulo y
espermatozoide). Este tipo de mutaciones se transmiten a la siguiente generación
si una célula mutada participa en la fecundación. Las mutaciones germinales no
dañan al individuo en sí mismo; esto es, un individuo con un fenotipo normal y sin
antecedentes familiares de alteraciones fenotípicas puede ser portador de células
germinales mutadas no detectadas, que sólo se detectarán si se incorporan a un
cigoto, de tal forma que al ser heredadas podrían desencadenar una enfermedad.
B. De acuerdo a la magnitud del material genético afectado
● Puntual o génica (silenciosa, sin sentido, de sustitución de bases)
Ocurre en un par de bases o en un número reducido de bases adyacentes y puede
deberse a modificaciones químicas del ADN que cambian una base nitrogenada por
otra diferente. De acuerdo con las bases sustituidas, las mutaciones puntuales
pueden clasificarse en dos grupos: transición (cambio de un nucleótido por otro de
la misma clase; es decir, purina por purina o pirimidina por pirimidina), y
transversión (cambio de un nucleótido por otro de diferente clase; es decir, purina
por pirimidina o pirimidina por purina).
También pueden deberse a alteraciones durante el mecanismo de replicación del
ADN, lo que provoca la incorporación de una base errónea en una cadena sencilla
de ADN. Una mutación puntual puede regresar a su secuencia original mediante
una mutación compensatoria, por medio de un fenómeno denominado reversión; es
decir, la aparición de una segunda mutación que restaura parcial o totalmente el
fenotipo normal.
Mutación silenciosa
Es aquella en la que, a pesar de que existe
una alteración en la secuencia de
nucleótidos, no provoca cambios en el
aminoácido que codifica. Esto sucede
gracias a que el código genético es
degenerado y a que para algunos
aminoácidos existe más de un codón, por
lo que los cambios en los codones no
modifican el resultado de la traducción.
Mutación sin sentido
Es aquélla en la que se cambia un codón que
codifica para un aminoácido por uno de
terminación (UAG, UAA, UGA), lo que propicia
la terminación prematura de un polipéptido, y
da como resultado una proteína truncada
Mutación por sustitución de bases
Se produce cuando en una secuencia de
ADN se cambia un nucleótido por otro; por
ejemplo, el cambio de un nucleótido de
citosina por uno de timina. En esta
clasificación se incluyen las transversiones
y transiciones mencionadas anteriormente
● Cromosómica
Es aquella que involucra el reordenamiento cromosómico resultado de un cambio
en la organización de segmentos cromosómicos, o la pérdida o ganancia de
cromosomas completos, y provoca anomalías funcionales tanto celulares como
orgánicas. Este tipo de mutaciones pueden detectarse mediante análisis a la
microscopia. Su clasificación es la siguiente:
Mutación por inversión de un fragmento
cromosómico
Es aquella que ocurre cuando un segmento del
cromosoma se invierte en su orientación dentro de
éste, al dar un giro de 180°, debido a una rotura
doble. Un ejemplo de inversión cromosómica es el
síndrome de Ambras o hipertricosis universal
congénita, una variante del síndrome del hombre
lobo, que es una inversión en el cromosoma 8
(p11.2q23.1).
Mutación por deleción o pérdida de un
fragmento cromosómico
Ocurre por la pérdida de un fragmento de
cromosoma en uno o varios sitios y se asocia
con la ganancia en otro cromosoma. Un ejemplo
es el síndrome de PraderWilli, una enfermedad
que cursa con defi ciencia mental,
hiperglucemia diabética e hipogenitalismo. Se
trata de una delecióninserción en la región
(15q11q13) (fi gura 8-8).
Mutación por duplicación de un fragmento
cromosómico
En esta mutación se produce una duplicación
de un fragmento cromosómico en uno o
varios sitios de éste.
Mutación por translocación de un fragmento
cromosómico
Se da por un cambio en la posición de un
fragmento cromosómico; es decir, existe
intercambio de segmentos cromosómicos, ya sea
en el mismo cromosoma, entre
cromosomas homólogos o bien entre
cromosomas diferentes. Un ejemplo de
translocación es la que ocurre en
aproximadamente 5% de los pacientes con
síndrome de Down: la más frecuente es
t(21q14q)
● Genómica
Son aquéllas en las que existe una segregación cromosómica errónea; es decir, que
afectan al número de cromosomas o al genoma en su totalidad. Entre este tipo de
mutaciones se encuentran las siguientes:
Poliploidía
En esta mutación se produce un aumento en el número de brazos en un cromosoma
en particular, y se presentan como triploidías (3n), tetraploidías (4n), etcétera.
Haploidía
En esta mutación se encuentra una disminución en el número de brazos en un
cromosoma.
Aneuploidía
Es aquella en que se modifica el número de copias de un cromosoma; es decir, en
lugar de haber dos copias de cada tipo de cromosoma (lo normal), hay uno, tres o
cuatro cromosomas (monosomía, trisomía y tetrasomía, respectivamente).
7. Definición de polimorfismo (polimorfismos de un solo nucleótido -SNP- y
polimorfismo de número de repeticiones -VNTR-
La presencia de formas alélicas diferentes o polimorfismos, sin ser propiamente una
mutación, ya que muchos loci se caracterizan por tener cierto número de alelos
comunes que permiten caracterizar a una población respecto a fenotipos distintos,
es otra situación en la que puede haber variación o diversidad genética. Esta gran
diversidad existente entre los miembros de una población da como resultado el
hecho de que estos individuos puedan sintetizar proteínas o enzimas modificadas,
que en ocasiones pueden estar asociadas también a susceptibilidades para padecer
alguna enfermedad.
Polimorfismos de un solo nucleótido
Existen polimorfismos de un solo nucleótido (single nucleotide polymorphisms,
SNP), que pueden deberse a la sustitución de un nucleótido por otro, la deleción de
un nucleótido o la inserción de un nucleótido en la secuencia de ADN. Aunque existe
modificación del triplete por alteración en la secuencia de nucleótidos, sólo en
algunos casos cambia en el aminoácido que se codifica.
Microsatélites
En el genoma existen regiones con repeticiones de secuencias de 9 a 100 pares de
bases conocidas como variable number of tandem repeats (VNTR), que se utilizan
como marcadores moleculares. Las repeticiones de secuencia las cuales oscilan
entre 2 a 9 pares de bases son conocidas como short tandem repeats (STR).
TEMA: DIVISIÓN CELULAR: CARIOCINESIS (MITOSIS Y MEIOSIS) Y
CITOCINESIS
Mitosis
1. Células que realizan mitosis.
El eje central de la mitosis consiste en separar y distribuir de manera equitativa los
cromosomas, ya replicados en la fase S que le precede, con la fi nalidad de que
cada célula hija reciba una copia idéntica del genoma. Ésta es una etapa del ciclo
celular en la que la célula cesa la mayor parte de sus actividades metabólicas y
presenta una falta relativa de respuesta a estímulos externos, debido a que dedica
toda su energía a la separación cromosómica. La mitosis, a su vez, se subdivide en
cinco fases, llamadas profase, prometafase, metafase, anafase y telofase,
acompañadas de un proceso denominado citocinesis, en el cual la célula en división
se separa en dos.
2. Características de las fases de la mitosis:
Profase
Durante la profase los cromosomas replicados se condensan y se preparan para
separarse, y el huso mitótico comienza a formarse afuera del núcleo. La envoltura
nuclear se rompe, el citoesqueleto se desensambla, el complejo de Golgi y el
retículo endoplásmico se fragmentan, y la envoltura nuclear se dispersa, lo que
marca el inicio de la prometafase.
Prometafase
En esta fase se forma el huso mitótico
definitivo que permite a los microtúbulos
del huso entrar en contacto con los
cromosomas, mismos que se mueven a
una posición en el centro de la célula.
Metafase
En la metafase los cromosomas se
encuentran alineados en el ecuador del
huso, con una cromátide de cada
cromosoma conectada a un polo
opuesto. El plano de alineación de los
cromosomas se conoce como placa de
la metafase. El huso mitótico de la célula
en metafase se encuentra altamente
organizado para separar los
cromosomas duplicados. Los
microtúbulos del huso en esta fase
tienen la misma polaridad pero
funcionalmente se dividen en tres grupos:
1) microtúbulos astrales, que irradian hacia fuera a partir del centrosoma en la
región situada por fuera del cuerpo del huso, y es probable que ayuden en la
colocación del aparato del huso dentro de las células y determinen el plano de la
citocinesis;
2) microtúbulos cromosómicos, que se extienden desde el centrosoma hacia una
estructura proteica localizada en el centrómero del cromosoma, que permite el
anclaje de los microtúbulos del huso a los cromosomas y se denomina cinetocoro;
este proceso es necesario para el desplazamiento de los cromosomas hacia los
polos durante el anafase, y
3) microtúbulos polares (o interpolares), que se extienden desde el centrosoma
hasta pasar los cromosomas y forman una canastilla estructural que mantiene la
integridad del huso.
Las dos cromátides hermanas de cada cromosoma replicado se comprimen una
contra otra a lo largo de las superficies internas y aparentemente se mantienen
juntas por unas proteínas de “pegamento” no cromosómicas denominadas
cohesinas.
Anafase
Ésta se inicia cuando se separan en forma sincrónica y súbita las cromátides
hermanas, y se acompaña de la liberación de la proteína “pegamento” dentro del
citoplasma; todos los cromosomas de la placa metafásica se separan de manera
sincronizada, y las cromátides (ahora conocidas como cromosomas, pues ya no se
encuentran fijas a su duplicado) inician su migración hacia los polos. El movimiento
de cada cromosoma hacia un polo se acompaña del acortamiento de los
microtúbulos fijos al cinetocoro.
Telofase
Durante la telofase los cromosomas se acercan a sus respectivos polos y tienden a
reunirse en una sola masa marcando el inicio de esta etapa final de la mitosis. La
envoltura nuclear se reconstituye conforme las vesículas membranosas se unen a
la superficie de los cromosomas y luego se fusionan lateralmente para formar una
cubierta de doble membrana cada vez más grande. La envoltura nuclear
reconstituida se acomoda alrededor de cada uno de los dos conjuntos de
cromosomas separados para formar dos núcleos
3. Descripción de proceso de citocinesis
La división del citoplasma se inicia al fi nal de la anafase y continúa durante la
telofase.
La citocinesis, o citodiéresis, es la separación física del citoplasma en dos células
hijas durante la división celular y se produce después de la cariocinesis, al fi nal de
la telofase. El mecanismo de las células animales y el de las vegetales es distinto.
En las células animales tiene lugar por estrangulación de la célula en el ecuador del
huso, y se lleva a cabo mediante la participación de proteínas ligadas a la membrana
(actina y miosina), que forman un anillo contráctil. El primer indicio de citocinesis en
animales se observa durante la anafase tardía como una depresión en la superficie
de la célula dentro de una banda estrecha alrededor de ésta.
Conforme avanza el tiempo, la indentación
se profundiza y se convierte en un surco
que rodea por completo a la célula. El plano
del surco se sitúa en el mismo plano que
ocupaban previamente los cromosomas de
la placa de la metafase; en otras palabras,
el plano del surco es perpendicular al eje
del huso mitótico, lo que garantiza que los
dos conjuntos de cromosomas se separen
finalmente en dos células. El surco
continúa profundizándose hasta que las
superficies opuestas hacen contacto en el
centro de la célula y ésta se separa en dos.
Este proceso se lleva a cabo por el impulso
de contracciones progresivas causadas por
un anillo periférico contráctil.
Meiosis
1. Células que realizan meiosis
La meiosis es un tipo especial de división celular que origina gametos o células
germinales masculinas y femeninas (espermatozoides y óvulos, respectivamente),
cada una de las cuales contiene la mitad de la dotación cromosómica normal. A esta
dotación media de cromosomas de cada gameto se la conoce como número
haploide (n). Por lo tanto, esta división, también conocida como gametogénesis,
termina produciendo cuatro células hijas (gametos), que más tarde se fusionarán
para formar cigotos, que ya tienen el número diploide de cromosomas (2n).
2. Características de las etapas del ciclo meiótico
2.1. Meiosis I
En ella tienen lugar algunos sucesos importantes:
• A diferencia de la mitosis, no ocurre separación de cromátidas, sino que cada
cromosoma duplicado de cada par homólogo emigra a cada polo del huso.
• Durante esta primera división meiótica hay un intercambio de alelos (genes
alternos que representan el código para una misma característica) entre las
cromátidas de los pares homólogos de los cromosomas duplicados. Este
intercambio supondrá la formación de cromátidas con diferente constitución
genética en la célula madre.
● Profase I (Leptonema, Zigonema, Paquinema, Diplonema, Diacinesis)
Ésta es la fase más larga de la meiosis, y en ella los cromosomas homólogos
intercambian fragmentos de material genético. Se divide en cinco subfases:
• Leptoteno: los cromosomas individuales, compuestos por dos cromátidas unidas
por el centrómero, empiezan a condensarse y hacerse visibles, y forman largas tiras
en el núcleo.
• Cigoteno: los pares de cromosomas homólogos se aproximan entre sí, y tiene lugar
la sinapsis o apareamiento, que suele comenzar por los extremos y se extiende a lo
largo de los cromosomas. Esta sinapsis, que se establece por medio del complejo
sinaptonémico, forma una tétrada.
• Paquiteno: se completa la sinapsis en todos los cromosomas. Tiene lugar un
entrecruzamiento cromosómico mediante quiasmas, y como consecuencia tiene
lugar una recombinación genética. Suelen darse dos o tres de estos
entrecruzamientos por cada par bivalente.
• Diploteno: comienza la separación de los cromosomas homólogos, y pone aún
más de manifi esto los quiasmas.
• Diacinesis: los cromosomas se condensan al máximo y desaparecen el núcleo y
la membrana nuclear, por lo que quedan libres en el citoplasma. Se puede apreciar
cómo cada bivalente está unido por cuatro cromátidas (tétradas).
● Metafase I
Durante esta fase los cromosomas homólogos se alinean en el plano ecuatorial
completamente al azar, lo que garantiza la reunión de los cromosomas maternos y
paternos.
● Anafase I
Es la separación de cada bivalente, que se desplazan hacia los polos opuestos de
la célula. Cada cromosoma sigue constituido aún por dos cromátidas.
● Telofase I
Esta fase es parecida a la de la mitosis: los cromosomas llegan hasta los polos
opuestos, se vuelven a formar los núcleos y comienza la citocinesis. Cada célula
hija recibe 23 cromosomas (n), pero como cada cromosoma está compuesto por
dos cromátidas, el contenido de ADN todavía es diploide. Cada una de las células
hijas recién formadas entra en la meiosis II.
2.2. Intercinesis
2.3. Meiosis II
Profase II
Es muy corta; se rompe la membrana nuclear y se forma el nuevo huso.
Metafase II
Los cromosomas, cada uno de ellos formado por dos cromátidas, se alinean en el
plano ecuatorial.
Anafase II
Se separan las cromátidas de cada cromosoma.
Telofase II
Se forma la membrana nuclear alrededor de los cuatro núcleos haploides y
comienza la citocinesis.
El resultado final son cuatro células hijas que, a diferencia de lo que ocurre en la
mitosis, contienen el número haploide de cromosomas y son distintas desde el punto
de vista de su dotación genética. Esto significa que cada gameto contiene su propio
complemento genético único
2.4. Maduración de gametos humanos
● Proceso de espermatogénesis
● Proceso de ovogénesis