1.

INTRODUCCIÓN
1.1 DEFINICIÓN
La microbiología es el estudio de los microorganismos, organismos microscópicos, que se mueven
en el orden de las micras (μm). Se estudian sus aspectos:
● Morfológicos
● Estructurales.
● Composición química
● Fisiología.
● Genética.
● Taxonomía.
● Ecología.
Como ciencia básica, se basa en el estudio de los procesos fundamentales de la vida, la comprensión de
la naturaleza y el entendimiento del funcionamiento microbiano. Como ciencia aplicada, se busca el
estudio de los MO en la industria, medicina, agricultura y la vida cotidiana, determinando tanto puntos
perjudiciales (agentes de contaminación o enfermedades) como beneficiosos (procesos microbiológicos
industriales, MO benéficos para el ser humano). Si bien hay muchos seres microbiológicos a estudiar,
nuestro principal interés corresponden a las bacterias, o en caso más general, los microorganismos
procariotas (bacterias y arqueas). También es de interés el estudio de Hongos y de levaduras

1.2. PROCARIOTAS Y EUCARIOTAS

Dicho previamente, el foco de estudio
es el de los microorganismos procariotas.
Las procariotas conforman un grupo muy
heterogéneo de organismos unicelulares,
compuesto por las bacterias y las arqueas
(organismos también similares, pero
diferentes en composición química).
Una célula procariota se caracteriza por su
estructura simple, y por poseer un núcleo
sin envoltura nuclear. Conforman un grupo
muy heterogéneo y variado, y corresponden a
células primitivas de 48 hs de ciclo de vida.
Por otro lado están las células eucariotas, más
grandes, complejas (tienen organelas) y
recientes en comparación a las procariotas.
Hay que remarcar sus diferencias y
similitudes.
 Similitudes
● Similitud química: ambas poseen ácidos nucleicos, lípidos y carbohidratos.
● Ambas utilizan el mismo tipo de reacciones químicas para metabolizar alimentos, producir
proteínas y almacenar energía.
● Las 2 poseen una membrana citoplasmática, un núcleo (procariota no limitado), espacio
citoplasmático, ribosomas y capacidad de poseer pared celular (según la célula o MO)
Diferencias
PROCARIOTA EUCARIOTA

Núcleo NO limitado Núcleo definido

0,2 a 2 μm de diámetro, 8 μm de largo 10 a 100 μm de diámetro

Sin organelas Tiene organelas

ADN único (un solo cromosoma) de disposición ADN asociado a proteínas (histonas y no
circular. No se asocian con histonas. histonas), conforman cromátidas. ADN lineal con
múltiples cromosomas

Se dividen por fisión binaria (se copia el ADN y la Se dividen por mitosis (se replican los
célula se divide en 2 hijas. Proceso más simple y cromosomas en un juego idéntico que se
con menos estructuras) distribuye en los núcleos de ambas células.
Proceso con más etapas, y mayor estructuras para
realizarse)

La pared celular posee casi siempre el polisacárido La pared celular posee una estructura química
complejo peptidoglucano sencilla

Presentan ribosomas 70 S (30 S + 50 S) Presentan ribosomas 80 S

Existen tambos aeróbicas como anaeróbicas, y En su mayoría aeróbicas

casos más particulares

Bacterias, arqueas, algas verdiazules Protozoos, hongos, plantas y animales

Diferencias en partes particulares:

● Citoplasma: No poseen citoesqueleto.
● Membrana plasmática: Participa en la producción de energía y
respiración celular.

1.3. OBSERVACIÓN Y TAMAÑO

Las bacterias son de tamaños variables, la mayoría entre 0,2 a 2
μm de diámetro, y 2 a 8 μm de largo (promedio de 5 micras).
Respecto a su forma y observación, éstas se pueden visualizar mediante
técnicas microscópicas. En un principio existen microscopios ópticos
y electrónicos.
● En microscopía óptica, visualizamos el MO a simple vista,
transparentes (las bacterias en sí no tienen color). Este tipo de
microscopio es el empleado en todas las clases.
 ● En microscopía electrónica las imagenes se obtienen en blamco y negro, existen 2 sub técnicas:
○ Por barrido: Imagen en 3 dimensiones (se puede ver volúmen).
○ Transmisión: Permite visualizar el interior celular, evidenciando estructuras internas y
partes del MO

Relación superficie-volumen
● En células esféricas se evidencia la mejor relación superficie-volumen. A menor radio, hay mayor
relación.
● A menor tamaño en una bacteria, hay:
○ Mayor intercambio con el ambiente
○ Mejor velocidad metabólica —> alta tasa de crecimiento
○ Menor influencia ambiental.
○
1.4. CLASIFICACIÓN
Existen una gran variedad de bacterias y microorganismos, cada uno con sus propiedades y
características. Podríamos encontrar una muy amplia variedad de formas de clasificarlos. Una forma muy
general y conveniente es según su forma y agrupación. Su forma está determinada por su genética, y la
mayoría tienen una configuración morfológica única (son monomorfas). No obstante diversas
condiciones ambientales tienen la posibilidad de alterar esa configuración, como así también existen
especies pleomorfas (presentan más de una configuración).

Las bacterias se asocian con un espectro reducido de configuraciones: cocos esféricos, bacilos
bastoniformes, y bacterias espirilares.
Los cocos en general son redondos, pero pueden ser ovalados y
alargados y con una cara aplanada. Algunos cocos después de la
fisión binaria permanecen pegados entre sí. Los cocos que
permanecen juntos en pares tras la fisión se llaman diplococos, y
si el caso se repite una vez más se forman estreptococos. Los
cocos que se dividen en 2 planos y permanecen unidos en grupos
de cuatro se conocen con el nombre de tétradas, mientras que
para 3 planos y configuración cúbica se llaman sarcinas.
Finalmente, los que se dividen en cadenas múltiples y forman
grupos en forma de racimo de uva se llaman estafilococos.

¿Por qué se agrupan en cantidad? → para aumentar la

relación superficie-volumen
 Los bacilos son estructuras con forma de bastón o cápsulas, que se
dividen en su eje menor (por las puntas). Al igual que los cocos, si
tras la fisión permanecen juntos se denominan diplobacilos, y en una
fisión contínua se forma un estreptobacilo. Se remarca que por lo
general los bacilos se encuentran aislados e individuales, por lo que
la cantidad de grupos de bacilos es mucho menor que en cocos. Otros
bacilos demuestran ser planos y alargados similares a los cocos, los
cuales se denominaron cocobacilos. Existen casos donde la unión se
da por su eje grande (los costados), llamada esta forma como
empalizada.

Finalmente los espirilos presentan

una o más curvaturas, y nunca
son rectas. Aquellas que
presentan una estructura similar a
un bacilo curvo se denomina vibrio, mientras que los espirilos tienen
una configuración helicoidal semejante a un tirabuzón, y se desplazan
con flagelos. Por otro lado están las espiroquetas, similares a los
espirilos, más flexibles y se desplazan mediante filamentos axiales
asemejados a los flagelos pero rodeados por una vaina externa
flexible.
También existen otras formas no tan recurrentes, como las del género
Stella (forma de estrella), las del género Haloarcula (Planas y
rectangulares) y células triangulares.

1.5. PARTES DE CÉLULA PROCARIOTA

Para finalizar la introducción a la microbiología y su objeto de estudio, se propone conocer a
detalle sus partes.
1.5.2. Citoplasma
Presenta un aspecto viscoso, semitransparente y elástico (sin estructura visible al microscopio)
● No tiene citoesqueleto (diferencia con eucariotas, que sí tienen).
● En su zona central aparece una zona nuclear (procarion) con la mayor parte del ADN bacteriano.
● En algunas bacterias aparecen plásmidos, fragmentos circulares de ADN con información
genética dispersos en el citoplasma.
● Tiene inclusiones de diversa naturaleza química:
○ 80 % Agua.
○ proteínas (enzimas).
○ Carbohidratos, lípidos e iones.
Región nuclear
● No tiene núcleo envuelto. Se habla de la zona como nucleoide.
Tampoco tiene histonas. Puede contener plásmidos y genomas
fágicos.
● ADN en el citoplasma. Tiene 1 x 106 pares de bases.
● Unida a los mesosomas - membrana plasmática.
● Es haploide (único cromosoma, solo una molécula de ADN de
doble cadena) Circular, super enrollada.
● corresponde al 20 % de la célula.
● No hay procesamiento del ARNm, todo el material genético se traduce en proteínas o enzimas.
“Se traduce y se lee”
● La transcripción está ligada a la traducción (diferencia con eucariotas)
Plásmidos
Moléculas de ADN extracromosómico de menor masa molecular
que el cromosoma, separados del cromosoma principal. Se le asocian a
todos los factores de virulencia. Cuenta con las resistencias de
antibióticos o toxinas. También pueden contar con genes que intervienen
en los procesos de conjugación. Se transmiten entre las bacterias por
medio de los pilis

1.5.4. Membrana plasmática

Membrana fosfolipídica, similar a las de las células
eucariotas. Participa:
● En la generación de energía y división celular
(diferencia con eucariotas).
● “La bacteria respira a través de su membrana”
● En el transporte selectivo de sustratos.
● Límite metabólicamente activo de la célula.
● Secreción de proteínas
● Son barreras osmóticas.
● Ancla de proteínas
Presenta invaginaciónes, que son los mesosomas, donde se
encuentran las enzimas que intervienen en la síntesis de ATP,
y los pigmentos fotosintéticos en el caso de bacterias
fotosintéticas.
● Bicapa fosfolipídica con proteínas integrales y
periféricas (reciben y transportan).
 ● Pueden obtener hopanoides de estructura similar al colesterol.
● Carecen de esteroles (diferencia con eucariotas)
● Fosfolípidos (enlaces éster): la composición / proporción de distintos lípidos dependen de la cepa
bacteriana y de las condiciones del cultivo (ph, temperatura, etc).

Mesosomas
Son estructuras internas en las bacterias, involucradas en la respiración celular y la división celular.
● Transportan electrones.
● Probable papel en la síntesis del septo transversal, regulando las autolisinas implicadas en la
división celular.
● Puntos de anclaje del cromosoma bacteriano.
● Zonas de secreción de ciertas
exoenzimas.
En GRAM +: Son menos complejos, con
forma laminar o a base de tubos dispuestos
de forma verticalada.
En GRAM - : Más característicos y visibles.
¿Qué implica barrera osmótica?
Implica la constancia del medio interno,
impidiendo la salida de metabolitos o
compuestos, pero simultáneamente
permitiendo la entrada activa de nutrientes y
la salida de desechos (básicamente
regulación) todo esto gracias a sistemas
activos y pasivos (vistos en intro a la biología, OBVIAMENTE nos acordamos). Si se rompe la barrera
osmótica, la célula estalla.

1.5.5. Ribosomas
Participan en la síntesis de proteínas, poseen ARN y ribosomas
característicos, pero a diferencia de su contraparte eucariota, éstos son más
pequeños y menos densos.
● A diferencia de las eucariotas (80S), el ribosoma bacteriano es de
70S, con 2 subunidades:
○ 50S (Subunidad mayor: 31 prots + ARNr 23S + ARNr 5S).
○ 30S (Subunidad menor: 21 prots. + ARN 16S).
● Los ribosomas son un punto clave para el ataque a las
bacterias con antimicrobianos: la diferencia entre
subunidades y su diferencia con los ribosomas eucariotas
facilita la elección de agentes antimicrobianos para atacar a
los ribosomas de un MO específico, sin correr riesgo de
perjudicar a otras células. Se considera a los ribosomas
como punto blanco.
○ Para 50S se usan Macrólidos: Eritromicina y
Fenicoles: Cloranfenicol.
○ Para 30S se usan Tetraciclinas y aminoglucósidos
(estreptomicina).
¿Qué significa la S? Se refiere a las unidades Svedberg, o coeficiente de sedimentación, que indican la
velocidad de sedimentación relativa durante la centrifugación ultrarrápida. La velocidad de
sedimentación depende del tamaño, peso y configuración de una partícula.

1.5.1. Pared celular1

Estructura compleja y semirrígida encargada de la configuración de la célula. La pared celular
rodea la frágil membrana plasmática, y protege el interior celular del medio externo y sus posibles
cambios. Casi todas las células procariotas poseen pared celular.
Sus principales funciones son:
● Proteger del medio y agentes externos
● Evitar la ruptura de la célula, ante la presión hidrostática intracelular supera la presión externa.
● Mantenimiento de la forma de la bacteria gracias a su condición semirrígida.
● Anclaje para flagelos.
● Contribuye a la virulencia de una bacteria y el sitio de acción de los antimicrobianos.
● Espacio periplasmático.
Para su estudio se saca la pared celular mediante lisis2 osmótica, empleando un medio hipotónico (muy
diluido, baja concentración de soluto).

La pared celular procarionte (más compleja que la de las eucariotas) está compuesta principalmente de
peptidoglicano (o mureína). La mureína está compuesta a su vez por un disacárido repetitivo unido por
polipéptidos que rodean y protegen la totalidad de la célula. Este disacárido está conformado por
monosacáridos N-acetilglucosamina (NAG) y ácido N-acetilmurámico (NAM).
Las moléculas alternadas de NAG y NAM se unen para formar hileras de 10 a 65 azúcares, siendo este el
“esqueleto” de carbohidratos (la fracción glucano del peptidoglicano). Las hileras vecinas están unidas
por polipéptidos (la fracción peptídica). Si bien la estructura de las uniones es variable, en todos los casos
existen cadenas laterales tetra peptídicas formadas por 4 aminoácidos, unidos a NAM en el esqueleto.
El punto importante de las paredes de las células procariotas es que estas pueden clasificarse según su
estructura en 2 grandes grupos: Gram positivas y Gram negativas.

GRAM POSITIVAS
Las bacterias Gram (+) tienen una pared
celular compuesta por varias capas de
peptidoglicano, formando una estructura gruesa
y rígida. Se distingue la membrana
citoplasmática y la capa de peptidoglicano
Su estructura conserva la capa de disacáridos
N-Acetilglucosamina y N-Acetilmurámico, y en
las moléculas de NAM se desprenden los
polipéptidos de 4 aminoácidos, en el mismo
orden:
● L - Alanina
● D - Glutámico
● L - Lisina
● D - Alanina

1
PUNTO DE EXAMEN: DIBUJAR Y EXPLICAR ESTRUCTURA GRAM + Y GRAM -
2
Lisis celular: proceso en el que una célula se rompe o destruye, liberando su contenido al entorno
Las hileras de peptidoglicano se encuentran unidas entre sí mediante puentes de 5 glicina (pentaglicina)
entre 3 L-lisina y 4 D-alanina

Además, la pared celular Gram (+) cuenta con la presencia de ácidos teicoicos, compuestos
principalmente por un alcohol (como glicerol o ribitol) y fosfato. Existen 2 clases de ácidos teicoicos:
● Ácido lipoteicoico: Abarca toda la capa de peptidoglicano, unida a la membrana plasmática y no
al peptidoglicano.
● Ácido teicoico mural: Unido a la capa de peptidoglicano.
Su carga negativa determina que estos compuestos se unen a los cationes y regulan su movimiento hacia
el interior y el exterior de las células.
También pueden contribuir al desarrollo celular al prevenir la ruptura de la pared celular y reducir el
riesgo de lisis. Son los responsables de la gran especificidad antigénica de la pared celular, permitiendo la
identificación de bacterias mediante pruebas de laboratorio, como así también una clasificación según la
importancia clínica.

La familia Gram (+) más grande se encuentra en cocos, ejemplos básicos son Estreptococos y
Estafilococos. Las gram (+) son altamente sensibles a antibióticos b-lactámicos
GRAM NEGATIVAS
Las gram (-), a diferencia de su contraparte, tienen una capa delgada de peptidoglicano, siendo
solamente una capa o muy pocas, acompañada de una membrana externa. Se distingue la membrana
interna (plasmática), el periplasma, la membrana externa y la fina capa de peptidoglicano.
El peptidoglicano se encuentra unido a lipoproteínas de la membrana externa y se encuentra en el
periplasma, sustancia gelatinosa localizada entre la membrana externa y la membrana periplasmática. El
periplasma contiene una concentración elevada de enzimas degradantes y proteínas de transporte.
Esta pared celular no contiene ácidos teicoicos, y el hecho de que contenga una escasa cantidad de
peptidoglicano aumenta su susceptibilidad a la ruptura mecánica.
La membrana externa está compuesta por lipopolisacáridos (LPS), lipoproteínas y fosfolípidos. Se
encarga de funciones especializadas.
● Su intensa carga negativa dificulta la fagocitosis y la actividad del complemento
● Impide el paso de ciertos antibióticos, como la penicilina; o de enzimas digestivas como la
lisozima. También frena detergentes, metales pesados, sales biliares y ciertos colorantes.
● NO impide el paso de todas las sustancias, pues necesitan nutrientes del medio para vivir. Su
permeabilidad se debe en parte a la presencia de proteínas (llamadas porinas) que forman canales
con la membrana y permiten el paso de diversas moléculas
Finalmente el componente LPS es el responsable de 2 características importantes de las Gram (-):
● La fracción polisacárida está compuesta por azúcares (polisacáridos O) que actúan como
antígenos y son útiles para diferenciar las distintas especies de bacterias gram (-).
● La porción lipídica, denominada lípido A o también endotoxina, ejerce un efecto tóxico una vez
liberada sobre la circulación sanguínea o el aparato digestivo del huésped.

A nivel estructural, las Gram (-) vuelven a contar con las hileras alternadas de NAM NAG unidos
mediantes enlace beta-1,4. La cadena es recta y no ramificada, constituyendo la estructura básica de la
pared celular.
● No existe puente de pentaglicina.
● No contiene Lisina.
● No se demostró existencia de ácidos teicoicos.
● Contiene siempre únicamente L-diaminopimélico.
Tinción de gram
Después de estudiar la tinción de Gram es más fácil comprender el mecanismo de acción. Éste se
basa en la diferencia estructural de ambos tipos de Gram y en su forma de reacción ante diversos
reactivos.
● El principal colorante (cristal violeta) se encarga de teñir de color violeta tanto las Gram (+) como
Gram(-), debido a que ingresa al citoplasma de ambos tipos de células.
 ● La aplicación de yodo (mordiente) determina la formación de cristales con el colorante que no
pueden atravesar la pared celular debido a su tamaño.
● El alcohol-acetona produce 2 efectos según el tipo:
○ En Gram (+), se deshidrata la pared de peptidoglicano, aumentando la impermeabilidad.
Por lo tanto, conservan el colorante dentro de sí.
○ En Gram (-), se disuelve la membrana externa de las células, y crea pequeños orificios en
la capa de peptidoglicano, donde se difunden los cristales de colorante-yodo. Esto culmina
en la decoloración de las Gram (-).
● La aplicación de safranina le brinda a las células el color rosado. Si bien es absorbida por ambas
células, las Gram (-) al haberse decolorado adquieren la fucsina como único colorante, mientras
que la safranina en Gram (+) se ve opacada por el cristal violeta

Con esto se culmina la descripción de partes celulares típicas de todas las bacterias (hasta ahora se vieron
partes en común, e inclusive algunas compartidas con las eucariotas). Ahora hay que meterse en las
estructuras características bacterianas, presentes en determinados género y especie (interesantes para la
taxonomía), y generalmente asociados a factor de virulencia (capacidad de colonizar un hospedero o
ambiente). Se hablará de:
● Cápsulas.
● Flagelos.
● Pilis.
● Endosporas.
● Fimbrias.
● Inclusiones citoplasmáticas.

Bacterias sin pared: Mycoplasma

Existen bacterias que, en vez de pared, tienen membrana más gruesa, y son parásitos obligados. Se
llaman del género Mycobacterium. Es un grupo de bacterias muy reducido, que se caracterizan por:
● Bacilos aerobios obligados.
● Inmóviles.
● No esporulado.
● Miden 0,2 um a 0,4 um x 2 um a 10 um-
● Bacilos ácido alcohol resistentes, debido
a su complejidad de la pared celular que
poseen.
● Crecimiento lento in vitro, con división
cada 12, 24 hs.
Está compuesta un 60 % de ácidos micólicos,
para su coloración es necesario Ácido
clorhídrico y fuego empleando la coloración de
Ziehl-Neelsen. Se fija el colorante (fucsina), se
decolora con alcohol/HCl, se emplea azul de
metileno como colorante de contraste.
Otro grupo que tampoco reaccionan
correspondientemente a la tinción gram son las Arqueas, que
se ven más adelante
1.5.6. Flagelos

Pilis y Fimbrias
Son “pelos cortos visibles a la bacteria, difíciles de ver a
microscopio. Son filamentos proteicos cortos, involucrados en
funciones de adhesión a las superficies (como por ejemplo, E.
coli emplea sus fimbrias y se adhiere a las vías urinarias,
provocando infección).

Existen también los llamados pelos sexuales o pili de

conjugación, más largos que la Pili, y con nombre mal
empleado (no existe la reproducción sexual en MO, ni
tienen algo que ver). Son uniones que hace un MO a una
célula receptora, para llevar a cabo la conjugación
(capacidad de un MO para pasar material genético a
través de los plásmidos).
Un emisor F+ genera el pelo sexual para pasarle a una F-
el material genético (por ejemplo, la resistencia a un
antimicrobiano).

¿Diferencia entre pilis o fimbrias?

● Fimbrias: Pueden nacer en los polos de la célula o estar distribuidas de
forma regular en toda la superficie. Pueden estar en número reducido o de
varios cientos por célula. Permiten la adhesión, inclusive con otras células.
● Pilis: Por lo general son mas largos que las fimbrias, y su cantidad es de
una o dos por célula. Se unen a la pared celular bacteriana como paso
previo para la conjugación.

Flagelos
Son más largos, gruesos y con una función y forma de funcionamiento muy
diferentes a los pilis o fimbrias.
● Están compuestos de proteínas Flagelina.
● Presente en algunas cepas de bacilos.
● Muy finas, de 20 nm (deben de teñirse para verlas en micro. óptico).
● le dotan de movilidad a la célula.
● Implican factor de patogenicidad en algunas bacterias.
● Se acercan a los nutrientes y se alejan de los tóxicos (pueden ir hacia adelante y
hacia atrás).
● Constituyen el antígeno H.

Fundamento
● Es un apéndice movido por un motor rotatorio.
● Puede girar a 6000 - 17000 rpm (pero la célula sólo alcanza 200 - 1000 rpm.
● Rotación de anillos en el cuerpo basal dirigido por gradiente de H+, no de ATP
● La rotación antihoraria de movimiento para adelante, y la rotación horaria de movimiento para
atrás. Están controladas por quimio atrayentes y repelentes.
Algunas usan un flagelo lateral para su desplazamiento, factor asociado a la formación de biopelículas y a
virulencia bacteriana. Casos: E. coli, Salmonella, Serratia.
Otros MO general flagelos laterales para poder desplazarse en medios sólidos y crecer en medios
viscosos, como especies de vibria, Azospirilum, Rhodobacter, Aeromonas.
Un flagelo está compuesto por 3 elementos fundamentales:
1. Filamento: La porción larga más externa, posee un diámetro
constante y tiene la proteína globular flagelina (varias cadenas
entrelazadas que forman una hélice rígida alrededor de un núcleo
hueco).
2. Gancho: unido al filamento, ligeramente más ancho y compuesto
por una proteína diferente.
3. Cuerpo Basal: Compuesto por un pequeño bastón central
insertado en una serie de anillos, que fija el flagelo a la pared
celular y la membrana plasmática.

Clasificaciones
● Atricas: sin flagelo
● monotricas: un solo flagelo polar
● anfitricas: un ovillo de flagelos en cada extremo celular
● lofotricas: 2 o más flagelos en ambos extremos
● peritricas: flagelos distribuidos en toda la superficie
(característico de salmonella, E. coli)

E. coli NO TIENE FLAGELOS POLARES, tiene pilis.

1.5.7. Cápsula
Muchas células procariontes secretan una sustancia superficial
llamada glucocáliz, siendo éste el término general que se utiliza para
designar a las sustancias que rodean a las células. El glucocáliz bacteriano es
un polímero viscoso (adherente) y gelatinoso que se encuentra localizado por
fuera de la pared celular y está compuesto por polisacáridos, polipéptidos o
ambas sustancias. La composición química del glucocáliz varía en las
distintas especies.
En la mayoría de los casos se fabrica en el interior de las células y se secreta
en la superficie celular. Si la sustancia que lo compone está organizada y se adhiere firmemente a la pared
celular el glucocáliz recibe el nombre de cápsula. La presencia de una cápsula se puede determinar
mediante la tinción negativa. Si la sustancia que lo forma no está organizada y se une a la células en
forma laxa el glucocáliz recibe el nombre de capa mucilaginosa.

RESUMEN:
● Cápsulas: Altamente organizado, gruesa y fija a la pared
celular.
● Glucocáliz/Glicocálix: Capa de azúcar, viscosa y
adherente. Un glucocáliz compuesto por azúcares se
denomina polisacárido extracelular (PSE).
● Capas mucilaginosas o mucosas: Menos organizadas y
fácilmente deformables.

Funciones:
● Protección contra defensas del hospedero (fagocitosis), a la desecación,
virus y toxinas.
● Adhesión a superficies.
● No permite la activación del complemento debido al aislamiento del
receptor C3b
● En ciertas especies contribuye considerablemente a la virulencia.
Bacterias con cápsula: Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae,
Salmonella
1.5.8. Endosporas
Estructuras producidas por la célula cuando las condiciones ambientales son desfavorables
(escasez de nutrientes, temperaturas extremas, radiación o compuestos tóxicos). formándose una espora
por cada forma vegetativa.
● Permite la supervivencia en ambientes desfavorables.
● Altamente resistentes a las condiciones extremas o sustancias nocivas.
● Cuentan con un bajo contenido de agua, no tienen metabolismo detectable y carecen de
compuestos de alta energía (como ATP).
● ADN protegido por ácido dipicolínico y proteínas.

Pautas y aclaraciones:
● Para referirse a ellas se las llama como endosporas. Sirven para la clasificación taxonómica.
● No es una forma de multiplicación bacteriana, ni está relacionado con las esporas de los hongos
(que tienen fines reproductivos).
● Nunca tienen fase exponencial de crecimiento, solamente fase estacionaria.
● Cuando las condiciones del medio vuelven a ser óptimas, las endosporas germinan para volver a
dar una célula.
● La capacidad de germinar perdura hasta miles de años.
● Algunas de las bacterias que esporulación son patógenas para el hombre.

Bacterias que producen endosporas:

- EN BACILOS: Bacillus (aeróbicos), Sporolactobacillus (microaerófilos), Clostridium
(anaeróbicos), Desulfotomaculum (anaeróbico reductor de sulfato), Sporohalobacter (anaeróbico
halófilo), Anaerobacter (anaeróbico fijador de nitrógeno).
- EN COCOS (gram positivos): Especie Sporosarcina (aeróbicos)

Clasificación (útil para taxonomía)

Se clasifica en función de la posición de la endospora. En
cada caso pueden ser deformantes o no deformantes:
● Endospora central: La espora se sitúa en el centro de la
bacteria. EJEMPLO: Bacillus megaterium.
● Endospora subterminal: La espora se sitúa cerca del
extremo de la célula. EJEMPLO: B. anthracis.
● Endospora terminal: Situada en el extremo de una célula.
EJEMPLO: Clostridium tetani.
Formación de endosporas
Se detalla el procedimiento de esporulación o esporogénesis, que tarda varias horas
en realizarse.
1. La célula, proveniente de una fase estacionaria y con 2 cromosomas, densifica su
ADN y ocupa el centro de la célula. Comienza un importante recambio intracelular
de proteínas.
2. Se forma un tabique, o septo, cerca del polo celular debido a la invaginación de la
membrana plasmática. El ADN es segregado en dos compartimentos (espora y
célula madre).
3. El citoplasma de la espora en formación se delimita por 2 membranas. La
membrana más interna se transformará en la membrana plasmática de la espora.
4. Se forma la corteza de la espora por el depósito de un peptidoglicano
esporoespecífico entre ambas membranas. La espora acumula calcio y sintetiza
ácido dipicolínico. Para esta etapa ya se llevó a cabo (o esta en curso) la
deshidratación de la preespora.
5. Aparece el exosporio, la membrana exterior se transforma en la capa cortical por la
incorporación de proteínas ricas en cisteína.
6. Maduración de la espora, su citoplasma se vuelve homogéneo y electrodenso. Se
completa la capa cortical.
7. Se libera la endospora por lisis celular.

● La mayoría del agua presente en el citoplasma de la preespora ya ha sido eliminada en el momento

en que se completa la esporulación y las endosporas no llevan a cabo reacciones metabólicas. La
endospora casi completamente deshidratada sólo contiene ADN, una pequeña cantidad de ARN,
ribosomas, enzimas y algunas pequeñas moléculas importantes. Estas últimas comprenden una
abundante cantidad de ácido dipicolínico junto con los iones de calcio. Esto debido a que el bajo
contenido de agua retarda o altera las reacciones químicas que afectan el ADN.

Germinación
Las endosporas ya sueltas
en el medio pueden permanecer
por miles de años, soportando
condiciones de temperatura
extremas, medios no viables o
presencia de toxinas o agentes
nocivos. Una vez las condiciones
vuelven a ser aptas para el
desarrollo del ciclo bacteriano,
empieza el proceso de
germinación, donde las esporas
vuelven a formar una célula y
recuperan el estado vegetativo.
La germinación es desencadenada
por una lesión física o química en
las cubiertas de la endospora,
donde las enzimas de la endospora
degradan las capas adicionales que rodean la misma, permitiendo el ingreso del agua y la reanudación de
los procesos metabólicos. Siguiendo la idea que una célula vegetativa produce una espora, una espora
germina en una única bacteria.
Se adjunta el mecanismo de esporulación y germinación de la bacteria Bacillus subtilis, comparada con su
proceso de fisión binaria, y remarcando una vez más que la esporulación y germinación no son
procedimientos de reproducción.

UNA PREGUNTA DE FINAL FUE EXPLICAR

EL CICLO Y GRAFICARLO

1.5.9. Inclusiones citoplasmaticas

En el interior del citoplasma existen diversos tipos de depósitos de
reserva, donde se acumulan ciertos nutrientes en condiciones favorables
para luego utilizarlos en condiciones adversas. La concentración de
macromoléculas en inclusiones evita el aumento de la presión osmótica
que tendría lugar si las moléculas se encontraban dispersas en el
citoplasma.
● Gránulos metacromáticos. Son inclusiones de gran tamaño, se tiñen
de rojo con azul de metileno. Globalmente se conocen como volutina. Es una reserva de fosfato
inorgánico, para sintetizar ATP.
● Gránulos polisacáridos: Consisten en glucógeno y almidón, y su presencia se puede demostrar con
tratamiento de las células con yodo.
● Inclusiones lipídicas: Presentes en especies de Mycobacterium, Bacillus, Azotobacter, Sprillum.
● Gránulos de azufre: presentes en bacterias “sulfurosas”, como el género Thiobacillus, obtienen
energía por la oxidación del azufre, y acumulan gránulos de azufre para reserva.
● Carboxisomas: Contienen la enzima ribulosa 1,5-difosfato carboxilasa. Las bacterias
fotosintéticas usan dióxido de carbono como única fuente de carbono, y necesitan esta enzima
para la fijación del dióxido de carbono. Un ejemplo son las bacterias nitrificantes,
cianobacterias y thiobacillus.
● Vacuolas gaseosas: Presentes en procariontes acuáticos, como cianobacterias, bacterias
fotosintéticas anoxigénicas y halobacterias. Confiere flotabilidad y permiten que las células
permanezcan en el nivel de profundidad apropiado para recibir las dosis necesarias de aire, luz
natural y nutrientes.
● Magnetosomas: Inclusiones de óxido de hierro producidas por varias bacterias gramnegativas
(Magnetospirillum, Magnetotacticum) que actúan como imanes.

1.5.10. Enzimas3
Las enzimas son proteínas especializadas que actúan como catalizadores biológicos. Estos
catalizadores aceleran y facilitan las reacciones químicas que ocurren dentro de las células bacterianas.

3
PREGUNTA DE EXAMEN: CLASIFICAR O DARSE CUENTA EN AGAR SANGRE QUÉ TIPO DE HEMÓLISIS
HAY
Las enzimas son fundamentales para prácticamente todos los procesos metabólicos en las bacterias, ya
que permiten que estas células realicen una amplia gama de funciones biológicas de manera eficiente.
● Catalasa: enzima específica que descompone el peróxido de hidrógeno (H2O2) en agua (H2O) y
oxígeno (O2). Esta enzima es crucial para las bacterias (y otros organismos) porque el peróxido de
hidrógeno puede ser tóxico para las células si se acumula en grandes cantidades.
● Coagulasa: Cataliza la conversión de fibrinógeno en
fibrina.
● Hialorunidasa: Favorece la diseminación bacteriana,
despolimeriza el ácido hialurónico.
● Lipasas: metaboliza grasas cutáneas.
● Nucleasas: ADNasas o desoxirribonucleasas, destruyen
el ADN de células eucariotas.
● Estafilocinasas o fibrinolisina: fibrinólisis y forma
micro trombos sépticos.
● Ureasa: Emplea Urea para crear amoníaco, y elevar el
pH de la placa dental.
● Leucotoxina: inhibe la quimiotaxis4, especialmente de los neutrófilos y monocitos
● Condroitín Sulfatasa: degrada el condroitín sulfato.
● Colágenasa: degrada el colágeno.
● Hemolisina: Destruye las membranas celulares de los hematíes (glóbulos rojos). Se puede
clasificar según el tipo de hemólisis.
○ ALFA: Lisis parcial (Enterococcus sp algunas cepas, Streptococcus pneumoniae, S.
viridans).
○ BETA: Lisis total (Enterococcus sp algunas cepas, Streptococcus agalactiae, S. pyogenes)
○ GAMMA: Sin lisis (Grupo D no Enterococcus, Streptococcus bovis)

1.5.11. Arqueas
Microorganismos células procariotas, NO
BACTERIAS, pero muy similares a ellas. Una de sus
principales diferencias es la presencia de membranas
adaptadas a condiciones extremas.

4
Quimiotaxis: proceso en el que las células, incluidas las bacterias, responden a sustancias químicas en su entorno
moviéndose hacia o alejándose de ellas
En lugar de los habituales lípidos a base de ésteres de ácidos grasos con glicerol, existen lípidos a base
de ésteres de alcoholes de cadena larga con glicerol. Esta propiedad les permite subsistir en
condiciones críticas.

Pared celular de arqueas

Si bien las arqueas tienen pared celular, no son como las bacterias, y no responden a la tinción de
gram.
● No poseen peptidoglicano, sino que tienen un polisacárido similar llamado pseudopeptidoglicano.
● Puede ocurrir que:
○ Pseudopeptidoglicano tiñe G +.
○ Pseudopeptidoglicano cubierta de proteína, tiñe G +.
○ monocapa superficial de glicoproteína / proteína.
● En la pseudomureina, los enlaces glicosídicos entre los azúcares son Beta-1,3 en lugar de
Beta-1,4.
● Los aminoácidos son todos estereoisómeros L.
● Existen arqueas sin pared (Thermoplasma).

¿Qué tiene la pared de las arqueas?

La idea de contar con pseudopeptidoglicano, o pseudomureina, es que en vez de tener NAM, la pared
contiene ácido N-acetil talosaminurónico, y carece de los aminoácidos presentes en las paredes
bacterianas.
 2. NUTRICIÓN Y CRECIMIENTO MICROBIANO
2.1. DEFINICIÓN
En el contexto de la Microbiología, se llama crecimiento Microbiano al aumento de números de
individuos de una población, no así al crecimiento en cuanto a tamaño o edad, como uno se acostumbra a
emplear esos términos.
Nutrición se refiere a los nutrientes necesarios para una determinada bacteria para su crecimiento,
propiedad que varía según cada especie, y resulta otro punto importante para la clasificación de MO.
En esta unidad se profundizará todas las necesidades nutricionales y del medio que deben de considerarse
para el crecimiento de cualquier MO, cómo se determinan y clasifican según sus condiciones y cómo
poder generar medios de cultivo para dichos MO. Esta sección también se complementará con cartas y
tablas de bacterias con sus condiciones, y cartas de medios de cultivo significantes.

2.2. REQUERIMIENTOS
Se hace referencia a todos los requerimientos o propiedades a considerar en una bacteria, y como
se clasifican según sus propiedades.
2.2.1. Físicos
[Link]. Temperatura
La temperatura es un factor que influye fuertemente en la velocidad de las reacciones enzimáticas,
las cuales presentan su mejor actividad y crecimiento a temperaturas óptimas. No obstante, eso no
implica que un MO no pueda crecer si no está bajo esa temperatura específica, sino que tiene un rango de
temperaturas para el crecimiento. Fuera de este espectro de temperaturas hay deficiencia en las
reacciones enzimáticas.
También es importante aclarar que el no cumplir esa temperatura no implica necesariamente la muerte
celular, sino la NO actividad metabólica, haciendo que la célula no se reproduzca. (puede seguir
existiendo en temperaturas atípicas, pero no habrá crecimiento). De la misma manera, temperaturas
extremas pueden inducir la muerte celular.

Se compara la velocidad de
crecimiento y la temperatura. Se
observa que, generalmente, la
temperatura óptima es cercana a la
temperatura máxima. Una vez
superada la temperatura óptima, la
velocidad de crecimiento ( y por lo
tanto la eficiencia enzimática celular)
se reduce rápidamente.

Los MO se clasifican en 3 grupos principales: sicrófilos (afinidad por el frío), mesófilos (afinidad a
temperaturas moderadas), o termófilos (afinidad por el calor). La mayoría de los MO crecen solo dentro
de un espectro limitado (rango de T mínimas y máximas), separadas por 30°C.
 ● Operar por debajo de la temperatura mínima implica el riesgo de la gelificación de la membrana
(aumento de rigidez), la formación de cristales de hielo que lisan la membrana, y el decrecimiento
metabólico.
● Operar por encima de la temperatura máxima implica el riesgo de la desnaturalización proteica,
afectar a las proteínas, lípidos y ácidos nucleicos, llevando a una lisis térmica.
Sin embargo, los límites de temperatura que definen a estos 3 grupos no están bien definidos. Debido a la
gran diversidad de MO y las diversas condiciones ambientales posibles, se proponen 5 clasificaciones por
temperatura, derivadas de las 3 principales ya descritas.
Donde entre los sicrófilos (a
favor del frío) se distinguen los
estrictamente sicrófilos, o los
que se desarrollan en
temperaturas un poco más
elevadas pero soportan los
0°C. Los termófilos (a favor
del calor) también se
distinguen en los estrictamente
termófilos o los termófilos que
pueden soportar temperaturas
relativamente bajas (para lo
que implica un termófilo).
Adaptación a bajas temperaturas:
Para que una célula soporte bajas temperaturas:
● Hay presencia de ácidos grasos insaturados de cadena corta (mayor rigidez).
● Enzimas con mayor contenido de alfa-hélices (mayor flexibilidad).
● Solutos como glicerol o DMSO pueden rebajar el punto de congelación, y protegen la
deshidratación y formación de hielo.
● Proteínas de choque térmico, para mantener proteínas y ARNm activos.
El límite de temperatura más bajo para el crecimiento bacteriano se estima cerca de -20 °C.

Adaptación a altas temperaturas:

Para que una célula pueda subsistir en altas temperaturas:
● Se cuenta con ácidos grasos saturados de cadena
larga.
● Hay enlaces iónicos entre aminoácidos (enlaces
mucho más fuertes y resistentes a la temperatura).
● Presencia de enzimas termorresistentes.
Para temperaturas extremas:
● Presencia de éteres de hidrocarburos con glicerol.
● Producen otros solutos que favorecen la
estabilización de proteínas (fosfato di inositol,
glicerol).
● Monocapa lipídica unida covalentemente

Para mantener un MO o población de MO a su temperatura óptima de crecimiento, vienen estufas de

cultivo de diferentes rangos, para emplearlas según el tipo de MO que se esté buscando cultivar.

Un último punto importante es que si un microorganismo es

sicrófilo o termófilo, esto no implica que tenga un crecimiento
exponencial en las condiciones dadas, sino que tendrá un
posible crecimiento y sobrevivencia en comparación a otras
especies. Aunque los microbios suelen sobrevivir a
temperaturas aún más bajas que la de congelación y
permanecer en un estado de latencia absoluta, su número
disminuye gradualmente. Los sicrótrofos en realidad no crecen
bien a temperaturas bajas, salvo en comparación con otros
organismos.
Siguiendo este razonamiento, es completamente viable
conservar alimentos en cadenas de frío, que sigue el principio
que las velocidades de reproducción microbiana disminuye a
temperaturas bajas.
Por lo tanto, el rango de temperaturas grises marcado en la
imagen del termómetro corresponden a temperaturas críticas
para los alimentos, donde son más propensas a contraer
bacterias y favorecer su crecimiento (zona peligrosa).
[Link]. Medio pH
El pH (medida de acidez / alcalinidad de una disolución) de un medio de cultivo no solamente
indica si una especie microbiana puede (o no) desarrollarse en un medio particular, sino que también
afecta a la velocidad de reproducción.
Por lo general casi todas las especies microbianas tienen un intervalo o rango de pH (análogo a la
temperatura), correspondiente a 2 cifras de la escala de pH (algunas son más variables y subsisten en un
rango de 3 unidades). La mayoría de bacterias crecen mejor en un rango de pH estrecho cercano a la
neutralidad (6,5 - 7,5), llamados neutrófilos, y muy pocas bacterias muestran preferencia a pH ácidos
(menores a 4) denominados acidófilos.
● Los hongos y levaduras muestran tener un espectro de tolerancia más amplio de pH que las
bacterias, y tienen mejor desenvolvimiento en medios ácidos (5 -6).
● La alcalinidad también inhibe el crecimiento microbiano, pero rara vez se emplea en tareas como
la conservación de MO.
● En medios de cultivo, se emplean sustancias químicas buffers para mantener el pH adecuado /
deseado. En algunos casos, las peptonas y aminoácidos actúan como buffers, y muchos medios
también contienen sales de fosfato.
Al igual que en temperatura, se distinguen 3 distinciones bacterianas: acidófilos, neutrófilos, alcalófilos.

Fundamentos básicos
Primero se aclara que la tolerancia de las bacterias a cambios de pH es limitada, un cambio brusco del pH
produce la muerte celular.
El pH óptimo para el crecimiento hace referencia al pH extracelular. El pH intracelular debe de
mantenerse en valores neutros. El ADN es sensible a la acidez, mientras que el ARN lo es a las bases,
implicando que el interior celular debe de mantener un medio en equilibrio. Por supuesto se encontraron
casos atípicos, que suponen la posibilidad que se encuentren en el límite tolerable intracelular.
Para pH casi neutros se usa normalmente el fosfato de potasio (KH2PO4 ) o el bicarbonato de sodio
(NaHCO3 ).
[Link]. Presión osmótica
Recordando el concepto de presión osmótica,
el agua se desplaza a zonas de mayor concentración
de solutos.
Cuando estamos en un medio de presión osmótica
alta (hipertónico), implicando que el medio tiene
una concentración de solutos muy alta en
comparación a la célula, el agua tiende a dirigirse al
medio de mayor concentración, por lo tanto, la
célula pierde agua necesaria para su desarrollo.
● Se produce la plasmólisis5 de la célula.
● Se inhibe el crecimiento (se separa la pared
de la membrana).
● Método de conservación de alimentos para peces salados, miel, leche condensada y mermeladas.

Algunos MO se adaptan positivamente a las

concentraciones elevadas de sales en el medio, y se
denominan Halófilos estrictos, pero es necesario que
permanezcan bajo esas condiciones de concentración
para su subsistencia. Casos de Halófilos estrictos son
MO presentes en salinas o aguas saladas. Más
comunes son los Halófilos facultativos, que no
requieren necesariamente de un medio hipertónico,
pero pueden crecer en concentraciones salinas de
hasta un 2% (una concentración que inhibe a muchos
MO). Sin embargo, la mayoría de MO deben de
crecer en medios de grandes concentraciones de agua,
o medio isotónico.
En el caso de un medio hipotónico (poco soluto en el
medio), hay el efecto inverso, y el agua invade a la
célula en exceso. Si la pared del MO es débil, es otra
razón de la lisis celular.

2.2.2. Químicos
En requerimientos químicos se refieren a los elementos y compuestos indispensables que requiere
la célula para su subsistencia y reproducción.
Se distinguen los macroelementos, capturados en grandes cantidades (orden de g/L) por la célula (C, N,
O, P, H, S, P, K, Mg, Fe, Ca) y correspondientes al más del 95 % del peso seco celular; y los
microelementos u oligoelementos, requeridos en cantidades muy pequeñas (orden de micras), donde la
presencia de contaminación del agua puede ser suficiente (Mn, Zn, Co, Mo, Ni, Cu).

[Link]. Carbono
El carbono es, junto al agua, uno de los requerimientos más importantes en la célula. Constituye la
estructura básica de la materia viva.
● Necesario para todo compuesto orgánico que forma una célula viva.
● Implica la mitad del peso seco de una célula bacteriana típica.
5
Plasmólisis: reducción del citoplasma de la célula.
 ● Las moléculas que aportan carbono también aportan H y O (excepto CO2)
○ Los quimioheterótrofos la obtienen de la fuente de su energía, carbohidratos, proteínas y
lípidos.
○ Los quimioautótrofos y fotoautótrofos la obtienen del CO2.

[Link]. N, S, P
Corresponden a otro grupo de macroelementos fundamentales y presentes en un gran porcentaje
de la célula.
Nitrógeno
Necesario para la síntesis de aminoácidos, ADN y ARN, ATP y polímeros de la pared celular.
Constituye cerca del 14% del peso seco.
Existen diversas formas de obtención.
● Por lo general las fuentes de Carbono también lo son de Nitrógeno.
● Se recupera el nitrógeno descomponiendo materia que contenga proteínas, y reincorporando los
aminoácidos en proteínas recién sintetizadas y otros compuestos con Nitrógeno.
● Otras emplean el Nitrógeno presente en iones Amonio (NH4+) presentes en la materia celular
orgánica. Mismo caso para los nitratos (NO3-).
● Las cianobacterias emplean nitrógeno gaseoso atmosférico (N2) gracias a la fijación del nitrógeno.
Algunos MO cianobacteria viven libremente, otros por simbiosis en las raíces de legumbres, donde
ambos se ven beneficiados (planta y bacteria).
Azufre
Necesario para la síntesis de sustancias como aminoácidos azufrados (cisteína y metionina),
vitaminas (biotina y tiamina), coenzima A,, entre otros.
Si bien muchos medios azufrados (como ecosistemas con sulfuro de hidrógeno) pueden ser tóxicos para
muchas especies, otras se benefician de esto. Las principales fuentes de azufre son:
● Sulfuro de hidrógeno (H2S).
● Ión sulfato (SO4-2).
● Aminoácidos con azufre.
Fósforo
Esencial para la síntesis de de ácidos nucleicos, fosfolípidos de membranas celulares y enlaces de
energía de ATP. También presentes en varios cofactores6, algunas enzimas y otros componentes celulares.
Presente en el Ión fosfato (PO43-) principalmente.

Finalmente existen otros macroelementos necesarios para las células, que desempeñan diversas
funciones, pero en menor proporción que los ya mencionados (orden de los mg).
● K+ : Necesario para la actividad de enzimas, entre ellas las que participan en la síntesis de
proteínas.
● Ca2+ : Contribuye a la termorresistencia de endosporas.
● Mg2+ : Actúa como cofactor de muchas enzimas, forma complejos con el ATP y estabiliza los
ribosomas y las membranas celulares.
● Fe2+, Fe3+ : Forma parte de los citocromos y es cofactor de enzimas y de proteínas transportadoras
de electrones.

6
Cofactor: molécula no proteica que es esencial para la actividad de una enzima. Los cofactores pueden ser iones metálicos,
como el hierro, el magnesio o el zinc, o moléculas orgánicas más complejas, como las coenzimas.
[Link]. Oligoelementos
También llamados micronutrientes o microelementos, son sustancias requeridas en pocas
cantidades (micras), empleadas para diversas funciones (principalmente cofactores y enzimas), facilitan la
catálisis de reacciones y mantenimiento estructural de proteínas. Si bien muchas veces se agregan como
componentes al medio de cultivo, muchas veces el agua de la canilla, e inclusive el agua destilada,
pueden tener suficiente cantidad de oligoelementos para el crecimiento bacteriano.
Los oligoelementos en cuestión son el Mn, Zn, Co, Ni, Mo y Cu
Se distinguen 2 categorías:
1. frecuentemente esenciales para el crecimiento como Ca, Mn, Fe, Co, Cu y Zn y
2. raramente esenciales como B, Na, Al, Si, Cl, V, Cr, Ni, As, Se, Mo, Sn, e I.
● Zn2+ : Se localiza en el centro activo de algunas enzimas.
● Mn2+ : facilita a muchas enzimas la catálisis de la transferencia de los grupos fosfato.
● Mo2+ : necesario para fijar nitrógeno.
● Co2+ : componente de la vitamina B12.
● Cu2+ : tiene funciones en algunas enzimas de óxido reducción.

[Link]. Factores De Crecimiento

Son los compuestos orgánicos esenciales que un organismo no puede sintetizar. Pueden obtenerse
directamente del ambiente.
● Las vitaminas constituyen un grupo de factores de crecimiento orgánicos.
● La mayoría actúan como coenzimas, los cofactores orgánicos que necesitan ciertas enzimas para
actuar.
○ Muchas bacterias pueden sintetizar la totalidad de sus propias vitaminas, sin depender de
fuerzas externas
○ Otras carecen de enzimas necesarias para la síntesis de ciertas vitaminas, por lo que dichas
vitaminas se vuelven factores de crecimiento orgánico para dicha célula
Existen 3 clases fundamentales de factores de crecimiento:
● Aminoácidos: Síntesis de proteínas.
● Purinas y pirimidinas: Síntesis de ácidos nucleicos.
● Vitaminas: normalmente forman la totalidad o parte de los cofactores enzimáticos. Constituyen
grupos prostéticos o centros activos de ciertas enzimas.
Finalmente también existen factores estimulantes, que influyen en el proceso de crecimiento, no son
imprescindibles, y que otorgan un crecimiento más rápido y eficiente
2.2.3. Oxígeno: Respiración celular
Generalmente el oxígeno molecular es visto como un elemento necesario para la vida, sin
embargo, en los MO (fundamentalmente protistas) el oxígeno resulta en un gas venenoso y tóxico, que
desencadena productos inestables y perjudiciales.
Para comprender cómo el oxígeno es tóxico para las bacterias, se propone conocer sus formas tóxicas:

Oxígeno monoatómico Radicales libres Peróxido (H2O2) Radical hidroxilo

(1O2-) superóxido (O2-) (OH)

Oxígeno molecular Se forman en pequeñas El peróxido producido Otra forma

normal que por cantidades durante la en la reacción contiene intermediaria del
excitación alcanza un respiración normal de el anión peróxido O22-, oxígeno y la más
estado de mayor organismos aerobios, y altamente tóxico. reactiva, se forma en el
energía, también para algunos citoplasma por
extremadamente anaerobios estrictos. radiación ionizante o en
reactivo. Produce una cadena de la respiración aerobia.
inestabilidades de toma
de electrones en
moléculas vecinas

(NO encontre info, chat Son tan tóxicos que si Las bacterias Son transitorios, no
gpt tira algo pero no un MO intenta crecer desarrollaron otra requieren de enzimas
puedo confirmarlo) en presencia de oxígeno enzima para su para su tratamiento
atmosférico debe de neutralización, la
desarrollar la enzima enzima catalasa, que
superóxido dismutasa lo convierte en agua y
(SOD), que logra oxígeno. La otra
convertir el radical libre enzima empleada es la
en oxígeno molecular y peroxidasa, que a
peróxido. diferencia de la
catalasa, no produce
oxígeno.

La catalasa se detecta con facilidad por su acción con el peróxido, viéndose la liberación de burbujas de
oxígeno (lo que pasa al aplicar agua oxigenada en una herida).

En la antigüedad, hablando en tiempos geológicos, el oxígeno no era un elemento predominante en la

atmósfera, por lo que los primeros protistas desarrollaron métodos de respiración independientes al
oxígeno. Dichos MO se denominan anaerobios, y emplean respiración anaeróbica para la producción y
obtención de energía. Poco después de la aparición distintiva del oxígeno en el mundo, los MO
percibieron el oxígeno como un elemento tóxico produciendo su inestabilidad y muerte. Muchos MO
aprendieron a neutralizar el efecto tóxico, e inclusive aprender a utilizar el oxígeno para la respiración
celular, resultando un método mucho más eficiente. Estos tipos de MO se denominan aerobios, y
emplean respiración aeróbica, mucho más eficiente que su contraparte
Se entablan las clasificaciones de MO según su tipo de respiración
2.2.4. Energía
Las moléculas de nutrientes poseen energía asociada con electrones que forman sus enlaces.
Distintas reacciones de la vía catabólica concentran energía en enlaces ATP, que termina actuando como
un transportador de energía eficiente. Importante aclarar que existen otros métodos de almacenamiento y
transporte de energía, pero el ATP resulta en el más práctico y eficiente para la célula.
Cuando hablamos de metabolismo celular, estamos hablando de el proceso que hace la célula para su
producción de energía o producción de ATP. Otra forma de clasificar un MO o célula es por la forma en
que produce y obtiene energía. Las células desarrollaron con el paso del tiempo diversas vías metabólicas.
A conocer:

● Respiración celular (ciclo de krebs).

● Fermentación.
● Fotosíntesis
En el libro se detallan y explican las diversas vías metabólicas (me parecen innecesarias, pág 144 - 163)

[Link]. Clasificación
Conociendo la existencia de las vías metabólicas, se pueden clasificar a las células según el tipo de
metabolismo que realizan y la fuente de energía empleada.
En primer lugar, en cuanto a la fuente de energía utilizada los organismos se pueden clasificar en
fotótrofos y quimiótrofos. Los organismos fotótrofos utilizan la luz como fuente de energía principal
mientras que los quimiótrofos dependen de reacciones de oxidación y reducción de compuestos
inorgánicos u orgánicos para obtener energía.
Los organismos autótrofos (se autoalimentan) utilizan dióxido de carbono como fuente principal de
carbono y los heterótrofos (se alimentan de otros organismos) requieren una fuente de carbono orgánica.
La combinación de las fuentes de energía y de carbono permite clasificar los organismos dentro de las
siguientes categorías nutricionales:

Fotoautótrofos
Utilizan la luz como fuente de energía y el dióxido de carbono como fuente principal de carbono. Estos
organismos comprenden bacterias fotosintéticas (bacterias verdes y púrpura y cianobacterias), algas y
plantas verdes. En las reacciones fotosintéticas de las cianobacterias, las algas y las plantas verdes se
utilizan los átomos de hidrógeno provenientes del agua para reducir el dióxido de carbono y se libera
oxígeno gaseoso. Dado que este proceso fotosintético genera O2, a veces se llama proceso oxigénico.
Además de las cianobacterias existen muchas otras familias de procariontes fotosintéticos que no pueden
utilizar H2O para reducir el CO y no pueden recurrir a la fotosíntesis en presencia de oxígeno (necesitan
un medio anaerobio). En consecuencia, su proceso fotosintético no genera O2 y por ese motivo se
denomina anoxigénico. Las bacterias verdes y las bacterias púrpuras son fotoautótrofas anoxigénicas. Las
bacterias verdes, como las del género Chlorobium , utilizan azufre (S), compuestos sulfurosos o
hidrógeno gaseoso para reducir el dióxido de carbono y formar compuestos orgánicos.

Fotoheterótrofos
Los organismos fotoheterótrofos utilizan la luz como fuente de energía pero no pueden convertir dióxido
de carbono en azúcar y deben obtener el carbono de compuestos orgánicos como alcoholes, ácidos grasos,
otros ácidos orgánicos e hidratos de carbono. Estos organismos son anoxigénicos. Las bacterias no
sulfurosas verdes, como las del género Chloroflexus, y las bacterias no sulfurosas púrpuras, como las del
género Rhodopseudomonas, representan ejemplos de bacterias fotoheterótrofas.

Quimioautótrofos
Los organismos quimioautótrofos utilizan electrones derivados de compuestos inorgánicos reducidos
como fuente de energía y CO2 como fuente principal de carbono. Las fuentes inorgánicas de energía de
estos organismos comprenden el sulfuro de hidrógeno en el caso de Beggiatoa, el azufre elemental en el
caso de Thiobacillus thioxidans, el amoníaco en el caso de Nitrosomas, los iones nitrito en el caso de
Nitrobacter, el hidrógeno gaseoso para las bacterias Hydrogenomonas, el ión ferroso en el caso de
Thiobacillus ferrooxidans y el monóxido de carbono en el caso de Pseudomonas carboxy hydrogena. La
energía resultante de la oxidación de estos compuestos inorgánicos se almacena en el ATP derivado de la
fosforilación oxidativa.

Quimioheterótrofos
Casi todos los microorganismos de importancia médica comentados en este libro son quimioheterótrofos.
Las fuentes de energía y carbono de los fotoautótrofos, de los fotoheterótrofos y de los quimioautótrofos
son fáciles de identificar porque se trata de organismos diferentes. En los organismos quimioheterótrofos
la distinción es menos clara porque la energía y el carbono en general provienen del mismo compuesto
orgánico (como la glucosa). Los quimioheterótrofos específicamente utilizan como fuente de energía
electrones provenientes de átomos de hidrógeno de compuestos orgánicos.

A su vez, los organismos heterótrofos se subdividen según la fuente de las moléculas orgánicas. Los
saprofitos se nutren de materia orgánica muerta mientras que los parásitos se nutren de un huésped vivo.
Los organismos quimioheterótrofos comprenden la mayoría de las bacterias y todos los hongos, los
protozoos y los animales. Las bacterias y los hongos pueden utilizar una gran diversidad de compuestos
orgánicos como fuentes de carbono y energía, por lo que pueden vivir en medios muy diferentes.
2.3. MEDIOS DE CULTIVO
Se llama medio de cultivo al material nutritivo preparado para el crecimiento de microorganismos
en un laboratorio. Algunas bacterias pueden crecer bien en casi cualquier medio de cultivo, mientras que
otras requieren medios especiales, y existen aquellas que no pueden crecer en ningún medio inerte
existente.
Se llama inóculo a los microbios que se introducen en un medio de cultivo para su crecimiento, y cultivo
a los microbios que crecen y se multiplican en un medio de cultivo.
Existen una amplia variedad de medios de cultivo (disponibles a nivel comercial) constituidos por
componentes mezclados con anterioridad, y solo necesitan el agregado de agua y su esterilización.

¿Para qué cultivarlo?7

El cultivar un MO nos puede resultar interesante para varios aspectos,
según la rama o área que estemos tratando:
● Para obtenerlo en laboratorio para su estudio.
● Identificación de MO en muestras in vivo.
● Erradicarlo o prevenir su multiplicación.
● Potenciar su crecimiento (para industria, biorremediación).

2.3.1. Diseño, Formulación y Optimización

Cuando se plantea el preparado de un medio de cultivo, se
plantea la finalidad de dicho medio. En un principio se puede plantear un medio solamente para permitir
el crecimiento de algún cultivo, o también se puede plantear como finalidad:
● La obtención de algún producto (por ejemplo una enzima que produce un MO determinado, y
obtener esa enzima en cantidad).
● Aumentar la biomasa (tener cantidad de ese MO en particular).
● Mejorar la velocidad / rendimiento de algún producto, producido en el crecimiento de un MO.

Para ello, se tienen los efectores intracelulares y extracelulares:

Efectores intracelulares: Información genética del MO, puede ser modificado por agregado o extracción
de genes.
Efectores extracelulares: Factores del entorno que modifican la expresión: físicos y químicos (todo lo
visto anteriormente en esta unidad).
Para relacionar estos factores con las condiciones del medio, todo sistema de cultivo debe satisfacer que:
● Contenga los nutrientes adecuados para el MO específico (a veces en proporciones precisas).
● Tenga la humedad suficiente.
● pH adecuado y ajustado, la temperatura correcta y la presión osmótica indicada.
● Concentración conveniente de oxígeno (o carencia de éste).
● Debe de estar estéril (no debe tener MO viables).

DISEÑO: Hay que elegir los componentes para lograr el crecimiento y la obtención de los productos
deseados.
Hay que tener en cuenta los requerimientos nutricionales del MO y la disponibilidad real de los
componentes.
FORMULACIÓN: Hay que elegir las proporciones y concentraciones de cada componente.
OPTIMIZACIÓN: Encontrar la mejor formulación para lograr el objetivo.

7
PARA CONSIDERAR: no lo mencionaron como tal, pero me pareció una pregunta interesante para un oral
Implica resolver los dilemas o elección de cuál podría ser la mejor combinación de componentes y sus
cantidades, teniendo en cuenta tanto los requerimientos iniciales como situaciones posibles:
● Existencia de limitaciones nutricionales ocultas (microelementos, factores de crecimiento).
● Uso de componentes en exceso, que puede causar inhibición.
● Ensayo de sustancias estimulantes, activadoras e inhibidoras del crecimiento y formación del
producto.
● Empleo de fuentes nutricionales no convencionales.
● Elección de fuentes (elegir entre glucosa, sacarosa, fructosa con un pH óptimo, por ejemplo).

La metodología más tradicional es la experimentación de modificar solamente un componente por cada

experiencia, para analizar cuál es el medio más óptimo mediante curva de crecimiento.
También hay que considerar posibles daños o desperfectos durante la esterilización del medio, pues
pueden existir modificaciones perjudiciales o beneficiosas dependiendo del tipo de esterilización y el
tiempo empleado.
● Los aa. y factores de crecimiento son lábiles al calor, pueden descomponerse.
○ Se recomienda esterilizarlas por filtración.
● Las sales de amonio se deben autoclavar a pH 7 o menor (se volatiliza).
● La esterilización por calor depende de la temperatura empleada,
duración del calentamiento, pH del medio y la agitación.
● Los PO4 utilizados como fuente de P y buffer deben esterilizarse
separados de las sales de Mg, con Na, K y amonio.
● Los azúcares pueden descomponerse por la acción del calor en
presencia de sales inorgánicas y compuestos amínicos.
● Los grupos carbonilos de azúcares con grupos aminos de proteínas dan productos de
concentración, que disminuyen significativamente las cantidades de carbohidratos y N amínico
disponible.
● Los carbohidratos se deben esterilizar por separado de compuestos nitrogenados orgánicos.
Se recomienda esterilizar los componentes de los medios de cultivo en fracciones separadas, se adjunta un
ejemplo:

También hay que considerar la disponibilidad de los recursos en la industria o a nivel comercial, como así
también su costo, puesto que, quitando la teoría, el costo de nutrientes puede representar entre el 10 - 60
% del costo total de muchos productos obtenidos (a veces el balance económico es negativo, por más que
sean las mejores condiciones)

2.3.2. Clasificación8

8
PRÁCTICA: en las diapos del teórico hay muchos ejemplos para practicar
 Ya finalizada la introducción, explicación y condiciones de un medio de cultivo, se clasifican los
medios de cultivo según su finalidad, composición física o también según sus propiedades químicas.
Por lo general, un medio de cultivo está compuesto por un 80 % de agua, y un 20% de peso seco, y
también se puede agregar, si se lo desea, un agente solidificante: el AGAR

Agar
Cuando se desea que las bacterias se desarrollen sobre un medio sólido se agrega un agente solidificante
como el agar, hasta ahora sin ningún reemplazante o sustituto satisfactorio. Consiste en un polisacárido
complejo proveniente de un alga marina, empleado para espesante de jaleas o helados.
● Pocos MO pueden degradar el agar, conservando su solidez en el medio.
● Tiene la misma temperatura de ebullición que el agua.
● Para el medio, se conserva con agua a 50 °C.
Los medios con agar suelen utilizarse en tubos de ensayo o placas de petri.
● En tubos de ensayo:
○ Tubos en pico de flauta o inclinados cuando el medio se solidifica en un ángulo adecuado.
○ Tubo profundo cuando el agar se solidifica en el tuvo de forma vertical.
○ Placa de petri: Se realizan en placas poco profundas con tapa que cubre perfectamente,
para evitar contaminación.

[Link]. Estado físico

El porcentaje de agar empleado durante la composición del medio de cultivo define si el mismo se
vuelve líquido, semisólido o sólido.

Por lo general, los siguientes porcentajes de agar producen estos resultados:

● Un medio se considera líquido con agar de 0,2 - 0,4 %.
● Un medio se considera semisólido con agar de 0,5 - 1 %.
● Un medio se considera sólido con agar de 1,5 - 2 % o más.
Estos porcentajes también varían según el MO objetivo, la composición de elementos del medio de
cultivo y la finalidad y resultados deseados.
[Link]. Composición Química
Para favorecer el crecimiento microbiano un medio debe proporcionar una fuente de energía,
como así también una fuente de carbono, nitrógeno, azufre, fósforo y el resto de nutrientes necesarios.
Por lo tanto, dado a la inmensa variedad de MO, con sus diversas condiciones y especificaciones, no
podemos hablar de catalogar medios específicamente por su composición o elementos presentes. Sin
embargo, si se puede distinguir entre un:
● Medio químicamente definido o sintético: se conoce la composición química y cantidades de
componentes. Útiles para investigación, conocer qué está metabolizando exactamente un MO en
estudio, o para bacterias autótrofas.
● Medio complejo: contienen ingredientes cuya composición química se desconoce, o no se conoce
con gran precisión. Implica no conocer ni cantidad ni calidad de los nutrientes. Son ricos para
satisfacer las necesidades nutricionales de diversos MO, y útiles cuando se desconoce los
requerimientos nutricionales particulares de un MO. Suelen contar con peptonas (hidrolizados de
proteínas, fuentes de C, N, energía), extractos de carne (a.a., péptidos, nucleótidos, ácidos
orgánicos, vitaminas y minerales) y extracto de levadura (de cerveza, fuente de vitaminas B, y
compuestos N, C)

● Si hay sales biliares, es un fuerte indicio que es un medio para enterobacterias

● Rojo neutro es un indicador rápido para pensar en que se trata del agar MacConkey.
● Con la presencia de peptonas hablamos de un medio complejo, no conocemos las proporciones
exactas de los nutrientes.
● Elementos como la lactosa tienden a que sea un medio diferencial, pues me permitirá conocer
visualmente qué MO fermentan la lactosa.
● Las sales biliares y colorantes como la fucsina y el cristal violeta favorecen el crecimiento de
Gram (-), inhibiendo el desarrollo de Gram (+).

[Link]. Finalidad Y Uso

Como se dijo en un principio una de las principales pautas a la hora de diseñar un medio de
cultivo es tener presente la finalidad. A nivel técnico, un medio de cultivo puede ser empleado como:

● Enriquecidos o nutritivos: Contienen componentes ricos nutritivamente y permite el crecimiento

de microorganismos no exigentes. (Agar sangre, Agar TSA, Agar nutritivo, infusión cerebro y
corazón).
● De enriquecimiento: Contiene componentes y condiciones que permiten el desarrollo de un tipo
microbiano y disminuyen la velocidad de crecimiento de la microbiota acompañante (caldo
tetrationato, agua peptonada ph 9, caldo selenito).
● Selectivos: Contienen componentes que permiten el desarrollo de un tipo microbiano e inhiben el
crecimiento de los demás microorganismos. (Agar cetrimida (Pseudomonas), Agar Bacillus
cereus, caldo bilis verde brillante, Agar Sabouraud).
● Diferenciales: Contiene componentes que permiten diferenciar las actividades metabólicas de los
microorganismos inoculados. La presencia de indicadores o el uso de reveladores después de la
incubación ponen de manifiesto la actividad. (Agar DNAsa, Agar almidón, Agar sangre).
● Medios selectivos y diferenciales: Contiene componentes que permiten diferenciar las
actividades metabólicas de los microorganismos inoculados. La presencia de indicadores o el uso
de reveladores después de la incubación ponen de manifiesto la actividad. (Agar manitol salado,
MSA; Agar eosina azul de metileno, EMB)
 ● De transporte: Transporte de muestras sin alterar la viabilidad y la proporción de
microorganismos. Tienen consistencia semisólida, con amortiguador de pH y reducidos en
nutrientes para preservar la proliferación de microorganismos por varias horas.
● De mantenimiento o conservación: Conservación temporal de microorganismos. En medio
sólido en caja a 4 ºC (hasta 1 semana). En medio de agar inclinado 4 ºC (hasta 2 semanas) con
sello de glicerol estéril a 4ºC (varios meses dependiendo del microorganismo).

2.3.3. Técnicas De Cultivo

[Link]. Aislamiento y recuento

A estas alturas se conocen todos los fundamentos, tipos de medios y posibles usos de un medio de
cultivo. Falta hablar de las técnicas empleadas en laboratorio para lograr los objetivos.
Una muestra de suelo, agua, orina, materia fecal o la mayoría de materiales infecciosos contienen varias
clases diferentes de bacterias. Si se siembran estas muestras en un medio sólido se tendrá como resultado
variedad de colonias como MO detectables en la muestra. Es de interés saber aislar esas colonias para
obtener un cultivo puro de una especie determinada. Hay muchas formas de lograr este acometido, y
muchas dependen de las proporciones del MO presente en la muestra.

En ocasiones, las bacterias presentes en una muestra (de suelo o

materia fecal por ejemplo) no pueden ser suficientes para marcarse
como detectables, por lo tanto se opta por emplear un cultivo de
enriquecimiento (líquido), con el objetivo de proporcionar los
nutrientes y ambiente necesarios para el crecimiento del MO en
cuestión, e inhibir el crecimiento de otros (por lo que se puede
considerar selectivo, pero destinado a aumentar la población
microbiana a niveles detectables).
En otro caso alternativo, puede ocurrir que no sea necesario un
enriquecimiento previo para hacer detectable la especie deseada,
por lo que se puede recurrir a un aislamiento directo.
En ambos casos (aislamiento directo e indirecto) se puede aislar una especie por el método de estriado (o
agotamiento), donde se pasa un ansa esteril con la muestra. Gracias a éste método se logra aislar los MO
a medida que el ansa agota su carga, y en el medio correcto, un MO puede dar origen a una colonia pura,
que puede separarse e inocular una muestra pura en un nuevo medio de cultivo.

La obtención de un cultivo puro permite estudiar al MO.

Un detalle importante es que las especies forman a
menudo colonias con una forma y aspecto característico,
en un medio determinado.. Por ello se debe refinar los
resultados con un análisis microscópico mediante tinción
y pruebas bioquímicas.
Para confirmar que el microorganismo efectivamente está
aislado se lo debe obtener nuevamente en un medio no
selectivo por estriado.

Por otro lado, también se pueden realizar estudios que

requieran, además del análisis cualitativo (presencia y efecto, o no, de un MO) también se puede requerir
y obtener un análisis cuantitativo, como la búsqueda de carga microbiana en el ambiente. Para ello existen
diversos métodos que, respetando sus pautas y bajo ciertas limitaciones, permiten obtener un recuento
efectivo y fiable.

1. Recuento directo: Consiste en observar al microscopio volúmenes muy pequeños de

suspensiones de bacterias/levaduras, con portaobjetos especiales (Petroff-Hausser).
2. Recuento de viables: Estiman el número de células viables contando el número de colonias
formadas (Cuando una célula aislada e inmovil prolifera en un sustrato, forma colonias). Esta
célula bacteriana viva y aislada se denomina unidad formadora de colonias (UFC).
3. Medida de biomasa: Consiste en medición directa/indirecta de la turbidez.
4. Medida de partículas: Contadores electrónicos de partículas.

Métodos a emplear: Se enuncian los diferentes métodos empleados en la práctica, su breve función y
limitaciones fundamentales. Es necesario aclarar que muchas de ellas dependen de una previa serie de
diluciones, para trabajar bajo resultados óptimos y controlados.
● Estriado: Permite aislar microorganismos. No permite contar.
● Rastrillado: Para aislar y contar microorganismos, se realiza en superficie, tiene límite de 30-300
UFC y una alícuota de 0,1. Se analizan muestras líquidas, pero puedo analizar muestras sólidas al
agregar líquido.
● Embebido: Para aislar y contar microorganismos. Emplea todo el agar, y sirve para
microorganismos escasos. Límite del 10% del volumen empleado.
● Filtración: Para microorganismos sumamente escasos.
● Número más probable: Medios enriquecidos para favorecer el crecimiento de un
microorganismo. Implica ver la reacción de la muestra ante el sustrato.

[Link]. Conservación de cultivos bacterianos

La refrigeración puede utilizarse para conservar cultivos bacterianos a corto plazo. Si nos interesa
conservar el medio por períodos prolongados podemos optar por:
● Ultracongelación, que consiste en colocar el cultivo puro de MO suspendido en un líquido y se lo
congela rápidamente, entre (-50) - (-95) °C.
● Liofilización: O congelación - desecación, donde la suspensión de microbios se congela
rápidamente entre (-54) - (-72) °C, y se elimina el agua por vacío elevado (sublimación). Mientras
se produce el vacío el recipiente se sella fundiendo el vidrio con soplete a altas temperaturas.

[Link]. Pruebas bioquímicas

Se realizan en los medios de cultivo, y son la prueba definitiva para la identificación de una
especie microbiana. Se basa en conocer y evidenciar las actividades metabólicas y enzimáticas de una
especie en particular. También, según la prueba, puede implicar el uso de un medio selectivo, al exponer a
MO a condiciones adversas donde solo unos cuantos microorganismos pueden subsistir.
Prueba de voges proskauer
La prueba de Voges-Proskauer (también
conocida como VP) es una prueba
bioquímica utilizada para detectar la
producción de acetilmetilcarbinol
(acetoína) por ciertas bacterias,
específicamente aquellas que fermentan
glucosa mediante la vía de Butanodiol.

Aislamiento de enterobacterias (agua)

1. Sembrar en caldo Macconkey para aislar enterobacterias de agua y leche. Por 24 hs, 37°C.
2. Las positivas (ácido + gas) se siembra por estría en agar MacConkey y agar EMB levine. Por 24
hs, 37°C.
Aislamiento de pseudomonas spp.
1. Sembrar en caldo M9 (2x) e incubar por 48 hs, 42°C.
2. Estriar en Agar Cetrimida, medio para Pseudomonas aeruginosa, por 48 hs, 37°C.
Aislamiento de staphylococcus spp.
1. Empleo medio Ricota en Agua peptonada, 2 hs a temperatura ambiente.
2. Mezclar con caldo cerebro corazón (con NaCl 13%) para enriquecimiento y cultivo de aerobias y
anaerobias, de MO exigentes como estreptococos, neumococos y otros de difcil desarrollo.
3. Si hay crecimiento, sembrar por estriado en Agar manitol salado-rojo fenol y agar azida (un medio
selectivo para Staphylococcus spp. que inhibe la flora gram negativa).
Aislamiento de bacillus cereus y b. subtilis
1. Cultivar en arroz en PBS, 80°C por 5 min.
2. Pasar el sobrenadante a caldo nutritivo. Incubar por 48 hs, 37°C.
3. Estriar en Agar Mossel con emulsión de yema de huevo, por 48 hs 37°C.
Aislamiento de lactobacillus spp. (yogurt)
1. Emplear Agar MRS, o Agar Rogosa (similar a MRS, pH 5,5 ; más selectivo) con incubación en
microaerobiosis.
3. ESTEQUIOMETRÍA DEL CRECIMIENTO MICROBIANO

3.1. FERMENTADORES O BIORREATORES

Es el espacio químico donde se realizan los procesos
bioquímicos por parte de una especie microbiana.
● Puede realizarse en una superficie (estacionario).
● Puede realizarse en un lecho empacado o sumergido, un
sustrato inmovilizado o en un sistema fluido en movimiento.
(dinámico).

3.2. FORMULACIÓN DE MEDIOS DE CULTIVO

Se repasan los fundamentos vistos previamente en un medio
de cultivo, ahora haciendo pie en las fuentes de nutrientes y
requerimientos nutricionales de un microorganismo.
Teniendo en cuenta los requerimientos nutricionales y medios
necesarios, el preparado de un medio de cultivo requiere de una
formación cuantitativa (cálculo de proporciones y cantidades).
En estos medios, son los macronutrientes los que controlan la
velocidad de crecimiento. Siempre se recuerda que se necesita
una formulación balanceada.

3.2.1. Materias Primas

No todos los MO usan las mismas fuentes de nutrientes. Algunos prefieren unas mas que otras, y
otras les rinden mejor ciertas fuentes (se ve en rendimiento). Además, según el metabolismo, algunos
nutrientes solo pueden ser metabolizados y usados por ciertos MO (principio empleado para desarrollar
medios diferenciales y pruebas bioquímicas).
Se mencionan y enlistan las principales materias primas a considerar cuando se busca armar un medio de
cultivo.
● Agua: Fuentes permanentes y fiables, pH, sales, posibles contaminaciones (agua de la canilla
puede ser también suficiente fuente de micronutrientes).
● Fuentes de carbono:
○ Glucosa o sacarosa (control preciso de la fermentación).
○ Melazas (rica y diversa, rica en N, vitaminas, también son baratas).
○ Extracto de malta (extracto acuoso de cebada malteada).
○ Almidón y dextrinas (maíz, arroz, trigo y mandioca).
○ Celulosa (amplia disponibilidad y bajo coste, requiere hidrólisis previa).
 ○ Aceites vegetales (soja, algodón).
○ Etanol.
● Fuentes de nitrógeno:
○ Amonio o nitrógeno gaseoso o urea.
○ Líquido de maceración del maíz.
○ Extractos de levadura.
○ Peptonas: hidrolizados de proteínas (carne, caseína, gelatina, semillas de girasol, harina de
soja), Origen vegetal ricas en carbohidratos.
● Minerales:
○ Esenciales (P, S, K, Na, Ca, Mg, Cl…) variabilidad según MO.
○ Elementos traza (Co, Cu, Fe, Mn, Mb, Zn…), presentes en el agua y materias primas. Su
rendimiento es afectado por su concentración.
○ Vitaminas.

3.2.2. Composición celular

Como se dijo antes, cada nutriente y elemento se necesita en determinada cantidad. Esto también
responde a la composición química de la célula. Se recuerda que una célula cuenta con un 80% de agua y
un 20% de peso seco (compuesto por 50% de C, 14% de N, 20% de O, 8% de N, 3% de F, y restante de
microelementos). Esta proporción varía según la especie y tipo de MO, pero siempre ronda estas
cantidades.

Donde se asocia como subíndice del

elemento la proporción del elemento que
forma la célula (C0,53, 53% de carbono).

(supongo q es así).

3.2.3. Rendimiento
La célula emplea las fuentes de nutrientes que se les brinda, y convierte el sustrato otorgado
(reactivos, si hacemos la analogía con una reacción) en productos, entre ellos, energía y elementos que la
célula usa para su propio crecimiento (gracias a esto el aumento de biomasa).
Sin embargo, para que este procedimiento sea eficiente es necesario que las condiciones en las que opera
el MO sean las adecuadas. Esto implica:
● Disponibilidad de los nutrientes.
● pH del sustrato.
● Temperatura de incubación.
● Disponibilidad (o ausencia / proporciones adecuadas) de
oxígeno.
● Fase de crecimiento del MO.
● Presencia / ausencia de MO competidores.
Si estas condiciones son las mejores (que dependen de cada
especie) el metabolismo y los procesos celulares tendrán mejor
rendimiento. Hablamos del “rendimiento de la fermentación”.

El rendimiento de utilización de diferentes substratos pueden ser diferentes:

● Hay substratos o alimentos que “engordan” más que otros.
○ Varía por el MO.
● Por las condiciones ambientales o fisiológicas (ya antes dichas, no es lo mismo comer sano o
enfermo, o en verano o invierno).
● Varía en función de un metabolismo oxidativo o fermentativo.

Cuantitativamente, se define al rendimiento de utilización del substrato

(Y) como la cantidad de biomasa producida a partir de un nutriente, y se
calcula como la diferencia de biomasa producida sobre la diferencia del
sustrato consumido.

Matemáticamente, es la relación entre el producto obtenido y el sustrato

consumido, ambos expresados en gramos. Si además de biomasa se forma un producto, el rendimiento
de producto es la diferencia de formación de ESE producto formado sobre la diferencia de sustrato
obtenido.

Según el metabolismo de la célula, muchas

veces encontramos este orden de proporciones
de los productos. (tanto chatGPT como las
diapos coinciden que anaerobios suele tener
menor porcentaje de biomasa).
 Rendimiento de biomasa (YX/S): Esta parte del sustrato se utiliza por el microorganismo para su
crecimiento y reproducción, convirtiéndose en masa celular. El rendimiento de biomasa se refiere a la
proporción del sustrato que se transforma en biomasa microbiana durante el proceso de crecimiento. Por
ejemplo, si el rendimiento de biomasa es del 70%, eso significa que el 70% del sustrato se convierte en
biomasa microbiana.
Rendimiento de productos (YP/S): Esta otra parte del sustrato se utiliza para la producción de productos
deseados, como metabolitos, enzimas o compuestos específicos. El rendimiento de productos se refiere a
la proporción del sustrato que se convierte en el producto final deseado. Por ejemplo, si el rendimiento de
productos es del 30%, eso significa que el 30% del sustrato se convierte en el producto final.

3.3. CÁLCULO DE BIOMASA

No podemos calcular de forma directa cuánta biomasa producirá un MO, debemos de conocer el
rendimiento en base a la relación antes mencionada. Se puede calcular:
● El rendimiento de la utilización del substrato en función de la cantidad de sustrato añadido al
cultivo.
● El rendimiento en función de la cantidad de carbono presente en el substrato.
Conociendo el rendimiento:
● La cantidad de biomasa total (gramos de células).
● El carbono producido por las células (aproximadamente el 0.5 de la masa celular correspondiente
al carbono - aerobio).

EJEMPLO: por las condiciones que nos dicen para la célula, debemos de identificar cuál será la fuente de
carbono, y también debemos siempre tener presente el porcentaje de composición de una célula
bacteriana. (resolví como interpreté, pueden haber fundamentos mal hechos)
 Sabemos por datos que la glucosa es la fuente de
carbono, y está presente en 100 g/L. Por molaridad,
sabemos que en 180 g de glucosa (1 mol C6H12O6)
hay 72 g de Carbono (6 moles C). Finalmente por
composición celular (suponiendo 1 g de biomasa o de
células):

Finalmente, recordamos que

trabajamos con un MO, anaerobio,
quiere decir que el 10% de producto neto
corresponde a biomasa:
Para
éste

caso, queremos saber la diferencia de sustrato.

Tenemos los gramos de biomasa, y por composición sabemos

que en 1 g de biomasa (1 g de bacterias) está compuesto por 0,5
g de carbono, por lo tanto, podemos calcular los gramos de
glucosa necesarios para 20 g/L.

Sin embargo, ésta cantidad de glucosa sólo representa el

porcentaje de biomasa producido, no el total. Sabiendo que es
un MO anaerobio su rendimiento es del 10% podemos calcular
cuánta glucosa se necesita en su totalidad, se convierta o no en
biomasa.
4. ESTERILIZACIÓN, DESINFECCIÓN Y ANTISEPSIA
4.1. DEFINICIONES
● Esterilización: eliminación o destrucción de toda forma de vida microbiana (de todos los
microorganismos y sus formas de resistencia que puedan existir en la superficie y en el interior de
un objeto cualquiera) que puede realizarse por métodos físicos o químicos con un agente
esterilizante.
● Desinfección: destrucción de los microorganismos patógenos (formas vegetativas no endosporas)
productores de enfermedades transmisibles, actuando sobre el ambiente y de superficies de
elementos inertes. Es selectiva y se aplica a objetos inanimados o superficies usando agentes
químicos (desinfectantes o germicidas).
● Antisepsia: Es el uso de una sustancia química no tóxica (antiséptico) sobre tejidos vivos, para
prevenir o detener el crecimiento o la acción de los m.o. ya sea inhibiendo su actividad o
destruyendolos.
● Asepsia: se dice que un ambiente es aséptico cuando se han eliminado todos los microorganismos
patógenos, y este no tiene por que ser esteril.

4.2. MECANISMOS DE ACCIÓN

1. Daño del DNA: por radiaciones (UV, ionizantes) o alquilantes (formaldehído, óxido de etileno).
2. Alteración de proteínas y enzimas: por calor, ácidos y álcalis, oxidacion (peróxido de H y iodo) y
metales pesados (mercurio).
3. Alteración de la permeabilidad de la membrana celular: por agentes coagulantes (alcoholes, fenoles)
y agentes tensioactivos (amonios, detergentes, jabones).
Un agente esterilizante ideal cumple con:
- Acción bactericida, esporicida, tuberculicida, fungicida, viricida
- Menor tiempo de acción
- Alto poder de difusión y compatibilidad
- Ausencia de toxicidad (para el trabajador, paciente y ambiente)
- Ausencia de residuos en el material
- Activo en presencia de materia orgánica
- Que disponga de una adecuada monitorización
- De costo razonable

4.3. ETAPAS DEL PROCESO DE ESTERILIZACIÓN

1. Limpieza y descontaminación
2. Inspección
3. Preparación/Empaque
4. Esterilización y/o desinfección
5. Almacenamiento
6. Entrega
7. Certificación (caducidad) de los métodos de esterilización
El proceso de esterilización no debe producir cambios ni en la apariencia, ni en el funcionamiento, aun
después de ciclos repetidos. Deben ser estériles todos los objetos que han de entrar en contacto con el
torrente sanguíneo o territorio orgánico estéril.

4.4. METODOS DE ESTERILIZACION

● Físicos
- calor: húmedo, seco, pasteurización
- radiaciones: ionizantes y no ionizantes
- filtración
- ultrasonido
 4.4.1 Agentes físicos:
El calor no sólo es el agente de esterilización más ampliamente utilizado y el más eficaz sino
también el más económico y el más fácil de controlar. En la esterilización por calor cabe tenerse en cuenta
el grado de resistencia de las bacterias a la temperatura. La resistencia al calor varía entre los diferentes
microorganismos; estas diferencias pueden expresarse a través del concepto de punto térmico de muerte.
- El punto térmico de muerte (PTM) es la temperatura más baja requerida para matar a todos los
microorganismos de una suspensión diluida en 10 min.
- El tiempo de muerte termica (TMT) es el menor tiempo necesario para que todas las bacterias de
un cultivo líquido mueran a una temperatura determinada.
- El tiempo de reducción decimal (TRD) es un tercer concepto relacionado con el grado de
resistencia al calor de las bacterias, y es el tiempo en minutos en que se destruye el 90% de la
población de bacterias a una temperatura determinada.

Mecanismo de acción Eficacia

Calor húmedo coagulación mayor eficacia al acelerar la rotura de los puentes de hidrógeno
(desnaturalización) de que mantienen la estructura tridimensional de las proteínas
proteínas

Calor seco oxidacion de proteinas menor eficacia que el húmedo

● Calor húmedo

Método Forma de aplicación Utilidad Observaciones

Ebullición o 10-15 min a 100° virus, bacterias patógenas, no destruye esporas y no

vapor fluente parásitos, hongos esteriliza

Vapor a presión 121° por 15 min destruye formas vegetativas y se aplica a sustancias
autoclave esporas bacterianas, virus, termoestables: medios de
parásitos y hongos cultivo, material de cirugia y
curacion, ropa, material de
vidrio, filtros, material de goma
y plástico

Tindalización 100° por 30 min y medios de cultivo o autoclave con la llave de purga
se repite por 3 días materiales, líquidos que no (espita) abierta
sucesivos resisten temperaturas altas

● Calor seco

Método Forma de aplicación Utilidad Observaciones

Flameado Aplicación directa del anses, espátulas, aplicable a pequeños

material a esterilizar pinzas, tijeras instrumentos
sobre la llama

Incineración el horno pirolítico hisopos eficaz y es el único

contaminados, procedimiento recomendado
material de curación, para la destrucción de priones
muestras de
desecho, órganos
humanos y
 cadáveres de
animales infectados

Aire caliente estufa (horno Pasteur) materiales de vidrio elimina microorganismos y

a 160° por 2 h o 180° y metálico de esporas
por 30 min cirugía, aceites.

● Pasteurización
Es el proceso térmico realizado a líquidos (generalmente alimentos) con el objeto de reducir los agentes
patógenos que puedan contener: bacterias, protozoos, mohos y levaduras, etc. y mejorar su capacidad de
conservación. A diferencia de la esterilización, la pasteurización no destruye las esporas de los
microorganismos, ni elimina todos los microorganismos termofilicos.

Tipos de pasteurización Forma de aplicación Utilidad

Baja temperatura por largo 61° por 30 min en lotes El vapor o agua circula en las paredes
tiempo (LTLT) del intercambiador de calor y luego se
enfría el líquido a 10° por una corriente
de agua fría.

Altas temperaturas por un 72° por 15 seg continuo al no estar esteril, se enfría el líquido
breve periodo (HTST) drásticamente a 4° y se envasa para
prevenir la multiplicación de bacterias
sobrevivientes.

Altas temperaturas (UHT) 140° por 2 seg se envasa en condiciones de esterilidad

y no requiere ser refrigerada, con una
larga vida

● Otros métodos

Método Forma de aplicación Utilidad Observaciones

Filtración filtros con poros de un Soluciones Filtros de membrana: entre 0.22 y

diámetro menor al termolábiles como 0.45 um
tamaño de los son antibióticos, Para virus filtros de 0.01 um.
microorganismos que se vitaminas, enzimas,
desean remover/retener, etc.
dejando un liquido
filtrado esteril

Radiaciones ionizantes rayos x y gamma material de plástico Producen iones y radicales libres
(alta energía) de un solo uso o que alteran las bases de los ácidos
desechable o goma, nucleicos, estructuras proteicas у
alimentos, lipídicas, y componentes
medicamentos, esenciales para la viabilidad de
vitaminas, etc. los microorganismos.
Esteriliza y tiene gran
penetrabilidad. Muchas medidas
de seguridad y muy costoso.
Radiaciones no rayos ultravioleta recintos cerrados Esteriliza, son escasamente
ionizantes (baja energía) (quirófanos) y penetrantes y lesiona el ADN.
superficies

Ultrasonido vibraciones de alta en un baño de agua poca penetración

frecuencia para para limpieza del
desnaturalizar las material
proteínas y componentes
bacterianos

[Link]. Factores a considerar en la selección del método

1. Microorganismos:
- Grado de muerte microbiana requerido
- naturaleza microbiana (virus, bacterias..)
2. Instrumental:
- Uso al que se destine
- naturaleza del objeto a tratar

4.4.2. Agentes químicos

Método Forma de aplicación Utilidad Observaciones

Gas de óxido a temperaturas bajas: ambiente artículos sensibles al alto poder microbicida, gran
de etileno por 12 h o a 58° por 4 h y 40% calor y la humedad poder de penetración y muy
de humedad. (termolábiles) como eficaz. Su limitación es que
material descartable, se debe airear los elementos
válvulas y prótesis, antes de utilizarse para
equipos electrónicos. eliminar su toxicidad.

Glutaraldehido Se utiliza al 2% en solución objetos de plástico e Luego de su uso se debe

acuosa. Es bactericida, instrumentos de enjuagar con abundante agua
tuberculocida y viricida en 10 cirugía y tejidos esteril.
min. Tiene efecto esporicida pero
en 10 h a temp. ambiente

4.5. VENTAJAS Y LIMITACIONES

DE LOS DISTINTOS METODOS DE
ESTERILIZACION
4.6. CONTROL DE ESTERILIDAD
Las pruebas microbianas son garantía de esterilidad al informar la existencia o no microbiana.
Esto se realiza luego de esterilizar el material dado, pero también hay controles para evaluar condiciones
físicas adecuadas durante el proceso de esterilización con agentes físicos:
- Radiaciones: vigilancia de las lámparas
- Filtracion: cambio periodico de los filtros
- Calor: indicadores fisicos, quimicos y biologicos

Método Instrumento

Indicadores Métodos directos que registran la - termometro, manometro.

físicos temperatura o presión en que se desarrolla la - microprocesadores
esterilización, como termómetros, - test de bowie-dick (evalúa la eficacia
manómetros, tiempo, vacío. Si se observa de la bomba de vacío)
alguna anomalía en el registro gráfico se
considera carga no esteril. Observación
constante.

Indicadores Llamados termo-cromos o indicadores - tiras colorimétricas

químicos colorimétricos que consisten en tiras con un - cintas adhesivas de papel especial
compuesto que cambia de color cuando se - envases de papel
alcanza una determinada temperatura, - test de bowie-dick (evalua el poder
presion, etc. de penetración del vapor en el interior
de los paquetes)

Indicadores Son preparaciones estandarizadas de - esporas (Bacillus)

biológicos microorganismos vivos específicos que
observan la mayor resistencia comprobada a
un método de esterilización. Los indicadores
se procesan en forma conjunta con el
material a esterilizar, y una vez concluido el
proceso, los indicadores son inoculados en
un medio de cultivo adecuado y se deja
incubar. Es el método más definitivo.
químico
biologico

Uso de indicadores:
4.7. AGENTES QUÍMICOS DESINFECTANTES
Algunos factores que afectan la potencia desinfectante son: tiempo, temperatura, pH,
concentración del agente, presencia de materia orgánica y características del microorganismo.
- Desinfectantes: alcohol, fenol, sol. cloradas, acidos y alcalis, formaldehído
- Antisépticos: alcohol etílico 70%, clorexidina, sol. yodadas, metales pesados, peróxido de
hidrógeno 3-6%.

● Alcoholes: etílico o isopropílico (al 70%). Produce desnaturalización de proteínas y alteraciones

en la membrana. Es de escasa toxicidad y sirve de desinfección de objetos semicríticos y no
críticos, y como antisépticos en solución acuosa 70-90%.
● Fenoles y derivados: actúan en presencia de materia orgánica, al 5% es excelente desinfectante
para Micobacterium tuberculosis, y es de olor tóxico.
● Derivados del cloro: su mecanismo es la oxidación, se usan como desinfectantes de superficies en
solución acuosa o tratamiento de aguas. Es inestable, las soluciones se deben preparar en el
momento y proteger de la luz y el calor, es muy tóxico y corrosivo.
● Ácido peracético: oxidación y alteración de la permeabilidad de la membrana, es de alto nivel y
esterilizante, tóxico y corrosivo de metales. Se mantiene activo en presencia de materia orgánica.
● Formaldehído: se presenta comercialmente en sol. acuosa al 40%, y se realiza la sol. final al 8%
para esporicida, 0,2-0,4% para vacunas, es de uso muy restringido en la desinfección.
Los antisépticos están recomendados para:
➔ disminuir la colonización de la piel con gérmenes
➔ lavado quirúrgico de manos para reducir la flora bacteriana
➔ preparación de la piel para procedimiento invasivos
➔ atención de pacientes inmunocomprometidos o con factores de riesgo de infecciones intra hospitalarias
➔ preparación preoperatoria de la piel
➔ posterior manipulación de material contaminado

Un antiséptico ideal debe ser: bactericida, bacteriostático y con persistencia por varias horas.
● Etanol al 70%: es bactericida de 1 a 2 min, no destruye esporas, inactividad en presencia de materia
orgánica y es de uso limitado en la piel.
● Yodo y yodóforos: su mecanismo de acción es la oxidación y halogenación, son poco tóxicos, y es de los
antisépticos de mayor uso.
● Detergentes catiónicos (amonios cuaternarios): tienen mayor actividad a pH alcalino, no son esporicidas
ni tuberculicidas y su acción es interferida por la presencia de materia orgánica y son neutralizados por jabones
y detergentes aniónicos.
● Cloruro de benzalconio (derivados del amonio cuaternario): alteran la membrana, es poco tóxico y su
actividad disminuye a pH ácido, en presencia de iones metálicos o materia orgánica.
● Derivados fenólicos: alteran la membrana y coagulan proteínas, y se usa para descontaminación
ambiental como el hexaclorofeno (incorporado al jabón con acción desodorante) y triclosan (pastas de dientes y
enjuagues bucales siendo antibacteriano y fungicida).
● Clorhexidina: alteraciones en la membrana, de escasa toxicidad y se usa como antiséptico cutáneo y de
cavidad oral, se inactiva con la luz y con determinados componentes aniónicos.
● Peróxido de hidrógeno (agua oxigenada): es un oxidante que se utiliza al 3-6%, soluciones concentradas
son tóxicas, y se usan para desinfección de lentes de contacto, equipos médicos etc.
5. ANTIBIÓTICOS Y QUIMIOTERÁPICOS ANTIBACTERIANOS
Alexander Fleming descubrió el primer antibiótico en 1929, la penicilina, antibiótico empleado en
el tratamiento de infecciones provocadas por microorganismos patógenos. Actualmente existen muchos
antibióticos derivados sintéticos de la penicilina, como la cloxacilina y la amoxicilina, que se pueden
tomar en forma de pastillas para combatir infecciones.

5.1. DEFINICIONES

Concepto Origen Ejemplo

Antibiótico sustancia producida por Natural - Bacitrocina, Polimixina para Bacilos

metabolitos de organismos grampositivos.
vivos, principalmente hongos y - Estreptomicina para Actinomicetos.
bacterias, que posee la - Cefalotina, Penicilina para Hongos.
propiedad de inhibir el
crecimiento o destruir otro
microorganismo.

Quimioterápico Sustancia producida de manera Netamente no dice

sintética que posee la propiedad sintético
de inhibir el crecimiento o
destruir microorganismos.

5.2 POSTULADOS DE KOCH

1. El microorganismo específico ha de encontrarse siempre asociado a la enfermedad.
2. El microorganismo ha de ser cultivado y aislado en pureza (cultivo puro) en el laboratorio.
3. Este cultivo puro, inoculado en un animal susceptible, debe producir la enfermedad.
4. Debe recuperarse el microorganismo en cultivo puro a partir del animal infectado
experimentalmente.
5.3. POSTULADOS DE ERLICH
Un antimicrobiano deber ser:
1. Muy activo frente a microorganismos
2. Fácilmente absorbible por el organismo humano
3. Activo en presencia de tejido o fluidos corporales
4. Bajo grado de toxicidad, alto índice terapéutico
5. No inducir desarrollo de resistencias

5.4. TRIÁNGULO DE DAVIS

Para estudiar a los microorganismos, los
antimicrobianos y al huésped podemos utilizar la relación
del Triángulo de Davis. Primero vamos a analizar la
sensibilidad que tiene un microorganismo ante un
determinado antimicrobiano, y luego analizaremos la
resistencia del microorganismo al antimicrobiano.
La actividad del antimicrobiano depende de:
- su estructura química
- concentración alcanzada en el sitio de la infección
- tipo de microorganismo
- tamaño del inóculo o cantidad de m.o.
- mecanismo de acción: tiempo de acción y fase de
crecimiento de la bacteria

Los antimicrobianos deben expresar las siguientes características:

 a- Toxicidad selectiva o Baja o nula toxicidad para el huésped
b- Acción bactericida
c- No inducir resistencia
d- Permanecer estable en los líquidos corporales y tener un largo período de actividad (si no es tóxico)
e- Ser soluble en humores y tejidos
f- Ser tolerado por el huésped - No inducir respuesta alérgica
g- Tener un espectro de acción limitada
h- Desarrollar la actividad a bajas concentraciones.
i- Via de administracion cómoda

5.5. CLASIFICACIÓN DE LOS ANTIMICROBIANOS

1. Estructura química
2. Reversibilidad de su efecto
3. Tipo de patógeno
4. Espectro de acción
5. Tipo de resistencia
6. Mecanismo de acción
7. Farmacología:
1. Concentración dependientes: quinolonas
2. Tiempo dependientes: 𝛽lactámicos

5.5.1. Estructura química

- los 𝛽-lactámicos constituyen la familia más numerosa de antimicrobianos y la más utilizada en la
práctica clínica.
- estructura reactiva: anillo 𝛽 lactámico

5.5.2. Reversibilidad de su efecto

- reversibles o primariamente bacteriostáticos
- irreversibles o primariamente bactericidas/bacteriolíticos

Bacteriostáticos Inhiben el crecimiento del microorganismo y su

multiplicación celular quedando el m.o. viable (no tiene
lugar la muerte celular), de manera que cuando se
suspende el tratamiento, puede volver a recuperarse y
multiplicarse. Ej: Estreptomicina, Cloramfenicol.

Bactericidas (no Producen la muerte del microorganismo sin necesidad de

lítico) destruirlos o lisarlos. Ej: metales pesados, rifampicina.

Bacteriolíticos Matan a los microorganismos por lisis. Ej: Penicilina,

(bactericida alcoholes, detergentes.
lítico)

5.5.3. Tipo de patógeno que atacan

- Antibacterianos, antifúngicos, antihelmínticos, antiprotozoarios,
antivirales, antineoplásicos, antimaláricos
5.5.4. Espectro de acción
- corto
- medio
- amplio
5.5.5. Resistencia a los antibióticos
Debido a un mal uso de los antimicrobianos (altas dosificaciones, falta de restricciones de uso e
incorrecto uso de la droga), los microorganismos generan mecanismos de resistencia a estos mediante
mutaciones o plásmidos, o por la formación de biofilms. (ver biofilm sección 5.6)
Un uso irracional de los antimicrobianos genera un ciclo interminable tal como:

Un 1% es debido al manejo
clínico, mientras que el 99%
es debido a animales de renta
5.5.6. Mecanismo de acción

1. Interfieren en la biosíntesis de PARED

CELULAR
2. Inhiben la SÍNTESIS DE PROTEÍNAS
3. Actúan sobre la síntesis de ÁCIDOS
NUCLEICOS
4. Actúan sobre la MEMBRANA CELULAR
5. Actúan sobre Vías METABÓLICAS

[Link]. Inhibición de la síntesis de la pared

bacteriana o síntesis del peptidoglicano
Actúan antimicrobianos como:
- 𝛽lactámicos: penicilina, cefalosporinas y cefamicinas,
monobactámicos y carbapenems.
- Glicopéptidos: vancomicina y teicoplanina
- Fosfomicina
- Cicloserina
- Bacitracina
Estos antibióticos pueden actuar en distintas partes de la pared celular, tales como:
1. Síntesis de precursores: Fosfomicina y Cicloserina. Son solubles en el citoplasma.
2. Transporte a través de la membrana: Bacitracina. Estos precursores son transferidos a un
transportador lipídico situado en la membrana citoplásmica (bactoprenol), donde se forman las unidades
disacarídicas con el pentapéptido.
3. Ensamblaje: Glicopéptidos y 𝛽lactámicos.
- Transglucidación: Las unidades disacarídicas se polimerizan en cadenas lineales fuera de la
membrana, pero aún unidas al bactoprenol.
- Transpeptidación: Unión del polímero lineal así formado al peptidoglucano preexistente en la
pared celular, por entrecruzamiento de sus péptidos respectivos.

Cada uno de estos antibióticos tiene su forma de

actuar:
● 𝛽lactámicos: inhiben la transpeptidación ( formación de enlaces cruzados entre los péptidos de las
cadenas de peptidoglicano).
● No 𝛽lactámicos
- Fosfomicina: inhibe la formación de N-Acetil Murámico a partir de la N-Acetil Glucosamina
- Cicloserina: inhibe la racemización del aminoácido Alanina, así como la formación del dipéptido
D-ala-D-ala. La racemización es el proceso mediante el cual el enantiómero L (levógiro) de la alanina se
convierte en su enantiómero D (dextrógiro) o viceversa. Los enantiómeros son formas especulares no
superponibles de moléculas que son imágenes especulares una de la otra, pero que no son idénticas. En el
caso de la alanina, se trata de un aminoácido que puede existir en dos formas enantioméricas: L-alanina y
D-alanina.
- Bacitracina: impide la regeneración del bactoprenol, un compuesto bioquímico que desempeña un
papel crucial en la síntesis de la pared celular en ciertos tipos de bacterias, especialmente en bacterias
gramnegativas.
- Vancomicina: inhibe transglicosidación (3ra fase) (inhibición del dímero de alanina) y en este
paso, ocurre la transferencia de los residuos de glucosa del bactoprenol a las cadenas de azúcares en
crecimiento. Esta transferencia es catalizada por enzimas transglucosidas que facilitan la formación de los
enlaces glucosídicos entre el bactoprenol y las cadenas de peptidoglicano.

El tetrapéptido unido al NAM de muchas bacterias está constituido por:

- Gram negativas: L-alanina, D-glutamico, Meso diaminopimelico, D-alanina
- Gram positivas: L-alanina, D-glutamico, L-lisina, D-alanina.
 Las cadenas polisacáridas paralelas se hallan unidas transversalmente directamente a través de los
tetrapéptidos (bacterias Gram negativas) o a través de un puente de pentaglicina que conecta dos
tetrapéptidos (bacterias Gram positivas).

[Link].1. 𝛽lactámicos
Los 𝛽-lactámicos son una clase de antibióticos que comparten una estructura química común
conocida como anillo 𝛽-lactámico. Esta estructura es un anillo de cuatro átomos que incluye un átomo de
nitrógeno, un átomo de carbono, y dos átomos de oxígeno. La presencia de este anillo es crucial para la
actividad antibacteriana de estos compuestos. A que esté unido este anillo determinará si se trata de
penicilina, cefalosporina, carbapenems o monobactámicos. En el caso de penicilina sería de la forma:

La toxicidad selectiva de estos antibióticos se basa en que las células animales no poseen pared celular,
así como tampoco las enzimas de su biosíntesis.
Los efectos adversos más relevantes son: alergia, diarrea, convulsiones a dosis altas.
 1. Penicilina: La penicilina es el prototipo de los antibióticos 𝛽-lactámicos y
fue el primero en ser descubierto en 1928. Presentan la fusión del anillo ß-lactámico
con un anillo pentagonal (anillo de tiazolidina), conformando una estructura básica
que es el ácido 6-aminopenicilánico (Ac. penicilánico) y una cadena lateral R-CO-
que ofreció la posibilidad de obtener una amplia variedad de compuestos
semisintéticos.
Penicilina G (Bencilpenicilina) - El radical acilo es el grupo bencilo.
- Tiene un espectro estrecho, con gran actividad sobre cocos gram +,
pero no frente a la mayoría de los gram -
- Es sensible a ácidos, no puede administrarse por vía oral.
- Es susceptible a penicilinas producidas por muchas bacterias.

Penicilinas Penicilinasa Resistentes - Se usan sobre todo frente a cocos +, con buena acción sobre [Link]
(Meticilina, Oxacilina) productores de penicilinasa.
- Resisten el medio ácido.

Aminopenicilinas (Ampicilina, - El grupo amino hace que puedan atravesar la membrana externa de
Amoxicilina) los gram -
- De espectro ampliado, permiten un uso efectivo frente a varias
bacterias gram - (H. influenzae, E. Coli, Proteus, Salmonella, Shigella)
- Tienen menos actividad sobre los gram +
- Resisten los ácidos

2. Cefalosporinas: Presentan la fusión del anillo ß-lactámico con un anillo

hexagonal (anillo dihidrotiacínico) conformando una estructura básica (núcleo
cefem) que es el ácido 7- aminocefalosporánico. Las cefalosporinas son
similares a las penicilinas en términos de su actividad antibacteriana.
Sintetizado por Cefalosporium acremonium.

Primera generación - Las orales son llamadas fenilglicinas o derivados hidroxifenilglicinas que incluyen la
cefalexina, cefadroxilo y cefradina; entre las parenterales (no vía oral) se cuenta con la
cefalotina, cefazolina, cefradina (administración oral también) y cefapirina.
- Este grupo de antibacterianos incluye sustitutos de la penicilina G que son resistentes a
las penicilinasas de Staphylococcus, por tanto tienen una buena actividad contra
bacterias aerobias gram-positivas y algunos organismos gram-negativos adquiridos en la
comunidad (P. mirabilis, E. coli, Klebsiella pneumoniae y Moraxella catarrhalis)

Segunda generación - Ofrecen una cobertura mayor frente a los bacilos gramnegativos que las de primera
generación y su cobertura es más extensa ya que incrementan su actividad contra
microorganismos gram-negativos, en especial tres: Haemophilus influenzae y Neisseria
sp.
- Existe un subgrupo entre estos agentes, los cuales son cefoxitina -es la más potente del
sub-grupo- cefotetan y cefmetazole que son activos contra el grupo de B. fragilis. Con
excepción de la cefuroxima, las cefalosporinas de segunda generación no deben
administrarse en meningitis.
- Estas se dividen en orales: Loracarbef, cefaclor, cefuroxime axetil y cefprozil; y
parenterales: el cefamandol, cefonicid, cefoxitina, ceforinida, cefuroxime, cefotetan y el
cefmetazole.

Tercera generación - Más eficaces in vitro frente a los bacilos gramnegativos y frente a los cocos
grampositivos (excepto S. aureus).
 - Son el tratamiento de elección en la meningitis por bacilos gramnegativos y se utilizan
también para combatir otras infecciones por bacilos gramnegativos.
- Son extremadamente activas contra la mayoría de las bacterias gram-negativas
(excepto Enterobacter y Citrobacter) y también contra bacterias productoras de
𝛽-lactamasas. La ceftazidime y el cefoperazone son activas contra Pseudomonas
aeruginosa, pero son menos activas que otros agentes de tercera generación contra cocos
gram-positivos.
- Cefixime, cefdinir, cefpodoxima proxetil y ceftibuten son las orales y cefoperazone,
ceftazidime, moxalactam, cefotaxime, ceftizoxime, cefmenoxime y ceftriaxone son
parenterales.

Cuarta generación - Tienen un extenso espectro de acción comparadas con las de tercera generación y
tienen una gran estabilidad contra 𝛽-lactamasas mediadas cromosomalmente y por
plásmidos, además de poca o ninguna capacidad para inducir la producción de
𝛽-lactamasas tipo I.
- Cubren Enterobacter y Citrobacter y tiene particular uso terapéutico en el tratamiento
de infecciones debidas a bacilos aerobios gram-negativos resistentes a cefalosporinas de
tercera generación con lo cual se logra su erradicación.
- Tienen mejor actividad contra algunos gram-positivos.
- Incluyen el cefepime y el cefpirone -ambas de administración parenteral

3. Monobactamas: son derivados del ácido 3-aminomonobactamico. Tienen una estructura

ß-lactámica sencilla con una estructura monocíclica en la que el anillo ß-lactámico no está fusionado a
otro secundario. Activos sólo frente a Gram negativos. Un ejemplos es el Aztreonam.

4. Carbapenemes: Su estructura básica consiste en un anillo ß-lactámico fusionado a uno

pirrolidínico compartiendo un nitrógeno. Resistentes a b-lactamasas al igual que las Monobactamas y son
de amplio espectro. Un ejemplo es el Imipenem.

5. Inhibidores de las 𝛽-lactamasas: Presentan una estructura muy similar a la de las penicilinas, con
cambios diversos que los hacen menos susceptibles a las ß-lactamasas. Algunos ejemplos son: Ácido
Clavulánico, Sulbactam.

[Link]. Inhibición de la sintesis de proteinas

→ Cuando los procesos de producción de las sustancias indispensables para el mantenimiento de las
funciones vitales y para garantizar su reproducción son interferidos, el resultado es la muerte de la célula
o la detención de su crecimiento.
→ Los antibióticos que interfieren en la síntesis de proteínas son muy variados y abundantes, y la
mayoría de ellos funcionan interfiriendo con el ribosoma,se unen a proteínas ribosómicas o a alguno de
los ARN ribosómicos.
→ Los más útiles son aquellos que tienen efectos selectivos
frente a los ribosomas 70s procarióticos, pero no sobre los
80s eucarióticos.
→ La diferencia en la estructura de los ribosomas explica la
toxicidad selectiva de los antibióticos que afectan la síntesis
de proteínas.

Tenemos dos subunidades ribosomales en las bacterias en las

cuales ejercen su acción:
● Subunidad 30 S:
- Aminoglicósidos ej. Estreptomicina, Neomicina,
Kanamicina, Gentamicina, Tobramicina, Amikacina
- Tetraciclinas ej. Doxiciclina, Tetraciclina
● Subunidad 50 S:
- Lincosamidas ej. Clindamicina
- Cloranfenicol
- Macrólidos ej. Eritromicina, Azitromicina, Claritromicina
- Oxazolidinonas
- Estreptograminas

La sintesis de proteinas consta de tres etapas:

​1. Iniciación:
→ Comienza con la formación del complejo de inicio, que consta de la subunidad pequeña del ribosoma,
el ARN mensajero (ARNm) y el primer ARN de transferencia (ARNt) cargado con el aminoácido
metionina.
→ Este complejo se une al codón de inicio AUG en el ARNm.
→ Luego, la subunidad grande del ribosoma se une al complejo de inicio, formando un ribosoma
funcional.
​2. Elongación: reconocimiento, transferencia y translocación
→ Durante esta etapa, se añaden sucesivos aminoácidos a la cadena polipeptídica en crecimiento.
→ El ARNt lleva aminoácidos adicionales y se empareja con los codones del ARNm mediante la regla de
apareamiento de bases.
→ La enzima peptidil transferasa cataliza la formación de enlaces peptídicos entre los aminoácidos,
extendiendo así la cadena polipeptídica.
El reconocimiento asegura la correspondencia correcta entre el ARNt y el codón del ARNm, la
transferencia implica la formación de enlaces peptídicos para alargar la cadena polipeptídica, y la
translocación facilita el desplazamiento del ribosoma a lo largo del ARNm para permitir la incorporación
sucesiva de aminoácidos.
​3. Terminación:
→ La terminación ocurre cuando el ribosoma alcanza un codón de terminación (UAA, UAG, o UGA) en
el ARNm.
→ En lugar de un ARNt, una proteína de liberación se une al sitio A del ribosoma, liberando la cadena
polipeptídica de la última ARNt y liberando la proteína sintetizada.

En resumen, la iniciación establece el ribosoma en el inicio del ARNm, la elongación agrega aminoácidos
a la cadena en crecimiento, y la terminación finaliza la síntesis de proteínas y libera el polipéptido
completado.
 Podemos agrupar a los antibióticos según la fase concreta de la elongación sobre la que actúan:
A. Inhibidores de la fase inicial de la elongación: tetraciclinas
B. Inductores de errores en la lectura del ARNm: aminoglucósidos
C. Inhibidores de la translocación: macrólidos
D. Inhibidores de la transcripción: rifamicinas

Antibiótico Sub Mecanismo de acción Estructura

unidad

Aminoglicósidos 30 S i) Se une a proteína S12 en la subunidad 30S Son azúcares complejos unidos
del ribosoma por enlaces glicosídicos. Los
ii) Bloquea la formación del complejo de grupos NH y OH interactúan
iniciación con proteínas del ribosoma.
iii) Produce lectura errónea del mensaje:
proteína defectuosa no funcional y por lo
tanto modificando la traducción del ARNm.
iv) El resultado final es la muerte de la
bacteria, son bactericidas

Tetraciclinas 30 S - Inhiben de manera reversible, la unión del Se basan en el cuádruple anillo

ARNt a los aminoácidos en la etapa de del naftaceno
reconocimiento y por lo tanto no hay
agregación de estos últimos evitando la
elongación de la cadena.
- La unión es transitoria, por lo que su
efecto es reversible: son bacteriostáticos.
- Son antibióticos de muy amplio espectro
(frente a gram-positivas, gram-negativas,
rickettsias y clamidias, e incluso
 micoplasmas), producidos por distintas
especies de Streptomyces.
- Su carácter hidrofóbico facilita su difusión
a través de membranas.

Macrólidos y 50 S i) Bloquea el paso de translocación Los macrólidos constituyen un

Lincosamidas interfiriendo específicamente con la grupo de antibióticos
liberación del ARNt desacilado, es decir, denominados así por la
impide que el ARNt “descargado” salga del presencia de un anillo lactónico
sitio P (del aminoacido) macrocíclico.
ii) El pp-ARNt cargado y situado en el sitio
A no puede translocarse al sitio P, y se
produce la parada de la síntesis de proteínas.
- La produce un actinomiceto llamado
Saccharopolyspora erithraea, y es un agente
bacteriostático.

Cloranfenicol 50 S - Su mecanismo está dado por la unión

reversible a la subunidad 50s del ribosoma,
lo que conlleva el bloqueo del acceso del
complejo ARNt al complejo ARNm-ARNr
- En este caso hay inhibición de la enzima
péptido sintetasa.
- Detiene la síntesis de proteínas en la
transferencia, por lo que es un agente
bacteriostático.
- El cloranfenicol es un antibiótico de
amplio espectro con graves problemas de
toxicidad.

Oxazolidinonas 50 S - Son exclusivos en lo que respecta a su sitio

de acción porque se unen a la subunidad
ribosómica 5OS, cerca del punto donde esta
subunidad se enfrenta con la subunidad 30S.
Actúan en la iniciación y en la
translocación.
- Estos fármacos son totalmente sintéticos,
lo que determina que el desarrollo de la
resistencia sea más lento.
 - Como la vancomicina, no son útiles contra
las bacterias gramnegativas pero son activos
contra ciertos enterococos.

[Link]. Inhibidores de la síntesis de ácidos nucleicos

Varios antibióticos interfieren en los procesos de
replicación y transcripción del DNA en los microorganismos.
Algunos fármacos con este mecanismo de acción poseen una
utilidad extremadamente limitada porque también interfieren
sobre el DNA y el RNA de las células de los mamíferos.

→ Los antibióticos pueden actuar a nivel de las topoisomerasas,

enzimas esenciales que desempeñan un papel crucial en la
regulación de la estructura del ADN. Su función principal es
alterar la topología del ADN, permitiendo cambios en la
superenrolladura y resolviendo tensiones torsionales en la doble
hélice de ADN.
Las topoisomerasas se componen de las enzimas:
➔ ADN-girasa: actúa durante la replicación del ADN para reducir la tensión molecular causada por
el superenrollamiento delante de la horquilla de replicación. La ADN girasa produce cortes de doble
cadena y después los une.
➔ Topoisomerasa IV: introduce cortes en ambas hebras del ADN, permite la separación física de las
cromátidas hijas y contribuye al proceso de división celular bacteriana tras la replicación.

.
 Recordatorio:

Hay 3 tipos de inhibidores de la síntesis de ácidos nucleicos:

Mecanismo de acción Ejemplos Estructura

Quinolonas - Inhiben la síntesis del ADN bacteriano, - Quinolonas de

actuando sobre la ADN girasa y primera
topoisomerasa IV generación
(ácido nalidíxico)
- Son activas frente a la mayoría de los - segunda
microorganismos Gram negativos y Gram generación
positivos aerobios (ciprofloxacina, (fluorquinolonas)
norfloxacina y ofloxacina)

- En general, la ADN girasa es el blanco

principal en las bacterias gramnegativas, y
la topoisomerasa IV en las grampositivas.

- Efecto bactericida.

Rifampicina - Inhibe la ARN polimerasa,la enzima - Rifamicina B

responsable de la transcripción del ADN en
ARN mensajero (ARNm), por lo que impide
la transcripción de los genes bacterianos.
- Acción bactericida
 - Rifamicina B: capacidad de pasar paredes
gruesas como las de las micobacterias
- Acción sobre gram positivas: neumococos
de cepas resistentes como Staphylococcus,
Streptococcus y Mycobacterium
tuberculosis.

Metronidazol - Actúa reduciendo el grupo nitro que - Metronidazol

compone a las bacterias anaerobias y así es - Secnidazol
incorporado en el DNA de la bacteria, - Tinidazol
tornándolo inestable o rompiéndolo. - Tioconazol
- Es un quimioterápico sintético, con - Ornidazol
actividad primariamente bactericida, de
espectro restringido a bacterias anaerobias
(y ciertos protozoos).
- Actúan sobre los microorganismos
sensibles mediante interacción de sus
derivados activos con el ADN de éstos,
cuando están en fase de crecimiento.

[Link]. Inhibidores de la membrana celular

→ Algunas moléculas de antibióticos poseen un extremo
liposoluble y otro hidrosoluble; cuando esta molécula llega a la
membrana se inserta entre la capa lipídica y la de proteínas,
produciendo una abertura entre estas capas (poros) y
conduciendo a la ruptura de la membrana (bicapa lipídica).
→ Otras sustancias desacoplan la fosforilación oxidativa con
un estímulo transitorio del consumo de oxígeno.
→ Recordatorio: la fosforilación oxidativa está íntimamente
vinculada al transporte de electrones y la creación de un
gradiente de protones en las mitocondrias. Este gradiente actúa
como una fuente de energía que impulsa la síntesis de ATP, la
principal moneda de energía en las células. Este proceso es
esencial para la generación eficiente de energía en forma de
ATP durante la respiración celular.

Antibioticos inhibidores según su mecanismo de acción:

● Desorganización de su membrana citoplasmática: altera la permeabilidad, y si la integridad
funcional de la membrana se altera los iones y macromoléculas se escapan y la célula se lesiona y muere.
Ej: polimixina, nistatina, anfotericina B.
● Polipéptidos: Estos antibióticos polipéptidos tienden a afectar a las bacterias de manera más
específica, ya que sus blancos suelen ser componentes celulares específicos que no están presentes en las
células humanas. Sin embargo, también pueden tener limitaciones, como la toxicidad y la posibilidad de
generar resistencia bacteriana. Ej: Bacitracina y polimixina (uso tópico)

[Link]. Inhibidores sobre vías metabólicas

Antibióticos Mecanismo de acción Estructura Ejemplos

Sulfonamidas - Interfieren con el metabolismo del ácido fólico, - Su estructura es - Trimetoprim

y Trimetoprim que es un precursor de la síntesis de purinas, similar al ácido - Sulfametoxazol
pirimidinas y aminoácidos. Se bloquea la síntesis paraaminobenzoico - Sulfasoxazol
 de ácidos nucleicos y pared celular. (PABA), un factor - Sulfadiazina
- Se usan generalmente combinados, ya que requerido por las
producen un efecto sinérgico, en infecciones bacterias para la síntesis
respiratorias, urinarias y gastroenteritis por del ácido fólico
Shigella y Salmonella.
- Bacteriostáticos sintéticos de amplio espectro,
eficaces contra la mayoría de las bacterias Gram
positivas y muchas bacterias Gram negativas.

Metabolismo del ácido fólico y estructuras moleculares intervinientes:

5.6. BIOFILMS
Son comunidades de microorganismos que crecen adheridos a una superficie, biótica o abiótica,
embebidos en una matriz de sustancias polisacáridas extracelulares (EPS) que ellas han producido y que
exhiben un fenotipo alterado en relación con la tasa de crecimiento y trascripción génica. Diversos
estudios realizados en una gran variedad de hábitats demostraron que la mayoría de los microorganismos
se desarrollan y persisten adheridos a superficies (células sésiles) dentro de ecosistemas estructurados
denominados biofilms o biopelículas, y no como organismos de crecimiento libre en soluciones acuosas
células planctónicas.
La matriz extracelular (MEC) es una red tridimensional de moléculas que rodea y proporciona soporte
estructural a las células en tejidos animales y vegetales. La MEC está compuesta por una variedad de
proteínas, carbohidratos y en algunos casos, fibras. Desempeña un papel crucial en la regulación del
comportamiento celular, la adhesión celular, la señalización y la determinación de la forma y la función
de los tejidos. La MEC supone entre un 75% y 90% del volúmen de un biofilm maduro, el resto está
compuesto por agua y microorganismos.

5.6.1. Fases del desarrollo de biofilm

1. Acondicionamiento a la superficie y adsorción de moléculas orgánicas
- Factores físicos: temperatura, rugosidad, topografía y carga superficial. Estos factores influencian
el transporte, los fenómenos de interfase, el desprendimiento y las reacciones en la interfase.
- Factores químicos: la composición de la superficie del sustrato, la composición del medio en el
que se desarrolla el biofilm, el pH, el oxígeno disuelto
2 y 3. Adhesión reversible y adhesión irreversible
- Activa: Motilidad otorgada por flagelos, fimbrias y pilis tipo IV. Gram-positivas inmóviles, como
estafilococos, estreptococos y micobacterias: la participación de proteínas de superficie.
- Pasiva: Factores externos: gravedad, difusión, precipitación de partículas y dinámica de fluidos
pueden favorecer la adhesión de los microorganismos a cualquier superficie.
- Unión específica entre las adhesinas bacterianas y un receptor del sustrato.
- En la formación de microcolonias, el anclaje microbiano se vuelve irreversible debido a la
secreción de polímeros extracelulares, En la etapa de colonización, las macromoléculas orgánicas e
inorgánicas se absorben a la superficie causando un anclaje reversible, es decir, interacciones débiles
entre las células y el medio de soporte como las fuerzas de Van der Waals
4. Maduración del biofilm
- Arquitectura compleja, con canales, poros y redistribución de bacterias en el sustrato.
- Limitado por la disponibilidad de nutrientes, la penetración de estos nutrientes dentro del biofilm
y la eliminación de residuos.
5. Desprendimiento de células
- Liberación de células (ya sea individualmente o en grupos) de un biofilm o sustrato. Causa:
necesidad de nutrientes o la presencia de sustancias agresivas.

5.6.2. Mecanismos de resistencia del biofilm

- Respuestas antioxidantes: enzimáticas y no-enzimáticas
- Baja penetración
- Alteración del ambiente: cambios en el pH, circulación de agua
- Inactivación
- Fenotipos persistentes: la célula persiste ante altas concentraciones del antimicrobiano sin mutar
genéticamente.
5.6.3. Impacto del biofilm
El 65% de las infecciones bacterianas humanas implican la producción de biofilms
Impacto en la industria:
→Problemas sanitarios: pérdidas de calidad y vida útil de los alimentos. Microorganismos precedentes de
materias primas, aire, agua, operarios, etc se pueden instalar como biofilms en planta y actuar como
reservorio desde los que se transfieren al alimento procesado
→ Problemas tecnológicos: alteración de las propiedades de las superficies (fricción, transferencia de
calor, obturación de conductos, orificios, filtros, válvulas), además facilitan la corrosión.
→ Problemas biotecnológicos: los biofilms son una forma natural de inmovilización de células
microbianas, algunas de ellas se utilizan para la obtención de ingredientes y aditivos, tratamiento de aguas
residuales, etc.
Ventajas para el microorganismo:
→ Es un modo protegido de crecimiento que permite la supervivencia de bacterias en un entorno hostil
debido a cambios en las condiciones del medio.
→ Protección frente a agentes antimicrobianos
→ Incremento de la disponibilidad de nutrientes para el crecimiento
→ Incremento de la unión a moléculas de agua, reduciendo el riesgo de deshidratación
→ Proximidad a otras bacterias, facilitando la cooperación y transferencia de genes
→ Mayor resistencia frente a desinfectantes
- Difusión lenta o incompleta del biocida al interior del biofilm
→ Procesos de adaptación y tolerancia de los microorganismos al desinfectante:
- Exposiciones a concentraciones subletales generan células persistentes
- Diferenciación fisiológica de las células en el biofilm
- Las sustancias que integran la MEC generan resistencia
6. RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS

6.1. RESISTENCIA BACTERIANA

→ Los antimicrobianos son un recurso terapéutico al que solo se debe acudir cuando son realmente
necesarios porque:
1. el problema de la resistencia aumenta
2. las posibilidades de nuevos antimicrobianos disminuyen.
→ La resistencia bacteriana es la capacidad natural o adquirida de una bacteria de permanecer
refractaria a los efectos bactericidas o bacteriostáticos de un antibiótico. Las modificaciones genéticas en
cromosomas o en plásmidos bacterianos dan lugar a diferentes mecanismos moleculares de resistencia.
- En la clínica resulta en la imposibilidad de realizar el control de la infección y la erradicación del
agente patógeno causal, con el consiguiente aumento en la mortalidad por enfermedades
infecciosas.
- En el laboratorio se expresa como un incremento significativo en la concentración mínima (CIM)
para inhibir el crecimiento del microorganismo
→ Hay dos tipos de resistencia
1. Resistencia intrínseca: Propia de cada familia, especie o grupo bacteriano. Por ejemplo, todos los
gérmenes Gram negativos son resistentes a la Vancomicina.
2. Resistencia adquirida:
- Endógena: mutación en genes propios (inactivación, modificación o cambio en el nivel de
expresión).
- Exógena: Transferencia horizontal de determinantes de resistencia a través de plásmidos,
transposones.

6.2. CAUSAS DE LA APARICIÓN DE RESISTENCIA

→ La aparición de resistencia se produce por dos factores fundamentales:
1. La existencia de genes determinantes de la aparición de un mecanismo de resistencia, que pueden
ser transferidos entre células bacterianas de una misma cepa o cepas diferentes, convirtiendo la
resistencia en un fenómeno transferible.
2. El uso amplio de antibióticos que ejercen una presión de selección que favorece la supervivencia
de cepas que portan y expresan genes determinantes de resistencia.
La resistencia puede, en consecuencia, originarse en mutaciones al azar de genes localizados en los
cromosomas o en sitios extracromosómicos como los plásmidos, que confieren resistencia (es decir un
fenómeno primario no relacionado con el uso previo de un antibiótico), o como consecuencia del uso
repetitivo y extendido de un determinado compuesto.

→ Contribuye a la aparición de resistencia:

1. Dosis insuficientes de antibióticos.
2. Tratamientos cortos.
3. Uso de antibióticos en enfermedades de infecciones banales, por ejemplo diarrea, porque se elimina
muy rápido.
4. Infecciones víricas.
5. Profilaxis antibiótica.
6. Uso de antibióticos de amplio espectro.
7. Uso innecesario de nuevos antibióticos.

6.3. MECANISMO DE ACCIÓN

Los mecanismos que llevan a la resistencia bacteriana en contra de la acción de un antibiótico
(ATB) a nivel metabólico son:
1) Bloqueo del transporte de ATB hacia el interior de la bacteria.
2) Modificación del blanco o incremento de su producción hasta superar los efectos del ATB.
 3) Alteración del ATB.
4) Salto del paso metabólico atacado por el ATB.
5) Biofilms.

A nivel genético:

Los mecanismos de acción dependen del antibiótico utilizado como ya hemos visto:
● 𝛽lactámicos y Glucopéptidos: inhiben la síntesis de la pared celular.
● Aminoglicósidos, Macrólidos, Lincosamidas, Tetraciclinas: inhiben la síntesis proteica al alterar la
función de los ribosomas.
● Fluoroquinolonas: inhiben la síntesis del ADN.
● Trimetoprima/Sulfametoxazol (TMP-SMZ): actúan en el citoplasma e interfieren, entre otras con
la síntesis del ácido fólico.
● Polimixinas: Interfieren con la membrana citoplasmática.

6.4. MECANISMOS DE RESISTENCIA ANTIBIÓTICA

Inactivación Modificación de la Disminución de la Modificación de la

enzimática permeabilidad de la concentración estructura de las proteínas
membrana celular intracelular blanco

- 𝛽-lactamasas, - La resistencia a los - Es el resultado de la - La inhibición de la síntesis

catalizan la degradación 𝛽-lactámicos en las acción de proteínas de de las proteínas bacterianas al
del antibiótico mediante bacterias gram negativas membrana celular unirse a los ribosomas es el
la ruptura del enlace son el resultado de interna con actividad de mecanismo de acción de
amino del anillo mutaciones que modifican bombas de flujo reverso. tetraciclinas, macrólidos,
b-lactámico para la estructura o función de (expulsan al lincosamidas y
producir metabolitos proteínas de membrana antimicrobiano de la aminoglucósidos.
inactivos. denominadas porinas. célula)
- Actúan en el espacio - Determina la
extracelular contenido resistencia de cepas de
entre la membrana y la algunos gram positivos a
pared celular y pueden tetraciclinas.
ser neutralizadas por - La estructura de estas
inhibidores específicos. proteínas es codificada
- Los aminoglucósidos por genes cromosómicos
son inactivados durante y extracromosómicos
su transporte a través de cuya expresión es
la membrana celular de inducida en presencia
los gérmenes anaerobios del antibiótico.
por enzimas que
catalizan la adenilación,
acetilación y
fosforilación de grupos
amino e hidroxilo.
- El cloranfenicol es
inactivado por medio de
una reacción de
acetilación catalizada
por la
cloranfenicol-acetiltrans
ferasa.
- La eritromicina es
hidrolizada en su anillo
lactona por medio de la
eritromicina esterasa.

- b-lactámicos: [Link] - b-lactámicos, - Macrólidos (Modificación

, Haemophilus aminoglucósidos, ribosomal): E. faecium, S.
influenzae, Neisseria cloranfenicol, macrólidos, aureus MR, S. pneumoniae,
gonorroheae, quinolonas, sulfonamidas: Bacteroides fragilis
Enterococcus faecalis Enterobacter y - Tetraciclinas (Modificación
Pseudomonas aeruginosa ribosomal): N. gonorrhoeae,
- Aminoglucósidos: Streptococcus spp
[Link], [Link], - Vancomicina: - Rifampicina (Modificación
Enterococcus Staphylococcus aureus de RNA polimerasa): E. coli,
S. aureus
- Macrólidos: [Link], - Cefalosporinas: - Quinolonas (Modificación
enterobacterias Salmonella typhimurium de DNA girasa): Enterobacter,
S. aureus
- Quinilonas: Serratia -Isoxazolilpenicilinas
marcesens, Pseudomonas (Modificación de PBPs): S.
aeruginosa aureus MR
6.4.1. Las 𝛽-lactamasas
Son enzimas bacterianas globulares capaces de hidrolizar:
- Penicilinas: las enzimas que inactivan a estos antimicrobianos son las
𝛽-lactamasas que rompen el anillo 𝛽-lactámico e hidrolizan el antibiótico por
formación del complejo acil-penicilina evitando su regeneración, eso se repite y
ataca otros antimicrobianos.
- Cefalosporinas
- Carbapenemes

→ Las b-lactamasas y PBP son serina proteasas que están altamente relacionadas, ya que los antibióticos
𝛽lactámicos, como la penicilina, actúan inhibiendo la acción de las PBP y las b-lactamasas .
- Las proteínas de unión a la penicilina (PBP) son un grupo de proteínas que desempeñan un papel
crucial en la síntesis de la pared celular bacteriana. Estas proteínas son el blanco de los
antibióticos 𝛽lactámicos, como la penicilina, que inhiben su actividad. Al interferir con las
proteínas de unión a la penicilina, estos antibióticos debilitan la pared celular bacteriana, llevando
a la lisis celular y, en última instancia, a la muerte de la bacteria.
- Las b-lactamasas pueden estar presentes en el microorganismo (constitutivas) o frente a la
aparición del antibiótico se induce su síntesis (inducibles).
→ Ambas se diferencian en que:
- Las PBP se encuentran en la membrana citoplasmática de las bacterias y con un bajo nivel de
disociación.
- Las 𝛽-lactamasas están libres (antes que las PBP) y presentan altísimos niveles de disociación
(viene, rompe y se suelta).
[Link]. Clasificación según espectro de acción
1. Penicilinasas: Son enzimas presentes en un tipo de bacterias llamadas Staphylococcus spp. Estas
enzimas solo afectan a las penicilinas.
2. 𝛽-lactamasas de espectro ampliado (BLEA): Se encuentran en bacterias Gram negativas.
Actúan sobre un tipo de antibióticos llamados cefalosporinas de primera generación. Algunos
ejemplos de estas enzimas son TEM-1, TEM-2, SHV-1 y OXA-1, y generalmente se encuentran
en elementos genéticos llamados plásmidos. Pueden ser detenidas por medicamentos como ácido
clavulánico y sulbactam.
3. 𝛽-lactamasas de espectro extendido (BLEE): Son versiones más fuertes de las BLEA y afectan a
cefalosporinas de tercera generación. Algunos ejemplos de estas enzimas son TEM-3 a 78, SHV-2
a 18, OXA-2 a 23, y otras como PER-1 y 2, CTX-M-1, 2 a 30.
4. Cefalosporinasas: Son enzimas presentes en ciertas bacterias como Enterobacter spp., Citrobacter
spp., Serratia spp. y Pseudomonas aeruginosa. Estas enzimas afectan a diferentes tipos de
antibióticos como penicilinas, cefalosporinas y monobactams. No pueden ser detenidas por
medicamentos como ácido clavulánico o sulbactam. Además, estas enzimas pueden ser
"inducibles" o "constitutivas".

6.4.2. Antibióticos y su resistencia (ACA VA EL CUADRO DE XMIND)

● Penicilina
Glucopéptidos

6.5. PATÓGENOS MULTIRRESISTENTES (resistencia a múltiples antibióticos)

Staphylococcus - Meticilina: alteración de las PBPs

aureus - Penicilina: producción de 𝛽-lactamasas
- Vancomicina: alteración de la permeabilidad
- A veces pueden presentar resistencia intrínseca por modificación del sitio blanco de
las PBPs.
- Eritromicina: resistencia a otros macrólidos.
- Tetraciclina: eflujo, protección ribosomal.
- Aminoglucósidos: cambios en proteínas ribosomales, impermeabilidad de la
membrana, modificación del ATB por enzimas bacterianas.
- Trimetoprima: sobreproducción de dihidrofolato reductasa o afinidad disminuida de la
enzima por trimetoprima.
- Fluorquinolonas: mutación del gen gyrA, eflujo, modificaciones en el gen grlA
(topoisomerasa IV).

Enterobacterias - Hay resistencia intrínseca.

- Resistencia a través de las 𝛽-lactamasas de espectro extendido (BLEE):
a. Las BLEE son enzimas derivadas de las b-lactamasas de amplio espectro TEM-1
y SHV-1, conocidas como BLEA.
 b. Estas enzimas presentan mutaciones que amplían su capacidad de hidrólisis a
todas las cefalosporinas, excepto de las cefamicinas, así como a los
monobactámicos.
c. Pueden ser inhibidas por el ácido clavulánico, lo que significa que la
combinación de antibióticos con este inhibidor puede restaurar parcialmente la
eficacia de los fármacos afectados.
d. Se han identificado nuevos grupos de BLEE, como CTX-M y OXAs, que
presentan diferentes perfiles de resistencia y pueden contribuir a la diversidad de
resistencia en las enterobacterias.
- Ocurre el fenómeno de transferencia entre distintas cepas de la misma especie y entre
distintas especies.
- Hay asociación con los mecanismos de resistencia co-transferibles en el mismo
elemento genético (aminoglucósidos).

Enterococcus - Resistente a glucopéptidos

- Mecanismo de resistencia sofisticado localizado en elementos genéticos transferibles
(transposones) localizado en plasmidos transferibles entre distintas especies

Pseudomonas - Multirresistente a penicilinas antiestafilocóccicas, ampicilina, amoxicilina-ácido

aeruginosa clavulánico, ampicilina-sulbactam, tetraciclinas, macrólidos, rifampicina, cloranfenicol,
trimetoprima sulfametoxasol, cefalosporinas de primera y segunda generación.
- Son susceptibles a penicilinas antipseudomonas, a aminoglucósidos, imipenem, etc.
- Resistencia adquirida emergente: carbapenemasas
- Resistencia por mutación en genes cromosómicos: Hiperproducción de bombas de
expulsión e hiperproducción b-lactamasa cromosómica

Mycobacterium - Tratamiento prolongado: genera mal cumplimiento/abandono, y la negligencia en el

tuberculosis control hace aparecer multirresistencias.
-Se utilizan fármacos con:
a. Elevado poder bactericida contra bacilos activos (Fluorquinolonas, Cicloserina)
b. Actividad esterilizante contra bacilos en estado semilatente.
7. TAXONOMÍA
La Taxonomía es la ciencia artificial (influenciada por avances en las técnicas) de la clasificación,
que agrupa (en el contexto de la microbiología) a los organismos vivos en grupos según sus
características fenotípicas o genéticas. Busca ser estable (invariable en el tiempo), objetiva (imparcial y
universal) y predictiva (posibilidad de prever futuros descubrimientos, o incorporarlos en su sistema).
Gracias a este sistema podemos ubicar el mundo procariota dentro del mundo de los seres vivos, y nos
permite nombrar a los MO descubiertos y por descubrir de acuerdo a sus características.
Para su estudio propongo conocer, primero, los sistemas de clasificación empleados, después analizar sus
criterios taxonómicos (características que se aprecian y las posibilidades que ofrecen). Ya conociendo la
forma de clasificar y sus posibilidades finalmente explicar la jerarquía que se usa, como se nombran y el
enfoque en que se puede representar dicha clasificación.

7.1. SISTEMAS DE CLASIFICACIÓN

El sistema de clasificación se basa en niveles / rangos taxonómicos. Se profundiza en el apartado 7.3

JERARQUÍA EJEMPLO: E. coli

● Dominio bacteria
● Reino proteobacteria
● Clase gammaproteobacteria
● Orden enterobacteriaceae
● Familia enterobacteriaceae
● Género Escherichia
● Especie E. coli

Donde el grupo taxonómico básico es la Especie (con el cual casi siempre nos manejamos). Este sistema
logra ubicar a cualquier MO en grupos homogéneos, que a su vez, pertenecen a otro grupo más extenso
siguiendo una estructura jerárquica sin superposición.
Reconocemos 2 principales sistemas de clasificación:

7.1.1. Sistema fenético9

Responde a la agrupación por semejanzas de características
observables, como morfología, comportamiento metabólico / físico /
químico, fisiología, estructura celular, entre otros.
Sin embargo, este sistema de clasificación muestra dificultades a la hora de
comparar MO de características fenotípicas similares. Por lo tanto es bueno
tener otro sistema de clasificación confiable que permita complementarse
con las características reales / observables.

7.1.2. Sistema filogenético10

Sistema que agrupa a los microorganismos en función de probables
relaciones evolutivas, los genes asociados a los rangos que se mantuvieron
con el paso del tiempo. Hoy en día es posible reconocer y estudiar la
genética bacteriana, por lo que es posible establecer relaciones evolutivas y similitudes filogenéticas entre
bacterias.

9
FENOTIPO: Características físicas, bioquímicas y del comportamiento que se pueden observar
10
FILOGENIA: estudio de la historia evolutiva de los organismos.
7.2. CRITERIOS TAXONÓMICOS
Los criterios taxonómicos son los diversos criterios y características que se consideran a la hora
de clasificar un organismo. Visto en otras palabras, las “opciones” que se pueden elegir o diferenciar al
aplicar un sistema taxonómico.

7.2.1. Taxonomía fenotípica

La taxonomía fenotípica adjunta todas las características y rasgos fenotípicos que se puede
distinguir y clasificar de un [Link]: son (casi) todos los casos que se vieron con anterioridad
A conocer:
● MORFOLOGÍA: Abarca la forma y tamaño celular o de las colonias, características
ultraestructurales, tinción gram, tipos de flagelos y motilidad, presencia forma y localización de
endosporas, inclusiones celulares, presencia y tipo de cápsula, y color.
● MOTILIDAD: Si la especie cuenta (o no) con motilidad, tipo de motilidad (por deslizamiento,
flagelar y tipo de flagelo, en enjambre, por vesículas o gas).
● METABOLISMO: Conservación de energía (fototrofia, quimioorganotrofos, quimiolitotrofía),
tipo de metabolismo, utilización de compuestos individuales (carbono, nitrógeno, azufre, tipo de
fermentación), necesidad de factores de crecimiento.
● FISIOLOGÍA: Márgenes de temperatura, pH, presión osmótica, tipo de respiración celular,
presencia de catalasa y oxidasa11, producción de enzimas extracelulares.
● QUÍMICA DE LÍPIDOS CELULARES: Ácidos grasos, lípidos polares, quinonas respiratorias.
● QUÍMICA DE LA PARED CELULAR: Presencia / ausencia de peptidoglicano, composición
de los aminoácidos del entrecruzamiento, o presencia / ausencia de puentes de entrecruzamiento
(tipos de gram Básicamente, y los “casos extra” que se mencionaron.
● OTRAS: Pigmentos, luminiscencia, sensibilidad a antibióticos.

[Link]. Serotipia
Clasificación o identificación de microorganismos basada en diferencias antigénicas específicas
presentes en su superficie. Estas diferencias se basan en antígenos, que son moléculas que el sistema
inmunológico reconoce y que pueden provocar una respuesta inmunitaria.
Las pruebas serológicas permiten diferenciar entre diferentes especies, como así también diferentes cepas
(ya se profundiza más adelante). Cepas con diferentes antígenos se denominan serotipos, serovariedades,
biovariedades.
EJEMPLOS DE SEROTIPIA (mencionados en el Tórtora): Para terminar de entender la serotipia se
mencionan 2 casos
- Ensayo imnunosorbente ligado a enzimas (ELISA): Se utiliza por su amplitud y rapidez, y
lectura accesible y rápida. En un ensayo ELISA se introduce una bacteria desconocida en los
pocillos de una microplaca con anticuerpos conocidos. La reacción entre anticuerpos y la bacteria
permite identificar la bacteria (este ensayo se usa para el SIDA, para identificar anticuerpos contra
el virus HIV).
- Western blot: Se utiliza para identificar anticuerpos en el suero. La infección de HIV se confirma
con Western blot, y también a menudo la enfermedad de Lyme.

[Link]. Fagotipia
La fagotipia es un método utilizado en microbiología para clasificar y tipificar bacterias mediante
la observación de cómo ciertos tipos de virus, llamados bacteriófagos o fagos, infectan y se reproducen en

11
ENZIMA OXIDASA: involucrada en procesos de transferencia de electrones, ayudando en la transferencia de electrones de
un sustrato a un aceptor de electrones. Fundamental en la cadena de transporte de electrones y en la respiración aeróbica.
esas bacterias específicas. La tipificación por fagos es una prueba para determinar a qué fagos es
susceptible una bacteria. Los bacteriofagos son altamente especializados, pues solo infectan una especie
en particular. Una cepa bacteriana podría ser susceptible a dos fagos diferentes, mientras que otra cepa de
la misma especie podría ser susceptible a esos dos fagos más un tercer fago.

7.2.2. Taxonomía genética

La taxonomía genética es la más importante para la clasificación de géneros y especies, donde se
analiza el estudio de genes (específicamente el gen 16S, altamente conservado en los MO).
En una jerarquía filogenética la agrupación de los organismos implica que un grupo de organismos
evolucionó a partir de un antepasado común; cada especie conserva algunas de las características del
antepasado. Si bien no se puede hablar de restos fosilizados en MO, si se puede recurrir a la secuencia de
ADN, donde las bacterias pueden todavía conservar secuencias genéticas compartidas con su antepasado
común. Así, identificando esas secuencias, se puede establecer relaciones y clasificaciones de una forma
más certera.
Las ventajas de la filogenética es que actualmente existen muchas bibliotecas genéticas compartidas a
nivel mundial, lo que facilita la comparación de MO ambientales o patógenos con datos conocidos. Nos
permite
● Tener un concepto más unificado de especie.
● Conocimiento más objetivo y estable.
● Se pueden organizar esquemas de identificación fidedignos.
● Indica la evolución de microorganismos y cómo pueden agruparse.

[Link]. Comparación genética

La filogenética emplea la hibridación, mide el número de secuencias de ADN que 2 organismos
cualesquiera tienen en común, para estimar un porcentaje de divergencia en las secuencias ADN
relacionadas pero no idénticas.
Se comparan macromoléculas, comportándose como cronómetros evolutivos.
● Estas moléculas están presentes en todos los seres vivos.
● Realizan la misma tarea en todos los organismos.
● Sus secuencias deben mostrar partes similares y diferentes.
● La rapidez con la que cambia la secuencia de estas moléculas se relaciona con cuán lejos están
evolutivamente los organismos.

[Link]. Características moleculares

Las técnicas para distinguir las secuencias del ADN y encontrar relaciones.

Composición de los ácidos nucléicos: La medición del contenido de G+C es útil para distinguir entre
diferentes tipos de bacterias o microorganismos, ya que esta proporción puede variar entre especies.
Algunas especies pueden tener un contenido de G+C más alto, mientras que otras tendrán proporciones
más bajas.
Secuenciación de ácidos nucléicos: La secuenciación
de ácidos nucleicos implica determinar el orden exacto
de las bases nitrogenadas (adenina, timina, guanina y
citosina) en una cadena de ADN o ARN. La tecnología
moderna ha permitido secuenciar genomas completos, lo
que ha revolucionado la comprensión de la diversidad y
la relación entre diferentes especies. Comparar
secuencias de ADN o ARN entre organismos revela
similitudes y diferencias, lo que puede ayudar a entender
cómo están relacionados evolutivamente.

Hibridación de ácidos nucléicos: La hibridación

implica la unión de dos cadenas de ácidos nucleicos
(ADN o ARN) de secuencias complementarias para
formar una doble hélice. La técnica de hibridación
permite ver cuán similares son las secuencias, ya que las
secuencias más parecidas tendrán una mayor capacidad
de unirse entre sí. Esto puede proporcionar información
valiosa sobre la relación genética entre diferentes
organismos.

Comparación de proteínas: Las proteínas desempeñan

funciones vitales en los organismos y están codificadas por los genes. Comparar las secuencias de
proteínas entre diferentes especies puede proporcionar información sobre su relación evolutiva.

Las similitudes en
las secuencias de
proteínas pueden
indicar un ancestro
común o una
relación más
estrecha entre
organismos,
mientras que las
diferencias pueden
señalar divergencias
evolutivas.
 7.3. JERARQUÍA
7.3.1. Nomenclatura
Los microbiólogos asignan nombre a los MO de acuerdo al sistema binomial (Carl Von Linneo,
1707-1778).
El nombre, latinizado y en cursiva, consta de 2 partes:
● El primer nombre, con mayúscula, corresponde al nombre genérico. Nos dice el género
● El segundo nombre, en minúscula, que nos dice la especie.
● A menudo se abrevia el nombre genérico con una letra mayúscula.

EJEMPLO:
Escherichia coli : Género Escherichia, especie
coli, abreviado como E. coli
Sin embargo, si queremos dar una taxonomía
completa en un MO, tenemos que tener en cuenta
toda la estructura jerárquica hasta llegar a la
especie.
 También hay estructuras
conservadas que permiten estas
distinciones, las secuencias ARNr
16/18 s de los 3 dominios.
Donde la posición puntual de
ciertas estructuras discierne y
caracterizan si un MO corresponde
a una bacteria o arquea.

Donde en el cuadro inferior se ve

un árbol filogenético de los
principales linajes de la bacteria.
La parte inferior, base del árbol,
representa las secuencias de ARNr
16 compartidas por todas las bacterias, y a medida que avanzan las ramificaciones esas secuencias se van
diversificando y divergen entre sí, marcando nuevas clasificaciones.
7.3.2. Definición de especie
Los taxónomos definen como especie a un grupo de poblaciones naturales que se reproducen entre
sí y que están aisladas de otros grupos desde el punto de vista reproductivo. Pero en microbiología se
habla de colección de cepas que comparten numerosas propiedades estables y que difieren de forma
significativa de otros grupos de cepas.
● CEPA: Población de microorganismos que desciende de un único microorganismo / o aislamiento
en cultivo puro.
○ MUTANTE: Difiere en genotipo y fenotipo de la cepa progenitora.
○ SALVAJE: Cepa aislada de la naturaleza.
● GÉNERO: Grupo bien definido de una o más especies claramente separado de otros géneros.
Cada especie tiene un género, debido a la jerarquía taxonómica.

Una especie corresponde a un grupo taxonómico básico, menos definido que para organismos superiores
y de rasgos morfológicos no tan importantes. Puede ser considerada una colección de cepas que muestran
muchos rasgos en común y difieren considerablemente de otras cepas.
Oficialmente, se acepta una última categoría más en la jerarquía, correspondiendo a las subespecies,
correspondiente a variaciones fenotípicas y genotípicas menores en una misma especie, pero de carácter
constante (se repiten).

7.3.3. Determinación de especie

Para empezar a concluir la unidad, ya se vio los conceptos básicos para la taxonomía, sus sistemas
y que se analiza en cada caso, y como se compone la jerarquía. Queda el punto de saber cómo determinar
una especie en laboratorio, o en caso inverso, como incorporar un MO conocido en la jerarquía
taxonómica empleada.
1. Uno de los primeros pasos en la identificación de las bacterias es la tinción diferencial. Casi todas
las bacterias son G(+) o G(-). Otras tinciones diferenciales, como la de ácido-alcohol resistencia,
pueden ser útiles para un grupo más limitado de microorganismos. Se considera el estudio de la
pared celular del microbio como un muy buen primer paso, para empezar a delimitar las futuras
operaciones. Además que en el proceso se clasifica morfológicamente.
2. Apartándose de la información visual a microscopio, para especificar una especie y determinar de
forma precisa un MO se realizan pruebas bioquímicas y conocer las actividades enzimáticas de la
especie a tratar. Podemos mencionar, en términos generales, pruebas de:
a. Prueba de la catalasa y oxidasa: para determinar la presencia de catalasa y oxidasa,
fundamentales en la respiración celular y prevención de toxinas por parte del oxígeno.
b. Fermentación de carbohidratos: empleamos diferentes medios de cultivo con diversos
carbohidratos (glucosa, lactosa, sacarosa) para observar la capacidad de la bacteria para
fermentar azúcares. La producción de ácidos, gases o cambios de coloración demuestra la
capacidad de fermentación de la bacteria (véase medios de cultivo, mencionando diferentes
medios diferenciales y su resultado).
c. Prueba de citrato: Para evaluar si, en un medio con citrato como única fuente de carbono,
la bacteria puede emplearlo como tal.
d. Prueba de coagulasa: Se usa principalmente para distinguir entre especies de
Staphylococcus.
e. Entre muchas otras.

Así, se puede llegar a conclusiones: por ejemplo todos los miembros de la familia Enterobacteriaceae son
oxidasa negativos. Las bacterias de esta familia pertenecen a los géneros Escherichia, Enterobacter,
Shigella, Citrohacter y Salmonella. Escherichia, Enterobacter y Citrobacter, que fermentan la lactosa para
producir ácido y gas, pueden distinguirse de Salmonella y Shigella, que no lo hacen.
Para finalizar, uno de los principales grupos bacterianos que se distinguen y deben de profundizar son los
Gram (+) y los Gram (-)

(PARA INFORMACION COMPLETA VER EL MANUAL DE BERGEY, AL FINAL DEL TÓRTORA.

7.4. ENFOQUE
Se sintetizan todos los enfoques
indirectamente trabajados en la unidad, y las diversas
formas que se puede organizar una especie para su
estudio, y según qué se esté estudiando de ella.

7.4.1. Enfoque clásico

La microbiología clásica se basa en función a
ciertas técnicas estandarizadas y conocidas.

7.4.2. Enfoque evolutivo / numérico

Luego está la taxonomía evolutiva, que hacía una
agrupación de MO en función a características compartidas con cortos organismos ya conocidos y
clasificados taxonómicamente . Se calcula luego un coeficiente o porcentaje de similitud. Se puede
emplear un dendograma, o matriz de similitudes entre los organismos.
7.4.3. Enfoque genético o molecular
Se basa en la identificación mediante un gen
conservado. Se compara la secuencia de cada
secuencia de genes en una cepa dada, con la
secuencia de genes para cada especie conocida.

AVISO PREVIO: la taxonomía bacteriana es

muy (MUY) larga, si se quiere info completa consultar el manual de Bergey al final del tórtora
(para filos clases y órdenes) y al final del brock (para géneros y especies)., acá se adjuntan tablas de
los MO que se trabajan en las diapos. (893 - 899 brock)

CHAT GPT A VECES SE EQUIVOCA, NO CONFIAR DEL TODO

8. TAXONOMÍA GRAM NEGATIVO

Se adjunta una gráfica con la jerarquía empleada para las Gram (-) y tablas con propiedades, las
remarcadas en negrita son las más desarrolladas en la unidad

G(-) FILOS
FILO CARACTERÍSTICAS

Proteobacterias ● La mayoría de bacterias conocidas.

● Amplia variedad de mecanismos de generación de energía.
● Relevancia médica, industrial, agrícola.
● Diversidad por su relación con O2.
● Morfológicamente variables

Bacteroidetes ● Gran variedad presentes en suelos, agua dulce y ambientes intestinales de

humanos y animales.
● Algunas desempeñan funciones importantes en la descomposición de
materia orgánica y en la fermentación
 Cyanobacterias ● Fotoautótrofos empleando CO 2 como fuente de C.
● Ampliamente distribuidas en ambientes acuáticos y terrestres.
● Producen O2 por fotosíntesis.

Chlamydiae ● Bacterias intracelulares obligadas12 que pueden causar infecciones en

humanos y animales.
● Responsables de enfermedades como la clamidia
● Ciclo de vida complejo que involucra la intrusión en las células huésped

Planctomycetes ● Presencia de membranas celulares internas y un metabolismo diverso.

● Presentes en ambientes acuáticos y suelos y han despertado interés debido a
su diversidad metabólica.

Fusobacterias ● Anaerobias presentes en el interior del ser humano.

● Forma de varilla, inmóviles y fermentativas.

Espiroquetas ● Forma alargada y enrollada helicoidalmente.

● Treponema es la causante de sífilis.

G(-) CLASE
CLASES DE CARACTERÍSTICAS
PROTEOBACTERIAS

Alfa proteobacterias ● Crecen con niveles bajos de nutrientes (oligotróficos).

● Algunos poseen prolongaciones celulares.
● Fijadores de nitrógeno, quimioautótrofos, quimioheterótrofos.

Beta proteobacterias ● Habitan en el agua y suelo.

● Algunos son patógenos humanos.
● Incluyen quimioautótrofos y quimioheterótrofos.

Gamma proteobacterias ● Suelen ser aeróbicas.

● Frecuente presencia de flagelos.
● Gran diversidad metabólica
● Algunos son extremadamente importantes en el ciclo del azufre y
el ciclo del carbono en ambientes marinos.

Delta proteobacterias Incluyen géneros: Myxococcus, Bdellovibrio, Desulfovibrio

Epsilon proteobacterias Incluyen patógenos humanos Campylobacter, Helicobacter

12
INTRACELULARES OBLIGADAS: Dependen de una célula huesped para su supervivencia y reproducción
G(-) ORDEN

El género Escherichia se caracteriza por tener:

● Bacilos gram (-), no esporulados, anaerobio
facultativo, fermentadores, móviles.
● Agente etiológico de septicemia, infecciones del
tracto urinario, meningitis neonatal y
gastroenteritis.
● Infecciones endógenas, por gastritis exógena.
● E. coli cuenta con 6 cepas de interés:
○ ECEI: Enteroinvasivo, contagia por
alimentos contaminados. La bacteria se
adhiere, invade y destruye las células
epiteliales. Causa diarreas con sangre y
acuosas. Enterotoxina codificada en un
plásmido.
○ ECEH: Enterohemorrágica, contagia por
alimentos contaminados, baja dosis
infectiva, causa leves diarreas hasta colitis hemorrágica. Toxinas VT1 y VT2 codificadas
en 2 pragos, parecidas a toxinas de Shigella. Puede producir SHU.
○ ECET: Enterotoxigénica. contagia por alimentos o aguas contaminadas. Causa diarrea de
viajero, fimbrias denominadas factores de colonización (CFA), se adhieren
específicamente al epitelio del intestino delgado. Toxinas STI y STII (termoestables), y
LTI y LTII (termolábiles).
○ ECEP: Enteropatogénica (más relevante), contagio por alimentos y aguas contaminadas.
Se adhiere al epitelio del intestino y destruye las microvellosidades. Los factores de
virulencia están codificados en una “isla de patogenicidad” y plásmido. La diarrea se
produce generalmente en niños pequeños.
 ○ ECDA: Enteroagregativa, formación de una biopelícula sobre las células epiteliales. Posee
varias enterotoxinas y citotoxinas. La diarrea se produce generalmente en niños, y es
persistente.
● Para diagnosticar E. coli se realiza por signos / síntomas clínicos, y se hace un aislamiento y
crecimiento del MO. para tratarlo se emplea antibiograma, y se debe mantener buenas condiciones
higiénicas junto con la ingesta de alimentos bien cocinados en períodos de riesgo.

El género Salmonella se caracteriza por:

● Bacilos gram (-), no esporulados, fermentadores, móviles,
anaerobio facultativo.
● Agente etiolítico de fiebre entérica (S. typhi), enteritis (S.
colerasuis, S. enteritidis) y bacteremias.
● En la actualidad se describieron +2000 serotipos O diferentes.
● Se diagnostica por reconocimientos de signos / síntomas
clínicos, y el aislamiento de las bacterias desde las heces. No se
recomienda tratar con antibióticos la enteritis para no liberar toxinas, se emplea ciprofloxacina,
cloranfenicol, trimetoprim para S. typhi y S. paratyphi. Hay que comer alimentos bien cocinados
en períodos de riesgo.

El género Shigella se caracteriza por:

● Bacilos gram (-), no esporulados, anaerobios facultativos, fermentadores, móviles.
● Agente etiológico de gastroenteritis (shigelosis), y disentería (S. dysenteriae).
● Se asocia a colitis hemorrágica (CH), síndrome urémico hemolítico (SHU).
● Invade y replica intracelularmente.
● Tiene toxina Shiga toxina (tipo A-B5) (S. dysenteriae).
● Se diagnostica por signos y síntomas clínicos, y aislamiento de las bacterias desde las heces. Se
trata con antibiograma, medidas de control para evitar diseminación, comer alimentos bien
cocinados en períodos de riesgo.

El género Yersinia se caracteriza por:

● Bacilos gram (-), no esporulados, anaerobio facultativos, fermentadores,
inmóviles.
● Y. pestis posee una cápsula proteica.
● Agente etiológico de peste bubónica (Y. pestis), diarreas acuosas agudas
(otras especies, Y. enterocolitica y Y. pseudotuberculosis).
● Se diagnostica por los signos y síntomas clínicos, y por aislamiento de bacteria desde las heces,
recomendable a 4°C. Se trata con estreptomicina para [Link], y las infecciones entéricas suelen
ser autolimitadas.

El género vibrio se caracteriza por:

● bacilos Gram (-), no esporulados,
anaerobios facultativos, fermentadores,
móviles.
● Agente etiológico de cólera (V.
cholerae), y diarreas acuosas explosivas.
● V. cholerae Se diagnostica por signos
y síntomas clínicos, y al cultivarse en etapas
tempranas de la enfermedad. Se trata con
reposición de líquidos y electrolitos,
Doxiciclina para adultos, trimetoprim
 /sulfametoxazol para niños y furazolidona en mujeres embarazadas.

El género campylobacter se caracteriza

por:
● Bacilos G(-) pequeños y
ondulados, no esporulados,
microaerófilos, fermentadores,
móviles con flagelo polar.
● Agente etiológico de
gastroenteritis, septicemias,
meningitis, aborto espontáneo,
proctitis.

El género Helicobacter se caracteriza por:

● Bacilos gram negativos pequeños con
forma de coma, no esporulados,
microaerofílicos, móviles.
● Producción elevada de ureasa (H.
pylori).

● Agente etiolítico de gastritis,

úlceras, y adenocarcinoma gástrico.
● Se diagnostica por signos y síntomas clínicos, y por
microscopía (examen histológico de las biopsias). Se trata con Claritromicina, Amoxicilina,
bismuto y omeprazol por 2 semanas. No hay tratamiento profiláctico ni vacunas.

El género pseudomonaceae se caracteriza por:

● Bacilos G(-) pequeños, cápsula mucoide de exopolisacáridos, aerobios estrictos, móviles, NO
FERMENTADORES.
● Agente etiológico de infecciones pulmonares, quemaduras, tracto urinario, oculares.
● Uno de los principales patógenos
de infecciones intrahospitalarias o
nosocomiales.
● Se diagnostica por signos y
síntomas clínicos, y P. aeruginosa
por sus colonias (hemolíticas
verdes y con olor a uva). Se trata
con Cefalosporinas de 3°
generación y fluoroquinolonas.
TAXONOMÍA GRAM POSITIVOS
Las gram positivas abarcan otro importante grupo bacteriano, con grupos importantes como los
Actinomicetos, los Bacillus anthracis (anthrax, bioterrorismo), Clostridium botulinum, causante de
botulismo, las especies Staphylococcus y Streptococcus, variadas y algunas cepas patógenas, y los
micoplasmas (Entre una inmensa variedad de bacterias).

G(+) FILOS

FILO CARACTERÍSTICAS HÁBITATS

ACTINOBACTERIAS Gram (+), formadores de esporas, aerobios Suelos, plantas en

o anaerobios, forman filamentos descomposición, raices de
ramificados, forman micelio, son plantas, estiércol, polvo o
quimioorganotróficos, diversos y actividad bucal.
procarióticos. Alto contenido G+C.

TENERICUTES No poseen pared celular. pleomórficas13 Parásitos intracelulares

FIRMICUTES Bajo contenido de G+C. Formas variadas, Ubicuas, presentes en el suelo,

13
PLEOMÓRFICAS: Sin forma definida.
 muchas productoras de ácido láctico. agua y algunos animales
Algunos patógenos, fermentadores y
amplios en la industria

FILO ACTINOBACTERIAS
Las actinobacterias se caracterizan por predominar de forma libre en suelos secos y cálidos, en
cantidades de millones por gramo de suelo. Causan un olor característico a mohoso o a tierra en campos
recién arados, y pueden degradar muchas sustancias complejas (importantísimas en la química del suelo).
Son notables por su capacidad de sintetizar y secretar antibióticos.
Dentro del filo actinobacteria se encuentran 3 grupos:

GRUPO CARACTERÍSTICAS

ACTINOMICETOS ● Sin resistencia al alcohol, aeróbicos facultativos, no forman micelio,

patógenos para humanos y animales.
● Las más comunes en el suelo y placa dental.
● Forman filamentos que se ramifican y forman esporas.
● Algunas producen antibióticos comúnmente usados como la estreptomicina

ACTINOMICETOS ● Procariotas G(+) con hifas y filamentos septados.

FIJADORES DE ● Fijan nitrógeno, forman simbiosis con plantas y producen micelios
NITRÓGENO verdaderos.
● Presente en las raíces de las plantas, donde fijan nitrógeno.
● Crecimiento lento, sus simbiosis proveen muchos nutrientes (sobre todo P).

ESTREPTOMICETOS ● Cadenas largas de esporas, micelios aéreos abundantes.

● Propiedad notable de producción de antibióticos.
● Principalmente organismos de suelo, de tierras alcalinas y neutras.
● Más de 500 especies

Los estreptomicetos forman micelio substrato y luego aéreo donde forman esporas por fisión de las puntas
de las hifas.
Son muy versátiles nutricionalmente, con gran importancia como agentes mineralizadores de materia
orgánica del suelo y como productores de metabolitos secundarios para la industria. Producen más del
60% de los antibióticos y otras sustancias de interés, y son productores de herbicidas.
Su metabolismo secundario14 da como producto la estreptomicina, que tiene acción letal sobre otros MO.
Ecológicamente los MO productores de estreptomicina la usan para tener ventaja a la hora de colonizar
ambientes, compitiendo con otras especies de MO. Esta acción se produce en bajas concentraciones.
La estreptomicina se produce en fases tardías del crecimiento, no son esenciales y son de estructura
química compleja. Se producen como familias de compuestos y son producidas por un rango limitado de
MO (hongos, bacillus, Streptomyces).
Siguiendo en el orden de las Actinomycetales, está la familia Nocardiaceae, y el género Nocardia,
identificables por sus características hidrofóbicas de su pared, debido a la presencia de compuestos
lipídicos (ácido-alcohol resistentes).
No se conocen mecanismos de transparencia horizontal de genes naturales, la transformación ha de
hacerse a través de protoplastos. Forman normalmente micelios substratos y aéreos solo en ciertas

14
METABOLISMO SECUNDARIO: Se produce una vez la célula tiene sus necesidades básicas cubiertas, en otras palabras
no es un producto indispensable para la célula
ocasiones. No esporulan, y son bacterias de suelo (Nocardia), parásitos de animales superiores
(Mycobacterium tuberculosis, M. leprae) o de plantas (Corynebacterium fascians).
Las corinebacterias son importantes en la producción de metabolitos secundarios, por su acción
desmineralizadora de algunos productos orgánicos y como productores de enfermedades. Han venido
utilizándose en la industria por ser el grupo más importante de productores de triptófano, lisina, ácido
aspártico y treonina.

Al microscopio se observa la presencia de niveles elevados de MO

filamentosos, suelen aparecer libres en el licor mezcla. Tienen
filamentos cortos miceliales como cadenas irregulares de células, o
filamentos largos enrollados.

FILO FIRMICUTES. BACILOS Y COCOS FORMADORES DE

ENDOSPORAS
● La mayoría móviles por flagelación lateral o perítrica.
● Aerobios, microaerófilos, anaerobios facultativos y estrictos.
● Algunos capsulados.
● Mesófilos, de 25 - 35°C. Se vieron especies psicrófilas y
termófilas.
● Se encontraron varios géneros formadores de endosporas.
● Se distinguen por su morfología, relación con el O2 y metabolismo energético.
● Habitan ampliamente en la naturaleza, algunas de origen marino. Se encuentran principalmente en
el suelo, donde les da ventaja ser esporulantes.
En el medio ambiente:
● Patógenas humanas y animales.
● Interés industrial por su capacidad de producir antibióticos, e importantes como plaguicidas
biológicos.
● Algunas alteran los alimentos.
El género sporosarcina abarca cocos ovalados y en forma de tétradas, o paquetes de 8 o
más células. Tienen endosporas centrales refringentes15.
▪ S. ureae: en suelos y en cantidades mayores en aquellos que reciben aportes de orina.
Descompone activamente la urea, formando CO2 y NH3. Son alcalófilas, con pH 10, 11;
debido a que degradar la urea aumenta el pH. Por su capacidad con la urea es uno de los
principales degradadores naturales.
▪ S. halophila: es de origen marino. Requiere iones sodio para crecer.

LOS DATOS DIFIEREN SEGÚN LA FUENTE. ASÍ INTERPRETE EN LAS DIAPOS Y LA CLASE

15
REFRINGENTE: Que refracta la luz, las esporas se ven brillantes al microscopio (ese efecto blanco)
FAMILIA BACILLACEAE (FILO FIRMICUTES):
● Bacilos Gram (+) endosporados.
● En el agua suelo e intestino animal.
● Resistente a condiciones ambientales.
● Aerobios estrictos y facultativos.
● Importantes en la producción de antibióticos

GÉNERO BACILLUS
El género Bacillus cuenta con bajo contenido de G+C (filo firmicutes).
● Bacilos rectos de extremos romos o casi cuadrados agrupados en cadenas largas o parejas desde
sus polos (también solos).
● Son aerobios y facultativos, con movilidad variable y esporulados refringentes.
● Resistentes al calor, hay de toda variedad física en presión, temperatura, concentración.
● La mayoría catalasa positiva.
● Algunos forman cápsulas.
● NUTRICIÓN: Usan medios sintéticos con azúcares,
ácidos orgánicos, alcoholes. Amoníaco como única
fuente de nitrógeno.
● HÁBITAT: El suelo, y también en aguas, sedimentos
marinos, alimentos y productos farmacéuticos.
● FUNCIONES: Producen antibióticos, elaboran enzimas
que descomponen polisacáridos, ADN y lípidos. Muchas
son patógenas.
FACTORES DE VIRULENCIA:
Codificados por plásmidos pOX 1 y pOX2, producen cápsulas, capas y
exotoxina.
Se cultivan en agar nutritivo, con colonias grisáceas y rugosas de bordes
irregulares.
Se aíslan en Agar sangre (prueba de hemólisis). B. anthracis es virulento y
forma colonias rugosas de gris claro (gamma hemolítica). Pero si hay
bicarbonato y se incuban en exceso de CO2 las colonias son lisas y mucoides.

¿Cómo identificamos B. anthracis?

● Por la morfología de sus colonias (recién mencionadas).
● Inmóvil, aerobio, encapsulado y patogénico en cobayos y
ratones.
● PCR para diagnóstico y determinar plásmidos de toxinas y
cápsulas.
● Se diferencia de S. cereus porque ésta segunda tiene
movilidad, efecto más rápido en el medio de cultivo, es
hemolítica, resistente a la penicilina (anthracis no) y no es
capsulada.

GÉNERO CLOSTRIDIUM
El género Clostridium (clase Clostridia según Brock) son bacilos grandes que:
● Producen esporas.
● Anaerobios, catalasa y oxidasa negativos.
● Móviles con flagelos perítricos, excepto por C. perfringens (éste es beta hemolítico).
● Presentes en el suelo, tracto alimentario y heces.
● Neurotóxicos, hisotóxicos y enterotoxemias.
● Esporas que penetran la piel por las heridas, alimentos, liberan exotoxinas.
● Agentes etiológicos de muchas enfermedades conocidas y peligrosas (enmarcadas en el cuadro).
Clostridium perfringens
● Uno de los patógenos con mayor distribución en el medio
ambiente, aislable de muestras de suelo y agua. Parte de la
microbiota intestinal animal y humana. Libera exoenzimas
específicas que atacan a las moléculas constituyentes de tejidos de
animales (fosfolipasas, hemolisinas, colágenasa, proteasas)
provocan putrefacción del tejido y producción de gas.
● Se trata con antitoxinas, antibióticos y profilaxis quirúrgica es muy
efectivo lo cual reduce los casos de amputación y muerte.

Clostridium botulinum
Genera botulismo, afección del hombre y animales por una
toxina de dicha bacteria, produce una parálisis flácida de la
musculatura estriada. Surge de la ingestión de la toxina o de
las esporas que germinan en el tubo digestivo, o a través de
una herida. Puede provenir de inhalación de esporas en
forma accidental o bioterrorismo.
 ● Posee amplia distribución en el suelo vegetativo, vegetales en descomposición, y ambientes
acuáticos de escaso caudal (aguas estancadas). Presente en el intestino del bovino.
● Esporas resistentes a los agentes ambientales.
● Las toxinas interfieren en la liberación de acetilcolina en las terminaciones nerviosas periféricas.
● Acción patógena en el sistema nervioso, con incubación de 18 - 36 hs. Afectan tanto los nervios
como el SNC (parálisis muscular) que puede llevar a la muerte.
Clostridium tetani
La enfermedad del tétanos, la infección comienza cuando las esporas
penetran el organismo en una lesión o herida. Tienen una incubación
de 1 a 2 semanas. Las bacterias liberan neurotoxinas tetanospasmina,
bloqueando las señales nerviosas de la médula a los músculos,
causando espasmos.
● Se produce por inoculación en la piel de las esporas del suelo
contaminado o tracto, o en herramientas contaminadas.
● No es infectiva via oral.
● Resistentes a muchos desinfectantes, sensibles al hipoclorito sódico (lejía) y a glutaraldehído en
alta concentración y con alto tiempo de contacto.
● Pueden vivir en el suelo durante mucho tiempo, siendo infecciosa por más de 40 años.
● Susceptible a la penicilina, clindamicina, eritromicina o metronidazol.

Clostridium difficile
Casual de diferentes patologías de carácter intestinal. Afectan al ser
humano, como Colitis. La exposición a antibióticos se asocia con el
sobre crecimiento y posterior enfermedad infección endógena.
● Resistente a la mayoría de antibióticos, más aún, es capaz de
crecer bajo dichas condiciones.
● Se transmite vía oral-fecal.
● Aislado de alimentos derivados de animales domésticos, indica
posibilidad de transmisión alimentaria.
● Está conformado principalmente por 5 especies: L.
monocytogenes L. ivanovii, L. innocua, L. welshimeri, L.
seeligeri. Las más significativas son L. monocytogenes y L.
ivanovii, que son patógenas.

GÉNERO LISTERIA
En el género listeria son bacilos cortos, regulares, no esporulados ni
ramificados, que suelen observarse en disposición individual o formando
cadenas cortas. Su mayor referente es la especie L. monocytogenes.
Listeria monocytogenes
Bacilos no esporógenos móviles. Parásitos facultativos del sistema reticuloendotelial, crecen en
condiciones aeróbicas.
● Infección vía ocular, entrando al nervio trigémino, produciendo meningoencefalitis.; vía visceral:
produciendo aborto. Deriva de los animales enfermos, se encuentra en heces, orinas, fetos
abortados, secreciones uterinas y leche.
● Patogenicidad debida a la capacidad de adherirse, invadir y multiplicarse dentro de una gran
variedad de células no fagocíticas.

FAMILIA MICROCOCCACEAE (FILO ACTINOBACTERIA)

Abarca géneros interesantes como:
● Staphylococcus (NOTA: en brock figuraba como género staphylococcaceae, en filo firmicutes)
● Micrococcus.
● Kocuria.
● Kytococcus.
● Alloiococcus

GÉNERO STAPHYLOCOCCUS
El género Staphylococcus abarca cocos gram positivos agrupados en racimos.
● Catalasa +.
● Inmóviles.
● No forman esporas.
● Anaerobios facultativos.
 ● FN piel y mucosas.
● Presenta cápsula de polisacáridos (limo).
● Se distinguen entre coagulasa positivos, como S. aureus, y coagulasa-negativos, como S.
epidermidis, S. saprophyticus, S. capitis, S. haemolyticus.
PATOGENIA:
● Cuenta con cápsula (antifagocítica), proteína A, ácidos teicoicos (adherencia), coagulasa
● Se identifica verificando:
○ Tinción gram.
○ Coagulasa.
○ Pruebas bioquímicas.
○ Epidemiología: antibiotipo, biotipia, fagotipia y técnicas moleculares.

TRANSMISIÓN:
• Portadores: 15-30% de adultos.
• Transmisión: autoinfección, persona-persona, aire, fomites.
• Las cepas resistentes a meticilina (SARM): brotes nosocomiales.
PREVENCIÓN:
1. Uso de desinfectantes y lavado de manos.
2. Lavado de ropas a altas temperaturas.
3. Descolonización de portadores.
4. Quimioprofilaxis en determinadas cirugías.

LACTOBACILLUS
 9. VIRUS, VIROIDES Y PRIONES

9.1. VIRUS
→ Los virus son agentes causantes de infecciones en vertebrados, invertebrados, plantas, hongos y
bacterias, por lo que tienen un gran espectro de hospedero (espectro de células huéspedes a las que
puede infectar)
→ Se distinguen por su tamaño especialmente pequeño (20-200 um) por lo que son filtrables y solo se
pueden ver por la microscopía electrónica.
→ Son parásitos intracelulares estrictos, por lo que tienen un requerimiento absoluto del hospedero
para su metabolismo y reproducción.
→ Las verdaderas características distintivas de los virus se relacionan con su organización estructural
simple y su mecanismo de replicación, es una partícula no celular compuesta de material genético y
proteínas que sólo puede multiplicarse dentro de células de otros organismos vivos
→ Se puede decir que UN VIRUS NO ES UN ORGANISMO VIVO, sino que toma prestada las
características funcionales de una célula.
→ Los virus que infectan a las bacterias se denominan bacteriófagos o fagos.
→ Los antibióticos no son efectivos contra ningún virus.

ver video: [Link]

Características Virus Otros microorganismos

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Ácido nucleico ADN o ARN ADN y ARN

Cubierta externa Simple y proteica Pared y membrana celular complejas

Reproducción Requiere hospedero Generalmente independiente

Metabolismo Utiliza maquinaria metabólica del hospedero Posee su propia maquinaria metabólica
 Cultivo No puede ser cultivado en medios libres de células Usualmente pueden ser cultivados en
medio sin células

9.2. ESTRUCTURA VIRAL

Un virión es una partícula viral infecciosa completa, totalmente desarrollada, compuesta por ácido
nucleico y rodeada de una cubierta proteica que la protege del medio y que es un vehículo de transmisión
de una célula huésped a otra. Los virus se clasifican según las diferencias de las estructuras de estas
cubiertas.

9.2.1. Acidos nucleicos

En contraste con las células procariontes y eucariontes, en las cuales el DNA siempre es el
material genético primario (y el RNA desempeña un papel auxiliar), un virus puede tener DNA o RNA,
pero nunca ambos.
→ Genomas víricos
- El ácido nucleico de un virus puede ser monocatenario o bicatenario. En consecuencia, hay 4
posibles tipos de ácidos nucleicos en virus: ADN monocatenario, ADN bicatenario, ARN
monocatenario y ARN bicatenario. También hay combinaciones de ARN-ADN, en la primera el
ARN es de simple cadena que con la enzima transcriptasa inversa sintetiza ADN para replicarse
(Retrovirus); y en la segunda el ARN viral se transcribe parcialmente en ADN de cadena simple
dentro del virión y una vez dentro del núcleo de la célula huésped, la transcripción inversa se
completa, generando una molécula de ADN de doble cadena (Hepadnavirus).
- Los cuatro tipos se encuentran en los virus de animales.
- Los virus de plantas suelen tener genomas de ARN monocatenario.
- Los virus bacterianos suelen contener ADN bicatenario, aunque también pueden tener ADN
monocatenario o ARN monocatenario.

→ El tamaño del material genético viral varía mucho

 - Según el virus, el ácido nucleico puede ser lineal o circular. En algunos virus (p. ej., el virus de la
gripe o virus influenza), el ácido nucleico aparece en varios segmentos separados.
- El porcentaje de ácido nucleico en relación con la proteína es de alrededor del 1% en el virus de la
gripe y de aproximadamente el 50% en ciertos bacteriófagos.

→ Los genomas víricos pequeños contienen, en general, pocos genes codificantes.

- Estos genes codifican proteínas estructurales de la envoltura viral y proteínas implicadas en la
replicación viral
- Pueden codificar proteínas que interfieren con la estructura y función de la célula hospedero
(enzimas líticas).
- Los virus pueden contener una mínima cantidad de enzimas específicas que participan en la
infección y replicación
- Los retrovirus cuentan con una enzima llamada Retrotranscriptasa o transcriptasa inversa
(VIH) que copia el ARN del genoma viral al ADN; que así puede insertarse en el genoma de la
célula huésped.

9.2.2. Cápside o cubierta proteica

El ácido nucleico de un virus está protegido por una cubierta proteica denominada cápside que
proporciona protección y rigidez. La estructura de la cápside está determinada en última instancia por el
ácido nucleico viral y representa la mayor parte de la masa de un virus, en especial los más pequeños.
Cada cápside está compuesta por subunidades proteicas denominadas capsómeros. En algunos virus las
proteínas que componen los capsómeros son de un único tipo; en otros virus pueden estar presentes
muchos tipos de proteínas. La disposición y simetría de los capsómeros es característica de un tipo de
virus particular y pueden ser icosaédrica, helicoidal o compleja.
Algunos virus animales son liberados de la célula huésped mediante un proceso de extrusión que recubre
el virus con una capa de la membrana plasmática de la célula huésped; esta capa se transforma en la
envoltura viral. Esta envoltura suele consistir en alguna combinación de lípidos, proteínas e hidratos de
carbono, y también glicoproteínas codificadas por el genoma viral.
 Según el virus, las envolturas pueden estar cubiertas o no por espículas, que son complejos de hidrato de
carbono-proteína que sobresalen de la superficie de la envoltura. Algunos virus se adosan a las células
huésped mediante espículas, por lo que cumplen una función de anclaje. Estas espículas son
características tan confiables de algunos virus que se pueden usar como medio de identificación.
Los virus cuyas cápsides no están cubiertas por una envoltura se denominan virus sin envoltura. La
cápside de un virus sin envoltura protege al ácido nucleico de las enzimas nucleasas presentes en los
líquidos biológicos y favorece la fijación de los virus a las células

[Link]. Clasificación según morfología general

Los virus se pueden clasificar en varios tipos morfológicos diferentes sobre la base de la
arquitectura de su cápside. La estructura de estas cápsides se ha determinado por microscopía electrónica.

Tipo Aspecto Ejemplos

Icosaedricos - aspecto esféricos, cuya cáspide adopta la estructura de un - poliovirus

icosaedro - adenovirus
- 20 caras, 30 bordes y 12 vértices. - herpesvirus
- Cada cara es un triángulo equilátero, resultando una
estructura simétrica

Helicoidal - Aspecto alargado que corresponde a un cilindro hueco - virus que causan la rabia
donde los capsómeros se ensamblan siguiendo un - virus del Ébola
ordenamiento helicoidal similar a los escalones de una - virus del mosaico del tabaco
escalera caracol

Complejo - La cápside (cabeza) es icosaédrica y que la vaina de la - poxvirus ([Link]. viruela)

cola es helicoidal. La cabeza contiene el ácido nucleico. - bacteriofagos (T2, T4 y T6)

Con envoltura - Los virus con envoltura son casi esféricos. Cuando los - virus helicoidal con
virus helicoidales o icosaédricos están rodeados por una envoltura es el virus de la
envoltura se denominan virus helicoidales con envoltura o gripe
virus icosaédricos con envoltura. - virus icosaédrico con
envoltura es el virus herpes
simple
9.3. VIRUS CONOCIDOS

Virus del - Estructura helicoidal.

mosaico del
tabaco
 Influenza A - Estructura con envoltura.
- Hay cuatro tipos de virus de la influenza: A, B,
C y D.
- Los virus A y B de la influenza humana causan
una epidemia estacional de la enfermedad
(conocida como temporada de influenza) casi
todos los inviernos.
- Los virus de influenza A son los únicos virus
conocidos por causar pandemias.
- Las infecciones por el virus de influenza tipo C
por lo general causan una enfermedad leve y se
cree que no causan epidemias de influenza
humana.
- Los virus de influenza D afectan principalmente
al ganado y no se cree que puedan causar
infecciones o enfermedades en los seres
humanos.

Papillomavirus - Estructura con envoltura.

humanos - Hay más de 100 tipos de PVH, de los que al
(PVH) menos 14 son oncógenos (también conocidos
como de alto riesgo).
- Los PVH se transmiten principalmente por
contacto sexual y la mayoría de las personas se
infectan poco después de iniciar su vida sexual,
generando verrugas en el cuerpo.
- El cáncer cervicouterino (CCU) en mujeres es
causado por la infección por determinados tipos
de PVH transmitidos por vía sexual. Además,
hay datos que relacionan los PVH con cánceres
de ano, vulva, vagina y pene. El CCU es curable
si se diagnostica en estadios tempranos.

Herpes simple - Estructura icosaédrica con envoltura

- Hay dos tipos de virus del herpes simple: virus
del herpes simple de tipo 1 (VHS-1) y virus del
herpes simple de tipo 2 (VHS-2).
- El VHS-1 se transmite principalmente por
contacto de boca a boca y causa herpes labial
(llagas), aunque también puede causar herpes
genital.
- El VHS-2 se transmite por vía sexual y causa
herpes genital.
- Las infecciones que provocan los dos tipos de
virus duran toda la vida.
- La mayoría de las infecciones herpéticas orales
y genitales son asintomáticas, y si hay síntomas
estos incluyen vesículas o úlceras dolorosas en el
lugar infectado.
- Las infecciones por herpes son especialmente
contagiosas cuando son sintomáticas, pero
también pueden transmitirse en ausencia de
síntomas.
 - La infección por VHS-2 aumenta el riesgo de
adquirir y transmitir infecciones por VIH.

Ébola - Estructura helicoidal.

La enfermedad por el virus del Ébola (EVE) es
una enfermedad grave, a menudo mortal en el ser
humano.
- Tasa de letalidad de aproximadamente el 50%.
- El virus es transmitido al ser humano por
animales salvajes y se propaga en las poblaciones
humanas por transmisión de persona a persona.
- Todavía no hay ningún tratamiento aprobado,
pero ayuda a la supervivencia una detección
precoz.

Retrovirus: - Estructura icosaédrica con envoltura

VIH (Virus de - La enzima transcriptasa inversa (o RTasa), lo
Inmunodeficien que provoca la síntesis de una molécula de ADN
cia Humana) complementario (ADNc) utilizando ARN de
virus como molde.
- Se han descubierto al menos dos tipos: HIV-1 y
HIV-2. HIV-1 posee 2 copias de ARN de una
sola hebra, 72 espículas con glicoproteínas.
- Se ha cobrado ya más de 32 millones de vidas.
- El diagnóstico, el tratamiento y la atención
eficaces del VIH, la infección por el VIH se ha
convertido en un problema de salud crónico
llevadero que permite a las personas que viven
con el virus llevar una vida larga y saludable.
- Aunque no existe cura para la infección por el
VIH, el tratamiento con antirretrovíricos eficaces
permite mantener controlado el virus y prevenir
la transmisión a otras personas.

SARS-CoV-2: - Estructura con envoltura.

Coronavirus - Su genoma consiste en una única molécula de
ARN simple cadena.
- Pertenece a una gran familia de virus
(Coronaviridae)
- En la envoltura se insertan las proteínas virales
S, E y M.

9.4. TAXONOMÍA
Se requiere la taxonomía viral para ayudar a organizar y conocer organismos recién descubiertos.
Esta clasificación se basa en los grupos de virus que comparten la misma información genética y el nicho
ecológico (rango de huéspedes), la estrategia de replicación y otros aspectos biológicos y moleculares.
- Familia: sufijo –viridae → Herpesviridae
- Género: sufijo -virus → Herpes Virus
- Especie: nombres descriptivos comunes → Retroviridae, Lentivirus, virus de la
inmunodeficiencia humana (HIV)
 - Subspecies: se designan por un número → Virus Herpes humano 1, HHV 2, HHV 3, virus de la
inmunodeficiencia humana (HIV)

9.5. TIPOS DE VIRUS

Según el espectro del hospedero:
- Virus animales.
- Virus vegetales.
- Bacteriófagos.
Los virus son muy específicos sobre el tipo de célula que infectan. Por ejemplo, los virus de plantas no
están equipados para infectar las células de los animales, aunque un cierto tipo de virus de plantas puede
infectar plantas de la misma familia.
Algunas veces, el virus puede infectar una especie y no ocasionarle daño, pero puede destruir cuando
infecta a otra diferente. Por ejemplo, el virus Hanta es portado por un ratón, sin efecto aparente en el
roedor, pero si infecta a una persona causa una enfermedad dramática, que frecuentemente es mortal,
caracterizada por un sangrado excesivo.

9.6. CLASIFICACIÓN DE LOS VIRUS

Se ha agrupado a los virus en familias sobre la base de
1) el tipo de ácido nucleico: ADNmc, ADNbc, ARNmc, ARNbc, RTasa
2) la morfología: icosaédricos, helicoidales o complejos.
3) la estrategia de replicación

9.6.1. Replicación viral

[Link]. Bacteriofagos
Mirar video para mayor entendimiento: [Link]
- Los virus que atacan a las bacterias se llaman bacteriófagos o simplemente fagos
- Fagos T son un tipo específico de bacteriófagos con la cabeza icosaédrica, ADN de doble cadena,
y las colas de proteínas
- Seis pequeños picos en la base de la cola contráctil se utilizan para unir a la célula hospedero e
inyectar ADN viral en células
- Los fagos T más estudiados son T4 y T7 que infectan E. coli

En todos los casos de infección el proceso empieza de esta forma:

a)Fase de fijación: Los virus se unen por la placa basal a la cubierta de la pared bacteriana.
b)Fase de contracción: La cola se contrae y el ácido nucleico del virus se empieza a inyectar.
c)Fase de penetración: El ácido nucleico del virus penetra en el citoplasma de la bacteria, y a partir de
este momento puede seguir dos ciclos diferentes.

[Link].1. Ciclo lítico

En el ciclo lítico el ADN bacteriano fabrica las proteínas
víricas y copias de ácidos nucleicos víricos. Cuando hay
suficiente cantidad de estas moléculas, se produce el
ensamblaje de la proteína y el ácido nucleico vírico y se
liberan al medio, produciendo la muerte de la célula por lisis.
Los 5 pasos del ciclo lítico son:
1. Fijación del virus a la célula huésped
2. Penetración del material genético viral en la célula
3. Biosíntesis donde el ADN del fago dirige la síntesis de
los componentes del virus por la célula huésped
4. Maduración donde se ensamblan los virus
5. Liberación de los nuevos virus fuera de la célula
 Curva de crecimiento viral

[Link].2. Ciclo lisogénico

En el ciclo lisogénico se produce cuando el genoma del virus queda integrado en el genoma de la
bacteria en estado latente (inactivo) durante largos periodos de tiempo (pueden ser años), no expresa sus
genes y se replica junto al de la bacteria. El virus queda en forma de profago.
Por distintos factores (señal externa - UV) el provirus puede comenzar un ciclo normal o lítico.
Ejemplos: HIV y el virus del herpes.

En el ciclo lisogénico el genoma

viral se integra con el del
hospedero, mientras que en el ciclo
lítico el genoma viral se expresa y
muere la célula hospedero.

9.7. ONCOVIRUS Y LA TEORÍA DE ONCOGENES

En la actualidad se sabe que alrededor del 10% de los cánceres son inducidos por virus, y los
oncovirus son un grupo especial de virus que cuando infectan células tienen la capacidad de alterar el
ciclo celular induciendo el desarrollo de tumores.
Una característica destacable de todos los virus oncogénicos es que su material genético se integra al
DNA de la célula huésped y se replica junto con el cromosoma de la célula huésped. Entonces:
- Algunos tienen copias de oncogenes en el genoma viral
- Algunos estimulan al genoma del hospedero cuando se inserta en el gen represor inactivandolo, y
las células pueden perder el control del crecimiento y la división celular.

Casi todo lo que puede alterar el material genético de una célula eucarionte implica la posibilidad de una
célula normal se transforme en cancerosa. Estas alteraciones del DNA celular que causan cáncer afectan
partes del genoma que se denominan oncogenes. Los oncogenes fueron detectados por primera vez en
virus causantes de cáncer y se creyó que eran parte del genoma viral normal. Sin embargo, los
microbiólogos estadounidenses J. Michael Bishop y Harold E. Varmus recibieron el Premio Nobel de
Medicina en 1989 por demostrar que los genes inductores de cáncer transportados por virus en realidad
derivan de células animales. Los oncogenes pueden ser activados con funcionamiento anormal por
diversos agentes, como por ejemplo compuestos químicos mutagénicos, radiación de alta energía y virus.

Los mejor caracterizados son los retrovirus, los cuales durante la infección, integran su ADN al genoma
de la célula hospedero y por evento raro de recombinación son escindidos nuevamente del genoma
portando consigo un segmento del ADN de la célula hospedero. Si este segmento contiene secuencias
reguladoras de un paso crítico de la división celular, el virus al infectar otras células afectará este proceso
haciendo que ellas se dividan sin control y se generen tumores. Otros ejemplos de virus que pueden
producir cáncer son el virus del Papiloma humano, el de la Hepatitis B y C, Virus de la inmunodeficiencia
humana, etc.

9.8. VIROIDES
Los viroides son agentes infecciosos más pequeños que los virus, se los llama con el sufijo “Vd”
y son una etapa primitiva de los virus.
- Constan de una cadena circular simple y corta de ARN, circular o con forma de varilla, que no
codifica proteínas
- Son fragmentos infectantes de RNA con 250-370 nucleótidos, que se suelen localizar en el
nucleolo de la célula infectada, en número entre 200 y 10.000 copias
- Está plegado fuertemente con lo que se protege de las nucleasas externas
- Sin cápside
- Son patógenos en plantas (viroide del tubérculo fusiforme de la patata, el pepino, el tomate o el
crisantemo)
- Los virus vegetales deben entrar en huéspedes vegetales a través de heridas o con parásitos
invasores, por ejemplo insectos, nematodos, hongos.

9.9. PRIONES
Los priones son los agentes infecciosos mas pequeños que existem (33-35 kDa) compuestos
únicamente de proteínas sin que se haya detectado la presencia de ácido nucleico.
Al parecer actúa produciendo un cambio conformacional de una proteína precursora celular PrP (se
propagan mediante la transmisión de proteínas anómalas con mal plegamiento). Cuando un prion entra en
un organismo sano, actúa sobre la forma normal del mismo tipo de proteína existente en el organismo,
modificándola y convirtiéndola en prion. Estos priones recién formados pueden pasar a convertir más
proteínas, provocando una reacción en cadena que produce grandes cantidades de la proteína prion.
- Todos los priones conocidos inducen la formación de amiloides plegado, en los que actúan
polimerasas formando un agregado que consiste en apretadas hojas ß.
- Los organismos que no expresan la forma normal de la proteína priónica no pueden desarrollar o
transmitir la enfermedad
- Estas enfermedades son causadas por la conversión de una glucoproteína normal del huésped,
denominada PrP Pc(por proteína celular de prión), en una forma infecciosa denominada PrPSc (por
proteína de scrapie)
- En el cerebro se acumulan fragmentos de las moléculas de PrpSc que producen degeneración de las
neuronas y luego la muerte de la persona
- Evidencia científica señala que se contrae por consumo de carne contaminada.
- Son resistentes al calor y radiación ultravioleta, no se elimina por esterilización, solo se eliminan
por incineración.
- Encefalopatía bovina espongiforme (BSE) o “enfermedad de las vacas locas”
- Además, se encuentra el SCRAPIE en ovejas o el Kuru o enfermedad de Creutzfeldt-Jakob en
humanos de edad avanzada, causa depósitos insolubles en el cerebro lo que conduce a un rápida
degeneración neuronal.
 9.10. PATOGÉNESIS DE LAS INFECCIONES VIRALES
La patogénesis es el conjunto de mecanismos por medio de los cuales los virus producen
infección/enfermedad en el huésped, y estos mecanismos se resumen en una infección inicial del
hospedero, luego una diseminación de la infección, y termina con el egreso del virus al exterior
La virulencia indica la gravedad de la enfermedad.

9.10.1. Vías de transmisión de las infecciones virales

● Transmisión horizontal: aerosoles contaminados, alimentos o agua contaminada, fluidos o
tejidos corporales contaminados. Inoculación directa por insecto vector, mordedura de animal
enfermo, material punzante infectado.
● Transmisión vertical: de madre infectada a hijo, a través de la placenta (Rubeola), canal de parto
(Herpes), lactancia (Retrovirus).

9.10.2. Estado de la patologia

● Remisión: la patología ha finalizado y la persona se cura. Ej: influenza, rotavirus, rubeola.
● Persistencia: el virus persiste en las células y se expresa una y otra vez en el cuerpo debido a
factores externos. Ej: Herpes virus, HPV.
● Progresión: en patologías crónicas, se estudia la progresión de la enfermedad como los daños en
el organismo, como es su recuperación, si el virus está en estado de latencia o de replicación, etc.
Ej: Hepatitis , HIV.

9.10.3. Ciclo infectivo de un virus

Si imaginamos ser un virus que depende de una célula para sobrevivir, tendríamos diferentes estrategias
de infección a considerar:
● Lisis: Algunos virus optarían por destruir la célula hospedadora para liberar nuevas partículas
virales. Sin embargo, este proceso puede depender de factores específicos del huésped, como
hormonas o anticuerpos.
● Persistencia: Otra estrategia podría ser que todas las células infectadas produzcan virus de manera
continua, ya sea en cantidades pequeñas o con unas pocas células que mueran debido a la
infección.
● Latencia: En este caso, el virus podría desaparecer casi por completo y subsistir en forma de
episoma. Factores externos podrían reactivar el virus, reiniciando el proceso de infección.
 ● Al considerar las infecciones en animales, es crucial distinguir entre infecciones agudas, crónicas
y recurrentes.
● Además, un concepto cada vez más relevante es la apoptosis, que es la muerte celular programada,
que puede ser inducida o inhibida por el virus.

9.10.4. Evolución de las infecciones virales

Las infecciones virales pueden clasificarse en subclínicas y clínicas según la manifestación de
los síntomas y la gravedad de la enfermedad.

● Infecciones Subclínicas: Son infecciones virales en las que el individuo infectado puede no
experimentar síntomas notables o son muy leves y es posible que no sea consciente de la presencia
del virus en su organismo. Estas infecciones pueden persistir durante un tiempo prolongado sin
causar malestar significativo. Ej: Poliomielitis, Hepatitis A.
● Infecciones Clínicas: Son infecciones virales en las que el individuo muestra síntomas que
pueden variar desde moderados hasta graves. La duración de las infecciones clínicas puede variar,
y en algunos casos, la enfermedad puede resolverse por sí sola o requerir tratamiento médico. Ej:
Sarampión, Rabia.

9.10.5. Triada epidemiologica

La triada epidemiológica describe tres componentes interrelacionados que contribuyen a la ocurrencia de
una enfermedad específica . Estos componentes son:
● Agente Causal: cual es su virulencia, que tan contagioso es, que tipo de infectividad tiene (ciclo
lítico o lisogénico) y en que cantidad tengo este virus.
● Huésped: Es el organismo (humano u otro) que puede ser afectado por la enfermedad. La
susceptibilidad del huésped puede estar influenciada, como si ha tenido una exposición previa, si
está vacunado, y también influyen sus costumbres/estilo de vida.
● Medio Ambiente: Se refiere a las condiciones externas que permiten la replicación, división
celular, y en consecuencia, que la transmisión del agente al huésped ocurra.
La interacción entre estos tres componentes crea un ambiente en el que la enfermedad puede ocurrir. La
comprensión de la triada epidemiológica es crucial para el diseño de estrategias de prevención y control
de enfermedades, ya que permite identificar puntos de intervención para reducir la incidencia de
enfermedades en una población determinada.

[Link]. Preparación de stocks y titulación de bacteriófagos

FUNDAMENTO:
- Un bacteriofago en una placa se produce cuando una
partícula vírica infecta una célula, se replica y
posteriormente provoca la muerte de dicha célula.
- Las células adyacentes son infectadas por los virus
recién producidos y también mueren. Este proceso
puede repetirse múltiples veces.
- Posteriormente las células son teñidas con una tinción
que solo marca células vivas.
- Las células muertas en la placa no se tiñen y aparecen
áreas sin tinción en un fondo coloreado.
- Cada placa es resultado de la infección de una célula por un virus seguido por la replicación y
propagación de dicho virus.
Cada Placa de lisis corresponde a un único virus de la suspensión inicial que afecta a una célula:
Unidades formadoras de placas – UFP 9
10. MICROORGANISMOS EN LA BIOSFERA
10.1. INTRODUCCIÓN
¿Qué controla la diversidad microbiana en un ambiente dado? ¿Qué
microorganismos crecen y dónde?
→ Disponibilidad y concentración de nutrientes
● Tipos de nutrientes
● Cantidades disponibles
● Constancia o exceso/escasez
→ Complejidad del ambiente
● Gradientes de parámetros importantes: temperatura, pH,
disponibilidad de agua, luz, oxígeno, presión, etc
● Variaciones en el tiempo
● Suelo y ambiente muy complejo
Por las complejidades mencionadas arriba es que se instala la teoría
de nicho, definido por todos los factores enumerados. Es en estos nichos
primarios donde los microorganismos se sienten más cómodos. Esto no
implica que no puedan sobrevivir en otros nichos, aunque con éxito
ecológico menor.
Debido al tamaño de los microorganismos, sus hábitats son pequeños (para una bacteria 3mm de
suelo es equivalente a 2 km para los humanos) por ello en estos casos hablamos de microambientes, y
que existen incontables cantidades de ellos. También grandes cantidades de microambientes generan
grandes biodiversidades metabólicas, fisiológicas y genéticas de los microorganismos. Por otro lado,
varios nichos cambian con el tiempo, de manera que diferentes organismos pueden dominar en el mismo
sitio en tiempos diferentes.
Por último, podemos esquematizar la importancia que tienen los microorganismos en la biosfera:
- Los procariotas son tan importantes que si desaparecieran, la vida en la tierra desaparecería
también.
- Tienen un rol importante en el reciclaje de elementos químicos entre los componentes vivos y no
vivos de los ecosistemas.
- Algunos actúan como descomponedores, degradando organismos muertos y productos de
desechos.
- Pueden, aumentar la disponibilidad de nitrógeno, fósforo y potasio para el crecimiento de las
plantas
- Tienen una gran capacidad adaptativa y colonizan todos los medios.
- Por su diversidad metabólica intervienen en los ciclos de la materia.
- Presentan pequeño tamaño y esto resulta una ventaja fisiológica.
- Los microorganismos autótrofos fabrican materia orgánica.
- Muchos realizan el papel de descomponedores y cierran las cadenas alimenticias.
- Presentan diferentes tipos de respiración y nutrición.
Beneficios:
- Colaboran en la degradación de celulosa en el estómago de animales que se alimentan de madera
y fibra.
- Imprescindible en los ciclos de la materia.
- Bacterias, y hongos proporcionan alimento, antibióticos, enzimas, etc
- Importantes en ingeniería genética
“La comprensión de las interacciones complejas entre los microorganismos y los ciclos
biogeoquímicos es de vital importancia para entender la estabilidad del ecosistema y su aplicación a la
biorremediación, la agricultura sostenible”

10.2. CICLOS
10.2.1. Ciclo del Nitrógeno
→ Se encuentra en la Naturaleza como nitrógeno molecular (N2 ) gaseoso
→ El 79 % de la atmósfera está constituida por este gas.
→ Es clave en los organismos vivos, pero sus compuestos
no abundan en la corteza terrestre.
→Las plantas y los animales pueden usar nitrógeno si es
convertido a una forma química disponible:
- amonio (NH4+)
- nitrato (NO3 - )
- nitrógeno orgánico (urea -(NH3 )2CO).
- Nota: importante saber cuáles microorganismos
→ Después del agua, es el compuesto que más limita la
productividad de los cultivos.

El nitrógeno puede llegar al suelo a través del amoniaco (NH3) procedente de la materia orgánica
de los seres vivos (excrementos, detritus vegetales, cadáveres de animales, etc). También puede existir
nitrógeno en el suelo cuando existan bacterias capaces de fijar el nitrógeno atmosférico (N2),
transformándolo en amonio (NH4+). Existen varias especies de bacterias capaces de fijar nitrógeno,
algunas de ellas asociadas a las raíces de las plantas leguminosas (guisantes, etc) donde viven en
simbiosis con plantas haciendo tumores donde se fijan y forman biofilms. Algunos ejemplos de estas
bacterias son los Rhizobium spp., otras que se encuentran libres como ocurre con Azotobacter spp.,
Beijernickia spp. Clostridium spp., Cyanobacteria spp., etc El proceso por el cual las bacterias fijadoras
de nitrógeno atmosférico incorporan el nitrógeno al suelo en forma de amoniaco se denomina
Amonificación. Una de las bacterias más importantes en este proceso es Azotobacter spp.
El amoniaco que se encuentra en el suelo puede oxidarse y convertirse en nitritos y éstos a su vez,
posteriormente, convertirse en nitratos. Este proceso se denomina nitrificación. La nitrificación es un
proceso que se realiza en dos etapas: en la primera el amonio (NH4+) se oxida a nitritos por parte de las
bacterias oxidantes de amonio (AOB: Ammonium oxidazing bacteria); y en la segunda, los nitritos son
oxidados a nitratos por las bacterias oxidantes de nitritos (NOB Nitrite oxidazing bacteria).
Posteriormente, los nitratos pueden convertirse de nuevo en nitrógeno libre por parte de las bacterias
desnitrificantes, proceso denominado desnitrificación. Entre las bacterias desnitrificantes se encuentran
 muchas bacterias gramnegativas anaerobias facultativas: Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp., Bacillus
licheniformis, Paracoccus spp., e incluso una de las bacterias nitrificantes, Nitrosococcus spp. ya que esta
bacteria participa tanto en la nitrificación como en la desnitrificación. Esta etapa se emplea como índice
de contaminación fecal a las enterobacteriaceae, ya que si encontramos coliformes fecales significa que se
ha estado en contacto con el tracto digestivo de mamíferos. De esta forma el nitrógeno vuelve a la
atmósfera completando el ciclo.

Las bacterias nitrificantes se incluyen inicialmente en la familia Nitrobacteraceae. Cuando se

secuenció su ácido ribonucleico ribosómico (16S rRNA), la familia se subdividió ya que se encontró que
incluía bacterias genéticamente muy diversas. Actualmente las bacterias nitrificantes se han clasificado en
los siguientes géneros:
→ Formación de nitritos a partir de amonio (nitrificación -primera etapa) realizada por bacterias
oxidantes del amonio, que poseen amonio-mono-oxigenasa (AMO) e hidroxilamina-oxido-reductasa
(HAO: hidroxilamine oxidoreductase):
● Nitrosomonas spp. (Clase 𝛽proteobacterias)
● Nitrosospira spp. (Clase 𝛽proteobacterias)
● Nitrosococcus spp. (Clase gammaproteobacterias)
→ Transformación de nitritos en nitratos (nitrificación - segunda etapa), rea;ozada por bacterias oxidantes
de nitritos, que poseen nitrito-oxido-reductasa (NXR):
● Nitrobacter spp. (Clase alfaproteobacterias)
● Nitrospira spp. (Clase deltaproteobacterias)
● Nitrococcus spp. (Clase gammaproteobacterias)

[Link]. Aplicaciones de las bacterias fijadoras de Nitrógeno

Las bacterias fijadoras de Nitrógeno son de especial importancia debido a su capacidad de fijar
Nitrógeno en el suelo. Este elemento tiene la gran cualidad de aumentar los rendimientos de los cultivos y
de enriquecimiento de suelos desertificados; por ello consideraremos que las bacterias son
biofertilizantes: Rhizobium es una de las más utilizada como biofertilizante por su capacidad de facilitar
la asimilación de nitrógeno en los cultivos. También podemos hablar en este caso de biorremediadores.
Además estos microorganismos pueden ser empleados para el control biológico de plagas, por lo
que los emplean en biocontrol de fitopatógenos. Esto ofrece una ventaja competitiva contra métodos
tradicionales debido a que tiene un menor impacto en contaminación.
 Microorganismos
Tipo de metabolismo fijador
Familia Nombres de Nitrógeno Importancia Económica
Bacilus polymyxa
Beneficios marginales en
Bacilaceas Clostridium Aeróbico, heterófico agricultura
Azotobacter
Azomonas insignis
Azotococcus agilis
Beijerinckia derxii
Derxia gummonsa
Beneficios a cosechas no
Azotobacterias Xhantobacter flavus Aeróbico, heterófico confirmadas
Klebsiella pneumoniae
Enterobacter aerogenes
Erwinia herbicola
Citrobacter freundii
Importantes en la fijación
Enterobacterias Azospirillum brasilense Aeróbico, heterófico asociativas
Rhizobium
Muy importantes en el
Rizobiaceas Bradyrhizobium Microaerófilo, heterotrófico cultivo de leguminosas
Streptomicetaceas Frankia Microaerófilo, heterotrófico Uso potencial en bsoques
Methylocystis Microaerófilo,
Obtención de proteína
Metanomonadaceas Methylococcus autotrófico unicelular
Tiobacteriaceas* Thiobacillus ferrooxidans Microaerófilo Minería microbiana
Anabea
Nostoc
Gloeothece
Spirulina
Anaeróbico o microaerófilo, Cultivo de arroz, producción de
Cianoficeas Synechococcus fotolitotrófico proteina unicelular
Cromatiaceas Chromatium vinosum Anaeróbico fotolitotrófico
Clorobiaceas Chlorobium limicola Anaeróbico fotolitotrófico
Rhodospirillum rubrum
Rhodopseudomonas palustris
Depuración de aguas
Rhodobacter capsulatus
Anaeróbico, residuales, abono y pienso para
Rodospirilaceas Rhodomicrobium vannielli fotoorganotrófico piscifactorías

10.2.2. Ciclo del Azufre

1. Oxidación del H2S (de la materia orgánica en descomposición) a Azufre
→ Thiobacteruim
2. Oxidan el Azufre a SUlfatos (que pueden ser usados por organismos fotosintéticos)
→ Thiobacillus, Beggiatoa
3. Reducen los sulfatos a H2S
→ Desulfovibrio
4. Debido a su actividad producen H2S que se acumula en la atmósfera
 5.. Sulfatos son asimilados por
plantas y bacterias (aa/proteínas)
6. Desasiminación
(descomposición de proteínas)
libera H2S

10.2.3. Ciclo del Carbono

El carbono en la Tierra se encuentra en rocas carbonatadas,
combustibles fósiles y la atmósfera
1. La fijación del CO2 en el medio acuático la realizan por la
fotosíntesis las cianobacterias y algas que forman el
fitoplancton.
2. El zooplancton se alimentan del fitoplancton. Al mismo tiempo
los microorganismos en la respiración devuelven el carbono. Es
decir, bacterias y hongos descomponedores devuelven CO2 al
medio mediante fermentación o respiración anaerobia
3. Los microorganismos descomponen la materia orgánica mediante la fermentación(azúcares) y
putrefacción (proteínas) y liberan CO2.
4. Las bacterias transforman en condiciones anaerobias los restos vegetales en combustible fósiles

Participan principalmente
Arqueobacterias metanogénicas
(utilizan CO2 para producir CH4) y
metanótrofas (Utilizan CH4 para
producir CO2).
Ciclo importante para la producción
de biodiesel

10.2.4. Ciclo del Fósforo

Los microorganismos en el Ciclo del Fósforo Producen fosfatos (a partir de orina, heces, tejidos animales
y plantas) que son utilizados por plantas → animales (para construir ATP o ácidos nucleicos).
10.3. MICROBIOLOGÍA DEL SUELO
El suelo es la capa externa, blanda, de la superficie terrestre y está totalmente diferenciada del
lecho rocoso:
- Soporta el crecimiento de los vegetales.
- Contiene multitud de sustancias orgánicas.
- Contiene multitud de microorganismos que interaccionan de forma muy dinámica.
Sus componentes principales son materia mineral, agua, aire, materia orgánica y organismos.
La microbiota del suelo tiene una gran variedad de microorganismos, formada por una mezcla
microscópica de miles y millones de bacterias por gramo de suelo (106 - 109 bacterias por gramo de
suelo), que cumplen un rol esencial en los procesos biogeoquímicos de una materia. Constituye su parte
viva y son responsables de la dinámica de transformación y desarrollo. La gran mayoría de estos son
heterótrofos, descomponedores de carbohidratos.
● Suministro directo de nutrientes (Fijación de nitrógeno)
● Transformación de compuestos orgánicas que la planta no puede tomar a formas inorgánicas que
sí pueden ser asimiladas (mineralización)
● Aumento del desarrollo radícula en la planta que mejora la asimilación de nutrientes, la capacidad
de campo y el desarrollo
● Reacciones antagónicas, parasitismo y control de fitopatógenos (competencia entre
microorganismos)
● El mejoramiento de las propiedades físicas del suelo
También podemos distinguir entre microorganismos autóctonos y zimógenos u oportunistas:
● Organismos autóctonos: microorganismos capaces de utilizar compuestos húmicos (orgánicos)
recalcitrantes, son los empleados para la biorremediación
● Organismos zimógenos u oportunistas: también son del suelo pero no utilizan compuestos
húmicos (no descomponen) si no sustratos fácilmente utilizables (utilizan compuestos degradados
por otros microorganismos)
○ Pseudomonas, Bacillus, Penicillium, Aspergillus, Mucor

10.3.1. Formación de suelos minerales

Uno de los principales y más importantes responsables de la formación de suelos son los líquenes16:
16
Un líquen es una simbiosis mutualista entre un hongo y una alga o una cianobacteria. Esta asociación
simbiótica es tan estrecha que se considera una entidad única. Los líquenes son organismos complejos formados
por hifas fúngicas entrelazadas que rodean y albergan células de algas o cianobacterias.
En esta relación simbiótica, el hongo proporciona protección y un ambiente adecuado para el crecimiento
de las células fotosintéticas (algas o cianobacterias), mientras que estas últimas contribuyen con la capacidad de
realizar la fotosíntesis y producir nutrientes que benefician tanto al hongo como a ellas mismas. Su presencia puede
 ● Fijación de N2 (ficobionte17)
● Ac. liquénicos: solubilización de nutrientes (P, Fe..)
● Producción de microorganismos
● Retención de humedad, protección de radiación
● CO2 respiración: disolución CO3
● Grietas y fisuras
Además está la acción de bacterias que amplían el efecto, por ejemplo:
● Bacterias heterótrofas: Estas son bacterias que obtienen su energía de compuestos orgánicos ya
formados. En el contexto de los líquenes, estas bacterias podrían participar en la descomposición
de materia orgánica circundante, contribuyendo a la liberación de nutrientes que pueden ser
utilizados por los líquenes.
● Bacterias quimiolitotrofas (ácidos inorgánicos): Las bacterias quimiolitotrofas obtienen su energía
a través de la oxidación de sustancias químicas inorgánicas. En algunos líquenes, especialmente
aquellos que tienen asociación con cianobacterias, estas bacterias pueden contribuir al ciclo de
nutrientes al descomponer compuestos inorgánicos y liberar nutrientes esenciales, como
nitrógeno.
● Hongos (ácidos orgánicos): La presencia de hongos en los líquenes es fundamental, ya que los
líquenes son una simbiosis mutualista entre un hongo y una alga o una cianobacteria. El hongo
proporciona una estructura protectora y ayuda en la absorción de agua y nutrientes, mientras que
la alga o cianobacteria realiza la fotosíntesis para producir nutrientes. Los ácidos orgánicos
producidos durante estas interacciones pueden afectar el entorno circundante y la disponibilidad
de nutrientes.
Una diferencia importante es que las bacterias tienden a utilizar las fracciones más simples
(exudados radiculares y residuos vegetales frescos), mientras que los hongos tienden a utilizar
compuestos complejos (residuos fibrosos, madera y hummus).
Por último, otros organismos relevantes son:
● Plantas Pioneras: Las plantas pioneras son las primeras en colonizar un área después de
perturbaciones como incendios, erupciones volcánicas o disturbios humanos. Su presencia inicial
puede influir en la disponibilidad de recursos, como la luz solar y los nutrientes, así como en las
condiciones del suelo. La llegada de plantas pioneras puede alterar el microclima y la composición
del suelo, lo que puede afectar la capacidad de los líquenes para establecerse.
● Rizosfera: La rizosfera es una zona del suelo en estrecha proximidad a las raíces de las plantas. Es
una región rica en actividad biológica y química, ya que las raíces liberan compuestos orgánicos, y
la presencia de microorganismos, como bacterias y hongos, es significativamente mayor en esta
área. La rizosfera puede tener un impacto en la disponibilidad de nutrientes y en la composición
del suelo.
La mayor actividad de los microorganismos se realiza desde la superficie del suelo hasta unos 20
centímetros de profundidad. Las colonias de microorganismos permanecen adheridas a las partículas de

tener un papel ecológico importante al contribuir a la formación y estabilización del suelo, así como al ser
indicadores de la calidad del aire, ya que son sensibles a la contaminación atmosférica.
17
Un liquen tradicionalmente se define como un holobionte conformado por un hongo (micobionte) y una
o varias poblaciones fotosintéticas de algas o cianobacterias (fotobiontes) esparcidas de manera extracelular en el
micelio del micobionte considerado como el hospedero o ex-habitante
Aunque los líquenes son conocidos por ser resistentes y capaces de colonizar ambientes desafiantes, la
mayoría de ellos no tienen la capacidad de fijar nitrógeno directamente. Sin embargo, algunas especies de
cianobacterias que pueden formar simbiosis con líquenes tienen la capacidad de fijar nitrógeno atmosférico. En
estos casos, la cianobacteria en el líquen realiza la fijación de nitrógeno, proporcionando así una fuente adicional de
nutrientes al líquen y al ecosistema circundante.
arcilla, humus y a las raíces de las plantas que les suministran sustancias orgánicas que les sirven de
alimento y estimulan su reproducción. Esto genera un nicho complejo que permite aprovechamiento de
micro/nutrientes.
Todo esto se ve afectado por acciones externas como el arado intensivo, que altera la actividad de
las bacterias y otros organismos descomponedores de la materia orgánica fresca generando una
disminución de la fracción activa (porción disponible para los organismos del suelo). Esto altera el nicho
en tal nivel que produce la muerte de grandes cantidades de microorganismos. Un ejemplo de cómo una
práctica como el arado intensivo afecta a la vida microbiana es por ejemplo al dar vuelta la tierra, aquellos
que sean anaerobios facultativos/estrictos se ven expuestos al oxígeno, inversamente para aquellos
superiores que son aerobios.
Mientras que prácticas que aumentan la materia orgánica aumentan la fracción activa.
Otros factores que afectan la microbiología en el suelo:
● Erosión y baja disponibilidad de nutrientes
● Fertilización mineral (el fósforo pasa a ser tóxicos)
● Temperatura y pH extremos
● Inundaciones y malos drenajes
● Incendios
● Uso de plaguicidas
● Textura del suelo, porosidad (penetración del oxígeno y agua) y concentraciones tóxicas de
metales pesados

→ Pregunta de exámen: ¿cómo la variación de condiciones

ambientales afecta la actividad fúngica o bacteriana?
Observamos que la disminución de las temperaturas
disminuye el crecimiento debido a que el frío gelifica/rigidiza
las membranas, afectando su respiración. Hay una directa
relación entre las actividades metabólicas y las condiciones
exteriores

[Link]. Tipos de microorganismos: Bacterias

→ Son los microorganismos más numerosos del suelo (106 -109 viables/gr)
→ Principales responsables del reciclado de nutrientes y fijadores de N2
→ Muy diversos taxonómicamente y fisiológicamente (aerobios obligados, microaerófilos, anaerobios,
etc.).
→ Las características particulares de cada suelo determinan el tipo de microorganismos que viven allí
→ Aunque dominan las bacterias G-, en relación a otros hábitat hay alta proporción de G+
→ Ejemplos de géneros: Acinetobacter, Agrobacterium, Alcaligenes, Arthrobacter, Bacillus,
Brevibacterium, Caulobacter, Cellulomonas, Clostridium, Corynebacterium, Flavobacterium,
Micrococcus, Mycobacterium, Pseudomonas, Staphylococcus, Streptococcus, Xanthomonas
→ Una particularidad de estas bacterias es su capacidad de esporular, la presencia de esporas es un
indicador de la calidad del suelo. Tiene una ventaja comparativa con cultivo en laboratorio debido a que
son más fáciles de reconocer y contabilizar, mientras que el crecimiento bacteriano en cultivos es mucho
más dificultoso ya que nunca se consiguen condiciones tan ideales como las del nicho
→ Aumentan la productividad del suelo
→ Las bacterias del género Bacillus, Pseudomonas y Azospirillum son bien conocidas por promover el
crecimiento de las plantas
[Link].1. Actinomicetos, “Antibióticos por naturaleza”
→ Pueden ser un porcentaje muy alto de la población bacteriana (10- 30%), pero su tasa de reproducción
es muy baja
→ Generan 30 tipos de antibióticos
→ Forman biofil
→ Los géneros más abundantes
son: Streptomyces y Nocardia.

→ Otros géneros como Micromonospora, Actinomyces, etc., se encuentran en mucha menor cantidad.
→ Formadores de compuestos húmicos a partir de celulosa
→ Resistentes a la desecación.
→ Crecen sobres suelos alcalinos o neutros
→ Importantes productores de antibióticos
→ Responsables del olor a tierra mojada.

[Link].2. Mixobacterias
→ Son muy abundantes en suelos de bosque
→ Activos descomponedores de residuos vegetales.
→ Los géneros más respresentativos son: Myxococcus, Cytophaga,
Chrondococcus, Archangium y Polyamgium.

[Link].3. Cianobacterias
→ Contribuyen a la estabilización del suelo al formar costras en los
suelos desnudos.
→ Fijadoras de C y N, solas o en asociaciones
→ Principales géneros en el suelo: Anabaena, Calothirx, Chroococcus,
Cylindrospermun, Lyngbya, Microcoleus, Nodularia, Nostoc, Oscillatoria,
Phormidium, Plectonema, Schizothrix, Scytonema y Tolypothrix.

[Link].4. Otras bacterias fijadoras de N2

→ Azotobacter, heterótrofo de vida libre
→ Algunos Clostridium del suelo
→ Rhizobium y Bradyrhizobium en los nódulos de las raíces

[Link]. Tipos de microorganismos: Hongos

Los hongos son conocidos por causar enfermedades en las diferentes actividades agrícolas. Sin
embargo, los hongos patógenos sólo representan una pequeña porción del total de la comunidad de
hongos del suelo; la mayoría son benéficos para la salud de las plantas. como los géneros Penicillium,
Aspergillus, Trichoderma, Gliocladium, Mucor y Mortierella

[Link].1. Los hongos hifales

→ Tan importantes en los suelos como las bacterias (105 -106 /gr suelo seco), constituyen una altísima
proporción de la biomasa.
→ Papel esencial en la descomposición de los residuos vegetales, especialmente de sustancias
recalcitrantes y en la formación de compuestos húmicos a partir de lignina
→ Aparecen como organismos de vida libre o en asociación con raíces (micorrizas).
→ Principalmente en los 10 primeros cm del suelo, no llegan a más de 30 cm de profundidad. Prefieren
suelos bien aireados debido a que son células eucariotas por lo que son aerobios
→ Son los únicos capaces de depurar espacios muy contaminados
→ Tamaño aproximado de 40 micras
→ Los géneros filamentosos más frecuentes son
hongos imperfectos: Aspergillus, Geotrichum,
Penicillium, Trichoderma, Botrytis, pero también se
encuentran numerosos ascomicetos y basidiomicetos

[Link].1. Levaduras
→ Muy comunes también en el suelo
→ Géneros más frecuentes: la mayoría son también hongos imperfectos o Deuteromicetos (Candida,
Rhodotorula y Cryptococcus).
→ Algunas especies de los géneros Lipomyces, Schwanniomyces, Kluyveromyces, Schizoblastoporion,
Hansenula, Candida y Cryptococcus han sido aisladas únicamente del suelo.
→ La mayoría de los hongos del suelo son oportunistas (zimógenos).
→ Muchos metabolizan carbohidratos, pero son pocos los que degradan lignina.
→ El letargo es una condición muy común en los hongos. Forman estructuras especializadas:
Esporangiosporas, conidios, oosporas, ascosporas, basidiosporas, clamidosporas y esclerocios.

[Link].2. Micorrizas
Son un grupo especializado de hongos que están en asociación
simbiótica con las raíces de las plantas. La relación de las micorrizas, es
que se benefician del carbono que producen las plantas mientras que
ésta se beneficia del incremento en la nutrición con fósforo y un mayor
movimiento de agua hacia las raíces.

[Link]. Tipos de microorganismos: Virus

La supervivencia de los virus en el suelo depende de muchos factores:
● Hospedero adecuado
● Si el virus se integra de forma estable en el genoma de la bacteria hospedero, puede llegar a ser un
componente permanente de la comunidad microbiana.

[Link]. Rizosfera
Es la región del suelo que se extiende entre 1 y 3 mm desde la superficie de las raíces al interior
del suelo. El efecto de la raíz sobre el medio que la rodea se debe fundamentalmente a la liberación de
sustancias orgánicas e inorgánicas al suelo. Aquí es muy importante la presencia de los ciclos
Bio-geo-químicos en función del microorganismo que sea
Materia orgánica (entre el 10% y el 30% del Carbono fijado en la fotosíntesis):
● Muerte de raíces
● Exudación radicular
○ Aminoácidos
○ Azúcares
○ Ácidos orgánicos
Es en esta región donde los fijadores de N2 viven relación muy estrecha con las raíces vegetales
formando nódulos simbióticos.
Bacterias fijadoras de N2:
 ● Bacterias Gram -
● Proteobacterias: alpha y 𝛽
● Bacilos móviles, flagelación polar.
● Quimioorganotrofas18
● Aerobios: microaerófilos
● La interacción promueve la formación de nódulos radicales.
● Independientemente, ninguno es capaz de fijar N 2 .
● Se requiere un medio microaerofílico.
● Nitrogenasa es inhibida por el O2
● Las concentraciones de O2 están controladas por la leghemoglobina19.
● Solo es sintetizada en los nódulos.
● En la leghemoglobina, el Fe3+ se reduce a Fe++ y se une al O2, manteniendo la [ O2 ] baja.

[Link].1. Mucigel
Material gelatinoso sobre la superficie de las raíces formado por: mucílagos vegetales originales y
modificados, células bacterianas y sus productos metabólicos coloides minerales y materia orgánica del
suelo polisacáridos: galactosa, fucosa y ácido urónico.
Sus funciones son:
● Alimento de bacterias
● Absorbe minerales de arcilla, especies tóxicas del Aluminio y metales pesados como Cu, Cd y Pb
● Es más grueso en los extremos de la raíz (protege al tejido meristemático esas toxicidades)
● Favorece el contacto entre la raíz y el suelo
Es muy relevante para evaluar la salud del suelo. Los microorganismos se encuentran como biofilms

18
Las quimioorganotrofas son organismos que utilizan compuestos químicos orgánicos como fuente de
carbono y obtienen su energía a través de procesos de oxidación química de estas sustancias orgánicas. Este
término se aplica comúnmente a ciertos grupos de bacterias que descomponen materia orgánica para obtener
energía y carbono, participando en la descomposición de materiales orgánicos en el ciclo biogeoquímico.
19
La leghemoglobina es una proteína especializada que se encuentra en las raíces de las plantas
leguminosas (como los frijoles, guisantes, y alfalfa) en asociación simbiótica con bacterias del género Rhizobium.
Esta proteína es fundamental en el proceso de fijación de nitrógeno, que es crucial para la capacidad de las
leguminosas de obtener nitrógeno atmosférico y convertirlo en una forma que las plantas pueden utilizar.
La leghemoglobina desempeña un papel clave en este proceso porque ayuda a proporcionar un ambiente
libre de oxígeno dentro de los nódulos de las raíces. El oxígeno podría inhibir la actividad de la enzima nitrogenasa,
que es responsable de la fijación de nitrógeno, ya que es altamente sensible al oxígeno. La leghemoglobina, al ser
una proteína capaz de unirse y transportar oxígeno, ayuda a mantener un ambiente bajo en oxígeno dentro de los
nódulos, permitiendo así que la fijación de nitrógeno proceda eficientemente.
11. MICROBIOLOGÍA AMBIENTAL
11.1. BIOTECNOLOGÍA
“Amplia área del conocimiento moderno que combina de manera innovadora la biología y la
ingeniería en procesos que, aplicados sobre organismos vivos, sus tejidos, células o partes generan bienes,
servicios o conocimientos que promoverán el bienestar de la humanidad. ”
→ La biotecnología implica la aplicación de la ciencia y la ingeniería sobre organismos vivos, tejidos,
células o sus partes.
→ La biotecnología busca intervenir en la producción de bienes, servicios o conocimientos para la
humanidad.
→ La biotecnología es innovadora en algún nivel del campo industrial, científico o productivo.
Aplicación de la biotecnología en aspectos medioambientales:
● Seguimiento de la contaminación (biosensores, biomarcadores)
● Tratamiento de residuos (origen doméstico, agrícola, industrial)
● Tratamiento de lugares y vías ya contaminados
● Prevención de la contaminación (biocombustible, plásticos biodegradables, etc)

11.2. BIORREMEDIACIÓN
“Desarrollo, uso y regulación
de los sistemas microbianos
para la remediación de
ambientes contaminados (aire,
agua y tierra) la creación de
procesos amigables con el
medio ambiente para la
protección y restauración de la
calidad del medioambiente con
una perspectiva a largo plazo.”
⇒ Cuando la biotecnología está abocada a eliminar, degradar o neutralizar contaminantes en el
medio ambiente se la llama biorremediación, donde se utilizan organismos vivos para resolver un
problema. La biorremediación aprovecha la capacidad natural de ciertos microorganismos (como
bacterias, hongos, plantas o enzimas) junto con tecnologías emergentes para metabolizar o transformar
sustancias contaminantes en formas menos perjudiciales.
Este es un proceso natural desarrollado a lo largo de toda la historia evolutiva de la biosfera; como
mecanismo de autodepuración y de recuperación de nutrientes, para mantener los ciclos biogeoquímicos,
responsables del equilibrio de los ecosistemas.
Microorganismos como levaduras, hongos o bacterias degradan una gran cantidad de sustancias
tóxicas, reduciendo su carácter nocivo o incluso volviéndolas inocuas para el medio ambiente y la salud
humana. La biorremediación consiste en acelerar este proceso natural para mitigar esta contaminación
ambiental.
Otro concepto empleado en el mismo marco es el de depuración, que es la eliminación, ya sea
por métodos físico, químicos o biológicos, de un contaminante antes de que éste alcance el medio
ambiente. Mientras que cuando la contaminación ya se ha producido, se precisa restaurar o mitigar el
ecosistema contaminado, para lo que se pueden utilizar diversas estrategias, una de ellas es la
biorremediación.
Además la biorremediación se puede dividir entre alteración natural, in situ y ex situ:
● Atenuación natural: proceso natural mediante el cual los contaminantes en el medio ambiente son
reducidos o eliminados de manera espontánea debido a las interacciones biológicas, químicas y
 físicas presentes en el entorno. Este proceso no implica la intervención directa de actividades
humanas, sino que aprovecha los mecanismos naturales para la degradación y transformación de
los contaminantes
● Biorremediación In Situ: En la biorremediación in situ, el proceso se lleva a cabo directamente en
el lugar donde se encuentra la contaminación. Los organismos o agentes biológicos se aplican o se
activan en el sitio contaminado para que realicen la degradación de los contaminantes en su
ubicación original. Este enfoque es beneficioso porque no es necesario transportar grandes
cantidades de suelo o agua contaminada a otra ubicación, lo que puede ser logísticamente
complicado y costoso. Sin embargo, la efectividad de la biorremediación in situ puede depender
de factores como las condiciones ambientales locales, la presencia de microorganismos adecuados
y la naturaleza de los contaminantes. Se acelera el proceso en el mismo medio modificando las
condiciones ambientales (pH, nutrientes, humedad, temperatura, oxígenos, etc), añadiendo
nutrientes para multiplicar los organismos del lugar, o inoculando organismos más eficaces para el
vertido concreto. La adición de nutrientes es la opción más económica y la que ofrece más
posibilidades de éxito hoy en día.
- Ventajas: Amplio ámbito de aplicabilidad (sólidos, líquidos y gases); es una tecnología poco
intrusiva en el medio y generalmente no requiere componentes estructurales o mecánicos dignos
de destacar; comparativamente es económica y, al tratarse de un proceso natural, suele tener
aceptación por parte de la opinión pública.
○ Bioaumentación: implica la introducción deliberada de microorganismos seleccionados o
modificados genéticamente en el área contaminada para mejorar la capacidad de
degradación de los contaminantes. Estos microorganismos pueden ser bacterias, hongos u
otros organismos especializados en la degradación de compuestos específicos.
○ Bioestimulación: implica la modificación del entorno para favorecer el crecimiento y la
actividad de microorganismos autóctonos ya presentes en el suelo o el agua. Se
suministran nutrientes, como nitrógeno y fósforo, y en algunos casos, sustratos
adicionales, para estimular la actividad microbiana y aumentar la degradación natural de
los contaminantes. Ejemplos:
■ Bioventing: técnica que utiliza la inyección controlada de aire (oxígeno) en el suelo
contaminado para estimular la actividad microbiana y la biodegradación de
contaminantes orgánicos. La adición de oxígeno mejora las condiciones aeróbicas
en el suelo, lo que favorece el crecimiento de microorganismos que requieren
oxígeno para descomponer los contaminantes.
■ Biosparging (Burbujeo): El biosparging, también conocido como burbujeo
biológico, es una técnica que implica la inyección de aire (oxígeno) en aguas
subterráneas contaminadas para estimular la actividad microbiana y la
biodegradación de contaminantes disueltos.
● Biorremediación Ex Situ: En la biorremediación ex situ, los contaminantes se retiran del lugar
contaminado y se tratan fuera del sitio. Esto puede implicar la excavación de suelos contaminados
o la extracción de agua contaminada para llevarla a una instalación especializada donde se aplican
los organismos o procesos de biorremediación. La biorremediación ex situ puede ofrecer un
mayor control sobre las condiciones de tratamiento, pero puede ser más costosa y logísticamente
desafiante debido al transporte de grandes volúmenes de materiales contaminados. Ejemplos:
○ Land Farming (Cultivo de Suelo): implica la remoción de suelo contaminado que se
extiende sobre una superficie y se trata in situ mediante procesos de aireación, volteo y
adición de nutrientes. La exposición controlada al aire y la luz solar, junto con la adición
de microorganismos y nutrientes, promueve la degradación de contaminantes orgá[Link]
 utiliza para tratar suelos contaminados con hidrocarburos, solventes orgánicos y otros
compuestos orgánicos persistentes.
○ Composteo: En el composteo, los residuos orgánicos contaminados se mezclan con
materiales compostables y se descomponen aeróbicamente en condiciones controladas.
Este proceso promueve la actividad microbiana beneficiosa y la degradación de
contaminantes orgánicos. Aplicable para la descomposición de residuos orgánicos
contaminados, como lodos de depuradora y residuos agrícolas.
○ Bioacumulación: implica el uso de plantas o microorganismos para absorber
contaminantes del suelo o el agua. Estos organismos acumulan los contaminantes en sus
tejidos, facilitando la posterior extracción o tratamiento. Utilizado para extraer metales
pesados del agua o suelo mediante plantas acumuladoras, como la almeja cebra para la
bioacumulación de metales.
○ Reactor Ex Situ: implica la extracción de agua o suelo contaminado para su tratamiento en
un sistema cerrado fuera del lugar original. Pueden utilizarse diversos tipos de reactores,
como los de lecho fluidizado o los de tanque agitado, para llevar a cabo procesos
biológicos, químicos o físicos de tratamiento. Se utiliza para el tratamiento de aguas
contaminadas con compuestos orgánicos o inorgánicos, como la degradación bacteriana o
la precipitación de metales.
○ Filtro de Percolación: es un sistema ex situ que utiliza materiales filtrantes para tratar
aguas contaminadas. El agua contaminada se hace pasar a través de un medio filtrante,
donde se retienen partículas y se promueve la adsorción de contaminantes. Aplicable para
la eliminación de sólidos suspendidos y contaminantes orgánicos en aguas contaminadas,
como las aguas de escorrentía industrial.
○ Reactor de Lecho Fluidizado: el sustrato contaminado se mezcla con un flujo continuo de
un gas o líquido. Este método mejora la transferencia de masa y facilita la interacción entre
microorganismos y contaminantes para la degradación más eficiente. Se utiliza para la
biodegradación aeróbica de compuestos orgánicos volátiles (COV) en aguas o suelos
contaminados.
Investigaciones y aplicaciones específicas en Argentina
- Industria de curtiembres
- Depuración de aguas residuales urbanas
- Industria lechera
- Industria metalúrgica
- Remediación de cuencas hídricas

11.2.1. Microorganismos
[Link]. Bacterias
El mecanismo biofísico consiste en que los microorganismos
producen enzimas que “rompen” la molécula contaminante en
partes digeribles para que estos luego sean digeridos por la célula
como nutrientes junto con otras fuentes de energía. Evidentemente
estos
contaminantes tienen que ser útiles para la célula
Se pueden emplear diversos microorganismos en el proceso de biorremediación, en forma
combinada/simultánea, secuencial o secuencial. Estos microorganismos son:
● Rhodococcus sp
● Stenotrophomonas maltophilia
● Stenotrophomonas sp
● Pseudomonas sp
● Achromobacter
● Arthrobacter
● Micrococcus
● Nocardia
● Vibrio, Acinetobacter
● Brevibacterium
● Corynebacterium
● Flabobacterium
Estos se agrupan en Biofilms ⇒ 2-5% de la masa total son microorganismos, 1-2% son
polisacáridos y más del 97% es agua. Le ofrece grandes ventajas como una estructura tridimensional
compleja, adhesión irreversible a la superficie, estructura rodeada por una matriz extracelular, sistema de
poro y canales para el transporte de nutrientes y desechos, y fundamentalmente, una gran tolerancia al
estrés medioambiental.

[Link]. Hongos
Se emplean principalmente para contaminantes más complejos (metales pesados por ejemplo por
su mayor capacidad de almacenamiento), pero son comparativamente más complejos de emplear que las
bacterias. Al igual que estas forman biofilms, pero a su vez tienen mayores requerimientos de pH,
temperatura, nutrientes, etc. Ventajas comparativas de bacterias vs Hongos:
● Velocidad de Crecimiento: En comparación con las bacterias, muchos hongos tienen tasas de
crecimiento más lentas. La biorremediación a menudo requiere microorganismos que puedan
proliferar rápidamente para degradar contaminantes en un plazo razonable. Las bacterias suelen
ser más eficientes en este aspecto.
● Adaptabilidad a Condiciones Variables: Las bacterias son generalmente más adaptables a una
amplia gama de condiciones ambientales. Pueden tolerar fluctuaciones en la temperatura, pH y
otros factores, lo que facilita su uso en diferentes entornos. Algunos hongos pueden ser más
sensibles a cambios en estas condiciones.
 ● Superficie de Contacto: La mayor parte de la actividad de las bacterias ocurre en la superficie, lo
que facilita la interacción con contaminantes en el medio ambiente. Los hongos, en cambio,
pueden tener una estructura más compleja y a menudo crecen en forma de filamentos o hifas, lo
que puede limitar su capacidad de contacto con ciertos contaminantes.
● Selección de Cepas Apropiadas: La identificación y selección de cepas de hongos adecuadas para
degradar contaminantes específicos puede ser más complicada que en el caso de bacterias.
Además, algunos hongos pueden requerir condiciones específicas de nutrientes y suelos
particulares para prosperar.
● Requerimientos Nutricionales: Algunos hongos pueden tener requisitos nutricionales más
específicos en comparación con las bacterias. Esto puede dificultar su cultivo y mantenimiento en
sistemas de biorremediación.

Tipos de Hongos Contaminantes para los cuales se los Emplea

➔ Penicillium ● Hidrocarburos aromáticos policíclicos.

➔ Aspergillum ● Organoclorados.
➔ Mucor ● Bifenilos policlorados
➔ Candida ● Tinturas
➔ Rhodotorula ● Pesticidas
➔ Sporobolomyces ● Fungicidas
➔ Phanerochaetes ● Herbicidas
➔ Chrysosporium ● Lignina.

[Link]. Fitorremediación
La fitorremediación es el uso de la capacidad de algunas plantas para acumular los tóxicos que
contaminan el suelo y aguas. El término está
asociado con el uso potencial de especies
hiperacumuladoras (imágen y cuadro más
abajo).
En general para la fitorremediación se
emplean plantas de pantano. Parámetros a tener
en cuenta de la adaptación de la vegetación en
los humedales vegetales:
● Tolerancia a los contaminantes
● Disponibilidad de luz solar
● Temperatura óptima y rango de efectivo
de pH
● Capaces de operar en ambientes
anaerobios
● Máxima salinidad tolerable
Una pregunta que nace del empleo de las plantas
es qué hacer luego si no se logró la
fitovolatilización y solo llegó a la fitoextracción, e incluso si el proceso queda en los pasos anteriores
como rizofiltración o fitoestabilización. La problemática que se presenta es compleja debido a que no
hacer nada implicaría que esos contaminantes reingresen a la tierra, si se la incinera pasan a estado
gaseoso.
 TIPO PROCESO INVOLUCRADO CONTAMINANTE

Fitoextracción Concentración de metales pesados en las partes Cadmio, cobalto, cromo, níquel.
aéreas y cosechables de la planta (Figura 8 a) mercurio, plomo, selenio. zinc

Rizofiltración Absorción, precipitación y concentración de los Cadmio, cobalto, cromo, niquel.

metales pesados en las raíces a partir de efluentes mercurio, plomo, plomo selenio. zinc
líquidos contaminados. Degradación compuestos isótopos radioactivos, compuestos
orgánicos (Figura 8 b) fenólicos

Fitoestabilización Las plantas tolerantes a metales se usan para Lagunas de desecho de yacimientos
reducir la movilidad de los mismos y evitar el mineros. Propuesto para fenólicos y
pasaje a aguas subterráneas o al aire compuestos clorados.

Fitoestimulación Se usan los exudados radiculares para promover Hidrocarburos derivados del petróleo y
el desarrollo de microorganismos degradativos poliaromáticos. benceno, tolueno,
(bacterias y hongos) atrazina. etc

Fitovolatilización Las plantas captan y modifican metales pesados o Mercurio, selenio y solventes clorados
compuestos orgánicos y los liberan a la atmósfera (tetraclorometano y triclorometano)
con la transpiración.

Fitodegradación Las plantas acuáticas y terrestres captan, Municiones (TNT. DNT. RDX.
almacenan y degradan compuestos orgánicos para nitrobenceno. nitrotolueno). atrazina.
dar subproductos menos tóxicos o no tóxicos. solventes clorados. DDT. pesticidas
fosfatados, fenoles y nitrilos. etc.

La fitorremediación juega un rol muy importante en la gestión sostenible del agua en la parte de
sistemas naturales de depuración (desarrollo más adelante).

11.2.2. Ventajas vs Desventajas de la Biorremediación

Ventajas Desventajas

– Mientras que los tratamientos físicos y buena parte de los – La biodegradación incompleta puede
químicos están basados en transferir la contaminación entre las generar intermediarios metabólicos
fases gaseoso, líquido y sólido, en la biorremediación se inaceptables, con un poder contaminante
transfiere poca contaminación de un estado a otro. Ejemplo: la similar o incluso superior al producto de
quema de contaminantes sólo transfiere contaminantes de estado partida y algunos compuestos
sólido a gaseoso (incluso puede ser más dañino para la salud) contaminantes son tan resistentes que
– Es una tecnología poco invasiva y generalmente no requiere pueden incluso inhibir la biorremediación.
componentes estructurales o mecánicos que signifiquen una Un ejemplo de industria es la del cuero
amenaza para el medio. – Es difícil predecir el tiempo requerido
– Comparativamente, es económica viable y al tratarse de un para un proceso adecuado.
proceso natural, suele tener “buena prensa”. Además tiene mayor – El seguimiento y control de la velocidad
empuje legislativo y/o extensión del proceso es complicado.
– El uso de la biorremediación ha servido y está sirviendo para – Si bien resulta eficaz para ciertos vertidos,
desarrollar herramientas de interés biotecnológico como por como el petróleo o incluso el uranio, no
ejemplo, el uso de las bacterias, o parte de ellas en procesos de puede hacer nada contra muchos tipos de
biominería (extracción de metales de interés usando bacterias), de vertidos: Metales pesados como el cadmio o
bioproducción de sustancias de interés tales como bioplásticos o el plomo no son absorbidos o lo son muy
biopolímeros, energía (electricidad), sustancias de interés dificultosamente; el mercurio es
farmacológico, o enzimas que realizan procesos químicos de una bioacomulado, lo que supone un grave
forma más eficiente y más respetuosa con el medio ambiente que riesgo para la cadena alimenticia; los
la industria química. Estas bacterias, o parte de ellas también pesticidas artificiales llevan moléculas que
pueden ser usadas para desarrollar biosensores, sistemas de no son reconocidas como nutriente por los
detección de sustancias más eficientes y rápidos que los típicos microorganismos.
análisis químicos

11.2.3. Actualidad de la biorremediación

La biorremediación enfrenta un nuevo reto: el de convencer a las compañías y a los organismos
oficiales de su alto potencial. Aún hay técnicas poco reconocidas y marginadas, pero es una verdadera
industria. Además de ello se enfrenta con desafíos propios de una tecnología innovadora y de frontera.
Esta “industria biotecnológica” busca seguir mejorando en sus líneas interdisciplinares:
1. Integración en el proceso de técnicas innovadoras que ayuden a comprender y controlar los
fenómenos de transporte de nutrientes y otros posibles aditivos.
2. Desarrollo de técnicas de biología molecular que permitan caracterizar las poblaciones indígenas
de los emplazamientos contaminados así como su potencial enzimático. Es decir, invertir recursos
para poder categorizar y estudiar aún más microorganismos con capacidades de estar involucrados
en el proceso de biorremediación
3. Exploración de las implicancias del concepto de biodisponibilidad ("bioavailability") definido por
las propiedades físico-químicas de los contaminantes. Se trata de un factor que en muchos casos
está limitando la biodegradación y en otros reduciendo la toxicidad de los contaminantes.
Especialmente significativo para las industrias mineras o derrames petroleros
En el ámbito de la microbiología aplicada a la evaluación de contaminantes, la exploración de las
implicancias del concepto de biodisponibilidad es fundamental. La biodisponibilidad se refiere a la
cantidad y velocidad con la que un contaminante está disponible para ser utilizado o afectar a los
organismos en un entorno determinado. Este concepto es crucial en el contexto de la
biodegradación de contaminantes y en la reducción de la toxicidad asociada con estos compuestos.
En muchos casos, las propiedades físico-químicas de los contaminantes, como su solubilidad, su
afinidad por ciertos sustratos o su forma molecular, tienen un impacto directo en su
biodisponibilidad. Es decir, la manera en que estos contaminantes se presentan en el medio
ambiente puede influir en la facilidad con la que los microorganismos pueden acceder a ellos y,
por ende, en su capacidad para degradarlos.
La biodisponibilidad es especialmente crítica en situaciones donde la biodegradación es un
proceso clave para la mitigación de la contaminación, como en derrames petroleros o áreas
contaminadas por la actividad minera. En algunos casos, la limitación en la biodisponibilidad
puede restringir la capacidad de los microorganismos para degradar eficientemente los
contaminantes, lo que puede prolongar la persistencia de la contaminación en el ambiente.
Por otro lado, en situaciones donde los contaminantes son altamente tóxicos en su forma original,
la limitación en la biodisponibilidad puede ser beneficiosa, ya que reduce la cantidad de
contaminante activo que está disponible para causar efectos perjudiciales en los organismos. Esto
puede tener implicaciones importantes para la gestión y remediación de sitios contaminados.
4. Desarrollo definitivo de técnicas de bioaumentación realmente útiles.
 5. Mejorar la falta de legislación producto del desconocimiento de las consecuencias (positivas o
negativas) de muchos de los procesos. Algunos ejemplos:
a. Impacto de la liberación de microorganismos modificados genéticamente (GMO:
genetically modified organism) al medio ambiente.
b. Seguridad en el consumo de la cadena trófica de productos procedentes de estos
microorganismos. Por ejemplo, el consumo de aves de corral bajo la acción de hormonas
de crecimiento produce la aparición de caracteres sexuales femeninos en hombres y
disminuye la edad de la primera menstruación en mujeres. Esto, que no es el efecto de un
microorganismos se puede extrapolar para entender las repercusiones que podrían tener los
microorganismos GMO
c. Alteración de la biodiversidad ambiental por los microorganismos modificados
genéticamente.
d. Introducción de mutantes y resistencia a antibióticos en humanos.
e. Impacto de la modificación genética en humanos. Por ejemplo riesgos teratogénicos20
f. Falta de nuevas leyes que regulen la propiedad de la información de los microorganismos
modificados genéticamente. Es debido a esto que no se pueden patentar microorganismos
o poner bajo propiedad intelectual a los GMO. Esta información debe ser pública y ser
expuesta a escrutinio científico
g. Necesidad de desarrollo de un código deontológico21/ético.
11.2.4. Factores que determinan la eficiencia de la biorremediación
1. Propiedades del contaminante (biodegradabilidad22):
a. Los hidrocarburos lineales se degradan más rápidamente que los ramificados.
b. La presencia de dobles enlaces, anillos aromáticos y diversas sustituciones químicas hacen
una molécula más resistente a su biodegradación
2. Presencia de comunidades microbianas adecuadas:
a. Biorremediación intrínseca o atenuación natural: los microorganismos pueden ser
autóctonos que trabajen, limitar el terreno contaminado e impedir que haya más. Depende
del grado de contaminación.
b. Bioestimulación: adición de nutrientes (principalmente fuentes de nitrógeno y fósforo)
para favorecer el crecimiento microbiano. Intervención activa. Posible pregunta: qué
nutrientes debo agregar, dónde los puedo encontrar (formulación de medios de cultivo ?) y
la cadena trófica natural donde debo intervenir.
c. Bioaumentación: microorganismos añadidos al sistema para mejorar/potenciar la
degradación. Intervención activa. Presenta conflictos respecto a los puntos marcados
anteriormente en el desconocimiento de las consecuencias.

20
Teratogenicidad se refiere a la capacidad de ciertos agentes, como sustancias químicas, medicamentos o
factores ambientales, para causar malformaciones congénitas o defectos de nacimiento en un feto en desarrollo.
Estos agentes teratogénicos pueden afectar el desarrollo embrionario y fetal durante el embarazo, dando lugar a
anomalías estructurales o funcionales en el feto.
21
El término "deontológico" o código profesional está relacionado con la ética y la moral, específicamente
en el ámbito profesional y las normas que rigen el comportamiento ético de los individuos en determinadas
ocupaciones o disciplinas. La ética deontológica se basa en deberes y obligaciones, y busca establecer reglas y
principios éticos que guíen el comportamiento de las personas. Este enfoque se centra en la idea de que hay deberes
y obligaciones morales que deben seguirse, independientemente de las consecuencias o resultados. Es decir, una
acción es considerada ética si está de acuerdo con ciertos principios o reglas morales, incluso si los resultados no
son los esperados o deseados.
22
La biodegradabilidad es la capacidad de un material para ser descompuesto por microorganismos, como
bacterias y hongos, en sustancias más simples y, en última instancia, en productos no perjudiciales para el medio
ambiente.
 3. Disponibilidad del contaminante: es un factor crítico
a. Depende de su solubilidad (agua)
b. Estado de oxidación
c. Adsorción a componentes (suelo) ⇒ las condiciones del suelo (arcilla vs suelo mineral)
4. Naturaleza del medio contaminado: puede afectar al crecimiento microbiano y al metabolismo del
compuesto en cuestión:
a. Permeabilidad (suelos)
b. Temperatura, pH, etc.
c. Presencia o ausencia de nutrientes orgánicos
d. Niveles de oxígeno u otros aceptores de electrones
e. Disponibilidad de nutrientes inorgánicos (fuentes de P y N).
f. Concentración de metales pesados
5. Toxicidad: la toxicidad de un compuesto puede afectar al crecimiento microbiano o la capacidad
para asimilarlo
a. Compuestos recalcitrantes: Compuestos químicos orgánicos que no pueden ser degradados
fácilmente por microorganismos o que son resistentes a su ataque. Por ejemplo la lignina
(propia de la producción de papel) solo puede ser degradada por hongos los que
complejiza aún más el proceso de biorremediación
b. Compuestos xenobióticos: Compuestos sintéticos que no se forman por procesos de
síntesis natural. Son sustancias extrañas al ecosistema que a menudo presentan un efecto
tóxico. En general hay una relación lineal entre la sinteticidad de un microorganismo y su
efecto contaminante. Por ejemplo el uranio radiactivo
En resúmen y aumentando el enfoque podemos resumir a los limitantes en:
● Tipo de contaminante y su concentración
● Medio ambiente circundante a la contaminación
● Características del suelo, agua y aire
● Proximidad y condición de napas
● Naturaleza del microorganismo
● Relación costo/beneficio: costo vs impacto ambiental
● Duración del proceso biorremediativo
● Capacidad limitada de biorremediación

11.2.5. Una Salud o One Health

Es importante, en este sentido, la incorporación del concepto de una salud (One Health): enfoque
integrado que reconoce la interconexión entre la salud humana, la salud animal y la salud ambiental. La
idea fundamental es que la salud de los humanos está intrínsecamente ligada a la salud de los animales y
al estado del medio ambiente en el que todos coexistimos. Es de base interdisciplinario y con un enfoque
global. Algunos principios fundamentales:
- Interconexión de Salud Humana y Animal: Reconoce que muchas enfermedades infecciosas
pueden ser compartidas entre humanos y animales, y que la salud de ambos está interrelacionada.
- Enfoque Holístico: Considera la salud como un sistema complejo que involucra no solo la
prevención y el tratamiento de enfermedades en humanos, sino también la salud animal y la salud
ambiental.
- Prevención: Destaca la importancia de la prevención de enfermedades y la identificación temprana
de amenazas para la salud antes de que se conviertan en crisis.
 - Colaboración Interdisciplinaria: Fomenta la colaboración entre profesionales de la salud humana,
veterinaria, ecología, biología, epidemiología, y otras disciplinas para abordar los desafíos de
manera integral.
- Conservación de la Biodiversidad: Reconoce que la salud de los ecosistemas y la biodiversidad
también tienen un impacto directo en la salud humana y animal.
- Seguridad Alimentaria: Aborda cuestiones relacionadas con la seguridad alimentaria, la
producción animal y la salud humana en relación con la cadena alimentaria.

11.2.6. Gestión sostenible del Agua

Se busca lograr una calidad de agua de manera que pueda ser reutilizada para actividades como la
agricultura, limpieza, etc. También buscan desinfectar para recargar las aguas subterráneas.
Para poder realizar esto se emplean dos sistemas: convencionales y no-convencionales o naturales.

[Link]. Humedales Artificiales

Los humedales artificiales (HA) son una tecnología de tratamiento de
agua residual no-convencional muy prometedora. Estos son
ecotecnologías basadas en depuración de aguas contaminadas
principalmente a través de la vegetación y los microorganismos presentes
en los Humedales Artificiales colocados por el humano. Son estanques
poco profundos impermeabilizados que permiten tratar aguas residuales de
diferentes orígenes (domésticas, urbanas e industriales)
← Parámetros críticos que afectan el rendimiento y la eficiencia de
tratamiento de los humedales artificiales.
Las principales características y los objetivos que deben cumplir pueden
ser englobadas en:
- Sirven para tratamiento secundario y terciario de aguas residuales, no así el tratamiento primario
⇒ no están diseñados para abordar la eliminación de sólidos gruesos y sedimentables en las aguas
residuales, pero si contaminantes y materia orgánica de menor tamaño.
- Diseñado, construído y mantenido por
el ser humano
- Amigables con el medio ambiente
 - Protección de fuentes de agua
- Económicamente viables
- Mantenimiento sencillo
- Alta eficiencia de tratamiento
Las plantas empleadas deben ser capaces de fitorremediar
sumado a que sean convenientes según la región y no tengan
consecuencias negativas para el ambiente de la zona (como
que se conviertan en plantas invasoras o afecten la fauna y/o
flora).
● Enraizadas Emergentes: Tifácea (Typha spp.)
Comúnmente conocida como "junco," la Tifácea es
una planta con raíces emergentes que crece en bordes
de lagunas y humedales. Es eficaz para la
fitorremediación de aguas contaminadas.
● Enraizadas con Hojas Flotantes: Lirio Acuático (Eichhornia crassipes). También conocido como
camalote, el lirio acuático tiene raíces sumergidas y hojas flotantes. Puede ayudar en la remoción
de nutrientes como el nitrógeno y el fósforo del agua.
● Flotantes Libres: Lenteja de Agua (Lemna spp.). La lenteja de agua es una planta flotante libre
que puede crecer rápidamente en la superficie del agua. Es eficaz para absorber nutrientes y puede
ayudar en la fitorremediación de aguas eutróficas.
● Enraizadas Sumergidas: Myriophyllum elatinoides Conocido como milfoil acuático, esta planta
tiene raíces sumergidas y se utiliza en la fitorremediación para la absorción de nutrientes y metales
pesados del agua.
Tanto las plantas y microorganismos elegidos y colocados deben responder al tipo de
contaminación (depuración biológica), tampoco deben salir del medio de manera de afectar
negativamente la zona.
Los elementos de un HA y los pasos para un correcto cálculo del área superficial necesaria
(caudal); determinación de la profundidad, pendiente y sustrato; relación largo y ancho; y, construcción
son:
● Reconocimiento del terreno y zona de trabajo
● Estudios geotécnicos y topográficos
● Dique de contención o celda
● Entrada y salida, cámara de registro
 El influente o afluente debe tener cierta calidad (no aguas primarias), por lo que se puede llegar a
necesitar un tratamiento previo. Luego, el agua se distribuye a través de la superficie con una tubería. El
terreno y el medio granular deben ser apropiados según el tipo de caudal y tipo de filtrado requerido
(depuración física), además todo debe estar apropiadamente impermeabilizado para evitar potenciales
contaminaciones por fuga. Además, el medio granular debe ofrecer soporte a las plantas.
En conclusión, es un proyecto altamente interdisciplinario y requiere del estudio, colaboración y
participación de una multiplicidad de campos como la biología; ingeniería ambiental, civil, agrónoma,
etc; sociología; etc.

[Link].1. Tipos de Humedales Artificiales

[Link].1.1. HA-FS: Humedal artificial de flujo superficial

Partes constituyentes de un HA-FS:

1. Impermeabilización
2. Grava
3. Tierra
4. Agua contaminada
5. Plantas y bacterias
Este HA-FS demora aproximadamente de 5 a 15 días en filtrar
[Link].1.2. HA-FSS-H: Humedal artificial de flujo subsuperficial horizontal

En este caso las plantas no están sumergidas en el agua, en cambio, existe un gradiente de esta
donde termina recolectando al final. En este caso la profundidad es mayor y el gramaje cambia a lo largo
del recorrido.
El HA-FSS-H demora más de 5 días en el proceso de remediación

[Link].1.3. HA-FSS-V: Humedal artificial de flujo subsuperficial vertical

En este caso el agua se inyecta a lo largo de todo el humedal

El HA-FSS-V demora minutos/horas en el filtrado

[Link].1.4. Sistema Francés

Son tres humedales en serie, en paralelo a otros dos humedales en serie. Esto aumenta la eficiencia del
humedal
[Link].1.5. Sistema Híbrido

Es una combinación de los HA mencionados anteriormente.

[Link]. Bio-barreras para proteger el suelo y las aguas subterráneas de contaminación

Para la gestión sostenible y recuperación de microcuencas se utilizan Buffer Strips. Estas
consisten en crear una zona de vegetación cerca de la ribera para controlar la contaminación difusa
proviene de los cultivos o de otras fuentes contaminantes. Evidentemente no pueden ser cualquier especie
de plantas las que se colocan en las riberas por lo que dividiremos la ribera en tres zonas con
fitorrequerimientos diferentes:
1. Franja 1 (Fr1): Especies autóctonas típicas del bosque de ribera. El objetivo es conferir estabilidad
a la orilla y proporcionar calidad de hábitat acuático.
2. Franja 2 (Fr2): Especies arbóreas de gran porte con subpiso de árboles más pequeños y arbustos.
Se busca que el agua infiltre en el suelo reteniendo nutrientes y contaminantes.
3. Franja 3 (Fr3): Cubierta herbácea densa. En ella se filtran sedimentos, se aumenta la capacidad de
absorción de agua, se retienen nutrientes y se busca minimizar los procesos erosivos.
Beneficio Tipo de Vegetación
Herbácea Arbustiva Arbórea
Prevención erosión Bajo Alto Alto
Filtro de sedimentos Alto Bajo Bajo
Filtro de nutrientes Alto Bajo Bajo
Hábitat acuático Bajo Medio Alto
Hábitat silvestre Bajo Medio Alto
Biodiversidad Bajo Alto Alto
Protección contra inundación Bajo Medio Alto

● Selección de Vegetación: Para la creación de bio-barreras de infiltración lenta, se elige

cuidadosamente una combinación de plantas con sistemas radiculares eficaces para aumentar la
infiltración del agua. Plantas con raíces profundas y densas, como ciertos pastos y vegetación
nativa adaptada, son comúnmente utilizadas.
● Diseño de la Bio-barrera: La bio-barrera se diseña de manera que intercepte el flujo de agua
superficial antes de que alcance áreas sensibles, como cuerpos de agua o zonas de recarga de
acuíferos. Esto se logra mediante la disposición estratégica de vegetación a lo largo de la
trayectoria del agua.
● Filtración y Retención de Contaminantes: La vegetación en la bio-barrera cumple varias funciones
beneficiosas. Las raíces de las plantas ayudan a estabilizar el suelo, reduciendo la erosión.
Además, actúan como un filtro natural, atrapando y reteniendo sedimentos y contaminantes
presentes en el agua superficial. Una aplicación superficial consiste en forzar la escorrentía del
efluente, mediante riego por circulación superficial en láminas, sobre un suelo previamente
acondicionado (en pendiente y con vegetación no arbórea).
● Infiltración Lenta: La vegetación contribuye a la infiltración lenta del agua en el suelo,
permitiendo que el agua se filtre gradualmente y recargue los acuíferos subterráneos. Esto es
beneficioso para prevenir la escorrentía rápida que podría transportar contaminantes y nutrientes a
las aguas subterráneas. Cuando se utilizan aguas residuales, como las provenientes de HA, se
consigue, a parte de la depuración del efluente, el crecimiento de especies vegetales, generalmente
arbóreas maderables y la recarga artificial de acuíferos.
● Beneficios Adicionales: Además de la protección contra la contaminación, las bio-barreras
ofrecen beneficios adicionales, como la mejora de la calidad del suelo, la promoción de la
biodiversidad y la reducción del riesgo de inundaciones.

[Link]. Contaminantes del agua

Los antimicrobianos se están convirtiendo en los contaminantes emergentes de los que no se ha
estudiado aún su impacto ambiental real. Las concentraciones que se encuentran en algunos de los ríos en
todo el mundo exceden los niveles seguros hasta 300 veces.

14 antibióticos de uso común en ríos de 72 países de 6 continentes y encontraron ATB en el 65% de los
sitios monitoreados.
"no existen niveles guía legislados para estos contaminantes en agua, lo que hace más difícil que se
establezcan políticas públicas en este sentido"
 Midiendo por primera vez, durante 2 años, las cuencas hidrológicas más extensas de américa del
sur, la cuenca de la Plata y los distintos afluentes, se obtuvieron resultados alarmantes:
→ Los resultados fueron claros y contundentes: la monensina y la salinomicina, medicamentos utilizados
principalmente para prevenir enfermedades en ganado y pollos y para promover el crecimiento criados en
condiciones de hacinamiento en feed lots con cereal y antibióticos, fueron detectados en 26 de los 45 ríos
y arroyos valorados.
Los antimicrobianos como promotores de engorde ejercen una intensa acción sobre la microbiota
intestinal de los animales alterando inevitablemente la microecología de los desechos biológicos. Esto sin
contar con la influencia sobre la salud humana que pueden ejercer los antibióticos que, por vía veterinaria,
se incorporan a la cadena alimentaria.
Otro estudio, de 2 años de recolección de muestras, en el curso de agua y derrames cloacales
ocurridos en diferentes puntos de la capital cordobesa, decantaron la presencia de superbacterias con
genes de resistencia antimicrobiana. El 73% de la muestras recolectadas de derrames cloacales en la vía
pública contenía enterobacterias resistentes a cefalosporinas de tercera generación, un antibiótico que se
usa en las instituciones de salud y que no debería ser de consumo extensivo en pacientes ambulatorios.
Pero además, encontraron patógenos resistentes a Carbapenems, enterococos resistentes a
vancomicina y staphylococcus aureus resistentes a meticilina

Cabe preguntarse qué sucede con los antimicrobianos que no se degradan. Se puede argumentar
que la mayoría de los ATM se eliminan metabolizados; lo que ocurre es que muchos metabolitos siguen
siendo activos, y a veces más activos, para otros microorganismos. Algunos pueden presentar fenómenos
sinérgicos con otros que no conocemos pero sobre todo, y fundamentalmente, que actúan sobre otros
seres vivos, los microorganismos fundamentales para mantener el ciclo biológico. Además, aunque
muchos ATM se degraden y aunque muchos metabolitos mantengan muy baja actividad, como se vierten
de una manera continua están actuando y ejerciendo una presión constante sobre los microorganismos de
estos nichos ecológicos con consecuencias no bien evaluadas
Distintos fármacos y su filtrado respecto a los Humedales Artificiales:
Fármacos HA-FSS-H H-FSS-V EDAR secundario
Cafeína 94-99 98-99 99
Ibuprofeno 78-90 98-99 90
Diclofenac 11-45 73-80 17
Galaxolide 86 90 70-85
12. MICROBIOLOGÍA INDUSTRIAL
12.1. OBTENCIÓN DE ENERGÍA Y RESPIRACIÓN
Formas de obtención de energía
1. Respiración: proceso por el cual la célula microbiana libera energía almacenada en los nutrientes.
Este proceso ocurre en las mitocondrias de la mayoría de las células eucariotas y en la membrana
celular de las células procariotas.
a. Aeróbica: en la mayoría de los microorganismos el oxígeno es necesario para este proceso,
por lo cual se respiración aerobia
b. Anaeróbica: en las
células microbianas que obtienen su
energía sin la presencia del oxígeno,
el proceso se llama respiración
anaerobia.

c. Fermentación: La fermentación es un proceso metabólico anaeróbico que permite la

obtención de energía a través de la degradación parcial de compuestos orgánicos,
generalmente [Link] fermentación no hay un aceptor de electrones externo, y la
cadena de transporte de electrones no está funcional o está ausente. Además, los productos
finales de la fermentación son compuestos orgánicos más simples en comparación con los
de la respiración anaeróbica23.
2. Fotosíntesis: es el proceso de conversión de energía lumínica en energía química, donde a partir de
sustancias inorgánicas simples (CO2) se pueden obtener compuestos orgánicos de mayor
complejidad (azúcares). A diferencia de las plantas, las bacterias comienzan el proceso con una
mínima cantidad de luz (fase lumínica) y luego continúa con una fase oscura donde se forma el
ATP.
a. Fotosíntesis oxigénica: cuando las plantas, algas y cianobacterias utilizan protones (átomos
de hidrógeno) provenientes del agua para reducir el CO2 y producir oxígeno molecular
b. Fotosíntesis anoxigénica: Estas bacterias no utilizan la clorofila a sino bacterioclorofila, un
pigmento que absorbe la luz en longitudes de onda superior a la clorofila. La localización
de la bacterioclorofila en los microorganismos es variable (en clorosomas, en la superficie,
inmersas o en invaginaciones de la membrana celular).
3. Quimiosíntesis: capacidad de obtener energía por fosforilación oxidativa a partir de donadores
inorgánicos de electrones. Sólo se presenta en ciertos grupos de procariotas, cada grupo
fisiológico de quimiolitotrofos usa un tipo de donador inorgánico
a. bacterias de hidrógeno (H2)
b. bacterias del hierro (Fe2+)
c. bacterias del azufre (S2- , S0 ).

23
Las células procariotas, es decir en la mayoría de los microorganismos, la respiración suele ser
aerobia debido a la ventaja comparativa de obtención de energía: 36 ATP en aerobia y 2 ATP en
fermentación. Cuando consideramos ciclos de vida de días u horas, prevalecerán los medios que aportan
la mayor cantidad de energía en el menor tiempo.
 d. bacterias nitrificantes, con dos subtipos diferentes:
i. las oxidadoras de amoniaco (llamadas nitrosas)
ii. las oxidadoras del nitrito (llamadas nítricas).
La glucosa, tanto en el metabolismo
respiratorio como en el fermentativo, se
transforma en ácido pirúvico por una de
las siguientes rutas:
1. Embden-Meyerhof (eucariotas y
procariotas)
2. Pentosa fosfato (eucariotas y
procariotas)
3. Entner Doudoroff (sólo en ciertos
procariotas como alternativa a la ruta
Embden-Meyerhof)
La cadena de transporte electrónico
acoplado al final es parte del ciclo de
Krebs que a su vez forma parte de la
glucólisis

Nota: tanto la glucólisis como el ciclo de krebs aparecen en este tema, pero son muy complejos y
extensos. Supuestamente para ambiental no es tan relevante. Recomiendo complementar con un video
mas didáctico en forma de repaso.
Solo hay que saber donde se generan los ATP y el tipo de respiración, no tanto el ciclo de Krebs

.
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.

.
12.2. FERMENTACIÓN
Características:
- Libera energía a partir de un azúcar u otra molécula orgánica (aa, ac org, purinas y pirimidinas)
- No necesita oxígeno (pero puede estar)
- No necesita recurrir al ciclo de Krebs ni de cadena transportadora de electrones
- Utiliza una molécula orgánica como aceptor final de electrones (pregunta: cuál?)
- Produce pequeñas cantidades de ATP (1 ó 2 px c/inicial)
- Producto final: ácido láctico, etanol, etc (almacena energía)
→ Es un proceso catabólico (necesita activar el metabolismo de la célula) de oxidación incompleta24,
totalmente anaeróbico, siendo el producto final un compuesto orgánico ⇒ metabolito primario o
secundario el que es de interés

24
Un proceso catabólico de oxidación incompleta es un tipo de reacción metabólica en la cual una
molécula orgánica, generalmente un compuesto carbonado como la glucosa, se descompone parcialmente en
productos más simples a través de una serie de reacciones de oxidación, pero sin llegar a una oxidación completa
hasta dióxido de carbono y agua. Los procesos catabólicos de oxidación incompleta son formas de obtener energía
de sustratos orgánicos mediante la descomposición parcial de estas moléculas, liberando productos finales menos
oxidados que en procesos de oxidación completa como la respiración aeróbica. Estos procesos son relevantes en
situaciones donde el oxígeno es limitado.
→ El compuesto orgánico que se reduce (acetaldehído, piruvato, etc.) es un derivado del sustrato que se
ha oxidado anteriormente → Estos productos finales son los que caracterizan los diversos tipos de
fermentaciones.
→ El proceso de fermentación es anaeróbico; ello significa que el aceptor final de los electrones del
NADH producido en la glucólisis no es el oxígeno, sino un compuesto orgánico que se reducirá para
poder reoxidar el NADH a NAD+. Esto se debe a la oxidación del NADH, que en lugar de penetrar en la
cadena respiratoria, cede sus electrones a compuestos orgánicos con poco poder oxidante.
→ Las fermentaciones pueden ser: naturales, cuando las condiciones ambientales permiten la interacción
de los microorganismos y los sustratos orgánicos susceptibles; o
artificiales, cuando el hombre propicia condiciones y el
contacto referido
Tipos de fermentaciones:
- Láctica
- Alcohólica
- Homoláctica
- Heteroláctica
- Ácido-mixta
- Butanodiólica
- Propiónica
- Acetona-butanol

12.1.1. Fermentación Láctica

Productos lácteos acidificados como el yogur, queso, chucrut.
→ Proceso anaeróbico fermentativo que consiste en la
producción de ácido láctico a partir de glucosa.
→ Bacterias ácido-lácticas (BAL) de la familia Streptococcus,
Lactobacillus acidophilus y Bacillus spp.
→ Homoláctica

[Link]. Tipos de fermentación láctica

Homoláctica: : se refiere a un tipo de fermentación que produce un solo producto final, y en el
contexto de la fermentación láctica, significa que el único producto final es el ácido láctico
Géneros: Streptococcus, Bacillus y Lactobacillus
Heteroláctica: Solo la mitad de la glucosa se convierte en ácido láctico El resto se transforma en
una mezcla de CO2 y etanol.
Géneros:
- Lactobacillus sakei
- Leuconostoc mesenteroides var. sake
 - Saccharomyces cerevisiae
- Saccharomyces uvarum
- Saccharomyces sake
- Kluyveromyces fragilis
- Kluyveromyces lactis
-
[Link]. Fabricación de queso
Queso: alimento lácteo obtenido por la coagulación enzimática de la leche mediante los
microorganismos de géneros:
- Lactococcus
- Streptococcus
- Lactobacillus
- Leuconostoc
- Bifidobacterium
- Pediococcus

12.1.2. Fermentación del alcohol o alcohólica

→ Empleada para la producción del pan, cerveza y vino
→ Aproximadamente el 96% . de la fermentación del
etanol se lleva a cabo mediante cepas de:
- Saccharomyces cerevisiae
- Saccharomyces uvarum
- Kluyveromyces fragilis
- Kluyveromyces lactis
- Zymomonas mobilis
→ Tipos de fermentación láctica: heterolítica y homolítica:

12.1.3. Fermentación acética

→ Producción de vinagre: fermentación del ácido propiónico
→ Característica de algunas bacterias anaerobias como el
Propionibacterium
→ Este tipo de genera una molécula más de ATP
→ Los productos principales de la fermentación de la glucosa son los
ácidos propiónico y acético
→ Requieren una cantidad mínima de oxígeno.

12.1.4. Fermentación Fórmica

Se producen diariamente en el intestino grueso, donde los
microorganismos ayudan a la fermentación. Las flatulencias son el
resultado de este proceso
[Link]. Fermentación ácido mixta
→ Salmonella y E. coli
→ Se fermentan hexosas, a través del piruvato, a ácidos: láctico,
acético, succínico y fórmico, etanol
→ También se produce etanol y dióxido de carbono
→ Organismos dan positivo para la prueba del rojo de metilo
 [Link]. Fermentación de butanodiol
→ Enterobacter
→ Se produce 2,3-butanodiol durante la fermentación de la glucosa
→ Derivado de condensación de piruvato a molécula de acetoína
→ Se producen pequeñas cantidades de los productos formados en
la vía ácido mixta
→ Organismos dan positivo para la prueba de Voges Proskauer

12.1.5. Fermentación del ácido butírica

→ Se ve en bacterias del género Clostridium spp.
⇒ Por ejemplo, clostridium tetanis aparte de la
toxina se genera un ácido (acético, butílico) y se
produce las heridas negras y se carcome la piel.
→ Se produce ácido acético, ácido butírico, CO2 y
H2, entre otros productos
→ Algunos organismos de este género pueden
fermentar aminoácidos para obtener energía

12.3. APLICACIONES EN LA INDUSTRIA

Evidentemente la célula vegetativa de los microorganismos son los sistemas biológicos más
usados en la microbiología industrial. Ocasionalmente el sistema biológico de interés para producir el
producto o el servicio son las esporas, como en el caso de los bioinsecticidas. Así como también las
enzimas y otras proteínas.
Los microorganismos pueden emplearse como:
- Productores de metabolitos primarios y secundarios
- Productores de biomasa y sus constituyentes (Proteínas y aminoácidos, Vitaminas, Ácidos
Nucleicos, Polímeros de H de C y ésteres, Biomasa)
- Huéspedes para la expresión de genes homólogos de heterólogos
 Producción de metabolitos primarios y de productos relacionados
Bebidas alcohólicas Vinos Saccharomyces
Cervezas
Etanol Etanol industrial
Ácido láctico Lactobacillus
Productos lácticos Leches fermentadas Quesos Bacterias lácticas
Embutidos
Vegetales fermentados: col ácida....
Ácido acético Vinagre Acetobacter
Ácido cítrico Aspergillus
Ácido propiónico Quesos Emmental Propionibacterium
Alimentos orientales fermentados Salsa de soja, miso, kimchi. sutu. Honduras y bacterias
tempeh... lácticas
Aminoácidos L - Glutámico L - Lisina Corynebacterium
Producción de metabolitos secundarios
Antibióticos beta-lactámicos, Tetraciclinas, Penicillium, Streptomyces,
Peptídicos, Aminoglucósidos Bacillus
Alcaloides Ergotamina Claviceps
Pigmentos Astaxantina Phaffia
Producción de otros componentes biológicos
Polisacáridos Dextrano Leuconostoc
Xantano Xanthomonas
Bioplásticos Polihidroxialcanatos Alcaligenes
Vitaminas B12 Pseudomonas
Riboflavina Ashbya
Transformación de esteroides Floriduras,
Streptomyces
Aplicaciones ambientales
Depuración de aguas residuales Fangos activos Bacterias aerobias Protozoos

Depuración de materia orgánica Biodigestión anaerobia Bacterias aerobias

semisólida Arqueas
Metanógenes

Biodegradación de xenobióticos Biodegradación de hidrocarburos Pseudomonas

Aplicaciones analíticas
Biosensores Análisis de glucosa Aspergillus
 Bioensayos Tests de Toxicidad ambiental Photobacterium
Tests mutagénicos Test de Ames Salmonella
Producción de biomasa microbiana
Microorganismos unicelulares Levadura de panificación Saccharomyces
Proteína unicelular bacteriana Methylophilus
Proteína unicelular de levaduras Candida
Microalgas Chlorella
Scenedesmus
Spirulina
Esporas bacteriana Bioinsecticidas Bacillus
Biomasa fúngica Proteína unicelular fúngica Paecilomyces
Cultivo de setas Morchella
Producción de enzimas y otras proteínas
Enzimas Amilasas Aspergillus
Proteasas Bacillus
Hormonas Insulina humana Escherichia
Otras proteínas Interferón humano Escherichia

12.3.1. Producción de metabolitos en el ciclo de vida

→ Cuando un microorganismo se inocula en un
medio de cultivo fresco su objetivo es crecer.
→ El crecimiento de los microorganismos se
detecta por el aumento del número de individuos
de la población.
→ Si hacemos una representación semilogarítmica
del crecimiento de una población microbiana
frente al Tiempo se observa:
● Trofofase: Los microorganismos crecen
hasta un punto en el que agotan los nutrientes
● Diofase: A partir de este punto, el
microorganismo no crece pero metabólicamente
sigue activo

[Link]. Trofofase o fase exponencial

1. Aumento de la Síntesis de Metabolitos25 Relacionados con el Crecimiento: Durante la trofofase,
hay un aumento significativo en la síntesis de metabolitos que están directamente relacionados con
el crecimiento celular. Esto incluye tanto procesos anabólicos (síntesis de moléculas más grandes

25
Un metabolito es cualquier molécula pequeña, intermediaria o producto que participa en las reacciones
químicas del metabolismo, que es el conjunto de procesos químicos que ocurren dentro de un organismo para
mantener la vida. Los metabolitos son esenciales para las funciones celulares
 a partir de unidades más pequeñas) como catabólicos (descomposición de moléculas más grandes
para obtener energía y componentes celulares).
2. Utilización y No Acumulación de Metabolitos: A medida que se sintetizan estos metabolitos, son
utilizados activamente por la célula en los procesos de crecimiento y mantenimiento. Es
importante destacar que, en esta fase, los metabolitos no se acumulan en la célula, sino que se
consumen a medida que se producen. Esto indica una regulación precisa para mantener un
equilibrio en el metabolismo celular.
3. Metabolitos Primarios: Los metabolitos que la célula sintetiza durante la trofofase y que están
directamente involucrados en el crecimiento celular se conocen como "metabolitos primarios".
Estos son esenciales para funciones celulares básicas y para la construcción de nuevas células.
Ejemplos de metabolitos primarios incluyen aminoácidos, nucleótidos, lípidos y carbohidratos.

[Link]. Idiofase o fase estacionaria

1. Metabolitos No Vitales para el Crecimiento: Durante la idiofase, la célula no está enfocada en el
crecimiento activo. En cambio, se dedica a la producción de metabolitos que no son esenciales
para el crecimiento celular en sí mismo. Estos metabolitos no están directamente involucrados en
las rutas metabólicas esenciales para la biosíntesis celular o la obtención de energía.
2. Metabolitos Secundarios o Idiolitos: Los metabolitos producidos durante la idiofase se llaman
"metabolitos secundarios" o "idiolitos". Estos metabolitos son productos químicos que, aunque no
son necesarios para el crecimiento y la supervivencia directa de la célula, pueden tener funciones
específicas y beneficiosas en otras áreas. Los metabolitos secundarios a menudo tienen roles en la
interacción con el entorno, la competencia con otros microorganismos, la defensa contra
patógenos (ej penicilina), o pueden tener aplicaciones industriales y medicinales.
3. Producción en Cultivos Discontinuos y Continuos a Baja Tasa de Dilución: La idiofase puede
ocurrir tanto en cultivos discontinuos como continuos, pero la producción de metabolitos
secundarios es posible a bajas tasas de dilución en cultivos continuos. En cultivos continuos, la
baja tasa de dilución permite que la población celular alcance la fase de idiofase, y la producción
de metabolitos secundarios se vuelve más evidente.

[Link]. Lectura en curva de crecimiento

1. Fase de Latencia: Al inicio de la curva, hay una fase de latencia donde las células se están
adaptando al entorno y preparándose para el crecimiento activo. En esta fase, la producción de
metabolitos puede ser baja.
2. Fase Exponencial: En la fase exponencial, las células experimentan un
crecimiento rápido y la población se duplica de manera constante. Durante esta
fase, las células están altamente metabólicas y se centran principalmente en la
síntesis de metabolitos primarios esenciales para el crecimiento y la división
celular. Se producen a tasas elevadas para satisfacer las demandas de la síntesis
celular. Es por esto que cuando los vemos representada la producción de
metabolitos primarios en un esquema semilogarítmico están justo por debajo,
pero paralelos a la fase exponencial. Luego, al entrar en fase estacionaria,
disminuye la producción y la curva de metabolitos primarios decrece.
3. Fase Estacionaria: Cuando los recursos se vuelven limitados (por
ejemplo, agotamiento de nutrientes), la población celular alcanza una fase
estacionaria en la que la tasa de crecimiento se equilibra con la tasa de muerte
celular. En esta fase, la producción de metabolitos primarios puede disminuir. Durante la fase
estacionaria, y especialmente en condiciones de estrés, las células pueden desviar recursos hacia la
 producción de metabolitos secundarios. Estos metabolitos
pueden tener funciones protectoras, de señalización o de
adaptación al entorno. Es por esto que cuando los vemos
representada la producción de metabolitos secundarios en un
esquema semilogarítmico, “arranca” la producción
considerablemente “más tarde” que la curva de crecimiento.
Durante la fase exponencial es paralela a la curva de
crecimiento, mientras que cuando esta llega a la fase
estacionaria, la producción de metabolitos secundarios sigue
aumentando.
4. Fase de Muerte: Si las condiciones empeoran, la población
celular puede entrar en una fase de muerte donde la tasa de
muerte celular supera la tasa de crecimiento. En esta fase, la producción de metabolitos puede ser
baja.

Curva
real de

producción de estreptomicina (ejercicio de final):

La curva de crecimiento es “mycelial biomass” y el producto que buscamos obtener es

“streptomycin concentration”. Se consume glucosa
→ ¿Qué tipo de metabolito es? ⇒ secundario
→ ¿Cómo nos damos cuenta? ⇒ 1. Por la gráfica observamos que hay un retardo donde la máxima
producción se da en la fase estacionaria 2. Todos los antibióticos son metabolitos secundarios
→ ¿Cómo está afectando el pH a la producción? ⇒ El aumento de pH está directamente relacionado con
la producción de estreptomicina. Hay un cierto pH que genera la mayor producción de metabolitos
secundarios.

12.3.2. Metabolitos primarios

“Moléculas de bajo peso molecular que intervienen, como productos finales o intermediarios, en
las distintas rutas metabólicas. Los más importantes desde el punto de vista industrial son los
aminoácidos, nucleótidos, vitaminas, ácidos orgánicos y acoholes”
→ Relacionados con la síntesis de células microbianas, con su crecimiento.
→ Aumentan en paralelo al crecimiento celular, o incluso de manera solapada.
→ Son generalmente moléculas de bajo peso molecular
→ Intervienen como productos finales o intermediarios en:
- Rutas anabólicas
- Rutas catabólicas
- Desde el punto de vista industrial, los más importantes son:
- Alcoholes (etanol)
- Ac. orgánicos (ác. cítrico)
- Aminoácidos (ác. glutámico, Lisina etc…)
- Nucleótidos
- Vitaminas

[Link]. Etanol
Producido por:
1. Levaduras
a. Saccharomyces (a partir de hexosas)
b. Kluyveromyces fragilis (a partir de lactosa)
c. Candida (a partir de pentosas)
2. Bacterias
a. Clostridium (a partir de celulosa) (termófilos, anaerobios)
b. Zymomonas
3. Recombinantes
a. E. coli recombinante: Introducción de los genes Alcohol deshidrogenasa y piruvato
decarboxilasa de Zymomonas.
Tomemos por ejemplo la producción de vino:
● La transformación de mosto de uva en vino es un proceso ecológico y bioquímico complejo que
implica el desarrollo secuencial de especies microbianas tales como levaduras, bacterias lácticas y
bacterias acéticas.
● En las primeras etapas de la fermentación del vino, varias docenas de especies de levadura puede
estar presentes, pero, a medida que aumenta la concentración de alcohol, la población de levaduras
progresivamente se ve dominada por levaduras pertenecientes al género Saccharomyces.
● A pesar de este dominio de las cepas de S. cerevisiae, el desarrollo controlado de las especies no
Saccharomyces puede contribuir a las propiedades de aroma y composición química del vino por
la síntesis de metabolitos de interés organoléptico.
○ La liberación de enzimas de diversos tipos, enzimas extracelulares que pueden ser
responsables de proporcionar al vino con propiedades únicas de la región de su
 producción, la liberación de
compuestos derivados de la pared
celular; o la reducción del grado
alcohólico final del vino

● Acetobacter y Gluconobacter
son los principales géneros de
importancia enológica dentro de la
familia de las bacterias acéticas.
Gluconobacter que se suele encontrar
en las uvas dañadas, degradan los
azúcares en ácido acético y otros
compuestos, pero tienen una baja
resistencia al alcohol.
● Acetobacter utiliza el etanol como sustrato y lo metaboliza a ácido acético.
● Ambas bacterias necesitan oxígeno para su actividad.
● En el momento se inicia la fermentación alcohólica, la saturación de CO2 en el medio y la falta de
oxígeno, impiden su desarrollo.
● Al final de la fermentación, con los trasiegos de los vinos y un almacenamiento incorrecto
(presencia de oxígeno) puede producirse una proliferación importante de las bacterias acéticas que
conduciría a un aumento de ácido acético y su éster, acetato de etilo, a partir de azúcares
residuales o de etanol, como fuentes de carbonos. Este es el conocido «picado acético».
● La cantidad de etanol formada en la fermentación con microorganismos depende de:
○ La cantidad de azúcar en la solución
○ De que la fermentación se lleve o no a cabo completamente
○ La concentración de alcohol que puedan tolerar las levaduras sin que se detenga la
fermentación

[Link]. Aminoácidos
Los principales productores son bacterias de los géneros
Corynebacterium y Brevibacterium
- Mutantes auxótrofas y regulatorias
- Mutantes alteradas en la secreción
- Cepas recombinantes

[Link]. Vitaminas
1. Vitamina B12
a. Microorganismos productores: Bacterias de los géneros Propionibacterium shermani y
Pseudomonas denitrificans.
b. Producción: 150 mg/ L.
2. Biotina
a. Microorganismo productor: cepas modificadas (mutantes) de Serratia marcescens.
b. Producción: 150-600 mg/ L
3. Vitamina B2 (Riboflavina)
a. Microorganismos productores: Hongos (Eremothecium ashby y Ashbya gossypii);
Candida sp.; Bacillus subtilis recombinante
b. Producción: 20 -30 g/ L
12.3.3. Metabolitos secundarios
“Moléculas sintetizadas por determinados microorganismos, normalmente en una fase tardía de su
ciclo de crecimiento. Algunos ejemplos: antibióticos, ciertas toxinas (micotoxinas), alcaloides (ácido
lisérgico), factores de crecimiento vegetal (giberelinas) y pigmentos”
→ Específicos de un grupo de organismos
→ No esenciales para el crecimiento
→ Dependiente de las condiciones de crecimiento
→ Producidos como grupo de estructuras relacionadas:
- Una cepa de Streptomyces produce 32 antibióticos distintos del tipo antraciclina
→ Puede obtenerse una superproducción
→ Los metabolitos secundarios funcionan en los organismos que los producen como:
- Reguladores del crecimiento
- Ionóforos
- Defensa frente a otros microorganismos (antibióticos, toxinas, pesticidas)
- Agentes de simbiosis
- Efectores de diferenciación
- Respuesta a estrés

[Link]. Antibióticos
→ Desde 1940 se han introducido una gran variedad de moléculas con actividad antibiótico para su uso
en medicina y agricultura.
→ En el mercado hay 160 antibióticos en uso por un valor de 23,000 millones de U$S.
→ Se han descripto 6,000 antibióticos de los cuales 4,000 se han aislado de Actinomycetes, y se
describen alrededor de 500 antibióticos nuevos por año.
→ Una sola cepa de Streptomyces hygroscopicus produce aproximadamente 200 antibióticos.
→ Muchos nuevos antibióticos se obtienen por semisíntesis, es decir, por modificación de antibióticos
existentes

Antibiótico Microorganismo productor Componentes del medio

Bacitracina Bacillus licheniformis
Cefalosporinas Cephalosporium
Cloranfenicol Streptomyces venezuelae
Cicloserina Streptomyces orchidaceus
Cloranfenicol Streptomyces erythreus
Eritromicina Streptomyces kanomycetus
Kanamicina Streptomyces fradioe
Neomicina Streptomyces fradioe Glucosa
Penicilina Penicillium chrysogenum Glucosa/Fuentes de nitrógeno
Polimixina Bacillus polymyxa
Estreptomicina Streptomices gríseas Glucosa/Fosfato
Tetraciclina Streptomyces rimosus Fosfato
12.4. INGENIERÍA DE LA FERMENTACIÓN
→ El microorganismo es lo más importante en las fermentaciones industriales y los aspectos de
ingeniería siempre están supeditados al organismo.
→ Elegir, para diferentes aspectos, las condiciones que sean las más adecuadas para mi biocatalizador.
→ La ingeniería es una herramienta que facilita el proceso que realiza el biocatalizador, mientras que en
otras industrias puede ser la base esencial.
→ El desarrollo de un proceso de producción a gran escala, en forma exitosa, es el resultado de acelerar e
intensificar un concepto original, generalmente un procedimiento de laboratorio o a pequeña escala.
Procedimiento:
1. Introducción
2. Diseño y funcionamiento del fermentador
3. Tipos de fermentaciones
a. Fermentación discontinua
b. Fermentación alimentada
c. Fermentación continua
d. Reactores de enzimas o células inmovilizadas
4. Factores físico-químicos que afectan al rendimiento de las fermentaciones industriales
a. Oxígeno
b. Temperatura
c. pH
5. Agitación y mezclado

12.4.1. Introducción
● Procedimiento de fermentación
○ Desarrollo/preservación de inóculos: conservación de cepas de producción a lo largo de un
período largo de tiempo es un mantener sus capacidades de producción después de la
conservación.
■ Obtener precultivos para que la fase de adaptación sea más corta.
■ Preservar la capacidad de formar producto.
■ Siempre tenemos que conservar las cepas maestras.
■ A partir de estas cepas obtenemos y las cepas de trabajo, que son las que vamos a
utilizar cada vez que inoculamos un fermentador.
■ Si se nos deteriorasen las cepas de trabajo recurriríamos a las cepas maestra.
■ Cepas de trabajo. Las tenemos conservadas para que no haya metabolismo
(congeladas, liofilizadas) por lo que hay que revivirlas.
○ Preparación de los medios: el desarrollo de los medios de cultivo se da en matraces
agitados
○ Regulación del metabolismo: formación de esporas en medio sólido
○ Fermentación: precultivo fermentador26 y fermentación
■ Una vez revivido hay una proporción ideal para utilizar con inóculo en el tanque
fermentador industrial.
■ Si es una bacteria el volumen de cultivo de inoculo que tenemos q utilizar es del
0,1 al 3% del volumen del productor.

26
Cultivo inicial de microorganismos que se prepara antes de realizar una fermentación a mayor escala.
Este precultivo se utiliza para introducir una cantidad específica y activa de microorganismos en el medio de
fermentación principal, facilitando así un inicio rápido y eficiente de la fermentación.
 ■ Si tenemos un tanque de 30000 L tendremos que utilizar un inóculo de hongo de
3000 litros y para obtenerlo tendremos que ir inoculando unos tres litros y así
avanzando por diez hasta 3000.
○ Parámetros de crecimiento y producción industrial
■ Tasa de crecimiento
■ Tiempo de generación
■ Rendimiento: Yx/s
■ Coeficiente metabólico/tasa específica de consumo de sustrato
■ Tasa específica de producción de un metabolito
○ Control de factores físico-químicos
● Recuperación del producto
○ Extracción
○ Purificación

12.4.2. Diseño y funcionamiento del fermentador

→ Objetivo: explotación industrial de los microorganismos
→ Funcionamiento ideal de un fermentador:
1. Tanque aséptico ⇒ debo poder desinfectar el
tanque sin dejar residuos.
2. Sistema de aireación y agitación ⇒ debo
asegurarme que no haya anaerobiosis, sin permitir el
crecimientos de microorganismos aeróbicos (ni
anaerobios estrictos ni aerobios estrictos). Además, el aire
que ingresa debe ser esteril, gracias a un filtro de aire
3. Bajo consumo de energía
4. Control de pH
5. Toma de muestras ⇒ debe estar incluída en el
equipo o ser simples de manera de no generar
contaminación
6. Control de la temperatura ⇒ para garantizar la
temperatura óptima de crecimiento. Como la
fermentación es un proceso metabólico, genera un
aumento de la temperatura que implica un cambio de la
temperatura ideal. Al aumentar se producen metabolitos
secundarios (algo que no quiero obtener) e incluso se
puede producir muerte celular
7. Evitar evaporación ⇒ temperaturas altas pueden
evaporar los metabolitos que quiero obtener (ejemplo
alcohol)
8. Enfriamiento con agua desmineralizada ⇒ no es necesario que sea estéril, solo no debe arruinar el
sistema de enfriado
9. Mínimas operaciones ⇒ cada control implica una posible contaminación
10. Versátiles
11. Superficies internas lisas ⇒ no se puede rayar el acero inoxidable para evitar la generación la
formación de biofilms y sea fácil la desinfección.
12. Sistema de agitación: para evitar la decantación y una distribución uniforme de nutrientes
13. Geometría idéntica
 14. Materiales baratos
15. Servicio de repuestos

→ El conjunto biorreactor-sistema de cultivo debe cumplir con los siguientes objetivos:

● Mantener las células uniformemente distribuidas en todo el volumen de cultivo.
● Mantener constante y homogénea la temperatura.
● Minimizar los gradientes de concentración de nutrientes.
● Prevenir la sedimentación y la floculación.
● Permitir la difusión de gases nutrientes a la velocidad requerida por el cultivo.
● Mantener el cultivo puro.
● Mantener un ambiente aséptico.
● Maximizar el rendimiento y la producción.
● Minimizar el gasto y los costos de producción.
● Reducir al máximo el tiempo.

→ Control de la contaminación
● Química: residuos de desinfección o de los diferentes procesos de fermentación, calidad del
fermentador
○ Inocuidad total (no tóxico)
○ Inerte químicamente (no reaccionar con el medio)
○ Superficie lisa y resistente (choque, rayado)
○ Resistente a las soluciones de lavado, productos desinfectantes, etc
● Microbiológica: contaminación cruzada
○ El tanque debe diseñarse para que funcione asépticamente durante numerosos días, así
como para las operaciones de más larga duración
○ No conexiones directas entre partes estériles y no estériles del sistema (usar soldadura)
○ Reducir al mínimo las conexiones con elementos móviles
○ Sello de vapor en las conexiones móviles con el exterior
○ Válvulas y llaves con sistema de no retorno
○ Eliminar los espacios muertos en el interior del fermentador
○ Esterilización por partes del sistema de fermentación
○ Presión positiva en el fermentador
● Sistemas de control:
○ Sistema de aireación
○ Sistema de agitación
○ Sistema de control de pH ⇒ ácidos y bases débiles para no matar a los microorganismos
○ Sistema de control de temperatura
○ Sistema de control de la espuma ⇒ debido a que contiene oxígeno puede evitar que el
organismo fermente y elija la vía aeróbica donde produce mayor ATP
○ Sistema de toma de muestras
○ Otros sistemas de control

→ Instrumentación y control
● Temperatura: termómetros y termistores
● Presión: manómetros
● Contenido: peso y volúmen
● Espuma: sondas de espuma
 ● Rpm: tacómetro
● Flujo gaseoso: rotámetro
● Flujo líquido: variables
● pH: electrodo de vidrio
● O2 disuelto: electrodo de O2
● CO2 disuelto: electrodo de CO2
● O2 en fase gaseosa: análisis paramagnético de gases
● CO2 en fase gaseosa: análisis infrarrojo

→ Salto de escala
Implica el paso en el cual un procedimiento desarrollado con éxito en el laboratorio, en volúmenes
reducidos, es modificado para ser usado en fermentaciones de gran tamaño, manteniendo las mismas
condiciones. El diseño del fermentador debe ser similar en todos los tanques:
Escala laboratorio = Planta semipiloto = Planta piloto = Planta industrial
1. Matraz de laboratorio. 96
2. Fermentador de laboratorio (1-10 litros).
3. Planta piloto (300-3000 litros).
4. Fermentador comercial (10.000-50.000 litros).
El comportamiento del microorganismo en una escala
no es el mismo en otra escala. El problema es que en el
laboratorio se intenta optimizar la producción en términos
puramente cuantitativos, mientras que en la planta es la
optimización del rendimiento, considerando también los
costes. Tener éxito en el salto de escala querrá decir conseguir
la máxima producción en la planta, en el mínimo de tiempo y
con el mínimo de costes.
Control del coste:
● El tanque debe ser versátil para la aplicación en diversas modalidades de procesos
● El diseño del tanque debe ser tal que las operaciones laborales durante el funcionamiento,
recolección, limpieza y mantenimiento sean mínimas
● El consumo de energía debe ser tan bajo como sea posible
● Deben emplearse los materiales más baratos que proporcionan resultados satisfactorios
● Debe existir un servicio adecuado de repuestos para el fermentador

12.4.3. Tipos de fermentaciones

[Link]. Fermentación discontinua
Una fermentación discontinua (en batch) es un “sistema cerrado”. Al
inicio de la operación se añade la solución esterilizada de nutrientes y se inocula
con el microorganismo, permitiendo que se lleve a cabo la incubación en
condiciones óptimas de fermentación. A lo largo de toda la fermentación no se
añade nada, excepto oxígeno (en forma de aire), un agente antiespumante y
ácidos o bases para controlar el pH.
En los procesos comerciales la fermentación se interrumpe al final de la
fase logarítmica (metabolitos primarios) o antes de que comience la fase de muerte (metabolitos
secundarios).
La ventaja de este método es que es bien conocido y con instalaciones simples. Pero, implica una
mala utilización de medios ambientales y humanos.
 [Link]. Alimentada (fed-batch)
Se considera una mejora del proceso cerrado discontinuo, se da una fermentación
alimentada que se utiliza en la producción de sustancias como la penicilina. Se
añaden sustratos como F. de carbono y F. de nitrógeno escalonadamente a lo largo
de la fermentación.
Ofrece como ventaja, al igual que la fermentación discontinua, que es un método
clásico, bien conocido, con instalaciones simples y además mejora la producción
(metabolitos secundarios). De la misma forma, sus desventajas son la mala
utilización de los medios materiales y humanos.
La formación de muchos metabolitos secundarios está sometida a represión
catabólica (efecto glucosa). Por esta razón, en el método alimentado los elementos
críticos de la solución de nutrientes se añaden en pequeñas concentraciones al principio de la
fermentación y continúan añadiendo a pequeñas dosis durante la fase de producción. Esto no inhibe la
producción de metabolitos secundarios al principio.
● El reactor puede operarse de manera semicontinua
● Una corriente de entrada de alimentación pero sin una corriente de salida
● Con este tipo de operación permite que la concentración de sustrato se pueda mantener en algún
valor predeterminado
● Este tipo de operación es una forma intermedia entre la operación por lotes y la continua,
incrementando la duración de la fermentación por lotes y de la productividad global del reactor.
● En la tecnología de operación por lotes con alimentación repetida, el fermentador no se descarga
completamente después de la reacción; el residuo se usa como inóculo para la siguiente corrida.
En la producción de levaduras para panadería, por ejemplo, un exceso de glucosa conduce al
inicio impetuoso de la fermentación y de la producción de etanol, lo cual reduce la producción de células.
Mediante el suministro lento de glucosa a una velocidad tal, que pueda ser consumida por completo por la
levadura, la concentración de glucosa residual se mantiene en aproximadamente cero y se obtiene la
máxima conversión de sustrato.
En la producción de penicilina, es común obtener primero una elevada concentración de células en
el reactor durante la fase exponencial del crecimiento, en el cual se produce muy poca penicilina, y luego
el suministro de la fuente de carbono y de nitrógeno al cultivo se hace a una velocidad que iguala los
requerimientos biosintéticos y de mantenimiento del organismo (los requerimientos de mantenimiento
para la producción de penicilina son bastante altos).
● En algún punto, parte del volumen del reactor se retira (por lo general entre el 10 y el 25%) y el
proceso se repite
● La mezcla retirada contiene producto a una elevada concentración, lo cual es ventajoso en la
recuperación del mismo.
Ejercicio tipos de examen/curva real:
[Link]. Continua
En la fermentación contínua se
establece un sistema abierto. La solución
nutritiva estéril se añade contínuamente al
biorreactor y una cantidad equivalente del
cultivo, con microorganismos, se saca
simultáneamente del sistema.
Es de difícil aplicación cuando el
producto de interés se sintetiza en la fase
logarítmica del crecimiento. Por lo tanto,
interesa que las bacterias estén en esa fase cuanto más tiempo mejor, para lo que
requieren más medio. Aunque en teoría el funcionamiento podría ser ilimitado,
pero conseguir mantener las condiciones en el interior del fermentador es muy difícil
Ventajas:
● Productividad: Si funciona bien, la productividad será máxima el tiempo que funcione.
● Rentabilidad constante: El tiempo total es el tiempo entre 2 producciones consecutivas. En batch y
fed-batch, aparte del tiempo de cultivo se ha de añadir el de prefermentación, por lo que la
rentabilidad es menor
● Se reducen costes, está todo automatizado
Desventajas:
● Poco versátil: Una vez puesto en marcha no se pueden alterar los parámetros, porque el equilibrio
se destruiría.
● Tecnología más cara
● Duración real limitada: En muchos casos, en el laboratorio operan de 20 a 200h solo, pero para
que fuese rentable tendría que funcionar entre 500 y 1000 horas, lo que no sucede.
● Composición variable de medios: La entrada de medios es constante, pero la composición de estos
medios es variable, por lo que el equilibrio se verá alterado.
● Contaminaciones: Mantener condiciones estériles a nivel industrial durante largos períodos de
tiempo
● Cuando se usan cepas de elevado rendimiento se pueden producir mutantes degenerados que
pueden crecer más rápido que las cepas productoras, con lo que te harán perder dinero y medio.

[Link]. Reactores de enzimas o células inmovilizadas

Sistema de producción continua.

Consiste en pasar el medio fresco a
través de un biorreactor en el que hemos
inmovilizado células (o enzimas)

Ventajas:
● Se eliminan problemas de
desequilibrio (estabilidad del sistema)
● Se eliminan problemas de
estabilidad genética del sistema continuo
clásico y además el producto resultante
está libre de células
Desventajas:
● Presenta el inconveniente de que no todos los microorganismos pueden inmovilizarse.
“La alta selectividad con la que las enzimas participan en diferentes procesos de transformación
química y las condiciones suaves de reacción en las que se operan dichos procesos industriales, traen en
consecuencia un ahorro energético y económico.”
Ejemplos de la utilización de enzimas en la industria:
★ La industria cervecera utiliza proteasas bacterianas para evitar que la cerveza se enturbie con las
proteínas de la cebada del lúpulo y amiloglucosidasas para hidrolizar el almidón y obtener
cervezas bajas en calorías
★ La industria textil utiliza enzimas para mejorar el procesamiento de las fibras y conseguir un
acabado o una textura específica, más brillante o gastado
★ Diversas enzimas son utilizadas para romper los granos de almidón de los cereales y producir
biocombustible o biocarburantes más eficaces para la combustión en los motores (biodiesel o
bioetanol)
★ En medicina y biotecnología las enzimas son ampliamente utilizadas en pruebas de diagnóstico,
en ingeniería genética para cortar ADN, o en líquidos limpiadores de lentillas.
★ La industria papelera utiliza enzimas para digerir la celulosa y obtener la pasta de celulosa
★ Se calcula que el mercado global de las enzimas es de alrededor de 4.5 billones de dólares y se
espera que crezca para el 2020 a un ritmo del 8.3% y alcance cifras de más de 7.5 billones de
dólares.
★ Dentro de este mercado se estima que las enzimas destinadas al procesamiento de alimentos y
bebidas captan alrededor de 40% del mercado global y que dentro de este sector al menos 45%
están destinadas a la modificación de carbohidratos, particularmente, aquellas destinadas a la
transformación de almidones.
★ En segundo lugar, se calcula que la industria de los detergentes capta alrededor del 30% del
mercado, la industria textil y la industria del papel entre del 12 y el 10% del mercado
respectivamente y el resto del mercado se divide en aplicaciones diversas para industria química,
farmacéutica y biológica.

→ Distintas formas de obtener

productos
12.4.4. Factores físicos y químicos que afectan el rendimiento
● Oxígeno
● Temperatura
● pH

[Link]. Agitación y mezclado

La agitación es la operación que crea o que acelera el contacto entre dos o varias fases. Un
fermentación microbiana puede ser considerada como un sistema de tres fases:
1. Fase líquida: sales disueltas, sustratos y metabolitos
2. Fase sólida: células individuales, agregando celulares, sustratos insolubles o productos del
metabolismo que precipitan
3. Fase gaseosa: proporciona un reservorio para el suministro de oxígeno, para la eliminación de CO2
o para el ajuste del pH con amonio gaseoso
Efectos de la agitación en la fermentación:
● Dispersión del aire en la solución de nutrientes
● Homogeneización de la temperatura, pH y concentración de nutrientes en el fermentador
● Suspensión de los microorganismos y de los nutrientes sólidos
● Dispersión de los líquidos inmiscibles
Tipos de agitación:

[Link].1. Aireación y agitación

Ambos procesos están interconectados: la entrada de aire produce turbulencias que agitan y la
agitación favorece la transferencia de oxígeno en el medio. La agitación es necesaria para:
1. Incrementar la velocidad de transferencia de oxígeno desde las burbujas de aire al medio líquido;
los microorganismos no pueden utilizar oxígeno gaseoso, sino solamente el que se encuentra en
disolución.
2. Aumentar la velocidad de transferencia de oxígeno y nutrientes desde el medio a las células.
Debido al movimiento se evita que las células creen áreas estancadas con bajos niveles de oxígeno
y nutrientes.
3. Impedir la formación de agregados celulares.
4. Aumentar la velocidad de transferencia de productos metabólicos de las células al medio.
5. Aumentar la tasa o la eficiencia de la transferencia de calor entre el medio y las superficies de
refrigeración del fermentador
[Link]. Temperatura
Una temperatura inferior a
la óptima genera un retardo en el
crecimiento y una reducción de la
producción celular. Las pérdidas de
calor se dan por evaporación.
Mientras que la refrigeración se
logra por camisas de agua.
Una temperatura superior a
la óptima genera un choque
término, inducción a una respuesta
de estrés, producción de proteasas
unicelulares y reducción de
productos proteicos. La producción
de calor se produce por agitación y
actividad metabólica.
⇒ Las fermentaciones deben
llevarse a cabo en un estrecho
margen de temperatura y a se ser posible constante
Tomemos como ejemplo la producción de etanol:

[Link]. pH
➔ Las bacterias crecen a un pH neutro
➔ Los hongos crecen a un pH ácido
➔ La mayor parte de los microorganismos crecen óptimamente entre pH 5,5-8,5
➔

12.4.5. Recuperación de productos

Criterios a considerar en la elección del proceso de recuperación del producto:
- Localización del producto (intracelular o extracelular).
- Concentración del producto.
- Propiedades fisicoquímicas del producto.
- Uso que se vaya a dar al producto.
- Estabilidad del producto.
- Pureza requerida.
- Impurezas del cultivo.
- Precio que ha de tener el producto
Secuencia general del proceso de purificación:
1. Fermentación
2. Separación de insolubles: por filtración o centrifugación.
3. Si es intracelular tenemos que hacer una disrupción celular por distintos métodos mecánicos,
químicos o enzimáticos. Después, tendremos que separar los restos celulares que lo haremos por
centrifugación, filtración o extracción.
4. A continuación, y común a si es un producto extracelular e intracelular, realizamos una reparación
o concentración mediante extracción, destilación, adsorción o ultrafiltración.
5. Purificación por cromatografía, precipitación o métodos eléctricos.
6. Refinado: mediante cristalización y secado.