UNIDAD 3

TRANSCRIPCIÓN
 TRANSCRIPCIÓN DE ADN (resumen)
PROCARIOTAS EUCARIOTAS
1.- Promotor caja TATA (TATAAA)
1.- Promotor caja Pribnow (TATAAT) -10 -25 a -35 bp del inicio de
bp del inicio de transcripción/RNA t r a n s c r i p c i ó n / C o m p l e j o d e
INICIACIÓN polimerasa + factor σ (sigma). iniciación/RNA Polimerasa/
Mediator/Enhancer.
- Helicasa y girasa necesarias. - Helicasa necesaria.

2.- Disociación de RNA polimerasa/factor σ

2.- RNA Polimerasa
ELONGACIÓN - Topoisomerasa II necesaria.

terminación Rho independiente 3.- Disociación de RNA Polimerasa.

o Rho dependiente.
TERMINACIÓN Y 4.- Procesamiento: Splicing, poli-
- mRNA no requiere ser procesado. adenilación y caping.
PROCESAMIENTO - mRNA puede ser policistrónico. 5.- Exportación al citoplasma.

- mRNA monocistrónico.

Lugo-Radillo, A. 2017
 TRANSCRIPCIÓN DE ADN (en detalle)

PROCARIOTAS EUCARIOTAS
1.- Complejo de preiniciación (PIC)
[TFIID se une a caja TATA (TATAAA)
-25 a -35 bp del inicio de
transcripción+TFIIA+TFIIB+Pol
INICIACIÓN 1.- RNA polimerasa + factor σ (sigma) se II+TFIIF+TFIIE+TFIIH (abre burbuja de
une a caja Pribnow (TATAAT) -10 bp del transcripción)]+enhancers, silencers e
inicio de transcripción+¿Helicasa y insulators -> Pol II se une a hebra
girasa necesarias? -> abre burbuja de molde de DNA -> síntesis de RNA de
transcripción -> RNA polimerasa se une ~10nt ->escape del promotor
a hebra molde de DNA -> síntesis de
RNA de ~10nt ->escape del promotor
2.- Disociación de RNA polimerasa/ 2.- RNA Polimerasa+factores de
factor σ elongación (P-TEFb, SPT5, TAF-SF1,
ELONGACIÓN TFIIS, NELF, DSIF, ELL y otros) +
¿Topoisomerasa II?.

3.- terminación Rho independiente 3.- Disociación de RNA Polimerasa.

o Rho dependiente.
4.- Procesamiento: Splicing, poli-
TERMINACIÓN Y adenilación y caping.
PROCESAMIENTO
- mRNA no requiere ser procesado. 5.- Exportación al citoplasma.
- mRNA puede ser policistrónico.
- mRNA monocistrónico.

Lugo-Radillo, A. 2017
 Characteristic rates and timescales in cell biology

Model bacterium (E. coli) vs. Mammalian cell line (HeLa)

Diffusion limited
on-rate Clathrin-mediated
d
endocytosis
10 -109 M–1 s-1
7
Passage across 1 min
membrane Diffusion over 10 μm
Ligand-induced 1-10 s
conformational change Channel Transporter
1 ms 0.1 μs 1-10 ms

Molecular motor
1 μm/s
DNA replication DNA replication
Diffusion over
ver 1 μm 103 nt/s 103 nt/min
10-100 ms

Cell movement - 10 μm/s Cell movement - 1 μm/min

Transcription

10-100 nt/s 10-100 nt/s

1 min/gene [1 kbp] 10 min/gene [10 kbp]
Cell cycle Cell cycle
1 hr 1 day

Translation
10 aa/s 10 aa/s
1 min/protein [300 aa] 1 min/protein [300 aa]
Flagellar rotation
100 Hz Protein folding
1 ms - 1 min
Cellular pool half-life (dominated by)
1s Metabolite (turnover) 1 min
10 min mRNA (degradation) 10 hr Sizes not to scale
1 hr Protein (dilution) 1 day Vbacteria : Vcell line
~1 : 1,000
5'-(gcc)gccRccAUGG-3'
Katahira, 2015
Lac Operon